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METABOLISMO DE LAS

PROTEÍNAS

EL CÓDIGO GENÉTICO
UNIDAD 7
PARTE 1
Utilidad de las proteínas
 Las proteínas son el producto final del dogma central de
la Biología Molecular.
 Las proteínas son requeridas en todas las células.
 Cada célula requiere al instante miles de proteínas diferentes.

 Las proteínas tienen un destino:


 Inicial: Las proteína son sintetizadas y transportadas al sitio
donde se requieren
 Final: son degradadas cuando ya no son necesarias.
Requerimientos de la síntesis de las
proteínas
 La síntesis de las proteínas requiere de la participación de
más de 70 proteínas ribosómicas distintas.
 Se requieren 20 o más enzimas para activar los
aminoácidos precursores.
 Se requieren una docena de enzimas auxiliares y otros
factores proteicos para las distintas etapas de la síntesis
(inicio, elongación y terminación).
 Se requieren 100 enzimas adicionales para la
modificación final de las proteínas.
 Se requieren 40 o más clases de RNA ribosómicos y de
trnasferencia.
 En total casi 300 macromoléculas para la síntesis.
Síntesis de proteínas; requerimientos
Una docena de
20 o más enzimas auxiliares
enzimas, para para el inicio,
activar a los elongación y
aminoácidos terminación de los
precursores péptidos
Cien enzimas
para la
70 proteínas Síntesis proteica modificación final
ribosómicas de las diferentes
diferentes proteínas

En total casi 300


macromoléculas cooperan
Aprox 40 RNAs Ribosómicos y para la síntesis de los
de transferencia polipéptidos
Los costos de la producción de
proteínas
 La síntesis de proteínas demanda hasta el 90% de la energía
química empleada por la célula en todas sus reacciones de síntesis.
 En general, las 100,000 moléculas de factores proteicos, los 15,000
ribosomas y las 200,000 moléculas de ARNt, constituyen el 35% del
peso seco de la célula.
Velocidad de la reacción

 No obstante la complejidad de su estructura, una proteína


(cadena polipeptídica de 100 residuos se sintetiza en una
célula de Escherichia coli a 37°C en 5 minutos.
Coordinación en los procesos de
síntesis y degradadión
 No obstante, que el proceso de síntesis es
complejo, los procesos de direccionamiento y
degradación han de estar coordinados.
LA HISTORIA
Primer experimento importante:
 1. Los descubrimientos (a inicios de los 50’s) de Paul
Zamenick y colaboradores diseñaron experimentos
para saber en que parte de la célula se
sintetizaban las proteínas.
 Inyectaba aminoácidos radiactivos a ratas y
extraía el hígado después.
 Después de algunas horas o días había proteínas
marcadas en las regiones subcelulares (compartimentos
discretos de las células).
 Si solo se esperaba algunos minutos… la proteína
marcada solo estaba contenida en partículas pequeñas
de ribonucleoproteína (que después se llamó: ribosomas).
Ribosomas
 Están compuestos por proteínas vinculadas al ARNr que proceden
del Nucléolo .
 Los ribosomas pueden hallarse adheridos al retículo o bien están en
el citoplasma.
 Su tamaño aproximado es de 30 nanómetros.

Un nanómetro equivale a la mil millonésima parte de un metro, o sea a dividir un metro


en mil millones.
LA HISTORIA
Segundo experimento importante:

 Realizado por Mahlon Hoagland y Paul Zamenick.


 Encontraron que los aminoácidos eran activados cuando se
incubaban con ATP y la fracción citosólica del hígado.
 Los aminoácidos se unían al RNA soluble, denominado más
tarde ARNt (ARN de transferencia), formando aminoacil-
tRNA.
 Mahlon Hoagland: (5 octubre 1921- 18 septiembre 1921).
Bioquímico estadounidense que descubrió el ARN de
transferencia y el descubrimiento del código genético.

 Paul Zamenick: (22 de noviembre de 1912 a 27 de octubre


de 2009). Científico estadounidense relevante para la
historia de la Biología Molecular. Pionero de la síntesis de
proteínas in vitro. Tabajo al lado de Hoagland y Elizabeth
Keller en el descubrimiento de los primeros pasos de la
síntesis de proteínas.

 Hoagland trabajó en el laboratorio de Paul Zamecnik,


donde investigó el papel del ARN de transferencia en la
formación de proteínas.
Aminoacil-ARNt
En amarillo el
aminoácido se une
 Un aminoacil-ARNt (aa-ARNt o ARNt cargado) es un covalentemente al
extremo 3’ del ARNt
ARN de transferencia al cual se encuentra para formar una
químicamente unido un aminoácido. molécula de aminoacil-
ARNt

 El aminoacil-ARNt, junto con algunos factores de


elongación, llevan el aminoácido hasta el ribosoma
para su incorporación a la cadena de polipéptidos.

 Un aminoácido específico se carga a cada tipo de


ARNt por medio de una aminoacil ARNt sintetasa.
LA HISTORIA
Tercer acontecimiento importante

 Francis Crick se preguntó de que forma el lenguaje


contenido en las cuatro letras de los aminoácidos se
transforma en el lenguaje de las 20 letras de las
proteínas.
 Pensó que una pequeña molécula de ácido
nucleico (quizás RNA), podría servir como adaptador
. Una parte del adaptador se une al aminoácido
específico y la otra parte reconoce a la secuencia
que codifica para dicho aminoácido en el RNAm.
 El proceso fue confirmado el adaptador es ARNt.
 Al proceso se le denomina TRADUCCIÓN.
Hipótesis del adaptador
de Crick.
Características del
código genético
Código sin solapamiento
 En la década de los 60s estaba claro que se requerían
al menos tres residuos nucleotídicos del DNA para
codificar cada aminoácido.
 Codón: triplete de nucleótidos que codifica para un
aminoácido.
 El código tiene cuatro letras en el ADN (A T G C).
 Cuatro bases en grupos de tres pueden dar: 43 = 64
combinaciones distintas.
 Durante la traducción los tripletes
se leen sucesivamente y sin
solapamientos.
Secuencia contigua
 Un primer codón determina el marco de lectura.
 La secuencia de tripletes contiguos determina la secuencia de aminoácidos.
• Cada secuencia de ADN
(cadena sencilla) o ARN tiene
tres posibles marcos de lectura.
• Cada marco de lectura da una
secuencia diferente de
codones.
• Sin embargo solo hay una
probabilidad.

Inicio de la secuencia del gen


Tres posibles marcos de lectura,
solo uno es verdadero
Listado de los 20 aminoácidos
Esenciales aquellos que no pueden ser sintetizados en el organismo y para
obtenerlos es necesario tomar alimentos ricos en proteínas que los contengan.

1. Histidina, es necesario para la producción tanto de glóbulos rojos y blancos en


la sangre, protege al organismo de los daños por radiación, reduce la presión
arterial, ayuda en la eliminación de metales pesados del cuerpo.

2. Isoleucina, es necesaria para la formación de hemoglobina, estabiliza y regula


el azúcar en la sangre y los niveles de energía. Este aminoácido ayuda a la
curación y la reparación del tejido muscular, piel y huesos.

3. Leucina, interactúa con los aminoácidos isoleucina y valina para promover la


cicatrización del tejido muscular, la piel y los huesos. Este aminoácido reduce los
niveles de azúcar en la sangre.

4. Lisina, garantiza la absorción adecuada de calcio y mantiene un equilibrio


adecuado de nitrógeno en los adultos. Además, la lisina ayuda a formar
colágeno que constituye el cartílago y tejido conectivo
Listado de los 20 aminoácidos
Esenciales aquellos que no pueden ser sintetizados en el organismo y para
obtenerlos es necesario tomar alimentos ricos en proteínas que los contengan.

5. Metionina: es uno de los dos aminoácidos que contienen azufre. es un


intermediario en la biosíntesis de la cisteína, la carnitina, la taurina, la lecitina, la
fosfatidilcolina y otros fosfolípidos. Fallos en la conversión de metionina pueden
desembocar en ateroesclerosis (un tipo de arteriosclerosis).

6. Fenilalanina:
7. Treonina
8. Triptofano
9. Valina
10. Alanina
Listado de los 20 aminoácidos
No esenciales aquellos que pueden ser sintetizados en el organismo a partir de
otras sustancias.

1. Arginina, retrasa el crecimiento de los tumores y el cáncer mediante el refuerzo


del sistema inmunológico, aumenta el tamaño y la actividad de la glándula del
timo, que fabrica las células T, componentes cruciales del sistema inmunológico.
Ayuda en la desintoxicación del hígado neutralizando el amoniaco.

2. Ácido aspártico, aumenta la resistencia y es bueno para la fatiga crónica y la


depresión, rejuvenece la actividad celular, la formación de células y el
metabolismo, que le da una apariencia más joven, protege el hígado, ayudando
a la expulsión de amoniaco y se combina con otros aminoácidos para formar
moléculas que absorben las toxinas y sacarlas de la circulación sanguínea.

3. Cisteína, funciona como un antioxidante en la desintoxicación de toxinas


dañinas. Protege el cuerpo contra el daño por radiación, protege el hígado y el
cerebro de daños causados por el alcohol, las drogas y compuestos tóxicos que
se encuentran en el humo del cigarrillo.
4. Ácido glutámico
5. Glutamina
6. Glicina
7. Ornitina
8. Prolina
9. Serina
10. Tirosina
Encontrando las tres letras de cada
aminoácido
 En 1961 Marshall Nirenberg y Heinrich Matthaei, incubaron
poliuridilato sintético Poli (U)con un extracto de E. coli, GTP, ATP, y
una mezcla de los 20 aminoácidos en tubos diferentes, cada tubo
con un aa distinto y marcados con radioactividad.

 El mRNA Poli U contenía tripletes UUU UUU UUU, debía sintetizarse el


aminoácido que correspondiera.
 Se formó un polipéptido radioactivo en uno de los 20 tubos, el que
contenía fenilalanina.
El experimento de Marshall Nirenberg
y Heinrich Matthaei.
Elaboraron polipéptidos con RNAm
. artificial
1) Desarrollaron un sistema in vitro: un tubo que
contenía ribosomas y ARNt de E. coli y RNAm
sintético.
2) En el tubo elaboraron una cadena de
polipéptidos RNAm artificial que contenía solo
UN NUCLEÓTIDO REPETIDO:
UUUUUUUUUUUUUUUUUUU, o bien:
AAAAAAAAAAAAAAAAAAAA, o
CCCCCCCCCCCCCCCCC
3) A cada tubo se le agregaba uno de los 20
aminoácidos en su forma radioactiva. Solo uno
se dejaba reaccionar y se separaban los
poliéptidos sintetizados si los había.
4) La radiación se encontró únicamente en el
tubo marcado como fenilalanina.
El aminoácido fenilalanina resultó sintetizado
en el tubo con poli U.
La conclusión del experimento
fue que el triplete UUU
codifica la Fenilalanina.

De igual manera el triplete


CCC codifica para Prolina.

Los polinucleótidos se obtenían


mediante una enzima: la
polinucleótido fosforilasa que
cataliza polímeros de RNA a partir
de ADP, UDP, CDP, y GDP.

ADP: Adenosín difosfato


UDP: Uridina difosfato
CDP: Citidín difosfato
GDP: Guanosín, difosfato
Polinucleótidos sintéticos
 La polinucleótido fosforilasa que cataliza la formación de
polinucleótidos a partir de nucleótidos (es decir forma polímeros de
RNA) fue descubierta por Severo Ochoa.
 La enzima no requiere molde y fabrica polímeros en función de la
concentración de precursores de nucleótidos.

 Si a la enzima se le aporta 5 partes de ADP y una parte de CDP,


fabricará un polímero de cinco sextos de adenosín (adenilato) y un
sexto de citidín (citidilato).
 Predominan tripletes AAA, regular: AAC, ACA y CAA, pocos ACC,
CCA y CAC. Muy pocos: CCC.

UDP: nucleótido Uridina difosfato, CTP: Citidín difosfato, ADP: Adenosín difosfato,
GTP: Guanosín difosfato.
Contienen la base nitrogenada, el azúcar y dos grupos fosfato.
Marshall Nirenbergh y Philip Leder,
otro avance
 Encontraron que los ribosomas aislados de E. coli fijan un aminoacil-
ARNt específico en presencia del correspondiente polinucleótido
mensajero sintético.

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