SARS-CoV-2

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Para la enfermedad provocada por este virus, véase COVID-19.

Symbol question.svg SARS-CoV-2
Novel Coronavirus SARS-CoV-2 (49640655213).jpg
Coronavirus. SARS-CoV-2.png
Imagen generada por ordenador de un virión del SARS-CoV-2.
Envoltura vírica, compuesta por lípidos
Proteína S o espícula viral
Proteína E o de la envoltura
Proteína M o de la membrana
Glucosa
Taxonomía
Dominio: Riboviria
Reino: Orthornavirae
Filo: Pisuviricota
Clase: Pisoniviricetes
Orden: Nidovirales
Suborden: Cornidovirineae
Familia: Coronaviridae
Subfamilia: Orthocoronavirinae
Género: Betacoronavirus
Subgénero: Sarbecovirus
Especie: Coronavirus relacionado con el síndrome respiratorio agudo grave
Subespecie: Coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo grave1
Clasificación de Baltimore
Grupo: IV (Virus ARN monocatenario positivo)
Sinonimia
2019-nCoV (2019 Novel Coronavirus)
[editar datos en Wikidata]
El coronavirus de tipo 2 causante del síndrome respiratorio agudo severo,2
abreviado SARS-CoV-2 (del inglés severe acute respiratory syndrome coronavirus 2)3
o SRAS-CoV-2,2 es un tipo de coronavirus causante de la enfermedad por coronavirus
de 2019,456 cuya expansión mundial provocó la pandemia de COVID-19. Inicialmente
fue llamado 2019-nCoV (en inglés: 2019-novel coronavirus, ‘nuevo coronavirus de
2019’) y también, ocasionalmente, HCoV-19 (en inglés: human coronavirus 2019).78 Se
descubrió y se aisló por primera vez en Wuhan, China. Tiene un origen zoonótico, es
decir, que se transmitió de un huésped animal a uno humano.9

Es un clado dentro de la familia de los Coronaviridae, género Betacoronavirus,

subgénero Sarbecovirus, especie virus SARS10(virus relacionado con el síndrome
respiratorio agudo severo o grave).11

El genoma del virus está formado por una sola cadena de ARN, y se clasifica como un
virus ARN monocatenario positivo. Su secuencia genética se ha aislado a partir de
una muestra obtenida de un paciente afectado por neumonía en la ciudad china de
Wuhan, aunque la falta de experimento de control doble ciego en la técnica de
secuenciación publicada puede poner en cuestionamiento la validez científica de la
técnica.121314151617 Se detectó por primera vez el 12 de noviembre de 2019. Puede
producir el contagio de una persona a otra mediante las gotas de saliva expulsadas
a través de la tos y el estornudo o al espirar (véase gotitas de Flügge).1819 Puede
provocar enfermedad respiratoria aguda y neumonía grave en los seres humanos.20
Aunque previamente no había ningún tratamiento específico aprobado oficialmente, ya
se habían desarrollado algunos antivirales existentes, así como el tratamiento con
plasma convaleciente y la dexametasona, que parecen tener una mayor eficacia en el
manejo de los síntomas o que parecen acortar el periodo de recuperación en
poblaciones especiales.2122 En diciembre de 2020 comenzó una campaña de vacunación
con las primeras vacunas experimentales autorizadas en emergencia, que se prolongó
y mantuvo durante 2021 y 2022.[cita requerida] Fue Pfizer - BioNTech, con la vacuna
Comirnaty, los laboratorios pioneros en patentar una vacuna23 y posteriormente, los
laboratorios Moderna y AstraZeneca se unieron a esta carrera por la vacuna.24

Índice
1 Historia
2 Virología
2.1 Filogenia
2.1.1 Identidad genética
2.1.2 Supercontagiadores y efecto fundador
2.2 Estructura
2.3 Fuente del virus
2.4 Mecanismo de transmisión
3 Patogenia en el ser humano
3.1 Ciclo infectivo
3.2 Periodo de incubación
3.3 Clínica
4 Inmunidad
5 Predisposición genética
6 Contención del virus
7 Medidas preventivas
8 Vacunas y antivirales
8.1 Investigación
9 Variantes
10 Véase también
11 Referencias
12 Enlaces externos
Historia
Artículo principal: Pandemia de COVID-19
Existen diferentes teorías acerca de su origen, la comunidad científica
internacional aún no ha podido ponerse de acuerdo; una de ellas sugiere un origen
zoonótico, presumiendo ese origen, el 17 de noviembre de 2019, se pudo haber
efectuado el primer contacto entre el SARS-CoV-2 y un individuo humano por
infección zoonótica. La fecha ha sido estimada asumiendo un período máximo de
incubación de 24 días. Esto supone que el virus se transmitió de manera silente
hasta la detección oficial del primer caso confirmado.25

El 30 de diciembre de 2019, las autoridades sanitarias de la ciudad de Wuhan

informaron sobre la aparición de veintisiete personas diagnosticadas de síndrome
respiratorio agudo grave de origen desconocido; la mayor parte de los casos estaban
relacionados con el Mercado Mayorista de Mariscos del Sur de China ubicado en la
ciudad. El 7 de enero de 2020 las autoridades chinas declararon que habían
descubierto que la causa de la enfermedad era un nuevo virus de la familia de los
coronavirus que fue nombrado provisionalmente como 2019-nCoV (coronavirus de
Wuhan).

El 10 de enero se anunció que se había aislado y se publicaría el primer genoma

secuenciado del nuevo coronavirus.1726

El 13 de enero se detectó un caso en Tailandia confirmado por pruebas de

laboratorio. El 14 de enero se detectó un caso en Japón de una persona que había
viajado recientemente a Wuhan. El 21 de enero se informó de la existencia de casos
en Estados Unidos también en personas que habían viajado a Wuhan.27

Al 29 de enero de 2020 se habían descrito casos en: Bangkok (Tailandia), Tokio

(Japón), Seúl (Corea del Sur), Pekín28 (China), Shanghái28 (China), Guangdong
(China), Hong Kong29 (China), Macao29 (China), Estados Unidos,30 Reino Unido,
Vietnam,31 Singapur,32 Francia y Alemania. Hasta ese día había provocado 169
muertes, principalmente en Wuhan y alrededores.

Mapa mundial de casos confirmados de COVID-19.

Más de un millón de casos acumulados
100 000-999 999 casos acumulados
10 000-99 999 casos acumulados
1000-9999 casos acumulados
100-999 casos acumulados
1–99 casos acumulados
No se han reportado casos
El 30 de enero de 2020, el Comité de Emergencias del Reglamento Sanitario
Internacional (2005) de la Organización Mundial de la Salud (OMS) declaró la
situación como emergencia de salud internacional por el brote de SARS-CoV-2.33
Hasta ese día se habían producido 7711 casos confirmados en la República Popular
China, con 170 víctimas mortales. En el resto del mundo se habían confirmado 83
casos en 18 países, casi todos los pacientes procedían de China. Solamente 7 no
tenían antecedentes de haber viajado recientemente a este país.[cita requerida]

El 13 de febrero se habían notificado 46 997 casos a nivel mundial, de los que 46

550 correspondían a la China continental y 447 en otros países. El número de
fallecidos ascendía a 1339.34

El 11 de marzo, la Organización Mundial de la Salud caracterizó como pandemia a la

infección por SARS-CoV-2 y la enfermedad denominada COVID-19,3536 mientras los
casos confirmados a nivel mundial superaban los 118 000 en 114 países y el número
de fallecidos ascendía a 4291.

Al 7 de abril, el GenBank contaba ya con más de quinientas secuencias genómicas del

virus a partir de muestras colectadas en diferentes partes del mundo, como parte de
un impulso colaborativo para facilitar su investigación y encontrar soluciones
contra la infección.37

Virología
Video animado del SARS-CoV-2.

Imagen obtenida con microscopio electrónico de barrido que muestra el virus SARS-
CoV-2 (resaltado en amarillo) emergiendo de la superficie de las células cultivadas
en el laboratorio.
En la taxonomía de los virus, los coronavirus se corresponden con la subfamilia
Orthocoronavirinae, que está incluida dentro de la familia Coronaviridae. Esta
subfamilia se compone de cuatro géneros, según su estructura genética:
Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus y Deltacoronavirus. El SARS-
CoV-2 se clasifica dentro del género Betacoronavirus.38

Los coronavirus forman una gran familia de virus. Tanto los alfacoronavirus como
los betacoronavirus provocan distintas enfermedades en diferentes especies de
mamíferos: infecciones respiratorias en humanos y procesos de gastroenteritis en
algunos animales.39 Existen CoVs que circulan globalmente en la población humana, y
en raras ocasiones, los coronavirus procedentes de otros mamíferos pueden mutar e
infectar al ser humano para después propagarse de una persona a otra, causando
desde un simple resfriado común hasta enfermedades más graves como el síndrome
respiratorio agudo grave (SARS) que apareció por primera vez en noviembre de 2002
en la provincia de Cantón (China) y el síndrome respiratorio de Oriente Medio
(MERS) que fue identificado por primera vez en el año 2012 en Arabia Saudita. Solo
se habían descubierto seis CoVs relacionados con enfermedades en humanos.40 El
coronavirus de Wuhan (SARS-CoV-2) sería el séptimo:

HCoV-229E. Se descubrió en 1966. Provoca en humanos una enfermedad respiratoria

similar a una gripe.
HCoV-0C43. Se descubrió en 1967. También provoca en humanos una enfermedad
respiratoria similar a una gripe.
SARS-CoV. Originó la epidemia del síndrome respiratorio agudo grave. Se descubrió
en noviembre de 2002, en la provincia de Cantón, China.
HCoV-NL63. Se identificó en los Países Bajos en 2003, en un niño con bronquiolitis.
HCoV-HKU1. Se descubrió en 2005 en dos pacientes de la ciudad china de Hong-Kong.
MERS-CoV. Provoca el síndrome respiratorio de Oriente Medio, enfermedad infecciosa
que se identificó por primera vez en 2012 en Arabia Saudita.
Filogenia

Propagación de las distintas cepas filogenéticas de SARS-CoV-2 por el mundo durante

la pandemia del COVID-19. Imagen adaptada de (41).
La secuenciación de genomas de SARS-CoV-2 en personas infectadas por todo el mundo
ha permitido el desarrollo de un árbol filogenético de sus distintas cepas. La
comparación de más de 4700 genomas virales disponibles en repositorios públicos
como GISAID o Nextstrain, permitió la caracterización viral basada es sus
mutaciones diferenciales.

Identidad genética
Los virus analizados por todo el globo presentaban una alta identidad de
secuencias, con un 99.98 % de similitud.25 Se compararon con los coronavirus
precursores más cercanos en otras especies como RaTG13 de murciélago (similitud del
98 %, 1100 pb diferentes), o en pangolín (similitud 92 %, 1600 pb diferentes).

Tras las primeras infecciones el virus se dividió en dos macro-haplogrupos, el A

(afectación internacional) y el B (afectación principalmente Asiática). Aunque
ambas cepas aparecieron prácticamente a la vez, se ha demostrado que lo más
probable es que la cepa original sea la A. Esto se explica porque la cepa B1
tendría que haber existido dos meses antes que la A, lo que es improbable, ya que
esta no se detectó hasta el 19 de enero de 2020.25

Cada haplogrupo y los sub-haplogrupos correspondientes poseen mutaciones puntuales

en posiciones características que los diferencian del resto. El virus cambia a un
ritmo aproximado de 1-2 mutaciones por mes, y cuando acumula más de dos mutaciones
no existentes en la cepa original, las cepas pasan a considerarse como novedosas.
De esta manera, el haplogrupo B, por ejemplo, tiene mutaciones en los aminoácidos
[C8782T, C18060T, T28144C] que lo diferencian del A,25 y así para todos los
distintos sub-haplogrupos.

Se ha especulado sobre ciertas mutaciones como la transversión A23403T, que provoca

el cambio de un aminoácido de aspártico (Asp, D) a una glicina (Gly, G) en la
posición 614 de la proteína Spike viral.42 Parece que esta mutación le aporta una
ventaja de transmisibilidad, lo que explicaría su rápida propagación por Europa a
principio de febrero de 2020 y la selección natural de sub-haplogrupos más
virulentos sobre otros. Esta mutación parece afectar a la habilidad de transmisión
del virus al alterar la interacción entre los dominios de la proteína Spike. Esto
puede suponer un problema para el desarrollo de vacunas por los posibles cambios en
la antigenicidad de la misma.

Supercontagiadores y efecto fundador

El patrón de propagación de SARS-CoV-2 parece estar basado en la transmisión por
supercontagiadores.[cita requerida] Estos son individuos con una capacidad superior
de transmitir el virus, los cuales suponen una ventaja para el mismo. Cuando uno de
estos individuos llega a una zona nueva comienza a transmitir el virus rápidamente
con un patrón de propagación característico.

Los focos por supercontagiadores alcanzan incidencias altas en la población

afectada, aparecen en un período breve de tiempo (normalmente días), y son
específicos de cada región infectada. Como los aparecidos en Europa (A2a2), Estados
Unidos (B1a1), Reino Unido - Australia (A2a4), o en Asia (B).25

En los focos por supercontagiadores existe una variedad alélica escasa, puesto que
todos los individuos se contagian desde una única cepa de virus. Esto se conoce
como efecto fundador, en el que ese virus en concreto sirve como único origen para
la formación de nuevos sub-haplogrupos. Por ejemplo, el haplotipo A2a2a que se
encuentra únicamente en Islandia.25

Así pues, estos factores contribuyeron a la rápida propagación del virus y al

establecimiento de la pandemia del COVID-19.

Estructura

Escultura coronavirus ubicada en el Instituto de Investigaciones Biomédicas de la

UNAM, México.
El tamaño de los viriones de SARS-CoV-2 es de aproximadamente 50 a 200 nm de
diámetro, y su genoma es de ARN monocatenario de sentido positivo.43 La secuencia
del betacoronavirus de Wuhan muestra semejanzas con los betacoronavirus encontrados
en murciélagos, pero son genéticamente distintos de otros coronavirus como el SARS-
CoV y el MERS-CoV.1744

Estructura de un virión del coronavirus.

Su secuencia de ARN es de aproximadamente treinta mil nucleótidos de longitud.
Consta de cuatro genes para las proteínas estructurales características de los
coronavirus que se designan con las letras S (homotrímero de glicoproteína cuyo
ensanchamiento distal de sus pliegues forma las puntas de la superficie), E
(pequeña proteína de la envoltura), M (proteína de la matriz que une la envoltura
con el núcleo vírico) y N (fosfoproteína de la nucleocápside), además de los ORFs
que codifican proteínas no estructurales incluyendo las enzimas que aparecen
durante su ciclo reproductivo intrahospedero.142645

Fuente del virus

Se cree que la fuente del virus es animal. Es probable que el brote se haya
originado por contacto directo con animales en el mercado de la ciudad de Wuhan.39
Una vez que el virus se encuentra en una persona puede transmitirse a otra.3946
Aunque no se ha logrado averiguar el reservorio específico, se han propuesto
diversas posibilidades, entre ellas murciélagos, serpientes o pangolines.47 Por
ejemplo, el 22 de enero de 2020, el Journal of Medical Virology publicó un informe
con el análisis genómico del virus, que refleja que las serpientes de la zona de
Wuhan, infectadas con el virus por murciélagos, son el reservorio más probable del
virus; sin embargo, se requieren más investigaciones para dar por segura esta
posibilidad.48

El 26 de enero, se inició una investigación para estudiar la posibilidad de que la

fuente sea una sopa de murciélago que se consume habitualmente en la zona, ya que
estos animales podrían actuar como reservorio del virus. Un informe prematuro sobre
un estudio de investigadores chinos, postulaba a los pangolines salvajes como
posible intermediario del SARS-CoV-2, cuya captura y venta es ilegal en China,
aunque se trafica con ellos de forma clandestina, pero los resultados finales
concluyeron que los metagenomas del virus encontrado en estos y los del ser humano
eran similares solo en un 90 por ciento y no tenía el motivo RRAR, una inserción
peptídica única en el virus SARS-CoV-2 humano posiblemente involucrado en la
escisión proteolítica de la spike y el rango de hospedadores y la transmisibilidad,
lo que sugiere que el virus SARS-CoV-2 humano no provino directamente de los
pangolines.495051

Mecanismo de transmisión
La transmisión del virus entre humanos es posible a través de las secreciones
respiratorias de las personas infectadas, sobre todo mediante la expulsión, a
través de la tos o el estornudo, de pequeñas gotas y aerosoles que pueden cruzar el
aire,39525354 también mediante contacto directo con estas secreciones o por objetos
contaminados por las mismas o fómites.55

Patogenia en el ser humano

Artículo principal: COVID-19
Ciclo infectivo
El ciclo infectivo del virus SARS-CoV-2 comienza con la interacción entre la
proteína "Spike1" (S1) del patógeno con la proteína de la membrana celular ACE2 o
enzima convertidora de angiotensina 2.56Antes de continuar cabe destacar que esta
proteína también es la puerta de entrada para el virus SARS-CoV, aunque su afinidad
por esta enzima es menor que la del SARS-CoV-2.57

Posteriormente, la proteasa TMPRSS2 realiza el corte de la proteína S1, lo cual

desencadena la fusión del virus con la membrana celular o su endocitosis. Una vez
dentro, el virus es capaz de secretar su material genético o ARN en el interior de
la célula. La propia maquinaria de la célula permitirá la traducción del genoma
viral utilizando los ribosomas. La célula sintetizará proteínas virales y la
nucleocápside del virus, para poder formar y ensamblar nuevos virus. Estos virus
podrán salir de la célula mediante exocitosis e infectar a un mayor número de
células.58

Periodo de incubación

Ciclo de coronavirus SARS-CoV-2.

El período de incubación, es decir el tiempo que transcurre desde que una persona
se infecta por el virus hasta que presenta síntomas, oscila en general entre los 4
y los 7 días, en el 95 % de las ocasiones es menor a 12.5 días. Los límites
extremos se han establecido entre 2 y 14 días después del contagio, aunque se han
reportado casos inusuales de hasta 24 días.2039

Clínica

Síntomas de la enfermedad COVID-19 provocada por el SARS-CoV-2.

Los síntomas iniciales de la infección pueden consistir en fiebre, tos, estornudos,
dolor de garganta y manifestaciones generales como dolor articular, por lo que el
cuadro sería similar al de la gripe. En algunas ocasiones se producen
complicaciones como neumonía59 y dificultad respiratoria que puede conducir a la
muerte. A veces la única manifestación de la infección es el delirium (alteración
aguda/fluctuante de la conciencia con fallos de la atención, la comprensión y el
ciclo sueño-vigilia),60 que si es grave puede indicar riesgo de muerte en pacientes
críticamente enfermos.61 Son más propensos a presentar complicaciones graves los
varones de más de 60 años, sobre todo los que presentan enfermedades previas.20 La
fiebre no aparece en todos los pacientes; en ocasiones no existe fiebre en
pacientes muy jóvenes, ancianos, personas con la respuesta inmune disminuida o
personas que toman ciertos medicamentos.62 En los pacientes con COVID-19, la
circunferencia del cuello se ha objetivado como un factor predictivo de necesidad
de ventilación mecánica invasiva.63

Inmunidad
Componentes de la respuesta del Sistema de inmunidad adquirida frente al SARS-CoV-
2.

Respuesta inmune frente al SARS-CoV-2.

La respuesta inmunitaria natural de los seres humanos al virus SARS-CoV-2 se
produce como una combinación de la inmunidad mediada por células y la producción de
anticuerpos,64 igual que con casi todas las otras infecciones.65 La presencia de
anticuerpos neutralizantes en la sangre se considera una prueba de inmunidad contra
la infección, pero el nivel de anticuerpos neutralizantes disminuye con el tiempo,
llegando a desaparecer tras tres meses en el 1 % de los pacientes y tras seis meses
en el 12 %.66 Sin embargo, la ausencia de anticuerpos en la sangre no significa que
el sistema inmunitario no pueda producir nuevos anticuerpos rápidamente en caso de
reexposición al SARS-CoV-2. Las células B de memoria específicas para las proteínas
de la nucleocápside y el pico del SARS-CoV-2 duran al menos 6 meses después de la
aparición de los síntomas.

Dado que el SARS-CoV-2 ha estado en la población humana solo desde diciembre de

2019, al principio de la pandemia se desconocía si la inmunidad era duradera en las
personas que se recuperan de la enfermedad. Se reportaron casos de reinfección en
pacientes que ya habían pasado la enfermedad y se temía que el SARS-CoV-2 se
comportase como algunos otros coronavirus, que son capaces de reinfectar después de
aproximadamente un año.67

En un estudio de enero de 2021 se encontró que la mayoría de los pacientes

infectados por el virus SARS-CoV-2 quedan inmunizados durante al menos cinco meses,
teniendo una probabilidad mucho más baja (el 83 %) de infectarse de nuevo que
aquellos que no habían estado expuestos previamente al virus. Además, en caso de
reinfección los previamente infectados solían no presentar síntomas (78 % de los
casos) mientras que la ausencia de síntomas solo se dio en un 34 % de los no
infectados previamente.6869 En un estudio de marzo de 2021 se observó que solo un
0,65 % de los pacientes infectados por SARS-CoV-2 volvieron a dar positivo en PCR
al menos tres meses más tarde y que ninguno se infectó una tercera vez. Se estima
que haber sido infectado reduce, de media, un 80 % la probabilidad de infectarse
una segunda vez y que la protección dura al menos seis meses.7071 En otro estudio
publicado en mayo de 2021, se concluyó que la inmunidad natural contra el SARS-CoV-
2 dura años, probablemente toda la vida, incluso en personas que tuvieron síntomas
leves de covid o no tuvieron cuando fueron infectados.727374 Ello se debe a la
acción tanto de las células B como de las células plasmáticas de médula ósea de
larga vida.

En total, se estima que haber contraído el virus proporciona una inmunización

natural contra los síntomas de COVID-19 del 94 %, la cual es comparable a la de las
mejores vacunas. No obstante, al igual que las vacunas, haber pasado el virus no
garantiza que una persona no pueda volver a contraerlo y a contagiarlo, por lo cual
las autoridades sanitarias recomiendan que todos los previamente infectados sigan
aplicando los métodos de prevención habituales.75

Sistema inmune humoral humana frente a la infección por SARS-CoV-2.

La inmunidad innata frente al SARS-CoV-2 se utilizan principalmente por macrófagos
y Células NK,en la inmunidad celular se utiliza por células dendriticas,linfocitos
T CD4+ y linfocito T CD8+, y también en la inmunidad humoral la primera línea de
defensa se utiliza la IgM y después la IgG, las citocinas implicadas en la
inmunidad es el balance entre proinflamatorio y antiinflamatorio (IL-1β, IL-1RA,
IL-2RA, IL-6, IL-7, IL-8, IL-9, IL-10, FGF básico, G-CSF, GM-CSF, HGF, Interferón
gamma, IP-10, MCP-1, MIP-1a, MIP-1b, PDGF, TNF-α, VEGF y TGF-beta), la duración es
alrededor de 2 semanas.76777478

Predisposición genética
Recientes estudios indican que puede existir una predisposición genética a ser
infectados por el virus SARS-CoV-2. Concretamente, variantes genéticas en el gen de
ACE2 en el cromosoma X han sido identificadas como posibles protectores de la
infección. Estos polimorfismos darían lugar a niveles reducidos de la expresión de
ACE2, reduciendo a su vez los puntos de entrada del virus en la célula. Se ha
demostrado que estas variantes pueden suponer hasta un 37 % en la reducción de
expresión de la proteína, evitando a su vez un gran número de infectados y
muertes.79

Por otra parte, se han identificado polimorfismos genéticos en genes como los que
codifican para IFNAR2, CXCR6 o el complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) estar
relacionados con la infección y síntomas de los pacientes de la enfermedad COVID-
19. Estos genes están relacionados con el sistema inmune, lo cual nos podría dar
una idea de la importancia de los mismos.8079Otros genes como el del transportador
de solutos SLC6A20 han demostrado no solo una relación con el gen ACE2 (importante
para la entrada del virus en las células), sino que también una estrecha
concordancia con los peores síntomas provocados por el SARS-CoV-2.81