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Variante Omicron SARS-CoV-2: un nuevo capítulo en la pandemia de

COVID-19

Publicado En línea
2 de diciembre de 2021
https://doi.org/10.1016/
S0140-6736(21)02758-6
El 25 de noviembre de 2021, aproximadamente 23 meses desde el primer caso El primer caso de omicron secuenciado se notificó en Botswana el 11 de
informado de COVID-19 y después de un estimado mundial de 260 millones de noviembre de 2021, y unos días después se notificó otro caso secuenciado en
casos y 5·2 millones de muertes,1 una nueva variante preocupante (VoC) del Hong Kong en un viajero de Sudáfrica.8 Siguieron varias secuencias de
SARS-CoV-2, omicron,2 Fue reportado. Omicron surgió en un mundo cansado Sudáfrica, después de la identificación inicial de que la nueva variante estaba

de COVID-19 en el que abundan la ira y la frustración con la pandemia en asociada con una falla en el objetivo del gen S en un ensayo de PCR

medio de impactos negativos generalizados en el bienestar social, mental y específico debido a una deleción 69– 70del, similar a la observada con la

económico. Aunque los VoC anteriores surgieron en un mundo en el que la variante alfa.9 El primer caso conocido de omicron en Sudáfrica fue un paciente

inmunidad natural de las infecciones por COVID-19 era común, este quinto diagnosticado con COVID-19 el 9 de noviembre de 2021, aunque es probable

VoC surgió en un momento en que la inmunidad de las vacunas está que hubiera casos no identificados en varios países del mundo antes de esa

aumentando en el mundo. fecha. En Sudáfrica, el número medio de 280 casos de COVID-19 por día en la

La aparición de los VoC alfa, beta y delta SARS-CoV-2 se asoció con nuevas semana anterior a la detección de omicron aumentó a 800 casos por día en la

oleadas de infecciones, a veces en todo el mundo.3 .Por ejemplo, la mayor semana siguiente, en parte atribuido a una mayor vigilancia. Los casos de

transmisibilidad del delta VoC se asoció, entre otros, con una mayor carga vi- COVID-19 están aumentando rápidamente en la provincia de Gauteng en

ral,4 mayor duración de la infecciosidad,5 y altas tasas de reinfección, debido a Sudáfrica; el tiempo de duplicación temprano en la cuarta ola es más alto que

su capacidad para escapar de la inmunidad natural, 6 lo que resultó en que el el de las tres olas anteriores (figura, apéndice).

delta VoC se convirtiera rápidamente en la variante dominante a nivel mundial. Las principales preocupaciones sobre omicron incluyen si es más10

La VoC delta continúa impulsando nuevas oleadas de infección y sigue siendo
la VoC dominante durante la cuarta ola en muchos países. Las
preocupaciones sobre la menor eficacia de la vacuna debido a las nuevas
variantes han cambiado nuestra comprensión del final del COVID-19,
Ver En línea para el apéndice,
desengañando al mundo de la noción de que la vacunación global es por sí
apéndice agregado el 6 de diciembre de 2021
misma adecuada para controlar la infección por SARS-CoV-2. De hecho, los
VoC han resaltado la importancia de la vacunación en combinación con las
medidas de prevención de salud pública existentes, como las mascarillas,
como vía hacia la endemicidad viral.
7
80 Primera ola Doblando tiempo*
Promedio móvil de 7 días de casos nacionales
infeccioso o grave que otros COV y si puede eludir la protección de la
vacuna. Aunque los datos clínicos e inmunológicos aún no están disponibles
para proporcionar evidencia definitiva, podemos extrapolar lo que se sabe
sobre las mutaciones de Omicron para proporcionar indicaciones
10
preliminares sobre la transmisibilidad, la gravedad y el escape inmunitario.
Omicron tiene algunas deleciones y más de 30 mutaciones, varias de las
cuales (p.ej., 69–70del, T95I, G142D/143–145del, K417N, T478K, N501Y,
N655Y, N679K y P681H) se superponen con las de alfa, beta, VoC gamma o
delta. Se sabe que estas deleciones y mutaciones conducen a una mayor
transmisibilidad, una mayor afinidad de unión viral y un mayor escape de
anticuerpos.11,12 Algunas de las otras mutaciones de omicron con efectos
conocidos confieren una mayor transmisibilidad y afectan la afinidad de
unión. Es importante destacar que se desconocen los efectos de la mayoría
de las mutaciones de Omicron restantes, lo que genera un alto nivel de
incertidumbre acerca de cómo la combinación completa de deleciones y
mutaciones afectará el comportamiento viral y la susceptibilidad a la
8
inmunidad natural y mediada por vacunas.

Segunda ola Cuarta ola (omicron)=1·2 días

70
tercera ola Tercera ola (delta)=1·5 días
60 Cuarta ola Segunda ola (beta)=1·7 días
50 Primera ola (D614G)=1·3 días
diarios por 100000 habitantes

40
30 11,12

20
10
0
Días

Figura: Casos de SARS-CoV-2 en la primera, segunda, tercera y cuarta oleada, provincia de Gauteng en Sudáfrica

* Tiempo de duplicación para los primeros 3 días después del umbral de onda de diez casos por 100 000 habitantes. Promedio móvil de 7 días

de casos por cada 100 000 habitantes hasta el 1 de diciembre de 2021. Los datos provienen del Departamento de Salud, Gobierno de

10
Sudáfrica.

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El impacto de Omicron en la transmisibilidad es motivo de preocupación. Si
las mutaciones de omicrón superpuestas mantienen sus efectos conocidos,
entonces se espera una mayor transmisibilidad, particularmente debido a las
mutaciones cerca del sitio de escisión de la furina. La evidencia epidemiológica
preliminar sugiere que los casos están aumentando en Sudáfrica y que las
pruebas de PCR con falla en el objetivo del gen S también están aumentando.
Aunque es probable que omicron sea altamente transmisible, aún no está claro
si tiene una mayor transmisibilidad que delta, aunque las indicaciones
preliminares sugieren que se está propagando rápidamente en un contexto de
transmisión continua de la variante delta y altos niveles de inmunidad natural a
la variante delta. . Si esta tendencia continúa, se prevé que omicron desplace a
delta como la variante dominante en Sudáfrica.
Estamos a la espera de saber cómo afectará este nuevo VoC a la
presentación clínica. En esta etapa, los datos anecdóticos disponibles de
médicos de primera línea en Sudáfrica sugieren que los pacientes con omicron
son personas más jóvenes con una presentación clínica similar a la de
variantes anteriores.13 Aunque hasta el momento no se han planteado
preocupaciones clínicas alarmantes, esta información anecdótica debe tratarse
con precaución dado que los casos graves de COVID-19 suelen presentarse
varias semanas después de los síntomas iniciales asociados con la
enfermedad leve.
El escape inmunológico es otra preocupación. En ausencia de datos
sobre la efectividad de la vacuna observacional y estudios de neutralización
de anticuerpos en sueros de vacunados, los datos preliminares del
programa nacional de pruebas de PCR podrían proporcionar algunas pistas.
Los datos sobre pruebas PCR positivas en personas con pruebas positivas
anteriores sugieren un aumento en los casos de reinfección en Sudáfrica.
Sin embargo, el aumento del uso de pruebas rápidas de antígenos y la captura
incompleta de resultados negativos han complicado la interpretación de las
tasas de positividad de las pruebas, que han aumentado aproximadamente
cuatro veces la tasa anterior en la última semana. A pesar de esta limitación, el
aumento de casos de reinfección está en consonancia con las mutaciones de
escape inmune presentes en omicron.
Aunque hay informes contradictorios sobre si las vacunas contra la COVID-19 han
conservado constantemente una alta eficacia para cada uno de los cuatro VoC que
preceden a omicron, los ensayos clínicos han informado una menor eficacia para algunas
vacunas en entornos de transmisión en los que la beta
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Comentario
variante es dominante. Las variantes anteriores han reducido la eficacia de la
vacuna; por ejemplo, la vacuna ChAdOx1 tuvo una eficacia del 70 % en la
prevención de infecciones clínicas para la variante D614G en el Reino Unido, pero
esta eficacia disminuyó al 10 % para la variante beta en Sudáfrica.14 Sin embargo, la
eficacia de la vacuna BNT162b2 en la prevención de infecciones clínicas se
mantuvo en las variantes D614G y beta.14 Dado que omicron tiene una mayor
cantidad de mutaciones que los VoC anteriores, el impacto potencial de omicron en
la eficacia clínica de las vacunas COVID-19 para infecciones leves no está claro.
Hasta ahora, la mayoría de las vacunas contra la COVID-19 han seguido siendo
eficaces para prevenir la COVID-19 grave, la hospitalización y la muerte, para todas
las variantes anteriores, porque esta eficacia podría depender más de las respuestas
inmunitarias de las células T que de los anticuerpos. Estudios observacionales de
Qatar (n=231 826)15 y Kaiser Permanente (n=3 436 957) informaron una eficacia de
la vacuna de más del 90 % en la prevención de ingresos hospitalarios durante la
transmisión de la variante delta, incluso hasta 6 meses después de la vacunación.
Los datos de observación del estado de Nueva York, EE. UU. (n = 8 834 604) dieciséis
indicaron una alta eficacia de la vacuna para prevenir enfermedades graves en per-
sonas mayores de 65 años, con diferentes niveles de protección conferidos por
diferentes vacunas: 95 % para BNT162b2, 97 % para mRNA-1273 y 86% para
Ad26.COV2.S17—con disminuciones mínimas en la protección 6 meses después de
la vacunación.
En términos de diagnóstico, la variante omicron es detectable en plataformas
de PCR ampliamente utilizadas en Sudáfrica. No hay razón para creer que los
protocolos de tratamiento y la terapia actuales de COVID-19 ya no serían
efectivos, con la posible excepción de los anticuerpos monoclonales, para los
cuales aún no se dispone de datos sobre la susceptibilidad de la variante omicron.
Es importante destacar que las medidas de prevención de salud pública
existentes (uso de máscaras, distanciamiento físico, evitar espacios cerrados,
preferencia al aire libre e higiene de manos) que han seguido siendo efectivas
contra variantes anteriores deberían ser igual de efectivas contra la variante omi-
cron.
Las extrapolaciones basadas en mutaciones conocidas y observaciones
preliminares, que deben interpretarse con cautela, indican que omicron podría
propagarse más rápido y escapar de los anticuerpos más fácilmente que las
variantes anteriores, lo que aumentaría los casos de reinfección y los casos de
infecciones leves en personas vacunadas. Sobre la base de los datos de VoC
anteriores, es probable que las personas vacunadas tengan menor riesgo de
enfermedad grave por infección de Omicron.
2127
 Comentario
Se espera que un enfoque de prevención combinado de vacunación y
medidas de salud pública siga siendo una estrategia eficaz.
No declaramos intereses contrapuestos.
* Salim S Abdool Karim, Quarraisha Abdool Karim
salim.abdoolkarim@caprisa.org
Centro para el Programa de Investigación del SIDA en Sudáfrica, Durban 4001,
Sudáfrica; y Escuela Mailman de Salud Pública, Universidad de Columbia, Nueva
York, NY 10032, EE. UU.
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5ef3652ab722df11fcb2ba5d/t/60a3d54f8b42b505d0d0de 4f/1621349714141/
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