Se conoce como centrifugación a la separación de substancias de diferente
densidad mediante movimiento giratorio. La centrifugación es una de las principales operaciones unitarias utilizada para la separación de células de caldos biológicos, especialmente cuando los caldos no son fácilmente filtrables. También es empleada en la remoción de desechos celulares de caldos de células que han sido sujetas a rompimiento, separación de precipitados proteicos y para la recuperación de productos insolubles como los cuerpos de inclusión. Estos últimos debidos a su tamaño y alta densidad pueden ser separados de los restos celulares por centrifugación en dos o tres pasos, utilizando agua de lavado y detergentes para facilitar la separación. Cuando se utiliza la centrifugación la diferencia entre la densidad de los solidos y el caldo, se incrementa por la acción de las fuerzas centrifugas que se generan por las altas velocidades de rotación de los equipos que se emplean. Existen diferentes tipos de centrifugas que se utilizan tanto a nivel laboratorio como a escala industrial y su aplicación depende de varios factores análogos.