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UNIVERSIDAD DE LAS FUERZAS ARMADAS

ESPE
INGENIERIA EN BIOTECNOLOGIA
BIOQUÍMICA I

Integrantes: Fernando Vivanco


Fecha: 24/02/2018 NRC: 3344
Tema: Cuestionario de Ácidos Nucleicos

PREGUNTAS DE REVISIÓN

Estas preguntas están diseñadas para poner a prueba el conocimiento del lector sobre los conceptos
clave expuestos en este capítulo, antes de pasar al siguiente. El lector puede comparar sus
respuestas con las soluciones que se proporcionan al final del libro y en la Guía de estudio de
apoyo, si así lo desea.

l. Defínanse los siguientes términos:

a. genética
Parte de la biología que estudia los genes y los mecanismos que regulan la transmisión de los
caracteres hereditarios.

b. replicación
La síntesis de DNA, que se denomina replicación, implica el apareamiento complementario de las
bases púricas y pirimídicas de las dos cadenas polinucIeotídicas que forman la hélice de DNA.

c. transcripción
La transcripción del ADN es el primer proceso de la expresión genética, mediante el cual se transfiere
la información contenida en la secuencia del ADN hacia la secuencia de proteína utilizando diversos
ARN como intermediarios. De esta manera, la transcripción del ADN también podría llamarse
síntesis del ARN mensajero.

d. esqueleto azúcar-fosfato
El esqueleto azúcar-fosfato (formado por una secuencia alternante de desoxirribosa y fosfato, unidos
por enlaces fosfodiéster 5'-3'). El esqueleto azúcar-fosfato está en el exterior de la hélice y lleva cargas
negativas en los grupos fosfato. In vitro, el ADN en solución las cargas se neutralizan por la unión de
iones metálicos, típicamente por Na+. In vivo, las cargas son neutralizadas por proteínas cargadas

e. bacteriófago
Los bacteriófagos son virus que infectan exclusivamente a las bacterias. Al igual que los virus que
infectan células eucariotas, los fagos están constituidos por una cubierta proteica o cápside en cuyo
interior está contenido su material genético, que puede ser ADN, de 5000 a 500 000 pares de bases.
El tamaño de los fagos oscila entre 20 y 200 nm aproximadamente.
2. Existen varias formas estructurales del DNA. Menciónense y descríbase cada forma.

El ADN existe en muchas conformaciones. Sin embargo, en organismos vivos sólo se han observado
las conformaciones ADN-A, ADN-B y ADN-Z.
 ADN-A
Aparece en condiciones de humedad escasa y menor temperatura.
Se trata de una doble hélice dextrógira, al igual que el ADN-B, con un surco menor poco
profundo y un poco más amplio que el surco mayor, que es más profundo. En comparación
a la doble hélice del ADN-B, ésta es más abierta, tiene mayor diámetro y una disposición de
las bases nitrogenadas más alejada del eje de la hélice. Las bases nitrogenadas están muy
inclinadas respecto de la horizontal, más próximas entre sí y localizadas más simétricamente
respecto al centro.
Los pares de bases no se encuentran formando ángulos rectos con el eje de la hélice, sino que
se inclinan 20° alejándose de la horizontal. Además, la distancia entre los pares de bases
adyacentes se reduce ligeramente, por lo que se encuentran 11 bp por vuelta de la hélice, en
lugar de los 10.4 bp que se observan en la forma B. Cada vuelta de la doble hélice se produce
en 2.5 nm, en lugar de en 3.3 nm, y el diámetro de la molécula se expande a cerca de 2.6 nm,
a diferencia de los 2.4 nm que se observan en el DNA B. La forma A del DNA se observa
cuando éste se extrae con solventes como el etanol. La importancia del DNA A en las
condiciones celulares radica en que la estructura de los dúplex de RNA y los dúplex de
RNA/DNA que se forman durante la transcripción se asemejan a la estructura del DNA A.

 ADN-B
Es la forma predominante en las células.
De 2,37 nm de diámetro, con dos cadenas antiparalelas y con los grupos azúcar-fosfato en el
exterior y las bases nitrogenadas en su interior. Los pares de bases A·T y G·C se sitúan casi
perpendicularmente al eje de la hélice. Dado que cada par de bases tiene el mismo tamaño,
se forma una estructura regular.

 ADN-Z
Esta conformación de ADN se configura como una doble hélice levógira (con giro hacia la
izquierda) con un esqueleto en zigzag. Esta configuración se genera en determinadas
secuencias, que alternan purinas y pirimidinas, especialmente con la alternancia
de deoxicitidina y deoxiguanosina.
La forma Z del DNA (que se llama así por su conformación en "zig-zag") se diferencia en
gran medida de la forma B. El DNA Z (D = 1.8 nm), que es considerablemente más angosto
que el DNA B (D = 2.4 nm), está enrollado en una espiral levógira que tiene 12 bp por vuelta.
Cada vuelta del DNA Z se produce en 4.5 nm, en comparación con los 3.3 nm del DNA B.
Los segmentos de DNA con bases púricas y pirimídicas alternas (en especial CGCGCG) son
los que con mayor probabilidad adoptan la configuración Z. En el DNA Z, las bases se apilan
con un patrón dimérico levógiro y escalonado, lo cual le proporciona al DNA la apariencia
de zigzag y su superficie plana sin surcos. Las regiones del DNA con abundantes repeticiones
de las bases CG a menudo son reguladoras, y se unen a proteínas específicas que inician o
que bloquean la transcripción. Aunque no es clara la importancia fisiológica del DNA Z, se
sabe que determinados procesos relevantes como la metilación y el superenrollamiento
negativo (que se discute en la pág. 642) estabilizan la forma Z. Además, se ha observado que
se forman segmentos cortos como consecuencia de la tensión de torsión durante la
transcripción.
3. Descríbase la estructura de orden superior del DNA que se denomina
superenrollamiento.

El ADN puede retorcerse como una cuerda en un proceso que se denomina superenrollamiento del
ADN (supercoiling, en inglés). Cuando el ADN está en un estado "relajado", una hebra normalmente
gira alrededor del eje de la doble hélice una vez cada 10,4 pares de bases, pero si el ADN está retorcido
las hebras pueden estar unidas más estrechamente o más relajadamente. 58 Si el ADN está retorcido
en la dirección de la hélice, se dice que el superenrollamiento es positivo, y las bases se mantienen
juntas de forma más estrecha. Si el ADN se retuerce en la dirección opuesta, el superenrollamiento
se llama negativo, y las bases se alejan. En la naturaleza, la mayor parte del ADN tiene un ligero
superenrollamiento negativo que es producido por enzimas denominadas topoisomerasas. Estas
enzimas también son necesarias para liberar las fuerzas de torsión introducidas en las hebras de ADN
durante procesos como la transcripción y la replicación.

4. Defínanse los siguientes términos:

a. reglas de Chargaff
La Ley de Chargaff se basa en la relación cuantitativa de los Nucleótidos que forman la doble hélice
del ADN, establece que la cantidad de Adenina( A) es igual a la cantidad de Timina( T), y la cantidad
de Guanina(G) es igual a la cantidad de Citosina(C), es decir, el n° total de bases purinas es igual al
n° total de bases pirimídinas( A+G= C+T), sin embargo existen diferencias en lo que respecta a la
relación AT/CG, comparado el ADN de un organismo eucariota con uno procariota. En los
organismos procariotas, virus, metafitas y metazoos inferiores hay un predominio de CG sobre AT,
en cambio, en las metafitas y metazoos superiores existe lo contrario más cantidad de AT sobre
CG.Solo las reglas de Chargaff y Col son aplicables a la molécula de ADN y no al ARN, porque el
ARN está formado por una secuencia lineal o de hélice simple de nucleótidos y por no poseer Timina,
en su lugar posee Uracilo.

b. efecto hipocrómico
El efecto hipercrómico es el incremento de absorbancia en un material. El caso opuesto es el efecto
hipocrómico. El caso más conocido es la hipercromicidad del ADN, que ocurre cuando
el dúplex se desnaturaliza, dando dos cadenas sencillas que absorben más en el ultravioleta. Esta
característica del ADN es una forma de seguir el proceso de desnaturalización de la molécula: a
medida que el proceso avanza, se observa un incremento en la absorbancia.

c. transposón
Un transposón o elemento genético transponible es una secuencia de ADN que puede moverse de
manera autosuficiente a diferentes partes del genoma de una célula, un fenómeno conocido
como transposición. En este proceso, se pueden causar mutaciones y cambio en la cantidad de ADN
del genoma. Anteriormente fueron conocidos como "genes saltarines" y son ejemplos de elementos
genéticos móviles.

d. familia Alu
Una secuencia Alu es un fragmento de ADN de aproximadamente 300 pares de bases que con ligeras
variaciones puede encontrarse en un gran número de lugares en el genoma de los primates. Las
primeras secuencias de este tipo se identificaron mediante la endonucleasa Alu, de la cual han
recibido su nombre, aunque actualmente se analizan mediante técnicas basadas en la reacción en
cadena de la polimerasa y electroforesis. Son las secuencias móviles más abundantes del genoma
humano. Derivan probablemente del gen 7SL ARN, que forma parte del complejo ribosomal. La
aparición de las secuencias Aluse sitúa hace aproximadamente 65 millones de años, coincidiendo con
el origen y expansión de los primates.

e. transcriptoma
El genoma humano está compuesto de ADN (ácido desoxirribonucleico), una molécula larga y
serpenteante que contiene las instrucciones necesarias para producir y mantener células. Estas
instrucciones se detallan en la forma de "pares de bases" de cuatro sustancias químicas diferentes,
que se organizan en 20,000 a 25,000 genes. Para que las instrucciones puedan llevarse a la práctica,
el ADN debe "leerse" y transcribirse, en otras palabras, copiarse para crear ARN (ácido ribonucleico).
Estas "lecturas" de genes se llaman transcritos, y un transcriptoma es una colección de todas las
lecturas de genes presentes en una célula.

5. Escríbanse tres propiedades biológicas facilitadas por el superenrollamiento.

En la actualidad se sabe que el superenrollamiento del DNA, que en un tiempo se consideró como un
artefacto de las técnicas de extracción del DNA, facilita diversos procesos biológicos. Entre los
ejemplos se encuentran el empaquetamiento compacto, la replicación y la transcripción del DNA.

6. Menciónense tres diferencias entre el DNA de las eucariotas y el de las procariotas.

7. Descríbase la estructura de un nucleosoma.

La unión de las histonas al DNA da lugar a la formación de nucleosomas, que son las unidades
estructurales de los cromosomas eucariotas. Las histonas, que son de cinco clases principales (Hl,
H2A, H2B, H3 Y H4), tienen estructuras primarias semejantes entre las especies eucariotas. En las
micrografías electrónicas, la cromatina tiene aspecto de cuentas. Cada una de estas "cuentas" es un
nucleosoma, que está formado por un segmento de DNA superenrollado que forma un rizado toroidal
alrededor de un núcleo de ocho histonas (dos copias de cada una de las histonas H2A, H2B, H3 Y
H4.
8. Defínanse los siguientes términos:

a. DNA satélite
Las repeticiones en tándem son secuencias de DNA en las que muchas copias están dispuestas cerca
unas de otras. Estas secuencias se denominaron originalmente DNA satélite debido a que forman una
banda separada o "satélite" cuando se fracciona en trozos el DNA genómico y se centrifuga para
separar los fragmentos mediante centrifugación por gradiente de densidad.

b. corte y empalme
El splicing de ARN, empalme de ARN o ayuste de ARN (del inglés RNA splicing, en
donde splice significa en inglés empalmar o unir, ayuste es un término marinero que se refiere al
empalme de dos cabos o piezas de madera) es un proceso post-transcripcional de maduración del
ARN del cual eliminan ciertos fragmentos secuenciales. Este proceso es muy común en eucariotas,
pudiéndose dar en cualquier tipo de ARN aunque es más común en el ARNm. También se ha descrito
en el ARNr y ARNt de procariotas y bacteriófagos. Normalmente consiste en eliminar
los intrones del transcrito primario y posteriormente unir los exones; aunque existen otros tipos de
ajuste donde se eliminan intrones y/o retienen exones.

c. método de terminación de la cadena


Técnica utilizada para la determinación de la secuencia de ADN a través del tamaño de partícula por
sedimentación en gel.

d. desnaturalización del DNA


Las fuerzas de unión que mantienen juntas las cadenas complementarias del DNA pueden romperse,
Este proceso, que se denomina desnaturalización, lo estimulan el calor, las concentraciones salinas
bajas y los valores de pH extremos

e. retroposón
Un retrotransposón (también llamados transposones a través de productos intermedios de ARN) son
elementos genéticos que se pueden amplificar a sí mismos en un genoma y son ubicuos componentes
del ADN de muchos organismos eucariotas.
Ellos son una subclase de transposón, y son particularmente abundantes en las plantas, donde a
menudo es un componente principal de ADN nuclear.

9. Descríbanse las diferencias estructurales entre el RNA y el DNA.

La estructura del ADN es de doble cadena, lo que confiere una mayor protección a la información
contenida en él.
La estructura de los ARN es monocatenaria aunque, puede presentarse en forma lineal como el ARNm
o en forma plegada cruciforme como ARNt y ARNr.

10. ¿Cuáles son las tres formas más comunes del RNA? ¿Qué funciones tienen en la
célula?

 ARN mensajero
ARN mensajero, consiste en una secuencia de nucleótidos que corresponde a la transcripción de un
trozo de DNA (gen). No obstante, esta transcripción no es siempre un proceso simple y directo. En
secuencias que contienen exones e intrones, el transcrito primario sufre una maduración durante la
que se cortan los intrones y se empalman los exones (splicing).
Su función es la de transportar la información genética del núcleo a los ribosomas en que son
transcritos.

 ARN de tranferencia
Los ARN de transferencia, son moléculas de ARN con estructura cruciforme, encargados de leer el
código del ARNm en los ribosomas e ir sintetizando la cadena de de proteína a partir de los
aminoácidos que tiene asociados a su estructura.
Existen tantos ARNt como aminoácidos codificables. Cada ARNt tiene en una parte de su estructura
la secuencia que codifica un aminoácido (anticodón) que se unirá al codón del ARNm. En la parte
opuesta tiene una parte diseñada para unirse al aminoácido que codifica el anticodón.

 ARN ribosómico
ARN ribosómico, es un ARN estructural que compone los ribosomas junto con proteínas. Parece ser
que tiene una función de enzimática al facilitar las interacciones para que el RNAm se acomode en el
ribosoma y sea leido por los RNAts, y al mismo tiempo facilita la interacción con proteinas
enzimáticas que posibilitan la formación de los enlaces peptídicos
Los ribosomas procarioticos tienen RNAr de tres tamaños 16S, 5S y 23S, los eucarioticos tienen 4
tamaños 18S, 5S, 5.8S y 28S
El ARNr es el que contribuye a dar a los ribosomas su forma acanalada, al condicionar la posición de
las proteínas, posibilitando la unión a su estructura del ARNm, de los ARNt y de la proteina que se
está sintetizando. Supone el 75% del RNA celular en procariotas y el 50% en eucariotas.

11. El DNA Z recibe su nombre de la conformación en zig-zag de los grupos fosfato. ¿Qué
características de la molécula de DNA permiten que se forme esta estructura distintiva?

En el DNA Z, las bases se apilan con un patrón dimérico levógiro y escalonado, lo cual le proporciona
al DNA la apariencia de zigzag y su superficie plana sin surcos. Determinados procesos relevantes
como la metilación y el superenrollamiento negativo estabilizan la forma Z, se forman segmentos
cortos como consecuencia de la tensión de torsión durante la transcripción.

12. Existe un par de bases cada 0.33 nm de DNA y la longitud total del DNA de una célula
humana es de 2 m. Calcúlese el número de pares de bases de una sola célula. Suponiendo
que en el cuerpo humano hay 1014 células, calcúlese la longitud total del DNA. Compárese
esta distancia con la que existe entre la Tierra y el Sol (1.5 X 108 km).

Existen cerca de 6 000 000 de pares de bases en una célula humana, al suponer que hay 1014 células
corporales, la longitud total del DNA en el cuerpo es de -2x1011km, lo que representa unas mil
veces la distancia de la Tierra al Sol.

13. Defínanse los siguientes términos:

a. telómero
Extremo de los brazos de un cromosoma, que evita que se adhiera a otros cromosomas, son regiones
de ADN no codificante, altamente repetitivas, cuya función principal es la estabilidad estructural de
los cromosomas en las células células eucariotas, la división celular y el tiempo de vida de las estirpes
celulares
b. minisatélite
Son repeticiones de secuencias de 9 a 100 pares de bases que se utilizan como marcador molecular.
El número de repeticiones es variable pero en general es menor a 1000.

c. perfil de DNA
Está compuesto por los valores alélicos que cada individuo presenta en las distintas regiones de ADN,
La prueba del perfil genético analiza 18 regiones de ADN y se entrega con el informe de alelos de
cada una de las regiones analizadas.

d. intrón
Es una región del ADN que forma parte de la transcripción primaria de ARN, pero a diferencia de los
exones, son eliminados del transcrito maduro, previamente a su traducción.

e. exón
Es la porción de gen que codifica aminoácidos. En las células de plantas y animales, la mayoría de
las secuencias de genes son alternadas por una o más secuencias de ADN llamadas intrones.

14. Una muestra de DNA contiene 21 % de adenina. ¿Cuál es su composición porcentual


de bases?

 21% timina
 29% guanina
 29% citosina

15. La temperatura de fusión de una molécula de DNA incrementa al aumentar el


contenido de bases GC. ¿Por qué?

A mayor proporción de C-G, mayor temperatura de fusión, pues la citosina y la guanina establecen
tres puentes de hidrógeno, mientras que la adenina y la timina sólo dos.

16. Defínanse los siguientes términos:

a. transversión
Las mutaciones por transversión, generadas por agentes alquilantes o radiación ionizante, se producen
cuando una pirimidina se sustituye con una purina o viceversa.

b. epigenética
Varios tipos de modificaciones de carácter covalente a los que son susceptibles de sufrir los residuos
aminoácidos de proteínas a las que se cambian sus propiedades estructurales y funcionales, además
de modificar la accesibilidad del DNA a factores de transcripción.

c. agente intercalador
Agente intercalador: Moléculas con la capacidad de distorsionar el DNA al insertarse (intercalarse)
entre los pares de bases apiladas de la doble hélice.

d. LINE
Long interspersed nuclear elements, elementos nucleares intercalados largos son los transposones no
LTR con longitudes mayores de 5 kb, estas secuencias poseen un promotor fuerte, una secuencia de
integración y las secuencias codificadas para las enzimas de transposición.
e. SINE
Short interspersed nuclear elements (elementos nucleares intercalados cortos) son retrotransposones
no LTR con menos de 500 bp. Aunque los SINE contienen secuencias de inserción, no pueden
experimentar transposición sin la ayuda de una secuencia LINE funcional.

17. Organícense los términos siguientes de forma jerárquica:


a. cromosoma
b. gen
c. nucleosoma
d. par de bases nucleotídicas

b, a, c, d