Genética clínica

Dra. Susana Aviles Viñas

Genética clínica y consejo genético
La genética clínica se ocupa del diagnóstico y atención de las personas y familias en las que parece una
enfermedad genética. Incluye varios aspectos, algunos de ellos algo diferentes de la práctica médica
habitual:
• Diagnóstico
• Medicina predictiva
• Consejo genético
Consejo genético

Requiere que una o más personas adiestradas de forma apropiada ayuden al individuo o familia a:

1) comprender los hechos médicos; 2) apreciar el modo en que la herencia contribuye al transtorno; 3)
comprender las alternativas para enfrentarse al riesgo de recurrencia; 4) escoger un curso de acción que
les parezca apropiado a la vista de su riesgo y 5) procurar la mejor adaptación posible a la enfermedad en
un miembro afectado de la familia y/o al riesgo de esta enfermedad.
• Entre profesionales de la Genética Clínica existe un amplio consenso a favor de que el consejo genético
sea un proceso no-directivo
Herramientas básicas
Las dos herramientas básicas de la genética clínica, que el
estudiante debe dominar, son:
• Realización de la historia familiar
• Estimación de riesgos genéticos

✓ La estimación del riesgo genético, se expresa

siempre como una probabilidad, es decir en
modo fraccional o en porcentaje

✓ El riesgo genético no es más que la

probabilidad de padecer la enfermedad que
tiene un individuo concreto de la familia
Enfermedades de herencia
autosómica
Autosómicas dominantes
• Suelen tener una frecuencia génica muy
baja (la prevalencia de estas
enfermedades es habitualmente
inferior a 1/1 000 individuos)
• los individuos homocigotos son
extremadamente infrecuentes
• El árbol típico de una enfermedad
autosómica dominante muestra
individuos enfermos en todas las
generaciones, afectando ambos sexos
por igual
• Hipercolesterolemia familiar
• Acondroplasia.
Enfermedades de herencia
autosómica
Autosómicas recesivas
• los individuos afectados son
homocigotos (dos alelos mutados) y,
por tanto, sus progenitores son
habitualmente portadores sanos
heterocigotos.
• El árbol típico de un patrón autosómico
recesivo muestra generaciones con
algún miembro afectado, separadas por
generaciones en las que no hay ningún
individuo enfermo
• Se encuentran individuos enfermos de
ambos sexos, y es muy frecuente la
presencia de uniones con-sanguíneas
• Fibrosis Quística del Páncreas
Síndrome de Rett, el
Raquitismo
Hipofosfatasémico,
Incontinencia Pigmentaria tipo
1 Dominante

La Distrofia Muscular de
Duchenne (DMD)
Recesiva
Enfermedades de herencia ligada al cromosoma X
Las enfermedades ligadas al sexo pueden ser recesivas o dominantes. Lo más
habitual es encontrar enfermedades de herencia ligada al sexo recesivas, en las
que las mujeres portadoras son sanas. El árbol típico muestra únicamente varones
enfermos, habitualmente sin transmisión de la enfermedad de un padre a sus
hijos varones.
Teorema de Bayes y su
aplicación al cálculo de
riesgos genéticos
• Es especialmente útil en el cálculo
de riesgos de recurrencia de
enfermedades recesivas ligadas al
cromosoma X, en las que podemos
incluir información de tipo
condicional.

• la situación en la que más se utiliza

el teorema de Bayes en consejo
genético es para el cálculo del riesgo
de ser mujer portadora en las
enfermedades con herencia ligada al
X recesiva, ya que en estos casos el
riesgo puede modificarse
sustancialmente.
 Enfermedades por alteración
del ADN mitocondrial
• Alta tasa de mutación (10 veces superior a la
del ADN nuclear)
• Poliplasmia y Segregación mitótica (homoplamia
(moléculas idénticas de ADNmt) heteroplasmia
(dos poblaciones de ADNmt)
• Efecto umbral- grado de heteroplasmia de una
mutación

• Herencia materna- el ADNmt se hereda

exclusivamente por vía materna.Los varones —
enfermos o no— nunca transmiten la
enfermedad, y sus descendientes (hijos o hijas) no
son portadores; por otro lado, las mujeres
afectadas transmiten la enfermedad a toda su
descendencia, de forma que todas sus hijas tienen
riesgo de transmitir y/o padecer la enfermedad, y
todos sus hijos tienen riesgo de padecerla.
 Enfermedades mitocondriales

• Las enfermedades mitocondriales pueden deberse a defectos en genes nucleares o a alteraciones del propio
genoma mitocondrial
Los pacientes con enfermedad del ADN mitocondrial pueden agruparse en tres categorías
1. Raramente se presenta como un síndrome fácilmente identificable (MELAS, ,CPEO, Síndrome de Kearns-
Sayre y MERRF)
2. Datos clínicos que sugieren enfermedad mitocondrial, pero no encajan en ninguno de los síndromes citados
(miastenia congénita)
3. Pacientes con síntomas aislados que —después de un estudio exhaustivo— terminan achacándose a
patología mitocondrial.( sordera familiar neurosensorial progresiva)
 Diagnóstico prenatal
Se recomienda que sólo se realice diagnóstico prenatal cuando se cumplen una serie de condiciones y en aquellos
casos en que está indicado.
 Bibliografía
Genética Cínica (Capitulo 18) La
Genética en el campo de la
Biomedicina- Francisco Javier Novo
Villaverde
Nutrición molecular

Dra. Susana Aviles

Nutrición
molecular

La nutrigenómica estudia la influencia de los

nutrimentos sobre la expresión génica del
individuo; la nutrigenética estudia el efecto de
las variaciones genéticas en la respuesta del
organismo a los nutrimentos.
 Fundamentos de
la nutrición
molecular
❑ La expresión de los genes es lo que
define el estado de salud-enfermedad
de un individuo.
❑ La constitución génica confiere a cada
individuo un perfil de expresión de
susceptibilidad o protección ante
agentes exógenos y procesos endógenos
del organismo.
❑ La estructura primaria de los genes y
el ambiente son los factores que
determinan la expresión génica.
❑ La nutrición constituye la variable
ambiental modificable más importante
que modula la expresión de los genes.
❑ Los genes predisponen, pero el
ambiente determina.
 Objetivos
▪ Búsqueda de alternativas
nutricionales para
frenar la prevalencia
creciente de las
enfermedades crónicas
degenerativas

▪ Análisis del efecto

provocado por algunos
alimentos en función de
variantes génicas
individuales.
Avance Científico
En la actualidad, se conoce que algunos nutrimentos se unen de
forma directa o afectan de manera indirecta a los factores de
transcripción, los cuales regulan la expresión de genes
específicos
 Galato de epsigalocatecina 3
EGCG- principal componente
del Té verde

Interacciones
nutrimento-gen
✓ Flavonoide (pigmento vegetar y metabolitos
secundario)
✓ Se ha relacionado con una baja incidencia de
cáncer (inhibe telomerasa, incrementa p53 y
p21)
✓ Impide la metástasis tumoral
✓ Efecto inhibitorio de la angiogénesis
✓ Ejerce un efecto antioxidante y
antiinflamatorio
Mecanismo de acción Recomendaciones nutricionales
(EGCG)
Consumo de 100 a 300 mg de flavonoides
al día puede prevenir el desarrollo de
procesos patológicos

Una taza de té verde (240 ml)- 200

mg de EGCG

Pimiento amarillo (100g)- 58 mg de

flavonoides

Uvas (100g)- 55 mg de flavonoides

Naranjas (100g)- 44 mg de
flavonoides
 Ácido docosahexaenoico
(DHA) y
eicosapentaenoico (EPA)

• Son ácidos grasos poliinsaturados

esenciales de cadena larga,
pertenecientes al grupo de los
omega 3 (ω-3)
• El DHA 22:6(ω-3) y El EPA 20:5(ω-
3)
• propiedades biológicas vinculadas
con la prevención y tratamiento de
enfermedades
• Su fuente dietética son los peces
que habitan en aguas frías (trucha
o el salmón)
 • Se asocia el consumo de pescado a una baja
DHA y incidencia de cáncer

EPA • DHA posee un efecto modulador en la expresión de

genes que participan en la replicación y la muerte
celular
• DHA altera la estabilidad de la membrana plasmática
• Antioxidante protectora en la reposición de lípidos
de membrana
• Los ácidos grasos omega 3 poseen efectos benéficos
en enfermedades cardiovasculares
• los ácidos grasos omega 3 desplazan al ácido
araquidónico de las membranas celulares, evitando su
metabolismo y sus posteriores productos
proinflamatorios y protrombóticos
 DHA y EPA

Recomendaciones
nutricionales

❑ La American Heart Association (AHA) recomienda el

consumo de pescado, de preferencia el aceitoso, por lo
menos dos veces a la semana en porciones de 100 g
aproximadamente o la suplementación de 1 g de EPA/DHA
al día para prevención de enfermedades
cardiovasculares.
❑ El consumo de 400 mg/kg de peso de DHA al día es
preventivo para el desarrollo de cáncer de mama y de
próstata en modelos in vivo. En seres humanos, esta
cantidad sólo puede obtenerse por suplementación.
Sulforafano (SFN)
o Se asocia el consumo de verduras a una baja incidencia
de cáncer
o Efecto modulador en la expresión de genes
o Utilidad en la anticarcinogénesis
o Isotiocianatos
o Las verduras crucíferas, como la coliflor, col de
Bruselas, col, brócoli, sobre todo el germinado de
brócoli, son sus fuentes dietéticas más abundantes.
 SFN
❑ Inhibidor de las enzimas
desacetiladoras de histonas
(HDACi)
❑ SNF se une al sitio catalítico
de las HDAC al impedir que éstas
lleven a cabo su función de
desacetilación
❑ SFN aumenta la acetilación de
las histonas H3 y H4 en el
promotor de p21 y elimina la
represión de los genes p21 y
Bax, que codifican proteínas de
arresto de ciclo celular y
apoptosis, respectivamente, por
lo que evita la proliferación de
células cancerígenas
❑ El consumo de SFN se ha Recomendaciones
relacionado con la nutricionales
disminución del tamaño de
tumores
❑ Se ha sugerido que la
muerte celular inducida
por SFN podría estar
mediada por estrés
oxidativo
❑ Se recomienda el consumo
de 68 g de germinado de
brócoli al día,-(105 mg de
SFN)
❑ Se necesitaría consumir
más de medio kilogramo de
brócoli maduro para
obtener la misma cantidad
de SFN.
Otros nutrimentos
CAROTENOIDES
o Son pigmentos vegetales
o Tienen la capacidad de disminuir el
daño oxidativo ocasionado en el DNA
o Acción antiinflamatoria
o efecto hipoglucémico
o Su fuente dietética está constituida
por alimentos altamente pigmentados
(amarillos, naranjas, verdes, rojos)
como jitomate, zanahoria o espinacas.
o Se recomienda un consumo diario de
carotenoides de 24 mg/día
o 6 tazas de zanahoria, 4 piezas de
jitomate o 1.5 taza de espinacas
VITAMINA C
• Molécula hidrosoluble
• Tiene función antioxidante
• Regenera al tocoferol y funciona como factor coenzimático.
• Deficiencia se relaciona con enfermedades como el cáncer
• Deficiencia C se ha asociado a la alteración de las glucosidasas reparadoras del DNA
• Dosis recomendada es de 60 mg/día.
• Algunos alimentos con altos contenidos son el brócoli, el chile poblano, el kiwi, la naranja y la guayaba.
ÁCIDO FÓLICO
o Vitamina hidrosoluble
o Deficiencia causa defectos de cierre
del tubo neural en la etapa fetal
o Su carencia aumenta el riesgo de
presentar leucemia en hijos de
madres con suplementación inadecuada
durante el embarazo
o Deficiencia provoca la incorporación
de uracilo en lugar de timina en la
síntesis del DNA, lo que altera la
metilación de las islas CpG en el
DNA
o Consumo recomendada es 400 µg/día.
o Alimentos con altos contenidos de
ácido fólico son las espinacas, el
hígado de pollo, el frijol bayo, los
garbanzos, las habas y las lentejas.
 CINC
• Es un metal que participa como
cofactor enzimático en diversas
reacciones bioquímicas
• Desempeña una función importante
en el funcionamiento del sistema
inmunológico y en el metabolismo
de los hidratos de carbono.
• Los alimentos ricos en proteínas
contienen grandes cantidades de
cinc.
• Las carnes de res, cerdo y cordero
contienen mayor cantidad de cinc
que el pescado y su contenido
también es mayor en la carne
oscura del pollo que en la blanca
• Se recomienda un consumo de cinc
de 12 a 15 mg/día.
VITAMINA E ✓ Vitamina liposoluble
compuesta por
tocoferoles y
tocotrienoles.
✓ Tiene una función
antioxidante
✓ Deficiencia se ha
relacionado con la
alteración de las
glucosilasas
reparadoras del DNA
✓ El consumo diario
requerido es de 10
mg/día
✓ Fuentes dietéticas
principales son el
germen de trigo y las
oleaginosas, como las
nueces y las
almendras.
 Interacciones
gen-nutrimento
Las condiciones génicas
particulares que presentan
algunos individuos atribuidas
a variaciones génicas, ya
sean polimorfismos o
mutaciones, influyen en el
efecto de los nutrimentos
sobre el organismo. Las
respuestas a los nutrimentos
condicionadas por estas
variables constituyen el
objeto de estudio de la
nutrigenética.
 Fenilcetonuria
❑ fenilcetonuria (FCN) es una
enfermedad caracterizada por la
acumulación de fenilalanina, debido a
la deficiencia de la enzima
fenilalanina hidroxilasa (FAH), que
transforma la fenilalanina en tirosina
(pertenece al grupo de afecciones
denominadas errores innatos del
metabolismo)
❑ La dificultad para metabolizar
fenilalanina origina la acumulación de
este aminoácido y la consecuente
deficiencia de tirosina.
❑ La acumulación de fenilalanina
conduce al retraso mental, cuyo grado
depende de la mutación sufrida en el
gen de la FAH
 RECOMENDACIONES
NUTRICIONALES
❑ Los individuos con FCN deben
recibir una dieta constituida por
un hidrolizado proteico libre de
fenilalanina desde el nacimiento y
hasta, por lo menos, los primeros
seis años de vida, o con la
cantidad de fenilalanina tolerada
por el paciente para mantener los
niveles plasmáticos y tisulares
necesarios.
❑ Debe suplementarse la tirosina
❑ Los alimentos de libre consumo
para pacientes con FCN, por no
contener fenilalanina, son azúcar,
miel y aceites
❑ Los elementos de la dieta para un
paciente con FCN deben elegirse de
manera cuidadosa para evitar
consecuencias irreparables.
 Consumo de etanol y
polimorfismos
• Efecto benéfico al incrementar los
niveles de colesterol unido a
lipoproteínas de alta densidad (cHDL)
• El consumo de etanol puede causar daño
hepático de manera diferencial en los
individuos, debido a diversos
polimorfismos asociados a la
susceptibilidad a desarrollar una
enfermedad hepática alcohólica
• Estos polimorfismos conducen a un
fenotipo con tendencia a la acumulación
de acetaldehído, que puede desencadenar
daño hepático.
• Si bien es cierto que estos polimorfismos
se han encontrado principalmente en
poblaciones asiáticas, en pacientes
mexicanos con cirrosis alcohólica se ha
observado asociación entre el daño
hepático y el polimorfismo de CYP2E1.
Polimorfismos asociados al desarrollo dedaño
hepático identificados en individuos que abusan
del consumo de bebidas alcohólicas
 RECOMENDACIONES NUTRICIONALES
• El consumo de bebidas
alcohólicas, en particular
vino tinto se ha relacionado
con niveles óptimos de cHDL,
debido principalmente a su
alto contenido de sustancias
antioxidantes
• El consumo de etanol en
mujeres no debe rebasar 20
g/día y en varones 40 g/día
• La cantidad de alcohol
ingerida puede calcularse
mediante la siguiente
fórmula:
g de alcohol =Volumen ingerido ×grados de alcohol en la bebida
100
Lípidos y Polimorfismo
G-308A de TNF α
• Los lípidos forman parte de la
dieta recomendada, ya que son
componentes estructurales de las
membranas celulares del cuerpo
• pueden tener efectos diversos
dependiendo de la estructura
génica de los individuos
• algunos polimorfismos que
modifican esta respuesta(G-308A
de TNF-α)
• Este polimorfismo incrementa la
tasa de transcripción y hace que
los individuos que lo presentan
sean más susceptibles de
desarrollar un perfil
inflamatorio
• Se ha propuesto como un
polimorfismo de riesgo para
enfermedades cardiovasculares y
dislipidemias.
RECOMENDACIONES
NUTRICIONALES

❖Una dieta balanceada incluye alimentos

que contienen fibra soluble e insoluble
(Avena y nopales)
❖Se recomienda un consumo de β-glucano de
3 g/día, lo cual equivale aproximadamente
a ingerir 25 g de avena o nopales por día
❖Se recomienda una dieta alta en
antioxidantes y suplementación de omega 3
por sus efectos en la disminución de
riesgo cardiovascular
 Dietas
inteligentes
Consiste en un plan
nutricional diseñado según
las necesidades específicas
de una población o un
individuo. Incluye el cálculo
calórico; la proporción
adecuada de hidratos de
carbono, proteínas y lípidos;
suplementos alimenticios, y
los nutrimentos específicos
que satisfagan una necesidad
particular.
Nutrimentos específicos que pueden ser útiles en la elaboración de una
dieta inteligente.
 Día con día se descubren nuevos polimorfismos de
influencia fenotípica, se dilucidan vías de
señalización, se comprenden mejor las bases
moleculares de las afecciones y la influencia de los
nutrimentos en la regulación de la expresión génica.
Conclusiones La nutrición molecular hará posible establecer
regímenes alimentarios personalizados que constituyan
la herramienta principal para conservar, recuperar o
mejorar el estado de salud. Asimismo, la nutrición
molecular deberá utilizarse como parte de una
estrategia de salud pública que contribuya a elevar
la calidad de vida de nuestra población.
 Biología Molecular.
Fundamentos y
aplicaciones en las ciencias
de la salud, 2e

CAPÍTULO 32:
Nutrición molecular
Farmacogenética y Farmacogenómica

Dra. Susana Aviles

Farmacogenómica y Farmacogenética

“Farmacogenética” es el estudio de la
variación interindividual en la secuencia
de un gen en relación con la respuesta
a los fármacos

“Farmacogenómica” es el estudio de la
variabilidad de la expresión de genes
individuales relevantes en la
susceptibilidad a enfermedades, así como
en la respuesta a un fármaco dado a
nivel celular, tisular, de un individuo o de
la población.
 Farmacogenómica y Farmacogenética
Dado que ambas disciplinas estudian la variabilidad hereditaria que sustenta las
diferencias en la respuesta individual a los fármacos, su aplicación es de gran
ayuda en el tratamiento de enfermedades al identificar polimorfismos o haplotipos
en genes que codifican para proteínas involucradas en el metabolismo de fármacos,
incluidas las proteínas transportadoras y enzimas metabolizadoras de fármacos.
Variaciones en la
secuencia de genes
La respuesta farmacológica es
principalmente el resultado de la
interacción del fármaco con el
receptor o blanco farmacológico,
con la subsecuente transducción
de señales dentro de la célula
(farmacodinamia); sin embargo,
la absorción, distribución,
metabolismo y excreción del
fármaco (farmacocinética) también
juegan un papel fundamental en
la eficacia farmacológica
 Factores que influyen en la eficacia de un fármaco

Específicos del fármaco

Demográficos y clínicos atribuibles a los individuos
Variaciones de la secuencia de genes individuales
Factores que influyen en la eficacia de un fármaco

Variaciones de la secuencia
del DNA (polimorfismos)

SNP- puede afectar la

eficacia, tolerabilidad,
seguridad y duración de la
acción de los fármacos.

Una variación genética puede

afectar el metabolismo de un
fármaco a diferentes niveles:
absorción, distribución, acción,
metabolismo y depuración.
Variaciones genéticas y metabolismo de fármacos
Los polimorfismos genéticos

Origen a proteínas
transportadoras
disfuncionales (P-
glucoproteína. ABCB1 y
MRP)
Los polimorfismos en genes
que codifican para proteínas
que funcionan como
blancos farmacológicos
podrían afectar su eficacia
Los polimorfismos en genes
que codifican para enzimas
implicadas en el
metabolismo de fármacos
pueden contribuir a la
variabilidad en la eficacia
Farmacorresistenciogenes

Genes de resistencia a fármacos

Codifican para las proteínas
transportadoras de fármacos

Codifican para proteínas que

funcionan como receptores de su
acción

Codifican para las enzimas

implicadas en el metabolismo de
fármacos (Citocromo P450).
 Metabolismo de compuestos endógenos y exógenos
Fase I - modificación (enzimas de la superfamilia CYP450)
Fase II – conjugación (ácido glucorónico, con metabolitos intermediarios de la
Fase I- por enzimas de tipo uridin difosfato glucuronosiltransferesas (UGT).)
Familia de enzimas
citocromo P450

La mayoría de los fármacos son metabolizados en el hígado por el conjunto de enzimas P450
La superfamilia citocromo P450 es un conjunto de genes que codifican para las llamadas enzimas
CYP450
En humanos han sido identificados 57 genes funcionales que codifican para enzimas CYP450 (18 familias
y 44 subfamilias)
familias CYP1, CYP2 y CYP3 catalizan la biotransformación de compuestos exógenos (incluyendo varios
fármacos y otros xenobióticos como alcoholes y procarcinógenos).
familias CYP restantes son enzimas que se encuentran principalmente involucradas en el metabolismo de
compuestos endógenos como ácidos grasos, prostanglandinas y esteroides
En humanos las enzimas CYP450 están localizadas en el retículo endoplásmico liso de las células, con
mayores niveles en hepatocitos y en células del intestino delgado.
 Enzimas CYP450
La actividad de las enzimas CYP450 está
regulada por numerosos factores como edad,
género, estado nutricional, factores fisiopatológicos
como enfermedades del hígado y también por
polimorfismos en genes que codifican para estas
enzimas metabolizadoras

Diferencias en el proceso de biotransformación de

fármacos sustrato
• Metabolizadores lentos (PM, poor metabolizers)
• Metabolizadores intermedios (IM, intermediate
metabolizers).
• Metabolizadores eficientes (EM, efficient metabolizers)
• Metabolizadores ultrarrápidos (UM, ultrarapid
metabolizers)
 Enzimas CYP450
✓ Las enzimas CYP450 son responsables
de la oxidación de alrededor de 90% de
los fármacos actualmente utilizados
✓ El CYP2C9 y el CYP2C19 están
implicados en el metabolismo de
compuestos exógenos y en particular
CYP2C9 es la principal enzima
responsable del metabolismo de varios
fármacos de importancia clínica

Gen CYP2C9
CYP2C9*2 (rs1799853) y
CYP2C9*3 (rs1057910)- tienen
relevancia funcional en el
metabolismo de diversos
fármacos incluyendo la
fenitoína, debido a que estas
variantes han sido asociadas
con una actividad enzimática
disminuida
Polimorfismos
CYP2C9 y CYP2C19
Son altamente polimórficos
gen CYP2C9 -35 variantes
gen CYP2C19 -28
Gen CYP2C19
variantes.
CYP2C19*2 y CYP2C19*3
asociadas con ausencia total
de actividad enzimática.
Estas dos variantes son las
responsables de la mayoría
de los fenotipos
metabolizadores lentos en
diferentes poblaciones.
Polimorfismos genéticos y farmacocinética
Muchos de los estudios de farmacogenética están focalizados
en el metabolismo de difenilhidantoína/fenitoína ( DPH), por
ser uno de los fármacos antiepilépticos de mayor prescripción
en la práctica clínica
 Farmacogenética
La aplicación de la farmacogenética se
encuentra aún en las primeras etapas
de desarrollo, se ha demostrado el
efecto del genotipo en la respuesta a
fármacos, la identificación de la
variabilidad interindividual en la
respuesta a fármacos puede permitir
individualizar el tratamiento con la
intención de maximizar su eficacia y
minimizar el riesgo, al margen de que
la variabilidad clínica y los efectos
adversos se presenten en una minoría
de pacientes.
Capítulo 19:
Bases fisiológicas
de la
farmacogenética
BIOLOGÍA MOLECULAR
 Dinámica de próxima clase
Se formarán equipos de 4 integrantes y se realiza una presentación en base al tema de biología
molecular que les toque, el tema será repartido al azar y cada equipo contara con un máximo de 10
minutos para exponer su tema.
 Extracción
de ácidos
nucleicos

▪ Extracción de ADN
▪ Extracción de ARN
▪ Características generales de cada técnica.
Electroforesis
▪ Características generales de la técnica.
▪ Tipos
▪ Aplicaciones
 Reacción en cadena de la polimerasa

▪ Características generales de la técnica

▪ Tipos
▪ Aplicaciones
 Vectores de clonación y expresión

• Tipos
• Aplicaciones
 Técnicas de hibridación

▪ Características generales de la técnica

▪ Tipos
▪ Aplicaciones
 Polimorfismos de ADN y
huella genética

▪ Características generales de la técnica

▪ Tipos
▪ Aplicaciones
Terapia génica
▪ Características generales de la técnica
▪ Tipos
▪ Aplicaciones
 Animales transgénicos y clonación

▪ Características generales de la técnica

▪ Aplicaciones
Libro consulta
Biología Molecular. Fundamentos
y aplicaciones en las ciencias de la
salud, 2e
Adriana María Salazar Montes, Ana
Soledad Sandoval Rodríguez, Juan
Socorro Armendáriz Borunda

https://accessmedicina.mhmedical.
com/book.aspx?bookid=1803
Grupo A

Kiana, Frida, Anette, Alexandra- Electroforesis

Jorge Solis, Valeria Cienfuegos, Samanta Muñoz y Cristina Hernandez- Terapia génica
Ana Paulina Alvarez, Sofia Asunsolo, Silvana Montiel, Samantha Montiel- Polimorfismos de ADN y huella
genética
Alinka, Martha, Isabella y Ana Sofia-6.1 Vectores de clonación y expresión
María José Florencia, Carolina Magdaleno, Carolina Jiménez, Rodrigo Chinchilla- Técnicas de hibridación
Melisa, Citlali, Rafael- Animales transgénicos y clonación
Eduardo Garcia, Alena Ortiz, Sara bueno y Erick Escalante- Extracción de ácidos nucleicos
Grupo B
Daniela garcia, Israel navarro, Dafne reyes, fernanda delgadillo- Polimorfismos de ADN y huella genética
Aurora Zapata, Carlos Suarez, Keren Paz y Monica Che- Técnicas de hibridación
Andres Alcocer, Javier Ramírez, Angelica Tziu y Rodrigo Saucedo- Terapia génica
Gabriela Garces, Mariana Beauregard, Georgina , Pedro- Vectores de clonación y expresión
Faddi Joaquin, Kristel Lopez, Maria Jose Moguel - Electroforesis
Andrea Rosas, Alejandra Gómez, Amira López y José Hernadez.-Reacción en cadena de la polimerasa
Gabriel Carrillo, Rossana Benavides, Axel Navarrete, Vanessa Alcantara-Extracción de ácidos nucleicos
Blanca granados, Kenny Canche, Samantha manducando y Sofia del rosario- Animales transgénicos y clonación
FUNDAMENTOS DE GENÉTICA,
GENÓMICA,
PROTEÓMICA Y BIOINFORMÁTICA

Dra. Susana Aviles Viñas

 Rosalind Franklin

Sir Archibald
Garrod

Thomas H.
Morgan

GENÉTICA

Watson y Crick Gregor Mendel

Código genético

Severo Ochoa

oCodón, integrado por tres bases

oCada codón codifica un aminoácido
oExisten cuatro bases (A,G,C,T)
oAgrupadas de tres en tres, forman 64 combinaciones
distintas
o El número de aminoácidos codificados es de 20
o Un aminoácido puede estar codificado por más de un
codón (degenerado)
o Codón de iniciación (ATG) y varios de terminación
 Francis Crick

ARNm Proteína

Hubert Chantrenne
Tecnología del ADN recombinante
• Enzimas de restricción- Werner Arber, DanielNathans y Hamilton Smith (60s)
• Secuenciación de ADN- Allan Maxam y Walter Gilbert en Estados Unidos y por
Frederick Sanger en el Reino Unido (70s)
• Transcriptasa inversa- Howard Temin y David Baltimore (ADNc)
• Técnicas que proporcionan proteínas humanas de interés clínico en
abundancia-Paul Berg, Stanley Cohen y Herbert Boyer(1973)
• Primera compañía que producía y comercializaba insulina humana
recombinante- Herbert Boyer junto a Robert A. Swanson (1976 Genentech)
• Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)- Kary B. Mullis (1983)
Proyecto Genoma
Humano
 Mapa físico del
genoma humano
El mapa físico del genoma
humano permite, como en un
libro, tener un índice de genes y
su localización en el genoma.
ANÁLISIS GENÉTICOS
 Organización del genoma humano
Podemos clasificar, un tanto arbitrariamente, el ADN del genoma
en ADN repetitivo y ADN de copia única. El ADN codificante se
suele incluir en esta última categoría pero es un error porque ¡el
número de copias de un gen puede ser variable en una
población!
Existen deleciones, inserciones, duplicaciones y otras variantes
complejas que se conocen genéricamente como variaciones en
el número de copias (CNV) o polimorfismos de número de
copias (CNP).
Las CNV representan una fuente considerable de diversidad
genética. Recientemente se ha publicado el primer mapa global
de CNV del genoma humano. Casi 3 000 genes están
asociados con CNV
Algunas CNV están asociadas a distintas patologías que van
desde un riesgo aumentado de infecciones por HIV-1 hasta la
glomerulonefritis
 ADN REPETITIVO
Aproximadamente la mitad del ADN eucariota corresponde a secuencias nucleotídicas repetidas. Estas
secuencias tienen un mismo elemento básico compuesto por un número variable de pares de bases que se
repite y expande por el genoma de dos formas distintas, en tándem o disperso:

Secuencias altamente repetitivas en tándem Secuencias repetitivas dispersas (Movilidad)

o Satélites o LINE (Long Interspersed Nuclear Elements)
o Minisatélites o SINE (Short Interspersed Nuclear Elements)
o Microsatélites o Elementos retrovirales humanos
o Transposones de ADN.
Patologías simples, las
alteraciones genéticas son
directamente responsables de la
Polimorfismo genético y enfermedad
enfermedad y tienen un patrón de
herencia mendeliano..
Complejas, para que la
enfermedad se manifieste es
necesaria la intervención de
factores ambientales. (presentan
agregación familiar –los miembros
de una familia afectada tienen un
riesgo mayor de padecer la
enfermedad que la población
general– pero no siguen patrones
de herencia mendelianos),
comunes (por ser las patologías
más prevalentes en nuestro
medio), o multifactoriales (ya que
se necesita la interacción de
varios factores para que la
patología se inicie y desarrolle)
 Bases genéticas de
las diferencias
interindividuales en el
genoma humano
Haplotipo

Se denomina haplotipo a un grupo de SNP que se hereda en bloque

 Gen o genes que contribuyen a las
patologías complejas

Existen dos grandes aproximaciones experimentales

para tratar de identificarlos: los estudios de asociación
y los estudios de expresión

o En los estudios de asociación- Una vez

identificados los haplotipos relevantes para el
médico, se irá creando una base de datos que los
agrupe y que traslade al clínico la información útil
para su práctica diaria.

o Estudios de expresión- pretenden analizar los

genes que se expresan o silencian diferencialmente
en un tejido patológico. Se llama “firma genética” de
una patología al conjunto de genes que se
expresan diferencialmente en el tejido anormal.
 Gen o genes que
contribuyen a las
patologías complejas
El análisis de ligamiento (AL) es una
herramienta poderosa para identificar genes
responsables de enfermedades mendelianas.
Los EAGC pretenden identificar qué variantes
génicas están estadísticamente asociadas con
una enfermedad compleja.

Tanto el análisis de ligamiento (AL) como los estudios de asociación con el genoma completo (EAGC) se
asientan sobre principios comunes. Éstos son:
1. Utilizar marcadores genéticos variables que se pueden estudiar experimentalmente
2. Estudiar grupos de personas sanas y enfermas en los que se analiza el marcador genético variable
3. Analizar estadísticamente si la distribución del marcador entre sanos y enfermos es resultado del azar
o si, por el contrario, existe una asociación entre el marcador y la población enferma.
 epilepsia mioclónica

Genoma mitocondria
El patrón de herencia de las
enfermedades mitocondriales
está determinado por la
existencia de varias copias del
genoma mitocondrial en cada
mitocondria (entre 2 y 10 en el
hombre)

miopatía mitocondrial

Neuropatía hereditaria de Leber

 Medicina genómica

✓ Medicina Molecular:
•Bases Genéticas de las Enfermedades
•Diagnóstico de Enfermedades Genéticas

✓ Farmacogenómica y Farmacogenética
✓ Ingeniería Genética
✓ Terapia Genética
 La Medicina molecular utiliza, fundamentalmente, técnicas de
Medicina molecular genética molecular con las que ha podido identificar miles de
alteraciones génicas responsables de patologías humanas.
Farmacogenómica
y
Farmacogenética
✓ Analizan los genes
involucrados en la
respuesta a un tratamiento,
especialmente los genes
responsables de la
distribución y la
metabolización de los
fármacos.
✓ El principal objetivo de la
farmacogenómica es tratar
de crear una base de datos
con los genotipos que
participan en la respuesta
a los fármacos.
TERAPIA GÉNICA

La terapia génica es de escasa

eficiencia, y con el tiempo da lugar
a la progresiva disminución de la
expresión de la proteína
recombinante. Todos estos
inconvenientes dificultan
enormemente el desarrollo de esta
especialidad, cuyo futuro está
ligado a la posibilidad de obtener
vehículos virales más seguros y
eficientes.
Proteómica
Disciplina que trata de la caracterización de todo el componente proteico que se expresa
en una célula, un tejido o en cualquier compartimento biológico

“Proteoma” (término que hace referencia al conjunto de proteínas que se expresa a partir
de un genoma

La definición de un proteoma requerirá la determinación de las proteínas que lo

componen (en términos de secuencia y estructura) y su abundancia, pero también las
modificaciones que presentan, sus localizaciones, así como sus interacciones (entre
proteínas y con otras moléculas biológicas), y todo ello en un momento o situación
fisiológica determinada.

La proteómica se ocupa, en la práctica, de estudios proteicos a gran escala, aunque no

del proteoma completo
MALDI (Matrix Assisted Laser Desorption), en combinación
Espectrometría de masas (MS)
con TOF (time of flight),

Herramientas de la proteómica
 Diseño proteómico
1. Separación de las proteínas contenidas en una muestra
biológica compleja (electroforesis bidimensional)
2. las “manchas” proteicas de interés pueden ser extraídas del
gel, sometidas a reducción y alquilación y digeridas con
proteasas para ser sometidas a la espectrometría de masas
para identificar los péptidos resultantes (MALDI-TOF)
 Co-inmunoprecipitación Resonancia de plasmón superficial (SPR)

Interacciones
proteína-proteína

Sistemas de doble-híbrido Arrays

 Perfiles moleculares

Arrays de proteínas SELDI-TOF (Surface Enhanced Laser Desorption/Ionization-

Time of Flight)
Bioinformatica
La bioinformática y la biología computacional emplean técnicas de otras disciplinas, como las
matemáticas aplicadas, la informática, la estadística, la inteligencia artificial o la bioquímica, para
solucionar problemas biomédicos, por lo general a nivel molecular. Sus objetivos principales son la
alineación de secuencias, la identificación de genes, el ensamblaje de genomas, la alineación y
predicción de estructuras proteicas o el modelado del curso de la evolución.
 RECURSOS EN RED
Los principales proveedores de información y servicios que son imprescindibles para la práctica de la
genética clínica se centran en dos grandes áreas: la información bibliográfica y la información
genética.

✓ Prácticamente toda la información bibliográfica generada en biomedicina se recoge en la base de datos

Medline, una de la fuentes de información que se consultan bien directamente o a través de otros servidores
de información que aprovechan dicha información para hacerla más rápidamente accesible.
✓ La base de datos Medline es la fuente bibliográfica por excelencia en biomedicina: contiene más de 15
millones de referencias de artículos de unas 5 000 revistas internacionales publicadas desde 1960
RECURSOS EN RED

La referencia mundial en cuanto a las enfermedades genéticas.

Es una base de datos que cataloga todas las enfermedades
conocidas con componente genético y eventualmente las enlaza
a los genes relevantes del genoma humano

PubMed es un sistema de búsqueda bibliográfica de la National

Library of Medicine (NLM) americana y desarrollada por el NCBI
y que permite el acceso a las bases de datos bibliográficos
Medline, PreMEDLINE, Genbank y Complete Genome.

GeneTests (Genetic Testing resource) proporciona información

actualizada y autorizada sobre pruebas genéticas y su empleo en
el diagnóstico, manejo y consejo genético, promocionando así el
uso de los servicios genéticos para el cuidado de los pacientes y
en la toma de decisiones
RECURSOS EN RED

Se trata de un servidor de información sobre enfermedades raras

y medicamentos huérfanos de libre acceso para uso público.

GeneCards es una base de datos integrada de genes humanos

que extrae información genómica, proteómica y del transcriptoma
automáticamente, así como de sus ortologías, relación con las
patologías, SNP, datos de expresión, función y enlaces con
proveedores de ensayos y anticuerpos.

GenAtlas Se estructura en tres bases de datos: de genes, de

fenotipos y de citas bibliográficas. La información de la literatura
se actualiza periódicamente y proporciona fichas estructuradas
con información genética básica de más de 21 000 genes y
cerca de 4 000 fenotipos.
RECURSOS EN RED
Es quizá la fuente de información más completa sobre mutaciones
de genes en general. La información de acceso privado tiene la
ventaja de estar más actualizada.

Son dos herramientas que trascienden su objetivo concreto de

SNPper y ofrecer información sobre SNP en genes concretos
GeneWindows
 Capítulo 1:
FUNDAMENTOS DE
GENÉTICA,
GENÓMICA,
PROTEÓMICA Y
BIOINFORMÁTICA
Va r i a c i ó n g e n é t i c a e n
las poblaciones

Dra. Susana Aviles

 Variación genética en poblaciones
La genética de poblaciones es el estudio cuantitativo de la distribución de las
variaciones genéticas en las poblaciones y de la manera en que las frecuencias
de los genes y los genotipos se mantienen o cambiancon el tiempo en el seno
de una población y entre poblaciones distintintas.
Genética de las poblaciones
Se ocupa de los factores genéticos, como las
mutaciones y la reproducción, y de los
factores ambientales y sociales, como la
selección y la migración, que determinan
conjuntamente la frecuencia y la distribución
de los alelos y los genotipos en las familias y
las comunidades. En la práctica de la genética
médica, la genética poblacional proporciona
los conocimientos sobre varios genes
causantes de enfermedades que son
frecuentes en distintas poblaciones.
 Genotipos y fenotipos en las poblaciones
Frecuencias alélicas y genotípicas en las poblaciones
Gen CCR5, que codifica un receptor
de citocina de la membrana celular,
que sirve como punto de entrada
para ciertas cepas del virus de la
inmunodeficiencia humana (VIH),
que causa el síndrome de Una deleción en ese gen de 32 pares de
inmunodeficiencia adquirida (SIDA). bases da lugar a un alelo (∆CCR5)

Los individuos homocigotos para el

alelo Δ CCR5 no expresan el receptor
en la superficie de sus células
inmunitarias y, como consecuencia,
son resistentes a la infección por el
VIH.
 Ley de Si una población cumple determinados
postulados, existe una ecuación
Hardy-Weinberg matemática sencilla para el cálculo de las
frecuencias genotípicas a partir de las
frecuencias alélicas.

Supuestos:
• La población estudiada es grande y los emparejamientos se efectúan al azar con
respecto al locus en cuestión.
• Las frecuencias alélicas permanecen constantes a lo largo del tiempo, por lo
siguiente:
• La tasa de mutación de novo es inapreciable.
• Los individuos con cualquier genotipo tienen la misma capacidad de emparejarse
y transmitir sus genes, es decir, no existe una selección contra un genotipo
determinado.
• No ha existido una inmigración significativa de individuos provenientes de una
población con frecuencias alélicas muy distintas de la población endógena.
Una población que parece cumplir razonablemente estas suposiciones se considera
que está en equilibrio de Hardy-Weinberg.
Factores que alteran el
equilibrio de Hardy-
Weinberg
El primero es que la población estudiada
sea grande y que los emparejamientos
entre sus miembros se produzcan al azar.
El segundo supuesto es que las
frecuencias alélicas no cambian
significativamente con el tiempo. Ello
requiere que no exista inmigración ni
emigración de grupos con frecuencias
alélicas en el locus de interés
radicalmente diferentes de las
frecuencias alélicas de la población
general
Los cambios en las frecuencias alélicas
debido a mutación, selección o
migración suelen causar desviaciones
menos importantes o sutiles del
equilibrio de Hardy-Weinberg.
 Deriva génica
Puede explicar cómo varían las frecuencias alélicas por efecto del azar. A partir de ahí, durante
unas cuantas generaciones puede existir una fluctuación considerable de la frecuencia génica,
aunque el tamaño del nuevo grupo de la población permanezca reducido. Esto se mantiene
hasta que las frecuencias alélicas alcanzan un nuevo equilibrio a medida que la población
aumenta de tamaño. A diferencia del flujo génico, en el que las frecuencias génicas se
modifican por la mezcla de poblaciones previamente independientes, el mecanismo de la
deriva génica es simplemente el impacto del azar sobre poblaciones pequeñas.
 Efecto fundador.
Una forma especial de deriva
genética se denomina efecto
fundador. Cuando una pequeña
subpoblación se separa de una
población mayor, las frecuencias
génicas en la pequeña población
pueden diferir de la originaria
porque el nuevo grupo contiene
una muestra aleatoria y de
pequeño tamaño del grupo inicial
y, por azar, puede no tener sus
mismas frecuencias génicas.
Migración y
flujo génico

La migración puede cambiar la frecuencia alélica mediante el

proceso de flujo génico, que se define como la lenta difusión de
genes a través de una barrera. El flujo génico suele implicar una gran
población y un cambio gradual de las frecuencias génicas. Los genes
de las poblaciones emigrantes, con sus propias frecuencias alélicas
características, se diluyen de forma gradual en el conjunto génico de
la población a la que han emigrado, proceso que se denomina
mezcla genética.
El término migración se utiliza aquí en el sentido amplio de
atravesar una barrera reproductiva, que puede ser racial, étnica o
cultural, y no necesariamente geográfica, y no implica el
desplazamiento físico de una región a otra.
 Anemia falciforme

Tay-Sachs en las personas afroamericanos

descendientes de judíos
asquenazíes

Diferencias en las frecuencia de los

alelos que causan enfermedades
Presentan un interés particular para los genetistas
médicos y asesores genéticos, porque pueden causar Enfermedad hemolítica del recién nacido
diferentes riesgos de padecer una enfermedad en y la fenilcetonuria
grupos específicos de la población.
en la población blanca.
 Sistema Rh

Enfermedad
Sistema ABO hemolítica del recién
nacido
La población se divide en individuos Rh-positivos, que expresan en los eritrocitos el antígeno Rh D,
un polipéptido codificado por el gen RHD, e individuos Rh-negativos, que no expresan este antígeno.
Por lo tanto, el estatus Rh-negativo se hereda como un rasgo autosómico recesivo en el que el
fenotipo Rh-negativo se manifiesta en individuos homocigotos o heterocigotos compuestos para
alelos no funcionales del gen RHD. La frecuencia de individuos Rh-negativos varía en gran medida en
los diferentes grupos étnicos.
Diferencias étnicas en las frecuencias
de varias enfermedades
Se cree que varios factores explican cómo se desarrollan las
diferencias de alelos y frecuencias alélicas entre los grupos
étnicos. Uno de ellos es la falta de flujo de genes debido al
aislamiento genético, de modo que una mutación en un
grupo no tendría la oportunidad de propagarse a otros
grupos a través de emparejamientos. Otros factores son la
deriva genética, que incluye la distribución no aleatoria de
alelos entre los individuos que fundaron determinadas
subpoblaciones (efecto fundador), y la ventaja heterocigótica
bajo condiciones ambientales que favorecen la eficacia
reproductiva de los portadores de mutaciones nocivas.
Efecto fundador
ligado a Enfermedad de Huntington en los habitantes indígenas de la

enfermedades región del lago Maracaibo, en Venezuela, debida a la

introducción de una mutación causante de la misma en este
aislamiento genético

Tirosinemia tipo 1 hereditaria en

población franco-canadiense de Canadá,
Esta enfermedad tiene una frecuencia de
1/685 en la región de Saguenay-Lac-
Saint-Jean de Québec, pero sólo de
alrededor de 1/100.000 en otras
poblaciones.
 Ventaja
heterocigotica
Aunque ciertos alelos mutantes
pueden ser nocivos en los
homocigotos, es posible que
existan condiciones
ambientales en las que los
heterocigotos para alguna
enfermedad tengan una mayor
eficacia biológica no sólo
cuando se comparan con los
homocigotos para el alelo
mutante, sino incluso con los
homocigotos para el alelo
normal Resistencia al paludismo de los heterocigotos
para la mutación de la anemia falciforme
Polimorfismo
equilibrado
La situación en que las
fuerzas de selección
actúan tanto para
mantener un alelo dañino
como para retirarlo del
conjunto genético se
denomina polimorfismo
equilibrado.
 Deriva génica contra ventaja heterocigota
No resulta fácil determinar si la deriva génica o la ventaja heterocigota es la responsable por la frecuencia
aumentada de algunos alelos nocivos en determinadas poblaciones. os genetistas siguen debatiendo si la deriva
génica o la ventaja heterocigótica (o ambas) explican de forma adecuada las frecuencias inusualmente elevadas
que algunos alelos perjudiciales adquieren en ciertas poblaciones
Genética y ancestros

Existe un extenso polimorfismo entre los individuos en una población

 Bibliografía
Capítulo 9
Variación genética en las
poblaciones - Thompson &
Thompson. Genética en
Medicina
Diversidad genética
humana: mutación y
polimorfismo

Dra. Susana Aviles

La naturaleza de la variación genética
 MUTACIÓN
Un cambio permanente en
la secuencia de nucleótidos
o en la disposición del DNA.
oscila desde el cambio de
un solo nucleótido a
alteraciones de un
cromosoma entero.
Clasificación de las mutaciones
Las mutaciones se clasifican a veces por el tamaño de la secuencia de DNA alterado y, en
otras ocasiones, por el efecto funcional de la mutación sobre la expresión génica.

✓ Mutaciones cromosómicas
✓ Mutaciones regionales o subcromosómicas
✓ Mutaciones de genes o del DNA ).
Polimorfismo genético

El hecho de que una variante

se considere un
polimorfismo o no depende
por completo de si su
frecuencia en una población
supera el 1% de los alelos en
dicha población
Los polimorfismos
son un elemento
clave para el
estudio de la
genética humana y
médica.
 Variación heredada y
polimorfismo en el
DNA

Los polimorfismos del DNA

pueden clasificarse de
acuerdo con la variación de
la secuencia del DNA entre
diferentes alelo
 Tipo de variación Rango de tamaño (aprox.) Base para el polimorfismo Número de alelos

Polimorfismos de un único 1 pb Sustitución de un par de bases en una Por lo general 2

nucleótido localización particular del genoma
Inserción/deleción (indels) 1 pb a > 100 pb Simple : presencia o ausencia de un Simple: 2
segmento corto de DNA de 100-1.000 pb Microsatélites :
de longitud generalmente 5 o más
Microsatélites : generalmente, una unidad
de 2, 3 o 4 nucleótidos repetida en
tándem 5-25 veces
Variantes del número de 10 kb a > 1 Mb Generalmente, presencia o ausencia de 2 o más
copias segmentos de entre 200 pb y 1,5 Mb de
DNA, aunque también puede haber
duplicaciones en tándem de 2, 3, 4 o más
copias
Inversiones Pocos pb a > 1 Mb Segmento de DNA presente en cualquiera 2
de dos orientaciones respecto al DNA
circundante
kb, kilobases; Mb, megabases; pb, par de bases

Variación frecuente en el genoma humano

Polimorfismos en el DNA genómico
Polimorfismo en el genoma humano mayores que los SNP.
Polimorfismos de un único nucleótido (SNP)

• Mas sencillos y frecuentes

• Tienen sólo dos alelos que
corresponden a dos bases
distintas que ocupan un
determinado sitio en el
genoma.
• Ocurren, de media, una vez a
cada 1.000 pares de bases
• Distribución desigual
• Sinónimos y no sinónimos
 Efecto de los SNP

El efecto de los SNP frecuentes es una modificación relativamente sutil de la susceptibilidad a

la enfermedad, más que la causa directa de una enfermedad grave.
 Polimorfismos de • Alrededor de la mitad se
denominan «simples», porque sólo
inserción-deleción tienen dos alelos

Producidas por la inserción

o la deleción (in/dels, o
simplemente indels) de
entre 1 y hasta alrededor
de 1.000 pb
 Polimorfismos de
microsatélites
polimorfismos cortos de
repetición en tándem (STRP)
• Indels multialélicos
• Consisten en segmentos de DNA
compuestos por unidades de 2, 3 o
4 nucleótidos, como TGTGTG,
CAACAACAA, o AAATAAATAAAT,
que se repiten entre una y varias
docenas de veces en una
localización particular del genoma
• En el genoma humano, se conocen
muchas decenas de miles de loci
polimórficos de microsatélites
Marcador de microsatélite hipotético en el DNA humano
Microsatélites: indels especialmente útiles
 Los polimorfismos de elementos móviles se encuentran en
todos los cromosomas humanos

Polimorfismos
de inserción de
elementos
móviles
Retrotransposición, un proceso
que implica la transcripción en
un RNA, la transcripción
inversa a una secuencia de
DNA y la inserción (es decir, la
transposición) en otro sitio del
genoma- familias Alu y LINE
Variantes del número de copias (CNV)
Consisten en la variación del número de
copias de segmentos más grandes del
genoma, con un tamaño que oscila
desde 1.000 pb a centenares de
kilobases. Las variantes mayores de 500
kb se encuentran en el 5-10% de los
individuos en la población general,
mientras que las variantes que
comprenden más de 1 Mb se observan
en el 1-2%.
El contenido de dos genomas humanos
cualesquiera puede variar hasta en 50-100
Mb debido a diferencias de número de
copias en loci de CNV.
 Polimorfismos
de inversión
• Tamaño oscila desde unos pocos
pares de bases a grandes
regiones del genoma (de hasta
varias megabases)

• No conllevan una ganancia o

pérdida de DNA

• La recombinación anómala puede

dar lugar a la duplicación o
deleción del DNA situado entre las
regiones de homología, asociada a
trastornos clínicos
Origen y frecuencia de
los diferentes tipos de
mutaciones

o Carga genética
o línea germinal y somática
Diferencias en
función del sexo y
efecto de la edad en
las tasas de mutación
Impacto de las mutaciones y el polimorfismo
 Bibliografía
Diversidad
genética humana:
mutación y
polimorfismo
Capítulo 4, 43-56
Genómica y
Proteómica
Docente: Dra. Susana Avilés Viñas
 Introducción
Revisión del
programa

1. Introducción: Retroalimentación
genética microbiana
2. Presentación del contenido:
Introducción al genoma humano
3. Exploración del tema
4. Cierre: Actividad de conclusiones
Objetivo de la
Clase:

Analizar los
componentes del
genoma humano
 El genoma
humano y las
bases
cromosómicas
de la herencia
 Estructura del DNA
El DNA es una macromolécula de ácido nucleico
polimérico constituida por tres tipos de unidades:
un azúcar con cinco carbonos, la desoxirribosa; una
base que contiene nitrógeno, y un grupo fosfato.

✓ las cuatro bases del DNA y la estructura general de

un nucleótido en el DNA.
✓ Cada una de las cuatro bases establece enlaces
con la desoxirribosa (a través del nitrógeno,
mostrado en magenta ) y con un grupo fosfato,
formando los nucleótidos correspondientes.
Estructura del DNA

✓ A, Porción de una cadena polinucleotídica de

DNA en la que se muestran los enlaces
fosfodiéster 3’-5’ que enlazan nucleótidos
contiguos.
✓ B, Modelo de doble hélice del DNA, según lo
propusieron Watson y Crick. Los «peldaños»
horizontales representan las bases emparejadas.
Se dice que la hélice sigue el sentido de las
agujas del reloj debido a que la cadena que va
desde la parte inferior izquierda hasta la parte
superior derecha cruza a la otra cadena. La
porción detallada de la figura muestra las dos
cadenas complementarias de DNA, con las pares
de bases AT y GC. Obsérvese que la orientación
de las dos cadenas es antiparalela.
 Estructura del
DNA
La estructura anatómica del DNA transporta la información
química que permite la transmisión exacta de la información
genética desde una célula hasta sus células hijas, y de una
generación a la siguiente

Replicación de una doble hélice de DNA con formación de dos

moléculas hijas idénticas constituida cada una de ellas por una
cadena madre y por una cadena recién sintetizada
 Estructura de los
cromosomas humanos
✓ 46 cromosomas humanos existentes en
el núcleo, l DNA del cromosoma
mitocondrial.
✓ cromosoma humano está constituido por
una única doble hélice de DNA continuo
✓ el genoma nuclear está formado por 46
moléculas lineales de DNA que suman en
total más de 6.000 millones de pares de
nucleótidos
✓ Cromatina (ADN + proteína)
✓ los cromosomas sólo son visibles en
forma de estructuras bien delimitadas
cuando las células se están dividiendo
 Cromosoma
mitocondrial
✓ Un pequeño pero importante
subconjunto de genes codificados en
el genoma humano reside en el
citoplasma de la mitocondria .
✓ Los genes mitocondriales se heredan
exclusivamente por vía materna.
✓ DNA circular, 16 kb de largo y codifica
sólo 37 genes.
Secuencia del
genoma humano

✓ Proyecto Genoma
Humano, un consorcio
internacional de cientos de
laboratorios de todo el mundo
formado para determinar y
ensamblar la secuencia de los
3.300 millones de pares de bases
de DNA localizadas en los 24
tipos de cromosomas humanos.
Organización del
genoma humano
• DNA de copia
simple o única, es decir, DNA
cuyo orden lineal de nucleótidos
específicos está representado
sólo una vez (o a lo sumo unas
cuantas veces) en todo el
genoma. (mayoría de genes)
• DNA repetitivo, e incluye DNA
con secuencias de nucleótidos
repetidas, ya sea de forma
idéntica o con pocas variaciones,
de cientos a millones de veces en
el genoma.
 Variación en el genoma humano

✓Cualquier individuo dado tiene

al menos 5 millones de estas
variantes de secuencia.
Transmisión del genoma
 Ciclo
celular
Mitosis
5 etapas
1. Profase.
2. Prometafase.
3. Metafase.
4. Anafase.
5. Telofase
Cariotipo humano

✓ Un procedimiento usual es cortar los

cromosomas a partir de una imagen digital o de
una microfotografía y ordenarlos en parejas en
una clasificación estándar. El conjunto completo
se denomina cariotipo
Ciclo de
condensación y
descondensación de
un cromosoma a
través del ciclo
celular.
Meiosis
La meiosis es el proceso por el que las células diploides de la
línea germinal dan lugar a gametos haploides; es un tipo de
división celular específico de las células germinales
GAMETOGÉNESIS
Y FECUNDACIÓN
HUMANAS
Las células de la línea germinal que
experimentan meiosis (espermatocitos
primarios y ovocitos primarios) derivan del
cigoto a través de una larga serie de mitosis
antes de que se inicie la meiosis. Los
gametos masculinos y femeninos tienen una
historia diferente, caracterizada por patrones
distintos de expresión génica que reflejan su
origen en el desarrollo como embrión XY o
XX
 Espermatogénesis

Espermatogénesis humana con sus

dos divisiones meióticas.
La secuencia de acontecimientos
comienza en la pubertad y dura
unos 64 días. Se muestran el
número de cromosomas (46 o 23) y
la constitución de los cromosomas
sexuales (X o Y) de cada célula.
Ovogénesis y Fecundación

ovogénesis y la fecundación humanas en

relación con las dos divisiones meióticas.
Los ovocitos primarios se forman antes del
nacimiento y permanecen suspendidos en
profase de la meiosis I durante décadas,
hasta que comienza la pubertad. Un
ovocito completa la meiosis I cuando
madura su folículo, produciendo un
ovocito secundario y el primer corpúsculo
polar. Después de la ovulación cada
ovocito continúa hasta la metafase de la
meiosis II. La meiosis II se completa sólo si
se produce fecundación, lo que resulta en
un óvulo maduro fecundado y el segundo
corpúsculo polar.
IMPORTANCIA MÉDICA
DE LA MITOSIS Y LA
MEIOSIS
CAPÍTULO 2 DE LIBRO

Introducción al genoma humano -

Thompson & Thompson. Genética en
Medicina Octava edición
 Genética microbiana

Dra. Susana Aviles Viñas

Ingeniería Genética
Información genética en las bacterias
ADN
o (A-T)(G-C) interacciones G-C son
más fuertes que las interacciones
A-T
o Bases unidas a fosfo-2′-
desoxirribosa
o Orientación de las dos cadenas de
ADN es antiparalela (5′→3′ y 3′→5′)
o Cada giro de la hélice tiene un
surco mayor y un surco en espejo
o Longitud en pares de bases (bp) o
pares de kilobases (kbp)
 ARN
Información genética • Monocatenario
• U remplaza a T (A-U y C-G)
en las bacterias • La función es la comunicación de secuencias de genes de ADN en
forma de ARN mensajero (ARNm) a los ribosomas.( transcripción y
traducción)
 Ribosomas bacterianos

o 3 Tipos de ARNr (120- 5S,1540-16S y 2900- 23S bases)

o ARNt y ARNr tienden a encontrarse estables y
constituyen en conjunto más de 95% del ARN total en
la célula bacteriana
o Unas cuantas moléculas de ARN parecen funcionar
como enzimas (ribozimas) (50S, 30S y 70S)
 Genoma de las
células
eucariotas
• Diploides (dos homólogos)
• Genes recesivos y dominantes
• Haploides (1 sola copia de genes)
• Mitocondrias y cloroplastos (ADN)
• Levaduras (plásmidos o episomas)
 Genoma de células procariotas
• La mayoría de los genomas procariotas (>90%)
consisten en una única molécula de ADN circular
que contiene 580 kbp a más de 5 220 kbp de
ADN
• 98% de los genomas bacterianos son secuencias
codificadoras.
• Replicones o Episomas
• La transcripción de ARNm y la traducción por los
ribosomas se producen al mismo tiempo
• Islas de patogenicidad
• Genes constitutivos
• Genes con orígenes evolutivos independientes
• Transposones (elementos de inserción (IS))
 Genoma viral
o Los virus son capaces de sobrevivir, pero no de crecer,
en ausencia de una célula hospedera.
o La replicación del genoma viral depende de la energía
metabólica y de la maquinaria macromolecular sintética
del hospedero.
o Propagación exitosa de los virus se requiere: 1) una
forma estable 2) un mecanismo para la invasión, 3) la
información genética requerida para la replicación 4)
información adicional.
o Procariotas- bacteriófagos o fagos
o ADN viral eucariótico- provirus
o ADN viral Bacteriano- profago
o Los genomas de los fagos pueden estar compuestos de
ADN bicatenarios (ADNds), el ARN bicatenario (ARNds),
ARN monocatenario, o ADN monocatenario (ADNss)
o Estructuras especializadas en forma de jeringa (colas)
Replicación de ADN bacteriano

oADNds- replicación semiconservadora.

oADN bacteriano- Replicación
semiconservadora (bidireccional,
horquilla de replicación)
oEl origen (ori) y terminación (ter)
oTopoisomerasas
Replicación de Fagos
• Fagos moderados (profago) La
especificidad de la integración
está determinada por la identidad
de la secuencia de ADN, contienen
genes requeridos para la
replicación lítica ó replicación
vegetativa y Desrepresión
• Fagos líticos(muchas copias 1
brote) ADNds lineal
• ADNss (forma replicativa
bicatenaria circular)
• ARNss (partículas extracelulares
más pequeñas que contienen
información)
 Transferencia de ADN
• El intercambio genético bacteriano se tipifica
mediante la transferencia de un fragmento
relativamente pequeño de un genoma donador
a una célula receptora, seguido de una
recombinación genética.
• Restricciones (enzimas de restricción y
compatibilidad)
• Mecanismos de recombinación (homologa o no
homologa)
• Mecanismos de transferencia génica
(horizontal y vertical)
Tres amplios
mecanismos
median el
movimiento
eficiente del ADN
entre las células:
• conjugación,
• transducción
• transformació.
 Ingeniería genética
la ingeniería basada en la genética
bacteriana ha transformado a la
biología.
Las colonias bacterianas o clones
portan genes específicos que pueden
identificarse por hibridación de ADN
o ARN con sondas marcadas
Los genes aislados se pueden utilizar
para una variedad de propósitos
mutagénesis dirigida
Los productos proteínicos de los genes
virales aislados ofrecen una gran
promesa como vacunas
las proteínas como la insulina que
tienen funciones útiles se pueden
preparar en grandes cantidades a
partir de bacterias que expresan los
genes clonados
 ingeniería genética

Preparación de fragmentos de ADN

con enzimas de restricción
Enzimas de restricción
• Selectivas
• reconoce predominantemente
palíndromos
• longitud variable (4 a 15 bases): 4-
produce fragmentos de 250 bp, 6 –
4 Kbp, 8 – 64 Kbp. + de 10 utiles
para construcción de mapa físico)
Separación física de fragmentos de
ADN de tamaño diferente

• Electroforesis en gel- permite que

los fragmentos de ADN se separen
según el tamaño
• Tinción- Bromuro de etidio
• Electroforesis en gel en campo de
pulsos- separación de fragmentos
de ADN que contienen hasta 100
kbp
 Clonación de fragmentos de
restricción de ADN

• ADN con extremos cohesivos

(adhesivos) se utilizan para formar
plásmidos recombinantes diseñados
genéticamente
• Transformación forzada- introducción
de un plásmido recombinante a una
célula bacteriana
 Manipulación del ADN
Clonado
• Las técnicas de ingeniería genética permiten la
separación y la expresión totalmente independiente de
genes asociados con patógenos.
• Las vacunas preparadas con genes diseñados permiten
medidas de seguridad previamente inalcanzables.
• Los principales avances científicos a veces han
provocado reacciones públicas adversas, por lo que es
prudente considerar las posibles consecuencias de la
ingeniería genética.
• La mayoría de las preocupaciones inmediatas son los
patógenos conocidos que han sufrido modificaciones
genéticas relativamente leves. Estos han sido y deben
ser investigados en laboratorios especialmente
diseñados para contenerlos.
CAPÍTULO 7:
Genética microbiana
Jawetz, Melnick & Adelberg
Microbiología Médica, 28e
Gracias
 Genómica y
proteómica en
odontología

Genética
Mendeliana

Dra. Susana Alejandra Aviles Viñas

 Introducción
Revisión del
programa

1. Introducción: Video
2. Presentación del contenido: Genética
mendeliana
3. Exploración del tema
4. Cierre: Actividad de conclusiones
Genética Mendeliana

https://www.youtube.com/watch?v=obMqm84A18k
 Charles Darwin pro Pangénesis

Aristóteles anti Pangénesis Joseph Gottlieb Kölreuter

Polen e hibridos

Antecedentes
Hipócrates (Pangénesis)
Gregor Mendel
Variaciones Discontinuas
Aquellos caracteres que se presentan únicamente en dos
formas alternativas
Para estudiar las variaciones
discontinuas es necesario:

1) Determinar con exactitud el

número de las diferentes
formas que aparecen en la
descendencia de los híbridos;
2) Agrupar estas formas por
separado en las distintas
generaciones;
3) Describir sus relaciones
matemáticas exactas.
Monohíbridos:
Primera Ley de Mendel

• Guisantes rugosos/lisos.
• Guisantes amarillos/verdes.
• Vainas en posición axial/terminal.
• Vainas hinchadas/arrugadas.
• Vainas verdes/amarillas.
• Flores violetas/blancas (o la
envuelta de la semilla gris/blanca,
respectivamente).
• Tallo de la planta alto/enano.
Pisum sativum
Monohíbridos:

1- Crear lineas
puras

Primera Ley de
Mendel
 2- Cruzar 2
lineas puras
(producto F1)
Monohíbridos:
 Monohíbridos:

• Cada planta debería tener

dos copias de ese
«factor»,
• Cada planta pasa a la
descendencia sólo una de
sus copias,
• Una de las formas domina
sobre la otra
• Estos factores se
transmiten a la
descendencia de forma
totalmente aleatoria

3- Autofecundar F1
 Primera ley
de Mendel
I. los factores que determinan la
herencia se encuentran en dos
formas alternativas y cada
individuo lleva dos copias
(idénticas o distintas), de las
cuales sólo una se transmite a la
descendencia;
II. cada una de esas dos copias
tiene la misma probabilidad de
pasar a la descendencia, es
decir, se transmiten de modo
totalmente aleatorio;
III. una de las formas de cada factor
domina sobre la otra, de modo
que cuando las dos copias son
distintas, el carácter se
manifiesta como si las dos
copias fuesen iguales para la
forma dominante.
Primera ley de
Mendel

Nomenclatura
moderna
 Cuadrados de Punnett

Métodos gráficos
 Método ramificado

Métodos gráficos

Como Rr y rR son iguales, tenemos las

proporciones genotípicas 1/4 RR, 1/2 Rr y
1/4 rr, o lo que es lo mismo 1:2:1.
Experimentos de
confirmación
• Cruzamientos prueba
(retrocruzamiento)

• Autofecundar plantas
de la F2
Cruzamientos
prueba
(retrocruzamiento)
Autofecundación
de las F2
Dihíbridos y
Trihíbridos:
Segunda
Ley de
Mendel
Segunda Ley de Mendel: dihíbridos y trihíbridos

Al cruzar dos plantas de la F1 tendríamos 16 posibles tipos de cruces:

R/r a los alelos liso/rugoso y V/v a los alelos amarillo/verde

1 / VVRR, / VVRr, / VvRR, / VvRr, / VVrr, / Vvrr, / vvRR, / vvRr y / vvrr.

16 2 16 2 16 4 16 1 16 2 16 1 16 2 16 1 16
Segunda Ley de Mendel: dihíbridos y trihíbridos
Debido a la dominancia del liso y del amarillo, estos nueve genotipos dan lugar
solamente a cuatro fenotipos en las siguientes proporciones: 9/16 amarillos/lisos,
3/16 amarillos/ rugosos, 3/16 verdes/lisos y 1/16 verdes/rugosos.

La Segunda Ley— establece que las parejas de

factores segregan no sólo al azar, sino además de
manera independiente para caracteres distintos.
 Cruce
trihíbrido

• 64 combinaciones
diferentes
• 27 genotipos
distintos,
• 8 fenotipos
diferentes en
proporciones
27:9:9:9:3:3:3:1.
Calcular el número de posibles gametos, genotipos y fenotipos

Si n es el número de caracteres distintos que estudiamos, cada uno de ellos

controlado por un gen con dos alelos, el número de gametos posible será 2n, el
número de posibles genotipos es 3n, y el número de posibles fenotipos es también
2n. Así, para tres genes tendríamos ocho gametos posibles que originan 64
combinaciones agrupadas en 27 genotipos y ocho fenotipos distintos.
n= caracteres (liso/rugoso, amarillo /verde, violeta/blanca) =3
Gametos= 2n =2x2x2=8
Genotipos=3n=3x3x3=27
Fenotipos=2n=2x2x2=8
 Morgan, Sturtevant, Muller y Bridges

La teoría cromosómica
de la herencia
https://www.timetoast.com/timelines/historia-
de-la-biologia-molecular-fde205d0-2a4d-
45d8-99c8-68734658d06f
Walter Sutton en 1902
 La teoría cromosómica
de la herencia

i) los dos alelos de cada gen se

localizan en la misma posición
(locus) en cromosomas
homólogos, y segregan al azar a
los gametos gracias a la
separación de los cromosomas
durante la meiosis; ii) genes
distintos segregan de manera
independiente (4º postulado de
Mendel) porque se localizan en
cromosomas distintos.
Bibliografía
Genética Mendeliana (Capitulo 7)
La Genética en el campo de la
Biomedicina- Francisco Javier
Novo Villaverde
 Genómica y
Proteómica en
Odontología

Docente: Dra. Susana Avilés Viñas

Introducción
Revisión del
programa

1. Introducción: revisión del

programa
2.Presentación del contenido:
3.Exploración del tema
4.Cierre: Actividad de
conclusiones
Genómica y Proteómica en
Odontología
Importancia para la formación
Anahuac:

El Cirujano Dentista Anahuac aplica las

ciencias genómicas en el diagnóstico y
tratamiento de los pacientes de tal manera
que se preserve siempre la integridad y
dignidad de las personas a quienes brinda
sus servicios o de aquellas que se
benefician de las investigaciones médicas
del profesionista.
Objetivos generales
El alumno:

1. Realiza mapeos genéticos en poblaciones

especificas recolectando e interpretándola
información adquirida.
2. Propone acciones de intervención, favorables
para poblaciones específicas con base a
resultados genómicos y proteómicos
confiables.
3. Priorizar el desarrollo de la genómica y la
proteómica para el desarrollo
interdisciplinario en la clínica traslacional
de Medicina y Odontología del siglo XXI.
4. Vincula el aprendizaje del programa con las
asignaturas: Ser Universitario, persona y
sentido de vida
Calendario Escolar

15 semanas = 15 sesiones
 Criterios de evaluación y
acreditación

Parcial 1- 20%
Actividades periodo 1- 10%
Parcial 2- 20%
Actividades periodo 2- 10%

Evaluación final: 40%

Contenido del curso
1 Genética
1.1 Marcadores genéticos
1.2 Genética mendeliana
1.3 Genética microbiana
1.4 Genética poblacional
2 Modelos genómicos
2.1 Biologia celular, células y
genomas

2.2 Biologia molecular

3 Genómica evolutiva
3.1 Filogenético y filogenómica,
evolución molecular
4 Genómica funcional
4.1 Estructura y función del
genoma en eucariontes y procariontes
4.2 Genes responsables de la
replicación y transcripción

5 Genómica integrativa
5.1 Células germinales y somáticas
5.2 Etapas embrionarias y capas
germinales
5.3 Plasticidad genómica y celular
5.4 Células troncales, meristemos y
blastemas
6 Genómica humana
6.1 Genoma y genes codificantes
6.2 SNIPs, CNVs y haplotipos
6.3 Medicina genómica
 7 Perfil de
riesgo

7.1 Fomentar la
evaluación del perfil de
riesgo para el manejo de
cada paciente.
8 Aplicación de catálogos de
asociación de genomas (GWAS)
8.1 Bioinformatica y bases de datos
8.2 Big Data de la salud (Juno
Therapeutics)
9 Triada genómica
9.1 Integrar los factores de riesgo genomico a
través de manejo de Genoma, Microbioma y Epigenoma
Humano
10 Exposoma humano 11 Nutrigenómica y nutrigenetica
10.1 Evaluación de factores de
riesgo en el exposoma 11.1 Metaboloma y Redox Biológico
individual
12 Farmacogenómica y
farmacogenética
12.1 Intervención
farmacogenética y citocromo
12.2 Analisis de la variabilidad
genética en los bancos
farmacológicos
12.3 Desarrollo de medicamentos
más potentes y más seguros.
 Objetivo:

Panorama general de las ciencias OMICAS (génomica)

Estudio de los genes

Gregor Mendel (1865) Oswald Avery, William James Wattson y Francis

MacLeod y Maclyn Crick (1953)
McCarty (1944)
 Genómica
✓Era pre-genómica
✓Era post-genómica

Se dedica al mapeo, secuenciación y análisis de las funciones de los genomas completos.

Ramas de la genómica
✓Genómica estructural-
Caracterización física de los genomas
completos

✓Genómica funcional-emplea las

técnicas de análisis masivo para el
estudio de genes, proteínas y
metabolitos
 Estudio global
de las
patologías
humanas
Hoy en día la genómica forma parte
integral de las ciencias biomédicas
y ha comenzando a modificar la
práctica médica con el
establecimiento de mejores métodos
de diagnóstico y pronóstico
 Secuenciación
masiva
✓ Detectar la presencia simultánea
de miles de mutaciones que, en
ciertos casos, están directamente
asociadas con la evolución de la
enfermedad
✓ La secuenciación del genoma
humano reveló la existencia de
variaciones en el DNA de cada
persona
✓ Crecimiento exponencial en la
obtención de datos
✓ proyecto de los 1000 genomas
(2008) se identificaron todas las
diferencias genéticas subyacentes
que determinan la resistencia o la
susceptibilidad a ciertas
enfermedades
Microarreglos
Consiste en una serie de
sondas unidas a un soporte
sólido que tiene una
disposición ordenada del
genoma. Sobre esta serie se
hibrida una muestra del
DNA o RNA que se desea
estudiar
 Proteómica

Rama de la genómica que se dedica al estudio del proteoma

Metabolómica

el objetivo de la
metabolómica es
caracterizar los
metabolitos
producidas en una
célula, tejido u
organismo en
circunstancias
determinadas.
Bioinformática
Herramientas
matemáticas
y de cómputo
Conclusiones
El surgimiento de
nuevos campos de
conocimiento, como las
ciencias ómicas, ha
incrementado el
conocimiento de
diversas patologías
humanas
Bibliografia

Rev Med Inst Mex Seguro Soc. 2014;52(5):566-73