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Hipermutación somática y afinidad

miércoles, 20 de abril de 2022 12:55

Introducción La respuesta inmunitaria es altamente específica para cada invasor, y


eso se debe a que las células de la respuesta inmunitaria adaptativa
tienen receptores únicos que pueden diferenciar las bacterias amigables
de los patógenos mortales por sus partes únicas, llamadas antígenos.

Las células clave de la respuesta inmunitaria adaptativa son los linfocitos,


las células B y T que tienen receptores de antígeno únicos conocidos
como receptor de células B o BCR y receptor de células T o TCR,
respectivamente.

Tanto las células B como las células T se someten a un proceso llamado


reordenamiento VDJ para generar un conjunto enormemente diverso de
receptores.

Las células B pueden mejorar aún más la diversidad de su repertorio de


BCR utilizando un proceso llamado hipermutación somática , y el
resultado es que las células que emergen tendrán una respuesta más
fuerte y más específica al antígeno, y esto se llama maduración por
afinidad .

BCR Ahora recuerde que el receptor de la célula B es esencialmente un


anticuerpo excepto que está adherido a la superficie de la célula B.
BCR Ahora recuerde que el receptor de la célula B es esencialmente un
anticuerpo excepto que está adherido a la superficie de la célula B.

Y cada receptor de células B o anticuerpo tiene dos partes generales: la


región variable que se une al antígeno y la región constante que
determina la clase de anticuerpo específico: IgM, IgG, IgA, IgD o IgE.

Cuando se crean inicialmente los receptores de células B, se hace en


ausencia de antígeno.

Hipermutación La hipermutación somática sólo ocurre en las células B activadas y no en


somática las células T.

Esto sucede en los sitios donde las células B se activan y las células T
también están presentes, básicamente en los centros germinales dentro
de los ganglios linfáticos y el bazo .

Cuando las células B reciben estimulación antigénica mediante el


entrecruzamiento de sus BCR, expresan la molécula CD40 en su
superficie.

Luego aparecen las células T auxiliares cercanas con un ligando CD40 y la


interacción CD40-ligando CD40 hace que las células B incrementen los
receptores de citoquinas .

Luego, la célula T envía citocinas que se unen a estos receptores y


provocan varios cambios dentro de la célula B activada.

Un cambio clave es la activación de la enzima citidina desaminasa


receptores de citoquinas .

Luego, la célula T envía citocinas que se unen a estos receptores y


provocan varios cambios dentro de la célula B activada.

Un cambio clave es la activación de la enzima citidina desaminasa


inducida por activación o AID, una enzima que solo se encuentra en las
células B.

La AID permite que la célula B haga cortes en el ADN, lo que hace que la
célula B cambie de clase de IgM a IgG, IgA o IgE según las citoquinas que
reciba de la célula T.

Debido al papel que juega AID en el cambio de clase, las personas que
carecen de AID sufren de un tipo de inmunodeficiencia hiper IgM en la
que tienen dificultades para producir anticuerpos que no sean IgM.
AID Además de promover el cambio de clase, AID también conduce a la
hipermutación somática .

Verá, AID solo puede unirse a ADN monocatenario, por lo que en


realidad solo puede atacar genes que se transcriben activamente
durante la fase de proliferación rápida que ocurre después de la
activación de las células B.
La forma en que funciona la enzima AID es convertir una citidina en una
uridina en el ADN.

Ahora tenga en cuenta que la uridina es completamente extraña al ADN


y, por lo general, solo se encuentra en el ARN.

Y la uridina no puede unirse correctamente al nucleósido de guanosina


en la hebra de ADN opuesta.

Como resultado, la célula trata de corregir este error en el ADN de una


de dos maneras: reparación de desajustes o reparación de escisión de
base.

Reparación de desajuste
En la reparación de desajustes, las proteínas de reparación de
desajustes, MSH2 y MSH6, intervienen para fijar el ADN antes de que se
complete la transcripción.

Esto es un poco como el equipo de boxes en una carrera de NASCAR


tratando de arreglar rápidamente un auto en la vuelta 40 de 100.
MSH2 y MSH6 reclutan nucleasas que eliminan la uridina y varios
nucleótidos adyacentes del ADN, y luego entra la ADN polimerasa para
ayudar a reemplazar los nucleótidos .

Este proceso es extremadamente propenso a errores y tiende a


introducir mutaciones en el ADN.

Reparación por escisión de base


La otra opción es la reparación por escisión de base, que es donde la
enzima uracilo-ADN glicosilasa elimina la base de uracilo de la uridina y,
por lo general, en la siguiente ronda de replicación del ADN, la ADN
polimerasa inserta un nucleótido aleatorio en la hebra de ADN opuesta.
Una vez más, lo que lleva a una mutación.
Y estas mutaciones aleatorias significan que las células hijas de la célula
B inicial pueden tener una especificidad de antígeno muy diferente a la
de su célula madre.

Mutaciones Ahora, aunque las mutaciones aleatorias en un gen suelen ser un


problema, ¡las mutaciones en la región variable del BCR son algo
realmente bueno!

Esto se debe a que los cambios afectan la fuerza con la que el BCR se une
al antígeno: su afinidad por el antígeno.

Y dado que las células B eventualmente se convertirán en células


plasmáticas que secretan anticuerpos, este proceso afecta la afinidad de
los anticuerpos por el antígeno.

Mientras que algunas células hijas tienen mutaciones en su BCR que


Mientras que algunas células hijas tienen mutaciones en su BCR que
aumentan la afinidad por el antígeno, otras tienen mutaciones que la
disminuyen.

Si la afinidad de una célula B es tan baja que ya no responde al antígeno,


la célula B simplemente dejará de activarse y se extinguirá con el tiempo.

Mientras tanto, otras células obtendrán una afinidad cada vez más
fuerte a lo largo de las generaciones y esto es lo que conduce a la
maduración de la afinidad.

Es realmente como la selección natural a nivel celular, acelerada para


que veamos los cambios que suceden durante días en lugar de durante
miles de años.

Mientras todo esto sucede, tenga en cuenta que se está produciendo


una respuesta inmunitaria y que inicialmente hay muchos antígenos
flotando.

Con el tiempo, a medida que el sistema inmunitario elimina cada vez


más la infección, queda menos antígeno para este proceso de
maduración de la afinidad .

Eso significa que solo los BCR con la mayor afinidad por el antígeno
podrán unirse a la pequeña cantidad que flota.

En otras palabras, a medida que se elimina el antígeno, también ayuda a


promover solo las células hijas con BCR que tienen la mayor capacidad
para unirse al antígeno y generar una respuesta contra él.
Eso significa que solo los BCR con la mayor afinidad por el antígeno
podrán unirse a la pequeña cantidad que flota.

En otras palabras, a medida que se elimina el antígeno, también ayuda a


promover solo las células hijas con BCR que tienen la mayor capacidad
para unirse al antígeno y generar una respuesta contra él.

Resumen La hipermutación somática solo ocurre en las células B, que expresan la


enzima AID.

AID es capaz de hacer pequeñas mutaciones directamente en el sitio de


unión al antígeno del BCR que se expresan en las células hijas de una
célula que prolifera rápidamente.

Estos cambios en la región variable modifican la afinidad, o fuerza, que


tiene el BCR por su antígeno.

A medida que el antígeno se vuelve limitante, las células B con la


afinidad más baja morirán primero, de modo que solo permanecerán las
células B con la afinidad más fuerte por el antígeno. Este proceso se
denomina maduración por afinidad.
Reordenamiento VDJ
21/04/22 10:03

Introducción La respuesta inmunitaria adaptativa es altamente específica para cada


invasor, y eso se debe a que las células de la respuesta inmunitaria
adaptativa tienen receptores que diferencian las bacterias amigables y los
patógenos potencialmente mortales de sus partes únicas, llamadas
antígenos.

Las células clave de la respuesta inmune adaptativa son los linfocitos, las
células B y T.

Y los receptores de antígeno para las células T y las células B tienen


muchas cosas en común, una de las cuales es que comparten el mismo
mecanismo, llamado reordenamiento VDJ , para generar un conjunto
enormemente diverso de receptores.

VDJ VDJ significa variabilidad, diversidad y unión, respectivamente, y el


reordenamiento de VDJ tiene 4 características clave que ayudan a
garantizar que cada receptor de antígeno sea único.

• Primero, cada individuo hereda múltiples segmentos de genes V, D


VDJ VDJ significa variabilidad, diversidad y unión, respectivamente, y el
reordenamiento de VDJ tiene 4 características clave que ayudan a
garantizar que cada receptor de antígeno sea único.

• Primero, cada individuo hereda múltiples segmentos de genes V, D


yJ
• En segundo lugar, los segmentos de los genes V, D y J se
recombinan aleatoriamente, lo que significa que cualquier V puede
emparejarse con cualquier D y cualquier J
• En tercer lugar, existe una inexactitud recombinatoria, lo que
significa que este proceso es intencionalmente propenso a errores,
lo que conduce a una variación adicional
• Cuarto, hay una reorganización aleatoria de dos cadenas, lo que
significa que este proceso involucra dos cadenas diferentes que se
unen para formar el receptor.

Diferencias BCR TCR


entre BCR y TCR
Es esencialmente un anticuerpo, El receptor de células T, o TCR,
excepto que tiene una parte por otro lado, se ve bastante
transmembrana que atraviesa la diferente pero todavía tiene
membrana y une el receptor a la solo dos cadenas.
superficie de una célula B.
Al igual que los anticuerpos, el receptor En este caso tiene una cadena
de células B tiene una cadena pesada y alfa que es análoga a la
una cadena ligera. cadena ligera de la célula B y
una cadena beta que es
análoga a la cadena pesada de
la célula B.
de células B tiene una cadena pesada y alfa que es análoga a la
una cadena ligera. cadena ligera de la célula B y
una cadena beta que es
análoga a la cadena pesada de
la célula B.
Una región o fragmento del receptor
de células B se une al antígeno y se
denomina fragmento: unión de
antígeno o región Fab.

Hay dos regiones Fab en cada receptor


de células B.
Luego está la región constante o A diferencia del receptor de
fragmento llamado fragmento - células B , las cadenas alfa y
constante o región Fc , que es la parte beta del receptor de células T
que determina qué clase de receptor solo forman un receptor
de células B será, por ejemplo, IgM o transmembrana: no se
IgD, y si permanecerá o no unido a la secretan y no hay diferentes
membrana celular o si se secretará clases. También solo tienen un
como un anticuerpo flotante libre. sitio de unión al antígeno.

Entonces , el reordenamiento de VDJ realmente solo afecta la porción de


la proteína que entra en contacto con el antígeno.

Tanto para BCR como para TCR, esto se conoce como región variable o
región V.

Esta región está respaldada por una región constante o C.


Tanto para BCR como para TCR, esto se conoce como región variable o
región V.

Esta región está respaldada por una región constante o C.

Las regiones variables de cada uno de estos receptores son muy diversas
en toda la población celular, donde no hay dos células T o células B
desarrolladas que reconozcan exactamente el mismo antígeno.

Esto se logra mediante la importante variabilidad en la secuencia genética


que constituye la región V, pero esta variabilidad se concentra en ciertos
segmentos de la región V conocidos como regiones hipervariables o
regiones determinantes de la complementariedad.

Estas ubicaciones se unen cuando las dos cadenas de TCR o BCR se unen
para crear un sitio hipervariable en la punta de cada brazo de BCR o la
punta de TCR, que es el sitio de unión al antígeno.

Por lo tanto, el reordenamiento de VDJ se usa para crear la variabilidad


que se ve en estas regiones hipervariables que forman el sitio real de
unión al antígeno, y solo esa parte de la proteína.

El primer paso en el reordenamiento de VDJ ocurre antes de que


nazcamos, en el sentido de que heredamos de cada padre, múltiples
segmentos de genes V, D y J.
Rearreglo Cada persona tiene 44 segmentos de genes V, 27 segmentos D y 6
segmentos J y eso es solo para cadenas pesadas de células B, hay más
segmentos V, D y J para la cadena beta del receptor de células T y, por
supuesto, hay más V y segmentos J para la cadena ligera de células B y la
cadena alfa de células T.

Los diversos segmentos de genes están alineados en el ADN como los


vagones de un tren.

Los segmentos del gen V están ubicados más alejados de los genes que
codifican los segmentos del gen constante, mientras que los segmentos J
están ubicados bastante cerca de los segmentos del gen constante.

Y en los cromosomas que contienen los genes para la cadena pesada o la


cadena beta, los segmentos del gen D se ubican entre los segmentos del
gen V y J.

Para generar diversidad , estos segmentos de genes se reorganizan al azar


tanto en las células B como en las células T.
Para las células B, comenzaremos con la cadena pesada y para las células
T, comenzaremos con la cadena beta.

Entonces, digamos que esta cadena pesada o cadena beta se reorganizó


para tener V2-D2-J1, bueno, esto sería completamente diferente y se
uniría a antígenos diferentes que una cadena pesada o cadena beta que
se reorganizó para tener V2-D3-J1.

Entonces, simplemente usando una región D diferente, cambia por


completo a qué antígeno podrían unirse estas dos células.

La reorganización de estos diferentes exones se logra al tener secuencias


de señal de recombinación que son secuencias de ADN no codificantes
que flanquean los puntos donde el ADN debe cortarse y reorganizarse.

Una secuencia de señal de recombinación tiene tres partes.

1. Primero, hay una secuencia de 7 nucleótidos llamada heptámero:


5'-CACAGTG-3'.
2. En segundo lugar, hay un tramo de exactamente 12 nucleótidos,
que corresponde a 1 vuelta de la doble hélice del ADN, o
exactamente 23 nucleótidos, que corresponde a 2 vueltas de la
doble hélice del ADN.
3. En tercer lugar, hay una secuencia de 9 nucleótidos llamada
secuencia sin nombre: 5'-ACAAAAACC-3'.

Durante el reordenamiento de VDJ, el ADN se mueve junto o gira para


unir dos secuencias de señales de recombinación dependiendo de cómo
estén orientadas, de modo que ambas sean imágenes especulares entre
3. En tercer lugar, hay una secuencia de 9 nucleótidos llamada
secuencia sin nombre: 5'-ACAAAAACC-3'.

Durante el reordenamiento de VDJ, el ADN se mueve junto o gira para


unir dos secuencias de señales de recombinación dependiendo de cómo
estén orientadas, de modo que ambas sean imágenes especulares entre
sí en términos de su orientación de 5' a 3'.

Por ejemplo, digamos que hay una secuencia de señal de recombinación


que flanquea un exón V y otra que flanquea un exón D.

Un grupo de enzimas llamadas RAG1 y RAG2, que están codificadas por


genes que activan la recombinación, cortan el ADN en estas secuencias
señal de recombinación.

Luego, las proteínas de reparación como Ku, la ADN-proteína quinasa y


Artemis ayudan a volver a unir y, por lo tanto, a recombinar el ADN, lo
que da como resultado una pieza circular extracromosómica de ADN
cuando se corta y se pierde cuando la célula se divide.

De esta manera, cada célula hija tendrá exactamente la misma secuencia


de VDJ que la célula original que recombinó los segmentos del gen
durante el reordenamiento de VDJ .
En este punto, vamos a aumentar la diversidad aún más, ¡porque este
proceso es intrínsecamente propenso a errores!

El extremo cortado se agregará mediante la enzima desoxinucleótido


transferasa terminal o TdT, que agrega y elimina nucleótidos al azar .

Estos se llaman N - nucleótidos y pueden ser literalmente cualquier


nucleótido.

Por lo tanto, podría haber dos células que usen exactamente las mismas
regiones V, D y J para crear su cadena pesada o beta, por ejemplo, V2-D3-
J1, pero podrían diferir debido a la inexactitud de la recombinación y la
enzima TdT.

Entonces, realmente una celda con esa selección V2-D3-J1 podría ser V2-
Adenina-Timina-D3-Citosina-Guanina-J1 donde TdT agrega adenina,
timina, guanina y citosina y la otra celda sería V2-Citosina -D3-Guanina-
Adenina-J1.

Y estos cambios adicionales alteran la especificidad antigénica del


receptor.

Finalmente, los extremos del ADN se mantienen unidos y luego se unen


mediante un complejo de enzimas que incluyen la ADN ligasa IV que liga
el ADN nuevamente creando la nueva unión codificante con las regiones
Y estos cambios adicionales alteran la especificidad antigénica del
receptor.

Finalmente, los extremos del ADN se mantienen unidos y luego se unen


mediante un complejo de enzimas que incluyen la ADN ligasa IV que liga
el ADN nuevamente creando la nueva unión codificante con las regiones
V, D y J recién reorganizadas.

Estos cortes y procesos deberán suceder para unir D a J y luego V a DJ.

Checkpoint En este punto hemos creado una cadena pesada para una célula B o una
cadena beta para una célula T.

Antes de proceder a hacer la cadena ligera para la célula B o una cadena


alfa para una célula T , es importante probar si las cadenas que hicimos se
pueden unir normalmente a cadenas ligeras o alfa.

Para comprobar que en las células B , la cadena pesada se empareja con


una cadena ligera sustituta conocida como VpreB, y en las células T, la
cadena beta se empareja con una cadena sustituta alfa pre-T.

Estas cadenas sustitutas, VpreB y alfas pre-T son como ruedas de


entrenamiento para la cadena pesada o cadena beta.

Si la cadena pesada o la cadena beta es capaz de unirse al receptor


sustituto, le indica al núcleo de la célula que prolifere salvajemente
formando muchas células hijas.
Luego, cada célula hija pasa por un proceso llamado surtido aleatorio de
cadenas, que es donde crea una cadena ligera o cadena alfa para
emparejarse con su cadena pesada o cadena beta.

La cadena ligera o cadena alfa luego pasa por un reordenamiento VJ


como lo hicimos para las cadenas pesadas o beta, eligiendo
aleatoriamente una región V y J para unir.

Recuerde, no hay regiones D en cadenas ligeras o alfa.

Una vez que haya reorganizado su cadena ligera o alfa, se emparejará con
la cadena pesada o beta ya hecha.

Si la nueva cadena ligera o cadena alfa se une a la cadena pesada,


entonces se analiza la célula para asegurarse de que no sea autorreactiva.

Si la célula es autorreactiva, seguirá intentando reorganizar la cadena


ligera o alfa hasta que se quede sin material genético.

Y si se queda sin material genético, entonces la célula muere.


Resumen El objetivo del reordenamiento de VDJ es crear una cantidad masiva de
receptores de antígenos únicos en las células T y B.

Durante el reordenamiento de VDJ , la celda selecciona aleatoriamente


de las múltiples regiones V, D y J que heredamos.

Se realizan cortes en la secuencia de ADN en ubicaciones precisas que


están señaladas por la Secuencia de señal de recombinación que está
hecha de un heptámero, un noámero y un espaciador de 12 o 23 pares de
bases.

Los cortes se rellenan con la enzima propensa a errores TdT que agregará
N - nucleótidos en los sitios de unión y luego el ADN se ligará.

Una vez que la célula ha terminado de reorganizar una cadena beta o una
cadena pesada, prolifera rápidamente y esa cadena se empareja con una
amplia variedad de cadenas alfa o ligeras.

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