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Procedimiento del minikit para usuarios experimentados
Introducción Esta hoja de referencia rápida se incluye para usuarios experimentados de PureLink.®
Mini kit de ADN genómico. Para obtener más detalles, consulte este manual.
Paso Procedimiento
Preparando Prepare el lisado utilizando un protocolo de preparación de muestras adecuado de la siguiente manera:
lisados Muestra Cantidad Número de página.
Células, tejidos y cola de 5×106células, ≤25 mg de tejido (≤10 mg de bazo), 0,5–1 dieciséis
2.Cargael lisado (~640 μL) con tampón de lisis/unión y etanol preparado como se describe
en las páginas 16 a 21 de PureLink®Columna de giro.
3. Centrifugar la columna a 10.000 ×gramodurante 1 minuto a temperatura ambiente.
3.Lavarla columna con 500 μL de Wash Buffer 2 preparado con etanol (página 23).
4. Centrifugar la columna a máxima velocidad durante 3 minutos a temperatura ambiente.
Deseche el tubo de recolección.
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Procedimiento del kit 96 para usuarios experimentados
Introducción Esta hoja de referencia rápida se incluye para usuarios experimentados de PureLink.®96 Kit de ADN
genómico. Para obtener más detalles, consulte este manual.
Paso Procedimiento
Preparando Prepare el lisado utilizando un protocolo de preparación de muestras adecuado de la siguiente manera:
lisados Muestra Cantidad Número de página.
Células, tejidos y cola de 5×106células, ≤25 mg de tejido (≤10 mg de bazo), 0,5–1 27, 28
ratón de mamíferos. cm de cola
Sangre ≤200 μL de sangre no nucleada 5– 27
10 μL de sangre nucleada ≤2 × 109
bacterias células 30
Células de levadura ≤5 × 107células 31
tejido FFPE 1 a 8 secciones de 5 a 15 μm de espesor de 32
aproximadamente 20 a 50 mm2área
9. Centrifugar las placas apiladas a ≥2250 ×gramodurante 15 minutos para secar completamente la
10. Deseche el flujo y vuelva a montar la placa de unión en unnuevoPlaca de 96 pocillos profundos.
14. Utilice el ADNg purificado para la aplicación posterior deseada. Para almacenar el ADNg purificado, cubra los pocillos con una
cinta de aluminio y guárdelos a 4 °C para un almacenamiento a corto plazo o a –20 °C para un almacenamiento a largo
plazo.
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Procedimiento del kit 96 de usuarios experimentados,Continuado
Paso Procedimiento
4. Aplique vacío a temperatura ambiente hasta que el lisado pase completamente a través de la
placa de filtro y libere el vacío.
5. Agregue 1 ml de tampón de lavado 1 preparado con etanol (página 35) en cada pocillo de la
placa de unión.
10. Aplicar vacío durante 10 minutos a temperatura ambiente para secar la membrana. Liberar el
vacío.
11. Desmonte el colector para retirar la bandeja de residuos. Deseche el contenido de la bandeja de residuos.
12. Monte el colector de vacío para elución según las instrucciones del fabricante. Consulte la página 38
para obtener instrucciones breves sobre cómo ensamblar varios colectores de vacío con diferentes
adaptadores y placas de elución.
15. Aplicar vacío durante 2 minutos a temperatura ambiente. Liberar el vacío. Desmonte el
colector de vacío para retirar la placa de elución.El ADNg purificado se eluye en la placa de
elución.
16. Utilice el ADNg purificado para la aplicación posterior deseada. Para almacenar el ADNg
purificado, cubra los pocillos con una cinta de aluminio y guárdelos a 4ºC por un período corto o
– 20°C para almacenamiento a largo plazo.
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Contenido y almacenamiento del kit
Envío y Todos los componentes del PureLink®Los kits de ADN genómico se envían a
Almacenamiento temperatura ambiente.
Nota:La solución de Proteinasa K y RNasa A son estables durante 1 año cuando se almacenan a
temperatura ambiente. Para almacenamiento a largo plazo (>1 año) o si la temperatura ambiente es
> 25ºC almacenar la solución de Proteinasa K y RNasa A a 4ºC.
Enlace puro® Los componentes incluidos en PureLink®Los minikits de ADN genómico se enumeran
ADN genómico en la siguiente tabla.
Contenido del minikit
Enlace puro®Columnas de giro con tubos recolectores 50 cada uno 5 × 50 cada uno
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Contenido y almacenamiento del kit,Continuado
Enlace puro®96 Los componentes incluidos en PureLink®96 Genomic DNA Kit se enumeran en la
Kit de ADN genómico siguiente tabla.
Contenido Nota:Es posible que algunos reactivos del kit se proporcionen en exceso de la cantidad necesaria.
Componente Cantidad
Enlace puro®Lisis genómica/tampón de unión 80ml
Enlace puro®Tampón de digestión genómica 70ml
Enlace puro®Tampón de lavado genómico 1 2 × 100 ml
Enlace puro®Tampón de lavado genómico 2 2 × 75ml
Enlace puro®Tampón de elución genómica 160ml
(Tris-HCl 10 mM, pH 9,0, EDTA 0,1 mM)
ARNasa A (20 mg/ml) en Tris-HCl 50 mM, pH 8,0, EDTA 10 mM 8ml
Proteinasa K (20 mg/mL) en tampón de almacenamiento (patentado) 8ml
Enlace puro®Placa de unión al ADN genómico 4 platos
Enlace puro®Placa de lavado de ADN genómico 4 platos
Placa de 96 pocillos profundos 2 × 6 platos
Cinta de aluminio 20/paquete
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Introducción
Descripción general
Introducción El enlace puro®Los kits de ADN genómico permiten una purificación rápida y eficiente del
ADN genómico. El kit está diseñado para aislar eficazmente ADN genómico de células y
tejidos de mamíferos, cola de ratón/rata, muestras de sangre, hisopos bucales, bacterias,
levaduras, tejido FFPE (fijado con formalina e incluido en parafina) y Oragene.™
saliva preservada. Después de preparar los lisados, el ADN se purifica rápidamente a partir de los lisados
mediante un procedimiento de centrifugación basado en columna giratoria o un aislamiento de alto rendimiento
utilizando placas de 96 pocillos con un colector de vacío o estaciones de trabajo automatizadas para el manejo de
líquidos.
El ADN aislado tiene un tamaño de 20 a 50 kb y es adecuado para PCR, digestión con enzimas de
restricción y transferencia Southern.
Resumen del sistema El enlace puro®Los kits de ADN genómico se basan en la unión selectiva del ADN a una
membrana a base de sílice en presencia de sales caotrópicas.
El lisado se prepara a partir de una variedad de materiales de partida, como tejidos, células o sangre.
Las células o tejidos se digieren con proteinasa K a 55 °C utilizando una formulación de tampón de
digestión optimizada que ayuda a la desnaturalización de las proteínas y mejora la actividad de la
proteinasa K. Cualquier ARN residual se elimina mediante digestión con RNasa A antes de unir las
muestras a la membrana de sílice.
El lisado se mezcla con etanol y PureLink.®Tampón de unión genómica que permite una alta unión
al ADN PureLink®Columna de Centrifugado (Mini Kit) o Placa de Encuadernación (Kit 96). El ADN
se une a la membrana a base de sílice en la columna o placa y las impurezas se eliminan mediante
un lavado minucioso con tampones de lavado. Luego, el ADN genómico se eluye en una solución
baja en sal.Tampón de elución.
96 pocillos.
• Automatización mediante sistemas robóticos estándar (kit 96) sin contaminación cruzada de
muestras
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Descripción general,Continuado
Capacidad de la placa de pozo profundo: 1,0 ml (0,75 ml sin boquillas en contacto) Capaz
Compatibilidad con centrífugas: de centrifugar a ≥2250 ×gramo Profundidad del
cubo 5,75 cm 50–200 μL
Volumen de elución:
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Métodos
Reglas generales
Introducción Directrices generales para utilizar PureLink®Los kits de ADN genómico se describen en las
siguientes secciones. Revise esta sección antes de iniciar el procedimiento de purificación.
ARNasa A La digestión con ARNasa A se realiza durante la preparación de la muestra para degradar el ARN
Digestión presente en la muestra y minimizar la contaminación por ARN en la muestra de ADN purificada. La
contaminación por ARN también aumenta el contenido de ADN medido a 260 nm.
La RNasa A se suministra con el kit y se incluye un paso de digestión de la RNasa durante los
protocolos de preparación de muestras.
Si el contenido de ARN de la muestra es mínimo (p. ej., cola de ratón) y hay contaminación por
ARN no esSi no interfiere con cualquier aplicación posterior del ADN purificado, puede omitir el
paso de digestión con RNasa durante la preparación de la muestra.
Proteinasa K La proteinasa K se utiliza para la lisis eficaz de tejidos/células. La digestión con proteinasa K se realiza
Digestión utilizando una formulación de tampón optimizada, PureLink®Tampón de Digestión Genómica, para
una óptima actividad enzimática.
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Reglas generales,Continuado
Cantidad de muestra Existen diferentes protocolos para la preparación de lisados dependiendo del
material de partida (muestra). Según su muestra, elija un protocolo de preparación
de lisado adecuado de la siguiente tabla.
El enlace puro®Los kits de ADN genómico son adecuados para aislar ADN genómico de una variedad
de muestras utilizando la cantidad de muestra recomendada (consulte la tabla a continuación).
Nota:Si comienza con una cantidad menor de muestra, el rendimiento de ADN también puede ser
menor.
Para obtener un alto rendimiento de ADN y minimizar la degradación del ADN, recolecte la
muestra y proceda inmediatamente a prepararla o congélela en nitrógeno líquido
inmediatamente después de la recolección.
Muestra Cantidad
Sangre pura El enlace puro®Los kits de ADN genómico están diseñados para purificar el ADN genómico de las
Muestra siguientes muestras de sangre completa:
• Sangre entera fresca o congelada
• Sangre entera fresca o congelada extraída en presencia de anticoagulantes
como EDTA o citrato
• Manchas de sangre seca sobre papel como FTA®tarjeta (Whatman) o S&S 903.
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Reglas generales,Continuado
El ADN genómico se eluye en 25–200 μL (Mini Kit) o 50–200 μL (96 Kit) de PureLink.®Tampón de
elución genómica. Puede cambiar el volumen del tampón de elución para obtener ADN genómico en
la concentración final deseada. Utilice el gráfico que se muestra a continuación para determinar las
condiciones de elución más adecuadas para su aplicación. Para aumentar el rendimiento de ADN,
utilice un volumen mayor de tampón de elución. Para aumentar la concentración de ADN, utilice un
volumen menor de tampón de elución.
60.0 2.50
50.0
2.00
Concentración
Producir
40.0
Concentración (ng/ul)
1,50
Rendimiento (ug)
30.0
1.00
20.0
0,50
10.0
0.0 0.00
25 50 100 200
Leyenda de la figura:El ADN genómico se purificó a partir de muestras de sangre de 100 μL con
PureLink.®Mini kit de ADN genómico que utiliza diferentes volúmenes de elución.
Número de eluciones
Utilizando un volumen de tampón de elución de 50 μL y 100 μL, la primera elución recupera aproximadamente
el 80 % y el 90 % del ADN genómico unido, respectivamente. Para maximizar la recuperación del ADN
genómico, puede realizar una segunda elución para recuperar el 10-15 % restante del ADNg. Para evitar la
dilución de la muestra de ADNg, realice la segunda elución utilizando el mismo volumen de tampón utilizado
para la primera elución. Evite el contacto de la columna de centrifugación con el eluido utilizando tubos
diferentes para los dos pasos de elución.
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Procedimiento de purificación mediante minikit
Introducción El procedimiento para purificar el ADN genómico utilizando PureLink.®Los minikits de ADN
genómico se ilustran en el siguiente diagrama de flujo.
-
-
--
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Preparación de lisados: minikit
Introducción Instrucciones para preparar lisados de células y tejidos de mamíferos, cola de ratón,
hisopos bucales, sangre, bacterias, levaduras, tejidos FFPE y Oragene™La saliva conservada
se describe en las siguientes secciones.
Para obtener ADN genómico de alta calidad, siga las pautas recomendadas en la
página 11.
• 96-100% etanol
• Muestra para aislamiento de ADN (consulte la página 12 para conocer la cantidad inicial recomendada)
• Solución salina tamponada con fosfato (PBS) para lisado de células de mamíferos (página 43)
• Lisozima y tampón de digestión de lisozima (Tris-HCl 25 mM, pH 8,0, EDTA 2,5 mM, Triton
X-100 al 1%) para lisado de células bacterianas
• Tampón Zimolasa (sorbitol 1 M, EDTA sódico 10 mM, β-mercaptoetanol
14 mM) y enzima Zimolasa (lisisasa) para lisado de levadura
• CitriSolv™Agente limpiador (Fisher cat. no. 22-143-975) o xileno para tejido
FFPE
• Acetato de sodio 3 M (pH 5–5,5) y 2,8 ml de isopropanol para Oragene™
muestras
• Tubos de microcentrífuga estériles y libres de ADNasa
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Preparación de lisados: minikit,Continuado
Células mamíferas Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado de células de mamíferos. 1.
Lisado Coloque un baño de agua o un bloque térmico a 55°C.
Mamífero Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado de tejidos de mamíferos y colas
Tejido y de ratón/rata.
Cola de ratón/rata 1. Coloque un baño de agua o un bloque térmico a 55°C.
Lisado 2. Coloque la siguiente cantidad de tejido o cola de mamífero en un tubo de
microcentrífuga estéril:
• ≤25 mg de tejido de mamífero picado
• ≤10 mg de tejido de bazo picado
• Clip de cola de ratón de 1 cm o de 0,5 cm de rata
Nota:Al procesar varias muestras, prepare una mezcla maestra de tampón de digestión
mezclando 180 μl de tampón de digestión y 20 μl de proteinasa K para cada muestra.
4. Incubar a 55 °C con agitación ocasional hasta que se complete la lisis (1 a 4 horas). Para colas
de ratón o trozos de tejido más grandes, puede realizar la digestión durante la noche.
5. Para eliminar cualquier material particulado, centrifugue el lisado a velocidad máxima durante 3
minutos a temperatura ambiente. Transfiera el sobrenadante a un tubo de microcentrífuga
nuevo y estéril.
8. Agregue 200 µL de etanol al 96–100 % al lisado. Mezcle bien agitando durante 5 segundos.
Nota:Al procesar varias muestras, prepare una mezcla maestra de tampón/etanol
mezclando 200 μl de tampón de lisis/unión y 200 μl de etanol al 96-100 % por muestra.
9. Proceda inmediatamente aUnión de ADN(página 23).
dieciséis
Preparación de lisados: minikit,Continuado
Lisado de sangre Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado a partir de muestras de sangre (nucleadas o no
nucleadas).
2. A un tubo de microcentrífuga estéril, agregue ≤200 μL de muestra de sangre fresca o congelada (si
usa <200 μL de muestra de sangre, ajuste el volumen de la muestra a 200 μL usando PBS).
Para procesar muestras de sangre >200 μL y ≤1 mL, aumente todos los volúmenes de
reactivo en consecuencia.
Manchas de sangre Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado a partir de manchas de sangre seca. 1.
8. Agregue 200 µL de etanol al 96–100 % al lisado. Mezcle bien agitando durante 5 segundos para
obtener una solución homogénea.
Nota:Al procesar varias muestras, puede preparar una mezcla maestra de tampón/
etanol mezclando 200 μl de tampón de lisis/unión y 200 μl de etanol al 96-100 % para
cada muestra.
9. Proceda inmediatamente aUnión de ADN(página 23).
17
Preparación de lisados: minikit,Continuado
Gram negativo Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado de células bacterianas Gram negativas. 1.
Célula bacteriana Coloque un baño de agua o un bloque térmico a 55°C.
Lisado
2. Cosecha hasta 2×109Gram negativos (~1 ml de solución nocturnaE. colicultivo) por
centrifugación. Si está utilizando un sedimento celular congelado, continúe con el Paso 3.
4. Incubar el tubo a 55 °C con agitación ocasional hasta que se complete la lisis (de 30
minutos a 4 horas como máximo).
Nota:Al procesar varias muestras, puede preparar una mezcla maestra de tampón/
etanol mezclando 200 μl de tampón de lisis/unión y 200 μl de etanol al 96-100 % para
cada muestra.
8. Proceder aUnión de ADN(página 23).
Gram positivas Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado de células bacterianas Gram positivas. 1.
Célula bacteriana Establecer dos baños de agua o bloques térmicos a 37ºC y 55°C, respectivamente.
Lisado
2. Prepare el tampón de digestión de lisozima (consulte la receta en la página 15). A ~200 μL de
tampón de digestión de lisozima/muestra, agreguefrescoLisozima para obtener una
concentración final de lisozima de 20 mg/mL.
3. Cosecha hasta 2×109Células Gram positivas por centrifugación. Si está utilizando un sedimento
celular congelado, continúe con el Paso 3.
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Preparación de lisados: minikit,Continuado
Células de levadura Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado a partir de células de levadura. 1.
Lisado Establecer 2 baños de agua o bloques térmicos a 37°C y 55°C, respectivamente.
3. Cosecha hasta 5×107células de levadura mediante centrifugación. Si está utilizando un sedimento celular
congelado, continúe con el Paso 4.
10. Agregue 200 µL de etanol al 96–100 % al lisado. Mezcle bien agitando durante 5 segundos para
obtener una solución homogénea.
Nota:Al procesar varias muestras, puede preparar una mezcla maestra de tampón/
etanol mezclando 200 μl de tampón de lisis/unión y 200 μl de etanol al 96-100 % para
cada muestra.
11. Proceda inmediatamente aUnión de ADN(página 23).
bucal humana Utilice el siguiente protocolo para preparar lisado a partir de hisopos de células bucales humanas. 1.
Lisado de hisopo Coloque un baño de agua o un bloque térmico a 55°C.
8. Agregue 200 μL de etanol al 96–100 % al tubo. Mezcle bien agitando durante 5 segundos para
obtener una solución homogénea.
19
Preparación de lisados: minikit,Continuado
Tejido FFPE Prepare el lisado a partir de tejido FFPE (fijado con formalina e incluido en parafina) como se
Lisado describe a continuación.
8. Incubar los tubos con la tapa abierta a 37ºC durante 5 a 10 minutos para evaporar el
etanol residual.
9. Agregue 180 l de PureLink®Tampón de digestión genómica y 20 μL de proteinasa K
(suministrados con el kit). Mezcle bien mediante un breve vórtex.
11. Centrifugue el lisado a velocidad máxima durante 3 minutos a temperatura ambiente para
eliminar cualquier material particulado. Transfiera el lisado a un tubo de microcentrífuga nuevo
y estéril.
14. Agregue 200 µL de etanol al 96–100 % al lisado. Mezcle bien agitando durante 5
segundos para obtener una solución homogénea.
Nota:Al procesar varias muestras, puede preparar una mezcla maestra de tampón/
etanol mezclando 200 μl de tampón de lisis/unión y 200 μl de etanol al 96-100 % para
cada muestra.
15. Proceda inmediatamente aUnión de ADN(página 23).
20
Preparación de lisados: minikit,Continuado
Hasta 1 ml de naranja™Muestra
1. Coloque un baño de agua o un bloque térmico a 55°C.
4. Agregue 1 volumen de muestra de etanol al 96–100 % y mezcle bien mediante un breve agitador vorticial.
6. Agregue 300 µL de etanol al 96–100 % y mezcle bien mediante agitación breve en el vórtex.
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Preparación de lisados: minikit,Continuado
Guias para Si ninguno de los protocolos de preparación de lisado descritos en este manual coincide con el
Protocolo de lisado tipo o tamaño de su muestra, utilice las siguientes pautas para desarrollar su propio protocolo de
Desarrollo preparación de lisado.
1. Para las células, coseche las células y resuspenda el sedimento celular en 180 μl de PureLink.®
Tampón de digestión genómica y 20 μl de proteinasa K. Incubar a 55 °C hasta que se
complete la lisis.
Para pañuelos, comience con una pequeña cantidad de tejido picado y agregue 180 μL de
PureLink.®Tampón de digestión genómica. Agregue 20 l de proteinasa K a la muestra y mezcle
bien. Incubar a 55°C hasta que se complete la lisis.
Según los resultados obtenidos con este protocolo de lisis, es posible que deba optimizar el
protocolo de lisis utilizando diferentes tampones o aumentando la cantidad y el tiempo de
digestión de la proteinasa K.
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Procedimiento de purificación mediante columnas de centrifugación
Introducción El procedimiento de purificación está diseñado para purificar ADN genómico mediante un procedimiento de
centrifugación basado en columna giratoria en un tiempo total de10 a 15 minutos.
•
--
• Asegúrese de realizar los pasos de lavado recomendados para obtener los mejores resultados.
Unión de ADN 1. Eliminar un PureLink®Haga girar la columna en un tubo de recolección del paquete.
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Procedimiento de purificación mediante columnas de centrifugación.Continuado
Lavado de ADN 1. Agregue 500 μL de tampón de lavado 1 preparado con etanol (página 23) a la columna.
4. Agregue 500 μL de tampón de lavado 2 preparado con etanol (página 23) a la columna.
Elución de ADN 1. Coloque la columna de centrifugación en un tubo de microcentrífuga estéril de 1,5 ml.
Almacenamiento de ADN • Guarde el ADN purificado a –20 °C o utilice ADN para la aplicación posterior
deseada.
• Para almacenamiento a largo plazo, almacene el ADN purificado en PureLink®Tampón de elución
genómica a –20 °C, ya que el ADN almacenado en agua está sujeto a hidrólisis ácida.
• Para evitar la congelación y descongelación repetidas del ADN, almacene el ADN purificado a 4 °C
para su uso inmediato o alícuotas del ADN y guárdelo a –20 °C para un almacenamiento a largo plazo.
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