Universidad Nacional de San Luis

Biotecnología vegetal 2020

Licenciatura en biotecnología.

Guía de estudio

Tema: control de la transcripción en plantas.

Las plantas comparten una herencia común de regulación transcripcional con todos los eucariotas. Por
lo que en cuanto a la estructura del promotor y mecanismos de activación de la transcripción tienen
características similares. La siguiente guía tiene como objetivo que indagues y puedas incorporar los
principales conceptos sobre la regulación de la transcripción en plantas y algunas de sus diferencias
respecto a otros organismos eucariotas.

1) Define y desarrolla los conceptos de:

a) promotor, promotor mínimo o núcleo del promotor (core promotor) y factores generales de la
transcripción.
 Promotor: es una secuencia especifica de DNA localizada justo donde se encuentra el punto
de inicio de la transcripción del DNA y contiene la información necesaria para activar o
desactivar el gen que regula. Aunque la estructura de los promotores es dispar, se pueden
definir 3 elementos esenciales de estos: promotor basal o mínimo, elementos proximales y
elementos distales. Es entonces que podemos pensar que el promotor es como un andamio
que regula la actividad génica especificando el tipo y la disposición física de las proteínas
que se ensamblan para la transcripción

 Promotor basal o mínimo: es la mínima secuencia de DNA en dirección 5´ de un gen que

determina el sitio de inicio de transcripción. Es una estructura compleja cuyos elementos
son reconocidos por factores generales de transcripción, entre esos elementos se encuentra
la caja TATA , la secuencia iniciadora Inr el cual determina el inicio de transcripción, y el
elemento de respuesta al TFIIB (BRE) para orientar el promotor y DPE
 Factores generales de transcripción: son proteínas que se une a secuencias específicas de
ADN, controlando así la transcripción de la información genética de ADN a ARNm. Estos
factores de transcripción pueden trabajar solo o en conjunto con otros complejos proteicos
promoviendo o silenciando la transcripción llevada a cabo por la RNA polimerasa II a genes
específicos. Hay dos clases principales de factores de transcripción, unos son los GFT o
factores de transcripción general y son los que regulan la expresión de la mayoría de los
genes y los transactivadores que son los que regulan subconjuntos específicos de genes.
 BRE (TFIIB recognition element), secuencia reconocida por el factor de inicio de la
transcripción TFIIB. Existen secuencias similares descritas en arqueas,
 Caja TATA o caja Goldberg-Hogness,8 elemento reconocido por la proteína de unión a la
caja TATA o TBP (de TATA binding protein). Posee cierta homología con la caja de
Pribnow, propia de procariotas,
 Inr o iniciador, que alberga al punto de inicio de la transcripción y al cual se une el
factor TFIID, y, probablemente, la propia ARN polimerasa II,
  DPE (Downstream promoter element), o elemento aguas abajo del promotor, reconocido
por TFIID.
Sin embargo, existen secuencias denominadas secuencias reguladoras que están implicadas en la
agilización del proceso de transcripción. Estas generalmente están ubicadas upstream respecto del
promotor mínimo y son de naturaleza diversa y se agrupan en diversas categorías, según su
estructura y actividad estimuladora o inhibidora.

 elementos proximales al promotor

 secuencias activadoras situadas aguas arriba
 enhancers
 silenciadores 
 elementos frontera 
 elementos de aislamiento
Los tres primeros elementos son activadores, y los tres últimos, represores del proceso.

 https://www.sebbm.es/BioROM/contenido/av_bma/apuntes/T11/RPii.htm

b) Indiquen las principales diferencias en plantas respecto de otros eucariotas.

Una de las diferencias principales en plantas respecto de otros eucariotas es que el promotor
mínimo de las plantas contiene los elementos TATA e Inr, pero parece carecer de otros motivos
como el DPE y BRE.

Otra de las

2) Explica cuál es la diferencia entre un “factor de transcripción general” y un “factor de

transcripción”.

La luz es un factor ambiental clave que regula el crecimiento y desarrollo de las plantas. Estas han
desarrollado mecanismos para detectar la presencia, ausencia, duración, intensidad y longitud de onda
de la luz. Los fitocromos y los factores que actúan en sus vías de señalización, median respuestas a la luz
en estos organismos. Indague y explique brevemente:

3) mecanismos implicados (ej.: transducción de señales, reconocimiento de secuencias dianas,

cambios conformacionales, interacción de proteínas, etc.) y;
factores de interacción de fitocromo (PIF).
El miembro fundador es PIF 3, este interactúa con los dominios C-terminales de phyA y phyB de
A. thaliana y arroz. Además, también se demostró que interactúa selectivamente con las formas
Pfr. PIF3 mostró mayor afinidad por la forma Pfr del dominio N-terminal (residuos de
aminoácidos 1-645) que el dominio C-terminal no fotoactivo.
Es entonces que PIF3 se nombro como el primer factor de señalización que interactúa con los
fitocromos posicionado para recibir la señal de luz de las moléculas de fitocromo fotoactivadas.
 El segundo miembro de la familia PIF, PIF4. Con el advenimiento de la secuenciación del
genoma, también se identificaron varios otros PIF por homología de secuencia con PIF3, y se
denominaron PIF1, PIF5 y PIF6.
4) describa los elementos (secuencias, elementos reguladores, receptores, factores de
transcripción, etc.) involucrados en la regulación genética mediada por foto-receptores en
plantas.

Los miRNA y siRNA son moléculas relevantes en la biología de las plantas. Por ejemplo, controlan
procesos de desarrollo y brindan inmunidad adaptativa a virus.

5) Describe los mecanismos por los que se forman los “small ARN” y su rol biológico en la
regulación de genes en plantas.

Nota: criterios de evaluación Pertinencia entre la respuesta elaborada y la consigna solicitada.

Elaboración y fundamentación en las respuestas.

www.encuentros.uma.es/encuentros45/factores.html

Promotor mínimo - Wikipedia, la enciclopedia libre