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Tema 2: Biología Molecular

2.1: Moléculas para el metabolismo

Teoría del vitalismo: los organismos vivos estaban hechos de compuestos orgánicos que solo
se podían producir en organismos vivos porque se necesitaba una fuerza vital.

Síntesis de urea
● Según el vitalismo solo se podía producir dentro de
organismos vivos (era un compuesto orgánico =
necesita de fuerza vital).
● 1828: se sintetiza urea artificialmente. Primera vez
que un compuesto orgánico se sintetizaba.
● Falsificó el vitalismo.

Metabolismo: red de todas las reacciones catalizadas por enzimas en una célula u organismo.
● Anabolismo: síntesis de moléculas complejas a partir de moléculas más simples
(monómero → macromolécula).
○ Son reacciones de condensación - se produce agua.
○ Requieren ATP.
● Catabolismo: descomposición de moléculas complejas a más simples.
○ Incluye la hidrólisis (macromoléculas → monómero), por lo que se rompen
moléculas de agua (de H2O a H y OH).
○ Liberan energía (ATP).
2.2: Agua
La molécula del agua
Polaridad del agua:
● Es una molécula polar: una parte tiene carga positiva y la otra carga negativa.
○ Hidrógeno: carga positiva leve.
○ Oxígeno: carga negativa leve porque atrae los electrones más fuerte que el
hidrógeno.

Enlaces de hidrógeno:
● Se forman este tipo de enlaces entre moléculas de agua - le da al agua propiedades
muy útiles para los organismos vivos.
● Sudor: actúa como refrigerante porque se libera energía (calor) cuando los enlaces de
las moléculas de agua en las gotas se rompen y se evaporan.

Propiedades del agua: CATS


1. Cohesión: las moléculas de agua se unen entre sí mediante enlaces de hidrógeno.
a. Beneficio: transporte de agua en las plantas. Es aspirada a baja presión por el
xilema - esto solo funciona si las fuerzas de succión no separan las moléculas.
Separación no ocurre porque enlaces de hidrógeno son fuertes.
2. Adhesivas: dipolaridad del agua le permite adherirse a otras moléculas que son
polares mediante enlaces de hidrógeno.
a. Beneficio: fuerzas adhesivas agua-celulosa en paredes celulares de hojas. Si
se evapora + sale de la hoja, las fuerzas adhesivas atraen agua del xilema
más próximo. Esto mantiene las paredes húmedas para absorber el CO2
necesario para fotosíntesis.
3. Térmicas:

4. Solvente: muchas sustancias se disuelven en agua debido a su polaridad.


a. Beneficio: agua es el medio para las reacciones metabólicas porque la mayoría
de sustancias en las reacciones químicas están disueltos en agua.
Solubilidad del agua:
● Hidrofílico: sustancias que se atraen al agua y forman enlaces con él. Sustancias
iónicas/polares se disuelven en agua porque sus iones/moléculas están más atraídas
al agua que a ellas mismas.
● Hidrofóbico: lo opuesto. Las moléculas de agua están más atraídas a ellas mismas
que a les moléculas apolares. Sustancias hidrofóbicas son insolubles en el agua.

Transporte en sangre: en el plasma se transportan sustancias - el modo de transporte de una


sustancia depende de su solubilidad con el agua.
1. Cloruro de sodio: soluble y es transportado disuelto como iones Na+ y Cl-.
2. Aminoácidos y glucosa: solubles - transportados disueltos.
a. AA: su solubilidad depende del grupo R (algunos R son hidrofob. otros
hidrofíl.). Pero, todos son lo suficientemente solubles.
3. Oxígeno: apolar. Es pequeño = soluble pero de manera limitada = cantidad de oxígeno
transportado en el cuerpo es muy poco. Se une a la hemoglobina.
4. Colesterol + grasas: apolares. Se transportan con las lipoproteínas.
2.3: Glúcidos y lípidos

Carbohidratos
Monosacáridos: los monómeros (unidades individuales de azúcar) de los carbohidratos. Solo
tienen C, H y O en una proporción de 1:2:1. Ejemplos:
● Ribosa: ● Glucosa:

Disacáridos: molécula resultante de la unión de dos monosacáridos. Son reacciones de


condensación (anabolismo). Son azúcares y tienen estructura de dos anillos.
1. Glucosa + glucosa → maltosa + agua

2. Glucosa + galactosa → lactosa + agua


3. Glucosa + fructosa → sacarosa + agua

Polisacáridos: unión de varios monosacáridos mediante enlace glucosídico (de C1 de una


glucosa a C4 de la siguiente). Celulosa, almidón y glucógeno están compuestos de
glucosa.

Lípidos
Hay tres tipos principales:
1. Triglicéridos: tres cadenas de ácidos grasos + un glicerol (condensación).
2. Fosfolípidos: dos cadenas de ácidos grasos unidos a un glicerol + grupo fosfato en
lugar de la tercera cadena de ácidos grasos.
3. Esteroides: estructura de cuatro anillos.

Ácidos grasos: - CH2 - (CH2)n - CH3


Tipos de ácidos grasos:
1. Saturados: todos los carbonos en la cadena se unen por enlaces simples.
2. Insaturados: hay 1+ enlaces dobles entre los carbonos.
a. Monoinsaturados: solo un enlace doble.
b. Poliinsaturado: 2+ enlaces dobles.
c. Cis insaturado: hidrógenos unidos al carbono del
mismo lado del doble enlace.
d. Trans insaturado: H unidos al C en lados
opuestos del enlace doble.

Riesgos de la salud por ácidos grasos trans/saturados.


● Grasas trans: correlación positiva entre # de grasas trans consumidas y enfermedad
coronaria. Su uso está prohibido en algunos países.
● Grasas saturadas: puede ser otro factor a la enfermedad coronaria, pero hay
poblaciones que no encajan en la correlación.
Kenya: una tribu consume muchas grasas saturadas y la enfermedad es muy
inusual.

Índice de masa muscular:

𝐵𝑀𝐼 = 𝑚𝑎𝑠𝑎 𝑒𝑛 𝑘𝑖𝑙𝑜𝑔𝑟𝑎𝑚𝑜𝑠 (𝑎𝑙𝑡𝑢𝑟𝑎 𝑒𝑛 𝑚𝑒𝑡𝑟𝑜𝑠)^2

Carbohidratos vs. lípidos: SODAS


2.4: Proteínas

Aminoácidos: monómeros de los polipéptidos.

Variedad: el grupo R en los aminoácidos puede cambiar. Los


organismos vivos solo incluyen veinte en los polipéptidos que los ribosomas sintetizan =
se usan los mismos veinte a.a. (+2 excepciones).
● Esto se usa como evidencia que todos los organismos vivos tienen un ancestro en
común.

Enlaces peptídicos:
● El nuevo enlace que se forma entre el grupo amino de un a.a.
y el carboxilo del a.a. adyacente.
● Los aminoácidos se enlazan mediante reacciones de
condensación.

Dipéptido: dos aminoácidos (solo un enlace peptídico).


Polipéptidos: muchos aminoácidos enlazados por enlace peptídico.

Polipéptidos y proteínas:
● Los aminoácidos pueden unirse en cualquier secuencia = muchos posibles
polipéptidos.
○ En un polipéptido con 100 aminoácidos, hay 2^100 secuencias posibles.
● Los organismos vivos solo producen una pequeña cantidad de estas secuencias
porque ellas tienen propiedades útiles.
● La secuencia de a.a. de un polipéptido codifica para un gen.
○ Se necesitan tres bases para codificar un aminoácido.
● Una proteína consiste de 1+ polipéptidos.

Proteomas: todas las proteínas producidas por una célula, tejido u organismo. Varía por
individuo porque diferentes células producen diferentes proteínas.
● Muestra lo que está sucediendo en el organismo porque las proteínas que se
producen varían con el tiempo.

Desnaturalización: cambio estructural y químico de una proteína.


1. Calor: rompe enlaces intramoleculares y cambia la estructura del polipéptido.
2. pH: cada proteína tiene un pH óptimo, si se aumenta o disminuye drásticamente
(cuando está lejos de lo óptimo), la proteína cambia de estructura = se rompen
enlaces.
Funciones de las proteínas: SHITS ME
1. Structure: colágeno/seda de araña.
2. Hormonal: insulina/glucagón.
3. Inmunidad.
4. Transporte: hemoglobina.
5. Sensación.
6. Movimiento: actina y miosina (movimiento del músculo).
7. Enzimas: rubisco.
2.5: Enzimas

Enzimas: proteínas globulares y catalizadoras biológicas que aceleran y controlan reacciones


del metabolismo.

Las enzimas reaccionan con sustratos.


1. El sustrato se une al sitio activo de la enzima. Esto ocurre porque la geometría y la
composición química del sitio activo se complementa con la del sustrato = se atraen y
encajan.
a. Especificidad enzima-sustrato: moléculas diferentes al sustrato no se
complementa con la enzima. La enzima está hecha para un sustrato en
particular.
b. Estado líquido del sustrato = hay movimiento aleatorio = probabilidad de
colisión.
2. Durante la unión el sustrato → producto (el sustrato se transforma en sustancias
químicas diferentes = el producto).
3. Los productos se separan del sitio activo, dejando al sitio activo libre para catalizar la
reacción con más sustratos.

Enzimas inmovilizadas:
● Las enzimas se inmovilizan para que catalizan reacciones específicas en la industria.
Se acopla a otro material (superficie de vidrio, atrapándolas en gel, o uniéndolas entre
sí).
● Trae beneficios:
○ Se controla la catálisis al añadir/remover enzimas de la mixtura de reacción.
○ Enzimas pueden ser reusadas.
Factores que afectan actividad enzimática
● Temperatura:

● pH:
● Concentración del sustrato:
2.6: Estructura del ADN y el ARN

Nucleótidos: monómeros de los ácidos nucleicos (polímeros - ADN y ARN). Estructura:


● Un azúcar pentosa + grupo fosfato + una base nitrogenada.
○ ADN: su pentosa es desoxirribosa (sin OH en el C2) y sus bases son adenina,
citosina, guanina y timina.
○ ARN: su pentosa es ribosa y sus bases son A, C, G y uracilo.

Estructura del ARN y ADN:


● ARN solo tiene una cadena de nucleótidos, ADN tiene dos.
○ Los nucleótidos en una cadena se unen por enlace covalente desde la pentosa
de un nucleótido hasta el fosfato del siguiente.
● ADN: sus dos cadenas son antiparalelas (en direcciones opuestas). Las dos cadenas
se unen por enlaces de hidrógeno entre sus bases (A-T y C-G) = bases
complementarias.
2.7: Replicación, transcripción y traducción del ADN

Replicación
Semi-conservativa:
● El modelo de Watson y Crick sugirió que el ADN se copiaba mediante un método de
replicación semiconservativo.
● Se separan las dos cadenas y cada una sirve como plantilla para las nuevas cadenas.
○ Complementariedad de bases: debido a esto, cada nueva cadena tiene la
misma secuencia de bases que la cadena antigua que fue separada de la
cadena plantilla con la que se formó esa nueva cadena.
● La dos nuevas moléculas de ADN son idénticas entre sí y con la antigua - cada ADN
producido tiene una cadena nueva y una cadena de la molécula pariente.

Pasos:
1. Helicasa desenrolla la doble hélice y
separa las dos cadenas al romper los
enlaces de hidrógeno entre las bases.
2. ADN polimerasa une nucleótidos libres
para formar la nueva cadena, usando la
cadena preexistente como plantilla y
guiándose por la comp.d.bases.
3. La molécula de ADN hija se enrolla en
una doble hélice.

Meselson y Stahl:
● Cultivaron E.coli por generaciones en un medio donde la única fuente de nitrógeno
era 15N - las bases en el ADN de la bacteria era 15N.
● Las movieron a un lugar con el isótopo 14N.
● Una solución de CsCl se giró en un centrífugo, Cs es pesado = se hundía. Se
establecía un gradiente con la mayor concentración de Cs.
○ Parte inferior: mayor concentración y densidad.
○ Parte superior: menor concentración y densidad.
○ Cualquier sustancia centrifugada con CsCl se concentra en un nivel
correspondiente con su densidad.
● Mezclaron ADN de E.coli con CsCl con diferentes tiempos después de que entraron
en contacto con 14N.
○ ADN absorbe UV por lo que creaba una banda oscura cuando los tubos eran
iluminados con luz UV.
○ Una generación: ADN entre 14N y 15N.
○ Dos generaciones: dos bandas iguales una en 14N y otra en 15N.
○ Otras generaciones: bandas menos densas se
volvieron más fuertes y las de 15N más débiles.

Transcripción
Para sintetizar un polipéptido se necesita hacer una copia de la
secuencia de bases de un gen - esta copia está hecha de ARN y es llevado a los
ribosomas por el citoplasma para que sea traducido por el ARN mensajero (ARNm).

Transcripción: el proceso en el que se copia la secuencia de bases de un gen al producir una


molécula de ARN.
1. ARN polimerasa se mueve a lo largo del gen y separa el ADN en dos cadenas
individuales.
2. ARN polimerasa une nucleótidos de ARN a una de las cadenas del ADN. Se siguen
las mismas reglas de comp.de.bas. pero uracilo (U) en vez de T.
3. ARN polimerasa une los nucleótidos de ARN (pentosa - fosfato).
4. La cadena de ARN se separa de la cadena de ADN.
5. Las dos cadenas del ADN se unen de nuevo y se enrollan para formar la doble hélice.

Cadena sentido: a cadena del ADN que no fue transcrita tiene la misma secuencia que ARNm,
pero T y no U.
Cadena antisentido: la cadena transcrita.

Producto final de la transcripción: una molécula de ARN con una secuencia de bases
complementaria a la de la cadena de ADN que se usó como plantilla.
Traducción
Es la síntesis de polipéptidos en los ribosomas, usando ARNm y ARNt. El código genético
determina la secuencia de aminoácidos en el polipéptido.
● Tres bases codifican un aminoácido.
● Codón: triplete de bases. Un codón codifica un aminoácido.
● La traducción depende de la complementariedad de bases entre los codones del
ARNm y los anticodones del ARNt.

Proceso:
1. ARNm se une a la subunidad menor del ribosoma. El ARNm tiene codones.
2. ARNt tienen un triplete de bases (anticodón) y lleva el aminoácido correspondiente al
anticodón.
3. Hay tres sitios de unión para el ARNt en la subunidad mayor del ribosoma, pero solo
se unen dos ARNt a la vez. El ARNt solo se puede unir si tiene el anticodón
complementario al codón del ARNm.
4. El codón y anticodón se enlazan (e.d.hidró.) usando las mismas reglas de
compl.de.bases.
5. Los aminoácidos llevados por los ARNt se unen por enlace peptídico.
a. Primero se forma un dipéptido en el ARNt de la derecha.
b. Luego el ribosoma se mueve a lo largo del
ARNm.
c. Se une otro ARNt con otro aminoácido a la
izquierda. El ARNt de la derecha sale y el de la
izquierda recibe el dipéptido + se mueve a la
derecha.
d. Se forma una cadena de tres aminoácidos.
e. Se repite desde paso B hasta que se forma una
cadena de polipéptidos.
2.8: Respiración celular
Definición: la liberación controlada de energía por compuestos orgánicos para producir ATP.
● Esta energía se necesita para llevar a cabo los procesos de organismo (transporte
activo/síntesis de proteínas).
● ATP: fuente de energía a disposición inmediata.

Respiración anaeróbica: sin oxígeno - proporciona poco ATP a partir de glucosa. Útil cuando:
1. Se agotó oxígeno en las células.
2. El organismo vive en ambientes con poco
oxígeno.
3. Se necesita poco ATP pero rápido.
● Como no está limitado por la cantidad de
oxígeno respirado, la respiración anaeróbica
es usada en músculos que realizan mucho
ejercicio.

Levaduras y sus usos:


● Los dos productos de las levaduras cuando hacen respiración anaeróbica se usan en
las industrias.
● CO2 (panadería y repostería):
○ La levadura usa todo el oxígeno en la masa y produce etanol con CO2 por
respiración anaeróbica.
○ El CO2 forma burbujas que hacen que la masa suba.
○ Cuando la masa está cocida el etanol se evapora y las burbujas del CO2 le
dan al pan una buena textura.
● Etanol (biofuel y cervecería):
○ La levadura es cultivada en líquido con nutrientes pero sin oxígeno para que
respire anaeróbicamente.
○ La concentración de etanol del fluido aumenta 15% antes que se vuelva tóxico
para la levadura y la fermentación acabe.
○ Las burbujas de CO2 salen a la atmósfera.

Respiración aeróbica: con oxígeno - proporciona mucho ATP a partir de glucosa.


● Consiste de muchas reacciones
químicas.
● Ocurre en la mitocondria.
2.9: Fotosíntesis
Definición: la producción de compuestos de carbono en células usando energía de lumínica.

Los organismos vivos necesitan de estos compuestos de carbono para construir las
estructuras de sus células y llevar a cabo procesos vitales.

Producción de glúcidos:
dióxido de carbono + agua + energía lumínica → glucosa + oxígeno
● CO2 se convierte en carbohidratos y otros compuestos de carbono (requiere energía).
● Luz es absorbida por pigmentos fotosintéticos.
● Fotólisis: luz rompe el agua para conseguir H+ que se necesitan para convertir el CO2.
Oxígeno es un residuo. (H2O → 4e- + 4H+ + O2)

Espectro de absorción:
● Espectro: rango de longitudes de onda de radiación
electromagnética (UV, IR, visible, radio).
○ Violeta: longitud de onda más pequeña (400nm).
○ Rojo: longitud de onda más grande (700nm).
● El gráfico a la derecha muestra el porcentaje de luz absorbida
por un pigmento.
○ Clorofila es el fotopigmento más importante. Absorbe
rojo y violeta/azul pero absorbe poco verde porque la
mayoría de la longitud de onda del verde es reflejado.
○ Por eso la clorofila es verde.
Espectro de acción:
● Muestra la tasa de fotosíntesis con cada longitud de onda
de luz.
● La eficiencia de fotosíntesis es el porcentaje de luz de una
longitud de onda que se usa en la fotosíntesis.

Factores limitantes:
1. Intensidad de luz:
a. Poca intensidad: tasa de fotólisis, y por ende tasa
de fotosíntesis (producción de glúcidos), es limitada porque no se absorbe
suficiente luz.
b. Alta intensidad: todas las clorofilas saturadas con luz.

2. Concentración de CO2:
a. Pocas concentraciones: enzima que convierte CO2, rubisco, no es efectiva.
b. Altas concentraciones: rubisco está saturado.

3. Temperatura:
a. Poca temperatura: enzimas que catalizan la conversión de CO2 → carbohidrato
trabajan lentamente.
b. Alta temperatura: las enzimas se desnaturalizan. Tasa de fotosíntesis
disminuye.

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