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INSTITUTO POLITÉNICO NACIONAL

ESCUELA NACIONAL DE CIENCIAS BIOLÓGICAS


BIOQUÍMICA GENERAL
Bitácora de la práctica: Determinación de aminoácidos terminales con grupo
alfa amino libre: Método de Sanger
Alumnos: Reyes Nathan Ulises y Bautista Bautista Maria Guadalupe
“DR. GUILLERMO CARVAJAL SANDOVAL”
Grupo: 3OM4 Sección: Fecha de entrega: 03-09-2021

3. Metodología

1. Introducción a. Agregar en un tubo de 30g de


hemoglobina y 2.4 ml de
El primer método útil para determinar el NaHCO3 al 4.2%.
N-terminal de los polipéptidos fue b. Añadir 2 ml de DNFB al 1%,
descrito por Frederick Sanger, quien agitar constantemente por una
diseño un método, el cual consiste en el hora y mantener el pH entre 8 y
marcaje del amino terminal a través del 9, si es necesario NaHCO3 al
uso de DNFB. La determinación de la 4.2%.
estructura primaria de una proteína c. Ajustar el pH por debajo de 3 con
suele denominarse secuenciación. El 12 gota de HCl 3N.
dinitrofluorobenceno (DNFB) es un d. Extraer 4 veces la suspensión
compuesto químico de color amarillo con volúmenes iguales con 5 ml
que reacciona con los grupos libres en de éter saturado con solución
condiciones ligeramente básicas acuosa de FeSO4.
formando los dinitrofenil derivados e. Evaporar los residuos de éter en
(DNP-aa), también reaccionará con los baño maría
grupos imidazol, fenólicos y f. Centrifugar a 3000 rpm durante
epsilonamino, lo que dará una 15 min y eliminar el
dinitrofenilación en la cadena lateral de sobrenadante.
la tirosina, histidina y lisina. g. Añadir 5 ml de HCl 6N y calentar
en autoclave 3 horas a 15 Ib de
presión.
2. Objetivos h. Calentar los extractos etéreos y
enfriar. Añadir 0.5 ml de acetona
Identificar mediante el método de o alcohol absoluto y disolver.
Sanger el aminoácido alfa-amino i. Realizar la cromatografía en
terminal que se encuentra en las papel.
cadenas de la molécula de a) Cortar una tira de papel
hemoglobina. Whatman No. 1 de 22 x
50 cm, trazar tres líneas
Conocer el fundamento del método paralelas de 2.5, 6.0 y 8.0
Sanger. cm, doblar en abanico
Interpretar adecuadamente la cada medida.
cromatografía. b) Sobre la línea 8.0 cm
marcar 5 puntos
equidistantes y un círculo
de 5mm de diámetro.
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Bitácora de la práctica: Determinación de aminoácidos terminales con grupo
alfa amino libre: Método de Sanger
Alumnos: Reyes Nathan Ulises y Bautista Bautista Maria Guadalupe
“DR. GUILLERMO CARVAJAL SANDOVAL”
Grupo: 3OM4 Sección: Fecha de entrega: 03-09-2021

c) En los 4 primeros puntos


colocar 7 a 9 aplicaciones
de los derivados
dinitrofenilados de los
aminoácidos. Al último
punto colocar 40 a 50
aplicaciones de la
muestra.
d) Secar después de cada
aplicación.
e) Colocar el cromatograma Tabla 1. Cromatografía en papel y valores de
es una cámara saturada Rf.
con solvente de ácido Resultados del cromatograma, del
cítrico y citrato de sodio problema 2.
0.1 M a pH de 6.4 por dos
horas.
f) Desarrollar en forma
descendente con el
mismo solvente en un
tiempo de 4 a 5 horas.
g) Sacar los cromatogramas
de la cámara y marcar
con el lápiz el frente del
disolvente, dejar secar.
h) Someter a vapores de
amoníaco. Tabla 2. Cromatografía en papel y valores de
i) Calcular los valores de Rf. Rf.

Se confirma que la muestra 2 es la


4. Resultado valina y el amino terminal es DNP-Val.

Los resultados que se obtuvieron a 5. Discusión


partir de la cromatografía realizada
fueron los siguientes: Con la ayuda del método de Sanger se
identificó el grupo α-amino terminal
de la hemoglobina, destacando la
coloración amarilla característica de la
prueba, esto debido al proceso
intermedio llamado Dinitrofenilación
(donde se adiciona el grupo Dinitrofenil
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al amino terminal de la proteína). Para Terminales Con Grupo Alfa Amino


el proceso de identificación se realizó Libre. Método De Sanger. Disponible
una cromatografía en papel, donde se en:
agregó cada uno de los derivados https://es.scribd.com/document/26696
dinitrofenilados de los aminoácidos tipo 4620/DETERMINACION-DE-
DNP-Phe, DNP-Val, DNP-Ala, DNFB, AMINOACIDOS-TERMINALES-CON-
solución problema. En los resultados se GRUPO-ALFA-AMINO-LIBRE-
hallaron similitudes entre la solución METODO-
problema y la solución de valina, que DE-SANGER (Consultado el 22 de
despues al realizar los cálculos de Rf agosto del 2021).
confirmamos la similitud entre la
mancha 2 de la solución problema y Nelson D. L. y COX M.M. 2014.
valina, ya que arrojaron datos muy Principios de bioquímica de Lehninger.
cercanos, revelando así al aminoácido 6ª. Ed. Editorial Artmed, Pp 170.
que contiene el grupo alfa-terminal de
la proteína de la hemoglobina.

6. Conclusión
1. Preguntas extra
Por lo obtenido en la cromatografía y
los resultados de Rf podemos concluir
que el aminoácido que corresponde al
grupo amino terminal de la
hemoglobina es la valina.

7. Referencias

Programa Educativo Por Qué De los siguientes aminoácidos indicar:


Biotecnología. (2021). El Cuaderno.
Por Qué Biotecnología. ¿Qué aminoácido es?
https://www.porquebiotecnologia.com.
R= Triptófano
ar/el-cuaderno
¿Qué nombre tienen su grupo R?
BOHINSKI R. Bioquímica. 1976.
Fondo Educativo Interamericano. R= Grupos R aromáticos

El grupo R ¿podría reaccionar con el


Lopez-Ramirez S. y Mendoza-Garces DNFB durante la reacción de marcaje?
D. Determinación De Aminoácidos
R= Si, si podría.
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¿Qué aminoácido es? ¿Qué aminoácido es?

R= Lisina. R= Dinitrofluorobenceno

¿Qué nombre tienen su grupo R? ¿Qué nombre tienen su grupo R?

R= Aminoácido N-terminal de los


R= Grupos R cargados positivamente.
polipéptidos.
El grupo R ¿podría reaccionar con el El grupo R ¿podría reaccionar con el
DNFB durante la reacción de marcaje? DNFB durante la reacción de marcaje?

R= No, no podría. R= Si, si podría, pero para pueda


reaccionar debe desprotonarse y para
ello se utiliza un medio básico como el
bicarbonato.

¿Qué aminoácido es?

R= Histidina.

¿Qué nombre tienen su grupo R?

R= Grupos R cargados positivamente.

El grupo R ¿podría reaccionar con el


DNFB durante la reacción de marcaje?

R=No, no podría.

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