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:O
ADN ARN PROTEÍNA
Retrotranscripción
Priones: son proteínas mal
Retrovirus ( HIV) plegadas que inducen el mal
Replicación Telomerasa plegamiento de otras proteínas
Reparación PROTEÍNA
Recombinación
Una parte importante de la información codificada en el ADN se utiliza para especificar el orden lineal -la secuencia-
de los aminoácidos de cada proteína que fabrica el organismo. La secuencia de aminoácidos, a su vez, dirige el
plegamiento de cada proteína dando lugar a una molécula con una forma y unas propiedades químicas
características. Cuando la célula fabrica una determinada proteína, ha de descodificar adecuadamente la región
correspondiente del genoma. Pero el ADN del genoma también codifica la información que especifica en qué
momento de la vida del organismo y en qué células se expresará cada gen en forma de su correspondiente proteína.
Dado que las proteínas son los principales componentes de las células, la descodificación del genoma no solo
determina el tamaño, la forma, las propiedades bioquímicas y el comportamiento de la célula, sino también las
características distintivas de todas las especies.
El ADN del genoma utiliza el ARN como intermediario para dirigir la síntesis proteica. Cuando la célula necesita una
proteína determinada, la secuencia de nucleotidos de la región apropiada de la inmensa molécula de ADN del
cromosoma se copia primero a ARN (Transcripción). Son estas copias ARN las que se utilizan como moldes para
dirigir la síntesis de las proteínas (Traducción). Por tanto, el flujo de información genética en las células va del ADN
al ARN y de éste a las proteínas. Todas las células expresan su información genética de esta manera –un principio
tan fundamental que se ha denominado dogma central de la biología molecular.
A pesar de la universalidad de este dogma, existen importantes variaciones en el mecanismo por el que la
información fluye desde el ADN a las proteínas. Entre estas variaciones, una de las principales es que, en las células
eucariotas, los transcritos de ARN sufren una serie de procesamientos en el núcleo, incluyendo su maduración,
antes de que se les permita salir del núcleo y ser traducidos a proteínas. Estos procesamientos pueden cambiar
aspectos críticos del significado de una molécula de ARN y por tanto resultan cruciales para entender de qué manera
las células eucariotas leen el genoma. Además, en algunos genes el producto final es la molécula de ARN, que se
pueden plegar formando estructuras tridimensionales precisas que desempeñan papeles estructurales y catalíticos
dentro de la célula.
Hebra molde
Pasaje de información desde la molécula de ADN Cadena creciente de ADN
que oficia de molde a la molécula de ARN de ARN Extremo 3’
Extremo 5’
•
La cadena molde de ADN es leída en dirección 3’ a 5’ Ribonucleosido trifosfato entrante ]
cadena 5’ a 3’
-
-
Al igual que en la replicación, la molécula de ARN es complementaria
con el segmento que se transcribe de ADN. Extremo 5’
-
No es una copia textual, es una copia complementaria.
-
La ARN polimerasa utiliza como sustratos ribonucleósidos trifosfato. La energía es aportada por este
ribonucleosido trifosfato entrante.
ARN:
Su azúcar es la ribosa.
Tiene uracilo en lugar de timina.
Es de cadena sencilla, estas cadenas se pueden plegar.
/
Cataliza la síntesis del ARNm en sentido 5’ a 3’; lee la hebra molde en sentido 3’ a 5’.
/
Necesita un molde (de ADN)
-
No necesita cebador, ni un extremo 3’–OH libre apareado para iniciar la síntesis.
/
Sustrato = ribonucleosidos trifosfato
-
No tiene capacidad autocorrectora, esto no tiene mucho impacto en la célula porque:
Por cada proteína mal transcrita que no sea funcional, voy a tener miles que sí lo son.
Son de poca duración en la célula
Subunidad critica
/
Tiene estructura cuaternaria: 5 subunidades 2α, 1β, 1β’, 1σ
I Reconoce el sitio donde se inicia la transcripción
Reconoce el sitio de unión de la ARN polimerasa al
ADN (promotor)
La ARN polimerasa bacteriana es un complejo formado por muchas subunidades. Una de las subunidades, llamada
factor sigma (σ), se puede desprender del complejo y es la principal responsable de la capacidad de la polimerasa
de leer las señales que hay en el ADN y que indican dónde debe empezar la transcripción.
Cuando la polimerasa se desliza a lo largo de una región de la doble hélice llamada promotor, una secuencia
especial de nucleotidos que indica el punto de inicio para la síntesis de ARN, se une a ella con fuerza.
1) La polimerasa, mediante su factor σ, reconoce esta secuencia de ADN estableciendo contactos específicos con la
parte de las bases nitrogenada que quedan expuestas hacia el exterior de la hélice.
2) Cuando la ARN polimerasa se ha unido fuertemente al promotor del ADN, separa la doble hélice exponiendo un
pequeño tramo de nucleotidos de cada hebra (sin gasto de energía).
3) Se inicia la transcripción. Esta síntesis inicial de ARN (a veces llamada “inicio abortivo”) es relativamente
ineficiente.
4) Sin embargo, cuando la ARN polimerasa ha conseguido polimerizar unos 10 nucleotidos de ARN, el factor sigma
relaja su unión a la polimerasa (se suelta, queda enzima núcleo) y esta sufre una serie de cambios conformacionales
que le permiten desplazarse rápidamente, transcribiendo sin el factor sigma (si no se suelta sigma, la transcripción
aborta)
5) La elongación de la cadena continúa hasta que la enzima encuentra una segunda señal en el ADN, el terminador
6) Las señales de terminación están codificadas en el ADN y muchas de ellas actúan formando una estructura en el
ARN (por autocomplementariedad de bases) que desestabiliza la unión de la polimerasa con el ARN.
7) La polimerasa se detiene y libera el molde de ADN y la cadena de ARN recién sintetizada.
Una vez la polimerasa se ha liberado en el terminador, vuelve a asociarse con una molécula libre de factor sigma y
puede buscar un nuevo promotor, en el cual volverá a iniciar la transcripción.
ARN POLIMERASA III GENES DE tRNA, ALGUNOS GENES DE snRNA Y OTROS ARN pequeños
RNA PEQUEÑOS. ARNt
ARNr 5S
Las tres polimerasas son estructuralmente semejantes entre sí. Comparten subunidades comunes y muchas
características estructurales, pero transcriben diferentes tipos de genes.
Hoja
corte,
por tanto, a proteínas diferentes. poliadenilación
y empalme
A partir de un mismo gen obtengo más de
ARMm
una proteína. maduro
Una molécula de ARN recién sintetizado recibe el nombre de transcrito primario, éste contiene las secuencias que
corresponden a un gen, aunque las secuencias que codifican el polipéptido puedan no ser contiguas. Los
fragmentos que interrumpen la región codificante del transcrito se denominan intrones, y los segmentos
codificantes se denominan exones. En un proceso denominado corte y empalme (splicing), los intrones son
eliminados del transcrito primario y los exones son unidos para formar una secuencia continua que especifica un
polipéptido funcional. Los ARNm eucarioticos también se modifican en ambos extremos. Un residuo modificado,
denominado casquete en 5’ (o caperuza/cap) se añada al extremo 5’ ( es un residuo de 7-metilguanosina unido al
residuo 5’-terminal de ARNm a través de un enlace 5’,5’–trifosfato, es contranscripcional). El extremo 3’ se corta y
se le añaden unos 80 a 250 residuos de adenina para formar una “cola” poli A (el ARN es escindido, luego la
enzima poli-A polimerasa añade, de uno en uno, unos 200 nucleotidos de A al extremo 3’.
Traduccion •
La secuencia de nucleotidos de un gen, a través del ARNm, es traducida a una secuencia de aminoácidos de una
proteína siguiendo una serie de reglas, conocidas como código genético. Este código fue descifrado a inicios de
los años sesenta.
La secuencia de nucleótidos de un ARNm se lee consecutivamente en grupos de 3 nucleótidos. El ARN es un
polimero lineal de 4 nucleótidos diferentes, así qué hay 4^3 = 64 combinaciones posibles de tres nucleótidos. Sin
embargo, en las proteínas sólo hay 20 aminoácidos diferentes. O bien algunos tripletes de nucleótido no se utilizan
nunca o el código es redundante y algunos aminoácidos son especificados por más de un triplete. En realidad, la
alternativa correcta es la segunda, como demuestra el código genético completamente descifrado (Degenerado).
Cada grupo de tres nucleótidos consecutivos del ARN recibe el nombre de codón y cada codón especifica un
aminoácido o una señal de paro del proceso de traducción (No es ambiguo).
Este código genético es utilizado por todos los organismos actuales (Universal), aunque se han detectado algunas
pequeñas diferencias, especialmente en el ADN mitocondrial (las mitocondrias tienen sus propios sistemas de
transcripción y síntesis de proteínas que actúan de forma bastante independiente de los del resto de la célula).
Ya hemos visto que, para leer el código genético, la célula fabrica una serie de ARNt diferentes. Consideraremos
ahora de qué manera se une cada molécula de ARNt con el único de los 20 aminoácidos que constituye su pareja
adecuada. El reconocimiento y la unión del aminoácido correcto dependen de unas enzimas llamadas aminoacil-
ARNt sintetasas, que unen covalentemente cada aminoácido con el ARNt apropiado. En muchas células existe una
sintetasa diferente para cada aminoácido (es decir, 20 sintetasas en total) (hay excepciones en bacterias).
En la figura se muestra el proceso, en dos etapas, por el cual se activa un aminoácido para la síntesis proteica.
Se utiliza energía de la hidrólisis del ATP para unir cada aminoácido a su correspondiente molécula de ARNt
mediante un enlace de alta energía.
En primer lugar el aminoácido es activado mediante la unión de su grupo carboxilo directamente a un grupo de AMP,
normalmente una reacción desfavorable, se consigue mediante la hidrólisis de la molécula de ATP que aporta el
AMP. Sin abandonar la sintetasa, el grupo carboxilo de aminoácido unido al AMP es transferido al grupo hidroxilo del
azúcar del extremo 3’ de la molécula de ARNt. Esta transferencia une el aminoácido al ARNt mediante un éster
activado y genera la molécula final de aminoacil-ARNt
Pirofosfato que
se hidroliza
Activación: formación de un aminoacil-ARNt, un aminoácido unido covalentemente a un ARNt por su extremo 3’.
Objetivos:
Asociar el aminoácido con el ARNt que contiene un anticodón complementario con el codón que codifica
para ese aa
Generar una unión de alta energía para poder unir posteriormente dos aminoácidos en la síntesis de la
cadena polipeptídica
Aminoacil-ARNt sintetasa:
Glutamil-ARNt sintetasa
Cataliza la unión del as con el ARNt.
Glicil-ARNt sintetasa
Reconoce el aa específico y el anticodón.
Existen 20 enzimas diferentes que catalizan la unión del aa con su ARNt específico.
1) La subunidad menor del ribosoma une dos factores de inicio IF-1 e IF-3.
IF-3 impide que la subunidad mayor se una prematuramente. A
continuación, el ARNm se une a la subunidad 30S. El iniciador 5’ (AUG) es
guiado hasta su posición correcta por la secuencia de Shine-Dalgarno del
ARNm. Esta secuencia consenso es una señal de inicio de 4-9 residuos
purínicos, que se encuentra entre 8 y 13 nucleotidos en el lado 5’ del codón
de inicio. La secuencia se aparea con una secuencia complementaria rica
en pirimidinas cerca del extremo 3’ del ARNr 16S de la subunidad
ribosómica 30S. Esta interacción ARNm-ARNr sitúa la secuencia de inicio
(5’)AUG de ARNm en la posición correcta de la subunidad 30S, donde es
requerida para que se inicie la traducción.
El (5’)AUG específico al que debe unirse el fMet-ARNt se distingue de otros
codones de metionina por su proximidad a la secuencia de Shine-Dalgarno
del ARNm.
El iniciador (5’)AUG se sitúa en el sitio P.
El factor de inicio IF-1 se une al sitio A para evitar que se una el fMet-ARNt
3) Este gran complejo se combina con la subunidad ribosómica 50S, al mismo tiempo, el GTP unido a IF-2 se
hidroliza a GDP + Pi, que se desprende del complejo. En este punto, los 3 factores de inicio abandonan el
ribosoma.
( )
La subunidad menor se une al los factores de iniciación IF y luego al ARNm
: El ARNt con su aa (formilmetionina en procariotas y metionina en eucariotas) se une al ARNm
Las proteínas pueden tener metionina independientemente de la de iniciación de la cadena (puede haber +
: de un AUG)
En las células eucariotas, el AUG iniciador está precedido por la CAP
/
En los procariotas no hay CAP, AUG iniciador esta señalizado por la Secuencia Shine-Dalgarno
Ello tiene lugar por transferencia del grupo N-formilmetionilo iniciador desde
si ARNt al grupo amino del segundo aminoácido, que se encuentra ahora en
el sitio A. El grupo α-amino del aminoácido en el sitio A actúa como nucleófilo,
desplazando el ARNt del sitio P para formar el enlace peptídico. Esta
reacción produce un dipeptidil-ARNt en el sitio A, mientras que el ahora
“descargado” ARNt (fMet) permanece unido al sitio P. A continuación, los
ARNt adoptan un modo de unión híbrido , con elementos de cada uno
abarcando dos sitios de unión en el ribosoma.
3) Translocación
En el último paso del ciclo de la elongación, la translocación, el
ribosoma se desplaza un codón hacia el extremo 3’ del ARNm.
Este movimiento desplaza el anticodón del dipeptidil-ARNt, que
está unido todavía al segundo codón del ARNm, del sitio A al sitio
P, y desplaza el ARNt desacilado del sitio P al sitio E, desde
donde es liberado al citosol. El tercer codón del ARNm se
encuentra ahora en el sitio A y el segundo codón en el sitio P. El
movimiento del ribosoma a lo largo del ARNm requiere EF-G
(también denominado translocasa) y la energía proporcionada
por la hidrólisis de otra molécula de GTP.
En eucariotas, el proceso de traducción ocurre con la misma lógica general que en procariotas