AMINOÁCIDOS Y PROTEÍNAS

Las proteínas y las funciones celulares

¿Qué es una proteína? Son las macromoléculas intracelulares más abundantes y se

encuentran en todos los compartimientos de la célula

Las reacciones que involucra transacciones de energía requieren: Proteína

Moléculas que se producen por las proteínas: O2, N2, H2O, NH3, CO2 y glucosa

En ausencia de un catalizador proceden de una velocidad inferior

Dentro de las células un tipo particular de proteínas (enzimas) aceleran las

reacciones

Funciones de las proteínas:

 Transportan y regulan el flujo de moléculas y electrones a traves de la

membrana
 Transmisión de información entre células y organos
 Controlan la expresión de las actividades celulares por sus uniones DNA
 Componentes principales de los músculos
 Forman parte de los sensores que nos permiten ver, oir y degustar

Determinan la estructura celular y extracelular, forman cabello y tendones:

proteínas estructurales

Cuales son las proteínas que producen el S. Inmunitario: Anticuerpos

Proteínas: polímeros de origen genético con conformación espacial

definida

Los humanos sintetizamos 50, 000 proteínas distintas.

La información contenida en el DNA es transformada por proteínas y ribosomas en la

secuencia de aminoácidos de las proteínas.

Proteínas: cadenas de L-aminoácidos

Son polímeros lineales de aminoácidos unidos por enlaces peptídicos: Proteínas

¿Cuántos aminoácidos se uilizan en la síntesis de proteínas? 20

Características de aminoácidos:

 Grrupos ionizables, por lo que, al variar la acidez de la solución, se observan

diferentes especies iónicas cuya carga neta varía con el pH.
 El carbono α (Cα) de los aminoácidos está unido a tres sustituyentes comunes: un
grupo carboxilo (-COOH), un grupo amino, básico (-NH2), con pKa cercano a
9.5; y un átomo de hidrógeno.
 El cuarto sustituyente del Cα, llamado cadena lateral (R en la figura 8-1), determina
la identidad del aminoácido. L

Son iones dipolares o zwitteriones: aminoácidos

Punto isoléctrico/pH: es cero en el aminoácidos

El Cα de los aminoácidos es quiral (del griego cheir, que

significa mano), cuatro sustituyentes pueden adoptar dos
configuraciones espaciales diferentes, llamadas
enantiómeros.

Enlace peptidico

Los L-aminoácidos unidos en las proteínas por: enlace covalente del grupo carboxilo de
un aminoácido con el grupo amino de otro.

Reacción de condensación se
forma una amida, que une
los dos aminoácidos para
formar el enlace peptídico
Durante la biosíntesis, la unión secuencial de varios aminoácidos al extremo carboxilo
genera: Cadena polipeptídica

En el inicio hay un aminoácido con el grupo

amino libre y al final un aminoácido con el
grupo carboxilo libre

La cadena polipeptídica se divide para su estudio en dos regiones

1. Esqueleto polipeptídico:

Constan de tres átomos: el nitrógeno de la amida –que antes de la condensación

peptídica formaba parte del grupo amino–, el carbono alfa (Cα) y el carbono del
carbonilo (C’), proveniente del carboxilo en el aminoácido original.

El esqueleto puede
considerarse una
secuencia de enlaces
peptídicos separados por
carbonos α. C’ está
unido a dos átomos muy
electronegativos, el
oxígeno del carbonilo y
el nitrógeno de la amida,
y genera un doble
enlace parcial entre el C’ y el N el cual restringe la rotación entre el carbono y el
nitrógeno a las dos conformaciones posibles (cis y trans), en las que los seis
átomos.

Cada amida del esqueleto polipeptídico proporciona un donador de puentes de

hidrógeno (-NH) y un receptor (-C’O).

2. Las cadenas laterales / residuos: determinan la identidad y propiedades de la

proteína al ser incorporadas a las cadenas polipeptídas

Proteínas: cadenas de aminoácidos unidos mediante enlaces peptídicos

Aminoácidos
Es el aminoácido más simple; su cadena lateral es un átomo de hidrogeno; como Cα tiene
dos sustituyentes iguales, este aminoácido no es quiral: Glicina

Cual aminoácido no presenta CH2: Glicina

Tienen cadenas laterales alifáticas hidrocarbonadas de diversas formas). Las cadenas

laterales de estos residuos no contienen átomos electronegativos, por lo que son no polares
e insolubles en agua: alanina, valina, isoleucina y leucina

La cadena lateral no es polar y esta unida al nitrogeno del enlace péptidico, por lo que
este aminoácido es en realidad un iminoácido, no tiene donador potencial de puentes
de hidrógeno: Prolina

Los dobles enlaces conjugados que presentan los anillos absorben la radiación ultravioleta:
tirosina, la fenilalanina y el triptófano

Cual es el aminoácido menos frecuentes: triptófano

Las cadenas laterales de estos dos aminoácidos son pequeñas y tienen como grupo
funcional un alcohol que permanece protonado en el intervalo de pH fisiológico, por lo que
participa como donador de puentes de hidrógeno: serina y treonina

Tiene como cadena lateral un imidazol, cuyo pK es de 6.5. En la forma no ionizada del
anillo, el nitrógeno protonado es electrófilo: Histidina

participan como aceptores potenciales de puentes de hidrógeno, tiene Pk de 4: glutamato y

aspargato

Es resultado de mutaciones en alguna de las dos proteínas que forman el transportador de

aminoácidos dibásicos que se encuentran en los túbulos proximales renales, lo que impide
la absorción de la cistina para su reutilización, con el consecuente aumento de la
concentración de cistina en orina. El pH ácido de la orina promueve la formación de
cristales de cistina que son los causantes de los síntomas: Cistinuria

Las cadenas laterales de estos aminoácidos presentan metilenos hidrófobos y una amina
básica, con pK cercano a 11: Lisina y arginina

la glutamina se desamida para dar lugar al glutamato y la asparagina produce

isoaspartato; ambos procesos se han relacionado con el envejecimiento de las proteínas.

La cadena hidrocarbonada no ramificada de la metionina es no polar. El azufre que

contiene es un nucleófilo débil, pero no puede ser protonado. En contraste, grupo tiol de la
cisteína es el más reactivo de todas las cadenas laterales y se ioniza con un Pk 9
Algunos aminoácidos son modificados en reacciones posteriores a la síntesis de las
proteínas, como la fosforilación (fosfotreonina y fosfoserina) o la hidroxilación (4-
hidroxiprolina y 5-hidroxilisina).

Existen otros aminoácidos que no son componentes de las proteínas y que se utilizan en
otras funciones biológicas, como la citrulina y la ornitina (intermediarios del metabolismo),
hormonas como la tiroxina, y neurotransmisores como el ácido γ-aminobutírico (GABA), la
dopamina

Para estudiar las propiedades de una proteína es necesario purificarla, es decir, separarla
de las otras proteínas y demás componentes celulares

Cuando se desean producir proteínas que no requieren modificaciones postraduccionales,

este es el método más frecuente en la producción de proteínas recombinantes.

Si la proteína de estudio se encuentra en el citoplasma, su liberación al solvente requiere de

la rotura o lisis de las células.

Proteína que degrada la pared celular: lisozima

Dos aminoácidos, el glutamato y el ácido γ-aminobutírico son respaonsables de la

excitación y la inhibición de las neuronas del sistema nervioso central, en particular del
córtex.

El GABA, principal neurotransmisor inhibidor del sistema nervioso central, es un

aminoácido que no está presente en las proteínas y su grupo amino se encuentra en el
carbono γ y no en α. La inhibición del córtex promueve el relajamiento muscular y
disminuye la ansiedad

El huevo, leche, carne y pescado son fuentes completas de proteínas contienen todos los
aminoácidos.

Los vegetarianos deben incluir en su dieta nueces, soya y frijoles para tener aminoácidos
esenciales.

Precipitación selectiva

La solubilidad de las proteínas depende de la concentración de sales, pH, temperatura y

polaridad del solvente. Concentraciones mayores la solubilidad disminuye, causando la
precipitación de las proteínas. Este método es importante además para preservar las
propiedades de las proteínas una vez purificadas, ya que las proteínas precipitadas por
sulfato de amonio pueden permanecer en este estado por meses y resuspenderse de
inmediato antes de su uso.
Cromatografía

proceso en el que una solución, conocida como fase móvil, se percola a través de una
matriz porosa o resina, llamada fase estacionaria, que retrasa el avance de los componentes
de la fase móvil, dependiendo de las características particulares de cada soluto.

 Intercambio de iónico (separa la proteinas por sus cargas)

 Exclusión molecular o filtración en gel (determinar peso)
 Afinidad ( resina contiene un ligando de la proteína de interés unido de modo
covalente)

Diálisis

Tipo de filtración en donde las moléculas se separan gracias a su paso a través de una
membrana semipermeable (p. ej., celofán), que permite la difusión de compuestos de bajo
peso molecular como sales y metabolitos, pero impide el paso de las macromoléculas

Electroforesis

Proceso donde las proteínas migran según su carga en un campo eléctrico

Polímeros sintéticos como el poliestireno, donde todas las moléculas tienen la misma
estructura covalente, no adoptan una conformación tridimensional específica

En contraste, en una población de proteínas con la misma estructura covalente, casi todas
las macromoléculas en solución adoptan una conformación tridimensional similar, llamada
conformación nativa, que tiene las características estructurales y dinámicas que permiten a
la proteína llevar a cabo una función biológica.

Interacciones no covalentes

La formación de enlaces restringe la distancia y el ángulo de unión entre núcleos atómicos.

En moléculas pequeñas, la descripción de la estructura covalente basta para determinar la
conformación tridimensional. En el caso de las macromoléculas, la rotación en los enlaces
de los miles de átomos en la estructura covalente da lugar a una infinidad

Interacciones de van der Waals

Son ubicuas y son de corto alcance y se maximizan cuando las superficies de los átomos o
moléculas son complementarias.

Fuerzas electrostáticas

está descrita por la ley de Coulomb. Usamos la ley de Coulomb para encontrar las fuerzas
generadas por configuraciones de carga
Dipolos

se debe a la distribución desigual de los electrones compartidos entre dos átomos.

Puentes de hidrógeno

son las interacciones no covalentes que se establecen entre un átomo de hidrógeno y dos
átomos electronegativos. La formación de un puente de hidrógeno entre dos moléculas
correlaciona los movimientos entre ambas; es decir, disminuye las orientaciones posibles
entre el par.

Efecto hidrófobo

refleja la capacidad del agua líquida de expulsar de su seno aquellas moléculas que no son
iónicas o que no tienen un gran número de donadores o aceptores de puentes de hidrógeno

Las proteínas globulares son macromoléculas esféricas o elipsoides de superficie irregular;

debido a esto, la formación de cristales de proteína de tamaño adecuado (0.5 mm)

La estructura primaria : secuencia de aminoácidos de la cadena polipeptídica y la

posición de los puentes disulfuro.

La estructura secundaria especifica la conformación local de segmentos de la proteína, en

los que la cadena adopta conformaciones regulares repetitivas, como las hélices α y las
hebras β; o no repetitivas, como vueltas y giros de conformación definida.

La estructura terciaria determina el arreglo espacial de la estructura secundaria en

dominios compactos. En las proteínas monoméricas, la estructura terciaria contiene la
posición relativa de todos los átomos de la molécula.

En las proteínas formadas por varias cadenas polipeptídicas, la descripción de toda la

molécula requiere de la estructura cuaternaria, que especifica la estequiometría y la
orientación espacial relativa de las diferentes cadena

Proteínas fibrosas y globulares

Las proteínas fibrosas: tienen funciones de soporte, están formadas por la repetición de
elementos de estructura secundaria, hélices α u hojas β, en forma de fibras.

Proteínas estructurales

 La α-queratina es una proteína fibrosa presente en todos los vertebrados; es el

componente principal de la región callosa externa de epidermis, cabellos, uñas,
cuernos, plumas y pezuñas
 El colágeno es la proteína más abundante en los vertebrados, insoluble en agua
El escorbuto es una enfermedad asociada con defectos del colágeno, se caracteriza por
lesiones en la piel, fragilidad de los vasos sanguíneos y escasa regeneración de las heridas;
el escorbuto se debe a la falta de vitamina C en la dieta.

proteínas globulares: formadas por elementos de estructura secundaria que adoptan una
conformación compacta.

Proteínas de transporte

Una de las propiedades más interesantes de las proteínas es la unión específica de

moléculas pequeñas, conocidas como ligandos.

 la mioglobina funciona además como almacén; tal es el caso de las ballenas, focas y
otros mamíferos acuáticos, en los cuales la concentración de esta proteína en el
músculo es 10 veces mayor a la encontrada en los seres humanos
 La hemoglobina responsable de la captación de oxígeno en los pulmones y de su
transporte hacia el rest del organismo.

A) la mioglobina es una proteína monomérica. B) la hemoglobina es un tetrámero

formado por dos dímeros α/β. En ambas proteínas se muestra el grupo hemo de cada
subunidad.

Anemia falciforme:  Las células falciformes se rompen fácilmente y mueren, es un grupo

de trastornos hereditarios en los que los glóbulos rojos adquieren forma de hoz. 

Proteínas catalíticas: enzimas

Las enzimas catalizan la formación, rotura y rearreglo de los enlaces covalentes necesarios
para producir nuevas proteínas, ácidos nucleicos, lípidos y carbohidratos, así como para
degradar los alimentos o las moléculas que ya no son necesarias

Proteínas de reconocimiento: inmunoglobulinas

Los anticuerpos son glucoproteínas globulares que también son llamadas inmunoglobulinas
(Ig). Estas proteínas se encuentran en el plasma de la sangre y son producidas por los
linfocitos B. Las inmunoglobulinas forman parte de la respuesta humoral del sistema
inmune, están formadas por cuatro cadenas polipeptídicas, dos cadenas ligeras (alrededor
de 220 aminoácidos) y dos cadenas pesadas (aproximada de 440 aminoácidos), que están
unidas entre sí mediante enlaces disulfuro.

cinco isotipos de anticuerpos diferentes en los humanos. Las IgG son las que están en
mayor concentración en la sangre y sirven para combatir a los patógenos; además son las
únicas que atraviesan la placenta. Las IgE unen a los alérgenos activando la liberación de la
histamina y produciendo las alergias; las IgM participan en la respuesta rápida a los
patógenos; las IgA se producen en las mucosas y las IgD son receptores en los linfocitos B.
 Proteínas motoras: actina y miosina

 Los filamentos de actina proporcionan también la base para la formación de

estructuras que protruden de la membrana celular como las microvellosidades
de las células intestinales o los seudópodos de las amibas
 La miosina es una proteína que funciona como motor molecular, que es capaz
de transformar la energía química contenida en el ATP en movimiento. La
miosina es una complejo oligomérico formado por dos cadenas pesadas y
cuatro ligeras que se pliegan formando un dominio motor y una cola larga

La hormona de crecimiento humano es una proteína de 191 aminoácidos secretada por la

glándula pituitaria. En niños se encarga del crecimiento esquelético mientras que en
adultos se relaciona con aumento de masa muscular. Esta hormona también regula el
metabolismo de lípidos y azúcares estimulando la lipólisis y la glucogenólisis.

La insulina es una hormona central en la regulación del metabolismo de la glucosa La

insulina es una proteína pequeña, lo cual facilita su transporte rápido y eficiente a través
del torrente sanguíneo.

Las cataratas son consecuencia de la alteración en la estructura de las proteínas

Coma hepático. Se trata de un cuadro clínico que presenta a menudo una afección hepática
aguda o crónica, como en la cirrosis; es una encefalopatía caracterizada por graves
trastornos neurológicos relacionados con la absorción, a nivel del intestino, de diversas
sustancias tóxicas

Ictericia

El aumento de la bilirrubina en el suero causa ictericia, o sea la coloración amarilla de las

mucosas y la piel. Existen tres tipos fundamentales de ictericia: a) la hemolítica, debida a la
destrucción excesiva de glóbulos rojos; b) la debida a la lesión de las celdillas hepáticas, o
hepatocelular; y c) la obstructiva, causada por alteración mecánica de las vías biliares.

En la obstrucción del árbol biliar es habitual que el hígado conjugue con el ácido
glucurónico la bilirrubina producida en cantidades normales. La ictericia por
obstrucción se hace manifiesta cuando no se logra excretar la mayor parte de la
bilis; en tal caso, aumenta la bilirrubina directa en sangre -hasta 40 y 50 mg/100
mL-, la cual, por ser soluble, aparece en la orina en cantidades exageradas
impartiéndole un color castaño de diferentes tonalidades (coluria).
El hígado es el principal órgano en que se forma la urea; de forma experimental se
ha demostrado que la citrulina,