TEMA 16: GENÓMICA NUTRICIONAL

GENÓMICA NUTRICIONAL
Ciencia que estudia las interacciones funcionales de los alimentos y sus componentes
con el genoma a nivel molecular, celular y sistémico, mediante:
- comprensión del impacto de la nutrición sobre las vías metabólicas y el control
homeostático. (depende de si como o no)
- Investigación de la alteración de la regulación homeostática en las fases iniciales de
las enfermedades relacionadas con la dieta.
- investigación en torno a cuánto y cómo influye la carga genética en las
enfermedades anteriores.
Objetivo: prevención o tratamiento de enfermedades mediante la dieta

Se deben distinguir dos términos:

- Nutrigenética
- Nutrigenómica
NUTRIGENÉTICA
Ciencia que estudia en función del gen como debe ser la dieta (fenilcetonuria). Se basa en
los genes
GEN o DNA→ NUTRIENTE o RESPUESTA A LOS NUTRIENTES
Ciencia que estudia el efecto de la variación genética individual sobre los requerimientos
óptimos de nutrientes concretos.

Correspondiente a la secuencia de ADN, estudia la relación entre la variación

inter-individual de ADN y la variación en la respuesta a los nutrientes.

Estudia el efecto de la variación genética en la relación entre la dieta y la enfermedad.

Se buscan polimorfismos:
Formas diferentes de un mismo gen. Una mutación es algo que le pasa a una
persona, ocurre al azar. El polimorfismo ocurre en un 1% de la población o más. Si
no, será una mutación.
Si tenemos un gen malo para la gestión del colesterol, pero tenemos una
vida saludable y no estresamos a ese gen, no vamos a enfermar. Si
empezamos a liarla con una dieta desequilibrada vamos a tener problemas
pero los que tienen ese gen bien van a ser capaces de contrarrestar y los
que lo tienen mal no. Es predisponente pero no determinante.

Entonces tenemos la capacidad de modificar la expresión génica.

• Cambios de la secuencia de nucleótidos del ADN → puntos que hacen que la
secuencia de ADN entre sujetos sea diferente.
• Aparecen en el 1% de la población o en porcentajes mayores.
• Unos de los más comunes:
– SNP (Single Nucleotide Polymorphisms), cambios en un sólo nucleótido.
• Pueden estar relacionados con la enfermedad→ej. obesidad o enfermedades
metabólicas.
Objetivo: Modificación del fenotipo de enfermo conferido por alteraciones en algún gen con
una dieta adecuada y compatible a la actividad enzimática que ha resultado dañada por la
mutación genética.

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 NUTRIGENÓMICA:
Estudia en función de la dieta como están los genes.
GEN o DNA ←NUTRIENTE
No se va a cambiar la secuencia, pero sí que ese gen se exprese o no.

Ciencia que estudia la regulación de los genes por parte de la dieta, incluidas las funciones
de los genes. Estudia cómo afecta la dieta a los siguientes aspectos

Es decir, la nutrigenómica estudia el efecto de los nutrientes en el genoma, transcriptona y

proteoma y metaboloma.

Interacción directa gen-nutriente → cambio agudo en la expresión génica

El cambio es agudo, porque es inmediato
Pero a corto plazo

EPIGENÉTICA
Es la ciencia que estudia la regulación de la expresión génica, que ocurre durante la vida de
cada persona, sin afectar a la secuencia de ADN.

Estudia las modificaciones covalentes que pueden regular la expresión del ADN sin alterar
la secuencia de nucleótidos.

Los mecanismos principales de regulación epigenética son:

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Sirve para estudiar cómo afecta lo que comemos a nuestra vida.

La epigenética es a largo plazo y la nutrigenómica es aguda a corto plazo

Características de la epigenética:

● Gemelas:
Idéntica genética
Dieta y modos de vida diferentes → epigenética ≠
ADN metilado → “borrado” de genes
Los cambios epigenéticos pueden corregirse

Los cambios epigenéticos SON RÁPIDOS

Es más a largo plazo pero muy rápido

● Hambruna de Amsterdam
El hambre no puede alterar los genes, pero sí su configuración.

Los efectos de ese invierno de hambre en los niños tuvo consecuencias en su salud
para toda su vida.
La epigenética tiene “memoria”. Lo grabado se mantiene en el tiempo y es
heredable

Los bebés nacidos en ese invierno y los fetos sufrieron cambios muy fuertes. Sus
organismos se adaptaron para permanecer siempre en esos entornos. Pero cuando
terminó la hambruna, su genética no se adaptó.
En este caso, era tan brusca que no se puedo recuperar. Porque la epigenética tiene
memoria. El hambre afectó a la configuración de los genes. Los que quedaron
inactivos quedaron indicativos para siempre y los activados para siempre.

Ventanas epigenéticas: Aquí se dan los cambios epigenéticos y el cambio dura más.
Vamos a decir que es crónico.

● La paradoja japonesa:
Menor incidencia de cáncer
La modulación de los grupos metilo activa e inactiva genes
Té verde

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 Componente epigenético de las enfermedades

Características: rápida, memoria, heredable

● Bisfenol A:
No es tóxico ni cancerígeno en lo general hasta ahora, pero epigenéticamente sí.

Activa receptores estrogénicos donde no tiene que haber y se activa genes

inactivados
Se han medido niveles de BFA en mujeres embarazadas y niños

El bisfenol A podría tener relación con la obesidad y desarrollo sexual

• ¿Cuáles son los causantes de los cambios epigenéticos?

Los cambios epigenéticos se dan como respuesta a los cambios ambientales.
Por lo tanto, los causantes de los cambios epigenéticos son:
• alimentos
• bebida
• tabaco
• actividad física
• hipoxia
• estrés
• sol
•etc.

•¿Cuáles son las características de los cambios epigenéticos?

Son cambios rápidos que se producen en respuesta a cambios ambientales (la genética
necesita generaciones)
Se mantienen en el tiempo la epigenética tiene memoria
Los cambios epigenéticos son hereditarios

•¿Cómo actúa la epigenética?

El ambiente influye en la forma de trabajar de nuestros genes (expresión)

El ADN tiene información genética guardada. La epigenética “desencripta” esa información

mediante la metilación de ADN y las histonas y la acetilación de las histonas.

Existe relación entre la actividad genética y la enzimática y entre la metilación / acetilación.

Los alimentos pueden aumentar o inhibir la expresión de los genes.

•¿Tiene el genoma toda la información necesaria?

El DNA guarda la información genética, la epigenética “desencripta” esa información.
- Genoma: cromosomas-genes
- Epigenoma: Configuración de la expresión génica, nos indica los genes activados y los
inactivados

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•¿Qué es el epigenoma?
Indica la CONFIGURACIÓN de la expresión génica
Nos indica los genes activos y los inactivos

•Las enfermedades tienen una base epigenética: diagnosis epigenética

Cada enfermedad tiene un componente epigenético
Hay que aplicar la epigenética en el análisis de todas las enfermedades. Los
investigadores, clínicos y epigenetistas deben trabajar de forma coordinada.
Utilidad de la diagnosis epigenética:
plasma → extracción de DNA → analizar el patrón de metilación → conocer cuáles son los
genes activados e inactivados → detectar probabilidad de padecer determinadas
enfermedades

El ser humano es la consecuencia de la conversación entre el entorno y el genoma:

• Los genes puede tener distintas variabilidades: polimorfismos
• los genes conllevan predisposición pero no son determinantes - deterministas
• Hay que provocar esa predisposición
•Podemos provocar un cambio en los genes según nuestro comportamiento o estilo de vida,
según nuestra relación con el entorno.
•El ser humano ha de utilizar los recursos del entorno, por ejemplo los nutricionales, de la
forma más eficiente posible.

La alimentación:
→ modifica la biodisponibilidad de los grupos metilo
→efecto en la metilación-acetilación genética
efecto en la expresión genética
→ cambios del fenotipo (sobre todo en momentos críticos del crecimiento y desarrollo del
feto)

Podemos provocar un cambio en los genes según nuestro comportamiento o estilo de vida,
según nuestra relación con el entorno.

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 TEMA 17. FACTORES NUTRICIONALES Y CONTROL DE LA EXPRESIÓN GÉNICA

1. Interacción gen-nutriente
La interacción entre los genes y los nutrientes es compleja y variada

3 tipos de interacciones:
• Variaciones genéticas, polimorfismos (SNP) → condicionan algunas necesidades nutritivas
• Interacción directa gen-nutriente → cambio agudo en la expresión de genes
• Interacción epigenética → cambio crónico en la expresión de genes

En los alimentos existen diversos componentes que no son considerados nutrientes pero
que pueden ser importantes en la regulación génica y, por lo tanto, pueden afectar a la
salud del individuo y ser causa de diversas patologías.

2. Regulación de la expresión génica

1. Desempaquetado del DNA cromosomal (crónica)
Las cadenas de DNA son muy largas
Se enrolla alrededor de las histonas (histonas carga+,DNA-)
Así la RNA polimerasa no puede actuar sobre ella
2. Regulación de la transcripción del DNA (nutrigenomica) (agudo)
Transcripción: síntesis de RNAm a partir de un trozo de la cadena de DNA
(gen)
Factores de transcripción
3. Regulación postranscripcional
- Procesamiento de RNA = maduración
- Estabilización del RNA
- Traducción ribosomal

Control epigenético
Mecanismos principales de la regulación epigenética:
a. Metilación de las cadenas de DNA
b. Modificaciones de la cadena de aminoácidos terminales de las histonas:
- metilación
- acetilación

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a. Metilación del ADN
A la cadena de DNA se le une el grupo metilo mediante unión covalente

La metilación se relaciona generalmente con la represión génica de esa zona de

DNA
Los enzimas que catalizan la reacción se denominan DNA metiltransferasas
(DNMT):
DNMT 1 – mantenimiento de la metilación
DNMT 3a y 3b – metilación de novo de las zonas no metiladas

La metilación tiene lugar en las zonas CpG (C seguido de G)(aquí se va a unir el

CH3):(por lo tanto, si hay un gen casi sin C y G juntas no será regulable
epigenéticamente)
• islotes CpG se caracterizan por ser zonas de inducción de la expresión de
muchos genes, zonas donde se unen los factores de transcripción.

Que un metil esté unido no deja espacio al factor de transcripción → Impedimento

estérico
Se ha visto que en la parte reguladora se encuentran la mayoría de G y C juntos

La dieta:
- puede influir directamente en los DNMT
- puede limitar la disponibilidad de moléculas que ofrecen grupos metilo
- Algunos nutrientes (ácido fólico, betaína, colina, vit B12) favorecen la formación de
metionina a partir de homocisteína. La metionina se convierte en Sadenosilmetionina
(SAM) que da grupos metilo al DNA.
Homocisteína → metionina → S-adenosilmetionina

Cuando el dna está metilado → está inhibido

b. Modificación de histonas
La unidad estructural de la cromatina → nucleosoma

Nucleosoma: 146 pares de bases de DNA helicoidal enrollado dos veces en una
proteína octamérica denominada histona
Los cambios epigenéticos suceden en la cola terminal de aa de las histonas
(zona externa)
Cambios epigenéticos en los extremos aminoacídicos de las histonas provocados
por la nutrición y las condiciones fisiopatológicas. Ac: acetilación,
ADP: ADP-ribosilación, Bio: biotinización, met: metilación, Ph: fosforilación.

Todas las cosas que se pegan a los flecos tienen efectos.

Se han descrito más de 100 tipos de cambios que tienen lugar en los extremos
terminales de las histonas:
- metilación: mono-, di-, tri-metilación. Esto puede suponer la activación o inhibición
- acetilación: mono-, di-acetilación.
- otros: fosforilación, ubiquitinación, biotinización, ADP-ribosilación

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 Los cambios en las histonas provocan alteraciones en el empaquetado del DNA
facilitan o dificultan la entrada a los factores de transcripción

Metilación:
Los grupos metilo se unen a los residuos de lisina (Lys) y arginina (Arg) de la cola
terminal de aa:
- la mono-, di-, trimetilación de Lys → activación o inhibición de la transcripción
- la mono-, dimetilación de Arg → activación de la transcripción

Alimentación → grupos metilo

Acetilación:
Las histonas sufren reacciones de acetilación/desacetilación en la cola terminal de
aa, sobre todo en los residuos de Lys.

Los enzimas que catalizan estas reacciones:

- Aciltransferasas de histonas (HAT)
- Desacetilasas de histonas (HDCA)

Sustrato de acetilación: acetil-CoA (y está en todos lados)

Receptor del residuo de la desacetilación: coenzima A

Cualquier factor que afecte a la disponibilidad de acetil-CoA puede afectar a la

acetilación de histonas.

La acetilación confiere a la cromatina una conformación más laxa y por lo tanto ésta
queda más alcanzable, transcripcionalmente más activa.

La desacetilación de histonas compacta la cromatina (normalmente) y por lo tanto

ésta no queda tan alcanzable, queda más inactiva para la transcripción.

Tipos de desacetilasas: dependientes de zinc y NAD (niveles en

dieta)
Activadores de desacetilasas: teofilina del té, resveratrol del vino, dietas
ricas en sal, dietas hipocalóricas
Inhibidores de desacetilasas: compuestos organosulforados del ajo,
metabolitos derivados de la vitamina E, isoflavonas, nicotinamida, niveles
elevados de glucosa, sulforananos de las crucíferas

3. Factores de transcripción
Proteínas necesarias para que actúen las RNA polimerasas.
Se unen a zonas específicas del ADN (zonas inductoras o elementos
respondedores) y activan la transcripción del gen.
Se clasifican según su función:
- constitutivos: provocan la expresión de los genes que dan lugar a
proteínas que se deben sintetizar en todo momento.
- reguladores: síntesis de la proteína según el estado fisiológico.

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 Tipos de factores de transcripción:
1. Superfamilia de receptores esteroideos
2. Factores de transcripción activados por señales internas
3. Factores de transcripción activados por señales extracelulares

FUTURO DE LA GENÓMICA NUTRICIONAL

El objetivo será el genoma:
1. Genoma Humano
• Genoma
• Transcriptoma
• Proteoma
• Metaboloma
• Epigenoma
2. Genoma de los alimentos
• Fitoestrógenos, antioxidantes…
3. Microbioma (genoma de la flora intestinal)

Definiciones nutrigenética, epigenética y nutrigenómica, epigenoma para que , ejemplos

Nutrigenómica → aguda
Epigenética → crónica, dura un largo tiempo

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 TEMA 18. APLICACIONES DE LA GENÓMICA NUTRICIONAL

I. APLICACIONES EN SALUD PÚBLICA

Salud Pública: Ciencia que se encarga de organizar y dirigir los esfuerzos colectivos para
proteger, promover y restaurar la salud de la población

¿Enfermedades? ¿Causas? Actuación sobre las causas

Genoma humano → 27%

Dieta → 43%
Medio ambiente → 19%
Asistencia sanitaria → 11%

Gracias a la nutrigenómica en Salud Pública….

1.- Se identificarán los componentes de la dieta que puedan suponer un riesgo o una
protección frente a la enfermedad

2.- Se podrán aplicar las tecnologías asociadas a la nutrigenómica para descubrir nuevos
biomarcadores en epidemiología nutricional

3.- Se caracterizará mejor la etiología de las distintas enfermedades en la población

4.- Se podrán estratificar los riesgos de enfermedad y realizar intervenciones nutricionales

más específicas

OBJETIVO:
Identificar sujetos con variaciones genéticas en distintos genes candidatos>>
>> Identificarlos como “personas de alto riesgo”
>>Diseñar dietas personalizadas

Los test genéticos que ofrecen asesoramiento han crecido de forma exponencial en los
últimos años.

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Nutrición personalizada
Concepto tradicional:
La adaptación de la dieta de acuerdo exclusivamente a las necesidades,
gustos y aversiones individuales.

Desarrollo de las ómicas → permitirá distinguir las diferencias individuales en la

respuesta a un patrón nutricional específico, contribuyendo al mantenimiento de la
salud junto al tratamiento y la prevención de enfermedades

METAGENÓMICA Comprende desde la biotransformación y la digestión de los alimentos

hasta la absorción de nutrientes, y los resultados sobre la fisiología humana y el
metabolismo, teniendo en cuenta la microbiota y el genoma, y la interacción con el ser
humano y los genomas individuales.

Es necesario un desarrollo de nuevas tecnologías metagenómicas para su aplicación en la

nutrición personalizada.

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II. APLICACIONES TERAPÉUTICAS
– Nutrigenómica y cáncer
Los compuestos de la dieta podrían estar implicados en el 30% de los casos de cáncer (2ª
causa después del tabaco):

algunos son procancy otros anti

Algunos alimentos influyen en la DMMTs y se da el silenciamiento de genes (son
anticancerígeno) y otros aumentan la expresión de genes proapoptóticos

-Carencias de vitaminas y minerales

•Déficit de ácido fólico, B12, B6, C, E, niacina,hierro y zinc → pueden provocar alteraciones
en el DNA:
Rotura de la cadena de DNA
Lesiones oxidativas
→ se relaciona con el desarrollo de procesos cancerígenos

-Aditivos (colorantes, emulsificantes, estabilizadores, conservantes, etc) → nitrosaminas,

nitrosamidas, micotoxinas e hidrocarburos aromáticos policíclicos:
→ alteraciones en los nucleótidos, daños en cromosomas
→ Cáncer de hígado, esófago, estómago

- Compuestos que se forman tras la cocción: benzopireno cáncer de estómago y de colon,

y aumentaría el riesgo de cáncer de mama y de pulmón

– Nutrigenómica y obesidad
Enfermedad multifactorial
En la mayoría de los casos, consecuencia de la interacción entre los factores genéticos y
los ambientales

Ambiente obesogénico → subgrupo de población genéticamente predispuesta que llegan a

ser obesos mórbidos

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Teoría de los genes ahorradores
genes que predisponen a la obesidad habrían tenido una ventaja selectiva en poblaciones
que están sometidas con frecuencia a épocas de hambruna susceptibilidad a obesidad
extrema, resistencia a la insulina y DM tipo 2
Indios Pima y de Islas del Pacífico.
•Vida rural
•Vida urbana

–Nutrigenómica y ECV
Existen individuos que responden de forma diferente a factores dietéticos

III. APLICACIONES EN LA INDUSTRIA ALIMENTARIA

El impacto de la nutrigenómica sobre la industria alimentaria es considerable, con
aplicaciones a lo largo de toda la cadena alimentaria…
•Agricultura
•Producción
•Seguridad
•Calidad
Podemos ver las aplicaciones desde dos puntos de vista:
1. Aplicación de técnicas epigéneticas en la elaboración directa de alimentos.
2. Aplicación de las técnicas empleadas y de los conocimientos acerca de la nutrigenómica
en el cultivo, producción y elaboración de nuevos alimentos y en el aseguramiento de su
calidad.

– Aplicación de técnicas epigéneticas en la elaboración de alimentos

Introducción de miARN en plantas o animales
→ Para la elaboración de nuevos alimentos Transgénicos o Funcionales → Más
resistentes o con compuestos o nutrientes específicos o concentrados
miRNA → provocan el silenciamiento de un gen y por tanto el organismo carecerá
de esa proteína

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Introducción de miRNA en plantas:
Aumento de la productividad
Mayor resistencia a patógenos
Mayor resistencia a condiciones ambientales
Cambios en la composición nutricional

Introducción de miRNA en animales

1. Prueban los miRNAs que sirven para bloquear el gen de la β-lactoglobulina
2. Lo prueban in vivo en el ratón
3. Lo reproducen en el ternero

Esto depende de donde se mire es bueno o malo:

- Se absorbían sin digerir y eran capaces de regular la expresión de nuestros genes
- Los miRNAs ingeridos en la leche materna son degradados y por tanto no pueden
llegar a regular la expresión génica

– Aplicación de las técnicas y de los conocimientos acerca de la nutrigenómica

Los conocimientos acerca de la nutrigenómica se pueden aplicar en distintos eslabones de
la cadena alimentaria:
- Agricultura
- Producción alimentaria
- Seguridad alimentaria
- Aseguramiento de la calidad
- Elaboración de alimentos funcionales

Nutrigenómica agrícola (PRODUCCIÓN PRIMARIA):

determinar formas de cultivo y crianza de plantas y ganado modificados genéticamente con
el fin de potenciar su propia salud, resistencia y rendimiento, así como modificar su
composición para mejorar las cualidades nutricionales que son importantes para la salud
humana

>>Incrementar la concentración de sustancias beneficiosas para la salud → podrían

modificar regular la expresión de genes (NUTRIGENÓMICA

Cultivos de plantas modificadas genéticamente

Objetivo:
- Conseguir resistencia frente a herbicidas, insectos, virus, etc. (Maiz Bt)
-Mejora de cualidades nutricionales (Arroz Dorado, tomate con flavonoides, vino enriquecido
en polifenoles, etc)
Producción animal
Suplementación/modificación de la dieta del animal para:
- Potenciar la salud del animal
- Mejorar el rendimiento
- Aumentar la calidad del producto:
Aceites, algas, semillas de lino, aceites de pescado, etc. obtención de leche o huevos con
DHA, EPA, omega-3, Ácido Linoleico Conjugado

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Procesado, seguridad y garantía de calidad:
1. Procesado
“marcadores de proceso” = marcadores moleculares informativos que pueden ayudar a
dirigir los procesos industriales o a mejorar la gestión de la cadena de distribución.
Ejemplos:
- En la manufactura del té: marcador de procesos de recolección, fermentación, secado
- En el proceso de envejecimiento del brócoli: marcadores que indiquen “buen” o “mal”
comportamiento tras recolección.

2. Seguridad alimentaria
Evaluación de composición (compuestos tóxicos, alérgenos, etc), detección de
microorganismos patógenos (E.coli, Salmonella, Lysteria…).
Ejemplos:
- Detección de ADN de gluten en alimentos hidrolizados (cervezas, cereales en polvo para
alimentación infantil, etc),
- Detección de ADN de microorganismos patógenos en alimentos (gen común para todos o
gen específico)

3. Garantía de calidad
Identificación de ADN para autentificación de vegetales, animales y productos alimenticios
envasados
Evitar “fraudes alimentarios” (arroz basmati, bonito, trigo común,
café, etc)

El ADN es resistente a distintos tratamientos y específico para cada especie

Gracias a las nuevas tecnologías: Desarrollo de los alimentos funcionales

IV. ASPECTOS ÉTICOS Y LEGALES

Las pruebas genéticas suscitan controversias en el plano ético y legal…
• Consentimiento informado
• Gestión de muestras
• Resultados discutibles
• Personas formadas en nutrición y genética.
• CONFIDENCIALIDAD (aportación de historial familiar y discriminación)
• Exceso de autonomía
• Medicalización de la dieta y obsesión con la salud

FALTAN DIRECTRICES → guías en algunos países

regresión multifactorial (navidades): considerando todos los factores y las relaciones

entre ellos.

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