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INTRODUCCION AL

METABOLISMO
METABOLISMO
CARACTERISTICAS Y FUNCIONES

El metabolismo es el conjunto de todas las transformaciones químicas que se producen


en una célula o en un organismo.

Características generales

El entramado metabólico lo componen cientos de reacciones químicas organizadas en


“rutas o vías” metabólicas, de todas ellas, solo unas pocas son reacciones clave para el
normal funcionamiento de las células u organismos.

Las biomoléculas importantes del metabolismo son menos de 100.

Hay unas pocas vías metabólicas centrales que son similares en todas las células vivas.
Las numerosas rutas metabólicas están controladas de forma similar y responden a
patrones de regulación simples.

Funciones del metabolismo

Obtener energía química (ATP) degradando nutrientes ricos en energía o a partir de la


energía solar.

Obtener precursores biosintéticos derivados de la degradación de nutrientes.

Sintetizar las macromoléculas biológicas a partir de los precursores (convertir los


nutrientes en componentes celulares)

Sintetizar y degradar biomoléculas necesarias para funciones especializadas (hormonas,


alcaloides, pigmentos, etc.)

ORGANIZACIÓN

Todos los procesos metabólicos de una célula u organismo se pueden dividir en dos
grandes grupos:

• Los procesos degradativos dirigidos a obtener energía e intermediarios


metabólicos. En conjuntos constituyen el CATABOLISMO celular.

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• Los procesos biosintéticos dirigidos a construir componentes celulares y
biomoléculas especializadas. En conjunto constituyen el ANABOLISMO celular.

Las reacciones químicas de ambos grupos se disponen de en “rutas o vías” metabólicas.


Cada ruta metabólica está constituida por una secuencia de reacciones químicas catalizadas
por enzimas. En ella, un precursor se convierte en un producto a través de una serie de
intermediarios (metabolitos).

Las rutas metabólicas son UNIDIRECCIONALES, es decir, están desplazadas del equilibrio
y pueden ser lineales, ramificadas o cíclicas.

Las rutas metabólicas están COMPARTIMENTADAS. Se desarrollas en lugares específicos


de las células.

ESTRATEGIAS METABOLICAS

CATABOLISMO:

• Degradativo, oxidativo.
• Genera energía, produce ATP.
• Los intermediarios finales son materias primas del anabolismo
• Genera desechos que se excretan al entorno
• “LISIS”

ANABOLISMO

• Sintético, reductivo
• Utiliza energía, consume ATP
• Los productos finales son materias primas del catabolismo
• “GENESIS”

COMPARTIMENTO

NUCLEO:

• Replicación del DNA


• Síntesis tRNA y mRNA
• NUCLEOLO: síntesis de rRNA

RETICULO ENDOPLASMATICO:

• Síntesis de lípidos
• Transporte intracelular

RIBOSOMAS:
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• Síntesis de proteínas

GOLGI:

• Maduración de glucoproteínas y otros componentes de las membranas

CITOSOL:

• Glucolisis, parte de gluconeogénesis; pentosas fosfato


• Síntesis de ácidos grasos
• Síntesis de nucleótidos

MITOCONDRIAS:

• Oxidación de piruvato
• Ciclo de Krebs
• Fosforilación oxidativa
• Oxidación de ácidos grasos
• Catabolismo de aminoácidos

REGULACIÓN

La velocidad del flujo en las vías metabólicas se está adaptando se está adaptando
continuamente a las necesidades fisiológicas de la célula (organismo). Estos se consigues
con diferentes mecanismos de regulación:

• Control de cantidad de enzimas


o Cambios en la velocidad de síntesis o degradación (o ambos)
• Control de la velocidad de la enzima
o Mecanismos comunes
▪ Disponibilidad de sustratos o cofactores, pH, temperatura…
o Mecanismos específicos
▪ Unión reversible de moléculas reguladores (enzimas alostéricas)
▪ Cambios covalentes en la estructura de la enzima: reversible
(fosforilación) o irreversible.
▪ Auto asociación de la proteína.
▪ Interacción con las proteínas.
o Comportamiento celular (control flujo sustratos)
o Regulación por señales extracelulares (coordinación)
▪ Hormonas
▪ Factores de crecimiento
o La carga energética de la célula en la señal reguladora global.

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El Quid de la cuestión (La carga energética)

GLUCOLISIS

• Es la ruta de DEGRADACIÓN de glucosa (y otros azúcares equivalentes) para obtener


energía.
• Tiene lugar en el citosol de las células
• Es básicamente un proceso anaeróbico (no requiere oxigeno).
• La oxidación de glucosa conduce a piruvato y se lleva a cabo en diez etapas. La energía
liberada en la ruta queda almacenada temporalmente en dos moléculas de ATP y otras
dos de NADH.
• La ruta consta de dos fases:
o Fase preparatoria: consume energía
o Fase de beneficios/resultados: libera energía
• La ruta glucolítica puede resumirse en la siguiente reacción general:

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FASE PREPARATORIA

FASE DE BENEFICIOS

REACCIONES DE LA GLUCOLISIS
1. Fosforilación de la glucosa

La unión de la glucosa a la
hexoquinasa se lleva a cabo por ajuste
inducido (video).

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2. Isomerización de la glucosa-6-fosfato

3. Fosforilación de la glucosa-6-fosfato

4. Escisión aldólica de la fructosa-1,6-bisfosfato

5. Interconversión de triosas fosfato

6. Oxidación de gliceraldehido-3-fosfato e incorporación de fosfato a la vía

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Mecanismo de acción de la Gliceraldehido-3-fosfato deshidrogenasa

7. Fosforilación a nivel de sustrato

8. Isomerización del 3-fosfoglicerato

El 2,3-bisfosfoglicerato es un
intermediario de la reacción.

9. Deshidratación del 2-fosfoglicerato

10. Fosforilación a nivel de sustrato

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REGULACIÓN DE LA VÍA GLUCOLÍTICA

Las tres reacciones irreversibles catalizadas por la hexoquinasa, fosfofructoquinasa y


piruvato quinasa son la clave para la regulación de la glicolisis.

La fructosa-2,6-bisfosfato es un activador alostérico de la Fosfofructoquinasa y es capaz


de revertir el efecto inhibidor del ATP.

La piruvatoquinasa está regulada por efectores alostéricos y por fosforilación


reversibles.

DESTINOS DEL PIRUVATO EN ANAEROBIOSIS

En ausencia de oxígeno se recurre a la


fermentación como destinos del
piruvato. Existen la fermentación láctica
y la fermentación alcohólica.

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Fermentación del Piruvato a Lactato

En ausencia de oxígeno los animales reducen el piruvato a lactato para regenerar el


NAD+ requerido por las enzimas glicolíticas. Esta reacción permite a las células seguir
trabajando cuando hay pocos ATP.

Si convertimos el piruvato en lactato según la reacción:

2Piruvato + 2NADH+ + 2H+ → 2Lactato + 2NAD+

REACCION GENERAL:

GLUCOSA + 2ADP + 2Pi + 2H+ → 2Lactato + 2ATP +2H2O

Fermentación de Piruvato a Etanol

En ausencia de oxígeno las levaduras


convierten el piruvato en etanol en dos
etapas. De este modo regeneran el NAD+
necesario para la ruta glicolítica. El piruvato
pasa a acetaldehído con la ayuda del
piruvato descarboxilasa y algunas coenzimas, después se redice a etanol.

Si convertimos el piruvato en etanol según la reacción:

2Piruvato + 2NADH + 2H+ → 2Etanol + 2CO2 + 2NAD+

REACCIÓN GENERAL:

Glucosa + 2ADP + 2Pi +2H+ → 2Etanol + 2CO2 + 2ATP + 2H2O

INCORPORACIÓN DE OTROS AZUCARES A LA RUTA GLUCOLÍTICA

Todos los carbonos de los azúcares se pueden utilizar para la ruta metabólica.

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GLUCONEOGÉNESIS

En la ruta metabólica que conduce a la síntesis de glucosa a partir de precursores que no


son hidratos de carbono.

Los sustratos gluconeogénicos son lactato,


piruvato, glicerol, alanina y los esqueletos
carbonados de algunos aminoácidos.

La gluconeogénesis se produce en los


mamíferos principalmente en el hígado y en
mucha menor medida en el riñón.

PANORÁMICA DE LA RUTA

Muchas reacciones de la glucólisis que son reversibles


se utilizan para sintetizar glucosa. Sin embargo, la
gluconeogénesis no es el resultado de la simple inversión
de la ruta glucolítica.

Las etapas irreversibles de la ruta glucolítica catalizadas


por la hexoquinasa, fosfofructoquinasa y piruvatoquinasa
se tienen que sortear mediante reacciones por enzimas
diferentes.

La ruta de la glucólisis esta desplazada hacia el


piruvato, por la que hay que evitar las reacciones
irreversibles; para ello, se sigue otro camino en esos
pasos, las enzimas rojas.

DE PIRUVATO A FOSFOENOLPIRUVATO

Para la reacción de piruvato a fosfoenolpiruvato son necesarias dos etapas que


consumen energía:

• La piruvato carboxilasa convierte el piruvato en oxalacetato. Se pasa de tener 3


carbonos a 4, hay que añadir un carbono, lo que requiere energía que se obtiene
del ATP:

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• La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa transforma el oxalacetato en
fosfoenolpiruvato. Se requiere la energía de la hidrolisis del GTP y se pierde un
carbono en forma de CO2:

DE PIRUVATO A OXALACETATO

La piruvato carboxilasa utiliza la biotina como coenzima para incorporar CO2 al


esqueleto carbonado del piruvato.

La biotina está unida covalentemente a la enzima mediante un enlace amida en el que


participa un residuo de lisina.

El mecanismo de la reacción es complejo y transcurre en dos fases:

1. El CO2 se activa y se incorpora a la biotina formándose el intermediario


carboxibiotinil-enzima:

2. La enzima transfiere el CO2 al piruvato para formar oxalacetato. La biotina


actúa en el metabolismo como un transportador de unidades de carbono
(CO2) actividades.

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DE OXALACETATO A FOSFOENOLPIRUVATO

La fosfoenolpiruvato carboxiquinasa descarboxila


y fosforila a la vez el oxalacetato para dar
fosfoenolpiruvato.

La reacción está impulsada por la ruptura de un


enlace fosfoanhidrido del GTP.

DE FOSFOENOLPIRUVATO A FRUCTOSA 1,6 BISFOSFATO

Una vez sintetizado, el fosfoenolpiruvato es


metabolizado por las enzimas de la glucólisis en el
sentido de la formación de dos triosas-fosfato que se
condensan para dar lugar a fructosa-1,6-bisfosfato.

Todas estas reacciones están muy próximas al


equilibrio y se desplazan en un sentido o en otro
dependiendo de las condiciones intracelulares.

DE FRCTUSA-1,6-BISFOSFATO A GLUCOSA

Hay que sortear dos etapas irreversibles:

1º. La fructosa bisfosfatasa cataliza la


desfosforilación de fructosa-1,6-bisfosfato
a fructosa-6-fosfato.

2º. La glucoas-6-fosfato es hidrolizada por la


glucosa-6-fosfatasa liberando glucosa y
ortofosfato.

BALANCE ENERGÉTICO

El balance energético de la gluconeogénesis:

2Piruvato + 4ATP + 2GTP + 2NADH + 6H2O → Glucosa + 4ADP + 2GDP + 6Pi +


2NAD+ + 2H+
∆Go´ = - 38 KJ/mol

Permitir distinguir inequívocamente esta ruta de la reacción inversa de la glucolisis cuyo


balance sería:

2Piruvato + 2ATP + 2NADH + 2H+ + 2H2O → Glucosa + 2ADP + 2Pi + 2NAD+


∆Go´ = + 85 KJ/mol

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REGULACIÓN DE LA GLUCONEOGÉNESIS

Las reacciones clave para la regulación de la gluconeogénesis son las reacciones


catalizadas por las tres enzimas especificas de esta ruta metabólica.

La piruvato carboxilasa es activada por la Acetil-CoA, cuando la concentración de


intermediarios aumenta, se activa la ruta. La piruvato carboxilasa y el fosfoenol piruvato
carboxilasa son inhibidas por ADP, cundo la carga energética es baja. La fructosa-1,6-
bisfosfatasa es activada por el citrato, cuando el nivel de intermediario es alto e inhibida
por la fructosa-1,6-bisfosffato que activa el camino de la glucolisis e inhibe la
gluconeogénesis, y por el AMP, cuando la carga energética es baja. Esta ruta biosintética
funcionará cuando haya suficientes metabólicos.

REGULACIÓN COORDINADA DE AMBAS RUTAS

LA GLUCONEOGÉNESIS Y LA GLUCÓLISIS SE REGULAN DE MANERA RECÍPROCA

Ambas rutas están coordinadas de modo que una de ellas suele estar casi inactiva
mientras la otra está muy activa. Esto se consigue regulando simultáneamente de manera
coordinada las enzimas características de cada ruta, de modo que ambas rutas no están
muy activas al mismo tiempo, los activadores de una de las rutas suelen ser inhibidores de
la otra y viceversa. Como regla general, cuando la glucosa es abundante, predomina la
glucolisis, mientras que cuando la glucosa escasea, se impone la gluconeogénesis.

REGULACIÓN COORDINADA: POR LA CARGA ENERGÉTICA

Cuando aumenta la carga energética, se


para la glucólisis y se activa la
gluconeogénesis. Cuando la carga energética
disminuye, se para la gluconeogénesis (hay un
nivel de energía bajo para la biosíntesis).

Las rutas se ajustan, pero nunca se aran ni


se activan completamente, normalmente
estarán 95% - 5%.

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REGULACIÓN COORDINADA: POR FRUCTOSA-2,6-BISFOSFATO

Cuando la concentración de fructosa-2,6-


bisfosfato aumenta, se activa la glucólisis y se
detiene la gluconeogénesis.

REGULACIÓN COORDINADA: POR ACCIÓN HORMONAL

Cuando los niveles de glucosa son bajos, una hormona (glucagón) activa una señal (para
parar la glucolisis y activar la gluconeogénesis), esta señal provoca el aumento de AMPc,
una quinasa dependiente del AMPc
fosforila la enzima bifuncional. Cuando
la enzima bifuncional está sin fosforilar,
el dominio quinasa es activo y el
dominio fosfatasa no. Cuando la
enzima está fosforilada, es activo el
dominio fosfatasa.

DESTINOS DEL PIRUVATO EN AEROBIOSIS: Acetil-CoA y Ciclo de


Krebs

La respiración celular proporciona más energía que la glucólisis. La oxidación completa


de piruvato hasta CO2 permite extraer más energía de la molécula de glucosa, es un proceso
que consume oxígeno y ocurre en 3 etapas:

1. Producción de Acetil-CoA
2. Oxidación de Acetil-CoA hasta CO2
3. Transferencia de electrones y fosforilación oxidativa

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ESTRUCTURA Y CARACTERISTICAS DE ACETIL-CoA

El Acetil-CoA aporta dos carbonos que se van a oxidar en el ciclo del ácido cítrico. La
coenzima A más ácido acético dan lugar al Acetil-CoA. Los tioésteres de la CoA son
moléculas activadas de alta energía.

PROCEDENCIA Y DESTINO DEL ACETIL-CoA

El Acetil-CoA proviene de la degradación de la glucosa, degradación de ácidos grasos y


degradación de algunos aminoácidos. Es oxidado en el ciclo del ácido cítrico y puede ser
utilizado como precursor en síntesis de ácidos grasos, síntesis de algunos aminoácidos y en
otros procesos.

Complejo Piruvato Deshidrogenasa

El complejo está formado por 3 enzimas y sus grupos prostéticos. El complejo cataliza la
descarboxilación del piruvato y se encuentra en la matriz mitocondrial.

• E1: Piruvato deshidrogenasa (descarboxilación oxidativa del piruvato)


• E2: Dihidrolipoamida acetiltransferasa (Transferencia del grupo acetilo a la
coenzima A)
• E3: Dihidrolipoamida deshidrogenasa (regeneración de la forma oxidada de la
lopiamida)

Coenzima del Complejo Piruvato Deshidrogenasa

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Reacciones del Piruvato Deshidrogenasa

CICLO DEL ÁCIDO CÍTRICO: Una ruta anfibólica


ESTRATEGIA GENERAL DEL CICLO DEL ÁCIDO CITRICO

Es una ruta metabólica cíclica (no lineal): Los


intermediarios se regeneran.

En cada vuelta del ciclo se introducen 2 carbonos, en


forma de acetilo (Acetil-CoA), y su equivalente será
totalmente oxidado, liberándose 2 moléculas de CO 2.

La energía libre de la oxidación se conserva en forma


de coenzimas reducidos (NADH y FADH2).

Localización: Matriz mitocondrial.

ETAPAS ENZIMÁTICAS DEL CICLO DEL ACÍDO CÍTRICO

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1. Acetil-CoA entra en el ciclo de Krebs por condensación con Oxalacetato (OAA)

Para evitar que el Acetil-CoA se hidrolice antes de


unirse al oxalacetato, se forma un intermediario (el
citril-CoA) y este será el que hidrolice.

2. Citrato se isomeriza a Isocitrato

En esta reacción de isomerización se cambia los sustituyentes de 2 carbonos.

3. Isocitrato se oxida y se descarboxila generando α-ceto-glutarato

4. La segunda descarboxilación oxidativa conduce a Succinil-CoA

5. Etapa de conservación de la energía

6. Oxidación del Succinato a Fumarato

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7. Hidratación del Fumarato a L-Malato

8. Oxidación del Malato regenera OAA

BALANCE DEL CICLO DEL ÁCIDO CÍTRICO

Cada acetil-CoA que entra en el ciclo origina:

• 3 NADH
• 1 FADH2
• 1 GTP (o 1 ATP)
La oxidación de cada NADH 2.5 ATP

La oxidación de cada FADH2 1.5 ATP

La oxidación de un Acetil-CoA 10 ATP

REGULACIÓN DEL CICLO DEL ÁCIDO CÍTRICO

La disponibilidad de Acetil-CoA es un control


importante (piruvato deshidrogenasa) junto a la
regulación de enzimas en las primeras etapas del
ciclo.

El estado energético de la celula y la


disponibilidad de coenzimas oxidados en la
mitocondria, determinan la actividad del ciclo.

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Carácter Anfibólico del Ciclo del Ácido Cítrico

REACCIONES ANAPLERÓTICAS

Estas reacciones sirven para reponer intermediarios del ciclo cuando se necesitan. La
más importante es la catalizada por el piruvato carboxilasa.

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