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Grado en Medicina
ENZIMAS
SUSTRATO
APOENZIMA COFACTOR
→
O
COENZIMA
HOLOENZIMA
+ → Enzima + cofactor
(catalíticamente activo)
ENZIMAS: Cofactores y Coenzimas
Sustrato
Mg2+
ENZIMAS: Cofactores y Coenzimas
Ej. de cofactor: Fe2+ unido al grupo prostético hemo de la
hemoglobina
Grupo hemo
Cofactores: EJEMPLOS DE COFACTORES
COFACTOR ENZIMA
Son iones inorgánicos: Cu2+
Citocromo Oxidasa, Amino
Oxidasa
Cu2+, Fe2+, Fe3+, Citocromo Oxidasa, Peroxidasa,
Fe2+ o Fe3+
K+, Mg2+, Mn2+, Catalasa
K+ Piruvato Quinasa
Ni2+, Se , Zn2+ Hexoquinasa, Glucosa-6-fosfatasa
Mg2+
Piruvato Quinasa
Arginasa, Ribonucleótido
Mn2+
Reductasa
Ni2+ Ureasa
Se Glutatión peroxidasa
Alcohol deshidrogenasa,
Zn2+
Carboxipeptidasas A y B
Los COENZIMAS son transportadores de grupos.
Se unen de forma transitoria.
Ej.: Coenzima A; transportador de grupos acilo.
ApoenzimaEnzima acetil-transferasa
=O
Coenzima –S–C–CH3
–S–H
Coenzima A Coenzima A con grupo
(CoA) acilo (acetil CoA)
Otras coenzimas con transportadores transitorios de
electrones.
H O 2 e– H H O
C C
Ej.: NADH. NH2 NH2
2 H+ + H+
:
O–––CH2 O N N
NADH
–– –– –– ––
O=P–O– R (Reducido)
O
O=P–O–
Adenina
O–––CH2 O
NAD+
(Oxidado)
Coenzimas
Enzima Dihidrofolato reductasa.
Reducción de DiHidroFolato a TetraHidroFolato.
DHF → THF
Cofactor: NADH → NAD+.
Las coenzimas provienen de las
Vitaminas B.
En frutas y verduras.
EJEMPLOS DE COENZIMAS
Reacción catalizada por la
Precursor Coenzima
holoenzima
Tiamina (Vit. B1) Tiamina Pirofosfato Descarboxilación de oxoácidos
Riboflavina (Vit. B2) FAD, FMN Oxido-reducción
Niacina o ác. Nicotínico (Vit. B3) NAD+, NADP+ Oxido-reducción
Ác. Pantoténico (Vit.B5) Coenzima A Síntesis, oxidación de ác. grasos
Transaminación,
Piridoxina (Vit. B6) Piridoxal Fosfato
descarboxilación, racemización
Biotina (Vit B7) Biocitina Carboxilación
CLASE FUNCIÓN SUBCLASES
Deshidrogenasas, Oxidasas,
Transferencia de Reductasas, Peroxidasas,
1. Oxidorreductasas
electrones Catalasa, Oxigenasas,
Hidroxilasas
Transaldolasas y Transcetolasas,
Transferencia de grupos
2. Transferasas Fosforiltransferasas, Quinasas,
funcionales
Fosfomutasas
Esterasas, Glucosidasas,
Peptidasas, Fosfatasas,
3. Hidrolasas Reacciones de hidrólisis Tiolasas, Fosfolipasas,
Amidasas, Desaminasas,
Ribonucleasas
CLASE FUNCIÓN SUBCLASE
Condensación dependiente de
6. Ligasas Sintetasas, Carboxilasas
hidrólisis de ATP
2. Transferasas, ejs.: Transferencia de grupos funcionales.
Aciltransferasa (utiliza coenzima A):
Colesterol-OH + Ester de colesterol (1 ác. graso)
Fosfatidilcolina (2 ác. grasos) + Lisofosfatidilcolina (1 ác. graso)
+ +
H
2. Transferasas, ejs.: Transferencia de grupos funcionales.
Fosfotransferasa: transfiere un grupo Pi.
Glc +ATP → Glc-6P +ADP
+
3. Hidrolasas, ejs.: con agua se rompe enlace condensación.
Glucosidasa:
Almidón (Maltosa)n + …
Peptidasa:
Trp-Ser-Asn-Arg-Thr Trp-Ser + Asn-Arg-Thr
Fosfatasa:
O- O-
R-O-P-O- R-OH + HO-P-O-
O O
4. Liasas, ejs.: rompe y forma doble enlace o viceversa.
Aldolasa:
Fru 1-6 biP Gliceraldehído 3P + Dihidroxiacetona-P
O-
-O-P-O- O-
O -O-P-O-
O
O- +
-O-P-O-
O
O-
-O-P-O-
O
4. Liasas, ejs.: rompe y forma doble enlace o viceversa.
Descarboxilasa (Con coenzima Tiamina Pirofosfato):
Piruvato (COO--CO-CH3) → Acetaldehído (CHO-CH3)
Piruvato
descarboxilasa
5. Isomerasa, ejs.: conversión de isómeros.
Epimerasa:
Galactosa Glucosa
Isomerasa:
Fructosa Glucosa
6. Ligasas, ejs.: condensación dependiente de hidrólisis ATP.
Sintetasa:
Asp + Gln Glu + Asn
ATP ADP
Carboxilasa:
Acetil CoA (CH3-CO-SCoA) Malonil-CoA (COO--CH2-CO-SCoA)
ATP ADP
CO2
Fructosa 1,6 P → Dihidroxiacetona-3P + gliceraldehído-1P
Maltosa + H2O → Glucosa + glucosa
Glucosa-6P → Fructosa-6P
COO–
– – –
Glucosa + ATP → Glucosa-6P + ADP HOCH
CH2
Piruvato + CO2+ ATP → Oxalacetato + ADP + Pi COO–
L-Malato
COO–
COO– ATP ADP
– – –
C=O
– –
C=O
CH2
CH3 COO–
CO2 Pi COO–
– – –
C=O
Piruvato Oxalacetato CH2
COO–
Malato+ NAD+ → Oxalacetato+ NADH + H+ Oxalacetato
EC1.2.3.4. (Enzyme Comission): http://enzyme.expasy.org/
1-Nombre de la clase o tipo de reacción.
2-Subclase o grupo funcional modificado.
3-, 4-Aspectos específicos de la reacción.
EC2.7.1.1 → hexoquinasa
2=transferasa.
7=fosfotransferasa.
1=grupo hidroxilo como aceptor.
1=D glucosa como aceptor del grupo fosforilo.
ATP + creatina ADP + fosfocreatina
• Nombre sistemático:
Grupo transferido
Donador Aceptor
Enzyme
comission
EC 2.7.3.2 Aceptor del
grupo donado
Grupo aceptor
1. Enzimas: Composición y Clasificación
2. Mecanismo de acción
3. Energía de Activación y Estado de Transición
4. Modelos de funcionamiento
5. Mecanismo de unión y catalítico
6. Uso de las enzimas en Medicina
S + E ES EP E + P
Enzima Enzima
UNIÓN A
CENTRO ACTIVO
CATÁLISIS
Centro
activo +
SUSTRATO
Residuos Polares COMPLEJO
ENZIMA Residuos Apolares
Residuos Polares ENZIMA-
Residuos Apolares SUSTRATO
¿Para qué son necesarias las enzimas?
Determinan la velocidad de una reacción.
La espontaneidad energética (valor de ΔG),
no afecta a la velocidad.
Energía libre, G
ΔG‡S→P ΔG‡
P→S
Estado de transición:
momento molecular en el que Estado ΔGº
basal (S) Estado
es igual de probable que se basal (P)
forme P o S.
Coordenada de la reacción
Energía libre, G
ΔG‡
S
P
Coordenada de la reacción
Energía libre, G
ΔG‡Sin Cat.
ΔG‡Cat
S ΔGM
P
Coordenada de la reacción
Energía libre, G
ΔGM
‡ ΔG‡Sin Cat.
ΔG‡Cat.
S
P
Coordenada de la reacción
El modelo implica escasa especificidad con el sustrato. No es real.
Hay complementariedad con estado de transición.
Hay compensación de energía en el estado de transición superando
la barrera de activación.
Explica la transición a producto.
Modelo de encaje inducido de Koshland:
Modelo guante-mano.
La unión enzima-sustrato provoca la
deformación del centro activo.
Hay especificidad por el sustrato.
Al cambiar la conformación hay compensación de
E y complementariedad con el estado de transición.
Explica la transformación en producto.
Explica todo
Modelo del encaje inducido:
1. Enzimas: Composición y Clasificación
2. Mecanismo de acción
3. Energía de Activación y Estado de Transición
4. Modelos de funcionamiento
5. Mecanismo de unión y catalítico
6. Uso de las enzimas en Medicina
¿Cómo consiguen las enzimas rebajar la energía de
activación?
Compensando mediante la Energía de Fijación.
Sucede al unirse E+S:
Se alinean grupos que van a reaccionar.
Se crean interacciones débiles.
Aa catalíticos
La unión y catálisis sucede en el Centro activo. Posee:
a) Sitio de unión:
Aa de unión.
Aa de unión
Aa de unión
b) Aa catalíticos:
Aa que transforman S en P.
Aa catalíticos
¿Cómo se reordenan los enlaces covalentes?
1. formación de enlaces entre enzima-sustrato.
2. transferencias de grupo.
Catálisis ácido-base.
Catálisis covalente.
:
– –
R–N–C–R’
–
δ+
R–N–C–R’ H O– R–NH2
=
H H
–
H O +
–
–
δ– Gly Ser –O
C–R’
O
Catálisis covalente: Nucleófilos Electrófilos
Se debe a grupos –O–
O cargado negativamente –C–
:R
nucleófilos-electrófilos:
=O
(ácido carboxílico ionizado)
C de un grupo carbonilo
son átomos inestables con –S– (el O del carbonilo atrae e– del C)
S cargado negativamente
e– de más o de menos. (grupo sulfihdrilo ionizado) :R
+
C=N–
– –
–
–C–
La cercanía de estos Carbanión
H
Grupo imino protonado
grupos provoca (activado para el ataque
– –
–N: nucleofílico sobre el C por
interacciones que Grupo amino no cargado protonación de la imina)
O
desestabilizan el S para :R
–
O–P=O
HN N:
convertirse en P.
–
O
P de un grupo fosforilo
Imidazol
:R
H–O– H+
Ión hidróxido Protón
Ejemplos de catálisis covalente:
http://depa.fquim.unam.mx/proteinas/enzcatal/liszquim.html
Rotura de un Polisacárido de 6 Sustratos de 2 y 4 unidades.
Catálisis por iones metálicos.
Ej. Hidrólisis del ATP
El Mg2+ cambia la polaridad del Pi.
Desestabiliza al ATP para convertirse en producto.
Base: H–O–(Ser)
:
O– O– O–
– =
– =
– =
–O–P~O–P~O–P–O–CH Adenina
2
O O O H H
H H
Mg2+
OH OH
1. Enzimas: Composición y Clasificación
2. Mecanismo de acción
3. Energía de Activación y Estado de Transición
4. Modelos de funcionamiento
5. Mecanismo de unión y catalítico
6. Uso de las enzimas en Medicina
A veces tienen componente molecular adicional:
1. Cofactor o Coenzima
HOLOENZIMA
2. Apoenzima (Proteína)
SUSTRATO
APOENZIMA COFACTOR
→
O
COENZIMA
HOLOENZIMA
+ → Enzima + cofactor
(catalíticamente activo)
CLASE FUNCIÓN SUBCLASES
Deshidrogenasas, Oxidasas
1. Oxidorreductasas Transferencia de electrones
…
Transferencia de grupos Transaldolasas y
2. Transferasas
funcionales Transcetolasas …
3. Hidrolasas Reacciones de hidrólisis Esterasas, Glucosidasas …
Rompen enlaces C–C, C–N o
Descarboxilasas, Aldolasas
4. Liasas C–S, y forma doble enlace en la
…
molécula resultante o viceversa
Transferencia de grupos dentro
5. Isomerasas Racemasas, Epimerasas …
de la molécula
Condensación dependiente de
6. Ligasas
hidrólisis de ATP Sintetasas, Carboxilasas …
S + E ES EP E + P
Enzima Enzima
UNIÓN A
CENTRO ACTIVO
CATÁLISIS
Estado de
Transición (‡)
Energía libre, G
‡ ΔG‡Sin catalizar
ΔG‡Catalizado
S
P
Coordenada de la
reacción
El modelo de encaje inducido explica
el mecanismo enzimático
La alta especificidad E-S
La complementariedad entre el centro
activo y el estado de transición
La compensación entre energía de
fijación y energía de activación
¿Cómo consiguen las enzimas rebajar la energía de
activación?
Compensando mediante la Energía de Fijación.
Sucede al unirse E+S:
Se alinean grupos que van a reaccionar.
Se crean interacciones débiles.
:
ácido-base – –
R–N–C–R’
–
δ+
R–N–C–R’ H O– R–NH2
=
H H
–
H O Catálisis +
–
–
2. Diagnóstico.
3. Terapéutica.
4. Farmacología.
Enzimopatías
Anemia hemolítica por deficiencias
enzimáticas:
▪ Glucosa 6-P deshidrogenasa.
▪ Piruvato quinasa.
Albinismo
▪ Tirosinasa.
Enzimopatías:
Enfermedades del almacenamiento del glucógeno:
▪ Enfermedad de von Gierke: Glucosa 6-fosfatasa.
▪ Enfermedad de Pompe: Glucosidasa 1-4 y 1-6.
▪ Enfermedad de Cori: Enzima desramificadora .
Hepatomegalia
Porfiria: deficiencia en síntesis de
Hemoglobina (del grupo prostético).
▪ Síntoma exclusivo de una de ellas:
lesiones provocadas por el sol.
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_to_paula
Hemofilia: deficiencia en una enzima coagulante.
▪ Síntoma: rotura de microvasculatura en articulaciones.
Pruebas analíticas:
Glicemia (Glc en sangre): Glucosa oxidasa.
Enzimas de escape:
▪ TGO, TGP: Transaminasas: daño hepático.
▪ LDH, CPK: daño celular: tumores o hepatitis.
▪ Lipasa, Amilasa: pancreatitis.
Marcadores tumorales:
▪ Fosfatasa ácida.
▪ PK-M2.
2. Diagnóstico: Enzimas de escape
COO- COO-
COO- COO- +
+ C O H3N CH
H3N CH C O
+ CH2 + CH2
CH2 CH2
CH2 CH2
COO- COO-
COO- COO-
- COO- - COO-
COO COO +
+ C O H3N CH
H3N CH C O
+ CH2 + CH2
CH3 CH3
CH2 CH2
COO- COO-
Alanina Piruvato
-Cetoglutarato Glutamato
Creatin kinasa, EC 2.7.3.2 (CK, CPK)
CH3 CH3 O
ATP ADP
N CH2 COOH N CH2 CO O P O-
HN C HN C
NH2 O-
NH2
Deficiencias enzimáticas:
Insuficiencia pancreática: Pancreatina.
Intolerancia a la lactosa: Lactasa.
Blancos terapéuticos:
Inflamación, AINES: Ciclooxigenasas Cox-1 y Cox-2.
Hipertensión, Captopril: ECA.
SIDA, Zidovudina: Transcriptasa reversa.
SIDA, Saquinavir: Proteasas de HIV.
Trombosis: anticoagulantes, heparina.
Diseño de fármacos:
Enfermedad ácido péptica, Omeprazol: H+-ATPasa.
Inflamación, Rofecoxib: Cox-2.
Antibióticos, Cefalosporinas: penicilin acilasa.
Hace 20 años, una muestra de sangre fue recogida en la
escena de un crimen para poder realizar un test de DNA y ser
utilizada como prueba de acusación en el juicio.
El abogado defensor propone que el test no es fiable ya que
sabe que las reacciones de hidrólisis del DNA tiene una ΔG
negativo.
Concluye que por ese motivo el DNA se ha degradado
espontáneamente después de todo este tiempo, y que ahora
no sirve.
Te llaman como testigo experto de la acusación por tus
conocimientos en Bioquímica y debes explicar que no es
correcto. ¿Qué dirías?
LIBROS Y TEXTOS:
Baynes (Elsevier)
Lehningher (Omega)
IMÁGENES:
Alberts (Garland Science)
albinismopr.wordpress.com
www.uvs.sld.cu
www.diariomedico.com
www.disgoo.com
http://biomanbio.com/GamesandLabs/LifeChemgames/Enzymatic.html