Proteínas

Bioquímica y
fisiología microbiana
Prof. Gustavo Faundez

Funciones de los aminoácidos

Aminoácidos

Precursores de:

Componentes de:
- Ceto ácidos
• Proteínas
- Glucosa
• Fosfolípidos
- Aminas biogénicas
- Nucleótidos

Neurotransmisores
- Heme y otras moléculas

Transportadores
de grupos amino:
Glutamato
Glutamina

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Estructura de los aminoácidos

Los aminoácidos forman enantiómeros

Aminoácidos esenciales

Aminoácidos con grupo R alifático (apolar)

Glicina no
presenta las
características
de este grupo

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 Aminoácidos con grupos R aromático (apolar)

Los aminoácidos
aromáticos
absorben radiación
alrededor de los 280 nm

Aminoácidos con grupo R polar sin carga

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 Aminoácidos con grupo R cargado

Con carga positiva

Con carga negativa

Equilibrios ácido base que

involucran grupos ionizables
comunes a todos los aminoácidos
(sin considerar los grupos R)

Cargas netas que involucran grupos

ionizables comunes a todos los
aminoácidos
(sin considerar los grupos R)

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 Equilibrio ácido base de aminoácidos

El punto isoeléctrico
de un aminoácido:
pI = ½(pK α- Carboxilo+pK α -amino)

El punto isoeléctrico es un valor

de pH en que la carga neta de un
aminoácido o una proteína es 0
Titulación de la glicina

Los aminoácidos se unen

covalentemente para formar
proteínas

Dos aminoácidos reaccionan

a través de sus grupos
carboxilo y amino para
formar por condensación
un enlace peptídico

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Orden estructural de las proteínas

Estructura primaria
La estructura primaria de las
proteínas está constituida por
la secuencia de aminoácidos
unidos por enlaces peptídicos
en la cadena polipeptídica

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Propiedades del enlace peptídico
• Tiene carácter parcial de doble enlace C= O y C=N, lo que impide
la libre rotación en torno a estos enlaces.
• Esto hace que sea rígido, formando un plano
• Tiene carácter polar,
• Puede formar enlaces de H

Las características del enlace

peptídico, plano y rígido, solo
permiten un limitado número
de estructuras regulares

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Estructura secundaria de proteínas
Estructuras regulares (repetitivas) que pueden adoptar las cadenas
polipeptídicas
Hélices α y láminas β están estabilizadas por enlaces de H

Hélices α

Láminas β

Hélices α

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La hélice α está estabilizada por
enlaces de H entre un grupo
amino (-NH) y el oxígeno de un
carbonilo (O = C) presentes en los
enlaces peptídicos

Láminas β
La unidad básica de la lámina β es la hebra β, que consiste en
un fragmento de cadena completamente extendido.
Esta es solo estable cuando se encuentra en una lámina β

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 (A) antiparalelas
(B) paralelas

Las láminas β están estabilizadas por enlaces de H

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Estructura terciaria
Presente en proteínas
globulares, involucra
elementos de estructuras
secundarias

La estructura terciaria de una proteína

está representada por la conformación,
que describe la arquitectura
tridimensional de la proteína

Las interacciones no covalentes determinan y estabilizan

la estructura terciaria

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En una proteína globular, al plegarse en ambiente acuoso, las grupos
R apolares tienden a localizarse en una región central, al interior,
mientras que los grupos polares se disponen hacia el exterior,
interaccionando con el agua

La estructura nativa de una proteína se puede desestabilizar por

agentes físicos o químicos.

La pérdida total de la estructura tridimensional deja a la proteína

en un estado denaturado

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La temperatura también puede actuar como agente denaturante.
Una alta temperatura desestabiliza las interacciones no covalentes
que mantienen la estructura terciaria.
En muchos casos la denaturación de una proteína por la
temperatura es irreversible

Los enlaces disulfuros

(cys-S-S-cys) le confieren más
estabilidad térmica a la estructura
terciaria de una proteína

Agentes reductores como el β-mercapto etanol rompen los enlaces

disulfuros, reduciendo los S-S a SH

Para denaturar
completamente una
proteína con puentes
disulfuro se debe
tratar con urea (8M) y
β mercapto etanol

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La estructura primaria
determina la estructura
tridimensional de una
fig 6-27 Estado nativo
catalíticamente
proteína activa

Estado denaturado
catalíticamente inactiva

Proteína renaturada
catalíticamente activa

Estructura cuaternaria
Asociación no covalente de dos o más cadenas polipeptídicas
(subunidades)

ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-
epimerase de Helicobacter pylori

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Hemoglobina
Existe un extenso contacto
entre subunidades:
- interacciones hidrofóbicas,
- enlaces de H
- interacciones electrostáticas

Cada subunidad es una proteína globular

con estructura terciaria definida y que
tiene hélices α como tipo de estructura
secundaria
Cada subunidad contiene un grupo heme

Mutaciones en un aminoácido pueden producir

importantes cambios en la estructura y función de
una proteína
La hemoglobina S tiene una mutación en la
posición 6, valina en vez de glutamato

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Las proteínas
presentan
una gran variedad
de estructuras y
funciones

Proteínas globulares

Las proteínas globulares poseen variadas funciones:

Catálisis
Transporte
Regulación
Defensa
Almacenamiento

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Catálisis

Enzimas. Catalizadores biológicos

Ribonucleasa

Almacenamiento
Algunas proteínas almacenan moléculas, como la mioglobina, que
almacena oxígeno en músculo

La mioglobina se une fuertemente al O2 aún

a muy baja pO2 por lo que su liberación
ocurre solo en condiciones de extrema
disminución de O2

mioglobina

Grupo prostético Heme:

protoporfirina con Fe (II)

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Transporte
Proteínas también funcionan como transportadores
Por ejemplo, la hemoglobina transporta oxígeno en los eritrocitos.

Otras proteínas funcionan como transportadores a través de la

membrana citoplasmática

Hemoglobina

La hemoglobina transporta oxígeno a tejidos

En pulmones la pO2 es alta y la hemoglobina se une y transporta al

O2 para llevarlo a tejido sólidos.

En los tejidos la pO2 y el pH disminuyen, en cambio, la pCO2 es alta

La hemoglobina en estas condiciones libera O2 y puede unir CO2

Al volver a los pulmones, la hemoglobina

encuentra nuevamente una pO2 alta,
liberando CO2 y se une al O2

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Defensa
Inmunoglobulinas
parte importante del sistema inmune

IgA, IgD, IgE, IgG, IgM

todas tienen 4 cadenas
polipeptídicas

IgG
2 livianas (25 kDa) de 212 residuos

2 pesadas (50 kDa) de 450 residuos

las cadenas están unidas por puentes
disulfuros

IgG CDR: regiones determinantes

de complementariedad

Antígeno
interacción de IgG con antígeno Anticuerpo (IgG)

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Regulación
Existen proteínas que
son reguladoras de procesos
o vías metabólicas como
hormonas

También hay proteínas que

regulan la expresión génica:
factores de transcripción

Insulina

Proteínas fibrosas
•Tienen funciones estructurales

•En general, están formadas por un solo tipo predominante

de estructura secundaria

•Insolubles en agua

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Colágeno
Figure 6-12
El colágeno es una abundante proteína fibrosa en animales.

En humanos, el colágeno constituye un tercio de las proteínas

totales, tres cuartos del peso seco de la piel y es el componente
más prevalente en la matriz extracelular

Presente en huesos, piel, tejido conectivo, cartílago, tendones

Las moléculas de colágeno forman una hélice regular que es

ligeramente diferente de la hélice α común: avanza en sentido
opuesto.

En el colágeno tres de estas hélices se asocian

para formar una triple hélice (tropocolágeno)

El 35% de los aminoácidos en las moléculas

individuales de colágeno es glicina:
es el único que cabe en la particular estructura
de la triple hélice en una secuencia Gly -X-X

En la triple hélice, las hélices individuales

pueden ser iguales o diferentes

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Existen enlaces de H entre las cadenas
(entre N-H y O=C) que estabilizan
la triple hélice

También se establecen enlaces de H involucrando hidroxiprolina

e hidroxilisina, los que contribuyen significativamente a la
estabilidad de la molécula de tropocolágeno

Vit C

Existen además enlaces

covalentes que entrecruzan las
triples hélices en la fibrilla de
colágeno

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Las fibras de colágeno forman
asociaciones más complejas en
huesos, piel, tejido conectivo, tendones

Estructura del tendón

fibrillas, redes o entramados

Queratinas
Forman parte de pelo, uñas, piel,
cuernos, plumas, citoesqueleto

Ricas en aa hidrofóbicos:
Phe, Ile, Val, Met, Ala
Puede llegar a tener 18% de Cys

2 hélice - α se asocian
para formar un heterodímero

Constituyen fibras con gran

resistencia a la tensión

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Fibroína
Fibra con alta resistencia a la
tensión, pero flexible

Proteína formada por

láminas β antiparalelas
estrechamente empacadas
Constituyente de la seda

Telas de araña también están

constituidas por fibroina

En la fibroina, la secuencia Gly-Ser-Gly-Ala-Gly-Ala es

recurrente en la estructura primaria.

La abundancia de glicina y alanina hacen posible el apilamiento

de las hojas lo que contribuye a la firmeza y resistencia de esta
proteína

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