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BIOMOLÉCULAS,
UNA PERSPECTIVA
ESTRTRUCTURAL
Parte 2
Proteínas
Las proteínas son las macromoléculas más abundantes de las células vivas. Las proteínas cumplen
diversas funciones biológicas: forman tejidos (piel, uñas, cartílagos, músculos), catalizan reacciones
(enzimas), regulan procesos del organismo (insulina, hormonas de crecimiento), transportan oxígeno
(hemoglobina), etc.
La denominación de proteínas proviene del griego protos-primero o más importante.
Las proteínas son las moléculas orgánicas más abundantes en los animales , constituyen hasta
el 50% o más de la masa seca y desempeñan funciones importantes tanto en la estructura como en el
funcionamiento de las células. Químicamente se consideran biopolímeros de los α-aminoácidos y
pueden presentar masas moleculares de hasta 40 millones de unidades.
Las propiedades físicas y químicas de una proteína están determinadas por los aminoácidos
que la constituyen, y debido a la diversidad de composición dada por la gran cantidad de
combinaciones posibles de aminoácidos, poseen una sorprendente variedad de propiedades
estructurales y catalíticas. Las proteínas pueden clasificarse según su función. Las principales clases
y algunos ejemplos se resumen en la siguiente tabla:
Cualquiera sea su función todas las proteínas son similares en cuanto a su estructura química: todas
son polímeros de α-aminoácidos dispuestos en una secuencia lineal. Una sola molécula de proteína contiene
cientos e incluso miles de α-aminoácidos que pueden ser de unos 20 tipos diferentes.
AMINOÁCIDOS
El primer aminoácido descubierto en las proteínas, fue la asparginina, en 1806, y el último de los
veinte en descubrirse fue la treonina en 1938.
Todos los aminoácidos tienen nombres comunes que en algunos casos provienen de la fuente de la
cual se aislaron:
Asparginina – espárrago
Ácido glutámico – gluten de trigo
Tirosina – queso (tyros)
Glicina – sabor dulce (glycos)
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Los veinte aminoácidos encontrados en las proteínas tienen todos una estructura en común: un
grupo carboxilo y un grupo amino unidos al mismo átomo de carbono (el C-α). Difieren unos de otros en sus
cadenas laterales o grupos R, que varían en estructura, tamaño y carga eléctrica y que influyen en la
solubilidad en agua de los aminoácidos.
El grupo amino es una base débil (acepta protones) y el carboxilo es un ácido débil (dador de
protones)
Todos los aminoácidos de las proteínas son L-estereoisómeros y estos es debido a que las células
sólo sintetizan el isómero L de los aminoácidos por la acción de las enzimas.
Entre los aminoácidos estándar o primarios encontramos aminoácidos esenciales o no esenciales, los
primeros se denominan así porque nuestro organismo no los puede sintetizar y debemos consumirlos en los
alimentos.
A las proteínas que proveen todos los aminoácidos esenciales en las proporciones casi correctas para
la nutrición humana se les llaman proteínas completas. Ejemplos de las proteínas completas son aquellas
que se encuentran en la carne, pescado, leche y huevos. Alrededor de 50 g de proteína completa por día es lo
adecuado para los humanos adultos.
A las proteínas que son bastante deficientes en uno o más de los aminoácidos esenciales se les llaman
proteínas incompletas. Si la proteína en la dieta de una persona proviene principalmente de una fuente
incompleta, la cantidad de proteína humana que puede sintetizarse está limitada por las cantidades de los
aminoácidos deficientes. Las proteínas de las plantas por lo general son proteínas incompletas. El arroz, el
maíz y el trigo son deficientes en lisina. El arroz también carece de treonina y el maíz carece de triptófano. El
frijol, los guisantes y otras leguminosas son las que tienen proteínas más completas entre las plantas
comunes, pero son deficientes en metionina.
Los vegetarianos pueden lograr una ingesta adecuada de aminoácidos esenciales si comen muchos
alimentos a partir de distintas plantas. Las proteínas de las plantas pueden elegirse como complementarias,
con algunos alimentos que suministren los aminoácidos que los otros carecen. Una alternativa es
complementar la dieta vegetariana con una fuente rica en proteína completa como la leche o los huevos.
En la gran mayoría de los casos, los aminoácidos con los que se sintetizan las proteínas en el
ribosoma son 20. Sin embargo, luego de incorporados en las proteínas pueden sufrir modificaciones (se
denominan postraduccionales) de modo que surgen nuevos aminoácidos, por ejemplo la hidroxiprolina. Por
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otro lado, si bien el código genético codifica para 20 aminoácidos, en determinados contextos se codifican
dos aminoácidos más, la selenocisteína y la pirrolisina, muy frecuentes en bacterias. Finalmente, hay más de
300 aminoácidos que no forman parte de las proteínas como por ejemplo la citrulina.
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Los grupos radicales de los aminoácidos tienen una importancia fundamental en las funciones biológicas
de las proteínas debido a que las células pueden producir proteínas con diferentes propiedades y funciones
debido a la combinación de los 20 aminoácidos estándar o primarios, los cuales comparten la presencia de
los grupos amino y carboxilo unidos al carbono alfa, pero se diferencian en el tamaño, estructura química
y carga eléctrica de sus radicales.
En el siguiente diagrama de Venn observamos la diversidad de clasificaciones que podemos realizarle a
los aminoácidos estándar de acuerdo a las características y propiedades de los radicales, tales como la
polaridad, tamaño, carga eléctrica
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Los aminoácidos en solución acuosa están ionizados y pueden actuar como ácidos o como bases. El
conocimiento de las propiedades ácido-base de los aminoácidos es importante para comprender las
propiedades físicas y biológicas de las proteínas.
Los α-aminoácidos que tienen un solo grupo amino y un solo grupo carboxilo cristalizan a partir de
las soluciones acuosas neutras en forma de especies totalmente ionizadas denominadas ZWITTERIONES (del
alemán – iones híbridos) o iones dipolares que tienen una carga positiva y una negativa.
Estos iones son eléctricamente neutros por lo que permanecen estacionarios en un campo eléctrico.
La naturaleza dipolar de los aminoácidos fue sugerida a partir de la observación de que los aminoácidos
cristalinos tienen puntos de fusión mucho más elevados que otras moléculas orgánicas de tamaño similar.
Los zwitteriones de los ainoácidos son sales internas y, por lo tanto tienen muchas propiedades
físicas asociadas con las sales. Tienen momentos dipolares grandes, son solubes en agua pero insolubles en
hidrocarburos y son sustancias cristalinas con puntos de fusión relativamente altos.
Debido a la formación de iones dipolares los aminoácidos son anfóteris, es decir se comportan como
ácidos o bases, cediendo o aceptando protones según el medio en el que se encuentren
En medio ácido, el anión carboxilato acepta un protón (se comporta como base) y el aminoácido
queda cargado positivamente (forma catiónica), por lo que si lo sometemos a la acción de un campo eléctrico
migra hacia el ánodo.
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En medio básico, el ión amonio cede un protón (se comporta como ácido) y el aminoácido queda
cargado negativamente (forma aniónica), por lo que si lo sometemos a un campo eléctrico migrará hacia el
cátodo.
En conclusión dependerá del medio la migración del aminoácido. La concentración de H + para la cual
un determinado aminoácido no migra en un campo eléctrico determina el PUNTO ISOELÉCTRICO (pI), que
el pH en el cual un aminoácido se encuentra en una forma eléctricamente neutra, como ión dipolar.
Cada aminoácido tiene su valor de pI, por lo tanto se pueden separar los diferentes aminoácidos que
se encuentran en una solución mezcla de ellos en base a la dirección y la velocidad relativa de su
desplazamiento cuando se colocan en un campo eléctrico a pH conocido.
Como en general, el grupo ácido no tienen la misma fuerza que el básico, a pesar de que el
amonoácido sea neutro (un grupo amino y uno carboxilo), el punto isoeléctrico no es en general 7 sino un
poco menor. Los pI mayores a 7 son característicos de los aminiácidos básicos y los mucho menores a 7 de
los aminoácidos de los aminoácidos ácidos.
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EJERCICIOS:
1. El pI de la alanina es 6.01. Formular la especie presente en una solución acuosa a pH=6.01 y pH=7.2
PÉPTIDOS
Los polímeros de los aminoácidos se denominan PÉPTIDOS. Los péptidos que se encuentran en la
naturaleza varían de tamaño desde pequeñas moléculas que solo contienen dos o tres aminoácidos a
macromoléculas que contienen miles de ellos (a estas se les denomina proteínas).
Dos moléculas de aminoácidos pueden unirse de forma covalente a través de un enlace amisa
sustituído denominado ENLACE PEPTÍDICO, formando un dipéptido.
Un enlace peptídico se forma a través de una reacción de condensación entre el grupo hidroxilo del
carbonilo de una molécula de aminoácido con un hidrógeno del grupo amino de otra molécula, con la
formación de una molécula de agua
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Por convención, los péptidos se escriben con el aminoácido terminal N o amino terminal (el que
tiene el grupo NH2 libre) a la izquierda y el aminácido terminal C o carboxilo terminal (el que tiene el
grupo COOH libre) a la derecha. El mombre del aminiácido se indica utilizando las abreviaturas para cada
aminoácido separada de guiones, los símbolos de una sola leta o cambiando las terminaciones de todos los
resitudos de aminoácidos por il exceptuando el aminoácido carboxilo terminal.
El enlace peptídico es el enlace covalente más importante que uno aminoácidos en los péptidos y
proteínas. El nitrógeno de la amida ya no es una base fuerte y el enlace C-N tiene un giro restringido debido
al carácter de enlace doble parcial, debido a las formas de resonancia siguientes:
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Otro enlace covalente que se presenta con frecuencia es el enlace disulfuro que se forma a veces entre dos
residuos de cisteína. Los enlaces disulfuro juegan un papel especial en la esttructura de muchas proteínas,
especialemente las que actúan en el medio extracelular, tales como la insulina y las inmunoglobulinas o
anticuerpos
El compuesto resultante luego de unir dos aminoácidos es un dipéptido, cuando se unen tres tipos
de aminoácidos es un tripéptido, cuando se unen unos cuantos aminoácidos se forma un
oligopéptido, cuando se unen muchos aminoácidos se denomina polipéptido. Las moléculas
denominadas polipéptidos tienen masas molares moleculares inferiores a 10000 uma.
EJERCICIOS:
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Clasificación de proteínas
Fibrosas: son insolubles en agua, resistentes al ataque por ácidos y bases y no sufren alteraciones por
calentamiento moderado. Están constituídas por cadenas polipetídicas ordenadas de modo paralelo a lo
largo de un eje, formando fibras o láminas largas. Ejemplo: queratina del cabello, uñas, colágeno de los
tendones y matriz del hueso.
Globulares: son solubles en agua y sensibles a los cambios de pH, por lo que resultan afectadas por ácidos y
bases. Se desnaturalizan a temperaturas elevadas. Están constituídas por cadenas polipeptídicas plegadas
estrechamente de modo que adoptan formas aproximadamente esféricas. Ejemplos: hemoglobina y
ovoalbúmina.
3. Clasificación de proteínas por su origen
De origen animal: generalmente contienen los aminoácidos esenciales para el hombre y son de alto valor
biológico. Ejemplo: ovoalbúmina.
De origen vegetal: generalmente son deficientes en algún aminoácido esencial por lo tanto poseen menor
valor desde el punto de vista biológico y nutritivo.Ejemplo: gluteína del trigo (gluten).
4. Clasificación de proteínas por su función biológica
Las proteínas proporcionan uno de los mayores grupos de sustancias nutritivas para el organismo,
mientras que glúcidos y lípidos se emplean principalmente como suministradores de energía; las proteínas
se utilizan principalmente para restaurar y sustituir los tejidos gastados.
Estas funciones se hacen con proteínas sintetizadas por el organismo animal a partir de las proteínas
ingeridas en la dieta.
La digestión de proteínas libera alfa aminoácidos que sirven para sintetizar las proteínas propias de
cada individuo.
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pepsina
Estómago proteína péptidos
(hidólisis de la proteína)
Enzimas específicas
Intestino péptidos aminoácidos
Hígado (aminoácidos)
La mayor parte de las proteínas de los tejidos se encuentran en equilibrio dinámico sujetas a
constantes degradaciones y síntesis. Este recambio es bastante rápido para las proteínas de los músculos.
Las proteínas enzimáticas no duran indefinidamente sino que se degradan a aminoácidos y se resintetizan
de acuerdo con las necesidades.
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La ESTRUCTURA TERCIARIA es su
estructura tridimensional completa, a
menudo contiene varios tipos de estructura
secundaria
La estructura terciaria de una proteína comprende atracciones y repulsiones entre los grupos R de los
aminoácidos en la cadena polipeptídica. A medida que se producen interacciones entre diferentes partes de
la cadena peptídica, segmentos de la cadena giran y se doblan hasta que la proteína adquiere una forma
tridimensional específica.
A continuación se detallan las interacciones estabilizadoras de las estructuras terciarias:
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Interacciones hidrofóbicas Son interacciones entre aminoácidos que tienen grupos R no polares. Dentro de
una proteína, los aminoácidos con grupos R no polares se alejan del ambiente acuoso, lo que forma un centro
hidrofóbico en el interior de la proteína.
Puentes salinos. Son enlaces iónicos entre los grupos R ionizados de aminoácidos básicos y ácidos. Por
ejemplo, el grupo R ionizado de arginina, que tiene una carga positiva, puede formar un puente salino
(enlace iónico) con el grupo R en el ácido aspártico, que tiene una carga negativa.
Enlaces por puente de hidrógeno. Se forman entre el H de un grupo R polar y el O o N de un segundo
aminoácido polar. Por ejemplo, un enlace por puente de hidrógeno puede ocurrir entre los grupos -OH de
dos serinas o entre el -OH de serina y el -NH2 en el grupo R de glutamina.
Enlaces por puente disulfuro (-S – S-). Son enlaces covalentes que se forman entre los grupos -SH de dos
cisteínas en la cadena polipeptídica. En algunas proteínas puede haber varios enlaces por puente disulfuro
entre los grupos R de cisteínas en la cadena polipeptídica.
Coordinación de un ion metálico. Dos cadenas laterales ionizadas con la misma carga normalmente se
repelerían una a la otra, pero también pueden unirse a través de un ion metálico. Por ejemplo, dos cadenas
laterales de ácido glutámico podrían ser atraídas a la vez por un ion magnesio (Mg2+), formando un puente.
Esta es una de las razones por las que el cuerpo humano requiere ciertos minerales traza.
Un grupo de proteínas conocidas como proteínas globulares tiene formas esféricas compactas porque
secciones de la cadena polipeptídica se pliegan unas sobre otras debido a las diversas interacciones entre los
grupos R. Las proteínas globulares son las que realizan el trabajo de las células: funciones como síntesis,
transporte y metabolismo. La mioglobina es una proteína globular que almacena oxígeno en el músculo
esquelético. Se encuentran altas concentraciones de mioglobina en los músculos de mamíferos marinos,
como focas y ballenas, que permanecen bajo el agua durante largo tiempo. La mioglobina contiene 153
aminoácidos en una sola cadena polipeptídica con aproximadamente tres cuartos de la cadena en la
estructura secundaria de hélice a. La cadena polipeptídica, incluidas sus regiones helicoidales, forma una
estructura terciaria compacta al plegarse sobre sí misma. En el interior de la estructura terciaria, el oxígeno
(O2) se enlaza a un grupo hemo, que es un gran compuesto orgánico con un ion hierro en el centro.
Las proteínas fibrosas son proteínas que consisten en formas largas y delgadas parecidas a fibras. En
general, forman parte de la estructura de células y tejidos. Dos tipos de proteína fibrosa son las queratinas α
y β. Las queratinas α son las proteínas que constituyen pelo, lana, piel y uñas. En el pelo, tres hélices α se
enredan juntas como una trenza para formar una fibrilla. En el interior de la fibrilla, las hélices a se
mantienen unidas mediante enlaces por puente disulfuro (-S–S-) entre los grupos R de los muchos
aminoácidos cisteína en el pelo. Varias fibrillas se enrollan para formar una hebra de pelo. Las queratinas β
son el tipo de proteínas que se encuentran en las plumas de las aves y las escamas de los reptiles. En las
queratinas β, las proteínas consisten en grandes cantidades de estructura hoja plegada β.
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Las proteínas que poseen varias cadenas polipeptídicas tienen un nivel adicional de estructura: la
ESTRUCTURA CUATERNARIA que se refiere a la relación espacial de los polipéptidos o subunidades en la
proteína global.
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Reacción con Reactivo de Millón: Nitrato de mercurio II en solución nitroso-nítrica. Reconoce Tirosina
al dar un color rojo carne por calentamiento debido a la
mercurización del anillo fenólico
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Reacción Xantoproteica: Ácido nítrico concentrado. Reconoce grupos aromáticos por coloración
amarilla debido a la nitración del benceno. Dan positiva esta reacción Tyr y Trp.
Reacción con Reactivo de Biuret: Sulfato de cobre II en medio básico. Reconoce enlaces peptídicos
por formación de un complejo violáceo
Acción del calor: elimina o reduce la capa protectora de agua (agua de hidratación) rompiendo los
enlaces salinos y de hidrógeno, dejando al descubierto grupos cargados que al interaccionar agrupan
las moléculas proteicas precipitándolas. La proteína coagula, el cambio es irreversible.
Acción de solventes orgánicos: Cumplen un doble papel, deshidratante y cambio de solvente. A causa
de ello la proteína se coagula ya que es insoluble en estos solventes.
Sales de metales pesados (mercurio, plata o plomo): precipitan la proteína por formación de sales
insolubles.
1. Formular y nombrar según IUPAC dos aminoácidos diferentes a los indicados. Clasifícarlos según los criterios
estudiados
2. Formular la tirosina, el ácido glutámico y la lisina. Clasificar estos AA según sean neutros, básicos o ácidos.
3. La valina tiene un pI de 5.97. Si la solución en la que está presente tiene un pH de 3.3 ¿De qué forma se encontrará
predominantemente el aminoácido?
4. La fenilalanina tiene un pI de 5.5. Si se prepara una solución en la cual la estructura predominante es la catiónica.
¿El pH de la solución es mayor, menor o igual a 5.5?
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a) Escribir las fórmulas estructurales del anión y del catión derivado de ella.
b) Explicar qué se entiende por punto isoeléctrico.
c) Escribir la estructura que presentará dicho aminoácido en su PI. y explicar que sucederá si se aumenta el pH de
la solución a 12.
d) Formular y nombrar un dipéptido. Señalice el enlace peptídico y el grupo amida.
6. El antibiótico vancomicina evita que las bacterias sinteticen Ala-Ala. Escriba la fórmula estructural de Ala-Ala
11. a) Formular un α-AA ópticamente activo y su enantiómero. Indicar cuál de ellos puede formar parte de una
proteína.
b) Representar, mediante la fórmula correspondiente, al AA anterior si cuando se lo somete a un campo eléctrico
no migra. Justificar
c) Indicar si la especie formulada en B) es capaz de reaccionar con HCl y con NaOH. Justificar con ecuaciones.
d) Si se unen 2 moléculas del aa formulado en A):
14. La seda es una proteína en la cual las cadenas polipeptídicas están dispuestas en forma de hoja plegada. En estas
cadenas, la secuencia peptídica: Gli-Ser-Gli-Ala-Gli-Ala, aparece repetidamente.
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c) lana
d) Gli-Fen-Val
e) Ácido aspártico
f) Lisina
BIBLIOGRAFÍA:
CAREY, FRANCIS- Química Orgánica. Sexta edición. Mc Graw Hill. México. 2006
MC MURRY, JOHN – Química orgánica. Séptima edición. Cengage Learning editores S.A.México. 2008
WADE, LEROY_ Química Orgánica. Volumen 2. Séptima edición. Pearson Education. México 2011
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