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Las ENZIMAS son catalizadores biológicos específicos de las reacciones bioquímicas. De naturaleza proteica, son
responsables de aumentar la rapidez/velocidad de una reacción, sin verse alteradas en el proceso global.
2H2O2 à 2H2O + O2
Reacción favorecida termodinámicamente
es muy lenta.
Catalizada por enzima catalasa 109 más
rápido.
Los SUSTRATOS son las sustancias sobre las que actúan las enzimas.
Estado de
transición
AH2+ O2 à A + H2O
AB+ C à A + CB
AB à A + B
ABC à ACB
Enzimas alostéricos
Son enzimas que presentan, además del centro activo, un sitio alostérico al que se une una molécula, llamado
MODULADOR, que puede ACTIVAR o INHIBIR la función de la enzima.
II. CINÉTICA ENZIMÁTICA
1. Formación de complejo enzima-sustrato (E-S)
El catalizador reduce la energía
libre standard (o basal) de
activación, con lo que hay más
moléculas de reactivos que poseen
Energía libre, G
E+S
REACCIÓN ENZIMÁTICA:
E+P
ES
II. CINÉTICA ENZIMÁTICA
Estado estacionario en la cinética enzimática
Esta ecuación se conoce como el modelo de cinética Michaelis-Menten para una reacción de un solo sustrato. Primero
se da una reacción unimolecular entre el enzima y el sustrato, formándose el complejo E-S. Esta etapa depende de la
afinidad de la E por el S (lo cual viene dado por una constante de afinidad, KM). Luego se da la etapa catalítica cuya
velocidad dependerá en general de la constante catalítica (Kcat).
II. CINÉTICA ENZIMÁTICA
K1 K2
E+S ES E+P
K -1
Ecuación de Michaelis-Menten
Vmax [ S ]
V =
KM + [ S ]
II. CINÉTICA ENZIMÁTICA
Vmax x [ S ]
V =
KM + [ S ]
• Competitiva
Reversible
• No competitiva
Inhibición
INHIBICIÓN REVERSIBLE
§ Competitivos
§ Acompetitivos
§ No competitivos
§ Mixtos
o al enzima libre E
o al complejo E-S
o a ambos
INHIBICION REVERSIBLE
1. Inhibición reversible COMPETITIVA
Km , Vmax no cambia
III. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
[E] [I]
Ki =
[EI]
[E]total= [E]libre+[EI]+[ES]
Representación de Lineweaver-Burk.
La variación de la concentración de
inhibidor da lugar a rectas que se
cortan en el mismo punto de las
ordenadas.
Vmax No varía.
Vmax [S]
V=
KMap+ [S]
KM ap = KM ( 1 + [ I ] / Ki )
Copyright: Bioquímica, Addison Wesley Ed.
III. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
KM
Vmax
III. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
[ES] [I]
K’i =
[ESI]
III. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
No hay reacción
Representación de Lineweaver-Burk. Un
inhibidor acompetitivo no altera la pendiente de
la recta, pero los valores de KM y Vmax
disminuyen en cantidades equivalentes. Vmax
varía.
Vmax [S]
Representación de V frente a [S] en presencia y ausencia de
V=
un inhibidor acompetitivo. La Vmax no se alcanza ni a altas
[S]. KM varía. KM + [S] ( 1 + [I] / k’i)
III. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
‘
EL INHIBIDOR Y EL SUSTRATO PUEDEN
UNIRSE SIMULTÁNEAMENTE AL E
[ES] [I]
K’i =
[ESI]
III. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Representación de Lineweaver-Burk .
La variación de la concentración de
inhibidor genera rectas que se cortan en el
mismo punto de las abscisas.
Vmax Varía
Vmax
Vmax ap =
1+ [i]/Ki
‘ ‘ ‘
‘ ‘ ‘
III. INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
q Por esta razón muchos cofactores enzimáticos deben ser, en todo o en parte,
ingeridos con la dieta y muchos de ellos son, por lo tanto, vitaminas,
precursores de cofactores.
q No todos los cofactores son vitamínicos ni todas las vitaminas son cofactores
enzimáticos.
q Existen también enzimas que contienen iones metálicos (Fe, Cu, Zn, Mn, etc…)
y que se denominan metaloenzimas.
IV. COENZIMAS Y VITAMINAS
EJEMPLOS DE COFACTORES
V. MECANISMOS DE ACCIÓN ENZIMÁTICA
1. LISOZIMA
Segunda etapa: la reacción hidrolítica se completa por la adición del OH- al ion carbonio intermedio y
de H+ a la cadena lateral del Glu 35
V. MECANISMOS DE ACCIÓN ENZIMÁTICA
2. CARBOXIPEPTIDASA A
3. SERIN-PROTEASAS
Las serin proteasas son hidrolasas que rompen enlaces peptídicos de péptidos y proteínas en el
lado carboxilo de aminoácidos específicos, esto es, reconocen secuencias en la estructura
primaria.
1. Formación del complejo enzima 2. Ataque del O de la ser195 al C del enlace peptídico. 3. Rotura del enlace peptídico. El
sustrato (E-S). El sustrato polipeptídico Formación del primer intermediario tetraédrico. Se péptido N-terminal está unido por
se une de forma no covalente con las transfiere un H+ desde Ser a His. El sustrato forma un un enlace acilo a la Ser. Se
cadenas laterales del bolsillo hidrófobo. estado de transición tetraédrico con la enzima. transfiere H+ al fragmento C-
terminal que queda libre por la
ruptura del enlace peptídico (C-N).
4. Entrada de una molécula de agua. Una 5. Formación del segundo intermediario 6. Formación del carboxilato. Se libera un
molécula de agua se une a la enzima por tetraédrico. La molécula de agua segundo fragmento peptídico: se rompe el
His, en lugar del polipéptido que se transfiere su protón a His y su –OH al enlace acilo, el protón se transfiere de
separó. fragmento del sustrato restante. Se forma nuevo desde His a Ser y la enzima vuelve a
el estado de transición tetraédrico. su estado inicial. Liberación del producto.
VI. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD DE LOS ENZIMAS
1. REGULACIÓN ALOSTÉRICA
CARACTERÍSTICAS
- Son proteínas grandes. Suelen tener dos o más unidades (estructura cuaternaria).
COOPERATIVIDAD
La unión del sustrato al sitio activo de una de las subunidades de la enzima
produce un cambio conformacional que afecta a las subunidades vecinas:
Cuando aumentan las [S] la unión a la enzima es cada vez mas eficaz.
La curva es SIGMOIDEA.
VI. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD DE LOS ENZIMAS
El estado T tiene un valor elevado de KM (une S débilmente). A medida que se une más S, el
equilibrio T R se desplaza hacia R, con una unión más fuerte y una KM menor.
VI. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD DE LOS ENZIMAS
1) EFECTO HOMOTRÓPICO
MODELO CONCERTADO
T T R R R R
MODELO SECUENCIAL
T T R T R R
v
Enzima alostérico
[S]
VI. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD DE LOS ENZIMAS
2) EFECTO HETEROTRÓPICO
INHIBIDOR
estabiliza la conformación T
T T v
Con inhibidor
[S]
R T
CINÉTICA COOPERATIVA
2. REGULACIÓN COVALENTE
Las enzimas están inactivas hasta que las activa una modificación covalente y se activan. También puede
ocurrir el caso contrario.
REVERSIBLE: IRREVERSIBLE:
La unión de un ligando modifica las Ruptura catalítica de la estructura de
propiedades de la enzima, enzimas precursoras (ZIMÓGENOS)
activándola/inhibiéndola da lugar a formas activas
Ej:
Fosforilación
Acetilación
Metilación
Ubiquitinilación
FOSFORILACIÓN
SERÍN-TREONÍN-KINASAS TIROSIN-KINASAS
EJEMPLO: GLUCÓGENOFOSFORILASA
GLUCAGÓN
BAJA [GLUCOSA]
EN SANGRE
INACTIVA ACTIVA
SUBE
[GLUCOSA] EN
SANGRE
VI. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD DE LOS ENZIMAS UBIQUITINIZACIÓN
DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS
ACTIVACIÓN DE ZIMÓGENOS
3. PROTEÍNAS REGULADORAS
CALMODULINA CICLINAS