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UNIDAD 6
METABOLISMO DE COMPUESTOS
NITROGENADOS
Curso anual 2011-2012
METABOLISMO DE AMINOACIDOS
Bibliografía recomendada:
1. Bioquímica. Autores: McKee y McKee. Capítulos: 14 y 15.
2. Fundamentos de Bioquímica. Autores: Voet, Voet y Pratt.Capitulo 20
3. Bioquímica de Harper. Autores: Murray et al. Capítulos: 30 al 33
Objetivo 2:
METABOLISMO DE NUCLEOTIDOS
3 SESIONES DE CLASES TEORICAS
Bibliografía:
1. Bioqúimica. Autores: McKee y McKee. Capítulos: 14 y 15.
2. Bioquímica. Autores: Mathews y Van Holde. Capítulo 22.
3. Bioquímica de Harper. Autores: Murray et al. Capítulo: 36.
Objetivo 3:
Bibliografía recomendada:
1. Bioquimica. Autores: McKee y McKee. Capítulos: 18 y 19.
OBJETIVO 1:
METABOLISMO DE AMINOACIDOS
COOH
Grupo carboxilo
+H N C H
3
Grupo amino
N N
Vegetales y
microorganismos NH3 Amoníaco
Cultivo de caraota (Phaseolus vulgaris)
Nódulos de la raíz de una planta leguminosa como frijol, caraota, lentejas, soya…
Fijación Biológica del Nitrógeno
Complejo Dinitrogenasa
nitrogenasa
Dinitrogenasa reductasa
16 ATP + 16 H2O
N2 + 8 H+ + 8 e- 2 NH3 + H2
16 ADP + 16 Pi
Bacterias anaeróbicas
Hongos y Plantas
NO2¯
Amonificación Aminoácidos
Nucleótidos
Aminoazúcares
<< bacterias de vida Coenzimas
Bacterias libre, cianobacteria y
anamox bacterias simbióticas Porfirinas
NO3¯ N2 NH3
Fijación de N2
Nitrato Desnitrificación Amoniaco
Descomposición
Nitrificación
Bacterias del suelo Nitrosomonas
Nitrobacter
NO2¯
Nitrito
Visión general del metabolismo de los aminoácidos
Desaminación oxidativa
NH4+ L-Glutamina
PROTEÍNAS
DE LA DIETA Urea
Esenciales No esenciales
Fenilalanina Alanina
Leucina Arginina
Lisina Asparagina
Metionina Aspartato
Isoleucina Cisteína
Treonina Glicina
Triptófano Glutamato
Valina Glutamina
Histidina
Prolina
Serina
Tirosina
Precursores de Glucosa
aminoácidos Glucosa 6-Fosfato
Ribosa 5- Histidina
Fosfato
Eritrosa 4- Serina
Fosfato 3-Fosfoglicerato
Fosfoenolpiruvato Glicina
Cisteína
Triptófano* Alanina
Fenilalanina* Piruvato Valina*
Tirosina Leucina*
Citrato
Asparagina
Metionina* Glutamina
Treonina* Prolina
Lisina* Arginina
Isoleucina*
-Cetoglutarato
Glutamato
Glutamina
Prolina
Arginina
Biosíntesis del L- Glutamato
COO¯ COO¯
Glutamato
O=C H3N+– CH
deshidrogenasa
CH2 + NH4+ H 2O + CH2
CH2 CH2
COO¯ COO¯
NAD(P)H + H+
- Cetoglutarato L - Glutamato
NAD(P)+
Esta enzima se encuentra en las mitocondrias y en el citosol
Baja carga energética desplaza el equilibrio de la reacción hacia la
formación de -Cetoglutarato, intermediario del ciclo de Krebs.
El Glutamato es fuente de grupo -amino en las reacciones de
transaminación. En el cerebro funciona como neurotransmisor.
Biosíntesis de L- Glutamina
ADP + Pi COO¯
COO¯
ATP H3N+– CH
H3N+– CH
+
CH2
CH2 + NH4
Glutamina CH2
CH2 sintetasa C=O
COO¯ +
NH2
L - Glutamato -Cetoglutarato
L - Glutamina
ATP H3N+
Glutamil H3N+ - CH2 - CH2 - CH2 - CH - COO¯
quinasa
ADP Ornitina
-Cetoglutarato
COO¯
H3N+– CH L-Glutamato
NADP+ COO¯
CH2
C H
O CH2 NADPH + H+ Pi
H3N+ CH2
O–P–O–C
H–C CH2
O
O Glutamilfosfato O
L--Glutamil fosfato deshidrogenasa L-Glutamato--semialdehído
Biosíntesis de L- Arginina
COO¯ H2N H3N+
H3N+– CH C - NH - CH2 - CH2 - CH2 - CH - COO¯
CH2 H2N+ L-Arginina
CH2
L-Glutamato COO¯ Ciclo de la Urea
O
II H3N+
CH3-C-S-CoA
Acetil glutamato H3N+ - CH2 - CH2 - CH2 - CH - COO¯
sintasa
CoASH Ornitina
CH3COO-
O Acetil ornitina
II COO¯
desacetilasa
CH3-C-HN+– CH
CH2 NAD(P)+
CH2 N-acetil-Ornitina
NAD(P)H + H+ Pi
-O –C
-Cetoglutarato
O
N-Acetil-Glutamato
L-Glutamato
Oxalacetato
Aspartato
Asparagina
Reacción de Transaminación
COO¯ COO¯
H3N+– CH O=C
CH2 CH2
CH2 CH2
COO¯ COO¯
L - Aminoácido Aminotransferasa - Cetoácido
Coenzima: Fosfato de
Piridoxal
COO¯ (Vit B6) COO¯
O=C H3N+– CH
CH2 CH2
COO¯ COO¯
-Cetoácido - Aminoácido
Coenzima de las reacciones
De transaminación
Biosíntesis del L- Aspartato
COO¯ COO¯
H3N+– CH O=C
CH2 CH2
CH2 CH2
COO¯ Aspartato aminotransferasa (AST) COO¯
L - Glutamato - Cetoglutarato
Fosfato de
Piridoxal
COO¯ (Vit B6) COO¯
O=C H3N+– CH
CH2 CH2
COO¯ COO¯
Oxalacetato L - Aspartato
COO¯ COO¯
H3N+– CH H3N+– CH
CH2 CH2
CH2 CH2
C=O COO¯
NH2 Asparagina sintetasa L - Glutamato
L - Glutamina
COO¯
COO¯ ATP H3N+– CH
H3N+– CH AMP + PPi CH2
CH2 C=O
COO¯ NH2
L - Aspartato L - Asparagina
Biosíntesis del L- Glutamato por transaminación
COO¯ COO¯
H3N+– CH O=C
CH2 CH2
COO¯ COO¯
- Aminoácido -Cetoácido
Aminotransferasa
Serina
Glicina
Cisteína
Biosíntesis de L- Serina
COO¯
COO¯ COO¯
O=C
H3N+– CH COO¯
H – C – OH CH2
CH2
CH2 CH2 H3N+– C – H
CH2
O – PO3¯ COO¯ CH2
COO¯
3-Fosfoglicerato - Cetoglutarato O – PO3¯
L - Glutamato
3-Fosfoserina
NAD+
3-Fosfoglicerato H2O
deshidrogenasa
– Pi 3-Fosfoserina
NADH + H+
L-Serina fosfatasa
COO¯ –
COO¯
O=C
H3N+– C – H
CH2
CH2
O – PO3¯
OH
3-Fosfohidroxipiruvato
L-Serina
La Serina es precursora de etanolamina y esfingosina
Biosíntesis de L-Glicina
COO¯
COO¯
H3N+– C – H Serina hidroximetiltransferasa
H3N+– C – H
CH2 Fosfato de
Piridoxal H
OH (Vit B6) H 2O
Glicina
Serina
COO¯ COO¯
H3N+– CH O=C
CH2 CH2
CH2 CH2
COO¯ COO¯
L - Glutamato - Cetoglutarato
Glicina aminotransferasa
Fosfato de
Piridoxal
(Vit B6)
COO¯ COO¯
O=C H3N+– C – H
H H
Glioxilato L-Glicina
Biosíntesis de L- Cisteína
COO¯ COO¯
H3N+– CH H3N+– CH
CH2 CH2
CH2 CH2
SH Metionina-adenosiltransferasa +S Adenosina
CH3 CH3
L - Metionina ATP S-adenosilmetionina
Pi + PPi
Aceptor
Metiltransferasa
CH3-Aceptor
COO¯ COO¯
H3N+– CH H3N+– CH
CH2 Adenilhomocisteinasa CH2
CH2 CH2
SH S Adenosina
H2O
L- Homocisteína Adenosina S-adenosilhomocisteina
Biosíntesis de L-Cisteína
COO¯
H3N+– CH
SH
COO¯ CH2
CH2
H3N+– CH S
CH2 + Cistationina sintasa
CH2 CH2
H3N+– CH
OH CH2
COO¯
L-Serina HOH H3N+– CH
L-Homocisteína COO¯
Cistationina
HOH
La Cisteína desempeña un papel
importante en el metabolismo del
azufre.
Cistationinasa
OH
CH2 COO¯
CH2 H3N+– CH
H3N+– CH CH2
L-Homoserina COO¯ SH
L-Cisteína
Piruvato
Alanina
Biosíntesis de L- Alanina
COO¯ COO¯
H3N+– CH O=C
CH2 CH2
CH2 CH2
COO¯ COO¯
L - Glutamato Alanina aminotransferasa
- Cetoglutarato
Fosfato de
Piridoxal
(Vit B6)
COO¯ COO¯
O=C H3N+– CH
CH3 CH3
Piruvato L-Alanina
Eritrosa-4-fosfato
Fenilalanina*
Tirosina
Biosíntesis de L-Tirosina
COO¯ COO¯
H3N+– CH H3N+– CH
CH2 CH2
L-Fenilalanina
L-Tirosina
Fenilalanina OH
monooxigenasa
O2 H2O
NADP+ NADPH + H+
Catabolismo de los aminoácidos
Aminoácido
COO¯
H3N+– CH
CH3
-L-aminoácido
Remoción del grupo -amino
Coenzima: Fosfato de
Piridoxal
COO¯ (Vit B6) COO¯
O=C H3N+– CH
CH2 CH2
COO¯ COO¯
-Cetoácido - Aminoácido
COO¯ COO¯
H3N+– CH O=C
CH2 CH2
COO¯ COO¯
- Aminoácido -Cetoácido
Aminotransferasa
COO¯ COO¯
H3N+– CH O=C
Glutamato deshidrogenasa
CH2 + H2O CH2 + NH4+
CH2 CH2
COO¯ COO¯
NAD(P)+
L - Glutamato - Cetoglutarato
NAD(P)H + H+
Transaminación + Desaminación Oxidativa
-aminoácido -cetoácido
Aminotransferasas
-cetoácido -aminoácido
Aminotransferasas
-glutamato -cetoglutarato
Glutamato
Deshidrogenasa
H2O
NAD(P)+
NAD(P)H + H+
NH3
Desaminación por Aminoácido Oxidasas
COO¯ COO¯
H3N+ – C – H L-Aminoácido oxidasa H2N+ = C
R R
L - aminoácido - Iminoácido
FMN FMNH2
H2O
NH4+
H2O2 O2
COO¯
Catalasa
O=C
½ O2
R
- Cetoácido
H2O
Transporte de +NH4 en animales Ureotélicos
Aminoácidos
Urea
Glutamato Glutamato
+NH
4
+NH +NH
4 4
Aminoácidos Glucogénicos
Aminoácidos Cetogénicos
Aminoácidos Mixtos
Alteraciones del metabolismo de los aminoácidos
Hiperamonemia ( Intoxicación por amoníaco):
La concentración de amoniaco en sangre es elevada.
H3N+– CH
CH2
L-Tirosina
OH
Tirosina hidroxilasa
Melaninas
Dopa
Trastornos del metabolismo de los aminoácidos
Fenilcetonuria:
Se produce por deficiencia de fenilalanina monooxigenasa, si no se
identifica y se trata a tiempo produce retardo mental y otras lesiones
cerebrales irreversibles.
COO¯
COO¯
H3N+– CH
H3N+– CH
CH2
CH2
L-Fenilalanina L-Tirosina
Fenilalanina
monooxigenasa
OH
O2 H2O
NADP+ NADPH + H+
Fin del objetivo 1
Objetivo 2:
METABOLISMO DE NUCLEOTIDOS
3 SESIONES DE CLASES TEORICAS
Bibliografía:
1. Bioquimica. Autores: McKee y McKee. Capítulos: 14 y 15.
2. Bioquímica. Autores: Mathews y Van Holde. Capítulo 22.
3. Bioquímica de Harper. Autores: Murray et al. Capítulo: 36.
Bases nitrogenadas
Pirimidina Purina
5-hidroximetilcitosina
5-metilcitosina Dimetiladenina Metilguanina
Bases nitrogenadas Metil Xantinas
café
té
cacao
Estructura de un nucleótido
Estructura de un nucleótido
Biosíntesis de nucleótidos:
Rutas de novo:
Síntesis de nucleótidos de purina y
pirimidina a partir de precursores de bajo
peso molecular.
Rutas de salvamento:
Síntesis de nucleótidos a partir de los
nucleósidos o bases obtenidas en el
recambio normal de los ácidos nucleicos
celulares o provenientes de la digestión
de los alimentos.
Biosíntesis de novo de ribonucleótidos de purina
H
Ribosa-5-fosfato
ATP
PRPP sintetasa
AMP
Glicina
GAR Sintetasa
Formil transferasa
Glutamina
Glutamato
FGAM Sintetasa
Formilglicinamidina
ribonucleótido (FGAM)
AIR Sintetasa
=R
AIR Carboxilasa
SAICAR Sintetasa
Liasa Fumarato
THF
Glicina
Aspartato
C
6 N
N 1 5 C 7
8 C N10Formil-THF
2 4 9
C 3 C
N
N
N10Formil-THF
N amida de
la glutamina
INOSIN MONO FOSFATO (IMP)
Aspartato + GTP NAD+ + H2O
GDP + Pi
NADH+H+
-OOC-CH -CH-COO-
2
NH
NH
ADP+Pi
Glutamina
Glicina PRPP
Formil-THF
CO2
Aspartato
Glicina
Aspartato
C
6 N
N 1 5 C 7
8 C N10Formil-THF
2 4 9
C 3 C
N
N
N10Formil-THF
Glutamina
Consumo energético de la síntesis de novo de los ribonucleótidos púrico
Ribosa 5 P
ATP
CO2 AMP
Formil-THF PRPP
Glicina,
Glutamina PPi
Aspartato
5 ATP
5 ADP + 5 Pi
IMP
Aspartato Glutamina
GTP ATP
GDP + Pi
ADP + Pi
ATP ATP
AMP GMP ADP
ADP
ATP
ATP ADP ATP GDP GTP
ADP
ADP
Regulación de la biosíntesis de los Ribonucleótidos Púricos
Ribosa 5-fosfato
PRPP sintetasa
PRPP
PRPP Glutamina
amidotransferasa
+
5- Fosforribosilamina
(En varios
pasos)
IMP
Adenilosuccionato
sintetasa IMP
+ deshidrogenasa
Adenilosuccinat XMP
o + GMP- sintetasa
Adenilosuccinato
liasa
GMP
AMP
GDP
ADP
ATP GTP
RUTAS DE RECUPERACIÓN O DE SALVAMENTO
DE NUCLEOTIDOS DE PURINA
Fosforribosil
transferasa
Base nitrogenada + PRPP Mononucleótido
PPi
2. Fosforilación de nucleósidos
Cinasa
Nucleósido + ATP Mononucleótido
ADP
RUTAS DE RECUPERACIÓN O DE SALVAMENTO DE
NUCLEOTIDOS DE PURINA
PPi
Fosforribosil transferasa
Base nitrogenada + PRPP Mononucleótido
PPi
RUTAS DE RECUPERACIÓN O DE SALVAMENTO DE
NUCLEOTIDOS DE PURINA
1. Fosforribosilación de bases nitrogenadas:
Fosforribosil
transferasa
Base nitrogenada + PRPP Mononucleótido
PPi
PPi
Hipoxantina-Guanina Fosforribosil
Hipoxantina o Guanina + PRPP transferasa (HGPRT)
IMP o GMP
PPi
RUTAS DE RECUPERACIÓN O DE SALVAMENTO DE
NUCLEOTIDOS DE PURINA
2. Fosforilación de nucleósidos
Cinasa
HO + ATP
ADP
Nucleósido Mononucleótido
Glutamina
Biosíntesis de novo de
Carbamoil fosfato sintetasa II Ribonucleótidos de
pirimidina
Glutamato
Dihidroorotato
Dihidroorotasa Deshidrogenasa
Aspartato transcarbamoilasa
Orotato fosforribosil
transferasa
Continuación biosintesis de ribonucleótidos de pirimidina
OMP descarboxilasa
CTP sintetasa
Pi
H2O
PRPP Ribosa 5 P
PPi
UMP
UTP
Glutamina
CTP
Origen de los átomos del anillo de pirimidina
N amida de la
glutamina
C
4
N 3 5 C
Aspartato
C 2
1
6
C
N
HCO3¯
Regulación de la biosíntesis de los Ribonucleótidos Pirimidínicos
UDP, UTP
CTP Orotato
PRPP
OMP
OMP descarboxilasa
UMP
dTMP
TMP sintasa
CTP sintetasa
CTP UTP
Glutamina
Biosíntesis de Desoxirribonucleótidos
Tiorredoxina (SH)2
(reducida)
NADP+
Ribonucleótido
Ribonucleótido Tiorredoxina
reductasa reductasa
H
Desoxirribonucleótido
Biosíntesis de Desoxirribonucleótidos
Ribonucleótido reductasa
dUMP
dTMP
Carbamoil-fosfato
Acido Nucleico
H 2O Endonucleasa
Oligonucleotidos
Pi
Fosfodiesterasa
Nucleótidos
H 2O
Nucleotidasa
Pi
Nucleósidos
Pi
Fosforilasa
Ribosa-1P
Bases nitrogenadas
Catabolismo de los
nucleótidos de purina
Catabolismo de los nucleótidos de purina
Catabolismo de los nucleótidos de purina
Catabolismo de los nucleótidos de purina
AMP
H 2O
5-Nucleotidasa
Pi
GMP Adenosina
H2O H2O
5-Nucleotidasa Adenosina desaminasa
Pi NH3
Guanosina Inosina
H2O H2O
Nucleosidasa Nucleosidasa
Ribosa Ribosa
H 2O H2O + O2
Guanina Hipoxantina
NH3 H2O2
Guanina desaminasa Xantina oxidasa
Xantina
H2O + O2
Xantina oxidasa
H2O2
Ácido Úrico
Catabolismo del ácido úrico y formas de excreción en
diferentes especies
Acido Úrico
O2 +2
H2OCO Urato oxidasa
2+
H2O2
Alantoína
H2O
Alantoinasa
Alantoato
H2O
Glioxilato Alantoicasa
2 Urea
2
2H2O
Ureasa
4+NH3 + 2 CO2
Catabolismo de los ribonucleótidos de pirimidina
CMP UMP
H2O H2O
Pi H 2O Pi
NH3
Pi Citidina Uridina
Ribosa-1-P Pi
H2O NH3
Ribosa-1-P
Citosina Uracilo
NADPH + H+
NADP+
Dihidrouracilo
H 2O
β-ureidopropionato
H2O
β-alanina
CO2 + NH3
Catabolismo de los desoxirribonucleótidos de pirimidina
dCMP dTMP
H2O H2O
Pi Pi
H2O
dCitidina
NH3
Pi dUridina dTimidina
dRibosa-1-P
Pi Pi
H2O NH3 dRibosa-1-P
dRibosa-1-P
Citosina Uracilo Timina
NADPH + H+ NADPH + H+
NADP+ NADP+
Dihidrouracilo Dihidrotimina
H 2O H 2O
β-ureidopropionato β-ureidoisobutirato
H2O H2O
β-alanina β-aminoisobutirato
CO2 + NH3
Trastornos del metabolismo de los nucleótidos de purina
Síndrome Lesch-Nyhan
PPi
Características del trastorno
Acumulación de PRPP que provoca incremento en la
síntesis de novo.
-D-Ribosa-5-fosfato
OH
ATP
PRPP sintetasa
AMP
5-Fosforribosil
1-pirofosfato (PRPP)
Glutamina
PRPP-Glutamina
amidotransferasa Glutamato
5-Fosfo--
D-
ribosilamina
Litiasis renal
PPi
Orotato fosforribosil
transferasa
OMP descarboxilasa
CO2
Trastornos del metabolismo de los nucleótidos de pirimidina
Seminarios de metabolismo de
Aminoácidos y Nucleótidos
28 febrero al 1° de marzo
Seminarios de metabolismo de
ADN, ARN, síntesis de proteína
6 al 8 de marzo