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Preparación de la muestra
Extracción de proteínas
Determinación de proteínas (kit Thermo scientific. Pierce BCA Protein Assay Kit, Rf.
23225/23227)
3. Preparar diseño de placa (tripe replica de cada estándar y doble replica de muestra.
Tomar 3 blancos reactivos). usar gradilla amarilla.
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12
A R R R I I I H H H G G G
B F F F E E E D D D C C C
C B B B A A A R R R
SPL SPL SPL
1 1 2
D SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL
2 3 3 4 4 5 5 6 6 7 7 8
E SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL S`L1
8 9 9 10 10 11 11 12 12 13 13 4
F S`L1 SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL
4 15 15 16 16 17 17 18 18 19 19 20
G SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL SPL
20 21 21 22 22 23 23 24 24
H
1000Ul/ml
Western Blot
1.- Lo primero es preparar la plantilla del gel, según la cantidad de muestra que hay que
cargar en función de la cantidad de proteina que queremos corre por pocillo (30Ug prot/Ul
muestra).
Mientras preparamos las muestras encendemos el termoblock (baño a 95ºC) para que vaya
adquiriendo temperatura.
Preparar eppendorff(1,5 ml), los rotulamos debidamente según plantilla y comenzamos la
preparación de las muestras. A cada eppendorff se le añade:
- 1º el agua bidestilada,
-2º la muestra (o el marcador de peso molecular=Page Ruler- PR),
-3º Loading 1X buffer (8Ul-muestra, 5Ul-PR) y
-4º Reducing 1X buffer (1,5Ul-muestra, 1Ul-PR). Conseguimos un volumen total de 40Ul-
muestras y 20Ul-PR.
Homogenizar bien; sacudir y agitar con voltex suave.
MODIFICACION DE BIO RAD
No usa Loading /Reducing.
Utiliza 475Ul Sample Buffer 2x (BIO RAD)y 25Ul ß-Mercaptoetanol (ALDRICH- M6250-
100ML)(que rompe la estructura 4ª proteinas (s=s) y deja las cadenas libres).
2.- Calentar durante 5 min. En el termoblock a 95ºC (con la finalidad de asegurarse que el
SDS en el buffer ha disuelto completamente las proteínas y evita la formación de complejos
proteicos de mayor peso).
Mientras preparar “Running Buffer SDS-PAGE 1X.
Compramos los geles ya preparados (Criterion Precast Gel- 4-20% Tris-HCl 1.0mm)
BIO RAD. Gel TGX (12+2 poc.) ANY KD, Gel Mini-Protean-TGX satín-Free (10 poc.)
Desprender la cinta adhesiva, eliminar el liquido, enjuagar con agua bidestilada el gel con
el frasco lavador, quitar el peine con suavidad hacia arriba y el protector del final del
cassette. Enjuagar los pocillos con agua bidestilada del frasco lavador evitando que el agua
caiga directamente sobre los mismos. (Ese lavado tiene como objetivo homogenizar el
medio en el que se encuentran y que todo tenga la misma reactividad, pues el buffer tendrá
también agua bidestilada.)
1.-colocar los geles en el tanque con la cámara por donde se cargan las muestras hacia
dentro y mirando los nº hacia nosotros.
2.-Añadir 60mnl de Running Buffer (aproximadamente, cubrir hasta arriba no completar)
en la cámara del gel. Eliminar posibles burbujas golpeando suavemente el gel.
3.-Cargar 15Ul de las muestras a los pocillos ( 1º PR, y colocar alternado las muestras 1 por
grupo, con cuidado para evitar desplazamientos a otros pocillos( usar pipetas manuales para
controlar el vaciado y puntas blancas de las cortas, son mas finas y sin corona).
Sujetar la punta y bajar suavemente hasta el fondo del pocillo, depositar la muestra y subir
lentamente en vertical.
BIO RAD. Preparo la plantilla de los geles de otra forma. Ver libreta, usando Marcador
Blue ( Preacision Plus Protein Dual Stra Standards )y marcador UNSTAINER (Preacision
Plus Protein Standards). 1º GEL TGX(12+2) ANY KD Y MB PDVF.
5.-A temperatura ambiente, correr el gel a 200V entre 20-35 min. (hasta que observemos
que la banda verde del marcador se separa claramente). Anotar la corriente inicial y final.
(0,07 A 1 gel, 0,14 2 geles; 20W).
(Nuestra lectura I inicial= 0,09A y I final=0,03ª).
Fin de la electroforesis a 50min. Con Mario Y 15min aprox. Con BIO RAD.
Cuando se visualiza bien la banda verde y a 0,5 cm del fondo rosa.
BIORAD. 203- a 300V cuando ya han empezado a correr las muestras
7.-Separar con pinzas el gel con mucho cuidado y dejarlo en agua bidestilada en la cubeta
de plástico para eliminar los restos de buffer running.
Nota= Eliminar geles y membranas en residuos especiales
BIO RAD. Con Visualize Serparation TGX Satín-Free precas geñs and the ChemiDoc
MP imagen- immediate visualization of protein separation in 1 minute using 1 easy step.
¿ usa fluorescente? Lavar las membranes con agua bidestilada y visualizamos la
electroforesis del gel en fluorescencia, permitiendo validar las muestras.
BIO RAD. con Transfer Proteins The Trans-Blot Turbo system enables rapid and efficient
transfer of proteins across a wide range of molecular wights.
1.-Rotular las membranas de PVDF( se activan con Metanol) en una de las esquinas con un
portaminas o lápiz bien afilado. (solo anotar N con portaminas, pero sin tocar la
membrana. Cortar el lateral mayor y dejar una anchura de 7,5 cm.
--------------------
7,5cm[
3.- Activar las membranas en metanol absoluto HPLC durante 10 s. Sacudir y escurrir con
las pinzas curvas finas y llevar a cubetas con buffer transferencia. Observar las burbujillas
que hay en la mb, quitar moviendo la mb por ambas caras.
4.-Preparar recipientes (se pueden usar los recipientes de plástico donde vienen los geles)
con buffer de transferencia para equilibrar los geles y las membranas durante 25min.
5.- Preparar los papeles Whatman. Recortarlos al tamaño del gel y de la membrana (para
disminuir la resistencia al paso de la corriente y por tanto evitar el sobrecalentamiento).
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6.- Montar el sándwich (con mucha humedad, añadir buffer transferncia en caja del
sándwich) para la transferencia proteica de la siguiente manera, de abaja hacia arriba (la
transferencia va del ánodo=polo(-)=N al cátodo=polo (+)=P)
Polo negativo (negra)
- parte negra del sándwich
- Esponja negra humedecida en buffer transferencia
- Papel whatman humedecido en buffer transferencia
- Gel(pasar el rodillo para quitar las burbujas)Dejar caer al gel sobre
el papel whatman suavemente, desde nuestro cuerpo hasta el
extremo opuesto.
- Membana(depositar la membrana, con mucho cuidado sobre el gel
evitando tener que recolocar después, hacer coincidir la esquina
rotulada sobre la esquina recortada del gel y anotar que cara de la
membrana está en contacto con el gel, ajustar bien las superficies
limitantes)
- Papel whatman humedecido en buffer transferencia
(Pasar el rodillo en la parte posterior del gel sobre el papel, para no
dejar burbujas, terminar presionando suavemente con la mano.)
- Esponja negra humedecida
- Cerrar el sándwich dejando caer la parte roja, ajustando el carril
blanco corredera.
Polo positivo (rojo)
Nota= todo tiene que estas húmedo con buffer transferencia.
BIO RAD. Sobre la bandeja del “Trands.Blot” coloca; Mb PVDF, gel y filtro, pasando el
rodillo suavemente y en humedad.
7.-Colocar el sándwich dentro del tanque, con el cierre blanco hacia la apertura, en el otro
canal del tanque meter un bloque de hielo.
BLOQUEO DE LA MEMBRANA
3.- Sumergir la membrana en buffer de bloqueo a temperatura ambiente durante una hora
y con agitación mecánica. (en una caja de vidrio con tapadera). Esto es necesario para
eliminar las partes de la membrana que no presentan proteínas y que pueden dar uniones
falsas con el anticuerpo).Nosotros lo dejamos overnight a 4º C no necesita oscuridad.
1.- Tras el bloqueo lavar la membrana 2 veces en TBS ( 1 dedo de volumen)durante 5 min.
en agitación mecánica, para eliminar restos del buffer de bloqueo. Escurrir bien el buffer
bloqueo de la cubeta y lavar la tapadera con H2O bidestilada, eliminando la condensación.
---------¦
N ¦
¦
¦
¦
¦
3.- Preparar una bolsita de plástico autosellable y ajustada casi al tamaño de la membrana
(recortar dos lados, por los que introduciremos la mb cuidadosamente con pinzas, escurrir
bien los restos de TBS y con “N” al revés).
Termoselar la parte larga 5 segundos (calentar el termosellador previamente) , añadir
volcando el Anticuerpo primario diluido y termosellar el lado restante habiendo eliminando
previamente todas las burbujas del interior.( con la bolsa sobre la palma de la mano
empujar las burbujas hacia la parte abierta de la bolsa). A la hora de verter el anticuerpo
dentro de la bolsa debemos asegurarnos que lo hacemos por la cara de la membrana que
estuvo en contacto directo con las proteínas del gel, para ello nos fijaremos en la marca que
le hicimos a las membranas “N” al revés. Hacer esto sobre un recipiente donde poder
recoger la solución si se derrama.
Comprobar el correcto sellado( ajustado al limite de la mb). Y dejar en horizontal en la
palma de la mano.
5.-Abrir la bolsa por una esquina dcha con una tijera(a) y verter la solución con el AC 1 ario
sobre un tubo de plástico con tapón de rosca de 25ml rotulado y preservar a 4ºC.(sellar el
tapón con papel de parafina). Hacer esto sobre un recipiente donde poder recoger la
solución si se derrama.
Cortar entre sello y la mb. ;arriba, lateral dcho y limite inferior(b), para abrir como un
libro(c).
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¦
b ¦
¦
¦
¦ \
¦a
¦---------------------
Coger la membrana con las pinzas curva por la esquina de la marca del “N” al revés, no
forzar al tirar de la bolsa de plástico.
1.- Lavar la membrana 3 veces durante 5 min. en TBS-T, en agitación media 10rpm.
2.- Preparar el Anticuerpo 2 ario conservado a 4ºC de Mario(Bio Rad Immu-Star Goat Anti-
Mouse-HRP conjúgate, Rf. 170-5047) sobre TBS-T (volumen final con probeta de 80ml ó
100ml).
(Anticuerpo 2 ario para DMT-1 Conejo; d(1/80.000)=1Ul+80ml TBS-T) con pipeta
Hamilton. Se prepara en vaso precipitado de 100ml y medimos 80ml con probeta)
Preparar TBS y TBS-T.
4.-Retirar la solución
5.- Lavar l as membranas con TBS-T x2 durante 15 min. en agitación media a Tª ambiente.
6.- Lavar las membranas con TBS durante 15min. en agitación media a Tª ambiente, ya que
el tween puede producir interferencia con la quimioluminiscencia.
Desechar y añadir nuevo TBS y dejar la membrana en la cubeta hasta la lectura a 4ºC.
Una vez que ve han hecho todos los lavados a la membrana, ésta debe estar conservada en
TBS.
-Preparamos los reactivos de quimioluminiscencia: pipeteamos 5ml de cada reactivo
(4,5+4,5ml) en un bote opaco( marrón).
-llevar bandeja transparente de plástico de electroforesis, folio blanco, papel de
filtro, un
(STRIPPING) LIMPIEZA DEL ANTICUERPO
1.- Escurrir bien la mb con TBS. Mantener la membranas en buffer de stripping( solución
única- termo Restore Western Blot Stripping Buffer, 5l Ref. 21063, aunque se puede
preparar) 10-15 min. min. aplicándoles calor (aproximadamente 30-40ºC) en el
calientaplacas y el recipiente abierto. Añadir solo el volumen que cubra la mb. Durante este
tiempo, iremos elaborando buffer de bloqueo, que utilizaremos posteriormente.
Escurrrir bien la mb con Buffer Stripping.
Preparar Buffer de Bloqueo.
2.- Lavar con TBS x2 veces al menos durante 5 min. en agitación media y a Tª ambiente,
para eliminar el buffer de Stripping.
4.- Tras el bloqueo lavar la membrana 2 veces en TBS durante 5 min. en agitación
mecánica, y Tª ambiente para eliminar restos del buffer de bloqueo. Escurrir bien el buffer
bloqueo de la cubeta y lavar la tapadera con H 2O bidestilada, eliminando la condensación.
Añadir TBS y conservar la membrana a 4ºC.
Colocar el gel en agua 2x 5 min. para eliminar el resto de SDS. Añadir la solución de
Coomassie Blue y mantener durante 2 horas en agitación. Lavar con agua bidestilada hasta
que el agua salga limpia y luego dejar el gel en agua toda la noche (para terminar el
lavado). Colocar el gel entre 2 trozos de parafina y escanearlo.
Esta solución es mantenida hasta que no tenga volumen suficiente para teñir el gel.
(Coomassie Brilliante R-250 BioRad, 10 g, SRf. 161-0400)
Secado de Geles
Colocar el gel con un papel de filtro por abajo y plástico film por arriba en el secador de
geles (Saavant) y secarlos a 50ºC durante 3h. Para hacer bien el vaco pasar vaselina por los
bordes del secador.
REACTIVOS
Para 1 Litro
2,42g Tris-base
8g NaCl
Ajustar el pH a 7,6 con ácido clorhídrico y conservar a 4ºC
TBS-Tween 20 (TBS-T)
Buffer de Bloqueo
Reactivos de quimioluminiscencia
Una vez que se han hecho todos los lavados a la membrana, ésta debe estar conservada a
4ºC en TBS.
Vamos al modulo nuevo con un día previo de reserva del aparato. Comprobar que estamos
autorizados para entrar en citometría.
-Una vez allí encendemos el ordenador (contraseña: tdi ) y el Fujifilm unos 10 min. para
que se enfríe a -30ºC.
Abrimos el programa Image Reader LAS-400
Conclusiones