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Compuestos de carbono:
El carbono es el decimoquinto elemento más abundante en la tierra. La diversidad de
compuestos de carbono se explica por las propiedades del elemento.
Los átomos de carbono forman enlaces covalentes con otros átomos: las moléculas que
tienen carbono pueden tener estructuras muy complejas. Se producen moléculas estables
con base de carbono muy complejas porque los enlaces covalentes son los más fuertes que
existen y cada átomo de carbono puede formar hasta 4 enlaces covalentes.
Los enlaces pueden ser con otros átomos de carbono para formar estructuras anulares o
cadenas de diversas longitudes (ácido grasos: cadenas de hasta 20 átomos de C). Pueden
formar enlaces con otros elementos: H, O, N o P.
Los átomos de C pueden formar enlaces con un solo elemento (H ⇒ CH4, metano) o varios
elementos, como en el etanol. Los cuatro enlaces pueden ser simples o puede haber dos
simples y uno doble (grupo carboxilo del ácido acético).
2.2 Agua
Metano y agua:
Fórmula CH4 H2 O
Masa molecular 16 18
Condensación e hidrólisis.
1. Monosacáridos, disacáridos y polisacáridos: los monosacáridos se combinan
mediante la condensación. Implica la pérdida de un -OH de una molécula y un -H de
otra (forman un H2 O). Al combinarse dos monosacáridos forman un disacárido y, al
combinarse más de dos monosacáridos forman un polisacárido. Esta unión es un
proceso anabólico (requiere energía). El ATP provee la energía. La hidrólisis es el
proceso inverso: se utiliza un H2 O para separar polisacáridos o disacárido a y
obtener monosacáridos. El proceso no requiere energía.
2. Ácidos grasos, glicerol y triglicéridos: los triglicéridos se forman a partir de tres
ácidos grasos y una molécula de glicerol. Cada uno de los ácidos grasos se une a la
molécula de glicerol por condensación y se liberan tres moléculas de H2 O. Entre
cada ácido graso y la molécula de glicerol se forma un enlace éster (un ácido
reacciona con el grupo -OH de un alcohol). En este caso, reacciona el grupo -COOH
de un ácido graso y un grupo -OH del glicerol. En la hidrólisis, intervienen 3
moléculas de H2 O para transformar a un triglicérido en tres ácidos grasos y un
glicerol.
3. Aminoácidos y polipéptidos: los polipéptidos son cadenas de aminoácidos unidad
mediante reacciones de condensación. En estas, participan el grupo amino (-NH2 )
de un aminoácido y el grupo carboxilo (-COOH) del otro. Se elimina agua y se forma
un nuevo enlace entre los aminoácidos (enlace peptídico). Un dipéptido es una
molécula de dos aminoácidos con un enlace peptídico. Un polipéptido consta de
muchos aminoácidos. En la hidrólisis, interviene una molécula de H2 O para
transformar a un dipéptido en dos aminoácidos.
Ácidos grasos insaturados: poseen uno o más dobles enlaces de carbono y contienen
menos de la cantidad posible de H. Los átomos de H están casi siempre en el mismo lado
que los dos átomos de carbonos que tienen enlaces dobles: a estos se los denomina ácidos
grasos cis. La alternativa es que los H estén en lados opuestos: a estos se los llama ácidos
grasos trans. (Estructura pág. 89)
● Cis: la cadena hidrocarbonada se curva en el enlace doble. Por esto, los triglicéridos
que los contienen se organizan peor juntos en matrices regulares que los ácido
grasos saturados (baja el punto de fusión). Los triglicéridos con ácidos grasos cis
son líquidos a temperatura ambiente (aceite).
● Trans: la cadena hidrocarbonada no se curva en el enlace doble, tienen un punto de
fusión más alto y son sólidos a temperatura ambiente. Se producen artificialmente
mediante la hidrogenación parcial de aceites vegetales o pescados. Da lugar a
grasas sólidas utilizadas en margarina y otros alimentos procesados.
Índice de Masa Corporal (IMC): fue desarrollado por un estadístico belga (Adolphe
Quetelet). Se necesitan dos medidas para calcularlo: la masa en kilogramos y la altura en
metros.
IMC Estado
En algunas partes no hay suficiente alimento y muchas personas tienen un peso bajo. En
otras partes, una causa más probable de peso insuficiente es la anorexia nerviosa
(enfermedad psicológica que conlleva pasar hambre voluntariamente y pérdida de masa
corporal).
La obesidad es un problema cada vez mayor en algunos países. La ingesta excesiva de
algunos alimentos y el ejercicio insuficiente causan acumulación de grasa en el tejido
adiposo. La cantidad de grasa corporal puede estimarse usando unas pinzas de pliegues
cutáneos.
La obesidad aumenta el riesgo de enfermedades cardíacas coronarias y diabetes II. Reduce
la esperanza de vida y aumenta los costos generales de los sistemas de salud.
Enfermedades nutricionales:
Enfermedades cardíacas coronarias ⇒ depósitos grasos bloquean parcialmente las
arterias coronarias dando lugar a la formación de coágulos sanguíneos e infartos. En
muchos programas de investigación se ha hallado una correlación positiva entre la ingesta
de ácidos grasos saturados y los índices de enfermedad cardíaca coronaria (no prueba que
las grasas saturadas causan la enfermedad). Las bajas cantidades de fibra en una dieta
podrían ser la causa (correlacionado con el consumo de grasas saturadas).
Los masáis de Kenia no encajan en esta correlación: tienen una dieta rica en carne, grasa,
sangre y leche (alto consumo de grasas saturadas). Sin embargo, la enfermedad cardíaca
coronaria es casi desconocida.
Las dietas ricas en aceite de oliva (ácidos grasos monoinsaturados cis) son tradicionales en
países del Mediterráneo ⇒ suelen tener bajos índices de enfermedad cardíaca coronaria y
se sugirió que esto es debido a la ingesta de ácidos grasos monoinsaturados cis. Aunque
los factores genéticos o la ingesta de algunos alimentos (tomate) podrían explicar estos
índices.
Hay una correlación positiva entre los índices de enfermedad cardíaca coronaria y la
cantidad de grasas trans consumidas. Lo más probable es que las grasas trans causen
enfermedades coronarias. En pacientes que murieron de enfermedad coronaria se
encontraron depósitos grasos en las arterias enfermas con alto contenido de grasas trans.
Desnaturalización de proteínas:
La estructura tridimensional de las proteínas se establece con la débil unión entre los
grupos R de los aminoácidos, por esto pueden interrumpirse o romperse lo que provoca la
desnaturalización de la proteína. Esta es permanente. Las proteínas solubles al
desnaturalizarse suelen convertirse en insoluble, pues quedan expuestos al agua grupos R
hidrofóbicos. El calor produce vibraciones dentro de la molecula que pueden romper
enlaces o interacciones intramoleculares. La el ADN polimerasa del procariota Thermus
aquaticus, funciona a 80 C. (Generalmente el calor desnaturaliza a temperaturas mucho
más bajas).
Los pH extremos alcalinos o ácidos pueden provocar desnaturalización ya que cambian las
cargas de los grupos R y se rompen los enlaces iónicos dando lugar a nuevos, alterando la
estructura tridimensional de las proteínas (pasan de líquidas a sólidas). La excepción por
ejemplo, son las del estómago como la enzima pepsina (digestión de proteínas en el
estómago), que tienen un pH óptimo de 1,5 y no se desnaturaliza en un pH ácido extremo.
La albúmina (proteína de la clara del huevo) cambia de transparente a blanco al aumentar
su temperatura. Igualmente podemos aprovechar sus aminoácidos al consumirla pese a que
esté desnaturalizada
2.5 Enzimas
Enzimas: son proteínas globulares que actúan como catalizadores (aceleran las reacciones
químicas sin sufrir cambios).
Enzimas como catalizadores biológicos ⇒ son producidas por células vivas y aceleran
reacciones bioquímicas.
Sustrato: sustancias que las enzimas convierten en productos.
Ecuación general para una reacción enzimática: Sustrato ⇒ (enzima) ⇒ producto
Las enzimas se encuentran en todas las células vivas y también son secretadas por algunas
células para realizar funciones en el exterior. Los organismos producen miles de enzimas
diferentes y cada una actúa en una reacción bioquímica diferente.
Especificidad de enzima-sustrato: en la miles de reacciones que ocurren en el organismo
actúa una enzima específica. Esta propiedad constituye una diferencia entre las enzimas y
los catalizadores no biológicos.
Sitio activo: área especial en la superficie de la enzima que tiene una forma y propiedades
químicas específicas que encajan perfectamente con el sustrato. Esto permite al sustrato
unirse al sitio activo pero no a otras sustancias.
Acción de la enzima:
1. El sustrato se une al sitio activo. Algunas enzimas tienen dos sustratos que se unen
en diferentes partes del sitio activo.
2. Los sustratos se convierten en productos mientras están unidos al sitio activo
3. Los productos son liberados (el sitio activo queda libre para otros sustratos)
pH: la escala del pH se utiliza para medir la acidez (bajo pH) o alcalinidad (alto pH) de una
solución. Reducir el pH en una unidad hace que la solución sea diez veces más acida. Las
soluciones con pH 7 son neutras; con pH 6 es ligeramente ácida, con pH 5 es diez veces
más acida que con pH 6 y con pH 4 es cien veces más acida que con pH 6.
● Acidez: debido a la presencia de iones de H: cuanto más bajo es el pH, más alta es
la concentración de iones de H.
La mayoría de las enzimas tienen un pH óptimo donde su actividad es máxima. Si se
produce un aumento o disminución con respecto al pH óptimo, la actividad enzimática se
reduce y finalmente se interrumpe por completo. Cuando la concentración de iones de H es
mayor o menor que el nivel en el que la enzima actúa naturalmente, se altera su estructura
y su sitio activo. Si se supera un cierto pH, la estructura cambia irreversiblemente
(desnaturalización).
No todas las enzimas tienen el mismo pH óptimo. Por ejemplo, la proteasa segregada por
Bacillus licheniformis tiene un pH óptimo entre 9 y 10 (se cultiva para obtener dicha
proteasa resistente a la alcalinidad: uso en detergentes biológicos).
Enzimas inmovilizadas
1897 ⇒ los hermanos Hans y Eduard Buchner demostraron que un extracto de levadura
(sin células de levadura) era capaz de convertir la sacarosa en alcohol ⇒ abrió la puerta a
la catalización de procesos químicos fuera de las células vivas. Estos resultados aportaron
a la refutación del vitalismo (Louis Pasteur).
Hoy en día más de 500 enzimas tienen usos comerciales. En general, están inmovilizadas.
Enzimas inmovilizadas: las enzimas están unidas a otro material o forman agregados para
restringir su movimiento. Puede hacerse de muchas maneras: acoplando enzimas a una
superficie de vidrio, atrapándolas en gel de alginato o uniéndolas entre sí.
Ventajas:
● La enzima se puede separar fácilmente de los productos de la reacción (evita la
contaminación del producto)
● Después de separar la enzima de la mezcla de la reacción, la enzima puede
reciclarse (ahorro ⇒ muchas enzimas son caras)
● Aumenta la estabilidad de las enzimas ante cambios de temperatura y pH
● Los sustratos pueden exponerse a concentraciones enzimática a más altas (acelera
las tasas de reacción)
Leche sin lactosa: la lactosa es el azúcar que está presente naturalmente en la leche. Se
puede transformar en glucosa y galactosa por la enzima lactasa
Lactosa ⇒ glucosa + galactosa
La lactasa se obtiene a partir de Kluveromyces lactis (levadura que crece naturalmente en la
leche). Las empresas de biotecnología cultivan la levadura, le extraen la lactasa y la
purifican para venderla a empresas fabricadoras de alimentos. Razones para el uso de
lactasa:
● Los intolerantes a la lactosa no pueden beber más de 250 ml de leche al día, a
menos que venga en cantidades reducidas de lactosa.
● La glucosa y la galactosa son más dulces que la lactosa (se debe añadir menos
azúcar a los alimentos dulces con leche: batidos de leche o yogures de fruta).
● La lactosa tiende a cristalizarse en la producción del helado (textura arenosa). La
glucosa y la galactosa son más solubles y permanecen disueltas (textura cremosa).
● Las bacterias fermentan la glucosa y la galactosa más rápidamente que la lactosa (la
producción de yogur y queso fresco es más rápida).
2.7 Replicación, transcripción y traducción del ADN (ver carpeta para dibujos)
Replicación.
Cuando la célula prepara su división, las 2 cadenas que forman la hélice se separan gracias
a la acción de la helicasa y cada una sirve de modelo (determina la secuencia de bases)
para una nueva cadena, que se forma gracias al apareamiento de bases. La helicasa (6
polipéptidos globulares organizados en forma de rosquilla) es una enzima que con
utilización de ATP desenrolla la hélice y rompe las uniones puente de hidrógeno entre las
bases complementarias. Lo que hace es acoplarse de modo que una de las cadenas quede
en el centro de la rosquilla y la otra por fuera, y con la utilización de ATP se desplaza a lo
largo de la molécula haciendo su trabajo.
Cuando las dos cadenas ya están separadas la enzima ADN polimerasa forma las 2
cadenas nuevas desplazándose por la vieja (modelo) y añadiendo nucleótidos que están
libres en el área de replicación dependiendo de la base que se necesite para el
apareamiento de bases. Una vez formada la unión puente de hidrógeno entre la base vieja y
la nueva, el nucleótido se une a la nueva cadena mediante un enlace covalente entre su
extremo 5’ (grupo fosfato) y el extremo 3’ (azúcar pentosa) del nucleótido ya existente al
final de la nueva cadena. Durante este proceso se cometen muy pocos errores, por esto
tiene alto grado de fidelidad.
La replicación es semiconservativa porque las 2 moléculas de ADN quedan formadas por
una cadena nueva y otra vieja.
2.7.4/12 (dibujo en carpeta)
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR): es una técnica utilizada para hacer muchas
copias de una determinada secuencia de ADN . Se necesita una cantidad muy pequeña de
ADN para empezar. Se introduce el ADN en una máquina de PCR en la que se duplica
repetidamente el ADN seleccionado. Proceso: separar las dos cadenas del ADN en uno de
los pasos y combinar ambas cadenas para formar ADN bicatenario.
Las cadenas se mantienen unidas por puentes de H (interacciones débiles). En una
molécula de ADN hay una gran cantidad de ellos y consiguen mantener las cadenas unidas
a temperaturas normales. Si el ADN alcanza una temperatura alta, los puentes de H se
rompen y las cadenas se separan. Si se vuelve a enfriar el ADN, pueden formarse puentes
de H que vuelven a emparejar las cadenas ⇒ proceso conocido como realineamiento.
Máquina de PCR:
1- Separa las cadenas de ADN calentándolas a 95° durante 15 segundos
2- Enfría el ADN rápidamente hasta 54°
Normalmente, 1 y 2 darían lugar a un realineamiento de las cadenas originales para formar
ADN bicatenario. Sin embargo, hay presente un exceso de secciones cortas de ADN
monocatenario llamadas iniciadores o cebadores. Estos se unen rápidamente a secuencias
complementarias y evitan el realineamiento de las cadenas originales. Se inicia la copia de
cada cadena original a partir de los cebadores.
3- Sintetiza ADN bicatenario a partir de las cadenas individuales con cebadores: utiliza la
enzima Taq ADN polimerasa (se obtiene de la Thermus aquaticus: organismo termófilo
cuyas enzimas están adaptadas a temperaturas entre 50°C y 80°C y se mantienen estables,
resistiendo la desnaturalización). Esta enzima es capaz de resistir el periodo a 95°C en el
que se separan las cadenas de ADN.
También funcionaría a 54°C pero su temperatura óptima es de 72°C ⇒ se calienta la mezcla
a esta temperatura cuando está actuando la Taq ADN polimerasa. A esta temperatura se
añaden unos 1000 nucleótidos por minuto.
Cuando se completa la replicación de la secuencia de bases seleccionada, se inicia un
nuevo ciclo. Se puede completar un ciclo de PCR en menos de dos minutos. Treinta ciclos
(multiplican el ADN por 1000 millones) tardan menos de una hora.
2.8.4
Ejemplos:
● Respiración anaeróbica (producto: lactato): seres humanos
● Respiración anaeróbica (producto: etanol + CO2): levadura
● Respiración aeróbica: rata del desierto ⇒ además, no necesita beber ya que la
respiración le proporciona todo el agua que necesita.
2.9 Fotosíntesis
Clorofila:
Al ser un pigmento (proteína) absorbe luz solar (1er etapa de la fotosíntesis), y es el
principal en la fotosíntesis. A todos los tipos de clorofila los percibimos verdes, pues
absorben muy eficazmente las ondas rojas y azules muy eficazmente, y no tan eficazmente
la verde, por esto en lugar de absorberla, la reflejan dándole el color verde a la mayoría
plantas del ecosistema. (Absorben todas las luces menos la de su color)
● Clorofila A: es la más común y absorbe ondas de una longitud de 450 nm.
● Clorofila B: absorbe ondas de 680 nm.
● Beta caroteno: tiene dos picos de absorción 400 y 500 nm (es el de la zanahoria)
Fotólisis:
En la fotólisis del agua se descompone el agua para liberar electrones, esta etapa es
dependiente de luz que excita los electrones de los pigmentos. Cuando los electrones
vuelven a su estado normal, se utiliza la energía cinética para romper la molécula de agua.
El oxígeno es liberado por la planta como desecho. 2H2O⇒ 4e- +4H+ +O2. Los H+ (protones)
se utilizan para formar ATP y NADH reducido, energía utilizada para la condensación del
CO2 en una molécula orgánica de mayor tamaño. El O se libera por los estomas, cuya
apertura depende de la presión osmótica producida por el balance de iones de K que
cierran los estomas.
Factores limitantes:
La temperatura, la intensidad lumínica y la concentración de dióxido de carbono pueden
limitar la tasa de la fotosíntesis, si está por debajo de su nivel óptimo, y se lo llama factor
limitante. Solo puede haber un factor limitante y es el que esté más alejado de su nivel
óptimo. Esto puede variar continuamente, por ejemplo a la noche el factor limitante es la
intensidad lumínica, pero cuando sale el sol la temperatura puede convertirse en el factor
limitante, pero al aumentar en el transcurso de la mañana, la concentración de CO2 se
puede convertir en limitante.