Doble hélice ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras

antiparalelas.
Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.

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Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.
Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.
Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.
Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.
Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.
Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.
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antiparalelas.
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antiparalelas.
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antiparalelas.

SURCO MAYOR

SURCO MENOR
 Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.

El DNA existe en la forma “B” la

mayoría del tiempo en las
células. Es la forma clásica de
Watson y Crick

Se encuentra la forma “A” en RNA

doble hebra, híbridos de RNA/DNA
y en algunas secuencias como
regiones ricas en purinas

La forma “Z” es rara, pero

secuencias ricas en
repeticiones de GC
(GCGCGC etc.) forman Z-
DNA fácilmente.
Doble hebra de ADN Estructura helicoidal, formada por dos hebras
antiparalelas.
 Ley Chargaff
Chargaff (1949) analizó el contenido
molar del DNA de distintos
organismos. De su investigación se
desprenden 4 conclusiones:
(A+G) = (T+C)*
* Ácidos nucleicos de doble hebra
• La composición de bases en el DNA varía entre
organismos
• El DNA aislado desde distintos tejidos de un
mismo organismo presenta la misma composición
de bases.
• La composición de bases en el DNA de un
organismo no varía con la edad, estado nutricional
o cambios ambientales.
• En todos los DNA celulares (sin importar la
especie) el número de adeninas (A) es igual al de
timinas (T) y el número de guaninas (G) es igual al
de citosinas (C).
• De esta relación se obtiene que la suma de las
purinas es igual a la suma de las pirimidinas.
 Ley Chargaff

• Una especie X tiene 30% de Adenina en su

DNA. ¿Cuáles son las proporciones de A, T, C y
G en este organismo?
Ley Chargaff
Factores que
distorsionan el ADN

• Factores de transcripción
• Represoras
• Histonas

Distorción de la doble hélice resultando de la unión de una proteína

Estructura terciaria del
ADN
Estructura terciaria del
ADN
Desnaturación del DNA

• Puentes de hídrogeno entre las hebras

complementarias pueden ser rotos por
temperatura o álcalis.

• La temperatura en la cual la mitad de los

puentes son rotos se llama Tm

• La Tm depende en el contenido de GC

• Es posible a renaturar las hebras

complementarias
Desnaturación del DNA
Desnaturación del DNA

H- T
Para el proceso de
hibridación
H <0
<0
Desnaturación del DNA
Desnaturación del DNA

0
 El ARN

A diferencia del DNA, se

encuentra mayoritariamente
como simple hebra y para MONOCATENA
estabilizarse forma “estructuras RIO
secundarias” entre sus bases
complementarias

La desoxirribosa Ribosa

La Timina (T) Uracilo (U)

 El ARN

Los ácidos nucléicos de

mono hebra pueden
asumir varias estructuras
secundarias a través de
puentes de hídrógeno. Las
estructuras tienen
relevancia biológica
(especialmente común en
moléculas de RNA)
El ARN
El ARN
El ARN
El ARN

Mensajero
mRNA contiene un copia de
la información existente en
el DNA en forma de
codones.
El ARN

Transferencia
tRNA transporta los aminoácidos al
lugar de síntesis. Es específico para
cada aminoácido.
 El ARN

Ribosómico

rRNA asociado con proteínas,

forma parte de la estructura
ribosomal.
Estructura de
ácidos nucleicos II

Dr. Carlos Felipe Vera vera

carlos.vera.v@usach.cl
 Funciones metabólicas
relevantes

• -Reservorio de la información
genética
• Síntesis de proteínas
• Metabolismo energético
• Regulación de la activad enzimática
• Traducción de señal
• Forman parte de coenzimas
• Metabolismo de carbohidratos y
lípidos
 Funciones metabólicas
relevantes

• -Reservorio de la información
genética
• Síntesis de proteínas
• Metabolismo energético
• Regulación de la activad enzimática
• Traducción de señal
• Forman parte de coenzimas
• Metabolismo de carbohidratos y
lípidos

The significance of Mg in prebiotic geochemistry. DOI:10.1111/j.1472-4669.2012.00323.x

 Funciones metabólicas
relevantes

• -Reservorio de la información
genética
• Síntesis de proteínas
• Metabolismo energético
• Regulación de la activad enzimática
• Traducción de señal
• Forman parte de coenzimas
• Metabolismo de carbohidratos y
lípidos
 Funciones metabólicas
relevantes

• -Reservorio de la información
genética
• Síntesis de proteínas
• Metabolismo energético
• Regulación de la activad enzimática
• Traducción de señal
• Forman parte de coenzimas
• Metabolismo de carbohidratos y
lípidos
 Funciones metabólicas
relevantes

• -Reservorio de la información
genética
• Síntesis de proteínas
• Metabolismo energético
• Regulación de la activad enzimática
• Traducción de señal
• Forman parte de coenzimas
• Metabolismo de carbohidratos y
lípidos
 Funciones metabólicas
relevantes

• -Reservorio de la información
genética
• Síntesis de proteínas
• Metabolismo energético
• Regulación de la activad enzimática
• Traducción de señal
• Forman parte de coenzimas
• Metabolismo de carbohidratos y
lípidos
 Funciones metabólicas
relevantes

• -Reservorio de la información
genética
• Síntesis de proteínas
• Metabolismo energético
• Regulación de la activad enzimática
• Traducción de señal
• Forman parte de coenzimas
• Metabolismo de carbohidratos y
lípidos
 Otras bases nitrogenadas
que forman parte del ADN

• La 5-metilcitosina es parte del DNA

bacteriano y de seres humanos.
• 5-hidroximetilcitosina es parte de
ADN y ARN de bacterias y virus.
• La adenina y guanina mono- y di-N-
metiladas están presentes en mRNA
de mamífero, regulando de la vida
media de los mRNA.
 Otras bases nitrogenadas
que forman parte del ADN

• La 5-metilcitosina es parte del DNA

bacteriano y de seres humanos.
• 5-hidroximetilcitosina es parte de
ADN y ARN de bacterias y virus.
• La adenina y guanina mono- y di-N-
metiladas están presentes en mRNA
de mamífero, regulando de la vida
media de los mRNA.
 Otras bases nitrogenadas
que forman parte del ARN

• Los tRNAs tienen bases poco

frecuentes. Por ejemplo:

• Inosina, cuya base es la hipoxantina.

• Pseudouridina (diferente enlace n-
glicósidico)

• 7-metilguanosina (probable
marcador urinario de cáncer, se
encuentra en la caperuza 5’ de los
mARN eucariotas)

• Tiouridina (estabiliza la estructura de

trebol de los tARN)
 Otras bases Intermediarios del metabolismo de la
adenina y la guanina. Estimulantes del
nitrogenadas naturales sistema nervioso central

Cafeína
Café

Teobromina (cacao) Teofilina (té)

Neurobiología de las metilxantinas. DOI: 10.1016/S1575-0973(08)76368-2

 Análogos de bases
nitrogenadas y nucleósidos

En el tratamiento oncológico emplean 5-

fluorouracilo o 5-yodouracilo, 3-desoxiuridina,
6-tioguanina y 6-mercaptopurina, 5- o 6-
azauridina, 5- o 6-azacitidina y 8-azaguanina.
El alopurinol, usado en el tratamiento
de hiperuricemia y gota, inhibe la biosíntesis
de purina y la actividad de la xantina oxidasa.
 Análogos de bases
nitrogenadas y nucleósidos

La citarabina (arabinosil-citocina) se usa en la

quimioterapia de cáncer, y la azatioprina, que
se cataboliza hacia 6-mercaptopurina, se
emplea durante trasplante de órgano para
suprimir el rechazo inmunitario
 Análogos de bases nitrogenadas, Tratamiento de infecciones víricas. Muchos
nucleósidos y nucleótidos son ihibidores de la transcriptasa reversa

Análogo de Timidina
Análogo de Guanosina

La lamivudina, Tenofovir y entecavir son fármacos

que se utilizan para el tratamiento de las Análogo de GMP
infecciones víricas (VIH, virus de la hepatitis B. El
Adefovir utilizado para tratar la hepatitis B.

El aciclovir se usa en el tratamiento Aciclovir Entecavir

Lamivudina
del virus varicela-zóster y del herpes
simple. Es fosforilado hasta aciclo- Análogo de AMP
GTP, que cuando es incorporado Análogo de AMP
detiene la replicación del ADN

Adefovir Tenofovir
Reacciones químicas
de los nucleotidos

Dr. Carlos Felipe Vera vera

carlos.vera.v@usach.cl
Tautomerismo ceto-enol
Tautomerismo ceto-enol

Lactima Lactama Lactama Lactima

Lactima Lactama

Lactama Lactima
Tautomerismo ceto-enol
Apilamiento de bases
 Apilamiento de bases

• Se produce la interacción electrónica

entre las nubes de electrones de las
bases (interacciones hidrófobas).

• Se disminuye la tensión superficial

generada entre las bases y el agua. Al
disponerse el agua por fuera del
polinucleótido de una manera
ordenada, éste tiende aún más a
agregarse.
Formación de dimeros de
pirimidinas
 Hidroxilamina es
agente mutagénico

La hidroxilamina a pH ácido (5 a 6)
provoca la hidroxilación del 4-amino de la
citosina. Esta hidroxicitosina puede
aparearse con la Adenina, con lo que un
ácido nucleico que tenga el par C:G puede
pasar a T:A (transición).
 Hidroxilamina es
agente mutagénico

A pH muy alcalino (>10) reacciona

con los uracilos haciendo que se
hidrolice. No se hidrolizan ni afectan
(si el tratamiento no es drástico) los
enlaces fosfodiéster, por lo que se
puede conseguir una eliminación
selectiva de los uracilos en un RNA. Ribosilurea
Isoxazolona
 Bisulfito (HSO3-) es agente
mutagénico/ analítico

Las citosinas se convierten a uracilo

por acción del bisulfito-
 Bisulfito (HSO3-) es agente
mutagénico/ analítico

Las citosinas se convierten a uracilo

por acción del bisulfito y luego se
puede luego acoplar la reacción de
la hidroxilamina para eliminar los
uracilos, con lo que eliminaríamos
realmente las Citosina del DNA. Se
utiliza para determinar citosinas
metiladas por PCR mC->C U-> T.

PLoS One. 2010 Jan 26;5(1):e8888. doi: 10.1371/journal.pone.0008888.

Agente alquilantes

Los agentes alquilantes (ethyl methane sulphonate

G—C→A—T (EMS), diethyl sulphonate (DES), nitrosoguanidine (NG),
dinnethyl sulphonate (DMS)) son muy cancerígenos en
más del 90% de los casos, ya que son capaces de
metilar las bases nitrogenadas y las pentosas en menor
grado. Las purinas son las que muestran mayor
reactividad (principalmente las posiciones N7 y N3 de la
guanina), las pirimidinas son menos reactivas. Estas
metilaciones provocan la ruptura del enlace β-N-
glucosídico, por lo que han sido muy usados para las
despurinación de los ácidos nucleicos. En consecuencia
se obtienen todo tipo de mutaciones. También
favorecen la ruptura de los esqueletos ribosa-fosfato
 Ácido nitroso (HNO2)

El ácido nitroso provoca la desaminación

de las bases (pérdida de un grupo amino –
NH2 y aparición, en su lugar, de un grupo
oxo), con lo que la C → U, la A →
hipoxantina (la base del nucleótido inosina)
y la G → xantina. Esto provoca un cambio
de apareamiento de nucleótidos en todos
los casos, por lo que resulta mutágeno
 Hidrólisis básica del
enlace fosfodiéster

Mediante hidrólisis alcalina en NaOH

diluido se rompe el enlace P–O del
enlace fosfoéster en 5’ puesto que el 2’-
OH ataca al P y forma un intermediario
cíclico 2’-3’-fosfato que luego se
hidroliza por igual a 3’ o 2’ fosfato. Esta
hidrólisis solo ocurre en el RNA puesto
que es absolutamente dependiente del
2’-OH. De manera contraria a lo que
ocurre con la hidrólisis ácida del enlace
N-glucosídico, las purinas son más
resistentes a hidrolizar el 3’ fosfato de su
nucleótido que las pirimidinas.
 Hidrólisis ácida

Se puede separar la base nitrogenada

del esqueleto del polinucleótido
mediante la hidrólisis ácida con un ácido
débil, que protona el O de la pentosa.
Los desoxirribonucleótidos son muy
sensibles a este tratamiento, pero los
ribonucleótidos tienen el 2’-OH que
atrae electrones de la base y el O de la
pentosa es más difícil de protonar.
Las purinas (A, G) se hidrolizan antes
que las pirimidina. Si el tratamiento es
extenso se hidroliza también la pentosa
Desaminación de las Alteraciones espontaneas que dan origen
a mutaciones
bases nitrogenadas
107 resididos /24h …100 mutaciones/ día
105 resididos /24h G≡C a A=U
Secuenciación del DNA
Secuenciación del DNA
Secuenciación del DNA