Profesor: Dr.

Javier Sáez Valero

Instituto de Neurociencias
Tfno. 965919580
j.saez@umh.es

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Material DE CLASE disponible en la web UMH

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Exámenes tipo test

Bibliografía
*Lehninger, PRINCIPIOS DE BIOQUÍMICA, Ed Omega, 4ª edición
*Stryer et al., BIOQUÍMICA, Ed Reverté, 5ª edición
TEMA 1 COMPOSICIÓN MOLECULAR DE LOS SERES VIVOS

1. PRESENTACIÓN DEL PROGRAMA DEL CURSO

2. BREVE HISTORIA DE LA BIOQUÍMICA
3. INTRODUCCIÓN: NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE LOS SERES VIVOS
4. BIOELEMENTOS Y OLIGOELEMENTOS
4.1. Bioelementos Primarios
4.2. Bioelementos Secundarios
4.3. Oligoelementos
5. BIOMOLÉCULAS
5.1. Biomoléculas inorgánicas
-El Agua
-Las Sales Minerales
5.2. Biomoléculas orgánicas
5.2.1. Unidades estructurales
5.2.2. Macromoléculas
5.2.2.1. Biopolímeros
5.2.2.2. Lípidos
5.2.3. Metabolitos
 BIOQUÍMICA
La Bioquímica intenta descifrar cómo las mismas moléculas inanimadas
que forman los compuestos más simples en la superficie de la Tierra
pueden dar lugar a organismos vivos de compleja organización
Características distintivas seres vivos:
-Elevado grado de complejidad química y de organización molecular
-Generación de mecanismos para obtención y transformación (uso) de la
energía
-Capacidad de “perpetuarse”: replicarse y ensamblarse
-Respuesta (mecanismo detección) a cambios en entorno
-Especialización de función para cada componente y macro-organización
(interacción)
-Generación de adaptación a situaciones distintas (evolución)

Intenta describir en términos moleculares las estructuras, mecanismos y

procesos químicos compartidos… La generalización siempre es inexacta
 Bioquímica

Bioquímica (según R.A.E. de la lengua):

“Parte de la química que estudia la composición y
transformaciones de los seres vivos.”

Definición “concreta”:
“Ciencia que estudia los constituyentes químicos de los seres
vivos, sus funciones y transformaciones, así como los procesos
que controlan estos”.

Explicar en términos químicos las estructuras y funciones biológicas

LA LÓGICA MOLECULAR DE LA VIDA
 NIVELES DE ORGANIZACIÓN DE LOS SERES VIVOS

1. Nivel Molecular:
bioelementos, moléculas y
macromoléculas
2. Nivel Celular: orgánulos y
compartimientos celulares

3. Nivel Organismo: la célula

como componente de un
organismo superior (tejidos y
órganos)
4. Nivel de población: individuo
dentro de una comunidad o
población
10.000 veces
 Raíces de la Bioquímica
INTERDISCIPLINAR
Ciencia que
integra varias
disciplinas,
haciendo del
lenguaje
Bioquímico una
herramienta
esencial para el
estudio de
muchas otras
áreas de
conocimiento
como la
Microbiología, Objetivos :
Genética y * Análisis químico de los
Biología celular. constituyentes celulares.
* Análisis de las reacciones
químicas de esos componentes
En 1866 Felix Von Hoppe-Seyler
Acuña por primera vez el término
Bioquímica (química de la vida)

Cronología
(nacimiento)
de la Bioquímica
1951, Fred Sanger secuencia por primera vez una proteína: la insulina
1953, descripción de la estructura de doble hélice del DNA, por J. Watson y F. Crick.

A la mitad de la década de los sesenta aumentan estudio en: proteínas,

aspectos bioquímicos de la genética, mecanismos de acción enzimática,
organización y regulación de enzimas, ácidos nucleicos y nucleótidos.
Así como: membranas y paredes celulares, diferenciación celular,
motilidad, fijación de nitrógeno, secreción, etc.

(1960) R. Hill y F. Bendall postulan el esquema en Z de la fotosíntesis

(1961) P. Mitchell establece la hipótesis quimiosmótica, lo que ha sido primordial para el

desarrollo de la energética de los fenómenos de transporte.

(1965) Jacob, Monod y Changeux proponen el modo de acción de las enzimas alostéricas.

(1972) Singer y Nicholson, modelo del "mosaico fluido" como explicación molecular de la
estructura de la membrana.

Decaen los estudios y caracterizaciones de enzimas o rutas metabólicas, y comienza

el auge de la Biología Molecular
 BIOELEMENTOS Y OLIGOELEMENTOS

95%

Elementos biogénicos o bioelementos,

aquellos elementos químicos que forman parte de la vida
Bioelementos Primarios (95% de la materia viva)
- Bioelementos Secundarios
- Oligoelementos
 F, Cr, Li

Las clasificaciones son variables dependiendo del autor, y más si cabe para los
oligoelementos ya que se puede considerar a todos en mayor medida más o menos
“indispensables”
 Bioelementos secundarios (4,5% de la materia viva)

Se encuentra en dos aminoácidos (cisteína y metionina) , presentes en todas las

Azufre proteínas. También en algunas sustancias como el Coenzima A

Forma parte de los nucleótidos, compuestos que forman los ácidos nucléicos. Forman
parte de coenzimas y otras moléculas como fosfolípidos, sustancias fundamentales de
Fosforo las membranas celulares. También forma parte de los fosfatos, sales minerales
abundantes en los seres vivos.
Forma parte de la molécula de clorofila, y en forma iónica actúa como catalizador,
Magnesio junto con las enzimas, en muchas reacciones químicas del organismo.
(*) (*): algunos autores lo consideran como un oligoelemento

Forma parte de los carbonatos de calcio de estructuras esqueléticas. En forma iónica

Calcio interviene en la contracción muscular, coagulación sanguínea y transmisión del
impulso nervioso.
Catión abundante en el medio extracelular; necesario para la conducción nerviosa y
Sodio la contracción muscular.

Catión más abundante en el interior de las células; necesario para la conducción

Potasio nerviosa y la contracción muscular

Anión más frecuente; necesario para mantener el balance de agua en la sangre y

Cloro fluído intersticial
 Oligoelementos (<1% de la Materia viva)
aislados más de 60 en seres vivos, sólo algo más de 15 considerados comunes

Fundamental para la síntesis de clorofila, catalizador en reacciones químicas y

Hierro formando parte de citocromos que intervienen en la respiración celular, y en la
hemoglobina que interviene en el transporte de oxígeno.
Manganeso Interviene en la fotolisis del agua , durante el proceso de fotosíntesis en las plantas.

Yodo Necesario para la síntesis de la tiroxina, hormona que interviene en el metabolismo

Fluor Forma parte del esmalte dentario y de los huesos.

Cobalto Forma parte de la vitamina B12, necesaria para la síntesis de hemoglobina .

Proporciona resistencia al tejido conjuntivo, endurece tejidos vegetales como en las
Silicio gramíneas.

Cromo Interviene junto a la insulina en la regulación de glucosa en sangre.

Zinc Actúa como catalizador en muchas reacciones del organismo.

Actúa sobre neurotransmisores y la permeabilidad celular.
Litio En dosis adecuada puede prevenir estados de depresiones.
Forma parte de las enzimas vegetales que actúan en la reducción de los nitratos por
Molibdeno parte de las plantas.
Características Físico-químicas de los Bioelementos Primarios

1) Forman enlaces covalentes

Con Bioelementos primarios

muy estables
Átomos de pequeña masa que forman entre
ellos enlaces covalentes muy estables,
compartiendo electrones

Con secundarios
La química de los
organismo vivos se
organiza alrededor del C

Mayor parte de las biomoléculas

son derivados de hidrocarburos
2) Presentan conformación Tetrahédrica
Los enlaces simples
(4 enlaces simples), lo que permite: carbono-carbono
presentan libertad
de rotación
* Formar estructuras 3D
responsable de la actividad biológica junto con
los grupos funcionales que le confieren
propiedades fisico-químicas específicas

** Existencia de Estereoespecificidad o
Isomería
asimetría molecular

Los compuestos de carbono existen como

estereoisómeros…

Estructura del carbono:

Tetrahedro regular
 Características Físico-químicas de los Bioelementos Primarios
3) Pueden compartir más C-H simple

de un par de electrones
C-O simple
generando enlaces
simples, dobles y
triples, facilitando la C-O doble

formación, además de
moléculas lineales, de C-N simple
moléculas rámificadas o
cíclicas
C=N doble
Versatilidad para el
enlace químico
C-C simple

Enlaces del carbono con Bioelementos C=C doble

Primarios:
El carbono puede formar enlaces simples,
dobles y triples (muy poco abundantes) C C triple
4) En el caso del Carbono, su combinación con otros bioelementos daría lugar
a la aparición de los Grupos funcionales
Generación familias sustancias orgánicas con propiedades fisico-químicas diferentes
 La estructura tridimensional: configuración y conformación

En la función biológica intervienen: los grupos funcionales, los enlaces convalentes y

la distribución de los átomos en el espacio tridimensional: estereoisomería*

Los compuestos de carbono existen como estereoisómeros, moléculas con los

mismos enlaces químicos pero con estereoquímica diferente: diferente configuración
o relación espacial entre sus átomos constituyentes
*las relaciones entre las biomoléculas son
estereoespecíficas

La configuración es el resultado de
1) la presencia de enlaces dobles
(sin libertad de rotación)
2) o centros quirales

Los isómeros configuracionales NO pueden ser intercambiados

sin romper temporalmente enlaces covalentes
(consume Energía)
 Isomería configuracional: Isómeros geométricos o cis-trans

Cis: grupos al mismo

lado que doble enlace
Trans: grupos lado
opuesto que doble
enlace

Difieren en la disposición de sus grupos sustituyentes con respecto al doble enlace

que no posee capacidad de rotación

A pesar de ser químicamente muy semejantes, resultan compuestos de papeles biológicos

muy diferentes
 Isomería configuracional: Asimetría molecular,
moléculas quirales y aquirales

Un átomo de carbono con 4 sustituyentes diferentes es asimétrico, centros quirales,

Se originan estereoisómeros con propiedades químicas similares pero que pueden diferir en algunas
propiedades físicas o biológicas
 Isomería configuracional:
moléculas quirales

Los sustituyentes pueden ordenarse en el espacio de

dos maneras diferentes
Una molécula con sólo carbono quiral puede tener 2 estereoisómeros:

Sistema RS
Dextrogiro (R), Levogiro (S)

Se ordenan de acuerdo a la “prioridad” del sustituyente

-OCH2 > -OH > -NH2 > -COOH > -CHO > -CH2OH > -CH3 > -H

*El sistema D y L, también usado cuando existe un solo centro quiral

Tipos de estereoisómeros: Enantiómeros y diastereómeros

2 C quirales, 22 esteroisómeros

Isómeros ópticos con más de un carbono quiral

*Los enantiómeros tienen propiedades químicas casi idénticas, pero se diferencian en su interacción con
la luz polarizada
(soluciones equimolares de los dos enantiómeros, mezclas racémicas, no provocan rotación óptica).
*Los compuestos sin centros quirales no provocan rotación óptica
La estructura tridimensional: configuración y conformación

La conformación molecular describe la disposición espacial de los grupos

que tiene libertad para adoptar diferentes posiciones en el espacio sin
romper enlaces, gracias a su libertad de rotación.
Son posibles muchas conformaciones diferentes e interconvertibles

Libertad de rotación Sin posibilidad de rotación

CONFIGURACIÓN: para cambiarse requiere

CONFORMACIÓN: puede cambiarse la ruptura del enlace ya que
por rotación del enlace (libertad de giro) (no hay libertad de giro)
 Conformación: libertad de rotación

Etano: muchas conformaciones posibles

(imposibles de aislar) al existir libertad de rotación
entre el enlace simple C-C
Las diferencia de energia entre conformaciones es
pequeñan y permiten la rápida interconversión:
Imposibilidad aislar formas

La libertad de rotación permite muchas conformaciones diferentes e interconvertibles

de especial interés la extendida (más estable y predominante) y la eclipasada
 Un reactivo con su enzima,
Una hormona con su receptor hormonal,
Un antígeno con su anticuerpo específico…

Las interacciones entre moléculas son estereoespecíficas

BIOMOLÉCULAS
 BIOMOLECULAS INORGÁNICAS: EL AGUA
70-95% del peso de los seres vivos (75% en humanos)

Estructura de la molécula de agua: H2O

Disposición
tetrahédrica irregular
Angulo enlace 104,5º

Ambos H con carga parcial (+), el O (-)

Aunque carga neta neutra, distribución asimétrica de densidad
electrónica (molécula no lineal): carácter dipolar
Interacción electrostática entre moléculas de agua,
dipolo-dipolo, formándose enlaces por puente de hidrógeno
Responsables de sus propiedades extraordinarias

Son enlaces relativamente débiles, con una

energía de disociación de enlace baja

Energías de enlaces covalente

y no covalente

Enlace de hidrógeno, con un 10% carácter

covalente, por el solapamiento de los orbitales
de enlace, y un 90% carácter electrostático
Enlaces de hidrógeno entre moléculas de agua

Aunque son uniones débiles, el ordenamiento casi

tetraédrico de los orbitales alrededor del oxígeno,
permite que cada molécula de agua forme
enlaces con hasta 4(*) moléculas de agua
vecinas mediante puentes de hidrógeno

En el agua líquida, a temperatura ambiente y presión

atmosférica, están desorganizadas y en movimiento
continuo (agrupamiento fluctuante)

(*) En estado líquido, cada molécula forma enlaces por puente

de hidrógeno con sólo 3,4 moléculas en promedio
(por desorganización y continuo movimiento)
Puentes de hidrógeno en el hielo

-El número de puentes de hidrógeno que rodean

a cada molécula influye en la fluidez y estado
físico del agua.

-En el hielo se alcanzan el máximo de puentes

posibles -4- (cada molécula está fija)

La red cristalina del hielo es menos densa que

el agua líquida: flota
 Puentes de hidrógeno en sistemas biológicos

Puentes hidrógeno NO son exclusivos del agua: entre un átomo electronegativo (el aceptor
de hidrógeno, normalmente O o N con un par de electrones no enlazantes) y un átomo de H
unido covalentemente a otro electronegativo (el dador de hidrógeno) en la misma u otra
molécula
Los átomos de H unidos covalentemente a átomos de C no participan de puentes de hidrógeno
 Direccionalidad del puente de hidrógeno

Puente hidrógeno alcanza fuerza máxima (máxima interacción electrostática) cuando las
moléculas unidas están orientadas (átomo de H y los dos átomos que lo comparten, entre
el átomo aceptor alineado con enlace covalente entre dador y H)

Puentes hidrógeno carácter direccional, mantener un ordenamiento geométrico preciso, lo que

confiere estructuras tridimensionales muy precias a moléculas de proteínas y ácidos nucleicos
 Puentes de hidrógeno con alta importancia biológica

Alcoholes, aldehídos, cetonas y compuestos con enlaces N-H

 Propiedades físico-químicas del AGUA

1.- Tª de ebullición alta: 100ºC a 1 atm: amplio rango de estado líquido.

2.- Densidad máxima a 4ºC: permite flotar al hielo (vida bajo el hielo).

3.- Elevado calor específico, calor de vaporización y conductividad

térmica: permite el mantenimiento de la Tª corporal.

4.- Alta constante dieléctrica y capacidad de solvatar iones…

 4.- Alta constante dieléctrica y capacidad de solvatar iones: .

Disolución de sales cristalinas por agua

El agua debilita las interacciones electrostáticas entre los

Lehninger iones de la sal, aprovechando su carácter dipolar, y
contrarrestando su tendencia a asociarse en una red
cristalina
Lo mismo ocurre con biomoléculas cargadas: ac. carboxílico ionizado –COO-
amina protonada –NH + 3
 Propiedades físico-químicas del AGUA

1.- Tª de ebullición alta: 100ºC a 1 atm: amplio rango de estado líquido.

2.- Densidad máxima a 4ºC: permite flotar al hielo (vida bajo el hielo).

3.- Elevado calor específico, calor de vaporización y conductividad

térmica: permite el mantenimiento de la Tª corporal.

4.- Alta constante dieléctrica y capacidad de solvatar iones…

5.- Disolvente de compuestos polares y anfipáticos:

5.- Disolvente de compuestos
polares y anfipáticos:

Compuestos anfipáticos contienen regiones

polares (cargadas) y apolares
En mezcla con agua la región apolar tiende a evitar
el contacto y las moléculas se agrupan formando
micelas (interacción región apolar: hidrofóbica)
 Propiedades físico-químicas del AGUA

1.- Tª de ebullición alta: 100ºC a 1 atm: amplio rango de estado líquido.

2.- Densidad máxima a 4ºC: permite flotar al hielo (vida bajo el hielo).

3.- Elevado calor específico, calor de vaporización y conductividad

térmica: permite el mantenimiento de la Tª corporal.

4.- Alta constante dieléctrica y capacidad de solvatar iones…

5.- Disolvente de compuestos polares y anfipáticos

6.- Alta tensión superficial: fuerzas intermoleculares: puentes hidrógeno

7.- Transparencia: al pasar la luz se puede verificar la fotosíntesis

8.- Comportamiento como un ELECTROLITO DEBIL

 8.- Comportamiento como un ELECTROLITO DEBIL

Ionización del agua:

El agua tiene capacidad de disociarse
en iones, resultando una mezcla de
agua molecular, iones hidroxilo e
hidrónio

Hidroxilo Hidronio Disociación muy débil en agua pura

[H+] [OH-] Kw: producto iónico del agua 25ºC

K´eq=
[H2O]
En el agua pura K´eq= 1,8.10-16 M y [H2O]= 55,5 M
En el agua pura concentraciones de hidronios e hidroxilos es constante, despejando:
[H+] = [OH-] = 10-7 M
El agua pura está a pH neutro
 El concepto de pH= - log [H+]

Los organismos vivos no soportan variaciones del pH mayores de unas décimas de unidad
y por eso han desarrollado a lo largo de la evolución sistemas de tampón o buffer, que
mantienen el pH constante mediante mecanismos homeostáticos.
Los sistemas tampón consisten en un par ácido-base conjugada que actúan como dador y
aceptor de protones respectivamente.
 BIOMOLECULAS INORGÁNICAS: Las SALES MINERALES
-Sales insolubles en agua.
Forman estructuras sólidas, que suelen tener función de sostén o protectora, como :
Esqueleto interno de vertebrados (fosfatos, cloruros y carbonatos de calcio)
Caparazones de carbonato cálcico de crustáceos y moluscos.
Endurecimiento de células vegetales, como en gramíneas (impregnación con sílice)
Otolitos del oído interno, formados por cristales de carbonato cálcico (equilibrio)

-Sales solubles en agua.

Se encuentran disociadas en sus iones (cationes y aniones ) que son los responsables de
su actividad biológica. funciones:
Funciones catalíticas. Algunos iones, como el Cu+, Mn2+, Mg2+, Zn+... actúan como
cofactores enzimáticos
Funciones osmóticas. Intervienen en los procesos relacionados con la distribución de agua
entre el interior celular y el medio donde vive esa célula. Los iones de Na, K, Cl y Ca,
participan en la generación de gradientes electroquímicos, imprescindibles en el
mantenimiento del potencial de membrana y del potencial de acción y en la sinapsis
neuronal.
Función tamponadora. Se lleva a cabo por los sistemas carbonato-bicarbonato, y también
por el monofosfato-bifosfato.
BIOMOLECULAS INORGÁNICAS: GASES

Serían fundamentales el O2 y el CO2

se estudiarán durante el bloque de metabolismo
 BIOMOLECULAS: BIOMOLECULAS ORGÁNICAS
Unidades Macromoléculas
estructurales biopolímeros
a.a.

Nucleótidos

Ac grasos y glicerina

Monosacáridos

Metabolitos: intermediarios en rutas metabólicas y otras rutas celulares