Tema 4. Composición y estructura de los ácidos nucleicos.

-Unidades constituyentes: purinas y pirimidinas. Nucleósidos y nucleótidos.

-Estructura del ADN: La doble hélice
-Propiedades físico-químicas
- Empaquetamiento
-Tipos estructurales y funcionales
-Procesamiento

1. Unidades constituyentes.

Los ácidos nucleicos son dos fundamentalmente: ADN y ARN y se

consideran los depositarios de la información genética en los seres
vivos.

Están constituidos por nucleótidos, formados a su vez por tres

constituyentes:

1. Una pentosa (ribosa o desoxirribosa) en forma beta-furanosa.

2. Una base nitrogenada (púrica o pirimidínica)

3. Ácido ortofosfórico.

En los átomos de carbono de las pentosas se añade el signo

prima(‘) para distinguirlos de los numerados en las bases
nitrogenadas.

La base está unida covalentemente (por el N-1 si la base es

pirimidínica o por el N-9 si es púrica) a través de un enlace N-beta-
glucosídico con el carbono 1’ de la pentosa (el grupo OH queda por
encima del plano). Esto es lo que se denomina nucleósido. Los
nucleótidos se forman cuando a esta estructura se le une un grupo fosfato al carbono 5’
mediante enlace éster (esterificación). A veces puede unirse al carbono 3’.

Bases purínicas y pirimidínicas

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Las bases púricas derivan de la purina y son la adenina y la guanina.

Las bases pirimidínicas son citosina, timina y uracilo. La timina es exclusiva del ADN y el uracilo
del ARN.

¿Qué es lo que hace que una molécula sea ARN o ADN? La pentosa ribosa o desoxirribosa.

Se llaman ácidos porque el grupo fosfato está ionizado (carga negativa).

Las bases también pueden protonarse o desprotonarse, lo que afectará a sus propiedades.

Absorben luz a 260 nm (UV) porque el anillo presenta dobles enlaces alternos que están
deslocalizados en todo el átomo. El anillo será plano por el carácter parcial de los dobles
enlaces. En las bases púricas los anillos son casi planos.

Tanto las purinas como pirimidinas pueden sufrir procesos de tautomerización: compuestos
que difieren en la posición de sus
hidrógenos y dobles enlaces.

En la adenina y citosina pueden alternar la

forma normal y la que forma un grupo
imino.

En citosina y timina encontramos en una

forma un grupo ceto y en la otra un grupo
alcohol (enol).

En condiciones fisiológicas predominan la

forma amina y ceto

El uracilo presenta las formas lactana, lactina y lactina doble. Suele estar en forma lactana.

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Nucleósidos y nucleótidos

Desde el punto de vista químico, los ácidos nucleicos son polinucleótidos, polímeros de
nucleótidos que están unidos por un enlace fosfodiéster, que es un ácido fosfórico que se une
por dos enlaces éster sucesivamente a dos grupos alcoholes.

¿Cómo se forman los oligonucleótidos? Por enlaces fosfodiéster 3’-5’. En la formación de este
enlace se libera una molécula de agua que proviene de un grupo OH de la pentosa y un H de la
base.

Todos los enlaces fosfodiéster tienen la misma orientación a lo largo de la cadena, con lo cual
la cadena lineal de ácido nucleico tiene una polaridad específica, está direccionada y va del
extremo 5’-3’ (extremo fosfato y extremo hidroxilo).

La línea vertical es la pentosa que por un extremo se une a la base y por abajo en el extremo 3’
se une por el grupo P a la pentosa del siguiente.

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Esqueleto covalente, eje o armazón de á.nucleico:
pentosas unidas por enlace fosfodiéster (todo
menos las bases). No tiene información pues es una
repetición. Lo que hace que sean ricas en
información es su unión a intervalos regulares con
las bases.

El enlace fosfodiéster hace que se pierda una

molécula de agua. El proceso de perdida no está
favorecido termodinámicamente. Se forma porque
lo que se une son nucleótidos trifosfato a partir de
los cuales se obtiene pirofosfato que por hidrólisis
da energía. Pero son metaestables porque al
ponerse en contacto no se hidrolizan. No se
hidrolizan porque la carga negativa que da el
fosfato hace que sean resistentes al ataque de
iones OH. En determinadas condiciones el ARN se
puede hidrolizar.

El ARN se hidroliza en condiciones alcalinas en tubos de ensayo. Sus grupos hidroxilos están
directamente implicados en el proceso de hidrólisis. En el ARN se forman derivados cíclicos
que se hidrolizan. En el ADN no está el grupo hidroxilo en 2’ y no se produce la hidrólisis
teniendo mayor estabilidad en estas condiciones. Por ello se eligió como la molécula para
almacenar la información genética en la mayoría de las células

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 2. Estructura del DNA.

Reglas de Chargaff

Los estudios de Chargaff y colaboradores a finales de los 40, fueron esenciales para la
determinación de la estructura tridimensional del DNA. Las proporciones de las bases
nitrogenadas se recogen en las “leyes de Chargaff”:

“En organismos de la misma especie, la proporción de bases A-T y C-G son iguales a diferentes
edades, condiciones ambientales… La proporción de A=T y la de C=G. púricas=pirimidínicas.”

La doble hélice

Rosalind Franklin y Maurice Wilkins:

-Las moléculas de DNA presentan una estructura en hélice.

- En la hélice de DNA la distancia entre bases apiladas es de 3.4 A

- Para sus estudios utilizaron la difracción de rayos X con fibras de DNA.

En base a estos experimentos Watson y Crick propusieron el modelo de

doble hélice en 1953.

Representación: modelo de empaquetado donde cada elemento está

marcado con su radio de van der Waals. Las bases están muy próximas
(mayor empaquetamiento) y apiladas. Las pentosas y el oxígeno del fosforo
se disponen en el exterior de la doble hélice. Hay un surco central de 12 A
donde hay un mayor acceso de las proteínas y un surco menor protegido
por los OH de las pentosas y donde se pueden formar puentes de H con las
moléculas de agua.

Es una doble hélice dextrógira.

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La información de cada cadena no es la misma sino que son complementarias. Se disponen de
forma antiparalela: 5’-3’ y 3’-5’.

Elementos fundamentales de la doble hélice

Los C-1’de los azúcares quedan exactamente a la misma distancia en los dos posibles
apareamientos de bases de Watson y Crick

Los surcos mayores y menores se forman porque la estructura de la parte superior del par de
bases no es igual a la estructura de la parte inferior y no están opuestos totalmente con
respecto al eje de la hélice por lo que varía el ángulo. Ambos surcos son importantes porque
en el mayor es el punto donde las proteínas se unen al DNA.

Cada par de bases presenta una rotación de 36º con respecto al

anterior. El apilamiento de las bases permite fuertes interacciones
de van der Waals entre ellas.

Las bases enfrentadas A-T se unen mediante 2 puentes de H y las C-

G mediante 3 puentes de H. Están muy próximos. El diámetro de la
doble hélice es constante. Si se dieran uniones entre purinas-
purinas o pirimidinas-pirimidinas la longitud sería variable. En una
vuelta hay 10.5 pares de bases.

Las bases se sitúan casi perpendiculares al eje de la doble hélice, con una distancia entre pares
de bases de 0,34nm. No se pueden aproximas más porque superaríamos el radio de Van der
Waals y habría repulsión entre las mismas. Si cada base está a 3.4 A de la otra y hay 10 bases
por vuelta: una vuelta son 34 A.

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Las propiedades de las bases de los nucleótidos determinan la estructura tridimensional de los
ácidos nucleicos:

- La hidrofobicidad de las bases nitrogenadas determina su apilamiento dando lugar a

múltiples interacciones de van der Waals y a interacciones hidrofóficas. Son la principal
fuerza que mantiene unida la doble hélice. No dependen del tipo de bases
nitrogenadas.
- La formación de puentes de hidrógeno entre grupos amino y carbonilo de las bases
nitrogenadas permite la interacción entre dos cadenas de ácido nucleico. Son
importantes porque estabilizan la doble hélice pero no es la interacción principal. Si
dependen del tipo de bases.

Es una estructura a nivel secundario.

Enlaces no covalentes que estabilizan la doble hélice:

- Puentes de hidrógeno entre bases: son más estables las uniones CG (tres enlaces) que
las AT (dos enlaces).
- Efecto hidrófobo :interacciones hidrófobas entre las bases apiladas en el centro de la
hélice.
- Fuerzas de van der Waals debidas al empaquetamiento de los anillos de las bases
- Fuerzas electrostáticas: El DNA es un polianión. La repulsión entre las cargas negativas
de los grupos fosfato se reduce por apantallamiento debido a la presencia de:
 Cationes divalentes (Mg2+)
 Proteínas ricas en Lys y Arg (histonas)
 Poliaminas

La repulsión se reduce porque la doble hélice se une a moléculas cargadas

positivamente que apantallan las cargas negativas de los grupos fosfatos.

El ADN es una doble hélice distorsionada

La difracción de rayos X realizada por Watson y Crick se hizo con fibras y por ello no se pudo
medir donde estaba cada átomo y las distancias específicas. Al realizarlo hoy día con ADN
cristalizado se ha descubierto que hay 10.5 pares por vueltas y hay 35.6o de inclinación por

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pares de bases. La molécula de DNA no es tan regular, es muy flexible y si nos fijamos en sus
giros individuales los ángulos varían entre 28 y 42º.

Cuando hay muchas adeninas, el eje de la hélice gira 18º. Esto tiene como función el
reconocimiento de varias zonas específicas por parte de las proteínas.

Formas estructurales del DNA: B-DNA y A-DNA.

Tiene dos formas posibles : B y A. La forma B es la que se

da en las células en condiciones normales cuando las
moléculas de DNA están hidratadas. Cuando se realizan
experimentos de difracción de rayos, se pierde mucha
agua y el DNA cristaliza en forma A.

En la forma A los pares de bases están más externos e

inclinados, por lo que el diámetro es mayor. El surco
principal se hace más superficial y el secundario más
profundo. Existe en las moléculas híbridas con RNA y DNA
y para RNA de doble cadena. Aparece al disminuir la
proporción de agua (<75%).

El DNA es una molécula muy flexible. Todos los números son ángulos en torno a los cuales
existe libertad de giro. La ribosa está en la forma C-2 endo (forma a) y la ribosa está en
C-3 endo (forma b). El grupo hidroxilo produce impedimento estérico y por ello se
cambia la conformación.

Debido al impedimento estérico los nucleótidos puricos y pirimidínicos están limitados a dos
conformaciones estables de la desoxirribosa denominadas sin y anti. Las pirimidínicas suelen
estar limitadas a la conformación anti debido a la interferencia estérica entre el azúcar y el
oxígeno del C-2 de la base.

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Formas estructurales del DNA.

Hay otra estructura: la forma Z. Los grupos fosfato se disponen en zig-zag, de ahí su nombre. Es
levógira a diferencia de las formas A y B. Se necesita alta concentración de sal para apantallar
los grupos fosfatos que están muy próximos. Aparece en secuencias muy ricas en C-G. En
muchos casos la citosina está metilada. Aparece en procariotas y eucariotas.

La forma B es la intermedia en cuanto a longitud y diámetro.

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(INFO). Solo sentido hélice, surco mayor, surco menor. La anti permite que se formen los
puentes de hidrógeno.

Propiedades físico químicas del DNA.

Si el ADN tuviera la estructura de ADN desnaturalizado la entropía sería mayor.

AG=AH-TAS.

Al romper la estructura la entalpía sería positiva (proceso desfavorable) pero si aumento la

temperatura el proceso sería aun más positivo al tener una mayor entropía también.

El ADN se desnaturaliza calentándolo o añadiendo ácidos y bases.

La desnaturalización por calentamiento se denomina fusión porque se produce en un intervalo

pequeño de temperatura.

En el proceso se puede seguir que los anillos de las bases N no absorben la misma luz a
260nm. Hipocromismo: absorción de menor luz por la forma de doble hélice. Sucede lo

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contrario cuando las cadenas están separadas. La absorción de la luz UV aumenta
notablemente al desnaturalizarse, lo que permite seguir fácilmente el proceso.

La temperatura de fusión: temperatura a la que la mitad de las cadenas de DNA se han abierto.

Se puede renaturalizar bajando la temperatura.

La temperatura de fusión de un ácido nucleico depende de las bases que aparezcan: si hay
mayor composición de guanina y citosina es mayor. En los termófilos el ADN tiene más C-G. Las
zonas donde el ADN se abre para replicarse suelen ser zonas ricas en A-T.

Estructura de los ácidos nucleicos de cadena única.

La estructura más sencilla es la de ovillo aleatorio donde existe libertad de giro en torno a
todos los enlaces y es variable. Cambia constantemente.

Normalmente suelen formar hélices de una cadena que se estabilizan por apilamiento de las
bases. Las interacciones entre purinas van a ser más fuertes de forma que las purinas estén lo
más próximas posibles.

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Cuando aparecen regiones complementarias se formarán horquillas que darán lugar a una
estructura secundaria de tipo A (en RNA) estructura de doble hélice.

Estructura secundaria del RNA.

Cadena sencilla plegada sobre sí misma, formando horquillas con protuberancias y bucles
internos.

Muchas veces las regiones complementarias dan lugar a regiones de doble hélice donde es
usual que aparezcan nucleótidos desapareados y esto da lugar a protuberancias o bucles que
desestabilizan la estructura y van a ser regiones reconocidas por proteínas y que permiten
formar un nivel estructural superior (estructura terciaria si se pliegan).

Los bucles suelen tener la secuencia UUUG que estabilizan a las horquillas unidas a él.

La interacción de bases alejadas permite a la molécula de RNA plegarse sobre sí misma. La

estructura terciaria se formaría por interacciones entre bases que se desvían de lo que se
predijo por Chargaff y no son interacciones de puentes de H típicas: son interacciones triples.
(RNA).

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Así no se puede definir una estructura única del RNA:

- Bucles, horquillas y brazos.

- Regiones dúplex con apareamientos C---G y A=U entre zonas palindrómicas de
complementariedad (forman hélices dextrógiras similares a las del DNA).

Globalmente adoptan una estructura terciaria compleja por asociación de hélices y bucles.

Moléculas de RNA en E.coli.

Existen otros tipos de RNA:

- RNA mensajero (mRNA): se transcribe en el núcleo a partir de la secuencia del DNA de

los genes. Su secuencia será leída en el citoplasma para dar lugar a proteínas
específicas.
- RNA de transferencia (tRNA): transporta los aminoácidos hasta los ribosomas para
formar las proteínas. Existen tipos específicos para cada aminoácido. Contienen
diversas bases modificadas.
- RNA ribosómico (rRNA): principal componente de los ribosomas (formados también
por proteínas).
- RNA pequeño nuclear (snRNA): en partículas ribonucleoproteicas nucleares. Participan
en el procesamiento de otros ARN. Tienen en torno a 150 nucleótidos. Forma parte del
spliceosoma que cortan los intrones y empalman los exones.

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 - RNA heterogéneo nuclear (hnRNA): Transcritos primarios. Tiene en torno 150
nucleótidos. Es el precursor de todos los ARNm en células eucariotas. El sintetizado sin
madurar.
- microRNA: en torno a 21 nucleótidos. Bloquean la síntesis de proteínas uniéndose a la
secuencia complementaria de ARNm
- siRNA: (small interference): degradan el RNAm.
- scRNA (pequeño RNA citosólico): forma parte de SRP (partícula de reconocimiento de
señales): dirige a las proteínas a su localización intra o extracelular.
- También hay un tipo que forma parte de las telomerasas.

Procesamiento del mRNA.

El ARNm porta la información desde el ADN hasta los ribosomas, donde actúan como molde
para especificar las secuencias de aminoácidos de las cadenas polipeptídicas.

En procariotas no tiene intrones y una única molécula de ARNm puede codificar una o varias
cadenas polipeptídicas (mono o policistrónico).

En eucariotas generalmente el ARNm es monocistrónico y encontramos partes que no

codifican para sintetizar proteínas (intrones): con un hibrido entre mRNA y DNA se observó
que había DNA que no encontraba complementariedad y se formaban regiones en forma de
bucle. Este ARN no codificante contiene secuencias que regulan la síntesis proteica.

La ovoalbúmina de la gallina tiene unos 360 aa. Los intrones son lazos y los exones el ARNm
hibridado.

Tiene 7 secuencias intrónicas, solo un 30% sería secuencia codificante.

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En el caso de eucariotas hay otras modificaciones adicionales: unión de la caperuza en el
extremo 5’ (unión CAP) y adicción de cola poli-A en el extremo 3’ (la señal para que se una está
a menos 30 y es una secuencia AAUAAA de poliadenilación) y por último el splicing (corte y
empalme de intrones y exones).

Las moléculas de ARNm no tienen una estructura definida y su longitud es variable.

La existencia de intrones da lugar a una gran variabilidad de proteínas.

Estructura general de un tRNA.

Presenta una estructura adaptada a su función, en forma de

trébol. Tiene cuatro brazos principales con zonas dúplex (de
horquilla) y cinco que no forman horquillas.

- Brazo aceptor: une el aminoácido activado en el extremo

CCA-3’.
- Brazo del anticodón: contiene la secuencia
complementaria de los codones del mRNA.

Contiene múltiples bases modificadas: derivados metilados de A,

U, G y C.

El ARNt lee la información codificada en el ARNm y transfiere el aminoácido adecuado a la

cadena polipeptídica en crecimiento durante la síntesis proteica. El aminoácido se une al ARNt
por el grupo OH del extremo 3’. Y contacta con el ARNm gracias a la secuencia del anticodón
que presenta en el bucle inferior de su estructura y que es complementaria co la secuencia de
bases del codón del ARNm.

Une el aminoácido activado en su extremo 3’ al codón del ARNm para la síntesis de proteínas.
Nombres de bucles: buscar.

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El tallo aceptor es el sitio donde se une el aminoácido y el brazo es el bucle del anticodón que
se une al ARNm. El tamaño del ARNt es constante: 73-93 nucleótidos (25Kdalton). De 7 a 15 de
los nucleótidos están modificados normalmente por procesos de metilación. Al estar
modificadas hacen que sean hidrofóbicos y pueden así interactuar con los ribosomas. Tienen
que existir como mínimo tantos tipos de ARNt para cada aminoácidos aunque suele haber más
de un ARNt para un aminoácido aunque este número va a ser menor que el número de
tripletes.

Variabilidad?

Plegamiento de un tRNA: estructura terciaria

Cuando se ha hecho difracción de rayos X se ha visto que su

estructura es como la de imagen.

Estructura adaptada a su función:

- Permite la interacción con la aminoacil-ARNt-sintetasa para

la unión del aminoácido.
- Permite la interacción con el ribosoma.

Estructura terciaria en forma de L invertida:

- Las cuatro regiones helicoidales forman dos segmentos de

doble hélice
- Las bases en las regiones no helicoidales forman puentes de H, algunos de ellos poco
habituales.

El extremo 3’ es una secuencia conservada a la cual se une el aminoácido. Los cuatros

segmentos de dobles hélices se han doblados y han formado dos regiones de doble hélice que
forman puentes de hidrógeno que estabilizan la estructura terciaria del ARNt. Es la ideal para
su interaccion con el ribosoma y con la enzima aminoacil-ARNt-sintetasa se une al aminoácido.
Permite el mayor número de apilamiento de bases y el mayor numero de puentes de H que
estabilizan el ARNt.

Estructura cristalina de la arginil-ARNt-sintetasa cargada

con el tRNA(Arg) y L-Arg

La proteína aminoacil-ARNt-sintetasa es la enzima

encargada de unir el aminoácido por su extremo
carboxilo al extremo 3’ del ARNt (con grupo OH)
mediante un enlace éster. En el extremo 5’ encontramos
un residuo de G fosforilado.

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Los rRNA son componentes de los ribosomas: El ribosoma 70S

Maquinaria de síntesis de proteínas de gran tamaño molecular:

- Coeficiente de sedimentación 70S en procariotas.

Su tamaño es variable: el más pequeño es el 5s que se encuentra en procariotas y el más

grande es el 28s de los eucariotas. Los ribosomas de E.coli forman hasta un cuarto del peso de
la célula.

Aproximadamente 2/3 rRNA + 1/3 proteínas ribosomales

Dos subunidades:

- 50S (con rRNA 23S, 5S y 34 polipéptidos). De las 34 cadenas polipeptídicas, 2 están

repetidas.
- 30S (con rRNA 16S + 21 polipéptidos).

En la interfase de contacto de las dos subunidades encontramos fundamentalmente el ARNr

(no las proteínas).

El ARNr además de función estructural tiene función catalítica. Las proteínas mejoran su
actividad.

Estructura del rRNA 16S

 Estructura secundaria del rRNA 16S: puede deducirse a partir de las zonas de
complementariedad encontradas en su secuencia. Bastante conservada.
 Estructura terciaria del rRNA 16S: determinada mediante cristalografía de rayos X.
Tiene tres dominios de plegamiento

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Estructura del ribosoma 70S

Estructuras a alta resolución de las subunidades ribosómicas 50S (izquierda) y 30S (derecha)
determinadas por rayos X.

Lugares de unión del tRNA en el ribosoma

El ARNm se une en la subunidad pequeña del ribosoma, así como el

ARNt. Así en esta subunidad encontramos el lugar A(aminoacilo) y P
(peptidilo) donde se produce la unión del codón-anticodón.

Posteriormente se uniría la subunidad grande del ribosoma.

Biosíntesis de proteínas en procariotas (Traducción)

- Elongación

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1. Todos los ARNm empiezan por la secuencia AUG. La unión del ribosoma al ARNm se produce
porque la subunidad 16s es reconocida a través de una secuencia Shine-Dalgarno (a menos 10)
del ARNm que se une. El ARNt se une al sitio P. Se une la subunidad grande. Ya tenemos
formado el complejo de la traducción.

2. Viene el segundo ARNt y se une al sitio A. El ARNr de la subunidad grande(23s) presenta

entonces actividad catalítica: la peptidil-transferasa cataliza la unión de aminoácidos para
formar el péptido.

3. El péptido queda en el sitio A y el sitio P queda libre. La cadena se desplaza al sitio P y se

produce una translocación del ARNm (se mueve en la subunidad pequeña) mediante el factor
de elongación G.

4. Al alcanzar la secuencia de parada se une un factor de liberación que desintegra el ribosoma

y se libera la cadena polipeptídica.

En eucariotas los ribosomas son 80s:

- 40s (ARNr 18s)

- 60s (ARNr 28s,5.8s y 5s)  el 5.8s es el homólogo del extremo 5’ del 23s procariota.

En eucariotas la caperuza es la que sirve para que los ribosomas reconozcan el ARNm. Por lo
demás el proceso es muy similar al de procariotas.

Empaquetamiento del DNA

Muchas moléculas de DNA naturales son circulares. Otras son lineales

Además no todas las células tienen como material genético ADN de cadena doble (en virus hay
mucha variabilidad). Es muy frecuente que el ADN adquiera forma circular (virus X174), es
decir, no tiene extremos libres. Su material genético puede variar a lo largo de su ciclo de vida.

E.coli tiene ADN de doble cadena circular.

El bacteriófago T2 tiene ADN de doble cadena lineal.

19
Necesidad de empaquetamiento del DNA.

Si comparamos el tamaño del ADN con el diámetro del ADN, el primero sería mucho mayor
que el segundo. Así el ADN tiene que estar empaquetado.

La compactación o empaquetamiento del material genético es una necesidad para la célula.

20
 En las
células humanas tenemos 46 cromosomas cuya longitud es de 1 metro para cada conjunto de
23 cromosomas. El total sería aprox. De 2 m.

Las moléculas de DNA circular están frecuentemente superenrolladas, formando una

superhélice. El superenrollamiento (torsión respecto al eje) es una forma de conseguir el
empaquetamiento en moléculas de ADN y reduce hasta un 40% la longitud de la molécula de
ADN. Estas moléculas no tienen extremos libres. Es el estado natural en
las células y suele ser negativo, lo que genera superhélices a izquierda.

Si aislamos el ADN de una mitocondria o E.coli sin proteínas y sin el resto

del material celular va a continuar superenrrollado.

Topoisómeros: moléculas de ADN que difieren en el grado de

superenrollamiento o en el tipo de superenrollamiento (a izquierda o a
derecha) de su ADN. Se interconvierten a través de las enzimas
topoisomerasas.

Las girasas utilizan la energía del ATP para que se pueda dar el proceso de superenrollamiento,
ya que el proceso no está favorecido termodinámicamente

Al abrir las hebras en los procesos de transcripción y

replicación se producen torsiones adicionales. En la
replicación hay topoisomerasas que impiden y deshacen los
superenrollamientos.

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Efectos del desenrollamiento del DNA: formación de un DNA superenrrollado.

Tenemos una molécula circular de doble cadena con 84 nucleótidos. Las moléculas de DNA no
cumplen las características de la forma B del ADN sino que
suelen estar tensionadas: se produce un desenrollamiento del
ADN y esto da lugar a una tensión. Es la conformación menos
estable pero es la que más suele darse. Esta tensión se dispersa
cuando se producen superenrollamientos, así estos son
resultado de que las moléculas de ADN no suelen estar en la
forma relajada.

Por ello se denomina negativo, porque está provocado por un

desenrollamiento de la doble hélice.

Si se produce un sobreenrollamiento de la doble hélice

estaríamos ante uno de tipo positivo.

Si separamos las dos hebras durante una distancia de 10 pares

de bases, el proceso no está favorecido energéticamente ya que
hay que romper muchos puentes de H.

Formación de un DNA superenrollado.

El superenrollamiento es un proceso catalizado que requiere energía proveniente de la

hidrólisis del ATP.

Es llevado a cabo por las topoisomerasas. En procariotas:

 Topoisomerasas de tipo I: catalizan la relajación del DNA superenrollado por corte

de una de las hebras.
 Topoisomerasas de tipo II: introducen superenrollamiento negativo por corte y
giro de las dos hebras.

Tiene importancia en la compactación del genoma: el superenrollamiento en “trenza” o

plectonémico no permite la compactación necesaria para el DNA en la célula.

En eucariotas:

 Superenrollamiento selenoidal compacto (vueltas

compactas hacia la izquierda).
 Asociación del DNA a núcleos sucesivos de proteínas

22
Niveles de estructura de la cromatina en eucariotas.

DNA lineal empaquetado alrededor de un octámero de histonas.

 Las histonas asociadas a ADN forman unidades

repetidas cada 200pb llamadas nucleosomas.
 El conjunto se asocia en una fibra condensada que
forma la cromatina
 Se consigue una elevada compactación
 La estructura de la cromatina regula la expresión
génica

Estructura de los nucleosomas

Necesitamos estructuras mayores para una mayor compactación:

Unidades repetidas cada 200pb

 Nucleosoma: octámero de histonas+ DNA enrollado (145pb)

 Las histonas son proteínas policatiónicas:
-Contienen muchas Lys y Arg.
-Estabilización electrostática del DNA (polianión)
 Cinco tipos de histonas:
-2X (H2A,H2B,H3, H4) forman el nucleo octamérico.
-H1 interacciona con el DNA conector y limita el
nucleosoma
 Modificaciones covalentes de las histonas regulan la
funcionalidad del DNA
-Acetilación, metilación, fosforilación

Enrollamiento solenoidal negativo: ADN se enrolla sobre histonas.

Las histonas presentan aminoácidos como lisina y arginina básicas
que presentan cargas positivas cuya función es reducir la estructura
al no producirse repulsiones electrostáticas entre las cargas
negativas de los grupos fosfatos del ADN.

Las histonas se asocian en un núcleo octamérico.

23
Existe una zona de enlace entre los nucleosomas formada por ADN.

La organización de ADN en torno a histonas reduce su longitud 7 veces. La compactación

aumenta cuando la histona H1 se une al ADN enlazante y se forma la fibra de 30nm. Esta no es
continua y hay zonas donde no encontramos esta estructura porque en esta zona no tenemos
información. En las zonas donde el ADN se está replicando encontramos otras proteínas no
histonas que hacen que el ADN este más accesible a las enzimas.

La fibra de 30nm compacta el ADN hasta 100 veces. Pero el ADN está compactado hasta
10.000 veces pero aun no se conoce su origen.

Las histonas también se pueden modificar: acetilar, fosforilar… y van a regular la funcionalidad
del ADN.

Los cuádruplex de ADN se forman en los telómeros. Su función es protegerlo de actividad de

nucleasas que degradarían el cromosoma. En ciliados también organizan los telómeros. Están
implicados en la unión a un armazón nuclear y hace que se unan unos ligando que afectan a la
actividad de las telomerasas. (INFO).

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