GUIA DE ESTUDIO SOBRE NUCLEOTIDOS Y ACIDOS

NUCLEICOS

Bases y nucleótidos:
¿Qué es una base nitrogenada?
- Son derivados de 2 compuestos parentales que poseen, pirimidina y purina.
¿Cuál es la estructura química de las purinas y cuál de las pirimidinas?

¿Qué es un nucleósido; qué tipo de enlace existe entre una base nitrogenada y
una pentosa?

Parte del nucleótido formada únicamente por la base nitrogenada y la pentosa; La

base de un neuclotido esta unida covalentemente (a través del N-1 en las
pirimidinas y el N-9 en las purinas) mediante un enlace N-β-glucosidico con el
carbono 1’ pentosa y el fosfato esta esterificado con el carbono 5’. El enlace N-β-
glucosidico se forma por eliminación de agua (un grupo hidroxilo de la pentosa y
un hidrogeno de la base).

¿Cómo se nombran cada uno de los 8 nucleósidos posibles?

Los átomos de carbono y de nitrógeno de las estructuras parentales se numeran
convencionalmente con el fin de facilitar la nomenclatura y la identificación de sus
muchos derivados, pero a los números de los átomos de carbono de las pentosas de
los nucleótidos y neuclosidos se le añade el símbolo prima (‘) para distinguirlos de
los átomos numerados de las bases nitrogenadas.

¿Qué compuestos integran un nucleótido; qué enlace químico existe entre los
mismos?
Está conformada por tres componentes característicos: (1) una base nitrogenada, (2)
una pentosa y (3) uno o más fosfatos.

¿Qué estructura química general poseen los nucleósidos difosfato y los

nucleósidos trifosfato; cómo se nombran?
Es una base nitrogenada unida a un azúcar de 5 carbonos (ya sea ribosa o
desoxirribosa). Los nucleótidos son nucleósidos unidos covalentemente a uno o más
grupos fosfato.

¿Qué características fisicoquímicas (solubilidad, actividad óptica o de

absorción, estructura iónica, etc.) poseen los nucleótidos?
Las bases purinicas y pirimidinicas son hidrofobicas y relativamente insolubles en
agua en el pH cercano a la neutralidad. Las pirimidinas son moléculas planas y las
purinas casi planas. Todas las bases nucleotidicas absorben luz UV, y los acidos
 nucleicos se caracterizan por una fuerte absorción a longitudes cercanas a 260 nm.

¿Qué nucleótidos forman parte del ADN y cuáles del ARN?.

ARN: Contienen ribosa y las bases pirimidinicas uracilo y citocina
ADN: Lo nucleótidos contienen 2’-desoxirribosa y las bases pirimidinicas timina y
citosina.

Las purinas primarias que son adenina y guanina están presentes tanto en el ADN
como en el ARN.

ADN:

¿Cómo se enlazan químicamente los nucleótidos para formar un ácido

nucleico?
Los acido nucleicos son polímeros de nucleótidos unidos por enlace fosfodiéster
entre el grupo 5’-hidroxilo de una pentosa y el grupo 3’-hidroxilo del siguiente
nucleótido.

¿Qué estructura iónica presenta el ADN a pH fisiológico (7.4)?

Doble Helice.

¿Qué significan los extremos 5’ y 3’ del ADN?

Que es antiparalela.

¿Qué composición y secuencia de bases tiene un ADN; presentan todos los

ADNs la misma composición y/o secuencia?
Guanina con citosina y Timina con Adenina. Según el pares de nucleótidos
mencionados, todos los ADNs possen la misma secuencia, ya que otros
apareamientos distintos tienden, en mayor o menor medida, a desestabilizar la
estructura en doble hélice.

¿Cuáles son las principales características estructurales del ADN de doble

hebra (doble hélice o bicatenar)?
Cada hebra no es igual a la otra, sino complementaria entre sí. La doble hélice se
encuentra unida por puentes de hidrogeno entre los pares de bases complementarias.
La doble hélice está estabilizada por cationes metálicos, que apantallan las cargas
negativas de los fosfatos, y por las interacciones de ampliamento de las bases
complementarias.

¿Qué base se aparea con la Guanina y cuál con la Timina?

Guanina se aparea con citosina y Timina con Adenina.

¿Qué inferencias se pueden hacer sobre la composición (fracción molar de

cada base) de una hebra en relación a la otra?

10 pares de bases por vuelta y 34 Å por vuelta de hélice.

¿Qué compuestos forman la superficie del llamado surco mayor y surco
menor?
El ADN consiste en 2 cadenas helicoidales enrolladas alrededor del mismo eje,
 formando una doble hélice dextrógira. Las cadenas hidrofilicas formadas por la
desoxirribosa adopta la conformación C-2’ endo. Las bases purinicas y pirimidinicas de
ambas cadenas están apiladas en el interior de la doble hélice, con sus estructuras en
anillo, hidrofobicas y prácticamente planas, situadas a muy corta distancia unas de otras
y en posición perpendicular el eje longitudinal de la hélice.
¿Qué fuerzas estabilizan y cuáles desestabilizan la estructura?
Mayor estabilidad cuando se da tres enlaces de hidrogeno entre guanina y citosina,
mayo que solo tener un doble enlace entre timina y adenina. otros apareamientos
distintos tienden, en mayor o menor medida, a desestabilizar la estructura en doble
hélice.

¿Qué diferencia existe entre ADN-A, ADN-B y ADN-Z?.

ADN-B: es la estructura mas estable que puede poseer el ADN.
ADN-A: Variante de ADN-B, predomina en disoluciones pobres en agua.
ADN-Z: variante de ADN-B, posee rotación hacia la izquierda (levógira) de la
hélice, contiene 12 pares de bases por vuelta (lo normal es 10.5) y la estructura es más
delgada y alargada. El esqueleto del ADN toma una forma en zig-zag.
¿Cuáles biomoléculas forman la cromatina?
Histonas
¿En qué tipo de células (eurocariótas/procariotas) existe cromatina?
Eucariotas

¿Qué son histonas, cómo se les clasifica, cuáles son los residuos aminoacídicos
más abundantes en las mismas, qué valor de pHI poseen (básico/neutro/ácido), qué
cargas poseen a pH fisiológico, qué fuerzas estabilizan el complejo ADN-
proteínas?
Se clasifican en 5 grupos: H2A, H2B, H3, H4 e histonas linker (H1)
Residuo aminoácidos: hidroxilo
pH: 8-9
pH fisiológico: básico
Fuerzas estabilizadoras: fuerza iónica del tampón, el crowding macromolecular, la
temperatura, el pH y el campo eléctrico
¿Qué son nucleosomas, en qué forma están empaquetados para formar la
estructura cromatínica?.
Unidad fundamental de la cormatina. Se empaquetan girándose en si mismos hasta
formar bloques.

ARN:

¿Qué diferencias estructurales presentan el ADN y el ARN?

El ARN posee solo una hebra, mientas que el ADN posee dos hebras.
El ADN contiene la información genética, el ARN permite que la información
 genética sea comprendida.
El ADN posee adenina, timina, guanina y citosina mientras que el ARN posee
uracilo en vez de timina.

¿Qué tipos de conformación puede adoptar el ARN?

1 hebra

¿Cuáles son los tipos de ARN existentes en las células; qué tamaño molecular
(número de bases) y qué función poseen cada uno de ellos?.

ARNm (mensajero)
ARNr (ribosomal)
ARNt (transferencia)

¿Cuál es el efecto de las bases y los ácidos sobre el ADN y el ARN?

Se forma una complementariedad haciendo que los pares de ácidos nucleicos se

emparejen formando así palíndromos que son secuencias de ADN y ARN repetidos
los cuales son secuencias de bases.

Ejercicios
Capítulo 8:
2 Secuencias de bases de hebras de ADN.
Hebra complementaria: (3’) CGCGTTATAAAGATTTTATAACGCG(5’)
Paralela. No puede formar otra cadena.
5. la horquilla de ADN tendrá timina y la de ARN uracilo
7. Su temperatura será mayor
8. ocurre una depurinacion lo que provoca mutaciones, perdiendo su función principal.
10. Porque al desnaturalizarse el ADN cambia sus características físicas y químicas, en este
caso la aborbancia lo que provoca una mayor absorbancia.
12. Según su solubilidad en agua. Guanina<Fosfato<Desoxirribosa

Guanina
Fosfato

Desoxirribosa

Referencias:
Nelson, D.L. & Cox M.M. (2013) Principles of Biochemistry (6ta. ed.). W.H. Freeman
and company. New York. 1263pp. ISBN-13: 978-0-7167-7108-1