Wizard-Genomic-Dna-Purification-Kit-Protocol Traducido
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MANUAL TÉCNICO
Revisado el 23/10
TM050
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3.A. Aislamiento de ADN genómico de sangre entera (volumen de muestra de 300 µl o 3 ml) ................................. ..........4
3.B. Aislamiento de ADN genómico de sangre total (volumen de muestra de 10 ml).................... ...................6
3.C. Aislamiento de ADN genómico a partir de sangre total (placa de 96 pocillos) ......................... ................................8
3.D. Aislamiento de ADN genómico a partir de células de cultivo de tejidos y tejidos animales................................. ............ 10
3.E. Aislar ADN genómico de tejido vegetal ................................. ................................................ 12
3.F. Aislar ADN genómico de levadura................................................. ................................................. ... 13
3.G. Aislamiento de ADN genómico de bacterias Gram positivas y Gram negativas................................. ....... 14
1. Descripción
El kit de purificación de ADN genómico Wizard® está diseñado para el aislamiento de ADN de glóbulos blancos (Secciones 3.A, B y C), células
de cultivo de tejidos y tejido animal (Sección 3.D), tejido vegetal (Sección 3.E), levadura (Sección 3.F) y bacterias Gram positivas y Gram
negativas (Sección 3.G). La Tabla 1 enumera el rendimiento típico de ADN purificado de cada una de estas fuentes.
El kit de purificación de ADN genómico Wizard® se basa en un proceso de cuatro pasos (1). El primer paso del procedimiento de purificación
lisa las células y los núcleos. Para el aislamiento de ADN de glóbulos blancos, este paso implica la lisis de los glóbulos rojos en la solución de
lisis celular, seguida de la lisis de los glóbulos blancos y sus núcleos en la solución de lisis de núcleos. En este momento se puede incluir un
paso de digestión con RNasa; es opcional para algunas aplicaciones. Luego, las proteínas celulares se eliminan mediante una etapa de
precipitación con sal, que precipita las proteínas pero deja el ADN genómico de alto peso molecular en solución.
Finalmente, el ADN genómico se concentra y se desaliniza mediante precipitación con isopropanol.
El ADN purificado con este sistema es adecuado para una variedad de aplicaciones, incluyendo amplificación, digestión con endonucleasas
de restricción e hibridaciones de membrana (p. ej., transferencias Southern y dot/slot).
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Cada sistema contiene reactivos suficientes para 100 aislamientos de ADN genómico a partir de 300 µl de muestras de sangre completa.
Incluye:
•
Solución de lisis celular de 100 ml.
•
Solución de lisis de núcleos de 50 ml.
•
Solución de precipitación de proteínas de 25 ml
•
Solución de rehidratación de ADN de 50 ml.
•
250 µl de solución de ARNasa A
Cada sistema contiene reactivos suficientes para 500 aislamientos de ADN genómico a partir de 300 µl de muestras de sangre completa.
Incluye:
•
Solución de lisis celular de 500 ml.
•
Solución de lisis de núcleos de 250 ml.
•
Solución de precipitación de proteínas de 125 ml
•
100 ml de solución de rehidratación de ADN
• 1,25 ml de solución de ARNasa A
Cada sistema contiene reactivos suficientes para 100 aislamientos de ADN genómico a partir de 10 ml de muestras de sangre total.
Incluye:
•
Solución de lisis celular de 3 litros
•
Solución de lisis de núcleos de 1 litro
•
Solución de precipitación de proteínas de 350 ml
•
Solución de rehidratación de ADN de 150 ml.
Condiciones de almacenamiento: Guarde el kit de purificación de ADN genómico Wizard® a temperatura ambiente (+15 °C a +30 °C). Consulte la etiqueta del producto
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Especies y Material Cantidad de material de partida Rendimiento típico de ADN Tratamiento con ARNasa
Líneas celulares
Tejido animal
Hígado de ratón 11 mg 15–20 µg Requerido
Cola de ratón 0,51,0 cm de cola 10–30 µg Opcional
insectos
células sf9 5 × 106 celdas 16 µg Requerido
Tejido vegetal
Hoja De Tomate 40 mg 7–12 µg Requerido
Bacterias Gramnegativo
Cultivo nocturno de Escherichia 1ml 20 µg Requerido
coli JM109, ~2 × 109 5ml 75–100 µg Requerido
células/ml
20 µg Requerido
Cultivo nocturno de 1ml
75–100 µg Requerido
Enterobacter cloacae , 5ml
~6 × 109 células/ml
Levadura
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Probamos la purificación de ADN genómico a partir de sangre entera fresca recogida en tubos de anticoagulante con EDTA, heparina y citrato y no detectamos
efectos adversos en manipulaciones posteriores del ADN, incluida la PCR (2). Las muestras de sangre con anticoagulantes se pueden almacenar a una
temperatura de 2 a 8 °C durante un máximo de dos meses, pero la producción de ADN se reducirá a medida que aumenta el tiempo de almacenamiento.
El protocolo de la Sección 3.A ha sido diseñado y probado para muestras de sangre de hasta 3 ml de volumen. El protocolo de la Sección 3.B ha sido
diseñado y probado para muestras de sangre de hasta 10 ml de volumen. El rendimiento de ADN genómico variará dependiendo de la cantidad de glóbulos blancos
presentes. Se puede usar sangre congelada en los siguientes protocolos, pero el rendimiento puede ser menor que el obtenido con sangre fresca y es posible que se
Precaución: Al manipular muestras de sangre (Secciones 3.A, B y C), siga los procedimientos recomendados en su institución para materiales biopeligrosos o
consulte la referencia 3.
3.A. Aislamiento de ADN genómico de sangre total (volumen de muestra de 300 µl o 3 ml)
1. Para un volumen de muestra de 300 µl: agregue 900 µl de solución de lisis celular a un tubo de microcentrífuga estéril de 1,5 ml.
Para un volumen de muestra de 3 ml: agregue 9,0 ml de solución de lisis celular a un tubo de centrífuga estéril de 15 ml.
! Importante: La sangre debe recolectarse en tubos con anticoagulante EDTA, heparina o citrato para evitar la coagulación.
2. Agite suavemente el tubo de sangre hasta que esté bien mezclado; luego transfiera la sangre al tubo que contiene la solución de lisis celular.
Invierta el tubo de 5 a 6 veces para mezclar.
3. Incubar la mezcla durante 10 minutos a temperatura ambiente (invertir 2 a 3 veces una vez durante la incubación) para lisar los glóbulos rojos. Centrifugar a
13 000–16 000 × g durante 20 segundos a temperatura ambiente para obtener 300 µl de muestra. Centrifugar a 2000 × g durante 10 minutos a temperatura
4. Retire y deseche la mayor cantidad de sobrenadante posible sin alterar el sedimento blanco visible. Aproximadamente
Quedarán entre 10 y 20 µl de líquido residual en el tubo de 1,5 ml (muestra de 300 µl). Quedarán aproximadamente entre 50 y 100 µl de líquido residual en el
Si la muestra de sangre se congeló, repita los pasos 1 a 4 hasta que el sedimento esté blanco. Puede haber cierta pérdida de ADN de las muestras congeladas.
Nota: Es posible que se vean algunos glóbulos rojos o restos de células junto con los glóbulos blancos. Si el sedimento parece contener solo glóbulos rojos,
agregue una alícuota adicional de solución de lisis celular después de retirar el sobrenadante sobre el sedimento celular y luego repita los pasos 3 y 4.
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5. Agite el tubo vigorosamente hasta que los glóbulos blancos se resuspendan (10 a 15 segundos).
! Resuspender completamente los glóbulos blancos para obtener una lisis celular eficiente.
6. Agregue la solución de lisis de núcleos (300 µl para un volumen de muestra de 300 µl; 3,0 ml para un volumen de muestra de 3 ml) al tubo que contiene
las células resuspendidas. Pipetee la solución 5 a 6 veces para lisar los glóbulos blancos. La solución debería volverse muy viscosa. Si se ven grumos de
células después de mezclar, incube la solución a 37 °C hasta que se rompan los grumos. Si los grumos aún son visibles después de 1 hora, agregue más
solución de lisis de núcleos (100 µl para un volumen de muestra de 300 µl; 1,0 ml para un volumen de muestra de 3 ml) y repita la incubación.
7. Opcional: agregue solución de ARNasa (1,5 µl para un volumen de muestra de 300 µl; 15 µl para un volumen de muestra de 3 ml) al lisado nuclear y
mezcle la muestra invirtiendo el tubo de 2 a 5 veces. Incubar la mezcla a 37°C durante 15 minutos y luego enfriar a temperatura ambiente.
8. Agregue la solución de precipitación de proteínas (100 µl para un volumen de muestra de 300 µl; 1,0 ml para un volumen de muestra de 3 ml) al reactor nuclear.
lisado y agitar vigorosamente durante 10 a 20 segundos. Es posible que se vean pequeños grupos de proteínas después de agitar.
Nota: Si se agregó solución de lisis de núcleos adicional en el paso 6, agregue un total de 130 µl de solución de precipitación de proteínas para un volumen
de muestra de 300 µl y 1,3 ml de solución de precipitación de proteínas para un volumen de muestra de 3 ml.
9. Centrifugar a 13 000–16 000 × g durante 3 minutos a temperatura ambiente para obtener un volumen de muestra de 300 µl. Centrifugar a 2000 ×
Debería verse una bolita de proteína de color marrón oscuro. Si no se observa ningún pellet, consulte la Sección 4.
10. Para un volumen de muestra de 300 µl, transfiera el sobrenadante a un tubo de microcentrífuga limpio de 1,5 ml que contenga 300 µl de
isopropanol a temperatura ambiente. Para un volumen de muestra de 3 ml, transfiera el sobrenadante a un tubo de centrífuga de 15 ml que contenga 3 ml de
Nota: Es posible que quede algo de sobrenadante en el tubo original que contiene el sedimento de proteínas. Deje este líquido residual en el tubo para
11. Mezcle suavemente la solución por inversión hasta que las hebras blancas de ADN en forma de hilos formen una masa visible.
12. Centrifugar a 13 000–16 000 × g durante 1 minuto a temperatura ambiente para obtener 300 µl de muestra. Centrifugar a 2000 × g durante 1 minuto a
temperatura ambiente para obtener 3 ml de muestra. El ADN será visible como una pequeña bolita blanca.
13. Decante el sobrenadante y agregue un volumen de muestra de etanol al 70% a temperatura ambiente al ADN. Invierta suavemente el tubo varias veces para lavar
el sedimento de ADN y los lados del tubo de microcentrífuga. Centrifugar como en el paso 12.
14. Aspire con cuidado el etanol utilizando una pipeta Pasteur extraída o una punta de pipeta de secuenciación. El sedimento de ADN es
muy flojo en este punto y se debe tener cuidado para evitar aspirar el sedimento hacia la pipeta. Invierta el tubo sobre papel absorbente limpio y seque el pellet
15. Agregue la solución de rehidratación de ADN (100 µl para un volumen de muestra de 300 µl; 250 µl para un volumen de muestra de 3 ml) al tubo y rehidrate
el ADN incubando a 65 °C durante 1 hora. Mezcle periódicamente la solución golpeando suavemente el tubo.
Alternativamente, rehidrate el ADN incubando la solución durante la noche a temperatura ambiente o a 4°C.
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Hay disponible un kit a gran escala para procesar hasta 1 litro de sangre completa (n.º de catálogo A1620). Este kit no incluye la solución RNase
ya que el paso de digestión de RNase es opcional. La solución de ARNasa A (4 mg/ml) está disponible como un artículo separado (n.° de cat. A7973). Si
es necesario, se requiere un total de 5 ml de solución de RNasa A para procesar 1 litro de sangre.
1. Para muestras de sangre total de 10 ml: agregue 30 ml de solución de lisis celular a un tubo de centrífuga estéril de 50 ml.
! Importante: La sangre debe recolectarse en tubos con anticoagulante EDTA, heparina o citrato para evitar la coagulación.
2. Agite suavemente el tubo de sangre hasta que esté bien mezclado; luego transfiera 10 ml de sangre al tubo que contiene la solución de lisis
celular. Invierta el tubo de 5 a 6 veces para mezclar.
3. Incubar la mezcla durante 10 minutos a temperatura ambiente (invertir 2 a 3 veces una vez durante la incubación) para lisar los glóbulos rojos.
Centrifugar a 2000 × g durante 10 minutos a temperatura ambiente.
4. Retire y deseche la mayor cantidad de sobrenadante posible sin alterar el sedimento blanco visible. Aproximadamente
Quedarán 1,4ml de líquido residual.
Si la muestra de sangre se ha congelado, agregue 30 ml adicionales de solución de lisis celular, invierta 5 a 6 veces para mezclar y repita los pasos
3 a 4 hasta que el sedimento esté casi blanco. Puede haber cierta pérdida de ADN en muestras congeladas.
Nota: Es posible que se vean algunos glóbulos rojos o restos de células junto con los glóbulos blancos. Si el sedimento parece contener solo
glóbulos rojos, agregue una alícuota adicional de solución de lisis celular después de retirar el sobrenadante sobre el sedimento celular y luego repita
los pasos 3 y 4.
5. Agite el tubo vigorosamente hasta que los glóbulos blancos se resuspendan (10 a 15 segundos).
! Resuspender completamente los glóbulos blancos para obtener una lisis celular eficiente.
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6. Agregue 10 ml de solución de lisis de núcleos al tubo que contiene las células resuspendidas. Pipetee la solución 5 a 6 veces para lisar los glóbulos blancos.
La solución debería volverse muy viscosa. Si se ven grumos de células después de mezclar, incube la solución a 37 °C hasta que se rompan los
grumos. Si los grumos aún son visibles después de 1 hora, agregue 3 ml de solución de lisis de núcleos adicionales y repita la incubación.
7. Opcional: agregue RNasa A, hasta una concentración final de 20 µg/ml, al lisado nuclear y mezcle la muestra invirtiendo el tubo de 2 a 5 veces.
Incubar la mezcla a 37°C durante 15 minutos y luego enfriar a temperatura ambiente.
8. Agregue 3,3 ml de solución de precipitación de proteínas al lisado nuclear y agite vigorosamente durante 10 a 20 segundos. Es posible que se vean
pequeños grupos de proteínas después de agitar.
Nota: Si se agregó solución de lisis de núcleos adicional en el paso 6, agregue 4 ml de solución de precipitación de proteínas (en lugar
de 3,3 ml).
Debería verse una bolita de proteína de color marrón oscuro. Si no se observa ningún pellet, consulte la Sección 4.
10. Transfiera el sobrenadante a un tubo de centrífuga de 50 ml que contenga 10 ml de isopropanol a temperatura ambiente.
Nota: Es posible que quede algo de sobrenadante en el tubo original que contiene el sedimento de proteínas. Deje el líquido residual en el tubo
para evitar contaminar la solución de ADN con la proteína precipitada.
11. Mezcle suavemente la solución por inversión hasta que las hebras blancas de ADN en forma de hilos formen una masa visible.
12. Centrifugar a 2000 × g durante 1 minuto a temperatura ambiente. El ADN será visible como una pequeña bolita blanca.
13. Decantar el sobrenadante y añadir 10 ml de etanol al 70% a temperatura ambiente al ADN. Invierta suavemente el tubo varias veces para lavar el
sedimento de ADN y los lados del tubo de centrífuga. Centrifugar como en el paso 12.
14. Aspirar con cuidado el etanol. El sedimento de ADN está muy suelto en este punto y se debe tener cuidado para evitar aspirarlo.
el pellet en la pipeta. Seque el pellet al aire durante 10 a 15 minutos.
15. Agregue 800 µl de solución de rehidratación de ADN al tubo y rehidrate el ADN incubándolo a 65 °C durante 1 hora.
Mezcle periódicamente la solución golpeando suavemente el tubo. Alternativamente, rehidrate el ADN incubando la solución durante la
noche a temperatura ambiente o a 4°C.
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Este protocolo se puede ampliar a 20 µl, 30 µl o 40 µl de sangre. La Tabla 2 describe los distintos volúmenes de solución utilizados en cada paso. Las
preparaciones de cincuenta microlitros generalmente producen ADN genómico en el rango de 0,2 a 0,7 µg, dependiendo del número de leucocitos en la
muestra de sangre.
Proteína ADN
20 µl 60 µl 20 µl 6,7 µl 20 µl 10 µl
30 µl 90 µl 30 µl 10 µl 30 µl 15 µl
40 µl 120 µl 40 µl 13,3 µl 40 µl 20 µl
50 µl 150 µl 50 µl 16,5 µl 50 µl 25 µl
! Importante: La sangre debe recolectarse en tubos con anticoagulante EDTA, heparina o citrato.
3. Deje la placa a temperatura ambiente durante 10 minutos, pipeteando la solución dos veces durante la incubación para ayudar a
lisar los glóbulos rojos.
4. Centrifugar a 800 × g durante 5 minutos en una centrífuga de mesa para concentrar las células.
5. Retire con cuidado y deseche la mayor cantidad posible de sobrenadante con la punta de una micropipeta, dejando un pequeño sedimento de
glóbulos blancos y algunos glóbulos rojos. Se recomienda el uso de una punta de pipeta extendida, como una punta de carga de gel. Inclinar la placa
de 96 pocillos entre 50 y 80° (dependiendo de la cantidad de líquido presente por pocillo) permite una eliminación más completa del líquido del pocillo.
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6. Agregue 50 µl de solución de lisis de núcleos a cada pocillo y pipetee 5 a 6 veces para resuspender el sedimento y lisar los glóbulos blancos. La solución debería
volverse más viscosa. Como ayuda en la visualización del sedimento de ADN, en este paso se pueden agregar 2 µl por pocillo de un portador (p. ej.,
Polyacryl Carrier [Molecular Research Center, Inc., Cat.# PC152]). Los rendimientos de ADN son generalmente equivalentes con o sin uso de portador.
7. Agregue 16,5 µl de solución de precipitación de proteínas por pocillo y pipetee 5 a 6 veces para mezclar.
8. Centrifugar a 1400 × g durante 10 minutos a temperatura ambiente. Debería verse una bolita de proteína marrón. Si no se ve ningún pellet, consulte la
Sección 4.
a. Transfiera con cuidado los sobrenadantes a pocillos limpios que contengan 50 µl por pocillo de isopropanol a temperatura
Nota: Es posible que quede parte del sobrenadante en el pocillo original que contiene el sedimento de proteínas. Deje este líquido residual en el pozo
para evitar contaminar la solución de ADN con la proteína precipitada. Como en el Paso 5, inclinar la placa facilitará la eliminación del líquido del
pocillo. El uso de una punta de pipeta extendida en este paso no permite mezclar fácilmente la muestra con isopropanol.
b. Centrifugar a 1400 × g durante 10 minutos. Retire con cuidado el isopropanol con una punta de micropipeta.
mi. Aspire con cuidado el etanol utilizando una pipeta Pasteur extraída o una punta de pipeta de secuenciación. Se debe tener cuidado para evitar
aspirar el sedimento de ADN. Coloque la bandeja en un ángulo de 30 a 45° y déjela secar al aire durante 10 a 15 minutos.
F. Agregue 25 µl de solución de rehidratación de ADN a cada pocillo. Deje que el ADN se rehidrate durante la noche a temperatura
ambiente o a 4°C.
gramo.
Guarde el ADN a una temperatura de 2 a 8 °C.
Nota: Se pueden recolectar fácilmente pequeños volúmenes de ADN en el fondo de un pocillo en V centrifugando brevemente la placa de 96 pocillos
antes de su uso.
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3.D. Aislamiento de ADN genómico a partir de células de cultivo de tejidos y tejidos animales
•
Baño de agua a 95 °C (opcional; para células de cultivo de tejidos, paso 1.d)
•
baño de agua, 37°C
•
isopropanol, temperatura ambiente
•
Etanol al 70%, temperatura ambiente.
•
baño de agua, 65°C (opcional; para una rápida rehidratación del ADN)
•
EDTA 0,5 M (pH 8,0) (para cola de ratón)
•
Proteinasa K (20 mg/ml en agua; Cat.# V3021) (para cola de ratón)
•
Baño María a 55°C (para cola de ratón)
a. Coseche las células y transfiéralas a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml. Para las células adherentes, tripsinice las células antes de cosecharlas.
d. Lavar las células añadiendo 200 µl de PBS y agitando vigorosamente para resuspender las células. Centrifugar como en el Paso 1.b,
y retire el PBS.
Nota: Para las células que no se lisan bien solo en la solución de lisis de núcleos (por ejemplo, células PC12), realice un paso adicional de congelación y
descongelación de la siguiente manera antes de continuar con el Paso 1.e: Lave las células como en el Paso 1.d; luego congelar en nitrógeno líquido.
Descongelar las células calentándolas a 95°C. Repita este procedimiento por un total de 4 ciclos.
mi. Agregue 600 µl de solución de lisis de núcleos y pipetee para lisar las células. Pipetear hasta que no queden grupos de células visibles.
b. Agregue de 10 a 20 mg de tejido fresco o descongelado a la solución de lisis de núcleos fría y homogeneice durante 10 segundos con un homogeneizador
pequeño. Transfiera el lisado a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml. Alternativamente, muela el tejido en nitrógeno líquido usando un mortero
que haya sido preenfriado en nitrógeno líquido. Después de la molienda, deje que el nitrógeno líquido se evapore y transfiera aproximadamente
de 10 a 20 mg del tejido molido a 600 µl de solución de lisis de núcleos en un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml.
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a. Para cada muestra a procesar, agregue 120 µl de una solución de EDTA 0,5 M (pH 8,0) a 500 µl de solución de lisis de núcleos en un tubo de
centrífuga. Enfriar sobre hielo.
b. Agregue entre 0,5 y 1 cm de cola de ratón fresca o descongelada a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml.
Nota: El tejido se puede moler hasta obtener un polvo fino en nitrógeno líquido utilizando un mortero previamente enfriado en nitrógeno
líquido. Luego transfiera el polvo a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml.
mi. Incubar durante la noche a 55°C con agitación suave. Alternativamente, realice una incubación de 3 horas a 55°C (con agitación); Agite la
muestra una vez por hora si realiza una incubación de 3 horas. Asegúrate de que la cola esté completamente digerida.
4. Opcional para cola de ratón: agregue 3 µl de solución de ARNasa al lisado nuclear y mezcle la muestra invirtiendo el tubo de 2 a 5 veces. Incubar
la mezcla durante 15 a 30 minutos a 37°C. Deje que la muestra se enfríe a temperatura ambiente durante 5 minutos antes de continuar.
5. A la muestra a temperatura ambiente, agregue 200 µl de solución de precipitación de proteínas y agite vigorosamente a alta velocidad durante 20
segundos. Enfríe la muestra en hielo durante 5 minutos.
6. Centrifugar durante 4 minutos a 13.000–16.000 × g. La proteína precipitada formará un gránulo blanco apretado.
7. Retire con cuidado el sobrenadante que contiene el ADN (dejando atrás el sedimento de proteína) y transfiéralo a un tubo de microcentrífuga
limpio de 1,5 ml que contenga 600 µl de isopropanol a temperatura ambiente.
Nota: Es posible que quede algo de sobrenadante en el tubo original que contiene el sedimento de proteínas. Deje este líquido residual en el tubo
para evitar contaminar la solución de ADN con la proteína precipitada.
8. Mezcle suavemente la solución por inversión hasta que las hebras blancas de ADN en forma de hilos formen una masa visible.
9. Centrifugar durante 1 minuto a 13.000–16.000 × g a temperatura ambiente. El ADN será visible como una pequeña bolita blanca.
Decantar con cuidado el sobrenadante.
10. Agregue 600 µl de etanol al 70 % a temperatura ambiente e invierta suavemente el tubo varias veces para lavar el ADN. Centrífugo
durante 1 minuto a 13.000–16.000 × g a temperatura ambiente.
11. Aspire con cuidado el etanol utilizando una pipeta Pasteur extraída o una punta de pipeta de secuenciación. El sedimento de ADN está muy suelto en
este punto y se debe tener cuidado para evitar aspirar el sedimento hacia la pipeta.
12. Invierta el tubo sobre papel absorbente limpio y seque el sedimento al aire durante 10 a 15 minutos.
13. Agregue 100 µl de solución de rehidratación de ADN y rehidrate el ADN incubando a 65 °C durante 1 hora. Mezcle periódicamente la solución
golpeando suavemente el tubo. Alternativamente, rehidrate el ADN incubando la solución durante la noche a temperatura ambiente o a 4°C.
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1. Procese el tejido de la hoja congelándolo con nitrógeno líquido y moliéndolo hasta obtener un polvo fino utilizando un mortero con tubo de
microcentrífuga o un mortero. Agregue 40 mg de este polvo de hoja a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml.
2. Agregue 600 µl de solución de lisis de núcleos y agite durante 1 a 3 segundos para humedecer el tejido.
4. Agregue 3 µl de solución de ARNasa al lisado celular y mezcle la muestra invirtiendo el tubo de 2 a 5 veces. Incubar el
mezcla a 37°C durante 15 minutos. Deje que la muestra se enfríe a temperatura ambiente durante 5 minutos antes de continuar.
5. Agregue 200 µl de solución de precipitación de proteínas y agite vigorosamente a alta velocidad durante 20 segundos.
6. Centrifugar durante 3 minutos a 13.000–16.000 × g. Las proteínas precipitadas formarán un gránulo apretado.
7. Retire con cuidado el sobrenadante que contiene el ADN (dejando atrás el sedimento de proteína) y transfiéralo a un tubo de microcentrífuga limpio
de 1,5 ml que contenga 600 µl de isopropanol a temperatura ambiente.
Nota: Es posible que quede algo de sobrenadante en el tubo original que contiene el sedimento de proteínas. Deje este líquido residual en el tubo para
8. Mezcle suavemente la solución por inversión hasta que las hebras de ADN en forma de hilos formen una masa visible.
10. Decantar con cuidado el sobrenadante. Agregue 600 µl de etanol al 70 % a temperatura ambiente e invierta suavemente el tubo varias veces para lavar el
11. Aspire con cuidado el etanol utilizando una pipeta Pasteur extraída o una punta de pipeta de secuenciación. El sedimento de ADN está muy suelto en este
punto y se debe tener cuidado para evitar aspirar el sedimento hacia la pipeta.
12. Invierta el tubo sobre papel absorbente limpio y seque el pellet al aire durante 15 minutos.
13. Agregue 100 µl de solución de rehidratación de ADN y rehidrate el ADN incubando a 65 °C durante 1 hora. Mezcle periódicamente la solución golpeando
suavemente el tubo. Alternativamente, rehidrate el ADN incubando la solución durante la noche a temperatura ambiente o a 4°C.
12 Promega Corporation ∙ 2800 Woods Hollow Road ∙ Madison, WI 537115399 EE. UU. ∙ Número gratuito en EE. UU. 8003569526 ∙ 6082744330 ∙ Fax 6082772516
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1. Agregue 1 ml de un cultivo cultivado durante 20 horas en caldo YPD a un tubo de microcentrífuga de 1,5 ml.
2. Centrifugar a 13.00016.000 × g durante 2 minutos para sedimentar las células. Retire el sobrenadante.
5. Incubar la muestra a 37°C durante 30 a 60 minutos para digerir la pared celular. Dejar enfriar a temperatura ambiente.
7. Agregue 300 µl de solución de lisis de núcleos al sedimento celular y pipetee suavemente para mezclar.
8. Agregue 100 µl de solución de precipitación de proteínas y agite vigorosamente a alta velocidad durante 20 segundos.
11. Transfiera el sobrenadante que contiene el ADN a un tubo de microcentrífuga limpio de 1,5 ml que contenga 300 µl de espacio.
temperatura isopropanol.
Nota: Es posible que quede algo de sobrenadante en el tubo original que contiene el sedimento de proteínas. Deje este líquido residual en el tubo
para evitar contaminar la solución de ADN con la proteína precipitada.
12. Mezcle suavemente por inversión hasta que las hebras de ADN en forma de hilos formen una masa visible.
14. Decantar con cuidado el sobrenadante y escurrir el tubo sobre papel absorbente limpio. Añadir 300 µl de temperatura ambiente.
Etanol al 70% e invertir suavemente el tubo varias veces para lavar el sedimento de ADN.
15. Centrifugar a 13 000–16 000 × g durante 2 minutos. Aspire con cuidado todo el etanol.
16. Drene el tubo sobre papel absorbente limpio y deje que el pellet se seque al aire durante 10 a 15 minutos.
18. Agregue 1,5 µl de solución de RNasa a la muestra de ADN purificada. Agite la muestra durante 1 segundo. Centrifugar brevemente en una
microcentrífuga durante 5 segundos para recoger el líquido e incubar a 37°C durante 15 minutos.
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19. Rehidratar el ADN incubándolo a 65°C durante 1 hora. Mezcle periódicamente la solución golpeando suavemente el tubo.
Alternativamente, rehidrate el ADN incubando la solución durante la noche a temperatura ambiente o a 4°C.
2. Centrifugar a 13.00016.000 × g durante 2 minutos para sedimentar las células. Retire el sobrenadante. Para bacterias Gram positivas, continúe con el
Paso 3. Para bacterias Gram Negativas, vaya directamente al Paso 6.
4. Agregue la(s) enzima(s) lítica(s) apropiada(s) al sedimento celular resuspendido en un volumen total de 120 µl y pipetee suavemente para mezclar. El
objetivo de este pretratamiento es debilitar la pared celular para que pueda tener lugar una lisis celular eficaz.
Nota: Para determinadas especies de Staphylococcus , se requiere una mezcla de 60 µl de 10 mg/ml de lisozima y 60 µl de 10 mg/ml
de lisostafina para una lisis eficaz. Sin embargo, muchas cepas de bacterias Gram positivas (p. ej., Bacillus subtilis, Micrococcus luteus, Nocardia
otitidiscaviarum, Rhodococcus rhodochrous y Brevibacterium albidium) se lisan eficazmente utilizando lisozima sola.
5. Incubar la muestra a 37°C durante 30 a 60 minutos. Centrifugar durante 2 minutos a 13.000–16.000 × g y retirar el sobrenadante.
6. Agregue 600 µl de solución de lisis de núcleos. Pipetear suavemente hasta que las células se resuspendan.
7. Incubar a 80°C durante 5 minutos para lisar las células; luego enfriar a temperatura ambiente.
8. Agregue 3 µl de solución de RNasa al lisado celular. Invierta el tubo de 2 a 5 veces para mezclar.
10. Agregue 200 µl de solución de precipitación de proteínas al lisado celular tratado con RNasa. Agite vigorosamente a alta velocidad durante 20
segundos para mezclar la solución de precipitación de proteínas con el lisado celular.
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13. Transfiera el sobrenadante que contiene el ADN a un tubo de microcentrífuga limpio de 1,5 ml que contenga 600 µl de espacio.
temperatura isopropanol.
Nota: Es posible que quede algo de sobrenadante en el tubo original que contiene el sedimento de proteínas. Deje este líquido residual en el tubo para
14. Mezcle suavemente por inversión hasta que las hebras de ADN en forma de hilos formen una masa visible.
16. Retirar con cuidado el sobrenadante y escurrir el tubo sobre papel absorbente limpio. Agregue 600 µl de etanol al 70 % a temperatura ambiente e invierta suavemente
17. Centrifugar a 13 000–16 000 × g durante 2 minutos. Aspirar con cuidado el etanol.
18. Drene el tubo sobre papel absorbente limpio y deje que el pellet se seque al aire durante 10 a 15 minutos.
19. Agregue 100 µl de solución de rehidratación de ADN al tubo y rehidrate el ADN incubando a 65 °C durante 1 hora.
Mezcle periódicamente la solución golpeando suavemente el tubo. Alternativamente, rehidrate el ADN incubando la solución durante la noche a temperatura
ambiente o a 4°C.
4. Solución de problemas
Si tiene preguntas que no se abordan aquí, comuníquese con su sucursal o distribuidor local de Promega. Información de contacto disponible en: [Link].
Síntomas Comentarios
Coágulos de sangre presentes en muestras de sangre. Es posible que el tubo se haya almacenado incorrectamente; la sangre no se mezcló
Pobre rendimiento de ADN La muestra de sangre puede contener muy pocos glóbulos blancos. Extraer nuevas
muestras de sangre.
La muestra de sangre era demasiado antigua. Los mejores rendimientos se obtienen con sangre
fresca. Las muestras que se han almacenado a una temperatura de 2 a 8 °C durante más
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Síntomas Comentarios
ADN degradado (<50 kb de tamaño) Recolección o almacenamiento inadecuado de la muestra de sangre. Obtener una
nueva muestra en las condiciones adecuadas.
Pobre rendimiento de ADN utilizando el protocolo de Los cultivos cultivados durante un tiempo prolongado contienen una alta
bacterias Gram positivas proporción de células que se lisan fácilmente tras la exposición al tratamiento con lisostafina.
Iniciar purificaciones con un cultivo saludable.
Sin gránulos de proteínas La muestra no se enfrió a temperatura ambiente antes de agregar la solución de
precipitación de proteínas. Enfriar la muestra a temperatura ambiente (al
Pellet de ADN difícil de disolver Es posible que las muestras se hayan secado demasiado. Rehidratar el ADN
incubando durante 1 hora a 65 °C y luego dejar la muestra a temperatura ambiente o
4 °C durante la noche. Precaución: No deje el ADN a 65°C durante la noche.
5. Referencias
1. Miller, SA, Dykes, DD y Polesky, HF (1988) Un procedimiento simple de salazón para extraer ADN de células nucleadas
humanas. Núcleo. Ácidos res. 16, 1215.
2. Beutler, E., Gelbart, T. y Kuhl, W. (1990) Interferencia de la heparina con la reacción en cadena de la polimerasa.
BioTécnicas 9, 166.
3. Departamento de Trabajo de EE. UU., Administración de Salud y Seguridad Ocupacional (1991) Exposición ocupacional a patógenos transmitidos por
la sangre, regla final. Registro Federal 56, 64175.
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6. Apéndice
Sistema de purificación de ADN Wizard® Plus SV Minipreps + adaptadores de vacío 50 preparaciones A1340
Sistema de purificación de ADN Wizard® Plus SV Minipreps + adaptadores de vacío 250 preparaciones A1470
7. Resumen de cambios
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(c) Licenciado según la patente de [Link]. Nos. 9.933.417, 10.018.624 y 10.161.932 del Instituto Médico Howard Hughes.
(d) Patente de [Link]. Nos. 7.867.726, 8.168.405 y 8.257.939, patente japonesa núms. No. 4748685 y otras patentes en trámite.
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