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Copyright © 2017 GN Hartmeyer et al. Este es un artículo de acceso abierto distribuido bajo la licencia de atribución de Creative Commons, que permite el uso,
distribución y reproducción sin restricciones en cualquier medio, siempre que el trabajo original se cite correctamente.
La microscopía de muestras de heces es una técnica inexacta y laboriosa para la detección de parásitos intestinales que causan diarrea y el reemplazo por PCR es atractivo.
Casi todos los casos de diarrea inducida por parásitos durante un período de nueve años en nuestro laboratorio se debieron a Giardia lamblia, Cryptosporidium especie, o Entamoeba
histolytica detectado por microscopía. Evaluamos y seleccionamos ensayos internos de PCR en tiempo real (RT-PCR) singleplex para estos patógenos en 99 muestras de
heces de pacientes sospechosos de tener parasitosis intestinal analizadas por microscopía. La estrategia incluyó un ensayo de PCR específico de género para C. parvum y C.
hominis, con posterior identificación mediante una PCR que distingue entre las dos especies. G. lamblia se detectó en cinco y C. parvum en una de 68 muestras microscópicas
negativas. El rendimiento de los ensayos de RT-PCR internos se comparó con tres sistemas de kits de prueba multiplex (MT-PCR) disponibles comercialmente en 81 muestras
de heces, recolectadas en 28 muestras microscópicas positivas y 27 microscópicas negativas de individuos sospechosos de parasitosis intestinal y en 26 muestras de
individuos sin sospecha de infección parasitaria. Los ensayos internos detectaron parásitos en más muestras de pacientes sospechosos de tener parasitosis que cualquiera de
los kits. Concluimos que los kits comerciales están dirigidos a parásitos relevantes, pero su rendimiento puede variar.
patógenos parasitarios intestinales. Por último, la realización de tres ensayos de como RT-PCR singleplex en 99 muestras analizadas como duplicado. Se probó
RT-PCR internos seleccionados para la detección de un ensayo para la detección de G. lamblia, tres fueron probados para C. parvum
Giardia lamblia, Cryptosporidium parvum / Cryptosporidium hominis, y Entamoeba
/ C. hominis, y se incluyó un ensayo (ensayo 3) para distinguir entre C. parvum y C.
histolytica fue comparado con los de hominis.
tres kits comerciales de PCR en tiempo real multiplex (MT-PCR). Finalmente un ensayo para E. histolytica fue probado, utilizando cebadores y sondas
Se definieron dos objetivos específicos: (1) evaluación del rendimiento de los (Tabla 1) descritas anteriormente [1, 4, 13-16].
ensayos internos de RT-PCR específicos de la especie Los 25 • La mezcla de reacciones contenía 1x TaqMan Fast Universal
para la detección de G. lamblia, C. parvum / C. hominis, y MI. PCRMasterMix, 2xNoAmpErase UNG (Thermo Fisher Scientific, Waltham,
histolytica en muestras de heces enviadas para examen de parásitos; (2) MA, EE. UU.), 1000 nM de los cebadores y 200 nM de las sondas y 5 • l
comparación del rendimiento de los ensayos de RT-PCR internos con el Eluido de ADN.
rendimiento de tres kits comerciales de MT-PCR para la detección de los La PCR en tiempo real se realizó utilizando un termociclador de PCR en tiempo real
mismos parásitos. rápido 7500 de Applied Biosystems (Thermo Fisher Scientific) con las siguientes
condiciones de ciclo: 95 ∘ C durante 20 segundos, seguido de 45 ciclos de 95 ∘ C durante 3
2.1. Recolección de datos del sistema de información del laboratorio Los productos de la PCR se analizaron utilizando el software de detección de
(LIS). Los datos de las muestras fecales examinadas en busca de parásitos secuencias v.1.4 (Thermo Fisher Scientific). Se estableció un umbral de ciclo manual
desde octubre de 2005 hasta enero de 2015 se extrajeron del LIS electrónico. Se en 0,1 con una línea de base automática. La muestra se consideró positiva si el
registró el número total de muestras y pacientes y resultados de microscopía. valor Ct era ≤ 42 y tenía una curva exponencial. Los controles de extracción y PCR
negativos y positivos se incluyeron en todos los análisis de PCR.
2.2. Muestras de heces. En total, 125 muestras de heces, de las cuales 99 Los ensayos de RT-PCR internos de singleplex para G. lamblia, C.
fueron examinadas por microscopía por sospecha de parasitosis, fueron parvum / C. hominis ensayo 1), y E. histolytica eran colectivos
recolectadas al azar de individuos con molestias gastrointestinales entre junio llamado kit A y en comparación con tres kits comerciales de MT-PCR, utilizados en el
de 2010 y enero de 2015. Noventa y nueve de estas muestras se incluyeron objetivo 2 en 79 muestras.
para el objetivo uno (31 microscopía- positivos y 68 microscopios negativos) y
ochenta y uno (28 microscopios positivos y 27 microscopios negativos) se 2.5. Kits de prueba de diagnóstico. Se probaron tres kits comerciales
incluyeron para el objetivo de prueba dos. Además se incluyeron 26 muestras diferentes disponibles en el mercado: RIDA GENE Parasitic Stool Panel
de individuos sin sospecha de parasitosis sin microscopía para el objetivo (PG1705) de R-Biopharm AG, Darmstadt, Alemania (kit B), LightMix
dos. Modular Gastroenteritis Assays de TIB MOLBIOL, Berlín, Alemania (kit C),
y BD MAX Enteric Parasite Panel de BD Diagnostic, Franklin Lakes, NJ,
Para el objetivo 1, se analizaron un total de 99 muestras mediante RT-PCR EE. UU. (Kit D). La extracción de ADN para los kits B y C se realizó como
interna. Para el objetivo 2, se analizaron un total de 81 muestras mediante RT-PCR se describe para los ensayos internos. Para el kit D, la extracción de ADN
interna y mediante tres kits comerciales de MT-PCR. Todas las muestras se se realizó de acuerdo con las instrucciones del panel de parásitos entéricos
mantuvieron en - 80 ∘ C hasta que se realizó la PCR. BD MAX en el sistema BDMAX. En todos los kits comerciales, utilizamos el
ADN de control interno, que se recomendó e incluyó en los kits. Se
analizaron setenta y nueve muestras por duplicado en los tres kits, de
2.3. Microscopía para parásitos intestinales. Examen microscópico acuerdo con las instrucciones del fabricante. ∘ C, seguido de 45 ciclos de 95 ∘ C
La determinación de la presencia de óvulos y quistes se realizó de forma rutinaria durante 15 segundos y 60 ∘ C durante 30 segundos. Para el kit C, los
mediante el examen de preparaciones de montaje en húmedo teñidas con yodo después ensayos de PCR se realizaron en un instrumento Roche LightCycler 480 II
de la concentración de formalina-acetato de etilo, a un aumento de × 400 [11]. Bajo en tiempo real con las siguientes condiciones de ciclo: 10 min a 95ºC. ∘ C,
pedido específico y cuando seguido de 50 ciclos de 95 ∘ C durante 5 segundos, 62 ∘ C durante 5
Cryptosporidium especies, Cyclospora especie, o Cystoisospora segundos y 72 ∘ C durante 15 segundos. Para el kit D, el análisis se realizó
Se sospechó la especie por microscopía de rutina y también se examinó un de acuerdo con las instrucciones del panel de parásitos entéricos BD MAX
frotis teñido con la técnica de Ziehl-Neelsen modificada [12]. en el sistema BD MAX. Un resultado positivo en los kits se consideró
positivo, si uno de cada dos duplicados era positivo, utilizado en el objetivo
2.
2.4. RT-PCR interna. Para los ensayos de PCR internos, el ADN se extrajo
utilizando el sistema NucliSENS easyMAG (bi- oMérieux, Francia) de acuerdo
con las instrucciones del fabricante. Antes de la extracción de ADN, se
sumergió un hisopo de algodón en la muestra de heces y se suspendió en 4
ml de solución fisiológica de NaCl. Se añadió a cada muestra una extracción
interna y un control de PCR, focina herpesvirus (cepa de laboratorio PhHV) 2.6. Análisis. Se utilizó la prueba de McNemar para la comparación estadística de los
antes de la extracción de ADN [13]. Los ácidos nucleicos se eluyeron en 100 • ly datos apareados en el objetivo 1.
procesado para PCR inmediatamente.
2.7. Ética, Biobanco y Almacenamiento de Datos. El estudio es parte de un
Doctor. proyecto y aprobado por la Agencia Danesa de Protección de Datos (j.nr.
Detección de los tres parásitos intestinales ( G. lamblia, 2008-58-0035). Todas las muestras se almacenaron en
C. parvum / C. hominis, y E. histolytica) fue realizado - 80 ∘ C en un biobanco de investigación aprobado establecido para el
Revista de investigación de parasitología
Tabla 1: Cebador y sondas utilizados para ensayos de PCR en tiempo real internos en estudio.
GAA CTG TAC AGA TGC TTG GGA GAA T CCTT CGT
TAG TTG AAT CCT CTT TCC A TTG GAG CTC ATA TCA
C. parvum / C. hominis G Yang y col.
Gen codificador de proteínas específicas
(ensayo 3) C. hominis Investigacion (2013) [15]
CTT GGA GCT CGT ATC AG
C. parvum Investigacion
Verweij y col.
ATT GTC GTG GCA TCC TAA CTC A GCG GAC
(2004) [1]
Entamoeba histolytica GGC TCA TTA TAA CA CAT TGA ATG AAT TGG ssu-rRNA
Stensvold y col.
CCA TT
(2010) [16]
Control interno
GGG CGA ATC ACA GAT TGA ATC GCG GTT
Herpesvirus focino Niesters
CCA AAC GTA CCA A Glicoproteína B
(PhHV) (2001) [13]
TTT TTA TGT GTC CGC CAC CAT CTG GAT C
3
4 Revista de investigación de parasitología
Giardia Cryptosporidium
Muestra
Mic. Equipo Equipo Equipo Equipo Equipo Equipo Equipo Equipo
número
UN segundo C re UN segundo C re
Total positivo 9 6 7 5 4 3 3 5
Mic = microscopía; undet = no detectado; + = positivo; 0 = negativo. Los resultados de las pruebas duplicadas se muestran como + / +, + / 0, y 0/0. Los resultados discordantes están en negrita. Kit A = ensayos internos de
RT-PCR, kit B = Panel de heces parasitarias RIDA GENE (PG1705), kit C = Ensayos de gastroenteritis modular LightMix y kit D = Panel de parásitos entéricos BDMAX.
estudiar. Los datos se almacenaron en un portal seguro y aprobado perteneciente a y en 5 muestras microscópicas negativas. Los tres ensayos de RT-PCR probados
la Región del Sur de Dinamarca. para C. parvum / C. hominis fueron positivos en diez de las once muestras
microscópicas positivas, así como en una muestra microscópica negativa. Los
De todas las muestras analizadas, se obtuvieron resultados discordantes a partir de negativos en la RT-PCR interna y posteriormente se identificaron como E.
determinaciones duplicadas en una muestra utilizando ensayos internos (kit A), dos utilizando dispar.
el kit B, dos utilizando el kit C y tres utilizando el kit D (Tabla 2). La comparación de cuatro kits de prueba, incluido el kit A basado en ensayos internos,
mostró resultados variables de las pruebas repetidas. Las pruebas en determinaciones
Ninguno de los kits de MT-PCR confirmó la presencia de GRAMO. únicas pueden dar lugar a resultados falsos en una minoría de casos. El uso futuro de estos
lamblia en las muestras números 32 y 33, que fueron positivas en dos de dos y una ensayos puede mejorarse realizando pruebas por duplicado.
de dos réplicas, respectivamente, mediante la RT-PCR interna. Estas dos
muestras eran del mismo paciente. Una muestra tres días después dio positivo La limitación de este estudio fue, en primer lugar, el tamaño de la muestra,
cuando se analizó en el Laboratorio Nacional de Referencia del Statens Serum que no permite el análisis estadístico de las diferencias en el rendimiento de los
Institut. Por lo tanto, los números de muestra 32 y 33 se consideraron verdaderos ensayos internos de microscopía y RT-PCR. Se observaron tendencias a favor de
positivos pero débiles. los ensayos internos al comparar la variación de réplicas y sensibilidades con los
kits de prueba comerciales.
La muestra número 86 (no se muestra en la Tabla 2) solo se probó en los kits
A, B y D y, por lo tanto, no se incluyó en el número total. En esta muestra, el kit B Como lo indica el número de casos de parasitosis intestinal registrados en
fue positivo para ambos G. lamblia nuestro LIS a lo largo de los años, la recolección de un mayor número de muestras
y E. histolytica, en uno de cada dos duplicados. Esto no fue confirmado por ninguno llevará tiempo. La detección de parásitos en muestras microscópicas negativas
de los otros kits de prueba. sugiere que el reemplazo de la microscopía por PCR aumentará las tasas positivas y,
La inhibición por los componentes fecales no fue un problema en este estudio, por lo tanto, acortará el tiempo necesario para establecer grandes colecciones de
como se informó anteriormente [17]. muestras.
4. Discusión
5. Conclusión
En este estudio, hemos evaluado ensayos de PCR para el reemplazo de la microscopía
para la detección de rutina de parásitos causantes de diarrea. Por el contrario, la PCR En nuestro entorno es relevante realizar pruebas G. lamblia, C. parvum / C.
de tomicroscopía solo detecta parásitos específicos. Por tanto, es obligatoria una hominis, y E. histolytica. Esperamos que el reemplazo de la microscopía con
selección cuidadosa de los objetivos para los ensayos de PCR. También es importante ensayos internos de RT-PCR para estos parásitos resulte en tasas positivas más
saber qué parásitos causantes de diarrea presentes en la población no son el objetivo altas para G. lamblia y
de los ensayos de PCR seleccionados y el número de pacientes afectados por la C. parvum / C. hominis, mientras que los resultados falsos positivos para E.
exclusión de los ensayos para parásitos raros particulares [18, 19]. histolytica será evitado. Adición de una prueba secundaria que diferencia entre C.
parvum y C. hominis será útil para el descubrimiento temprano de brotes.
Basándonos en las frecuencias previas de detección por microscopía y la gravedad de Todos los kits comerciales de MT-PCR evaluados aquí probaron los objetivos
la enfermedad, decidimos establecer ensayos de PCR. relevantes. Sin embargo, se observó alguna variación en el rendimiento al usar los kits. La
para G. lamblia, C. parvum / C. hominis, y E. histolytica. los elección del método para la detección de protozoos intestinales puede depender del
sólo se detectó el parásito causante de diarrea previamente detectado y no dirigido entorno. En comparación con la PCR, la microscopía es menos sensible y menos
por los ensayos de PCR Cyclospora spp. con un poco más de un caso en promedio específica, requiere más tiempo y depende más de las habilidades individuales. El uso de
cada año. kits de PCR comerciales puede resultar atractivo en los laboratorios que manipulan un
Los tres ensayos diferentes para C. parvum / C. hominis número moderado de muestras, mientras que los ensayos de PCR internos pueden
se realizó igualmente, pero el ensayo 1 dio como resultado los valores de CT más bajos y establecerse y mantenerse para análisis de rendimiento a gran escala, principalmente
se utilizó para el objetivo 2. El ensayo 3 distinguió entre debido a costos más bajos.
C. hominis y C. parvum y se utilizó para la posterior identificación de especies en
muestras positivas. La identificación rápida de especies es valiosa para las
investigaciones epidemiológicas. Divulgar
Los ensayos internos de RT-PCR detectados G. lamblia y
Cryptosporidium spp. en muestras microscópicas negativas de pacientes Los patrocinadores no tuvieron ningún papel en el diseño del estudio, la recopilación, el
sospechosos de padecer parasitosis intestinal y, por tanto, parecían más sensibles análisis y la interpretación de los datos.
que la microscopía. Se ha informado anteriormente que la PCR es más sensible
que la microscopía para la detección de parásitos específicos. En el estudio de ten Conflictos de interés
Hove en
2007, la PCR mostró un 3,6% más de sensibilidad que la microscopía para Giardia en Los autores declaran no tener conflictos de intereses.
muestras de heces clínicas [3], y, en el estudio Starks en 2011, la PCR tuvo un
2,9% más de sensibilidad para Giardia y 2% mejor sensibilidad para Cryptosporidium Expresiones de gratitud
que la microscopía [5]. Encontramos que la PCR detectó un 4,1% más Giardia que
la microscopía, pero no encontró ninguna diferencia para Cryptosporidium en este El estudio es parte de un doctorado. proyecto y apoyado por una subvención
estudio. Una gran ventaja de la PCR sobre la microscopía es la especificidad de las siguientes organizaciones danesas: AP Møller Foundation for the
obtenida de la discriminación entre E. histolytica y E. dispar [ 7-10]. Siete de las ocho Advancement of Medical Science, "Fonden for Læge Else Poulsens
muestras informadas originalmente con E. histolytica por microscopía fueron Mindelegat", Beckett-Fonden, Region Syddanmarks y Region Sjællands
Fælles Forskningspulje, Universidad del Sur de Dinamarca, y la Departamento
para
6 Revista de investigación de parasitología
Microbiología Clínica en el Hospital Universitario de Odense. Los autores [11] AV Allen y DS Ridley, “Observaciones adicionales sobre el
agradecen al personal de laboratorio de las Secciones de Parasitología en el técnica de concentración de formol-éter para parásitos fecales. ”
Departamento de Microbiología Clínica del Hospital Universitario de Odense, Revista de patología clínica, vol. 23, no. 6, págs. 545-546, 1970.
Odense, Dinamarca, por su ayuda en la recolección de muestras de heces y al [12] SA Henriksen y JF Pohlenz, “Tinción de criptosporidios
Departamento de Microbiología Clínica del Hospital Slagelse, Slagelse, mediante una técnica de Ziehl-Neelsen modificada " Acta veterinaria Scan- dinavica, vol. 22,
Dinamarca, para el uso de su sistema BD MAX, especialmente Tina Vasehus no. 3-4, págs. 594–596, 1981.
Madsen, Ph.D., para ayudar con las pruebas. También agradecen al Dr. Ming [13] HGM Niesters, “Cuantificación de la carga viral usando tiempo real
Chen del Departamento de Microbiología Clínica del Hospital de Jutlandia técnicas de amplificación " Métodos, vol. 25, no. 4, págs. 419–429,
2001.
Meridional, Sønderborg, Dinamarca, por la revisión crítica del artículo.
[14] M. Fontaine y E. Guillot, “Development of a TaqMan quanti-
ensayo de PCR tativo específico para Cryptosporidium parvum ”, Cartas de Microbiología
FEMS, vol. 214, no. 1, págs. 13-17, 2002.
detección de Entamoeba histolytica, Giardia lamblia, y Cryp tosporidium parvum en 135, no. 1, págs. 142-147, 2013.
muestras fecales mediante el uso de PCR multiplex en tiempo real " Revista de [16] CR Stensvold, M. Lebbad, JJ Verweij et al., “Identificación
microbiología clínica, vol. 42, no. 3, págs. 1220-1223, 2004. y delimitación de los miembros del complejo entamoeba mediante pirosecuenciación
", Sondas moleculares y celulares, vol. 24, no. 6, págs. 403–406, 2010.
PAGS
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