1. Enumere 5 diferencias entre la traducción en eucariotas y la traducción en procariotas.
La traducción en eucariotas 1. Entre las características exclusivas de la traducción eucariota se incluyen la abundancia de factores proteínicos que facilitan cada paso, proteína de unión al casquete y la formación de polisomas de mRNA circular. 2. El mRNA eucariota se procesa por la adición de un capuchón (casquete) de metilguanosina y una cola de poli(A) y por la eliminación de los intrones. 3. El mRNA eucariota no se relaciona con un ribosoma hasta que sale por completo del núcleo en complejos con varias proteínas. 4. A diferencia de los mRNA procariotas, las moléculas eucariotas carecen de secuencias Shine- Dalgarno, que permiten la identificación de la secuencia de iniciación AUG. 5. Los ribosomas eucariotas “exploran” cada mRNA. Esta exploración es un proceso complejo en el que los ribosomas se unen al extremo 5′ encasquetado de la molécula y se desplazan en la dirección 5′ → 3′ buscando un sitio de inicio de la traducción. La traducción en procariotas 1. La síntesis proteínica en las bacterias ocurre en ribosomas, las cuales son capaces de polimerizar aminoácidos a un ritmo cercano a 20 por segundo. 2. El centro decodificador (DC) se localiza en el sitio A de la subunidad 30S, es donde el codón de mRNA se aparea con un anticodón de tRNA entrante. 3. Tres bases del rRNA 16S muy conservadas, son contiguas al triplete de pares de bases codón- anticodón. 4. síntesis de proteínas en las procariotas es un proceso rápido en el que participan varios factores proteínicos. 5. La formación del enlace peptídico es resultado de un mecanismo concertado de traslado de protones que se activa cuando se une un aminoacil-tRNA en los nucleótidos de rRNA precisamente organizados dentro del sitio activo PTC. Tomado de la sección 19.2, paginas 659, 660, 666, 669 2. Enumere 5 diferencias entre la transcripcion en eucariotas y la transcricpion en procariotas. La transcripción en eucariotas 1. Durante la transcripción, se sintetiza una molécula de RNA a partir de un DNA molde. 2. Acceso limitado de la maquinaria de transcripción eucariota al DNA. 3. La cromatina suele estar, al menos parcialmente, condensada. 4. Los contactos histona-DNA deben ser debilitados por complejos remodeladores de cromatina. 5. Existen dos clases de complejos remodeladores de cromatina. Las proteínas SWI y SNF. La transcripción en procariotas 1. La holoenzima RNAP se une a la región promotora. 2. Las cadenas de DNA estan separadas, se dice que el complejo enzima-promotor está “abierto”. 3. La transcripción comienza con la unión del primer nucleósido trifosfatado (por lo general ATP o GTP) al complejo de la RNA polimerasa. 4. La RNAP procede a catalizar la formación de enlaces fosfodiéster adicionales entre ribonucleótidos apareados con la cadena molde de DNA dentro del promotor. 5. A medida que la síntesis de RNA procede en la dirección 5′ → 3′, el DNA se desenrolla por delante de la burbuja de transcripción. Tomado de la seccion 18.2, paginas 623, 624, 627
3. Enumere 5 diferencias entre la síntesis de ADN en eucariotas y la síntesis de ADN en
procariotas. La síntesis en eucariotas 1. Hay 15 DNA polimerasas de organismos eucariotas. De ellas, tres participan en la replicación del DNA nuclear. 2. La DNA polimerasa alfa es una primasa que inicia la replicación del DNA sintetizando un segmento corto de RNA de 10 nucleótidos. 3. Las células eucariotas producen determinadas proteínas que regulan las transiciones de fase dentro del ciclo celular. 4. La replicación del DNA es mucho más lenta en los eucariotas que en los procariotas. 5. La replicación sucede durante la mayor parte del ciclo de división celular. La síntesis en procariotas 1. Las helicasas de desenrollamiento del DNA, son proteínas motoras que requieren ATP y que separan a las cadenas unidas del DNA bicatenario. 2. La síntesis de cebadores es catalizada por la primasa, una RNA polimerasa. 3. Ocurre una síntesis de cebadores, necesaria la formación de segmentos cortos de RNA complementarios a un molde de DNA monocatenario llamados cebadores, para que inicie la replicación del DNA. 4. La síntesis de cebadores es catalizada por la primasa, una RNA polimerasa. 5. El complejo reconoce cadenas sencillas de DNA con cebador y, actuando como un cargador de pinza. Tomado de la sección 18.1, paginas 594, 597, 600, 601
4. Enumere 5 diferencias entre la expresion génica en euacriotas y la expresión génica en
procariotas. La expresión génica en eucariotas 1. Los genomas de los eucariotas se regulan en una forma sustancialmente más elaborada que los de los procariotas. 2. La expresión de los genes eucariotas se regula en los siguientes niveles: control genómico, control de la transcripción, procesamiento del RNA, edición del RNA, transporte del RNA y control de la traducción. 3. Existen dos factores principales que actúan sobre el inicio de la transcripción en las eucariotas: la estructura de la cromatina y la formación del complejo de RNA polimerasa regulada por factor de transcripción. 4. La expresión génica es influida por cambios en la organización estructural del genoma, como ser, la remodelación de la cromatina inducida por la metilación del DNA y la modifi cación covalente de histonas. 5. Durante ciertas fases del desarrollo, el requerimiento de productos específicos de los genes puede ser tan grande que se amplifican de forma selectiva los genes que codifican su síntesis. La expresión génica en procariotas 1. El metabolismo altamente regulado de los procariotas les permite vivir con recursos limitados y responder a un entorno cambiante. 2. La síntesis oportuna de enzimas y de otros productos génicos sólo cuando son necesarios, combinada con la rápida destrucción de las moléculas de mRNA por medio de ribonucleasas (RNasas), evita el desperdicio de energía y de nutrimentos. 3. El control de los genes inducibles, está a cargo de grupos de genes estructurales y de genes reguladores ligados que se denominan operones. 4. El operón lac, proporciona un conocimiento sustancial sobre la forma en la que las condiciones ambientales pueden modifi car la expresión de los genes. 5. Los ribointerruptores son dominios sensibles a metabolitos en los mRNA; regulan el transporte o la síntesis de determinados tipos de moléculas. Tomado de la sección 18.3, página 635, 637, 638
5. Haga una descripción breve de 3 diferentes tipos de RNA no codificador (ncRNA).
Los RNA que no codifican polipéptidos de manera directa se llaman RNA no codifi cadores (ncRNA), estos RNA realizan sus funciones como componentes de complejos de ribonucleoproteína. Entre los ncRNA más importantes están: 1. Los microRNA (miRNA), con 22 a 26 nt de largo, participan en la regulación de la expresión génica. Después de unirse con varias proteínas para formar un complejo silenciador inducido por RNA (RISC), cada tipo de miRNA se une con una secuencia de bases complementaria en los mRNA blanco, lo que impide su traducción. Los miRNA transitorios producidos durante procesos del desarrollo se conocen como RNA temporales pequeños (stRNA, small temporal RNA). 2. Los RNA interferentes pequeños (siRNA, small interfering RNA) son dsRNA de 21 a 23 nt que tienen una participación crucial en la interferencia del RNA (RNAi), un proceso de degradación del RNA que defi ende a las células del virus de RNA y de cualquier transposón transcrito de manera inadvertida. 3. Los RNA nucleolares cortos (snoRNA) son RNA monocatenarios que contienen de 70 a 300 nucleótidos; facilitan modifi caciones químicas del rRNA dentro del nucléolo. Tomado de la sección 17. 2, página 583