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Biomódica 2023;43:121-30
doi: hßps://doi.org/10.7705/biomedica.6695
influir en el trabajo presentado en este artículo.
Recibido: 12/08/2022
Aceptado: 0@02/2023
Publicado: 04/03/2023
Cita:
Nav as MC, Ceron JD, Aguilar-Jirrlónez W, Rugebs
MT, Díaz FJ. Informe de un brote de SA RS-CoV-2
inłectio n by airborne transmissio n: Ep idemio log ic and
mo bcular evide nœ. Biomédica. 2023;43:121-30.
https://doi.orp10.7705/biomedica.6695
Autor de la respuesta:
Francisco J. Díaz, Calle 70 N'52-21, Unive rsidad de
Antioquia, Mede llin, Colo mbia
Número de teléfono: (57) (604) 219 6484: fax: (57)
(604) 219 6482
francisco.d iaz@udea.edu.co
Contribución del autor:
Maria Cristina Nav as: Análisis formal, metodología,
conceptualización e investigación
Juan D. Cerón: Investigación, software y
visuales
Wbeimar Aguilar-Jimórez: Análisis formal,
investigación y metodología
Maria T. Ruge les: Conœ ptualización y
administración de proyectos
Francisco J. D iaz: Análisis formal. investigación y
supervisión
Todos los autores participaron en la redacción y
revisión del manuscrito.
Financiación:
Este estudio fue financiado por la Unive rsidad de
Antioquia (becas CO DI 2020-34194 y "soste nibilid
ad").
Conflictos de intereses:
Los autores declaran que no tienen intereses
económicos ni relaciones personales que pudieran
121
puestos de vacunaciôn de la ciudad de Medellín.
Artículo original Objetivo. Describir la epidemiología, virología y caracterización molecular de un brote de
COVID-19 en un punto de vacunación œrrado durante la tercera ola de SARS- GoV-2 en
Informe de brote de Colombia.
infección por SARS- Material and methods. Se realizaron pruebas diagnósticas, entrevistas, análisis de
muestras, aislamiento viral y secuenciación genómica. Con esta última, se hizo la
CoV-2 por transmisión caracterización molecular y se identificó el linaje.
Results. SÎete trabajadores fueron positivos para SARS- CoV-2, y de éstos, tres muestras
aérea: Pruebas fueron secuenciadas, más una muestra adicional perteneciente a la madre del presunto
epidemiológicas y caso índiœ. Todas las muestras fueron identificadas con el linaje B.1.625, con un măximo
de dos nucleôtidos de diferencia entre ellas.
moleculares Conclusions. Se identificó la variante B.1.625 como la causante del brote de GOVID-19, y
tambÎén un compañero de trabajo fue identificado como el caso índiœ. De forma
Maria-Cristina Navas1 , Juan D. CeróJ,
imprevista, asistir a una jornada de vacunaciôn se convirtió en un factor de riesgo para
Wbeimar Aguilar-Jiménez2 , Maria T.
adquirir la infección.
Rugeles*, Francisco J. Díaz2
1 Grupo Gastrohepatología, Facultad de Palabras clave: SARS- GoV-2; COVID-19 ; brotes de enfermedades ; vacunación; Golombia.
Medicina, Unîversidad de Antioquia, Medellín.
Colombia "Grupo Inmunovirología. Facultad En Colombia, el primer caso de enfermedad infecciosa por coronavirus
de Medicina, Unversidad de Antioquia, 19 (COVID-19) se detectó y confirmó en marzo de 2020 en una persona que
Medellín, Colombia viajaba desde Italia. Desde entonces, el país ha experimentado varias
Introducción: Se ha demostrado que la oleadas de infecciones por COVID-19. Desde el inicio de la pandemia, el
transmisión del SARS-CoV-2 se Ministerio de Salud ha notificado más de cinco millones de casos y 129.487
produce principalmente por vía aérea, y casos mortales.
que el riesgo de infección es mayor en de Salud y Protección Social a finales de 2021 (1,2). La tercera ola que se
los balnearios cerrados. presentó de abril a julio de 2021, fue la más severa en Colombia, con la mayor
Objetivo: Describir la epidemiología,
virología y caracterización molecular de
incidencia y muertes presentadas hasta la fecha (3).
un brote de COVID-19 en un punto de
vacunación cerrado durante la tercera
El análisis de la vigilancia genómica durante la tercera oleada demostró
ola de SARS-CoV-2 en Colombia. que la variante de interés o1 (VOI) mu
Material y métodos: Se realizaron pruebas
diagnósticas, entrevistas, toma de
muestras, cultivos œII y secuenciación viral,
esta última de caracterización molecular e
identificación de linaje.
Resultados: Siete trabajadores
resultaron positivos para el SARS-
CoV-2; entre ellos, se analizaron 3
muestras, más una muestra adicional
perteneciente a la madre del presunto
caso índice ; todas las muestras se
identificaron con el linaje B.1.625, con
un máximo de 2 nucleótidos de
diferencia entre ellas.
Conclusiones: Se identificó la variante B
1 625 como causa del brote de COVID-
19, y también se identificó a un
compañero de trabajo como caso
índice. Inesperadamente, la asistencia
a una jornada de vacunación se
convirtió en un factor de riesgo para
adquirir la infección.
Palabras clave: SARS-CoV-2; COVID-19;
brotes de enfermedad; vacunación;
Golombia.
Reporte of a brote of infection by SARS-
CoV-2 by airborne transmission:
epidemiological and molecular
evidence
Introducción. Se ha demostrado que la
transmisión de SARS- GoV-2 se
produce principalmente por vía aérea y
el riesgo de infección es mayor en
espacios cerrados con alta
conœntración de personas ; este último
factor se presentô en algunos de los
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Tabla 1. Datos epide mio Io gicos, clínicos y labo ratorios de los co mpañeros que asistieron a la aplicació n de la indo
o vacunació n
NC_045512.2) utilizando
el algoritmo BWA-MEM 14 y el BBMap (11) para generar la secuencia
consenso. El linaje viral se clasificó mediante PANGOLIN (Phylogenetic
Assignment of Named Global Outbreak LlNeages) (12).
124
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Resultados
126
Biomôdica 2023;43:121-30 Brote de SRAS-CoV-2 por transmisión aérea
20
10
vacunación
Acceda
a
I¥agaosis
Compañeros
de trabajo
CowwkwP' ¡! #3
Figura 2. Línea de tiempo del contagio del brote de la cita de vacunación en interiores en Medellfn, Colombia.
La línea de tiempo describe los eventos más importantes asociados con el brote viral, los datos fueron
colbcados a través de inteivlews como se describe en la sección de materiales y métodos.
125
Nav as MC. Cerôn JD, Ag uilar-JirrÓ nez W, et al. Biomédica 2023;43:121-30
Zeta
B.1
• 92.ú
Kappa
Delta
País
Lambda
Aruba Chile
Omicron
Colombia
Alfa
Costa Rica
Gamma
Eta México
Panamá
Iota España
Bela Suiza
Reino Unido
Estados Unidos
B.1.bZS Ver'ezuela
Figura 3. Árbol filogenético de las secuencias obtenidas en este estudio y otras secuencias de referencia. Las
diferentes variantes, linajes y casos se colorearon según la clave del panel izquierdo. Las cuatro secuencias
asociadas al brote se indican en verde. La secuencia B.1 corresponde al primer aislamiento de SARS-CoV-2 en
Colombia (8). El tamaño de los círculos grises indica el sire ngîh del soporte de la rama según el panel superior
derecho. Los recuadros en el exterior del círculo indican el país de origen según los colores del panel inferior
derecho. El análisis se pe rłormó mediante el método de máxima like lihood en el servic io IQ-Tree.
Debate
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Este resultado indicó que la variante B.1.625, causante del brote descrito
en el presente estudio, era minoritaria pero seguía siendo una variante
circulante durante la tercera ola e pidémica en Antioquia. Curiosamente, la
variante B.1.625 desapareció en el muestreo realizado en todo el país entre
el 15 de septiembret ° y el 30 de octubret °, 2021 (figura 4).
130
Biornódi¢ø 20Z3;43:121-30 Brote de SARS-CoV-2 por tænemîssÓn
aerotransportado
2O%
B.1.625
Gamma
Alfa
Sourœ: https://outbreaLinfo/.
Figura 4. Frecuencia de los genomas reportados de las variantes alfa, gamma y mu y del
linaje B.1.615 en Antioquia de febrero a septiembre de 2021. La frecuencia se basa en los
genomas reportados en la plataforma GISAID, la franja de tiempo corresponde al primer y
último dato reportado del linaje B.1.625, y los círculos de las variantes alfa, gamma y
mu se agregaron por ser los más reportados durante la franja de tiempo. La línea de puntos
indica el valle del brote.
Agradecimientos
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