Nombre del Alumno: Karla Aguilar Durán

Matricula: A01657611
Materia: Aplicación de las Bases Moleculares
Fecha de Aplicación: 20/07/2021
Profesor: Dr. en C. José Bonilla Delgado
Evaluación: Primer Examen Parcial

Valor 40 pts.
1. Es el grupo funcional que le da al DNA y al RNA la propiedad de ácido:

a) Base nitrogenada. d) Fosfato.

b) Ribosa. e) Pirimidina.
c) Desoxirribosa. f) Purina.

2. Es la causa de inestabilidad intrínseca del RNA como polímero:

a) El hidrógeno unido al carbono 2’. d) El hidroxilo unido al carbono 2’.

b) El ataque por RNasas. e) “b” y “c” son correctas.
c) El superenrrollamiento. f) “b” y “d” son correctas.

3. Son algunas de las reglas propuestas por Erwin Chargaff:

a) Que el DNA sea dextrógiro. d) El principio de re-asociación del DNA.

b) [A+G]/[C+T]=1. e) “a” y “d” son correctas.
c) Distribución equitativa de f) “b” y “c” son correctas.
R y Y en ambas cadenas del dsDNA g) “b” y “d” son correctas.

4. Son datos obtenidos de la difracción de rayos X del DNA, excepto:

a) El DNA da una vuelta completa d) El radio de la doble hélice

cada 3.4 nm. mide 1 nm.
b) El surco menor tiene una e) Hay una distancia entre las
longitud de 0.34 nm. bases nitrogenadas adyacentes
c) El diámetro de la molécula de 0.34 nm.
es cte.

5. Enzima encargada de proporcionar el extremo 3’-OH durante la síntesis de novo de

la cadena naciente del DNA:

a) DNA pol I. d) Topoisomerasa.

b) Proteínas SSBs. e) DNA-Primasa.
c) Helicasa. f) RNA-Primasa.

6. Enzima(s) que posee(n) actividad exonucleasa 3’-5’ para asegurar la fidelidad

en la replicación:

a) DNA pol III. d) Primasa.

b) Girasa. e) “a” y “b” son correctas.
c) DNA pol I. f) “a” y “c” son correctas
 7. Proteína con la capacidad de unirse a cajas Dna-A de baja afinidad en el origen de
replicación de procariontes:

a) DnaB. d) DnaA-ADP.
b) IHF. e) SeqA.
c) DnaG. f) Ninguna es correcta.

8. Subunidades de la replicasa que componen el fragmento Klenow:

a) α, θ, ι. g) φ, θ, ε

b) φ, θ, ι. h) α, ε, ι.

c) α, ε, θ. f) α, ε, δ
9. Técnica de Biología Molecular que amplifica un producto de PCR a partir de un
producto de PCR previo.

a) Clonación sustractiva. d) Southern blot.

b) PCR semi-anidada. e) qPCR con SYBR-Green.
c) PCR anidada. f) “b” y “e” son correctas.

10. Técnica de Biología Molecular que identifica una secuencia de DNA

mediante el uso de una sonda.

d) Clonación sustractiva. d) Southern blot.

e) PCR semi-anidada. e) qPCR con SYBR-Green.
f) PCR anidada. f) “b” y “e” son correctas.

Problema 1 (20 pts. en total): Mencione brevemente cómo ocurre el punto de control para
que la replicación del DNA ocurra una sola vez en Bacteria (recuerda al inhibidor SeqA).

En el origen de replicación, hay secuencias de DNA palindrómicas, estas se pueden metilar por
medio de una DNA metiltransferasa (DAm), que van a metilar a las adeninas.
Cuando el DNA está metilado en ambas cadenas se habla de un origen activo, haciendo posible que
el proceso de replicación ocurra, generando dos moléculas de dsDNA. Sin embargo, después de que
ocurre la replicación, sólo una de sus hebras está metilada, lo que indica que ya ocurrió la
replicación (origen inactivo). Lo siguiente es que una proteína inhibidora llamada SeqA va a
pegarse en dichas secuencias hemimetiladas, impidiendo que la DNaA se pueda pegar a sus cajas.
Problema 2 (20 pts. en total): Explique por qué la tautomerización de las bases nitrogenadas
presenta un problema para preservar la fidelidad de la replicación del DNA.

Las mutaciones puntales se deben a la tautomerización de las bases nitrogenadas, con esto
último nos referimos al cambio dinámico de grupos funcionales en la molécula de DNA.
En el caso de la adenina y la citosina (que poseen una tautomerización amino-imino) el
tautómero más estable es el amino. En cuanto a la guanina y a la timina, el tautómero más
estable es el ceto.

En la replicación del DNA, cuando de manera espontánea alguna base se encuentra en su

forma tautomérica rara, va a producir un cambio en las propiedades de formación del
puente de hidrógeno, induciendo apareamientos erróneos y como consecuencia, se
reemplazan bases.
A continuación se muestran dichos apareamientos, en este caso la citosina se encuentra en
su forma rara y menos estable (tiene el grupo imino) y forma puentes de hidrógeno con la
adenina, provocando un apareamiento erróneo.

Lo mismo sucede en el siguiente apareamiento, en donde la guanina tiene un tautómero enol

(grupo inestable), y forma puentes de hidrógeno con la timina.
En la replicación, cuando por ejemplo, la adenina (que está en la cadena molde), cambia a un
tautómero imino, va a aparearse con la citosina, provocando un error. En el momento en el
que la DNA polimerasa pega la citosina, la adenina cambia a su grupo funcional más estable,
es decir, al amino. Se reclutan las enzimas de reparación, sin embargo, estas últimas pueden
quitar tanto la A como la C, lo correcto sería que quitaran a la citosina.

Problema 3 (20 pts. en total): Dibuje una horquilla de replicación con su síntesis continua, y
su síntesis discontinua (rezagada) de DNA. Explique por qué, pese a que la replicación de las
hebras hijas es opuesta, el replisoma puede dirigirse hacia un mismo sentido.

El DNA se produce de diferente forma en las dos cadenas, la cadena líder que va de 5´a 3’
hacia la horquilla y se forma de manera continua. La cadena rezagada que corre de 5’ a 3’ en
dirección opuesta a la horquilla y se forma en pequeños pedazos llamados fragmentos de
okazaki (síntesis discontinua)
Los fragmentos de okazaki son cadenas cortas de DNA que se sintetizaron previamente de la
hebra rezagada los cuales se van a sintetizar en dirección 5’-3’ a partir de los cebadores de
RNA que van a ser eliminados después. Estos se van a unir entre sí con ayuda de la DNA
ligasa.