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Las pequeñas moléculas son los sillares estructurales a partir de los cuales se construyen las moléculas orgánicas
complejas y se denominan monómeros cuando la molécula se genera por polimerización de ellos como en el caso
de las macromoléculas
Todos son sillares estructurales, pero sólo aa, ác nucleicos, azúcares simples son MONÓMEROS Generan polímeros
Grupo amino C
7
2
Los 20 aminoácidos estándar encontrados en las proteínas son α-L-aminoácidos. Tienen todos un grupo carboxilo y
un grupo amino unidos al mismo átomo de carbono (el carbono α). Difieren unos de otros en sus cadenas laterales, o
grupos R, que varían en estructura, tamaño y carga eléctrica y que influyen en la solubilidad en agua de los
aminoácidos.
Además de estos 20 aminoácidos existen muchos más que se encuentran con menor frecuencia.
Por convención, los carbonos dentro de un aminoácido se identifican con letras griegas. Los carbonos adicionales de
un grupo R se designan comúnmente β, γ, δ, ε, etc., empezando a partir del carbono α.
En todos los aminoácidos estándar excepto la glicina, el carbono α está unido a cuatro grupos diferentes: un grupo
carboxilo, un grupo amino, un grupo R y un átomo de hidrógeno. El átomo de carbono α es, por tanto, un centro
quiral.
Proteína: PM>10.000 C , Cr Cz Ca
s
C C C C C C C C C C
C C C C
3
C 3
C C 3
C
3
( s
( 3 (
f ( s
( 3
C 3 C C
C
C ,
C C ,
C C ,
,
Aspartato Glutamato
C C C
, , Asp Glu
C C
3 3 C z
S
C 3
A pH: 7 presentan carga neta negativa
Leucina Isoleucina Metionina Fenialalanina y tienen un pI <7
Leu Ile Met Phe
3
C 3
C 3
C
Co C C ,
l C C C
[ 3
5
C C C
Serina Treonina Cisteina 3 3 3
C C 3
C 3
C l l
3 3 C
C , C >
q ,
q >
G '
G ' l l c
C C ,
CC
G >
,
>
C
3
G 7
7 ?
Los grupos R de estos aminoácidos son solubles A pH: 7 presentan carga neta positiva
y tienen un pI > 7
en agua o hidrofílicos, debido a que contienen
grupos funcionales que pueden formar puentes
de hidrógeno con el agua La Historia Argentina
El esqueleto covalente de una proteína típica se compone de centenares de enlaces individuales. Dado que es
posible la rotación libre alrededor de muchos de estos enlaces, las proteínas pueden adoptar un número ilimitado de
conformaciones. Sin embargo, cada proteína tiene una función química o estructural específica, lo que sugiere que
cada proteína posee una estructura tridimensional única.
A pH y temperatura normal las cadenas polipeptídicas se pliegan adoptando una sola conformación particular,
biológicamente activa, que es la energéticamente mas favorable (menor energía libre G) y por lo tanto la mas estable
&
y biológicamente activa se denomina
“CONFORMACIÓN NATIVA”
1) Interacciones electrostáticas (que se dan entre un grupo que presenta carga y otro grupo que posea carga o δ
de carga opuesta): ión – ión; ión – dipolo.
2) Fuerzas de van der Waals: interacciones electrostáticas débiles que se dan entre grupos de átomos no unidos
entre sí como consecuencia de la existencia de dipolos (permanentes o instantáneos): dipolo-dipolo; dipolo-dipolo
inducido; dipolo instantáneo-dipolo inducido.
3) Puentes de hidrógeno: interacción electrostática compleja que se establece entre un átomo de H unido a un
elemento muy electronegativo (O, N, F) y un átomo electronegativo que presente densidad negativa de carga.
4) Interacciones hidrofóbicas: fuerzas a través de las cuales los compuestos hidrofóbicos tienden a agruparse en
un medio acuoso, no porque exista atracción real entre ellas sino porque son repelidos por las moléculas de agua
circundantes.
En general, la conformación proteica de menor energía libre (es decir, la más estable)
es aquella que posee el mayor número de interacciones débiles.
' FORMA
Fibrosas
Globulares
p
Clase Grupo Prostético Ejemplo
Muchas proteínas contienen sólo residuos aminoácidos y ningún otro grupo químico adicional; a este tipo de
proteínas se las considera proteínas simples. Sin embargo, algunas proteínas contienen componentes químicos
diferentes a los aminoácidos asociados permanentemente; estas proteínas se denominan proteínas conjugadas.
La parte no aminoácido de una proteína conjugada se denomina grupo prostético.
Las proteínas conjugadas se clasifican según la naturaleza química de su grupo prostético. Normalmente el grupo
prostético juega un papel importante en la función biológica de la proteína.
Residuos α-hélice
=
Cadena Subunidades
de aminoácidos Polipeptídica Ensambladas
La estructura primaria es una descripción de todos los enlaces covalentes (peptídicos) que unen los residuos aminoácidos
de una cadena polipeptídica. El elemento más importante de la estructura primaria es la secuencia de los residuos
aminoácidos.
La estructura es estabilizada por: Enlaces peptídicos
La estructura secundaria se refiere a la disposición particularmente estable de los aminoácidos que dan lugar a patrones
estructurales repetitivos.
Disposición que adoptan en el espacio los restos de aminoácidos adyacentes de una zona de la cadena
polipeptídica. O sea, plegamiento de la estructura primaria a lo largo de un eje.
La estructura es estabilizada por: Puentes de H intracatenarios entre el grupo CO de un aa y el Hunido al N de otro
aa ubicado 4 restos más arriba.
La estructura terciaria describe todos los aspectos del plegamiento tridimensional de un polipéptido.
Estructura tridimensional completa que resulta del plegamiento tridimensional de una cadena polipeptídica sobre sí
misma (en proteínas globulares).
La estructura es estabilizada fundamentalmente por interacciones hidrofóbicas y otras interacciones débiles (no
covalentes) como:
- las interacciones electrostáticas,
- los puentes de H,
- fuerzas de van der Waals.
El único enlace covalente que puede estabilizar esta estructura es el puente disulfuro
Cuando una proteína posee dos o más subunidades polipeptídicas, su disposición en el espacio se denomina estructura
cuaternaria. Es la descripción de la disposición espacial que adoptan las subunidades (protómeros) de una proteína
oligomérica
Pérdida de la conformación nativa por ruptura de los enlaces débiles que la estabilizan.
En la desnaturalización se pierden la estructura cuaternaria, terciaria y/o secundaria (que se hallan estabilizadas por
enlaces débiles) pero no de la estructura primaria. Ruptura de enlaces peptídicos (covalentes) = HIDRÓLISIS
Consecuencias de la Desnaturalización
-Pérdida de la función biológica: ya que la función de una proteína depende de su conformación.
-Insolubilización en agua de las proteínas globulares: la pérdida de la estructura terciaria de las proteínas globulares
determina que los restos de aa hidrofóbicos, que se hallaban confinados al interior de la esfera, queden expuestos al
entorno acuoso tornándose insoluble en agua.
Desoxiribosa s
C
, B
l
Pentosa
2- Base nitrogenada Se une al azúcar a través del OH hemicetálico
de la pentosa (unión N-glicosídica)
'
3 7
Adenosin – 5’-trifosfato
ATP i
°
SC 7
°C
Uniones fosfoanhídrido
[ 2
3
4C 9
'
5
s s s
C
y
Enlace N-glicosídico
'
4
'
'
Z
3
'
Enlace fosfoéster
Nucleósido
Nucleótido
PIRIMÍDICAS:
"
C DESOXIRRIBONUCLEÓTIDOS
3 OC C 3
zc OC 3
C
OC
C
?
6C C
?
6C C
?
6C É ,
7
3
C
t ,
,
l
1
'
' ' 3
3 7
Enlace fosfoéster
3
7
s Enlace fosfoéster % ,
% ,
l
1
3
'
s
'
Enlace fosfodiéster
Los nucleótidos sucesivos del ADN y el ARN están unidos covalentemente mediante “puentes” de grupos fosfato,
en los cuales el grupo hidroxilo 5’ de un nucleótido está unido al grupo hidroxilo 3’ del enlace siguiente mediante
un enlace fosfodiéster.
ADN Extremo 5’ Extremo 5’ ARN Todos los enlaces fosfodiéster tiene la misma
orientación a lo largo de la cadena, con lo cual cada
J J
cadena lineal de ácido nucleico tiene una polaridad
U específica y extremos 5’ y 3’ diferenciados.
sic , sic ,
Por definición, el extremo 5’ carece de nucleótido en
posición 5’, mientras que el extremo 3’ carece de
nucleótido en posición 3’. Otros grupos (con
3 3
frecuencia uno o más grupos fosfato) pueden estar
Unión ] ] presentes en uno o en ambos extremos.
fosfodiéster
G
C C
'
C
'
s s
y s C y
Extremo 5’ Extremo 3’
s s s D 3
3 3 3
] ]
Extremo 3’ Extremo 3’
ADN
3
Extremo 5’
1 ]
Extremo 5’ ARN
'
ÍC ,
o Cs
Unión D
ADN ARN D
fosfodiéster
Doble hebra constituido por
G
s JC , ÍC ,
3 3 desoxirribonucleótidos ribonucleótidos 3
3 ]
C C
ÍC , ÍC ,
3
3
Extremo 3’ Extremo 3’
-El grupo hidroxilo en 5’ de un nucleósido está unido al grupo hidroxilo 3’ del siguiente nucleósido por un “enlace
fosfodiéster”
-Se distingue un extremo donde hay un fosfato libre unidos al C5’ : extremo 5’ y un extremo donde hay un hidroxilo
libre unido al C3’: extremo 3’: Se dice que las cadenas tienen “polaridad”.
-Unidades alternas de grupos fosfato y residuos de pentosas constituyen el “Esqueleto covalente” de los ac.
nucleicos (hidrofílico y cargado negativamente) Por la presencia de los grupos fosfato
-Las bases púricas y pirimídicas son hidrofóbicas y se disponen en las cadenas perpendiculares al esqueleto
covalente apiladas entre sí de modo que los planos de sus anillos se encuentren paralelos.
-Por convención la estructura de una hebra o cadena simple de ac. nucleico se escribe siempre con el extremo 5’ a
la izquierda y el 3’ a la derecha.
ADN:
Por cuestiones geométricas, para mantener constante la distancia
entre los esqueletos covalentes, las bases se aparean púrica con
pirimídica
Carlos Gardel
Aníbal Troilo
Base púrica Base pirimídica
de una cadena de la otra
Can
• Se las nombra utilizando el sufijo –osa.
i
• Constituidos por una cadena de 3-7 átomos de C unidos entre sí por enlace simple.
• Cada C posee un grupo –OH excepto uno que presenta doble enlace con un átomo de O generando un grupo
i
carbonilo.
• Si el grupo carbonilo está en el extremo de la cadena tendremos un aldehído y de lo contrario tendremos una
cetona.
Triosas 3 .
Aldosas grupo aldehído 2C
Tetrosas 4
Pentosas 5
Hexosas 6
•
Cetosas grupo cetona 2C 2
Heptosas 7
Pentosas C C
i
C ,
,
C C
C
C C C C
, ,
C
D-gliceraldehído Dihidroxiacetona forma parte del C Se une al CO2
ATP y del ARN C Cr en la fotosíntesis
Intermediarios metabólicos ,
D-ribosa D-ribulosa
C ,
C C C
C ' ' '
c C C
Hexosas C
3g 3g 3g
C
Monosacáridos mas abundantes. C C C
C
C
E E E
,
D-fructosa 6g ,
6C ,
6C ,
23 "
2 C sí 2 C sí a c sí ,
,
z
2 2
2 C 23 2 C 23 2 C 23 y
si oí a sí
Cetona Alcohol Hemicetal Cetal
Si la cadena carbonada del monosacáridos es suficientemente larga el grupo carbonilo reacciona con el grupo –OH
de la misma cadena dando una estructura cíclica.
Las aldosas de mas de 4 carbonos y las cetosas de mas de 5 carbonos forman en disolución hemiacetales y
hemicetales intramoleculares (respectivamente) lo que hace que la molécula pase de la forma lineal a la cíclica.
Como resultado de la ciclación surge un nuevo carbono asimétrico (carbono anomérico) y por lo tanto dos nuevos
isómeros espaciales denominados anómeros: α y β
°
? α- D-Glucopiranosa
C C C
↳ G
3 Carbono
anomérico
C
↳ “Anómeros de la D-Glucosa”
C 6C ?
,
Pirano
6C ? C
,
C C β- D-Glucopiranosa
ka C C G G C
Cz G OH hemiacetalico hacia arriba
,
C
6C ?
[
?
ycg ,
Carbono
≤ anomérico co G
C C
, , α- D-Fructofuranosa
3C C C [
y 3
4C C [
3
C
]
6C 6C 7
?
Furano
C
J
C
P
β- D-Fructofuranosa
C C
RG Co C
Cz G y C [
y
3
C C
Galactosa + Glucosa
s s
Enlace (β1→4)
Glucosa + Glucosa
C C
Enlace α1→4
s s
C s C s Glucosa + Glucosa
Enlace (β1→4)
C s α- D-Glucosa
C s
Glucosa + Fructosa
Enlace α(1→2)β
C s X
ALMIDÓN
GLUCÓGENO DE RESERVA
HOMOPOLISACÁRIDOS "
DEXTRANOS , Proporcionan energía
Formados por el mismo |
CELULOSA /
tipo de monosacárido
-
QUITINA ,
PECTINAS
- ,
ESTRUCTURAL
-
HEMICELULOSAS ,
Proporcionan
AGAR - AGAR
- ,
soporte y
HETEROPOLISACÁRIDOS GOMAS
protección
MUCÍLAGOS
Formados por '
PEPTIDOGLUCANOS .
Homopolisacáridos Homopolisacáridos
de RESERVA ESTRUCTURALES
80-85%
15-20%
Polímero lineal. Formado por moléculas Polímero ramificado. Formado por
de α-D-glucosas unidas por enlaces moléculas de α-D-glucosas unidas
glicosídicos α (1→4) que adoptan un por enlaces glicosídicos α (1→4) y
arrollamiento helicoidal. ramificaciones cada 15 o 30
monómeros con enlaces
glicosídicos α (1→6).
I I I I III
. . . ' I
. r
rr. .
•..r r
. r
rr .
° i r ,
' , i i r
° i .r'II .
,II III II
I II Ii
' ..
-
|
' Las ramificaciones permiten obtener glucosa libre
más rápido debido a que las enzimas hidrolizan
enlaces glicosídicos desde los extremos
"
C ?
J J J J
\ 7 7 •
3 7 3 7 3 7 3 7
C
C s
y
C
C
C
C 3
3
Almidón
Celulosa Glucógeno
Amilosa Amilopectina
No Si Si
Ramificaciones No
cada 15-30 glucosas cada 8-12 glucosas
Bla Bha
Diagrama
Fei Fei
www.VSBWKBBWKBBw Kosaka FORT www.FBBw
VII. KOMM Kokomo KOMM www.VSow.Vsow.Vsowa
'
•
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• Los mas abundantes en la naturaleza son lineales y tienen entre 12 y 24 átomos de carbono.
-
• En algunos todos los átomos de C de la cadenas hidrocarbonada se unen por enlaces simples ( C–C):
.
denominados ácidos grasos saturados; mientras que otros presentan uno o mas enlaces dobles (C=C):
denominados ácidos grasos insaturados.
2- se identifica la posición del doble enlace mediante un exponente que sigue a la letra ∆.
?
:P , Ácido Linoleico (Linoleato)
Casi todos los ácidos grasos insaturados naturales presentan la configuración cis
3C C C C C C C C C C C C C C C C
Palmitato 16:0
(forma ionízada del ácido palmítico)
f C C C C C C C C C C C C C C C C C
:
Los lípidos incluyen a un grupo heterogéneo de moléculas orgánicas complejas (PM: 750-1500) que presentan
como característica común su insolubilidad en agua.
Según la presencia o ausencia de ácidos grasos en su molécula los lípidos se clasifican en:
l
Función: reserva energética y protección Función: estructural, componentes de
membranas biológicas
Triacilglicéridos Ceras
Reserva energética Protección FOSFOLÍPIDOS GLUCOLÍPIDOS
C
Glicerofosfolípidos Esfingoglucolípidos
,
- T C
C as
g
.
Ca era a-
C
jas
ya
i i
gas jas
"
£
c. i i
jas jas
É 7
jas
U
3 3
mis
• "
ac 1 sacar
y
TRIGLICÉRIDOS
Enlace tipo éster Esfingofosfolípidos
C y
C C 7 6
C 3 C s
C C 7 6
C 3
'
r Esfingolípidos
n
C C C 7
C 3 C C C C 3 O C -25
6 s s 3 ,
y
E
C s C C C C C C C
7 6 3 7 7 3 3
6 3
C
-
yz
C C C C C C C C C C C C C C C C C C C
Enlace
fosfoéster
Enlace fosfoéster
a c c c C C C ° ° °
°
°
C
Aminoalcohol s
C C
C
o Polialcohol c
,
c
,
Cabeza polar Colas no polares
Son moléculas
anfipáticas
•
Los 2 ácidos grasos son las “colas” apolares
del fosfoglicérido y sólo son solubles en otras
sustancias apolares como otros lípidos
.
La cabeza “polar” del fosfoglicérido,
se une fuertemente al agua
>
C C
Grupo sustituyente
en cabeza polar
Ciclopentanoperhidrofenantreno
C
Isopreno 3
o Estrano
°
3
Ácido araquidónico C ) 6
°
7 : °
°
3
°
°
Cadena hidrocarbonada
Núcleo en el carbono 17
Cabeza polar esteroide
/
Componente de las membranas celulares de animales (ausente en vegetales) Colesterol
Vitamina D Tiananmen
.
Precursor a partir del cual se sintetizan Hormonas esteroideas
Sales biliares " "" "
{{ HIM
Fosfolípido aaaa aaaa