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Segunda especialidad en nutrición clínica

nutrigenómica y nutrigenética

Mg.Sc. Ambulay Briceño Johnny


Índice
1. Genoma
2. Gen
3. Nucleótidos
4. Transcripción
5. Traducción
6. Factores de transcripción
7. Regulación de la transcripción y modificaciones
postraduccionales
8. Polimorfismos
Genoma
Toda la información genética en forma codificada contenida en una célula o
virus. Material genético completo de una dotación cromosómica
¿Qué parte del genomas es funcional?

8.2% (1.4% de región codificante y 6.8% de


secuencias que regulan la expresión de genes).
GEN
Un gen es un segmento del ADN que codifica para una proteína.
Unidad funcional, física y funcional, de la herencia, que transmite información de
una generación a la siguiente; tramo de DNA compuesto de una región que se
transcribe y una secuencia reguladora que hace posible la transcripción.
GEN
En termino gen es mas complejo, puesto que algunos genes no codifican para
proteínas, sino que son reguladores y algunos genes dan lugar a más de una
proteína.
GEN
GEN

No todos los genes codifican proteínas, sino que son reguladores y algunos genes dan lugar
a mas de una proteína.
GEN
Nucleótidos
Nucleótidos
Pasos de la transcripción
• Iniciación: unión de la RNA polimerasa a la doble cadena de DNA.

• Elongación: Adición covalente de nucleótidos al extremo 3” de la


cadena polinucleótido, incluye la reunión de la doble cadena de DNA.

• Terminación: Reconocimiento de la secuencia de terminación de la


transcripción y separación de RNA polimerasa.
Gen

La información codificada en el DNA es convertida en la secuencia de aminoácidos de proteínas


mediante u proceso de múltiples pasos.
Recordando

Transcrito
primario

Proteína

Actividad biológica
Formación del cap o casquete

Modificado

Sirva para el reconocimiento del extremo 5 del RNAm en el inicio de la traducción, en


la estabilidad del RNAm y regulación en el transporte para salir del núcleo.
Inserción de la cola de poli-adeninas
En el extremo 3 del RNA se
adiciona aprox. 200-250
nucleótidos de adenina. La
adenilación ocurre si existe
una señal de inserción, una
secuencia (5-AAUAAA-3)
ubicada entre 10 y 30
bases antes del extremo
final 3. La adición de cola
de poli-A le otorga
estabilidad al RNAm
Spling o emplame

Proceso para
eliminar los
intrones.
https://www.youtube.com/watch?v=pdMD6ohp1fM
Factores de
transcripción
Factores de transcripción basales
Son necesarios para que ocurra la transcripción: Proteína
de unión a TATA (TBP); FTIID, FTIIB, FTIIA
Factores de transcripción reguladores
Son específicos para un gen o genes. Se unen activadores, iniciadores o
silenciadores para modular la expresión génica.

1. Sitio de unión al DNA (DBD). Se une a


secuencias especificas del promotor de
un gen, también son llamados elementos
de respuesta.

Ejemplo: El elemento de
respuesta
a glucocorticoides (GRE)
Factores de transcripción reguladores

2. Dominio de
transactivación (TAD)
sitio de unión para
proteínas
correguladoras de la
transcripción; también
se les denomina
factores de activación.
Factores de transcripción reguladores
Dominio de detección de señal (SSD). Detecta
señales externas y las transmite al resto del
complejo de transcripción para la activación o
inhibición de la expresión genética. Por
ejemplo los dominio de unión a ligando(LBD).
Inicio de la transcripción de un promotor de polimerasa II eucariota
Regulación de la
transcripción
Regulación cis
Regiones no codificantes
del DNA que regulan la
transcripción de genes
cercanos. Generalmente
Elementos de
se ubica a 200pb< de respuesta al hierro

sitio de inicio de la
transcripción (regiones
promotores o
enhancers)
Regulación trans
Las responsables de la modificación de
la velocidad son proteínas que trabajan
recíprocamente con las secuencias
reguladoras. A este tipo de regulación
es que se le llama regulación en trans.
Secuencia de genes que codifican

Las proteínas contienen un dominio de


fijación al DNA (reconoce al gen o
genes) y un dominio de acción de
transcripción (efectos positivo o
negativos de la proteína sobre la
transcripción).
Receptores nucleares
Los receptores nucleares son miembros
de una familia de factores de
transcripción. Estos son responsable de
diversas funciones como diferenciación
celular, respuesta inmune inflamatoria,
metabolismo entre otros.

La actividad de lo receptores nucleares


esta afectado por la unión de sus
ligandos o moléculas de señalización
como hormonas, vitaminas, ácidos
grasos, vitamina D y A entre otros.
PPAR, receptores proliferadores de peroxisomas.
SREBP, proteínas de unión a elementos de
regulación de esteroles.
LXR, receptor hepático X
HNF4, factor nuclear 4 de hepatocitos.
ChREBP, proteínas de unión al elemento de
respuesta a carbohidratos.

IRP, proteína de unión de respuesta a hierro


ER, receptor de estrógeno
AR, receptor de andrógeno
VDR, receptor de vitamina D
MTF-1, factor de transcripción de respuesta a
metales.
Traducción y modificaciones
postraduccionales
Código
genético
T
r subunidad 30S

a
FIGURA 11-44. Inicio de
d la síntesis de proteínas
en bacterias
u
c
c
i
ó
IF3 puede evitar que la unidad secundaria grande (50S) se una prematuramente a la
n subunidad 30S; El IF2 es una proteína de unión al GTP requerida para la unión del primer
aminoacil-tRNA; El IF1 estabiliza la unión de la subunidad 30S al mRNA, y evita que el
iniciador aa-tRNA ingrese al sitio equivocado en el ribosoma.
FIGURA 11.47 Representación esquemática de los pasos de la elongación durante la traducción en bacterias
Modificaciones postraduccionales
1. Fosforilación
2. Metilación
3. Acetilación
4. Carboxilación
5. Hidroxilación
6. Glucosilación
7. Acilación y prenilación
8. Plegamiento y reparación de las proteínas
9. Degradación de las proteínas…………>100 modificaciones
Modificaciones postraduccionales
1. Fosforilación: proteínas cinasa con uso de ATP
2. Metilación: Generalmente en Lys y Glu se adiciona metilos a partir del SAM por
metiltransferasas.
3. Acetilación: N terminal de las proteínas. Lo lleva a cabo la acetil transferasa con la
adición de acil acetil-CoA
Modificaciones postraduccionales
1. Carboxilación: incorpora grupo carboxilo por la enzima carboxilasa.
2. Hidroxilación: Realizado por la hidroxilasas (lys-OH, pro-OH)
3. Glucosilación: unión de oligosacáridos a los aminoácidos de las
proteínas (receptores de membrana)
Modificaciones postraduccionales
1. Degradación de las proteínas
Alelos
Una de las diferentes formas de un gen que
puede darse en un locus simple.
• Alelo mutante: alelo
que difiere del alelo
estándar o silvestre.

• Alelo nulo: alelo cuyo


efecto molecular es la
ausencia del producto
génico normal o cuya
consecuencia fenotípica
es la desaparición de la
función normal.
Genotipo
Composición alélica especifica de una
célula, bien referida al total de su genoma
o, mas comúnmente , a un gen o conjunto
de genes. (Griffiths et al., 2000).

Conjunto de la información genética almacenada en


el ADN de un organismo particular, cuya totalidad en términos
de especie compone el genoma. O dicho de otra forma: cada ser
vivo posee un genotipo específico, que es el total de la
información genética albergada en sus células; pero el
genotipo de toda la especie constituye el genoma humano.
https://concepto.de/genotipo/#ixzz6qtPYRupX
Fenotipo
Todos los genes Medio
de un individuo FENOTIPO
ambiente
(genotipo). Características observables
de un organismo.

El ambiente puede cambiar a través del tiempo, con lo


cual su acción sobre los genes también cambia, que se
traduce en una modificación del fenotipo (variabilidad
genotípica y fenotípica).
MEDIO AMBIENTE
El impacto del medio ambiente puede ser:

EXTERNO INTERNO

Temperatura
DIETA
Cantidad de luz
Humedad ambiental
Gases contaminantes
Presión atmosférica, otros
MEDIO AMBIENTE
El medio ambiente puede actuar en tres niveles: sobre el DNA, sobre los
RNAs y sobre las proteínas, con implicancias en un rasgo genético visible.

DNA RNAs proteínas


Polimorfismo genético

Aprox. el 99.9% de la secuencia del ADN de 2 individuos diferentes es la misma.


Una proporción significativa de las diferencias encontradas en los individuos, es
decir, sus diferencias fenotípicas y/o susceptibilidades a ciertas enfermedades,
radica en el 0.1% de variación (polimorfismos genéticos).
Polimorfismo genético
Es una variación en la secuencia de un lugar determinado del DNA entre los
individuos de una población.

Presencia en una población (o entre poblaciones) de varias formas fenotípicas debidas a


distintos alelos de un gen o a distintos homólogos de un cromosoma.
Tipos de polimorfismo
Polimorfismo de un solo nucleótido (SNP).

Los polimorfismos de nucleótido


único (SNP) son un tipo de
polimorfismo que producen una
variación en un solo par de bases.
Los científicos están estudiando
cómo los polimorfismos de
nucleótido único, o SNPs
(pronunciado "snips"), en el
genoma humano se correlacionan
con enfermedades, con la
respuesta de los fármacos, y con
otros fenotipos.

https://www.genome.gov/es/genetics-glossary/Polimorfismos-de-nucleotido-%C3%BAnico
Tipos de polimorfismo
Polimorfismo equilibrado.
Polimorfismo genético estable que se mantiene así por selección natural.

Polimorfismo de secuencias cortas


(SSLP). Variación en el número de
repeticiones de un tramo corto de
DNA (microsatélites y mini
satélites) presente en un mismo
locus de distintos cromosomas
homólogos; lo heterocigotos para
ese locus constituyen marcadores
útiles en la cartografía genómica
(Griffiths et al., 2000).
Tipos de polimorfismo
Polimorfismo del tamaño de fragmentos de restricción (RFLP)
En algunas posiciones cromosómicas, una sonda molecular detecta a veces diferentes tamaños o
números distintos de fragmentos de restricción (como consecuencia normalmente, de la presencia o
ausencia de puntos de cortes de la enzima correspondiente). Esta situación es llamado RFLP. En un
individuo heterocigoto para tal diferencia cromosómica, esa región puede usarse como marcador en la
cartografía genómica (Griffiths et al., 2000)

https://www.news-medical.net/life-sciences/Restriction-
Fragment-Length-Polymorphism-(RFLP)-Technique-
(Spanish).aspx
SNP

https://www.youtube.com/watch?v=h2gO-FfS-8o

https://www.youtube.com/watch?v=UfWPyaQ4bm8
Referencias
• Griffiths A, Gelbart W, Miller J, Lewontin R. Genética moderna.
McGraw-Hill-Interamericana S.A.U. España, 2000.
• Wallace JI. Biología celular y molecular. Conceptos y
experimentos. Octava edición. McGraw-Hill Interamericana
Editores. S.A. México, 2018.
• Gordillo D, Gordillo E. Nutrición molecular. McGraw-Hill
Interamericana Educación. México, 2015.

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