Parcial III de Biología molecular - 00000230407

Parcial III- Biología molecular

Transcripción es la copia de un segmento de ADN en forma de ARN. Se abre
una burbuja en la que se abre el segmento y solo se copia una cadena.
La transcripción sucede para copiar el ADN para producir una proteína.
El ARN es el que sale del núcleo.
★ Splicing. Eliminación de intrones que no van a codificar.
En las procariotas NO existe el tipo de splicing porque no hay un núcleo
definido como en las eucariotas.

Purinas Pirimidinas

A-G C-T (ADN)

C-U (ARN)

El ARN puede tener distintas estructuras

ARNm —> Estructura lineal
Genes nucleares —> ARNt, ARNm y ARNr
ARNt —> Facilita los aminoácidos para la síntesis de proteína, una sola
hebra pero pesada de sí misma.
ARNr —> Presenta estructura más compleja
Anticodón.

—> Se tiene una secuencia de ADN de 3´ a 5´ y de 5´a 3´ hebra molde de 3´a

5´ en el ADN.
La hebra sentido es la que lleva la información y la hebra 5´a 3´es no
codificante.

Hebra no molde = (hebra sentido) 5´a 3´

Hebra molde = (hebra no sentido) 3´a 5´

EL ARN polimerasa lleva a cabo la transcripción utilizando un molde de ADN

(Lee de 3´a 5´)
Requerimientos:
- 4 ribonucleótidos, 5 ́ trifosfato (ATP, GTP, UTP, CTP) presencia de Mg
+, la enzima también lleva 2n 2+, molde de ADN, copia dirección 5´a 3´.
El ARN polimerasa se coloca antes del promotor (la enzima tiene que
reconocer la parte promotora) donde se forma un complejo cerrado unido al
promotor para formar el ARN.
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LEER DESCRIPCIÓN
★ Splicing —> corte y empalme
Se eliminan intrones
Se quedan exones
★ Cap —> Es como la llave para poder entrar al ribosoma
Para que el ribosoma la reconozca
★ Cola Poli A —> Protege al ARNm de las ARNasas
(200- 250 adeninas)
La enzima helicasa rompe los puentes de hidrógeno.
Las proteínas estabilizadoras no van a dejar que se unan los puentes de
hidrógeno y llegue la ARN polimerasa, se coloca en la hebra y copia la
información igual (donde se llama “ARNm” o “transcrito”) y se desplaza
del ADN y las proteínas estabilizadoras se siembra el nuevo y de ADN.
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Cuestionario Transcripción
1. ¿En qué consiste el proceso de transcripción?
Es el proceso mediante el cual una célula elabora una copia de ARN de una
pieza de ADN. Esta copia de ARN, se llama ARNm.
2. ¿Por qué se dice que la transcripción es un proceso conservador?
Porque no afecta la estructura del ADN.
3. ¿Cuál es el lenguaje en bases nitrogenadas del producto de la
transcripción?
El código genético.
4. Menciona 3 tipos de ARN, además de su abundancia y función en
la célula.
ARNm —> Estructura lineal con alguna horquilla. Su función es copiar
fragmentos de ADN para sacar dicha información del núcleo y llevarlo a los
ribosomas donde la información genética procesará a proteínas (traducción).
ARNt —> Estructura peculiar en forma de trébol. Su función es transportar
aminoácidos específicos hasta los ribosomas para conseguir complementar
este proceso de traducción.
ARNr —> Es el más abundante y el ARNr unido a las proteínas forman
ribosomas, organelos encargados de la traducción.
5. Defina, ¿cuál es la hebra molde y en qué sentido ocurre la copia?
La hebra molde es la que actúa tanto como molde para la síntesis del ARNm.
Hebra del ADN que es complementaria en su secuencia de bases ARNm
transcrito. De 3´a 5´.
6. ¿Qué significa las palabras UPSTREAM y DOWNSTREAM?
UPSTREAM —> Contra corriente o río arriba situados en 5´a 3´. Son
proteínas de unión del ADN que reconoce en secuencias cortas específicas
situadas corriente arriba en 5´(proximales) del punto de inicio de la
transcripción.
DOWNSTREAM —> Río abajo, es decir, hacia 3´.
7. ¿Cuáles son los promotores más frecuentes, cuál es su secuencia
y su ubicación?
Se ubican en los extremos 5´
Caja TATAAT presenta una secuencia consenso del tipo 5´- TATAA-3´que es
seguida generalmente por 3 o más adeninas. Se localiza a 31 a 25 bp hacia
el extremo 5 ́ del punto de inicio.
Caja TTGACA ambos se localizan en los extremos 5´terminales. Los
promotores consecutivos son los más frecuentes.
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8. Menciona las tres fases del proceso de transcripción y describa lo

que ocurre en cada uno de ellos.
INICIACIÓN —> La ARN polimerasa se une a una secuencia de ADN llamado
“promotor” que se encuentra al inicio del gen. Una vez unida el ARN
polimerasa separa las cadenas de ADN para proporcionar el molde de
cadena sencilla necesario para la transcripción.
ELONGACIÓN —> Una cadena de ADN, la cadena molde, actúa como
plantilla para la ARN polimerasa. Cuando se lee este molde, una base a la
vez, la polimerasa produce una molécula de ARN a partir de nucleótidos
complementarios y forma una cadena que crece de 5´a 3´. El transcrito de
ARN contraria a la molde (codificante) en el gen, pero conotine U en vez de T.
TERMINACIÓN —> Las secuencias llamadas terminadores indican que se ha
complementado el transcrito de ARN. Una vez transcritas estas secuencias
provocan que el transcrito sea liberado de la ARN polimerasa.
9. ¿Qué es el proceso de Splicing?
Proceso en el que se elimina los intrones y unen a los exones para
producir una molécula de ARNm madura capaz de salir del núcleo hacia el
citoplasma.
10. ¿De qué está compuesto el casquete y la cola de poliA que tipo
de bases y cuántos?
Casquete —> Es un nucleótido alterado situado en el extremo 5´.
PoliA —> Protege al ARNm de los ARNasas, tiene bases púricas, es decir,
adeninas entre 200 a 250 adeninas.

TRANSCRIPCIÓN
La iniciación es crucial para determinar qué genes se pueden expresar,
cuándo y dónde.

Locus: lugar donde está contenido el gen.

Nivel promotor —> Señales de ADN que indican al aparato como deben
iniciar una transcripción en un sitio especial la actividad de promotor puede
ser regulada por la unión de factores auxiliares en sitios disponibles.
Nivel estimulador —> La frecuencia del inicio transcripcional depende de la
eficiencia que este une y organiza el complejo.
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Nivel de la dinámica del nucleosoma —> Los factores….

Promotores fuertes. Frecuente en la iniciación.

Promotores débiles. Rara vez dirigen la iniciación transcripcional.

Holoenzima —> Enzima compleja que tiene varias subunidades. El factor

sigma se une al ADN polimerasa sólo en las procariotas y se unen al
promotor.
Complejo promotor cerrado cuando se unen complejo promotor abierto
cuando se hace la burbuja y comienza la transcripción.

Unión especial de las secuencias promotoras -35 y -10.

Cuando inicia la transcripción se libera el factor sigma (𝝈)
ARN polimerasa —> Coloca aproximadamente 40 nucleótidos por segundo.

TRANSCRIPCIÓN DE ADN
El código genético se conoce con frecuencia como un “modelo” porque
contiene las instrucciones que necesita una célula para mantenerse.
- Se puede visualizar por microscopía electrónica.
- Visualizado por primera vez en 1970.
- En las primeras micrografías, las moléculas de ADN aparecen como
“troncos” o muchas “ramas”.
- En una sola cadena sirve como plantilla para la transcripción.
- La hebra molde se denomina hebra no codificante.
- La hebra que es plantilla se denomina hebra codificante porque su
secuencia será la misma que la de la nueva molécula de ARN.
- A veces una hebra de ADN que sirve para molde para un gen puede
ser la hebra no molde de otros genes dentro del mismo cromosoma.

Proceso de transcripción
Proceso cuando una enzima ARN polimerasa (ARN pol) se une a una cadena
de ADN molde y comienza a catalizar la producción de ADN complementario.
Existen tres tipos de ARN pol en las células eucariotas:
- ARN pol I —> Transcribe los genes que codifican la mayoría de los
ARN ribosomales.
- ARN pol II —> Transcribe los ARN ribosomales peq, además de los
ARN transferencia que juegan el papel clave en la traducción.
- ARN pol III —> Transcribe ARNm que sirven de moldes para la
producción de moléculas de proteína.
-
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Inicio de transcripción
El primer paso —> es cuando la ARN pol se une al ADN corriente arriba 5´del
gen en una secuencia llamada “promotor”.
En los procariotas la mayoría de los genes tienen una secuencia llamada caja
de pribnow, con la secuencia de consenso TATAAT ubicada a 10 pb del sitio
que sirve como ubicación de inicio. Secuencia de consenso TTG CCA
posición 35 bases algunas arriba. En cualquier caso, tras la unión, la enzima
del núcleo ARN pol se une a una subunidad sigma para formar una
holoenzima capaz de desarrollar la doble hélice.
Los promotores eucariotas son más complejos por las tres partes ARN
pol que transcriben diferentes conjuntos de genes. En eucariotas, el promotor
“central” de un gen transcrito por pol II tiene una caja TATA de 25 a 35 bases
arriba.
Los términos “fuertes” y “débiles” se utilizan para describir promotores y
potenciadores, según sus efectos sobre las tasas de transcripción. La
alteración de la fuerza del promotor puede tener efectos sobre una célula, lo
que a menudo da resultado a una enfermedad. Secuencias potenciadoras
mejoran la velocidad a la que transcriben los genes.
El bucle es el resultado de interacciones y proteínas unidas al potenciador
que facilitan es bucle se denomina activadores y las que inhiben son
represores.

Alargamiento de hilo.
El ADN se desarrolla y la ARN pol lee la hebra molde, agregando nucleótidos
al extremo 3´de la cadena en crecimiento, a 37°C alrededor de 42- 54
nucleótidos por segundo en bacterias y en eucariotas 22- 25 nucleótidos por
segundo.

Terminación de la transcripción.
Las secuencias terminadoras se encuentran en las no codificantes.
Bacterias poseen dos tipos:
- Terminadores independientes de rho —> transcriben secuencias
repetidas invertidas, pueden plegarse sobre sí mismas en bucles de
horquilla donde ARN pol se detiene y libera la transcripción.
- Terminadores dependientes de rho —> usan un factor llamado rho,
desenrolla activamente el híbrido ARN-ARN formado en la transcripción
liberando el ARN.
Las eucariotas dependen de la pol exacta.
Para Pol I se define a través de un mecanismo similar a la ter dep de rho en
bacterias.
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Para Pol II —> puede continuar por cientos o miles de nucleótidos más allá
del final de una secuencia no. La hebra de ARN se escinea por un complejo
que parece asociarse con la polimerasa. La excepción parece estar acoplada
con la terminación de la transcripción con ARNm moldes.
Para Pol III —> termina después de transcribir una secuencia de terminación
que incluye un tramo pol lucracilo semejante a la ter procariota independiente
de rho en bacterias. Se polidenominan en el extremo 3´, lo que de como
resultado una cola de poli A.

Transcripción.
Un promotor tiene secuencias de ADN que permiten a la ARNpol o a sus
proteínas auxiliares cuando se forma la burbuja.
Nucleótido —> azúcar, fosfato y bases nitrogenadas.
El nucleótido sería el manómetro. ARN pol Polimorfar la cadena de ARN.
Cadena codificante 5´ a 3´ 5´ ATG ATC 3´

ARN 5´ a 3´ 5´ AUG AUC 3´

Cadena molde 3´ a 5´ 3´ TAC TAG 5´

El ARNm queda en el sentido codificante de 5´a 3´ y lleva la información de la
codificante.

Pol y se une al promotor y comienza a sintetizar.

Promotores en bacterias
El promotor típico bacteriano contiene las secuencias de ADN incorporantes,
los elementos -10 y -35.
Elemento -10 —> Rica de T y A TATAAT
Elemento -35 —> TTG ACG
AAC TGC
En el elemento -10 comienza la transcripción porque hay dobles enlaces
ya que es más fácil romper los puentes de hidrógeno.
El (-) es porque está antes del sitio de iniciación.
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Eucariotas
★ Splicing. Corte y empalme (eliminación de intrones que no codifica
para proteína) y para terminar de transcribir de a lugar a la poli A
★ Cap- 5´o casquete es una G modificada.

Cola de A
Se eliminan los intrones y se agrega los casquitos (Cap- 5´y la cola poli A)
que sería un ARNm.
Transcripción primer paso de la expresión génica. Copia la secuencia de ADN
de un gen para sintetizar una molécula de ADN.
Los ARN pol realizan la transcripción, unen nucleótidos para formar una
cadena de ARN (utilizan una cadena de ADN molde).
En eucariotas las moléculas de ADN deben ser procesadas después de las
transcripción se empalmen y añade una cap- 5´ y una cola de poli A en sus
extremos.
Expresión génica —> Transcripción y traducción.
El ARN pol copia la información y necesita un molde de ADN ,es decir, una
cadena sencilla, sintetiza de 5´ a 3´.
Iniciación —> Sitios de reconocimiento en una región promotora (se une a
forma el complejo cerrado y reconoce un sitio específico (-10) se abre la
burbuja y empieza a copiarla).
Elongación —> Copia el segmento de 5´a 3´y lo lee de 3´a 5´.
Terminación —> Se pone los casquetes.

En eucariotas se hace el corte y empalme y la adición del cap- 5´y poli A

★ Poli A —> Se une en el extremo 3´.

★ Cap 5´—> Guanina modificada se une al 5´.
★ Intrones—> Quedan interior del núcleo (se eliminan).
★ Exones —> Quedan en la cadena para unirse en splicing
(empalme).

Cuando empieza a sintetizar el ARN pol II se pone la adición de la cap- 5´.

Transcrito se considera pre- ARNm y se procesa para obtener ARNm.

Splicing alternativo conduce a la producción de diferentes ARNm maduros a
partir del mismo transcrito inicial y da lugar a diferentes proteínas por sus
formas.
Cap- 5´protege al transcrito de la degradación y ayuda al ribosoma a
unirse al ARNm y leerlo para elaborar la proteína.
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El complejo enzimático CAPPING necesario para formar la cap- 5´se

encuentra.

La transcripción ocurre en cada gen.

Expresión génica en qué cantidad se expresan los genes.
En las bacterias es controlada en pequeños grupos.
Codón iniciación AUG/ codón terminación UAG u otros.

Hebra que lleva la información 5´a 3´(hebra codificante)

No codificante es la hebra molde
Cadena molde —> 3´ ATG CCC TTA GAA CCG ATT TAG GGC 5´
H. Codificante —> 5´ TAC GGG AAT CTT GGC TAA ATC CCG 3´
ARN mensajero → 5´ UAC GGG AAU CUU GGC UAA AUC CCG 3´
La hebra codificante es la que lleva la información.

Errores en la replicación.
Se detectan y apoptosis (muerte celular programadas).
Si los mecanismos de reparación fallan las mutaciones ocurren y se heredan
a las células hijas.

Revisión por polimerasas si la polimerasa agrega un nucleótido incorrecto a

la nueva cadena de ARN.
Reparación por mal apareamiento se detecta el mal emparejamiento
erróneo, se corta la secuencia y reemplaza el segmento de ADN con ayuda
de la ligasa.
En bacterias una cadena de ADN antiguo tiene grupo metilos.

En eucariotas.
Reversión directa cuando hay reacciones que dañan al ADN a una base se
le agrega un grupo y una enzima elimina al grupo
Reparación por escisión se elimina y reemplaza
Reparación por escisión de base
Reparación por escisión de nucleótidos se elimina un segmento de ADN,
la polimerasa sintetiza y con ayuda de la ligasa une
Reparación de ruptura de la doble cadena unión de extremos no
homólogos y recombinación homóloga para reparar las rupturas.
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¿Cómo los ribosomas leen los codones?

Espacios donde los ARNt encuentran sus codones correspondientes.
Se leen de 5´a 3´
Región E, P y A. (En la región E es donde se libera el ARNt)
La Met (codón de inicio) se coloca en la región P y a partir del segundo es en
la región A, se desplaza y se coloca el siguiente aminoácido.
Iniciación —> El ribosoma se une con el ARNm y el primer ARNt para que
pueda empezar la traducción.
Elongación —> Los ARNt traen a los aminoácidos al ribosomas y se unen
para formar una cadena.
Terminación —> El polipéptido es terminado y liberado para que realice su
función.
Complejo de iniciación

Iniciación en bacterias
Primero es el reconocimiento llamado secuencia shine. Delgarno (marca el
inicio de cada secuencia codificante y permite que el ribosoma encuentre el
codón de inicio correcto para cada gen).
Varias secuencias se traducen en una misma hebra y da la conformación de
distintas proteínas en una sola lectura.

-Proteínas auxiliares liberan los ARNt 5´extremo N y 3 ́ extremo C (carboxilo)

se unen los aminoácidos.

Terminación.
Termina con los codones stop y entra en el sitio A y los factores de liberación
reconocen dichos codones y caben en el sitio P.
Terminación de liberación interfieren con la enzima y forma enlaces peptídicos
hacen y agregan una molécula de agua al último aminoácido esta reacción
separa la cadena de ARNt y la proteína que se acaba de formar se libera.
Se separan las subunidades ribosomales de una de la otra y ARNt.

Coeficiente de sedimentación.
Es una medida de velocidad en la que se sedimenta una célula, macro
molécula o partícula en un medio líquido es proporcional a la centrifugación
centrífuga.
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Iniciación de la transcripción

Promotores en la bacteria
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Promotores en los seres humanos

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Elongación

Terminación en bacterias rho dependiente

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Terminación en bacterias rho independientes

Traducción

Replicación