Variante ómicron del SARS-CoV-2

Variante ómicron
B.1.1.529.1

Parte de las variantes del SARS-CoV-2

Casos acumulados de la variante ómicron por

territorio     10.000–99.999     1.000–9.999     100
–999     10–99     1–9     0

Agente patógeno

Patógeno SARS-CoV-2

Tipo de patógeno Virus

Enfermedad COVID-19
causada

Datos históricos

Inicio del contagio 26 de noviembre de 2021

Lugar de inicio  Sudáfrica

Nivel del contagio Pandemia

Lugares afectados 149 territorios

[editar datos en Wikidata]

La variante ómicron 1 (también conocida por el identificador de linaje

PANGO B.1.1.529.1, el identificador de clado GISAID GR/484A y el identificador de
clado Nextstrain 21K)2 es una variante del SARS-CoV-2, causante de la enfermedad
COVID-19. El primer caso se detectó en Botsuana el 9 de noviembre de 20213 a partir
de una muestra recogida bajo los auspicios de la Red para la Vigilancia Genómica en
Sudáfrica.4 El 26 de noviembre de 2021 la Organización Mundial de la Salud (OMS) la
designó como una variante preocupante.5
La variante tiene un número inusualmente grande de mutaciones, varias de las
cuales nuevas y algunas de ellas (concretamente treinta y dos) afectan a la proteína de
la espícula utilizada en la mayoría de las vacunas actuales. Este nivel de variación
tiene efectos preocupantes respecto a la transmisibilidad, evasión del sistema
inmunológico y resistencia ante las vacunas contra la infección asociada al SARS-CoV-
2. Por ello, la variante fue rápidamente designada como «preocupante» y varios países
introdujeron restricciones de viaje para limitar o ralentizar su propagación internacional.
Sin embargo, el 31 de enero de 2022 se puso fin al bulo de esta variante no era
suficiente con dos vacunas cuando los científicos españoles confirmaron que las
vacunas son efectivas al igual que otras variantes. 6
Por su contagiosidad y mutaciones, rápidamente ha dado lugar a subvariantes.

Índice

 1Clasificación

o 1.1Nomenclatura

o 1.2Mutaciones

 2Historia

 3Impacto clínico

o 3.1Síntomas

 4Estadísticas

 5Medidas

 6Véase también

 7Referencias

 8Enlaces externos

Clasificación[editar]
Nomenclatura[editar]
El 26 de noviembre, el Grupo Asesor Técnico de la OMS sobre la evolución del Virus
SARS-CoV-2 declaró que el linaje PANGO B.1.1.529 era una variante preocupante y lo
designó con la letra griega ómicron.78 La OMS omitió «nu» y «xi», las siguientes letras
en el alfabeto griego, para evitar confusiones con la palabra inglesa new y evitar
confusión y ofensa con el apellido chino Xi, que es el 296º apellido más común en
China y el apellido del líder de dicho país. 9 La Organización Mundial de la Salud
reserva la designación «ómicron» para variantes preocupantes. 10
El proyecto GISAID le ha asignado el identificador de clado GR/484A y el proyecto
Nextstrain le ha asignado el identificador de clado 21K. 2
Mutaciones[editar]

Ilustración de las ubicaciones de las mutaciones de ómicron en la proteína de pico.

Vista superior (izquierda) y vista lateral (derecha) que muestran sustituciones
de aminoácidos (amarillo), eliminaciones (rojo) e inserciones (verde). En esta estructura
trimérica dos monómeros (gris y azul claro) tienen sus dominios de unión al receptor en
la conformación inferior mientras que uno (azul oscuro) está en la conformación
superior o abierta. Datos de mutación de la OMS. Estructura de PDB : 6VYB.11
La variante tiene una gran cantidad de mutaciones, algunas de las cuales son
preocupantes.12 Treinta y dos de estas mutaciones afectan a la proteína de la espícula.
Dicha espícula es el principal objetivo antigénico de los anticuerpos generados por
infecciones y de la mayoría de las vacunas administradas hasta 2021. Muchas de esas
mutaciones no se habían observado en otras cepas. 1313 La variante se caracteriza por
30 cambios de aminoácidos, tres pequeñas supresiones y una pequeña inserción en la
proteína de la espícula en comparación con el virus original, de los cuales 15 están
ubicados en el dominio de unión al receptor (residuos 319-541). También lleva una
serie de cambios y supresiones en otras regiones genómicas. Es de destacar que la
variante tiene tres mutaciones en el sitio de división de la furina. 14 El sitio de escisión de
la furina aumenta la infectividad del SARS-CoV-2.15 Las mutaciones por región
genómica son las siguientes:16

 Proteína de la espícula: A67V. Δ69-70. T95I. G142D. Δ143-145. Δ211.

L212I. ins214EPE. G339D. S371L. S373P. S375F. K417N. N440K. G446S.
S477N. T478K. E484A. Q493R. G496S. Q498R. N501Y. Y505H. T547K.
D614G. H655Y. N679K. P681H. N764K. D796Y. N856K. Q954H. N969K.
L981F
 ORF1ab:
o nsp3: K38R. V1069I. Δ1265. L1266I. A1892T
o nsp4: T492I
o nsp5: P132H
o nsp6: Δ105-107. A189V
o nsp12: P323L
o nsp14: I42V

 Proteína de la envoltura: T9I

 Proteína de membrana: D3G. Q19E. A63T

 Proteína nucleocápside:P13L. Δ31-33. R203K. G204R

Historia[editar]
Artículo principal: Anexo:Cronología de la variante ómicron del SARS-CoV-2
Una persona positiva viajó a Hong Kong proveniente de Sudáfrica17. Se identificó un
caso confirmado en Israel de un viajero que regresaba de Malaui.18 junto con dos que
regresaron de Sudáfrica y uno de Madagascar. Se detectó otro caso en Bélgica de una
joven que viajó a Egipto (donde aparentemente adquirió la infección) e hizo escala
en Turquía.1920
Varios investigadores afirman que la vacuna de Pfizer-BioNTech contra la COVID-
19 protege contra la variante ómicron.2122

Impacto clínico[editar]
Para diciembre del 2021, diferentes investigaciones han señalado que la variante
posee una mayor capacidad de transmisión incluso en la población previamente
infectada por COVID-19.23 Estos datos han sido extrapolados en base al patrón
epidemiológico de infección observado en Sudáfrica durante el último trimestre del
2021. En cuanto al grado de severidad de la enfermedad. en base a los mismos datos
previamente descrito se hipotetiza que los pacientes presentan cuadros clínicos más
leves.23 En un estudio realizado por la Facultad de Medicina de la Universidad de Hong
Kong se encontró que la variante ómicron se reproduce con facilidad en
los bronquios pero pobremente en los pulmones.24 Si bien la capacidad de infección es
menos eficiente en los pulmones, una carga viral más alta puede empeorar la
respuesta inmunitaria.25
En relación con la capacidad de la variante de escapar al efecto de las vacunas, un
pequeño estudio 26 mostró una disminución de hasta 41 veces en cuanto a la formación
de anticuerpos neutralizantes en relación con la vacuna Pfizer-BioNTech. Para el 12 de
diciembre aún no se cuenta con mayor información en relación con el resto de vacunas.
En España, en la semana del 6 al 12 de diciembre de 2021 se comprobó mediante
secuenciación de muestras aleatoria del virus en contagiados que el 47.2 % de las
muestras correspondían a la variante ómicron.27 Las muestras de ómicron en la
semana del 29 de noviembre al 5 de diciembre de 2021 fueron del 3.4 %. De esta
forma se sigue apuntando a las hipótesis iniciales de la mayor capacidad de
propagación de esta variante respecto a la delta.
El 3 de diciembre el subsecretario de prevención y promoción de la salud
de México, Hugo López-Gatel confirmó que la variante ómicron ya se encontraba
en México28. Para el 21 de diciembre se indicó que había al menos 23 casos
confirmados de la variante en el territorio mexicano. 29
Síntomas[editar]
No se han asociado síntomas inusuales con la variante y, al igual que con otras
variantes, algunos individuos que cursan la infección son asintomáticos. 30 31

 No presentan pérdida de olfato ni de gusto, síntoma hasta ahora

característico entre los infectados por coronavirus.
 Como principal característica los contagiados presentan secreción nasal y
dolor de cabeza
 En España, los pacientes contagiados de COVID-19 con la variante ómicron,
son episodios de sudores nocturnos, como brotes de sudoración repentina,
síntoma que no se había registrado hasta ahora. 32

Estadísticas[editar]
Casos registrados al 22 de julio de 2022 (UTC).33Datos del rastreador de variantes.3435
Actualizado el 22 de julio de 2022

mostrar

Medidas[editar]

 Se han vetado los vuelos

desde Sudáfrica. Namibia. Lesoto. Esuatini. Zambia. Zimbabue. Botsuana. M
ozambique y Tanzania. También se irán incluyendo todos los países de
África según se vayan detectando un caso o más de esta variante. además
de a su lista roja de destinos de viaje.
 Además exigen estricto esquema de vacunación completo y PCR negativo
de todos los países que se hayan detectado casos de ómicron (linaje
B.1.1.529).
  Japón ha prohibido el nuevo ingreso a todos los extranjeros a partir del 30 de
noviembre del 2021.92
 México cancela conciertos de fin de año de Los Ángeles Azules y verbena
navideña para evitar contagios.
 Estados Unidos cancela miles de vuelos en las aerolíneas, se genera una
gran pérdida económica.

Véase también[editar]

 Variantes de SARS-CoV-2
 SARS-CoV-2

Referencias[editar]

1. ↑ www.fundeu.es. 27 de noviembre de 2021 nombre de la nueva variante

https://www.fundeu.es/recomendacion/omicron-nombre-de-l. nombre de
la nueva variante  |url=  sin título (ayuda). Consultado el 28 de noviembre
de 2021.
2. ↑ Saltar a:a b «Tracking SARS-CoV-2 variants». www.who.int (en inglés).
Consultado el 27 de noviembre de 2021.
3. ↑ «US to Restrict Flights Over New Heavily Mutated Omicron COVID-19
Variant - November 26. 2021». Daily News Brief (en inglés
estadounidense). 26 de noviembre de 2021. Consultado el 27 de
noviembre de 2021.
4. ↑ Scheepers, Cathrine. «The hunt for coronavirus variants: how the new
one was found and what we know so far». The Conversation (en inglés).
Consultado el 27 de noviembre de 2021.
5. ↑ «Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2». www.who.int.
Consultado el 8 de enero de 2022.
6. ↑ «Las vacunas son efectivas frente a Ómicron». Consultado el 1 de
febrero de 2022.
7. ↑ Parekh, Marcus (26 de noviembre de 2021). «Coronavirus latest news:
EU suspends all flights to southern Africa over omicron Covid variant
fears». The Telegraph (en inglés británico). ISSN 0307-1235. Consultado
el 27 de noviembre de 2021.
8. ↑ «Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of
Concern». www.who.int (en inglés). Consultado el 27 de noviembre de
2021.
9. ↑ «Lambda. Mu ... Omicron? Why the WHO skipped ‘Nu’ and ‘Xi’ to name
latest coronavirus variant». South China Morning Post (en inglés). 28 de
noviembre de 2021. Consultado el 6 de diciembre de 2021. «the Chinese
president's surname is the 296th most common family name in the
country. »
10. ↑ «What's Omicron? Here's what we know and don't know about the new
COVID variant that's roiling markets and air travel». Fortune (en inglés).
Consultado el 27 de noviembre de 2021.
11. ↑ Bank, RCSB Protein Data. «RCSB PDB - 6VYB: SARS-CoV-2 spike
ectodomain structure (open state)». www.rcsb.org (en inglés
estadounidense). Consultado el 29 de noviembre de 2021.
12. ↑ Hurst, Luke (25 de noviembre de 2021). «Omicron: The new COVID
variant with 32 mutations causing concern». euronews (en inglés).
Consultado el 28 de noviembre de 2021.
13. ↑ Saltar a:a b Cookson, Clive (26 de noviembre de 2021). «What we know
about Omicron variant that has sparked global alarm». Financial Times.
Consultado el 28 de noviembre de 2021.
14. ↑ Zimmer, Carl (26 de noviembre de 2021). «New Virus Variant Stokes
Concern but Vaccines Still Likely to Work». The New York Times (en
inglés estadounidense). ISSN 0362-4331. Consultado el 28 de noviembre
de 2021.
15. ↑ Zhang, Liping; Mann, Matthew; Syed, Zulfeqhar A.; Reynolds, Hayley
M.; Tian, E.; Samara, Nadine L.; Zeldin, Darryl C.; Tabak, Lawrence A. et
al. (23 de noviembre de 2021). «Furin cleavage of the SARS-CoV-2 spike
is modulated by O -glycosylation». Proceedings of the National Academy
of Sciences (en inglés) 118 (47): e2109905118. ISSN 0027-
8424. doi:10.1073/pnas.2109905118. Consultado el 28 de noviembre de
2021.
16. ↑ Public Health England. (21 de noviembre de 2021). «SARS-CoV-2
variants of concern and variants under investigation in England. technical
briefing 29» (PDF).
17. ↑ CNN, Christina Maxouris. «What we know about the Omicron
variant». CNN. Consultado el 27 de noviembre de 2021.
18. ↑ «Israel detecta un caso de la nueva variante de covid descubierta en
Sudáfrica». France 24. 26 de noviembre de 2021. Consultado el 26 de
noviembre de 2021.
19. ↑ «Site verification». www.europapress.es. Consultado el 26 de
noviembre de 2021.
20. ↑ Reuters (26 de noviembre de 2021). «Belgium detects first case of new
COVID-19 variant in Europe». Reuters (en inglés). Consultado el 26 de
noviembre de 2021.
21. ↑ Zimmer, Carl (26 de noviembre de 2021). «New Virus Variant Stokes
Concern but Vaccines Still Likely to Work». The New York Times (en
inglés estadounidense). ISSN 0362-4331. Consultado el 27 de noviembre
de 2021.
22. ↑ «Covid: New variant classed 'of concern' and named Omicron». BBC
News (en inglés británico). 27 de noviembre de 2021. Consultado el 27
de noviembre de 2021.
23. ↑ Saltar a:a b https://www.bmj.com/content/375/bmj.n3062
24. ↑ «HKUMed finds Omicron SARS-CoV-2 can infect faster and better than
Delta in human bronchus but with less severe infection in
lung». www.med.hku.hk (en inglés). Consultado el 16 de diciembre de
2021.
25. ↑ Cevik, Muge; Kuppalli, Krutika; Kindrachuk, Jason; Peiris, Malik (23 de
octubre de 2020). «Virology. transmission. and pathogenesis of SARS-
CoV-2». BMJ (en inglés) 371: m3862. ISSN 1756-
1833. PMID 33097561. doi:10.1136/bmj.m3862. Consultado el 16 de
diciembre de 2021.
26. ↑ Cele, Sandile; Jackson, Laurelle; Khan, Khadija; Khoury, David; Moyo-
Gwete, Thandeka; Tegally, Houriiyah; Scheepers, Cathrine; Amoako,
Daniel et al. (9 de diciembre de 2021). SARS-CoV-2 Omicron has
extensive but incomplete escape of Pfizer BNT162b2 elicited
neutralization and requires ACE2 for infection (en inglés).
pp. 2021.12.08.21267417. doi:10.1101/2021.12.08.21267417v1.
Consultado el 16 de diciembre de 2021.