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Las enzimas son proteínas biológicas específicas que catalizan las reacciones
bioquímicas sin alterar el punto de equilibrio de la reacción o ser consumidas o
experimentar algún cambio de composición. Las enzimas, que se encuentran en
todo el tejido corporal, aparecen con frecuencia en el suero después de una lesión
celular o, en ocasiones, en cantidades más pequeñas, de células degradadas.
Ciertas enzimas como las encargadas de la coagulación son especificas del plasma
por lo que se encuentran en concentraciones significativas. Como proteína, cada
enzima contiene una secuencia de aminoácidos específica (estructura primaria),
con las cadenas polipeptídicas resultantes retorciéndose (estructura secundaria),
que luego se pliega (estructura terciaria) y da como resultado en cavidades
estructurales. Si una enzima contiene más de una unidad polipeptídica, la estructura
cuaternaria se refiere a las relaciones espaciales entre las subunidades. Cada
enzima contiene un sitio activo, a menudo una cavidad sin agua, donde la sustancia
sobre la que actúa la enzima (el sustrato) interactúa con residuos de aminoácidos
cargados en particular. Un sitio alostérico, una cavidad que no sea el sitio activo,
puede unirse a moléculas reguladoras y, por lo tanto, ser significativo para la
estructura enzimática básica.
Aunque una enzima mantenga la misma función catalítica en todo el cuerpo, esa
enzima puede existir en diferentes formas dentro del mismo individuo, las diferentes
formas se pueden diferenciar entre sí por ciertas propiedades físicas como la
movilidad electroforética, solubilidad o la resistencia a la inactivación. Además de la
estructura básica de la enzima, una molécula no proteíca llamada cofactor puede
ser necesario para la actividad de la ezima. Los cofactores inorgánicos como iones
cloruro o magnesio se llaman activadores. Una coenzima es un cofactor inorgánico
tal como nicotinamida adenina dinucleotido (NAD). Cuando se une fuertemente a la
enzima la coenzima se llama grupo prostético.
La porción de enzima (apoenzima es decir la parte proteica), con su respectiva
coenzima, forma un sistema completo y activo, una holoenzima. Algunas enzimas,
en su mayoría enzimas digestivas, se secretan originalmente del órgano de
producción en una forma estructuralmente inactiva, llamada proenzima o zimógeno.
Otras enzimas posteriormente alteran la estructura de la proenzima para hacer que
los sitios activos estén disponibles al hidrolizar residuos de aminoácidos específicos.
Este mecanismo evita que las enzimas digestivas digieran su lugar de síntesis. La
Enzyme Commisision (EC) de la IUB adoptó un sistema de clasificación para
estandarizar la nomenclatura que defina el sustrato en el que actúa, la reacción que
cataliza y posiblemente el nombre de la coenzima que participa en la reacción.
Además, mediante un código numérico que contiene cuatro dígitos separados por
puntos decimales el primer digito coloca a la enzima en una de las seis clases:
1. Oxidorreductasas: Catalizan una reacción de oxidación-reducción entre dos
sustratos.
2. Transferasas: Catalizan la transferencia de un grupo distinto al hidrógeno de
un sustrato a otro.
3. Hidrolasas: Catalizan la hidrólisis de varios enlaces.
4. Liasas: Catalizan la eliminación de grupos de sustratos sin hidrólisis, el
producto contiene enlaces dobles.
5. Isomerasas: Catalizan la interconversión de isómeros geométricos, ópticos y
posicionales.
6. Ligasas: Catalizan la unión de dos moléculas de sustrato, junto con la rotura
del enlace pirofosfato en trifosfato de adenosina (ATP) o un compuesto
similar.
Cinética enzimática.