9-3-2023 DNA POLIMERASA

DNA POLIMERASA I

Zango Rodríguez Sergio

1º GRADO EN FARMACIA | FACULTAD DE FARMACIA
ÍNDICE

QUÉ SON LAS DNA POLIMERASAS Y REPLICACIÓN DE DNA ..................................................................... 2

¿QUÉ REACCIÓN PRODUCEN? .................................................................................................................. 2
CARACTERÍSTICAS DE LAS DNA POLIMERASAS ......................................................................................... 2
DNA POLIMERASA I: ESTRUCTURA Y FUNCIONES .................................................................................... 3
BIBLIOGRAFÍA ........................................................................................................................................... 3

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QUÉ SON LAS DNA POLIMERASAS Y REPLICACIÓN DE DNA

Las DNA polimerasas son una familia de enzimas que se encargan de regular determinadas acciones
durante el proceso de replicación del DNA. Su nombre establecido por la IUBMB es EC 2.7.7.7.
Pertenece al grupo de las transferasas (2), ya que transfiere grupos que contienen fósforo (7).
Específicamente pertenece al grupo de las nucleotidiltransferasas (7).

La replicación del DNA tiene por objetivo la síntesis de una cadena de DNA a partir de otra, emparejando
los desoxirribonucleótidos trifosfato o dNTP con los desoxirribonucleótidos complementarios que
corresponden con el DNA molde.

¿QUÉ REACCIÓN PRODUCE N?

La principal reacción que se produce es una

transferencia de un grupo fosfato en la que el
grupo 3’-OH actúa como nucleófilo en el extremo
3’ de la cadena que está desarrollándose.

Cataliza la extensión dirigida por plantilla de ADN

del extremo 3' de una hebra de ADN en un
nucleótido a la vez. No se puede iniciar una
cadena de novo. Requiere un cebador, que puede
ser ADN o ARN. Esto significa:

a 2′-desoxirribonucleósido 5′-trifosfato + ADN n =

difosfato + ADN n +1

CARACTERÍSTICAS DE LAS DNA POLIMERASAS

Característica Polimerasa I Polimerasa II Polimerasa III

Gen estructural polA polB polC
Peso molecular 103.000 90.000 130.000
Número de
400 100 10
moléculas/célula
Vmax (nucleótidos/segundo) 16-20 2-5 250-1.000
3’ exonucleasa Sí Sí No
5’ exonucleasa Sí No No
Procesividad 3-200 10.000 500.000
C
Fenotipo mutante UVSMMS Ninguno dnats
Reparación del
¿Reparación del DNA Elongación de la
Función biológica DNA, escisión del
SOS? cadena replicativa
RNA primer

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DNA POLIMERASA I: ESTRUCTURA Y FUNCIONES

Los sustratos que va a necesitar esta enzima son un DNA molde y un primer que puede ser DNA o RNA.
Esta molécula contiene tres lugares activos: uno polimerasa y dos exonucleasa.

La DNA polimerasa I se encarga de retirar el ARN cebador mediante su actividad exonucleótídica 5'P - 3'
OH y al mismo tiempo rellena el hueco sintetizando ADN.

Esta enzima, además de su actividad polimerasa, posee

también dos actividades nucleasa: la 3’ exonucleasa y la
5’ exonucleasa. La primera degrada DNA de una única
cadena a partir del extremo 3’, mientras que la segunda
degrada DNA con apareamiento de bases a partir del
extremo 5’.

La 3’ exonucleasa va a realizar una función de

“corrección de pruebas”, es decir, se encargará de
mejorar la exactitud con la que la cadena de DNA es
replicada. La 5’ exonucleasa participa en la replicación y
en la reparación del DNA.

Esta polimerasa se va a componer de dos fragmentos: el

fragmento C-terminal grande o de Klenow, y el
fragmento N-terminal pequeño. El grande contiene los
dominios polimerasa y 3’ exonucleasa, teniendo así el
pequeño el dominio 5’ exonucleasa. Para comprender
su estructura se va a comparar con la palma de una
mano (palma, pulgar y dedos). Imagen: Fragmento de Klenow de la DNA polimerasa I de E. coli.

Esta enzima, in vitro resulta ser muy lenta (20 nucleótidos por segundo aproximadamente), mientras
que in vivo, el crecimiento replicativo asciende hasta los 800 nucleótidos por segundo. Además, se ha
descubierto que el número de moléculas de enzima respecto del número de horquillas de replicación
por célula es muy superior, lo que nos hace pensar que esta función o funciones se pueden llevar a cabo
en otro lugar. Otra de sus características en la replicación es su capacidad de replicar únicamente en
sentido 5’ → 3’, aunque en la otra dirección también puede replicar, pero con más complicaciones. Otra
característica de esta enzima es que no es capaz de iniciar la síntesis de nuevas cadenas de DNA, pues
solo puede hacerlo a partir de extremos 3’ hidroxilo preexistentes.

Nuevas investigaciones de datos genéticos sugieren la existencia de otras polimerasas (DNA polimerasa
III, DNA polimerasa II, etc.), así como de otras enzimas y proteínas implicadas en la replicación del DNA.

BIBLIOGRAFÍA

IUBMB. The enzyme database.https://www.enzyme-database.org/query.php?name=DNA+POLYMERASE

Eom SH, Wang J, Steitz TA. Structure of Taq polymerase with DNA at the polymerase active site. Nature.
1996 Jul 18;382(6588):278-81. doi: 10.1038/382278a0. PMID: 8717047.

Mathews, Christofer K. et al. Capítulo 25: Replicación del DNA En: Bioquímica 4ª Ed. Madrid, Pearson
Education S.A. Págs: 1039-1041.

Benito Jiménez, César. La replicación. https://www.ucm.es/data/cont/media/www/pag-56185/06-

La%20replicaci%C3%B3n.pdf