Grupos A y B: 05/10/22

SP-4
En la secuencia del genoma de E. coli
a) Determinar la posición y organización de los genes que participan en la replicación

Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655

NC_000913.3

dnaA dnaN

gene complement(3880148..3881221)
/gene="recF"

gene complement(3881221..3882321)
/gene="dnaN"

gene complement(3882326..3883729)
/gene="dnaA"

gene 3884026..3884106
/gene="ysdD"

Conclusiones
• recF, dnaN y dnaA son genes adyacentes o contiguos, codificados en la banda
negativa
• DI (distancia intergénica) entre dnaN y dnaA es de 4 nucleótidos
• recF y dnaN comparten un nucleótido (no hay DI)
• dnaA, dnaN y recF están organizados en operón: dnaA es el primer gen y dnaN el
segundo gen de este operón de tres genes.
 Grupos A y B: 05/10/22
dnaB
gene complement(4263248..4264231)
/gene="qorA"

gene 4264314..4265729
/gene="dnaB"

gene 4265782..4266861
/gene="alr"
Conclusiones
• dnaB, y alr son genes adyacentes, codificados en la banda positiva
• DI entre estos genes es de ~ 50 nt (nucleótidos)
• dnaB y alr están organizados en operón: dnaB es el primer gen de este operón de
dos genes

dnaG
gene 3210781..3210996
/gene="rpsU"

gene 3211107..3212852
/gene="dnaG"

gene 3213047..3214888
/gene="rpoD"
Conclusiones
• rpsU, dnaG y rpoD son genes adyacentes, codificados en la banda positiva
• DI entre rpsU y dnaG es de ~110 nucleótidos
• DI entre dnaG y rpoD es de ~ 194 nt
• dnaG está aislado.
 Grupos A y B: 05/10/22
dnaE
gene 204493..205089
/gene="rnhB"

gene 205126..208608
/gene="dnaE"

gene 208621..209580
/gene="accA"
Conclusiones
• rnhB, dnaE y accA son genes adyacentes, codificados en la banda positiva
• DI entre rnhB y dnaE es de ~36 nucleótidos
• DI entre dnaE y accA es de ~ 11 nt
• rnhB, dnaE y accA están organizados en operón: dnaE es el segundo gen de este
operón de tres genes.

dnaQ
gene complement (235535..236002)
/gene="rnhA"

gene 236067..236798
/gene="dnaQ"

gene 236931..237007
/gene="aspV"

Conclusiones
• dnaQ y aspV son genes adyacentes, codificados en la banda positiva
• DI entre dnaQ y aspV es de ~132 nucleótidos
• dnaQ está aislado.