Nucleótidos y Ácidos nucleicos.

• Los nucleótidos son biomoléculas que tienen una serie de funciones en el metabolismo celular:
✓ Constituyentes de los ácidos nucleicos: ADN y ARN, los depositarios de la información genética → Tienen
la capacidad de almacenar y transmitir información genética sobre la naturaleza química de una
generación a la siguiente (es el requisito básico de la vida).
✓ Son la reserva energética en las transacciones metabólicas
✓ Nexos en los sistemas celulares en respuestas a hormonas y otros estímulos extracelulares
✓ Componentes estructurales de enzimas e intermedios metabólicos.

Conceptos Básicos.

OM
• Gen → Segmento de ADN que contiene la información necesaria para la síntesis de un producto biológico
funcional, proteína o ARN.
• Funciones del ADN → almacenamiento y transisión de la información biológica
• Tipos de ARN → ARN ribosómico: componentes de los ribosomas, complejos que llevan a cabo la síntesis de
proteínas.
ARN mensajero: intermediarios que transportan la información desde un gen hasta el

.C
ribosoma
ARN de transferencia: moléculas adaptadoras que traducen la información contenida en el
ARNm a secuencias específicas de aminoácidos.
DD
• Los nucleótidos y los ác nucl están formados por bases y pentosas características.
o Nucleótidos → formados por una base nitrogenada, una pentosa y un fosfato.
o La molécula sin el grupo fosfato se denomina → nucleósido.
o Bases nitrogenadas → derivados de dos compuestos parentales: pirimidina y purina (compuestos
heterocíclicos)
La base de un nucleótido está unida covalentemente a través de un enlace → N-β-glucosídico con el C
LA

o
1 ҆ de la pentosa (este enlace se forma por la eliminación de H2O por condensación)
o El fosfato está unido por un enlace → Éster con el C5 ҆
o El OH del C 2 e҆ n la Ribosa facilita la ruptura del enlace fosfodiester por medio de un ataque nucleofílico
(ARN inestable) → 2 ҆, 3 -҆ monofosfato son hidrolizados para producir una mezcla entre ellos.
Bases → dos bases púricas (2 ciclos, 6C y 5C): Adenina y Guanina
FI

o
dos bases pirimídicas (1 ciclo de 6C): Citosina, Timina (ADN) y Uracilo (ARN)
o Los desoxirribonucleótidos del ADN contienen 2-desoxi-D-ribosa, y los ribonucleótidos contienen D-
ribosa. Ambos tipos de pentosa se encuentran en la forma de β-Furanosa (anillo pentagonal cerrado). El
anillo de pentosa no es plano, presenta conformaciones distorsionadas: formas “ahuecadas”.


o Bases secundarias → ADN: las bases principales pueden ser metiladas, en ADN víricos pueden estar
hidroximetiladas o glucosiladas. Sirven como señales específicas para la regulación o la protección de la
información genética.
ARN: pueden ser modificadas en reacciones postranscripcionales.

• Los nucleótidos sucesivos de los ác nucl están unidos por enlaces fosfodiéster.
o Los nucleótidos están unidos covalentemente por “puentes” de grupos fosfato → el grupo hidroxilo en
5d҆ e un nucleótido está unido al grupo hidroxilo en 3 ҆ del nucleótido siguiente medinte un fosfato →→
Enlace fosfodiéster
o Los esqueletos covalentes del ADN y ARN son hidrofílicos → Los grupos hidroxilo forman Ptes de H con
el H2O.

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 o Los grupos fosfato se encuentran ionizados y cargados negativamente a un pH 7, pero estas cargas
negativas se encuentran neutralizadas por interacciones iónicas con cargas positivas de proteínas, iones
metálicos, poliaminas, etc.
o Un ác nucl de cadena corta se denomina Oligonucleótido (hasta 50 nucleótidos). Cadenas de mayor
longitud: Polinucleótidos.
• Las propiedades de las bases de los nucleótidos influyen en la estructura tridimensional de los ac
nucl.
o Las pirimidinas y purinas libres son componentes débilmente básicos y por esto se denominan bases.
Son moléculas aromáticas.
o Las pirimidinas son bases planas y las purinas casi planas, presentan deformaciones. Ambas permiten
que los ac nucl presenten una fuerte absorción de luz UV a longitudes de onda cercanas a 260 nm.

OM
o Son hidrofóbicas e insolubles en agua a un pH celular cercano a la neutralidad. A pH alcalino o ácido →
adquieren carga y aumenta su solubilidad en H2O.
o Las interacciones hidrofóbicas de apilamiento son interacciones de Van der Waals y dipolo-dipolo entre
bases → esto ayuda a minimizar el contacto con el agua y en la estabilización de la estructura
tridimensional de los ac nucl.
o Grupos funcionales de las purinas y pirimidinas → grupos carbonilo, Nitrógeno y grupo amino

.C
exocíclicos. La formación de Ptes de H entre el grupo amino y carbonilo logra la interacción entre 2
cadenas de ac nucl. La A se une por 2 Ptes de H con la T o U. La C por 3 Ptes de H se una con la G.
o Cuanto mayor sea el contenido de C-G, más energía habrá que entregar para denaturalizar la hebra.
o Temperatura melting (TM) → temperatura a la cual el 50% de la hebra se encuentra desnaturalizada
DD
(una hebra separada de la otra). Se determina por Abs a 260 nm.

Estructura de los ácidos nucleicos.

• Estructura Primaria → Estructura covalente y su secuencia de nucleótidos.
• Estructura Secundaria → Estructura regular y estable adoptada por algunos o todos los nucleótidos de un ac nucl.
LA

• Estructura Terciaria → Plegamiento complejo de los cromosomas en el nucleoide bacteriano o la cromatina

eucariótica.
• El ADN es una doble hélice que almacena información genética.
o Erwin Chargaff (1940) → concluyó que:
1. La composición de bases del ADN generalmente varía de una especie a otra.
FI

2. Los ADN de tejidos diferentes de la misma especie tienen la misma composición de bases.
3. La composición de bases del ADN de una determinad especie no varía con la edad del
organismo, con su estado nutricional, ni con las variaciones ambientales.
4. La suma de los residuos de purina es igual a la suma de los residuos de pirimidina (A + G꓿T + C)


o Estructura: dos cadenas helicoidales de ADN enrolladas alrededor del mismo eje, formando una doble
hélice. Las cadenas hidrofílicas formadas por la desoxirribosa y los frupos fosfato alternados se
encuentran en el exterior de la doble hélice, en contacto con el agua. Las bases se encuentran apiladas
en el interior de la doble hélice, con sus estructuras de anillo, hidrofóbicas, situadas a distancias muy
cortas unas de otras y en posición perpendicular al eje longitudinal de la hélice.
o El apareamiento compensado de las dos cadenas da lugar a la formación de un surco mayor y un surco
menor en la superficie de la doble hélice
o Las hebras de ADN son antiparalelas → sus enlaces 5 ,҆ 3 -҆ fosfodiéster tienen direcciones opuestas
o Las dos cadenas polinucleotídicas son complementarias entre sí → siempre que hay A en una cadena,
se encuentra T en la otra; la presencia de G en una cadena implica la presencia de C en la otra.
o La doble hélice se mantiene unida por los Ptes de H entre los pares de bases complementarios y las
interacciones de apilamiento de las bases (estabilidad)
o La replicación se tiene a partir de la separación de dos hebras y la síntesis de hebras complementarias
de cada una de ellas.

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 • El ADN puede adoptar diferentes formas tridimensionales.
o La estructura de Watson y Crick se conoce como la forma B del ADN o B-ADN → es la estructura más
estable que puede adoptar un ADN.
o Formas A-ADN y Z-ADN → dos variantes estructurales que se encuentran en estructuras cristalinas.
o Forma A → Predomina en disoluciones relativamente pobres en agua. La hélice es más gruesa y el
número de pares de bases por vuelta es de 11, en lugar de 10,5 del B-ADN.
o Forma Z → Se encuentra presente como fragmentos cortos en procariotas y eucariotas. Pueden tener
un papel importante (no está chequeado) en la regulación de la expresión de algunos genes o la
recombinación genética. Contiene 12 de pares de bases por vuelta, y la estructura es más delgada y
alargada. Las cadenas del ADN adoptan un plegamiento en zig-zag.
• Los ARN m codifican las cadenas polipeptídicas.

OM
o El ARN actúa de intermediario en la conversión de la información codificada en el ADN a la secuencia de
aminoácidos de las proteínas funcionales.
o Una molécula distinta al ADN debe transportar el mensaje genético necesario para la síntesis de
proteínas desde el núcleo hasta el citoplasma → el ARN mensajero es la porción del ARN celular total
que traslada la información genética desde el ADN hasta los ribosomas, actuando de molde para
especificar las secuencias de aminoácidos de las cadenas polipeptídicas.
o El proceso de formación del ARNm sobre una cadena molde de ADN se denomina → Transcripción.

.C
o En bacterias → una única molécula de ARNm contiene la información para la síntesis de un solo
polipéptido →→ el ARNm es Monocistrónico. Si codifica para dos o más polipéptidos →→
Policistrónico.
DD
o En eucariotas → ARNm monocistrónico.
o Cada aminoácido está codificado por un triplete de nucleótidos.
o El ARN no codificante adicional incluye secuencias que regulan la síntesis proteica.
• Muchos ARN tienen estructuras tridimensionales más complejas.
o El ARN de transferencia → moléculas adaptadoras en la síntesis proteica; unidos covalentemente a un
LA

aminoácido por un extremo, se aparean se aparean por el otro con el ARNm.

o ARN ribosómico → componentes de los ribosomas.
o El producto de la transcripción del ADN es siempre un ARN de cadena sencilla.
o Las monohebras tienden a adoptar una forma helicoidal dominada por las interacciones de apilamiento
de las bases.
FI

o El ARN puede formar pares de bases con regiones complementarias del ARN o del ADN. Las reglas de
apareamiento son las mismas que las del ADN.

Química de los ácidos nucleicos.



• Los nucleótidos y ácidos nucleicos experimentan transformaciones no enzimáticas.

o Pueden experimentar alteraciones espontáneas en su estructura covalente.
o Las alteraciones en la estructura del ADN que dan lugar a cambios permanentes en la información
genética codificada por la molécula → Mutaciones.
o Desaminación → Varias bases de nucleótidos sufren la pérdida espontánea de su grupo amino
exocíclico. La citosina da lugar a Uracilo (100 mutaciones por día). Si el ADN contuviera normalmente U,
el reconocimiento de estos sería más difícil; y se llevarían a cabo cambios permanentes en la secuencia
durante la replicación → Esto provocaría una disminución gradual en la cantidad de pares de bases C-G y
aumento de A-U en el ADN de todas las células.
o Depurinación → Hidrólisis del enlace N-β-glucosídico entre la base y la pentosa, produciendo una lesión
denominada sitio AP. En el ADN se pierden 10000 por 24 hs. En el ARN es más lenta y no tiene tanto
significado fisiológico.

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 o Dímeros de pirimidina → Los rayos UV generan entre dos bases pirimidínicas adyacentes un dímero.
También pueden genrar la abertura de los anillos, la fragmentación de las bases y roturas en el
esqueleto covalente de los ac nucl.
o Los rayos UV y las radiaciones ionizantes son responsables de aproximadamente el 10% del total de las
lesiones en la estructura de los ADN causados por agentes medioambientales.
o Actividad industrial: Hay dos distintos agentes que generan mutaciones: Agentes desaminantes (ácido
nitroso HNO2) y Agentes alquilantes. El primero es un reactivo que acelera la desaminación de las bases.
o La causa principal de las mutaciones de ADN son los procesos oxidativos → Las especies que contienen
oxígeno reactivo como el peróxido de H o los radicales hidroxilo → son los responsables de una gran
parte del daño oxidativo del ADN. Las células poseen un elaborado sistema de defensa para destruir
estas especies de oxígeno reactivas. Sin embargo, una fracción de estos agentes oxidantes escapa a las

OM
defensas celulares y se producen lesiones en el ADN → oxidación de la desoxirribosa, de las bases y
rotura de las hebras.

Se ha automatizado la síntesis química de ADN.

• Actúan como tranportadores de energía, componentes de cofactores enzimáticos y mensajeros químicos.
• Los nucleótidos transportan energía química en las células.

.C
o Los nucleótidos pueden presentar 1,2 o 3 grupos fosfato unidos covalentemente al grupo hidroxilo del
C5 ҆de la ribosa. Se les conoce como nucleósidos mono-, di- y trifosfato.
o Partiendo de la ribosa, los grupos fosfato se suelen denominar ᾳ, β y Ỿ. La hidrólisis de los nucleósidos
trifosfato proporciona la energía química para impulsar reacciones celulares. El ATP es el más utilizado.
DD
o La hidrólisis del ATP → libera energía como consecuencia de la estructura del grupo trifosfato. El enlace
entre la ribosa y el fosfato es de tipo éster y los enlaces ᾳ, β y Ỿ son anhídridos de ácido fosfórico.
o La hidrólisis del enlace éster libera 14 kcal/mol en condiciones estándar, mientras que la de cada uno de
los enlaces anhídrido libera 30 kcal/mol.
• Los nucleótidos de adenina forman parte de muchos cofactores enzimáticos.
LA

o Una gran cantidad de cofactores enzimáticos que llevan a cabo una amplia gama de funciones químicas
incluyen Adenosina como parte de su estructura. No es primario, pero si se elimina de su estructura, el
resultado suele ser una drástica reducción de su actividad.
o Por ejemplo → la eliminación de la adenina del acetoacetil-CoA → reduce su reactividad como sustrato
de la β-cetoacil-CoA transferasa (una enzima del metabolismo lipídico) en un factor de 10 a la 8 veces.
FI

o La adenosina tiene relación con la energía de unión entre la enzima y el sustrato (o cofactor) que está
implicada en la catálisis y estabilización del complejo enzima-sustrato inicial.
o La porción nucleotídica del CoA parece actuar como un “asidero” de fijación que ayuda a tirar del
sustrato para colocarlo en el sitio activo.


o Un solo dominio proteico capaz de fijar adenosina puede utilizarse en enzimas diferentes. Este tipo de
estructura, denominada plegamiento de unión de nucleótidos, se encuentra en muchas enzimas que
unen ATP y cofactores nucleotídicos.
• Algunos nucleótidos son moléculas reguladoras.
o La interacción de señales químicas extracelulares (“primeros mensajeros”) con los receptores de la
superficie celular suele promover la producción de segundos mensajeros en el interior de la célula que
provoca cambios adaptativos en el interior de la célula.
o El segundo mensajero es a menudo un nucleótido → el más común es la adenosina 3 ,҆ 5 -҆ monofosfato
cíclico (AMP cíclico o cAMP) que se forma a partir del ATP, en una reacción catalizada por la adenilil
ciclasa, una enzima asociada a la cara interna de la membrana plasmática. El AMPc se encuentra en
todas las células que no pertenezcan al reino vegetal y tiene funciones reguladoras.
o El nucleótido guanosina 3 ,҆ 5 ҆-monofosfato cíclico (cGMP) se encuentra en muchas células y también
tiene funciones reguladoras.

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