Variante �micron del SARS-CoV-2

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Art�culo principal: Variantes de SARS-CoV-2

Variante �micron
B.1.1.529.1
Parte de las variantes del SARS-CoV-2
Map of countries with confirmed SARS-CoV-2 Omicron variant cases.svg
Casos acumulados de la variante �micron por territorio 10.000�99.999
1.000�9.999 100�999 10�99 1�9 0
Agente pat�geno
Pat�geno SARS-CoV-2
Tipo de pat�geno Virus
Enfermedad causada COVID-19
Datos hist�ricos
Inicio del contagio 26 de noviembre de 2021
Lugar de inicio Bandera de Sud�frica Sud�frica
Nivel del contagio Pandemia
Lugares afectados 149 territorios
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[editar datos en Wikidata]

La variante �micron 1? (tambi�n conocida por el identificador de linaje PANGO

B.1.1.529.1, el identificador de clado GISAID GR/484A y el identificador de clado
Nextstrain 21K)2? es una variante del SARS-CoV-2, causante de la enfermedad COVID-
19. El primer caso se detect� en Botsuana el 9 de noviembre de 20213? a partir de
una muestra recogida bajo los auspicios de la Red para la Vigilancia Gen�mica en
Sud�frica.4? El 26 de noviembre de 2021 la Organizaci�n Mundial de la Salud (OMS)
la design� como una variante preocupante.5?

La variante tiene un n�mero inusualmente grande de mutaciones, varias de las cuales

nuevas y algunas de ellas (concretamente treinta y dos) afectan a la prote�na de la
esp�cula utilizada en la mayor�a de las vacunas actuales. Este nivel de variaci�n
tiene efectos preocupantes respecto a la transmisibilidad, evasi�n del sistema
inmunol�gico y resistencia ante las vacunas contra la infecci�n asociada al SARS-
CoV-2. Por ello, la variante fue r�pidamente designada como �preocupante� y varios
pa�ses introdujeron restricciones de viaje para limitar o ralentizar su propagaci�n
internacional.

Sin embargo, el 31 de enero de 2022 se puso fin al bulo de esta variante no era
suficiente con dos vacunas cuando los cient�ficos espa�oles confirmaron que las
vacunas son efectivas al igual que otras variantes.6?

Por su contagiosidad y mutaciones, r�pidamente ha dado lugar a subvariantes.

�ndice

1 Clasificaci�n
1.1 Nomenclatura
1.2 Mutaciones
2 Historia
 3 Impacto cl�nico
3.1 S�ntomas
4 Estad�sticas
5 Medidas
6 V�ase tambi�n
7 Referencias
8 Enlaces externos

Clasificaci�n
Nomenclatura

El 26 de noviembre, el Grupo Asesor T�cnico de la OMS sobre la evoluci�n del Virus

SARS-CoV-2 declar� que el linaje PANGO B.1.1.529 era una variante preocupante y lo
design� con la letra griega �micron.7?8? La OMS omiti� �nu� y �xi�, las siguientes
letras en el alfabeto griego, para evitar confusiones con la palabra inglesa new y
evitar confusi�n y ofensa con el apellido chino Xi, que es el 296� apellido m�s
com�n en China y el apellido del l�der de dicho pa�s.9? La Organizaci�n Mundial de
la Salud reserva la designaci�n ��micron� para variantes preocupantes.10?

El proyecto GISAID le ha asignado el identificador de clado GR/484A y el proyecto

Nextstrain le ha asignado el identificador de clado 21K.2?
Mutaciones
Ilustraci�n de las ubicaciones de las mutaciones de �micron en la prote�na de pico.
Vista superior (izquierda) y vista lateral (derecha) que muestran sustituciones de
amino�cidos (amarillo), eliminaciones (rojo) e inserciones (verde). En esta
estructura trim�rica dos mon�meros (gris y azul claro) tienen sus dominios de uni�n
al receptor en la conformaci�n inferior mientras que uno (azul oscuro) est� en la
conformaci�n superior o abierta. Datos de mutaci�n de la OMS. Estructura de PDB :
6VYB.11?

La variante tiene una gran cantidad de mutaciones, algunas de las cuales son
preocupantes.12? Treinta y dos de estas mutaciones afectan a la prote�na de la
esp�cula. Dicha esp�cula es el principal objetivo antig�nico de los anticuerpos
generados por infecciones y de la mayor�a de las vacunas administradas hasta 2021.
Muchas de esas mutaciones no se hab�an observado en otras cepas.13?14? La variante
se caracteriza por 30 cambios de amino�cidos, tres peque�as supresiones y una
peque�a inserci�n en la prote�na de la esp�cula en comparaci�n con el virus
original, de los cuales 15 est�n ubicados en el dominio de uni�n al receptor
(residuos 319-541). Tambi�n lleva una serie de cambios y supresiones en otras
regiones gen�micas. Es de destacar que la variante tiene tres mutaciones en el
sitio de divisi�n de la furina.15? El sitio de escisi�n de la furina aumenta la
infectividad del SARS-CoV-2.16? Las mutaciones por regi�n gen�mica son las
siguientes:17?

Prote�na de la esp�cula: A67V. ?69-70. T95I. G142D. ?143-145. ?211. L212I.

ins214EPE. G339D. S371L. S373P. S375F. K417N. N440K. G446S. S477N. T478K. E484A.
Q493R. G496S. Q498R. N501Y. Y505H. T547K. D614G. H655Y. N679K. P681H. N764K. D796Y.
N856K. Q954H. N969K. L981F
ORF1ab:
nsp3: K38R. V1069I. ?1265. L1266I. A1892T
nsp4: T492I
nsp5: P132H
nsp6: ?105-107. A189V
nsp12: P323L
nsp14: I42V

Prote�na de la envoltura: T9I

Prote�na de membrana: D3G. Q19E. A63T
 Prote�na nucleoc�pside:P13L. ?31-33. R203K. G204R

Historia
Art�culo principal: Anexo:Cronolog�a de la variante �micron del SARS-CoV-2

Una persona positiva viaj� a Hong Kong proveniente de Sud�frica18?. Se identific�

un caso confirmado en Israel de un viajero que regresaba de Malaui.19? junto con
dos que regresaron de Sud�frica y uno de Madagascar. Se detect� otro caso en
B�lgica de una joven que viaj� a Egipto (donde aparentemente adquiri� la infecci�n)
e hizo escala en Turqu�a.20?21?

Varios investigadores afirman que la vacuna de Pfizer-BioNTech contra la COVID-19

protege contra la variante �micron.22?23?
Impacto cl�nico

Para diciembre del 2021, diferentes investigaciones han se�alado que la variante
posee una mayor capacidad de transmisi�n incluso en la poblaci�n previamente
infectada por COVID-19.24? Estos datos han sido extrapolados en base al patr�n
epidemiol�gico de infecci�n observado en Sud�frica durante el �ltimo trimestre del
2021. En cuanto al grado de severidad de la enfermedad. en base a los mismos datos
previamente descrito se hipotetiza que los pacientes presentan cuadros cl�nicos m�s
leves.25? En un estudio realizado por la Facultad de Medicina de la Universidad de
Hong Kong se encontr� que la variante �micron se reproduce con facilidad en los
bronquios pero pobremente en los pulmones.26? Si bien la capacidad de infecci�n es
menos eficiente en los pulmones, una carga viral m�s alta puede empeorar la
respuesta inmunitaria.27?

En relaci�n a la capacidad de la variante de escapar al efecto de las vacunas, un

peque�o estudio 28? mostr� una disminuci�n de hasta 41 veces en cuanto a la
formaci�n de anticuerpos neutralizantes en relaci�n a la vacuna Pfizer-BioNTech.
Para el 12 de diciembre a�n no se cuenta con mayor informaci�n en relaci�n al resto
de vacunas.

En Espa�a, en la semana del 6 al 12 de diciembre de 2021 se comprob� mediante

secuenciaci�n de muestras aleatoria del virus en contagiados que el 47.2 % de las
muestras correspond�an a la variante �micron.29? Las muestras de �micron en la
semana del 29 de noviembre al 5 de diciembre de 2021 fueron del 3.4 %. De esta
forma se sigue apuntando a las hip�tesis iniciales de la mayor capacidad de
propagaci�n de esta variante respecto a la delta.

El 3 de diciembre el subsecretario de prevenci�n y promoci�n de la salud de M�xico,

Hugo L�pez-Gatel confirm� que la variante �micron ya se encontraba en M�xico30?.
Para el 21 de diciembre se indic� que hab�a al menos 23 casos confirmados de la
variante en el territorio mexicano.31?
S�ntomas

No se han asociado s�ntomas inusuales con la variante y, al igual que con otras
variantes, algunos individuos que cursan la infecci�n son asintom�ticos.32? 33?

No presentan p�rdida de olfato ni de gusto, s�ntoma hasta ahora caracter�stico

entre los infectados por coronavirus.
Como principal caracter�stica los contagiados presentan secreci�n nasal y dolor
de cabeza
En Espa�a, los pacientes contagiados de COVID-19 con la variante �micron, son
episodios de sudores nocturnos, como brotes de sudoraci�n repentina, s�ntoma que no
se hab�a registrado hasta ahora.34?

Estad�sticas
Casos registrados al 17 de julio de 2022 (UTC).35? Datos del rastreador de
variantes.36?37?

Actualizado el 17 de julio de 2022

Medidas

Se han vetado los vuelos desde Sud�frica. Namibia. Lesoto. Esuatini. Zambia.
Zimbabue. Botsuana. Mozambique y Tanzania. Tambi�n se ir�n incluyendo todos los
pa�ses de �frica seg�n se vayan detectando un caso o m�s de esta variante. adem�s
de a su lista roja de destinos de viaje.
Adem�s exigen estricto esquema de vacunaci�n completo y PCR negativo de todos
los pa�ses que se hayan detectado casos de �micron (linaje B.1.1.529).
Jap�n ha prohibido el nuevo ingreso a todos los extranjeros a partir del 30 de
noviembre del 2021.94?
M�xico cancela conciertos de fin de a�o de Los �ngeles Azules y verbena
navide�a para evitar contagios.
Estados Unidos cancela miles de vuelos en las aerol�neas, se genera una gran
p�rdida econ�mica.

V�ase tambi�n

Variantes de SARS-CoV-2
SARS-CoV-2

Referencias

Plantilla:Cita En m�dico web

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Enlaces externos

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before; positive rate 24.3 %); 72 percent of them were found in Gauteng)
nicd.ac.za: GIS dashboard (statistical data)

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