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Guía Bioquímica: Fundamentos y Conceptos

Este documento presenta una guía sobre conceptos básicos de bioquímica. En menos de 3 oraciones, resume lo siguiente: Introduce los temas de mundo vivo, biomoléculas y metabolismo, describiendo conceptos clave como que la vida es celular, se fundamenta en la información y se adapta. También presenta una introducción a moléculas como aminoácidos, azúcares, ácidos nucleicos y otras biomoléculas importantes.

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Guía Bioquímica: Fundamentos y Conceptos

Este documento presenta una guía sobre conceptos básicos de bioquímica. En menos de 3 oraciones, resume lo siguiente: Introduce los temas de mundo vivo, biomoléculas y metabolismo, describiendo conceptos clave como que la vida es celular, se fundamenta en la información y se adapta. También presenta una introducción a moléculas como aminoácidos, azúcares, ácidos nucleicos y otras biomoléculas importantes.

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Guía Bioquímica Parcial 1

Bioquímica (Universidad de Monterrey)

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Guía Bioquímica Parcial 1

Tema 1: Mundo Vivo


1. La vida es compleja: ​Todos los organismos se encuentras constituidos por
el mismo conjunto de elementos químicos carbono, nitrógeno, oxigeno,
hidrogeno, azufre y fosforo
2. La vida es organizada y se sustenta a si misma:​ Los seres vivos son
sistemas organizados jerárquicamente ya que constan de niveles de
organización que van desde lo mas pequeño (átomos) a lo mas grande
(organismos)
3. La vida es celular: ​Si se separan los componentes de una célula se detiene el
funcionamiento vital. Las células solo pueden originarse mediante la división
de células existentes.
4. La vida se fundamenta en la información:​ Los seres vivos son sistemas
que procesan información, porque el mantenimiento de su integridad
estructural y sus procesos metabólicos requiere interacciones entre un
conjunto enorme de moléculas dentro de las células y entre ellas
5. La vida se adapta y evoluciona:​ Cada vez que se produce un individuo de
una población, las modificaciones del DNA causadas por el estrese ambiental
y los errores del proceso de replicación pueden dar lugar a ​mutaciones. ​La
mayoría de las mutaciones son silenciosas, sin embargo algunas son nocivas
y limitan el éxito reproductor de los descendientes

Biomoléculas: ​Moléculas sintetizadas por los seres vivos

Las células están compuestas por diversas biomoléculas y macromoléculas ,


dispuestas en estructuras supramoleculares mas complejas

Metabolismo​: La suma de todas las reacciones que ocurren en un ser vivo

Homeostasis: ​La capacidad de los seres vivos para regular los procesos
metabólicos, a pesar de la variabilidad de sus ambientes interno y externo

El agua es una molécula inorgánica que supone entre el 50 y el 95% del peso de una
célula y los iones como el sodio (Na+), potasio (K+), magnesio(Mg2+) y calcio (Ca2+)
pueden representar el otro 1%

Las moléculas orgánicas se forman principalmente de 6 elementos:


● Carbono
● Hidrogeno
● Oxigeno
● Nitrógeno
● Fosforo

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● Azufre

Hidrocarburos: ​Moléculas que contienen carbono e hidrogeno y son hidrófobas


(insolubles en agua)

Grupos funcionales: ​Conjuntos específicos de átomos que determinan las


propiedades químicas

Nucleótido trifostafo de adenosina (ATP):​ Funciona como reserva celular de


energía química

Aminoácidos​: Compuestos orgánicos que se combinan para formar proteínas


● El mas simple es la Glicina
● Se unen por enlaces peptídicas
● La insulina tiene 51 aminoácidos y fue la primera sintetizada

Existen 20 aminoácidos
● Aminoácidos esenciales​: No pueden venir del cuerpo por lo cual se tienen
que obtener por los alimentos
● Aminoácidos no esenciales:​ Significa que aunque no lo obtengamos a
través de los alimentos nuestro cuerpo lo produce

Proteína +50 aminoácidos


Polipetido -50 aminoácidos
Oligopetidos -10 aminoácidos

Enlaces peptídicos: ​Enlace entre un grupo amino de un aminoácido y un grupo


carboxilo de otro aminoácido

Azucares​: son los carbohidratos mas pequeños y contienen grupos funcionales


alcohol y carbonilo
● Los azucares que posen un grupo aldehído se denominan aldosas
● Los azucares que posen un grupo cetona se denominan cetosas

Monosacáridos​: son azúcares sencillos como la glucosa y la fructosa

Polisacáridos:​ Polímeros que contienen miles de unidades de azúcar como el


almidón y la celulosa de las plantas

Ácidos grasos: ​Ácidos monocarboxilicos que en general contienen un numero par


de átomos de carbono
● Están representados por la formula química R-COOH
● Ácidos grasos saturados​: que no contiene enlaces dobles carbono-carbono
● Ácidos grasos insaturados​: Que tienen uno o varios enlaces
carbono-carbono

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Nucleotidos: ​Contienen 3 componentes


● Azucar de 5 carbonos
● Base nitrogenada
● Uno o varios grupos fosfato

DNA (acidos desoxirribonucleico)​: Es el sitio de almacenamiento de la


información genética y forma una doble hélice
● Contiene 4 clases de bases nitrogenadas
● Purinas: adenina y guanina
● Pirimidinas: timina y citosina
● Enlace de hidrogeno: fuerza de atracción de atracción entre el hidrogeno
polarizado de un grupo molecular y atomos electronegativos de oxigeno o
nitrógeno

RNA (acido ribonucleico): ​Se diferencia del DNA porque contiene azúcar ribosa y
contiene la base uracilo en lugar de timina
● El RNA se sintetiza mediante la transcripción, que es la unión de pares de
bases complementarias especificas
● RNA mensajero
● RNA ribosómico
● RNA de transferencia

Tema 2: Agua
Molécula del agua: ​Esta formada por 2 átomos de hidrogeno y uno de oxigeno

El oxigeno es mas electronegativo que el hidrogeno

Si las moléculas del agua fueran lineales, como las del dióxido de carbono, las
polaridades se equilibrarían entre si y el agua seria no polar

Dipolos: ​Moléculas en las que la carga esta separada


● Cuando los dipolos moleculares se encuentran en un campo eléctrico, se
orientan a si mismos en dirección opuesta a la del campo

Enlace de hidrogeno o puente de hidrogeno: ​El hidrogeno es compartido de


modo desigual por los 2 centros electronegativos. El enlace tiene tanto carácter
electrostático como covalente.

Interacciones electrostáticas: ​Ocurren entre cualesquiera de 2 cargas opuestas


parciales o bien, completas

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Enlaces covalentes: ​Implican la distribución compartida de electrones con


superposición o mezcla de orbitales

Interacciones no covalentes electrostáticas: ​Se producen entre el nucleo positivo


de un atomo y las nubes eléctricas negativas de otro atomo cercano

Interacciones covalentes individuales: ​Son relativamente débiles y, por lo tanto,


se rompen con facilidad

Los iones de carga opuesta se atraen y los iones con cargas similares se repelen

Puentes salinos: ​Se forman con la atracción de las cadenas laterales de los
aminoácidos cargados de forma positiva y negativa

Fuerzas de van der Waals: ​Son interacciones electrostáticas relativamente débiles


que se originan cuando las biomoleculas que contienen dipolos permanentes
neutros se aproximan entre si o a un dipolo inducible. Cuanto mas polares y
colineales son los grupos involucrados, mas fuerte es la interacción de van der
Waals

Interacción dipolo-dipolo: ​Fuerzas que se producen entre moléculas que


contienen átomos electronegativos, hacen que las moléculas se orienten a si mismas
de tal forma que el extremo positivo de un grupo polar se dirija hacia el extremo
negativo de otro

Interacciones dipolo-dipolo inducido: ​Un dipolo permanente induce un dipolo


transitorio en una molécula cercana al modificar su distribución electrónica

Interacciones dipolo inducido-dipolo inducido: ​El movimiento de los electrones


en las moléculas apolares cercanas da lugar a un desequilibrio de carga transitorio
en las moléculas adyacentes

Fuerza de dispersión de London: ​Un dipolo transitorio en una molécula polariza


los electrones de una molécula vecina

La estructura dipolar del agua y su capacidad para formar enlaces de hidrogeno con
átomos electronegativos le permiten disolver sustancias iónicas y polares

Esferas de solvatación:​ Capas de moléculas de agua que se forman alrededor de los


iones positivos y negativos

Constante dieléctrica: ​Determina la capacidad de un disolvente para reducir la


atracción electrostática entre las cargas

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● El agua es considerado el disolvente universal y posee una constante


dieléctrica muy elevada

Gel​: es una mezcla coloidal, consiste en biopolímeros con superficies polares


vinculadas con agua absorbida

Efecto hidrofobico:​ proceso en el cual la red de solvatación del agua excluye


pequeñas cantidades de sustancias apolares mezcladas con agua

El efecto hidrófobo es responsable de la generación de membranas lipídicas estables


y contribuye a la fidelidad del plegamiento de las proteínas

Biomoleculas anfipaticas:​ contienen grupos polares y apolares

Micelas:

Osmosis: ​Es el paso espontaneo de moléculas de disolvente a través de una


membrana semipermeable que separa una disolución con menor concentración de
soluto de una disolución con mayor concentración

Cuanto mayor sea la concentración de agua en una disolución, mayor será la


cantidad de agua que fluya a través de la membrana

Presión osmótica: ​Presión que se requiere para detener el flujo neto del agua a
través de la membrana

El valor de i para un soluto no ionizable es siempre 1.0

Solución isotónica​: La concentración de soluto y de agua es la misma a ambos lados


de la membrana plasmática de permeabilidad selectiva

Solución hipotónica​: Solución con una menor concentración de soluto

Soluciones hipertónicas: ​Aquellas con mayores concentraciones de soluto

Potencial de membrana: ​Diferencia de potencial a ambos lados de una membrana


● El lado citoplasmático de una membrana es fuertemente negativo
● El lado externo de la membrana es positivo debido a la cantidad
relativamente grande de iones sodio extracelulares

Neutra​: Cuando una solución contiene cantidades iguales de H+ y OH-

Acidas:​ Soluciones con exceso de H+

Básicas: ​Tienen un numero mayor de OH-

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Se dice que un grupo lateral de una molécula es acido si actúa como donante de
protones y básico si lo hace como aceptor

Ácidos débiles:​ Ácidos orgánicos que no se disocian en su totalidad en el agua

Base conjugada​: producto que ha perdido protones en la reacción de disociación

La escala del pH:​ se puede utiliza para determinar la concentración de iones de


hidrogeno
● La neutralidad se define como pH 7
● Las soluciones acidas tienen valores de pH menores de 7
● Y las que tienen valores de pH mayores de 7 son básicas o alcalinas

Acidosis: ​Trastorno que se produce cuando el pH de la sangre humana desciende


por debajo de 7.35

Alcalosis​: Cuando el pH aumenta por encima de 7.45

Amortiguadores​: Ayudan a mantener una concentración de iones hidrogeno


relativamente constante
● Una solución amortiguadora puede oponerse a cambios de pH porque se
establece un equilibrio entre los componentes del amortiguador

Principio de Le Chatelier: ​Establece que si una reacción en equilibrio es sometida a


fuerza, el equilibrio se desplazara en la dirección que contrarreste dicha fuerza

Capacidad amortiguadora:​ Depende de 2 factores


● La concentración molar del par acido-base conjugada
● El cociente de sus concentraciones

Amortiguador de fosfato:​ consta de un par acido débil-base conjugada

TEMA 3: TERMODINÁMICA

Termodinámica​: Cambios físicos y químicos de la materia

Bioenergética​: estudia las transformaciones de la energía de los seres vivos

Entalpia​: Contenido total de calor

Entropía​: Desorden

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Energía libre: ​La energía disponible para realizar un trabajo químico y una medida
de la espontaneidad de las reacciones químicas
● El cambio de la energía es negativo cuando ∆S es positivo lo cual es una
reacción exergonica
● Si ∆G es positivo se dice que el proceso es endergonico
● Cuando ∆G es cero, el proceso se encuentra en equilibrio

Primera ley de termodinámica: ​La energía no se crea ni se destruye, solo se


transforma
● Cuando H es negativa (​∆H<0​) el proceso o la reacción libera calor y se
denomina exotérmico
● Cuando H es positiva (​∆H>0) se absorbe calor del entorno y el proceso se
llama endotérmico
● Isotérmico (​∆H​ =0) no se intercambia calor

Segunda ley de termodinámica: ​Los procesos físicos y químicos se producen de


manera espontanea solo cuando incrementan el desorden del universo
● Cuando se producen cambios físicos o químicos con libercion de energía son
espontaneos
● Cuanto mas desordenado esta un sistema, mayor es el valor de su entropia

Tercera ley de termodinámica: ​El desorden se aproxima a 0

Trifosfato de adenosina (ATP): ​La hidrólisis del ATP proporciona de forma


inmediata y directa la energía libre para impulsar una variedad inmensa de
reacciones bioquímicas endergonicas
● El ATP impulsa varias clases de procesos
o La biosíntesis de biomoleculas
o El transporte activo de sustancias a través de las membranas celulares
o El trabajo mecánico, como la concentración celular

Hibrido de resonancia: ​Cuando una molécula tiene 2 o mas estructuras


alternativas que solo se diferencian en la posición de los electrones

La hidrólisis del ATP proporciona la mayor parte de la energía libre que requieren
los procesos vivos

Tema 4: Carbohidratos
Monosacáridos​: Son aldehídos o cetonas polihidroxilados

Aldosas: monosacáridos con un grupo funcional aldehído

Cetosas​: Los que tienen un grupo ceto

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Triosas​: son los azucares mas pequeños, contienen 3 átomos de carbono

Los azucares de 4, 5 y 6 átomos se llaman ​tetrosas, pentosas y hexosas

Los monosacáridos mas abundantes en las células son las pentosas y las hexosas

Estereoisomeros: ​Un isómero que tiene la misma fórmula molecular y la misma


secuencia de átomos enlazados, con los mismos enlaces entre sus átomos, pero
difieren en la orientación tridimensional de sus átomos en el espacio.

Diastereoisomeros​: Estereoisomeros que no son enantiomeros ( isómeros


espectaculares)

Epimeros:​ Diastereoisomeros que se diferencian en la configuración de un único


átomo de carbono

Los azucares que contienen 4 o mas carbonos se encuentran principalmente en


formas cíclicas

Familia de las d-aldosas: foto al final y explicación en el video

Cuando el grupo aldehído o cetona y el grupo funcional alcohol son parte de la


misma molécula se produce una reacción de ciclación intermolecular que puede
formar productos estables

Anomeros​: Los 2 diastereoisomeros posibles que pueden formarse durante la


reacción de ciclicacion

Los anillos hemiacetalicos de 5 miembros se denominan furanosas por su semejanza


estructural con el furano

Formulas conformacionales: ​Son representaciones mas exactas de la estructura


de los monosacáridos

Los monosacáridos experimentan la mayoría de las reacciones que son típicas de los
aldehídos, de las cetonas y de los alcoholes

Mutarotación​: Produce una mezcla de equilibrio de las formas a y b en las


estructuras de anillo de la furanosa y de la piranosa

Acido aldónico: ​La oxidación de un grupo aldehído

Acido uronico:​ La oxidación de un grupo terminal CH2OH ( pero no del grupo


aldehído)

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Acido aldarico:​ La oxidación del aldehído y del CH2OH


Azucares reductores: ​Azucares que pueden ser oxidados por agentes oxidantes
débiles como el reactivo de Benedict

Reducción​: la reducción de los grupos aldehído y cetona de los monosacáridos


produce los alcoholes azucares

Epimerización​: La conversión de glucosa en manosa

Los hemiacetales y hemicetales reaccionan con los alcoholes para formar el


correspondiente acetal o cetal

Enlace glucosidico: ​Cuando la forma cíclica hemiacetal o hemicetal del


monosacárido reaccionan con un alcohol​ ​y el compuesto se denomina glucosido

Si se forma un enlace acetal entre el grupo hidroxilo hemiacetal de un monosacárido


y el grupo hidroxilo de otro monosacárido, el glucósido que se forma se denomina
disacárido

Una molécula que contiene un gran numero de monosacáridos unidos por enlaces
glucosidicos se denomina polisacárido

Las reacciones de glucosilacion unen azucares o glucanos a proteínas o a lípidos

Aducto​: Producto de una reacción de adicción, es decir las reacciones de dos


moléculas para formar una tercera molécula

Monosacáridos importantes: ​glucosa, fructosa y galactosa

Derivados de los monosacáridos: ​Los azucares sencillos pueden convertirse en


compuesto relacionados desde el punto de vista químico
● Acidos uronicos, aminoazucares, desoxiazucares

Disacáridos​: son moléculas formadas por 2 monosacáridos unidos mediante un


enlace glucosidico

Lactosa​: disacárido que se encuentra en la leche, esta formado por una molécula de
galactosa unida por un grupo hidroxilo del carbono 1 con un enlace glucosidico

Celobiosa​: Un producto de degradación de la celulosa contiene 2 moléculas de


glucosa ligadas por un enlace B(1,4) glucosidico

Glucanos​: Estan formados por grandes cantidades de monosacáridos conectados


por enlaces glucosidicos

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Oligosacaridos​: Son polímeros que contienen hasta unos 10 o 15 monómeros y que


con mayor frecuencia se encuentran unidos a polipetidos
Homoglucanos: ​Formados por un solo tipo de monosacárido
● Los homoglucanos que abundan en la naturaleza son el almidón, el
glucógeno, la celulosa y la quintina

Heteroglucanos: ​Que contienen 2 o mas tipos de monosacáridos


● Contiene mas de una clase de monosacárido
● La principales que se encuentran en los mamíferos son heteropolisacaridos
con enlaces N y con enlaces O

Almidon: ​Es una fuente significativa de carbohidratos en la alimentación humana

Amilosa​: Esta formada por cadenas largas sin ramificar de residuos de D-glucosa
unidos por enlaces glucosídicos

Amilopectina: ​Es un polímero ramificado que contiene enlaces glucosidicos a(1,4) y


a(1,6)

Glucógeno​: Es el carbohidrato de almacenamiento de enrgia de los vertebrados

Celulosa​: Polimero formado por residuos de D-glucopiranosa unidos por enlaces


B(1,4) glucosidicos

Glucosaminoglucanos​: son polímeros lineales con unidades repetitivas de


disacáridos

Proteoglucanos​: Se distinguen de las glucoproteinas mas comunes por su


contenido muy elevado de carbohidratos, pueden constituir hasta 95% del peso
seco

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