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Cinética de las
reacciones monosustrato
Contenidos
Introducción
Definición y propiedades generales
Coenzimas y grupos prostéticos
Nomenclatura y clasificación
Cinética de las reacciones químicas
Determinación de la actividad enzimática
Cinética de las reacciones monosustrato
Definición
Los enzimas son catalizadores biológicos
(generalmente proteínas) que incrementan la velocidad
de las reacciones en las que participan, sin que ellos sufran
cambios y sin modificar la posición de equilibrio del proceso.
A + B ⇔ C + D
reactantes
sustratos productos
Naturaleza de los enzimas
orgánico
APOENZIMA COENZIMA
• Proteínas inactivas + COFACTOR
HOLOENZIMA ión metálico
Los coenzimas
Precursor Coenzima Grupo transferido
Tiamina (Vit B1) Tiamina pirofosfato aldehidos
Riboflavina (Vit B2) FAD electrones
Niacina (Vit B3) NAD+ iones hidruro (:H-)
Piridoxina (Vit B6) Piridoxal fosfato grupos amino
El NAD+
Vitamina B3
(niacina)
NAD+
NADP+
El FAD
Vitamina B2
(riboflavina)
FAD reducido
Propiedades de los enzimas
• Alto poder catalítico (Condiciones de reacción moderadas)
Sistemas multienzimáticos
No emplear terminaciones –asa
Isoenzimas
Nomenclatura y clasificación
El nombre sistemático está compuesto por el nombre del dador y del aceptor
separados por dos puntos (:), seguido de la palabra oxidorreductasa.
A-X + B A + B-X
El segundo número indica el tipo
general de grupo transferido, y el
tercero el grupo transferido
concreto, excepto en el caso de
grupos fosfato (EC2.7.x.y), en
cuyo caso el tercer número
depende del tipo de aceptor.
L- alanina D-alanina
Nombre sistemático alanina racemasa
Código numérico EC 5. 1. 1. 1
Nombre trivial: alanina racemasa
Ligasas
Catalizan reacciones de formación de enlaces con ruptura de un NTP,
siguiendo una de las ecuaciones generales siguientes:
Number Name
EC 7.1 Catalysing the translocation of hydrons
EC 7.1.1 Linked to oxidoreductase reactions
EC 7.1.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
EC 7.1.3 Linked to the hydrolysis of diphosphate
EC 7.2 Catalysing the translocation of inorganic cations
EC 7.2.1 Linked to oxidoreductase reactions
EC 7.2.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
EC 7.2.4 Linked to decarboxylation
EC 7.3 Catalysing the translocation of inorganic anions and their chelates
EC 7.3.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
EC 7.4 Catalysing the translocation of amino acids and peptides
EC 7.4.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
EC 7.5 Catalysing the translocation of carbohydrates and their derivatives
EC 7.5.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
EC 7.6 Catalysing the translocation of other compounds
EC 7.6.2 Linked to the hydrolysis of a nucleoside triphosphate
Glucosa oxidasa
Glucosa + H2O + O2 Ac. Glucónico + H2O2
ABTS RED
Peroxidasa
ABTS OX
H2O
velocidad inicial v0
x
t
Velocidad y reacciones de 1er orden
k
Una reacción del tipo A → B
Se dice que es de 1er orden porque v ∝ k [A]
Las unidades de las k de primer orden son s-1 Cte de velocidad
k
Para una reacción simple S→ P
tenemos que v = k [S]
Para acelerar la reación, los enzimas aumentan
el valor de k (obviamente no cambian la [S])
¿Cómo?
‡/RT
Según la ecuación de Arrhenius k = cte. e-G
cte. preexponencial = factores espaciales y frecuencia de colisión
R = constante universal de los gases
T = temperatura de la reacción (en ºK)
G‡ = energía de activación
La energía de activación
Afecta a la velocidad
∆G‡ (no catalizada) (al ↓ ∆G‡ ↑ k )
SUSTRATO
Energía libre
Afecta al sentido de
∆G la reacción pero no
a su velocidad.
∆G no cambia por
PRODUCTOS acción del enzima.
Progreso de la reacción
Factores que contribuyen al valor de ΔG‡
v v
[S] [S]
[E]
Esto explica que las unidades de actividad enzimática tienen dimensiones de velocidad
Unidades de actividad enzimática
A B
pH
Factores que afectan a la velocidad de
las reacciones catalizadas por enzimas
S
Concentración de sustratos S
S
I S
I
Activadores I I S
E
Inhibidores
I
I
I I
Dependencia de la velocidad de la
concentración del sustrato
Vmax [ST]
v=
Km
[ST] +
v Ecuación de Michaelis-Menten
kcat[ET] [ST]
v=
[ST] + Km
[ST]
El modelo del equilibrio (Henri & Brown)
k1 k2
para una reacción del tipo E + S → ES → E + P
k-1
k1 k2
para una reacción del tipo E + S → ES → E + P
(k-2)
k-1
Dos intermediarios
Tres intermediarios
Dos productos
Significado de Vmax y kcat
• Solamente en el modelo del equilibrio coincide con la constante de disociación Ks del complejo ES
• Puede considerarse como una constante de disociación aparente del enzima respecto al sustrato o
productos. Es indicativa de la afinidad por sustratos y/o productos.
k
luego v = cat [E][S]
Km
kcat
Km
Es una cte aparente de velocidad (2º orden)
k-1+ k2 kcat k2 k1 k1 k2
Si Km = Km
= Recordemos que E + S → ES → E + P
k1 k-1+ k2
k-1
La relación kcat / Km tiene un valor máximo
Cuando NO SE CUMPLE la hipotesis de equilibrio El valor máximo de k1 es del orden 107 – 109 M-1s-1
kcat1 kcat2
v1 = [E1][S1] v2 = [E2][S2]
Km1 Km2
V1 kcat1/Km1 [S1]
= Si además hacemos que [S1] = [S2]
V2 kcat2/Km2 [S2]
V1 kcat1/Km1
=
V2 kcat2/Km2
La relación de Haldane
Para una reacción catalizada en el equilibrio
v+ kcat+/Km+ [Seq]
=
v- kcat-/Km- [Peq]
[Peq] kcat+/Km+
Keq = = -
[Seq] kcat /Km-
Cálculo de Km y Vmax
Al representar V frente a [S] tenemos La ecuación de Lineweaver - Burk
Vmax
1 Km 1 1
= +
v Vmax [S] Vmax
Km [S]
- 1 1
Vmax Km [S]
si [S] <<<<< Km v= [S]
Km
v
[S]
Limitaciones de las linealizaciones
El error experimental
Cuando no se cumple [ET] «« [ST]
(El método de Dixon)
Resumen
La Vmax no es una “constante”, es la máxima velocidad inicial
para una concentración dada de enzima