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HUMANA
CURSO 2021/2022 - ULL
Comisión 1
28/09/2021
1. INTRODUCCIÓN
Doble hélice (2 nm)
Descubridores: Watson y Crick
Componentes: Grupos fosfato, azúcares y unas bases nitrogenadas
apiladas perpendiculares a un eje.
Complementariedad: A-T; G-C
2. CROMATINA
Componentes:
Tipos:
- No es homogénea
EUCROMATINA - Cromatina activa
3. COMPACTACIÓN
NIVEL GRADO DE COMPACTACIÓN GROSOR ESTRUCTURA
1 6 veces 11 nm Nucleosoma
2 50 veces 30 nm Solenoide
CARACTERÍSTICAS
- NUCLEOSOMA: Enrollamiento negativo alrededor de un núcleo de 8 histonas (2H2A, 2H2B, 2H3 y 2H4)
Colas ricas en Lys/Arg: fusión cromatina y
mantenimiento estructura
H1: mantenimiento compactación ADN,
Tipos:
1. Nucleosoma basal: octámero de histona → 146 pb
(1 vuelta y ¾)
2. Nucleosoma completo (cromatosoma):
octámero + H1 → 166 pb (2 vueltas)
3. Nucleosoma + ADN linker (tiene entre 8-114 pb)
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- BUCLES/LAZOS:
Estructura presente en: interfase (G1,S y G2)
Interviene (mirar foto): Matriz nuclear y MARs/SARs
4. CENTRÓMERO
Componentes:
- ADN Satélite alfa (presente en todos los cromosomas
humanos): heterocromatina constitutiva; 171 pb repetidas en
tándem. → 1500-3000 copias.
- CAJA CENP-B (secuencia concreta de 17 pb): unión de pp
CENP-B
- CENP-A: histona que sustituye a la H3
Funciones: formación de cinetocoros
5. TELÓMERO
TTAGGG: Secuencia en tándem repetida (2000 repeticiones)
Extremo 3’ protuberante: debido a hebra retardada
- Sustituido por telomerasa: sólo en células madre
- En cls somáticas: acortación de cromosomas
- Forma T-loop (bucle): para proteger el telómero de
degradación; a él se une el complejo de protección del
telómero (POR o Shelteron; 6 pp)
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GENOMA NUCLEAR
1. GENES Y SECUENCIAS RELACIONADAS
CONCEPTOS
Cromosoma: Genes (26%) + ADN
extragénico (74%)
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Los genes más grandes no tienen por qué codificar las proteínas más grandes, porque los intrones influyen el tamaño del gen pero no en el producto
final
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NO PROCESADOS
La cadena duplicada deja de tener presión de expresión selectiva y muta, cuando esto ocurre se inserta en el
genoma como una copia original, posteriormente se darán las mutaciones
PROCESADOS
Reintegración de ADN
complementario (cDNA), en
otra región del genoma.
Durante la transcripción. Cuando el gen se encuentra en forma de AN; se puede formar un ADN
complementario mediante una transcriptasa inversa. Así, el ADN puede insertarse en cualquier parte del
genoma y permanece como como pseudogen (no tiene intrones y secuencias reguladoras)
2. ADN EXTRAGÉNICO
A. ÚNICO O BAJO NÚMEROS DE COPIAS (15%)
2
Solo estan en una zona única de un cromosoma en concreto
3
Pueden evitar la transducción de algunos ARNm a proteínas
4
Esto es lo se pensaba antiguamente, no obstante, se ha comprobado que algunos tienen un función de regulación, mayormente del gen que proviene
(sobre todo en pseudogenes procesados)
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ADN microsatélite (STR) Máx 150pb Polimórficos: Identificación humana: cotejo y paternidad
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No tiene secuencia completa, no puede transponerse
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También tenemos las variantes de tipo indel (inserciones-deleciones) que se presentan cuando a la vez hay
inserciones y deleciones. La persona presenta ausencia de una región o nucleótido, y en su lugar se añaden otros.
GENOMA MITOCONDRIAL
Origen mitocondrias: teoría endosimbiosis (Lynn Margulis)
● Prácticamente no contiene ADN de tipo extragénico (D-Loop), el cual solo se encuentra en un 2% (replicación
del cromosoma mitocondrial en la célula)
● Sus genes no presentan intrones, y codifican funciones relacionadas con la fosforilación oxidativa, la respiración
celular y la traducción
● Su tamaño varía entre organismos: 15-18 kb en animales y hasta 100-2.500 kb en plantas
● Existen 22 genes que codifican para non-coding RNA
● RNA mitocondrial codifica para los genes 12S y 16S del rRNA
● La cantidad de mitocondrias en las células varía dependiendo del tipo de célula de la cual estemos hablando. La
célula que posee mayor cantidad de mitocondrias son los óvulos. Aunque los espermatozoides, las células
nerviosas y las musculares también poseen grandes cantidades de este orgánulos.
1. CROMOSOMA MITOCONDRIAL
Un pequeño pero importante subconjunto de genes
codificados en el genoma humano reside en el
citoplasma de la mitocondria. Los genes
mitocondriales se heredan exclusivamente por vía materna
(línea matrilineal). Las células humanas tienen entre cientos y
miles de mitocondrias que contienen cada una varias copias de
una pequeña molécula de DNA circular, el
cromosoma mitocondrial. Aunque los productos de estos
genes realizan su función en la mitocondria, debe señalarse
que la inmensa mayoría de las proteínas que se
encuentran en la mitocondria son, de hecho, productos
de genes nucleares. Por tanto, una mutación del ADN
mitocondrial sólo será transmitida por las mujeres.
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2.1. MENDEL
● Estudió la herencia biológica mediante experimentos de cruces (en plantas), explicando las observaciones
empleando proporciones matemáticas.
● Formulación de tres leyes de herencia de caracteres
● Responde a la herencia de enfermedades monogénicas
- Enfermedades poco frecuentes (2%)
- OMIM: agrupa a todas las enfermedades humanas heredadas según modelo mendeliano.
- Estas enfermedades principalmente debutan en edad pediátrica (<10% desde la pubertad), cuando el
individuo ya se ha reproducido y deja el alelo defectuoso en su descendencia
2.2. REPASO: CONCEPTOS BÁSICOS DE GENÉTICA MENDELIANA
● Gen: fragmento de ADN (porción de un cromosoma) que contiene información para una característica
● Locus: lugar físico específico que ocupa un gen en el cromosoma (en plural, loci)
● Alelo: cada una de las dos formas alternativas que puede presentar un gen
● Genotipo: conjunto de alelos que posee un individuo diploide, mitad heredados del padre y la otra mitad de la
madre
○ Homocigoto: individuo que para un carácter posee dos alelos iguales (Ej.: AA o aa)
○ Heterocigoto: individuo que para un carácter tiene los dos alelos distintos (Ej. Aa o Bb)
En algunos rasgos genéticos el ambiente juega un papel fundamental. Ej: tendencia al colesterol alto.
ANEMIA FALCIFORME
Gen: HBB (hemoglobin subunit beta)
- Localización: 11p15.4 (brazo corto del cromosoma 11).
- Número de exones: 3
- Longitud: 1506 pb (gen), 628 nt (mRNA), 147 aa (proteína)
- Variantes patogénicas: 258
Variante (SNP): NM_000518.5:c.20A>T (p.Glu7Val). En la posición 20 se cambia adenina por timina (genética
transversión).
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GENÉTICA TRANSVERSIÓN: siempre que cambiamos bases diferentes (púnicas por pirimidínicas, ó viceversa)
hablamos de genética transversión
GENÉTICA DE TRANSICIÓN: si cambiamos bases de la misma naturaleza (púrica por púrica, pirimidina por
pirimidina), hablamos una genética de transición
Genotipos (fenotipos) en la población: con dos alelos se pueden generar tres fenotipos
- AA (normal)
- AT (normal
- TT (talasemia, anemia falciforme)
Por tanto, sólo si el individuo es homocigótico presentará la anemia.
En el caso de dos individuos heterocigóticos (AT y AT), obtendremos 3 tipos de genotipos diferentes y 2
fenotipos (el 75% de los individuos serán normales y el 25% presentará la enfermedad):
- ¼ AA (normal)
- ½ AT (normal)
- ¼ TT (anemia falciforme)
En el caso de tener dos individuos diheterocigóticos: AT/NF y AT/NF. El hombre podrá tener 4 gametos
distintos (AN, TF, AF y TN) con una proporción del 25% cada uno, y lo mismo pasará con la mujer.
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Comisión 4
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SIMBOLOGÍA DE PEDIGRÍES
Los pedigríes son empleados en situaciones de consejo genético o cuando se desea rastrear una familia para
conocer de dónde proviene un alelo defectuoso.
SEXO: hombres en cuadrados, mujeres con círculos y personas con sexo no conocido con rombos
COLOR: individuo afectado se pinta la figura, no afectado no se pinta
CON PUNTO: portador obligado (no padece la enfermedad pero si uno de los alelos que la produce)
CON LÍNEA VERTICAL: portador asintomático
NÚMEROS: en genealogías muy grandes
CON LÍNEA OBLICUA: persona fallecida
PROBANDO (“p): persona con la cual se empieza el estudio de toda su familia para determinar de dónde proviene el
alelo
SIGNO DE INTERROGACIÓN: historial desconocido
FAMILIAS: con letras romanas se enumeran las generaciones
ADOPCIÓN: entre corchetes y con una línea discontinua, y se liga con una raya continua a sus padres biológicos
GEMELOS: si son idénticos se le pone una línea que los une entre sí, sino no se representaría dicha línea. En caso de
que no se sepa, se señala con una interrogación.
CONSANGUINIDAD: dos líneas entre sí a personas que son consanguíneas (parientes naturales de otra por descender
de los mismos antepasados)
Características
- El fenotipo aparece igualmente en hombres y mujeres (autosómico) y suele saltar generaciones
- Normalmente, los individuos afectados suelen tener padres no afectados
- Si ambos padres están afectados, todos sus hijos también lo estarán. Aunque existen excepciones (por ejemplo,
la sordera es autosómica recesiva pero aunque los progenitores la padezcan, pueden tener hijos que oigan)
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Comisión 4
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07/10/2021
ENFERMEDADES
HAPLOINSUFICIENCIA ACONDROPLASIA COREA DE HUNTINGTON
(HIPERCOLESTEROLEMIA) (ENANISMO)
Una sola copia del gen normal es Una sola copia del gen mutado Una sola copia del gen mutado
incapaz de producir proteínas en produce receptores que presentan produce proteínas con una nueva
cantidades y calidad suficiente para activación constitutiva en ausencia función tóxica para la célula.
de ligando.
asegurar la función normal.
Mutación en el gen LDLR: low density Mutación en el gen FGFR3: fibroblast Mutación en el gen HTT: huntingtina
lipoprotein receptor growth factor receptor 3 - Localización: 4p16.3 (brazo
- Localización: 19p13.2 (brazo - Localización: 4p16.3 (brazo corto del cromosoma 4)
corto del cromosoma 19) corto del cromosoma 4) - Número de exones: 67
- Número de exones: 18 - Número de exones: 19 - Longitud: 169279 pb (gen);
- Longitud: 44468 pb (gen); - Longitud: 15573 pb (gen); 13498nt (mRNA); 3144 aa
5292nt (mRNA variante 1); 860 4310nt (mRNA variante 3); 808 - Variantes patogénicas: 88
aa (isoforma 1) aa (isoforma 3)
- Variantes patogénicas: 1476 - Variantes patogénicas: 146
PROCESO: En su funcionamiento normal, PROCESO: en casos normales el receptor PROCESO: el triplete inestable2 suele
el receptor se coloca en la superficie de inhibe la proliferación de condrocitos a extenderse más de lo debido, sobre todo
las células (hepatocitos), y se internaliza partir del cartílago cuando recibe una en la espermatogénesis masculina
con una vesícula conteniendo la molécula señal (placa de crecimiento en los (dando lugar a numerosas repeticiones
de LDL para regular sus niveles en huesos). La mutación provoca que el en generaciones futuras). Es decir, a
sangre. Así pues, una vez que el receptor esté continuamente activado, medida que se expande, la enfermedad va
endosoma está dentro se libera el por lo que el individuo no crece a ir a peor y aparecerá antes (fenómeno
colesterol junto a otras moléculas. La (inhibición del crecimiento de la placa) de anticipación).
disminución del número de receptores1 Si fuera la mujer la afectada no hubiera
LDL provoca un aumento de colesterol en extensión, o sí, pero mucho menor que en
sangre, ya que se incorporan menos varones portadores afectados.
partículas de LDL a la célula (para los
heterocigóticos los niveles de colesterol
son 2 veces mayor, y homocigóticos hasta
6 veces mayor).
Si un individuo recibe una de esas
mutaciones patogénicas, tendrá la mitad
de receptores en la superficie
1
Las estatinas aumentan el nivel de receptores y por tanto, disminuye los niveles de colesterol
2
Las repeticiones normales de este triplete son de 9–36 copias y es patológico cuando están en el rango de 37–121 copias, lo cual
provoca que la huntingtina adquiera una nueva capacidad de agregar
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Comisión 4
07/10/2021
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Comisión 5
11/10/2021
● Gen COL1A1: collagen type I alpha 1 chain Mutaciones: una Gly es cambiada por una Cys o una Ser
○ Localización: 17q21.33 (suelen ser compactadas, no al azar). La hélice de glicina
○ Número de exones: 51 central del colágeno se ve afectada. Esto provoca que las
otras hélices tampoco se puedan compactar
○ Longitud: 17553 pb (gen); 5927nt
correctamente a pesar de que estén correctamente
(mRNA); 1464 aa fabricadas.
○ Variantes patogénicas: 312 ● Efecto Dominante Negativo: defectos
● Colágeno normal: triple hélice estructurales en colágeno tipo I. Se fabrica pero
con una cadena alfa 2 y dos mal
alfa 1. ● Adquiere osteogénesis
imperfecta de tipo I
(predisposición a la
fractura de huesos
incluso traumas leves)
● Deformidades
esqueléticas
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Aumento de dosis génica debido a una incorrecta alineación de los cromosomas.
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Comisión 5
11/10/2021
Ocurre en un estadio muy temprano del desarrollo, ya que al principio los embriones tienen gónadas bipotenciales.
Dependiendo de los cromosomas del gameto, las gónadas se desarrollan según el sexo correspondiente:
XX XY
- No poseen el gen SRY. Esto favorece la - El gen SRY (solo se activa en este momento a lo
fabricación del factor FOXL2 largo de la vida) activa la transcripción de
- La corteza se transforma en ovarios que ciertos genes en cascada hasta estimular la
producen hormonas que estimularán la formación de las gónadas masculinas, generando
formación de los genitales femeninos. mayor producción de testosterona y bloqueando
- El gen RSPO1 activa la cascada femenina de los genes de la vía femenina
genes y estos desarrollaran las gónadas - La AMH (hormona antimulleriana) impide el
femeninas y bloquearan las masculinas. desarrollo de los conductos de Muller. Por tanto
- FGF9, SRY y CYP26B1 inhiben el desarrollo de se desarrollan los de Wolf
esta vía - WNT4, RSPO1 Y FOXL2 inhiben el desarrollo de
- También actívate WNT4, que activa un ruta de esta vía
deseñalización (beta-Catenina)
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Comisión 5
11/10/2021
GENES COMPARTIDOS 27 genes del Y que codifican proteínas de los cuales 20 genes son homólogos en
el X.
En el cromosoma X (brazo) existe, un centro de inactivación del X (XIC). En esta región hay una serie de tránscritos:
- XIST = transcrito específico para inactivar. Se queda en forma de molécula de ARNm larga, no se traduce
(long non coding RNA), madura y se coloca a lo largo del cromosoma X que se va a inactivar, y traerá
maquinaria epigenética modificadora de las histonas que van a cerrar la cromatina, y que compactarán el
ADN. Se le añadirá la histona Macro 2A
- TSIX = transcrito que aparece en el cromosoma ACTIVO. ARNm antisentido del XIST (se transcriben en
cadenas diferentes/complementarias)
Conceptos:
- INTENSIFICADOR/ENHANCER: son secuencias de DNA a las que se le unen proteínas que estimulan la
expresión génica y, por tanto, sintetice más RNA. Suelen estar cerca de genes específicos.
- AISLADOR/INSULATOR: hace lo contrario, cuando se les unen proteínas bloquean a las proteínas que se
unen a los intensificadores, luego no favorecen la expresión génica.
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Comisión 5
11/10/2021
1) Recuento de cromosomas, si hay dos se inactiva 1) Recuento de cromosomas, si hay dos se inactiva
uno uno
2) El insulator está metilado (reprime su 2) Insulator no está metilado
transcripción) 3) Esta región al actuar como aislador se le une la
3) TSIX se inactiva proteína CTCF que hace que el amplificador o
enhancer (lo bloquea) no active XIST
4) XIST está activado por el amplificador y se
4) Se transcribe TSIX
transcribe a la derecha. (Cuando se expresa, se
genera un RNA que va a recubrir todo el
cromosoma y va a reclutar proteínas que
compactan el DNA.)
Las mujeres con un solo cromosoma X desarrollan el síndrome Turner. ¿Por qué razón?
Hay genes que se escapan de la inactivación X, es decir, no se inactiva el 100% de los genes de dicho cromosoma.
En condiciones normales de desarrollo:
● Se inactivan un 75% de los genes presentes en X
● 15% escapa totalmente a la inactivación → Homólogos en Y. Doble dosis génica en mujeres para evitar el
síndrome, y doble dosis génica en el sexo masculino para contraerlo.
● 10% se inactivan parcialmente (en estudio). Parece ser que entre las mujeres somos más diversas, ya que no
activamos los mismos genes. Ni siquiera en todos los tejidos es igual.
Por lo tanto, una mujer con el síndrome le falta la dosis génica que no se inactiva, ese 25 % de doble dosis génica (de ahí
que sean estériles).
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Comisión 5
11/10/2021
Las personas con aneuploidías de los cromosomas sexuales nacen y se desarrollan gracias al mecanismo de inactivación
de las células
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Número incorrecto de cromosomas (más o menos de 46). Las aneuploidías de los cromosomas sexuales están más permitidos en la naturaleza, con
respecto a las de los autosomas (sólo en el Síndrome de Down los individuos pueden sobrevivir). Trisomías, monosomías no sobreviven.
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Comisión 6
14/10/2021
1.CONDICIONES INTERSEXUALES
a. Trastorno del desarrollo sexual (DSD, disorders of sex
differentiation).
- Definición: individuos en los que hay discordancia
entre cromosomas, gónadas, genitales internos y
externos, y el sexo que muestran o en el que han
sido criados.
- Frecuencia: 1/ 20.000 nacimientos
- Causa: ocurre porque sigue una distribución
incorrecta en la recombinación de los
cromosomas paternos.1
b. Gónadas y genitales
Puede tener cromosomas XX, cromosomas XY o ambos.
- Doble Gónada: Los individuos presentan a la
Los genitales externos pueden ser ambiguos o pueden
vez ovarios y testículos diferenciados.
tener apariencia masculina o femenina. ... Incluyen,
- Genitales internos:
entre otros, 45, XO (solamente un cromosoma X) y 47
- Trompa y útero en el lado del ovario.
XXY, 47, XXX - ambos casos tienen un cromosoma sexual
- Conducto deferente, próstata y vesícula
adicional, sea un X o un Y.
seminal en el lado del testículo.
- Alternativamente gónadas que contienen una
mezcla de tejido ovárico y testicular (ovotestes)
- Genitales externos ambiguos con tendencia a la
virilización.
- Talla normal.
- Cuerpo “musculado” o femenino
¿Qué se hace ante estas situaciones? Esperas a que el individuo sepa su identidad para realizarle una
reconstrucción genital, si ese es su deseo. Sino esperas, la persona a lo mejor no se indentifica con el sexo asignado por
operación (de unos gilipollas) al nacer.
1
El cromosoma X e Y recombinan por la región PAR, a veces ocurre mal porque se alinean incorrectamente y debido a ello se produce
el traslado del gen SRY desde el PARs del cromosoma X materno hacia el cromosoma X paterno. Así, el nuevo individuo será XX pero
también tendrá el gen SRY, lo que dará rasgos y características de ambos sexos
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Comisión 6
14/10/2021
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Fallo en el gen que sintetiza para la percepción color rojo y verde.
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Recuerda: no hay transmisión de un padre afectado a un varón porque los individuos heredan el cromosoma Y de dicho sujeto. Este defecto va
ligado al cromosoma X, no al cromosoma Y.
4
Incluso pueden no presentar la enfermedad (mecanismo de inactivación del cromosoma X)
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Comisión 6
14/10/2021
●
Afectación del gen LHCGR (cromosoma 2:
autosoma): codifica para el receptor de la
hormona luteinizante (LH).
● Mutación p. D578G (ganancia de función)6.
Provoca que el receptor esté continuamente
activado cuando solo debería estar activado por la
hormona LH.
Otro ejemplo: la acondroplasia (gen XIX)
CUESTIÓN PRÁCTICA
PREGUNTA: Si el padre fuera homocigótico para el alelo recesivo (pp) y la madre heterocigótica (Pp), ¿cuál
sería el fenotipo esperado para los descendientes varones o hembras?
RESPUESTA: La mitad de los hijos varones tendrán la enfermedad y serán portadores, mientras que ninguna
hija tendrá la enfermedad pero la mitad serán portadoras. Tanto los hombres como las mujeres pueden transmitir la
enfermedad, pero sólo los varones la padecerán
6. HERENCIA PSEUDOAUTOSÓMICA
Características: Genes que se hallan en las regiones
pseudoautosómicas (PAR1 y PAR2) de los cromosomas sexuales, y
actúa como herencia autosómica dominante. Son rasgos codificados
por genes ubicados en las regiones homólogas de los cromosomas
sexuales (X e Y), y por tanto, tanto mujeres como hombres tendrán
dos copias del gen
5
Se escribe A y c pequeña porque dependiendo del sexo será dominante o recesivo. La calvicie se puede heredar de la madre y/o del padre
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P: proteína; D: aspartato; G: glicina. REPASAR LOS AMINOÁCIDOS
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Comisión 6
14/10/2021
El varón señalado con la flecha no concuerda con una enfermedad X dominante, ya que un padre enfermo NO puede
transmitir la enfermedad a su hijo. Por esto sabemos que es una herencia pseudoautosómica.
Se comporta como una herencia autosómica normal, pero la llamamos pseudo ya que la mutación está en los cromosomas
sexuales.
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Comisión 7
19/10/2021
Enfermedades de dominancia parcial en humanos: son muy raras en humanos porque normalmente el individuo
heterocigoto tiene un alelo más suave que uno homocigótico. Ej: hipercolesterolemia familiar (individuos
heterocigóticos con la mitad de receptores de LDL y homocigóticos sin ellos)
HIPERCOLESTEROLEMIA FAMILIAR
NOTA: Las estatinas no están relacionadas con el receptor del colesterol. Las estatinas bloquean la síntesis endógena
del colesterol.
SOBREDOMINANCIA
La sobredominancia tiene lugar cuando individuos heterocigotos para un locus presentan una mayor eficacia
biológica que individuos homocigotos para ese mismo locus.
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Comisión 7
19/10/2021
CODOMINANCIA
Los individuos heterocigóticos se distinguen de los homocigotos y su fenotipo muestra características de ambos
homocigóticos. Por tanto, el organismo presentará ambos fenotipos sin mezclar.
A Su glicosil transferasa puede meter un residuo de Entre estos genes el A domina sobre i (0). B
N-acetil-galactosamina. Este residuo de azúcar se pondrá en el dominante sobre i (0). A=B Codominante
antígeno 0 que se encuentra en la superficie del eritrocito.
Genera el antígeno A Con un gen de tres alelos podemos formar seis
genotipos
B Su glicosil transferasa puede meter un residuo de galactosa. La
galactosa se une al antígeno O formando el antígeno B. Individuos AB: mostrará los dos antígenos en
la superficie del eritrocito
C Su glicosil transferasa no es funcional, por lo tanto, no serán
capaces de poner en la superficie del eritrocito esos
determinantes antigénicos.
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Comisión 7
19/10/2021
DONACIÓN
O A, B y AB (donante universal) O
A A y AB AyO
B B y AB ByO
AB AB O, A, B y AB (receptor universal)
NOTA: los genes con alelos múltiples son muy comunes en la población, y en los genes que se estudian.
ALELOS LETALES
Son aquellos que causan que el gen no sea funcional o que tenga una actividad anormal y dañina.
Ocasiona que sea imposible o muy improbable obtener un organismo vivo con un genotipo homocigoto (o, en algunos
casos, incluso heterocigoto). Esto provoca una alteración de las proporciones esperadas de fenotipos a partir de un
determinado cruce.
NOTA. También existen alelos letales recesivos, como es el caso de consanguinidad familiar. El cruce entre, por ejemplo,
primos y hermanos podrá dar lugar a homocigosis de dichos alelos → individuos con anomalías muy graves o que no
nacen directamente.
1
Fundamental en el estadio de desarrollo, y una alteración que provoque su no expresión de manera no deletérea (AA) es
incompatible con la vida. Aunque en los acondroplásicos también existe la expresión de este receptor en su forma normal, y en su
forma deletérea activada constantemente → enfermedad y características propias
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Comisión 7
19/10/2021
PENETRANCIA
Proporción de individuos en una población que manifiestan el fenotipo correspondiente al genotipo que presentan.
Penetrancia (P) = (Nº individuos fenotipo esperado / Total individuos) x 100
EXPRESIVIDAD VARIABLE
Grado de expresión individual de un fenotipo para un genotipo determinado. Un gen tiene expresividad variable
cuando distintos individuos con un mismo genotipo manifiestan el fenotipo con una gravedad o nivel diferente.
NO CONFUNDIR EXPRESIVIDAD CON PENETRANCIA: La expresividad tiene una penetrancia del 100% pero se
expresa de manera diferente, mientras que en la penetrancia el gen se expresa o no se expresa.
NOTA: la expresividad variable y la penetrancia incompleta se pueden combinar en un mismo gen.
FENOCOPIAS
Modificación fenotípica producida por condiciones ambientales que origina un fenotipo similar o igual al producido
por un genotipo o condiciones genéticas específicas, no es enfermedad hereditaria.
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Comisión 7
19/10/2021
HETEROGENEIDAD GENÉTICA
TIPOS EJEMPLOS
Heterogeneidad de locus: variantes en genes distintos causan Hemocromatosis: enfermedad del metabolismo
el mismo fenotipo o enfermedad. del hierro, que se acumula en distintos órganos y
causa fallos.
Existen varias entradas de genes en el OMIM:
- HFE1 (recesiva)
- HFE2A (recesiva)
- HFE2B (recesiva)
- HFE3 (recesiva)
- HFE4 (dominante)
- HFE5 (dominante)
Heterogeneidad alélica: distintos alelos del mismo gen Retinitis pigmentosa: grupo heterogéneo de
originan condiciones distintas, pero clínicamente similares. Cada enfermedades oculares que cursan con
alelo genera un fenotipo diferente, depende del tipo de mutación degeneración progresiva de la retina. Muchísimos
que tenga en el gen en concreto. Variantes en un mismo gen genes implicados, con distintos patrones de
causan distinto fenotipo herencia: autosómica recesiva, herencia
autosómica dominante o ligada al X.
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Comisión 8
21/10/2021
COMPLEMENTACIÓN
HETEROGENEIDAD GENÉTICA DE LOCUS. Mutaciones en distintos genes provocan la misma enfermedad.
NOTA: Si dos personas diheterocigóticas se cruzan, la posibilidad de tener un hijo sordo es de 1/16
Distintos alelos del mismo gen originan condiciones distintas, pero clínicamente similares
EJEMPLOS
Mutaciones en el gen Existen más de 120 mutaciones en SERPINA1, algunos de pérdida de función.
SERPINA1 y deficiencia Al menos 30 alelos conllevan niveles de ATT más bajos o ausentes → Enfisema
de la pulmonar y/o hepatopatías. En casos muy raros se produce paniculitis (alteración de
alpha-1-antitripsina1 la capa grasa subcutánea de la piel).
(AAT)
Mutaciones en el gen Existen más de 1.800 mutaciones distintas del gen CFTR.
CFTR2 y fibrosis quística Manifestación más frecuente: enfermedad pulmonar grave y progresiva, insuficiencia
pancreática, ausencia congénita de conductos deferentes en varones.
Otras manifestaciones (diversidad de fenotipos): afectación pulmonar con función
pancreática normal o únicamente alteraciones del tracto reproductor masculino.
1
Enzima fundamental. Función protectora: evita que las infecciones de los patógenos se vuelvan peores y más crónicas. Se sintetiza en el hígado (sino
se metaboliza bien puede formar precipitados → hepatopatías).
2
Muy importante para regular la entrada de cloro y el crecimiento celular (sobre todo en el epitelio pulmonar).
1
Comisión 8
21/10/2021
Tema 3.2
PLEIOTROPÍA
Efecto de un único gen en la expresión de múltiples características
CAUSAS EJEMPLO
1. La expresión de un solo gen puede afectar Variante en el gen PAH3. En individuos con las dos
diferentes funciones en la cél. Ej. Un defecto en copias defectuosas del gen se producirá: fenilcetonuria
una proteína del microtúbulo puede afectar la (acumulación de fenilalanina), ojos azules y piel clara
división celular y el movimiento celular. (ausencia de melanina), retraso mental y fallos en el SN
2. Un gen puede expresarse en diferentes tipos (afectación al SN y neurotransmisores).
de células. Ej. un gen puede expresarse en una
cél. muscular y también una cél. nerviosa. Importancia de la tirosina
3. Un gen puede expresarse en diferentes etapas Precursor fundamental de neurotransmisores como la
del desarrollo. Ej. Un gen puede expresarse dopamina y de la melanina, lo que explica el fenotipo
durante el desarrollo embrionario y también en el presentado en la fenilcetonuria.
tejido adulto.
Si el individuo tuviera un alelo normal en En condiciones normales el gen A que codifica a x enzima produciría el intermediario y el
cada gen de la enzima que participa en la ruta, gen B generaría otra enzima y obtendría el producto final.
esta se llevaría a cabo correctamente. Pero en caso de mutación el gen aa no funciona por lo tanto no produce la enzima, con lo
cual no hay intermediario y el gen B no puede actuar.
EJEMPLO
3
Fenilalanina-hidroxilasa: cataliza el paso de fenilalanina a tirosina
2
Comisión 8
21/10/2021
ANTICIPACIÓN GÉNICA
Aparición de una enfermedad a edades cada vez más tempranas y con síntomas más graves dentro de una misma
familia, debido a expansión de trinucleótidos.
Ej.: Corea de Huntington (meiosis masculina) o síndrome del X-frágil (ligada al “ X dominante”, meiosis femenina)
Expansión de trinucleótidos
¿Por qué se expande tanto ? Estas repeticiones (micro
satélites) son complicadas de replicar por el ARN
polimerasa. Debido a que la cadena de nueva síntesis es
propensa a formar bucles (deslizamiento y estabilización
de las hebras durante la replicación generando
inserciones), provocando un aumento del nº de
repeticiones
Estas regiones son puntos calientes.
4
Transferasa coloca la N-acetilgalactosamina en su centro activo.
5
Colocación del residuo de azúcar (galatosa) en su centro activo.
6
Que seamos A ó B depende del residuo de azúcar.
7
Síndrome ovárico ligado a X-frágil: mujeres se vuelven menopáusicas prematuramente, sus ovarios son similares a los de una persona mayor.
Suelen tener infertilidad.
8
Síndrome de ataxia o temblor asociado al síndrome de X frágil: presenta movimientos descontrolados similares a el Párkinson.
3
Comisión 8
21/10/2021
EJEMPLO PRÁCTICO
Varón presenta premutación (70). Los hijos heredan el
70 del padre y 29 o 30 de la madre.
¿Por qué esto es así? Hipótesis solo aplicable para estos genes importados
IGF2 (factor de crecimiento de insulina) contribuye al desarrollo del embrión en su plenitud. El H19 es un inhibidor
del crecimiento (molécula de RNAm que regula la expresión del genoma, long coding RNA).
En el caso de que el cromosoma venga del padre, lo que le interesa es que se exprese IGF2 para que el bebé salga
robusto incluso a expensas de la madre. El femenino le interesa que el bebé nazca pero tampoco morirse en el parto,
por lo que el objetivo es que el embrión crezca con un tamaño compensado para seguir trayendo individuos.
9
Región de control de imprinting.
4
Comisión 9
26/10/2021
El gen H19 es un long-non-coding DNA que tiene funciones de supresión del crecimiento, mientras que el IGF2 favorece
el crecimiento.
TEORÍA DEL GEN EGOÍSTA: Un gen egoísta de origen paterno se interesará por un buen desarrollo del bebe. Sin
embargo, un gen egoísta desde el punto de vista materno tiene como prioridad la propagación y descendencia, por lo
que frena el crecimiento del embrión.
2. IMPRONTA GENÉTICA: PRADER-WILLI Y ANGELMAN
Región 15q11→ Región de control del imprinting
SÍNDROME DE PRADER-WILLI
Falta de expresión de los genes específicos del
cromosoma paterno tras deleción.
- Síntomas: obesidad, hipotonía muscular,
retraso mental, hipogonadismo,
hipopigmentación, baja estatura, rasgos
dismórficos.
SÍNDROME DE ANGELMAN
Falta de expresión del gen UBE3A específico del
Genes improntados (expresión de una copia en cada cromosoma materno.
cromosoma, una única dosis génica): En el cr paterno el - Síntomas: retraso mental grave, temblor,
centro de control está abierto (los genes pueden ataxia, marcha anormal, tendencia a la risa,
expresarse) pero el gen UBE3A está cerrado. En el cr trastorno del sueño, convulsiones.
materno el centro de control está cerrado y el UB3A está
abierto.
1
Se expresa el cromosoma materno o paterno, pero no los dos.
2
No es la condición general en los genes, lo normal es que cada gen exprese una copia materna y otra paterna.
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Comisión 9
26/10/2021
3. MOSAICOS
Son alteraciones postcigóticas que producen dos o más líneas celulares
genéticamente diferentes. Cuando tiene lugar la mutación de una de las
cél, todas las cél resultantes van a adquirirla, generando individuos
mosaicos (cél normales y mutadas).
En este caso podemos asumir que ocurre una mutación de ENFERMEDADES RELACIONADAS:
novo en los individuos estudiados, pero resulta
extremadamente raro que una mutación al azar se de en dos
personas diferentes de igual manera.
El mosaicismo en línea germinal hace referencia a
aquellas mutaciones que pueden transmitirse a la
descendencia sin haberse desarrollado en el individuo. Ej.
Un padre con espermatozoides mutados.
En el mosaicismo somático las mutaciones no se
transmiten a la descendencia. - Osteogénesis imperfecta →6% de formas graves de
osteogénesis imperfecta.
- Otros: hemofilia A, hemofilia B y DMD.
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Comisión 9
26/10/2021
4. QUIMERAS
Unión de dos cigotos gemelos no idénticos para generar un
único embrión y con colonización limitada de uno de los
gemelos. Puede ir o no acompañada de sintomatología clínica
en función del parche; si los embriones son del mismo sexo no
hay síntomas, en cambio si son de diferente sexo
probablemente haya sintomatología.
CASO LYDIA FAIRCHILD: Gracias a este caso se descubre la no complementariedad perfecta con la descendencia en las
quimeras. Genéticamente, en algunos tejidos tenía alelos con la complementariedad de su descendencia y en otros no.
¿Hay problemas autoinmunes en las quimeras? Sí, hay algunos casos en los que hay ataques hacia ciertas células del
otro embrión y otros en los cuales no se reconocen las cls. propias como impropias. Incluso, hay casos en los que las
personas afectadas tienen más alelos de lo normal y eso puede generar gran cantidad de enfermedades.
MICROQUIMERISMO
Presencia de un reducido nº de cls. originarias de un individuo en otro
diferente (cls. genéticamente diferentes a las del individuo huésped). Esto se
Tiene lugar tanto en el recién nacido produce durante la gestación del individuo e intercambio de sustancias en el
torrente sanguíneo. Puede resultar en enfermedades autoinmunes.
como en la madre gestante
QUIMERAS MOSAICOS
Cls. diferentes que se originan de más de un cigoto Cls. diferentes que vienen de un solo cigoto
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Comisión 9
26/10/2021
b. EXPERIMENTO:
Experimento con trigo de dos colores. El experimento partía de líneas puras.
1. Semilla de trigo de color rojo pura x semilla de trigo blanca pura → Roja intermedia (F1) → dominancia
incompleta
2. Roja intermedia x Roja intermedia (en la genética mendeliana se esperaría proporción 25% AA, 50% Aa, 25% aa)
→ Rango de fenotipos más amplio → no se trata de la dominancia incompleta (F2)
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Comisión 9
26/10/2021
d. Conclusión
- El color del grano (carácter cuantitativo que se distribuye normalmente), se hereda según los mismos
principios de Mendel.
- Dos genes actúan sobre el mismo carácter (color de la semilla) y dichos genes poseen alelos con carácter
aditivo, contribuyendo independientemente al color.
- Muchos locis, denominados QTLs son regiones del genoma que contribuyen al carácter cuantitativo y la
mayoría son genes que codifican proteínas. En estos genes existen regiones enhancer o promotoras
susceptibles a aumentar la transcripción, y reguladoras.
- A medida que tengamos más QTLs que contribuyen al carácter, los fenotipos y genotipos van a aumentar
hasta llegar a una distribución o espectro continuo.
- Existen relaciones de dominancia.
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Comisión 10
28/10/2021
Ambos tienen el color de los ojos marrón no muy oscuro y son diheterocigóticos
Esto es una simplificación → se estima que en el color de ojos hay al menos 10 genes involucrados, por lo tanto
hay más fenotipos que los mencionados.
Genotipos posibles: 9
Fenotipos posibles (teniendo en cuenta el carácter aditivo): 5
AABB: marrón oscuro intenso (todos suman al carácter color).
aabb: azules claros (ningún alelo suma al carácter color).
Entre medio toda una graduación…
AABb (o AaBB): ojos marrones con tono inferior a AABB (tres alelos que suman).
AaBb: tono marrón más suave que el anterior (dos alelos que suman).
Aabb (o aaBb): Tono verde, ya no es marrón (un solo alelo que suma).
Los alelos segregan exactamente igual que la herencia mendeliana clásica pero la interpretación es
diferente. Recordemos que son QTLs (quantitative trait loci). Esto explica una mayor diversidad de fenotipo
respecto al color de ojos en la población.
1.2. COLOR DE PIEL
Ahora veremos otro ejemplo más complicado: tenemos 3 genes que contribuyen al color de la piel.
- Supongamos que el carácter cuantitativo color de la piel está influenciado por 3 loci: A, B y C.
- Cada loci tiene 2 alelos: + y –
- Cada alelo + contribuye a aumentar el color (mayúsculas).
- Cada alelo - no suma (minúscula).
1
Comisión 10
28/10/2021
15/64 Piel bastante oscura (suman 4 AABbCc (AaBBCc, Hay muchos más genes que intervienen en
alelos) AaBbCC) el color de la piel
CONCLUSIÓN: Fenotípicamente los individuos se diferencian en el tono del color de la piel por la suma de alelos
aditivos al carácter color de piel, por lo que se trata de una distribución continua en la población. Para los
caracteres continuos intervienen muchos genes que influyen en ese carácter.
Genes 1 2 3 4 n
Gametos 2 4 8 16 2n
Genotipos 3 9 27 81 3n
Fenotipos 3 5 7 8 2n+1
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Comisión 10
28/10/2021
Cálculo:
La varianza genética es 6,78, por el control que se les impone a los individuos.
La varianza fenotípica es 17,8, debido a que en este momento cada individuo realiza sus hábitos personales,
obteniendo influencia genética y del ambiente.
La variabilidad en sentido amplio tiene un rango entre 0-1.
NºGENES = 3
2.2. SIGNIFICADO DE HEREDABILIDAD
¿Qué quiere decir que la heredabilidad es del 38% en la población en estudio en ese momento en
concreto?
El 38% de la variación (de 300 mg/dL a 150 mg/dL) se debe a
sus genes. El 62% restante se va a deber al ambiente. Por lo
tanto, se trata de un carácter en el que el ambiente tiene una
mayor influencia. Desde un punto de vista médico resulta
interesante para prevenir y tratar enfermedades.
Si tuvieran una heredabilidad del 100%, aunque tengamos
hábitos muy saludables, los niveles de colesterol dependerán
completamente de los genes que heredamos de tus padres.
ERROR COMÚN: una heredabilidad de 0 no significa que el carácter no se deba a genes, sino que no afecta a la
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Comisión 10
28/10/2021
Fórmulas:
- Concordancia monocigóticos (CMC) = MC
Fórmula de la heredabilidad en cuanto al estudio de
concordantes / MC totales
gemelos:
- Concordancia dicigóticos (CDC) = DC
concordantes / DC totales
Cálculos:
Enfermedad monogénica Desorden causado por una mutación en un único gen o la alteración en un solo
(o enfermedad gen es suficiente para que el individuo desarrolle la enfermedad.
mendeliana)
Enfermedad compleja Desorden causado por una combinación de efectos genéticos y ambientales.
Enfermedad sin base Está influenciada en su mayoría por el ambiente y no se sabe qué gen o si un gen
genética clara influye.
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Comisión 10
28/10/2021
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Comisión 10
28/10/2021
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http://www.diariopopular.com.ar/notas/215976-gran-bretana-le-dice-si-los-ninos-tres-padres
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Comisión 11
02/11/2021
1. Genética de poblaciones
Rama que estudia la composición genética de las poblaciones y cómo dicha composición cambia entre
poblaciones diferentes y a lo largo de las generaciones o del tiempo.
1.1 Población
Conjunto de individuos de la misma especie con un mismo acervo génico (pool génico) que comparten un
espacio y tiempo, lo que les permite entrecruzarse, es decir, intercambiar sus genes.
Para analizar las poblaciones emplearemos variantes genéticas, las cuales se denominarán polimorfismos
cuando alcancen un determinado porcentaje en la población (igual o superior al 1%).
VARIANTE VS MUTACIÓN
Mutación. Causa un daño en una determinada Variante. Cambio en el gen, que puede ser una mutación o no.
proteína por la sustitución de un nucleótido o Pasan a denominarse polimorfismos o variantes polimórficas
cambio de fase en la lectura del gen cuando su presencia alcanza una frecuencia mayor al 1%.
Estos cambios comienzan a detectarse a medida que se secuencian los genes humanos:
TIPO DE VARIACIÓN O RANGO DE TAMAÑOS NATURALEZA ALELOS
VARIANTE
Poliformismo de único 1 pb Sustitución de un solo Normalmente 2
nucleótido (SNP) nucleótido
Inserción/deleción (indel) 1 → 100 pb Ganancia/pérdida de un Normalmente 2
fragmento corto de ADN
Microsatélites (STR)1 Hasta 200 pb Repetición en tándem de un Multialélico (> 2); son
fragmento corto o núcleo de muy polimórficas:
repetición (1-6 pb)2 muchos alelos con
frecuencia similar
Variación de nº de copias 10 Kb - 1 Mb Repetición en tándem de 2 o más
(CNV) fragmentos grandes > de 1kb
Inversiones Amplio rango Inversiones 2
(microinversiones o de gran
tamaño)
1
Son comúnmente repeticiones dinucleotídeas (Ej. CACACACACACACACA)
2
Se generan por deslizamiento y formación de bucles entre las cadenas
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Comisión 11
02/11/2021
CCR5: codifica para receptor de quimioquinas que era utilizado por la bacteria de la peste bubónica y como
correceptor el virus del SIDA para infectar linfocitos. En la población del norte de Europa se ha detectado una deleción
de treinta y dos pares de bases (∆32) . Los individuos homocigóticos para esta variante son más resistentes al virus del
SIDA.
f(A1)= p f(A2)= q p + q =1
ESPERMATOZOIDES
A1 (p) A2 (q)
Hoy en día, cuando hacemos análisis de genomas completos siempre se escogen marcadores puntuales y se
comprueba que, para dichos marcadores, la población está en equilibrio de Hardy-Weinberg (no evoluciona). En
resumen, tienen que seguir este equilibrio para que el muestreo de la población sea el correcto. Se trata de un control
de calidad. Sin embargo, las poblaciones sí evolucionan porque algunas de estas premisas no se cumplen. Es necesario
que se cumplan todas para aplicar la ley y en caso contrario, modificarla.
3
Sucesos independientes, ya que la segregación meiótica del hombre es distinta a la de las mujeres
3
Comisión 12
04/11/2021
A1A1 X A1A1 p² x p² p⁴ - -
(CCR5) p = 0,906 ● CCR5 / CCR5 = p2 = 0,906 x 0,906 = 0,821 0,821 x 788 = 647
(∆32CCR5) q = 0,094 ● ∆32CCR5 / CCR5 = 2 x p x q = 2 x 0,906 x 0,094 = 0,170 0,170 x 788 = 134
A2A2 = q2
A3A3 = r2
A1A2 = 2pq
A1A3 = 2pr
A2A3 = 2qr
g.l. = 3 = 6 genotipos - 3 alelos
En este caso llamamos a las frecuencias alélicas p, q, r. Tenemos las frecuencias alélicas y quiero saber si la
población está en equilibrio. Para calcular los genotipos esperados debemos saber que cada vez que sea heterocigótico
será 2 veces la frecuencia de los dos alelos implicados y cuando sean homocigóticos será el alelo implicado elevado al
cuadrado. No se elevaría al cubo porque cada individuo presenta dos alelos. Este es el modo para calcular las
frecuencias genotípicas a partir de las alélicas y viceversa, testando si está en equilibrio de Hardy-Weinberg.
Comisión 12
04/11/2021
PROBLEMA I.A La fenilcetonuria (PKU) es una enfermedad autosómica recesiva. En Finlandia 1 de cada 4500 individuos
padece de esta enfermedad. ¿Podría decir cuál es la frecuencia del alelo en dicha población? ¿Y la frecuencia de portadores?
Los individuos normales tienen dos genotipos (p2 + 2pq). Pero, los homocigotos recesivos que es el fenotipo enfermo
(PKU), solo tiene un genotipo posible.
Con el valor de q (0,015) podemos calcular p: p = 1-q = 1-0,015 = 0,985. Por tanto, la frecuencia del alelo q es
de 0,015 y el de p es 0,985 (aprox. el 3% de la población será portadora de un alelo).
PROBLEMA I.B. Calcular la probabilidad de una pareja que tiene familiares afectados de la enfermedad.
En el caso de la mujer, su probabilidad es ser portadora o no portadora siendo ella sana. Además no tiene familiares
afectados por la enfermedad, pero que por pertenecer a la población finlandesa podría ser portadora del alelo (3%),
aunque en su familia todavía no se haya manifestado. Si calculamos su probabilidad de ser portadora (frecuencia de
portadores = 2pq), estamos calculando la probabilidad dentro del grupo de los sanos (p2 + 2pq) y no dentro de la
población total, de manera que esa probabilidad habría que corregirla un poco más. Es decir, P= 2pq/(p2+2pq)
El daltonismo puede venir provocado por un número elevado de alelos diferente, pero vamos a suponer que
reúne a todos esos alelos en una única clase alélica. Además, es recesivo, necesitamos dos alelos para que se transmita la
enfermedad, aunque en el caso de los varones, como solo tienen un cromosoma X basta con un solo alelo.
EJEMPLOS:
1. Se analizaron un total de 361 individuos de la población canaria para el grupo sanguíneo MN. De ellos 305 fueron
M, 52 eran MN y 4 eran N. Determina si la población se encuentra en equilibrio de H-W.
1.4. Consecuencias
Homo y endogamia: ↓ la frecuencia de heterocigotos Heterogamia: ↑ la frecuencia de heterocigotos
↑ la frecuencia de homocigotos ↓ la frecuencia de homocigotos
1
Comisión 13
05/11/2021
Conclusiones:
- Endogamia máxima
- La frecuencia de los homocigotos (A1A1 y A2A2) ha aumentado
- La frecuencia de los heterocigotos (A1A2) ha disminuido
RESUMEN: La frecuencia de los homocigotos ha aumentado a expensas de los heterocigóticos (si esto perdura a lo largo
de las generaciones, irán dejando de existir los heterocigotos y los homocigotos aumentan hasta llegar a su frecuencia
alélica)
En realidad, solo una fracción (F) de la población sufre endogamia. Normalmente los cruces son heterogámicos,
sólo existe una pequeña proporción de cruces endogámicos.
Cuando existe endogamia los individuos endogámicos tienen alelos idénticos por descendencia. Hay dos tipos de alelos
idénticos:
2
Comisión 13
05/11/2021
EXAMEN. Coeficiente de endogamia (F): Mide la probabilidad de que un inidividuo presente dos alelos idénticos por
descendencia. Sólo una fracción (F) de la población sufre endogamia (por tanto, 1-F no sufriría endogamia).
A1A1=p2 + pqF A2A2 = q2 + pqF A1A2 = 2pq - 2pqF
Lo que ganan de pqF los A1A1 y A2A2 (homocigotos) es lo que pierden los heterocigóticos (disminuyen la
endogamia).
La barra negra representa el porcentaje de población que sufre
endogamia:
● En Japón 5%. P.e.:
○ Albinismo: podría ser un 3%. Si los analizamos, casi el 60%
de los albinos son resultado de cruces endogámicos
○ Microcefalia: 80% de ellos proceden de padres
familiarmente relacionados
● En Europa 2-3%: Ocurre lo mismo que en Japón pero con menos
frecuencia → Menos endogamia
○ La frecuencia del albinismo es baja en comparación
con Japón. Solo el 20% procede de una población
endogámica
Relación entre homocigotos recesivos en una población endogámica y homocigotos recesivos en una población
exogámica
ENDOGAMIA = 1 + pF / q
NO ENDOGAMIA= q2 + pq / q2
EJEMPLOS
F = 1/16 F (q) = 0,1 F(p) = 0,9 QF/Q = 1,56 F = 1/16 F (q) = 0,01 F(p) = 0,99 QF/Q = 7,19
El número de homocigotos si hubiera endogamia sería El número de homocigotos si hubiera endogamia sería
1.56 veces mayor que si no hubiera endogamia. 7,19 veces mayor que si no hubiera endogamia.
RECUERDA. Cuanto menor es q, mayor es la diferencia entre una población endogámica y no endogámica (↑
probabilidad de homocigosis en cruces endogámicos).
3
Comisión 13
05/11/2021
Consecuencias de la endogamia:
- En las atracciones fenotípicas (homogamia) se harán más homocigotos con aquel fenotipo por el que los
progenitores se emparejaron, pero no se afecta todo el genoma; sólo afectaría a aquellos genes similares.
- Cuando estos genes participan en homocigosis o cruces familiares de parientes cercanos (primos, hermanos,
etc), provocan que los individuos tengan menor eficacia biológica (menor capacidad de pasar sus genes a la
descendencia).
4
Comisión 14
09/11/2021
2. ESTRATIFICACIÓN/ESTRUCTURA POBLACIONAL
En algunos casos una población aparentemente homogénea está constituida por varios subgrupos con una
relativa separación o diferencia genética (distintas frecuencias alélicas) entre ellos, siendo común que existan
cruces entre ellos.
ps y qs = frecuencias “p” y “q” en la subpoblación.
El déficit de heterocigotos (no eq. de H‐W) puede indicar la presencia de una estructura o estratificación poblacional
(subdividida en subpoblaciones con diferencias alélicas entre lo observado y esperado); cuanto mayor sean las
diferencias entre las poblaciones, mayor defecto de heterocigotos.
3. MUTACIÓN
Modifica las frecuencias alélicas muy EJEMPLO. Alelo A1 sufre mutación (frecuencia disminuye) y
lentamente (detectable a lo largo de miles de pasa a ser el alelo A2 (frecuencia aumenta)
generaciones, ya que presentamos sistemas de
reparación del ADN)
En enfermedades autosómicas recesivas hay Tasa de mutación que tenemos: µ = 1*10-5
Esta mutación cambiaría la frecuencia de los alelos ligeramente
escaso efecto frente al que presenta el
aumentando un poco la de A2, no obstante apenas ha habido
emparejamiento de heterocigóticos (¼ de la cambio.
descendencia será homocigótica recesiva).
1
Comisión 14
09/11/2021
5. DERIVA GENÉTICA
Cambios aleatorios en las frecuencias alélicas de una
población producidas de generación en generación. Esto se
produce por error de muestreo. La deriva es la principal fuerza generadora de
diferencias entre poblaciones, así como de la
Los cambios serán inversamente proporcionales al tamaño evolución y la especiación. Esto provocará que cada
de las poblaciones. Es decir, el efecto es muchísimo mayor población tenga una seña genética determinada y
cuando el tamaño de la población es más pequeño diferente de otras poblaciones
2
Comisión 14
09/11/2021
EFECTO FUNDADOR:
Un grupo reducido de individuos conforman una nueva población, y
por tanto presentan frecuencias alélicas que no representan las de la
población original. Reducción de la variación genética original.
CUELLO DE BOTELLA
Un evento (accidente geológico, desastre natural) reduce de forma no
selectiva la población.
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Comisión 15
11/11/2021
6. MIGRACIÓN
Puede modificar las frecuencias alélicas mediante la transferencia
de alelos de una población a otra (flujo génico).
El efecto de la migración cambia en función de: ● Generación 0: población inicial (p0, q0)
● Pd y Qd: frecuencia alélicas de la
1. Proporción de migrantes por generación (tasa de migración):
población inicial que actúa como
cuanto mayor sea, mayor será el cambio de las frecuencias donadora
alélicas ● m: proporción de migrantes que pasan de
2. Diferencias en las frecuencias alélicas entre población la donadora a la receptora
donadora y receptora ● 1-m: individuos policlonales que no han
migrado de la población inicial
Esto ha permitido saber qué % de la población canaria procede de ● p1, q1: frecuencias alélicas de la
Bereberes (10-15%), cuál de Europa y cuál de África (5%). generación siguiente
Recordamos que la herencia mitocondrial es exclusiva de las
mujeres, motivo por el cual se ha mantenido tan alto el porcentaje de La población receptora (generación 1), tras la
bereberes, ya que cuando se colonizaron las islas los hombres se donación, tendrá unos alelos determinados.
cruzaban con las mujeres de la isla.
OTRAS CARACTERÍSTICAS
1
Precursor de la anemia falciforme
2
Precursor de la fibrosis quística
1
Comisión 15
11/11/2021
Dos genes segregan la mitad parental y la mitad Dos genes segregan de forma que los recombinantes son
recombinante → en cromosomas independientes menos frecuentes que los parentales → en mismos
cromosomas (genes ligados).
3. LIGAMIENTO
Tendencia de alelos en loci próximos de un mismo
cromosoma a transmitirse juntos, como si constituyeran
una unidad, durante la meiosis. El análisis de ligamiento
depende de la determinación de la frecuencia de
recombinación, como medida de la proximidad
(distancia genética) de dos loci en un cromosoma5:
- Si en una segregación de los individuos aparece
un 13%, la distancia alélica es 0,13 centimorgans
(cM): cromosomas ligados.
- Si en una segregación de los individuos aparece
un 50%, la distancia alélica es 0,5 centimorgans6
(cM): cromosomas independientes.
3
No se han recombinado
4
Aparece una nueva combinación alélica
5
Lo esencial es que cuanto más cerca estén dos loci menor es la frecuencia de recombinación y menos genotipos recombinantes
se observan en la descendencia.
6
A partir de este valor ya se puede considerar como cromosomas independientes
2
Comisión 15
11/11/2021
7
Los alelos AB y ab van casi siempre juntos.
3
Comisión 16
16/11/2021
POBLACIÓN 1 POBLACIÓN 2
Importante: aunque las frecuencias alélicas son iguales en ambas poblaciones, las frecuencias gaméticas no coinciden
(desequilibrio gamético).
3. 2 CÁLCULO DEL DESEQUILIBRIO Y COEFICIENTE DE CORRELACIÓN
Como hay desequilibrio, calculamos D= gAB*gab-gAb*gaB
- En población 1: D= 0
- En población 2: D= -0’04 < 0 . Esto significa que los gametos que están en el segundo término (gAb y gaB) de la
ecuación están en mayor frecuencia que los del primer término (gAB y gab), según el equilibrio de H-W. Esto es
importante en medicina para averiguar genes asociados a enfermedades o efectos tóxicos de un medicamento. Con
una mayor frecuencia cuando un cromosoma lleva el alelo “A” también va acompañado con una alta frecuencia de b,
y cuando va el “a” normalmente va también B. La recombinación entre estas dos locis no es suficientemente grande
como para nosotros detectar que los genes estén muy próximos, en el caso de que estuviesen muy alejadas, la
recombinación a lo largo de las generaciones habría eliminado la asociación.
EJEMPLO. Si sabemos que se heredan juntos, al analizar el SNP (marcador genético)
A: Asociado a una enfermedad sabremos si el individuo tendrá la enfermedad o si sufrirá toxicidad debido a
b: variante genética (SNP) algún fármaco.
RESUMEN
Los gametos de la primera parte de la esperado por azar, esto es que lo esperado por sus frecuencias en la
primera parte de la ecuación están en población.
defecto - La correlación de ambas combinaciones de alelos es positiva
3. Si D = 0 - Las frecuencias de los gametos son las esperadas dada las
No hay desequilibrio frecuencias de los alelos que lo constituyen
2
Comisión 16
16/11/2021
1
Enzima conversora de angiotensina 2
3
Comisión 17
18/11/2021
De todas las variantes representadas se analizarían principalmente aquellas encontradas en los exones (+38Ser/Arg y
+7178 Pro/Ala), porque son las partes que codifican la proteína y de ellos depende que salga funcional o no. Sin
embargo, esas regiones no son las únicas importantes. Hay que analizar también…:
- Regiones intrónicas, ya que contienen las secuencias específicas y exactas para que se produzca el fenómeno de
splicing (corte y empalme). Una alteración de esa frecuencia haría que no se produjera un splicing correcto y la
proteína final sería anormal, no funcionante.
- Regiones flanqueantes, ya que si varían lo que ocurrirá es que la proteína se expresa en mayor o menor
cantidad o se deja de expresar; además, son zonas en las que se van a expresar también otras proteínas. Los
microARN actúan preferentemente en las regiones 3’ y también regulan la función de los ARNm
1
Comisión 17
18/11/2021
HAPLOTIPO. Combinación de variantes para distintos loci en una misma molécula de ADN. Genotipo multilocus de
un gameto o cromosoma.
Haplotipos posibles 27 = 128 combinaciones diferentes
¿Podemos reducir el número de SNPs que debemos analizar en este gen? Sí, teniendo en cuenta el desequilibrio de
ligamiento de los tagSNPs
EJEMPLO.
-438A: En la población canaria, después de haber analizado múltiples genomas, encontramos que solo hay 5 haplotipos,
pero resulta que no están todas las combinaciones. En la primera fila, solamente se presenta en el segundo lugar +38Ser.
Se debe a que existe un fuerte desequilibrio en el ligamiento entre esas dos posiciones y a la proximidad de
ambos loci
- Posición : Lo mismo ocurre en otras posiciones, la T y la G solo aparecen en el haplotipo V.
¿Tenemos que analizar las 7 posiciones en la población canaria?
No, porque sabemos que si empieza por un -438A, sabemos que lo que va después va una serina. Sabiendo esto, si
empieza por 438G, analizaremos la segunda columna mirando si tienen Ser o Arg (también se podía haber analizado
Pro y 12491C). Si analizo la posición 2642 T y 5795 G y nos da este combinación sabemos que es el V haplotipo
Si por otro lado analizamos el último elemento del haplotipo IV (una inserción), vemos que es +16435CC, y salta a la
vista que es única para el haplotipo que estamos observando, por tanto si apreciamos está combinación en esa posición
podemos saber ya en el resto de posiciones.
El SNP -438A solo puede ser del haplotipo I y sus otras variantes tienen que ser 38Ser, +7178Pro, +12491… Esto lo
sabemos porque existe un gran desequilibrio en el ligamento
IMPUTACIÓN: Con la distinta combinación de los cuatro marcadores sabemos qué ocurrirá con el resto de las
posiciones que varían del gen, esto se conoce como fenómeno de imputabilidad
Los SNP elegidos para analizar muchas variantes en los haplotipos (aquellos que son diana) son los tag SNPs (SNPs
diana a analizar).
Conclusión: tenemos una serie de marcadores dentro de los haplotipos que son característicos del haplotipo en sí,
por lo que si conocemos un elemento del haplotipo que solo se encuentra en uno de los 5 que tenemos, podemos ya
deducir el resto de elementos del haplotipo. Ej: si sabemos que empieza por -438A, sabemos que viene luego una
serina, luego C…, todo ello por un desequilibrio en el ligamiento
2
Comisión 17
18/11/2021
Dentro de un pocillo encontramos una nanobola, que tiene pegada unas pequeñas moléculas de DNA de un individuo
(color azul). También se diseñan cebadores (primers) cortos de 20 nucleótidos que acaba su extremo 3’ justo en la
base anterior de donde está el SNP
EJEMPLOS:
A. El individuo homocigótico para la G (primer pocillo en la
imagen), con la polimerasa se uniría a una C. Cuando incide el
láser, en ese pocillo se emite color verde debido a la presencia
del nucleótido modificado.
3
Comisión 17
18/11/2021
C. CONCORDANCIA DE SEXO
- Se usan datos de marcadores del cromosoma X (sin incluir la región pseudoautosómica).
- Dentro de los SNPs que se analizan en la población, están los que se incluyen en el cromosoma X (sólo las SNPs
exclusivas del cromosoma X).
- No obstante, aunque se estudien los hombres estos no podrán ser
heterocigóticos para los marcadores de este cromosoma, mientras que la
mujer siempre puede serlo.
- Durante el proceso de aislamiento de ADN puede ser extraviado o cambiado
por otro, por tanto si se hace este control de calidad podemos comprobar…
ANÁLISIS DE ASOCIACIÓN
ESPERADOS (E); OBSERVADOS (O) ALELO 1 ALELO 2 TOTALES
CASOS O 80 45
125
E (120X125)/230: 65’22 (110x125)/230=59,78
CONTROLES O 40 65
105
E (120x105)/230=54,78 (110x105)/230=50,22
Test de la Chi-cuadrado
4
Comisión 17
18/11/2021
RECORDATORIO:
- Cálculo de probabilidades: La probabilidad de que hayan casos con el alelo 1 se calcula de la siguiente forma…
Se multiplica la probabilidad de que tuviera alelo 1 (120/230) por la probabilidad que sea de la población de
casos (125/230), y todo ello se multiplica por el nº de individuos totales (230). De forma que la fórmula sería
(120x125)/230
- Cálculo de los grados de libertad.
Al realizar todos estos cálculos, los datos serían los siguientes:
ALELO GRUPO O E (O-E)2 (O-E)2/E
Alelo 1 Casos 80 65.22 218.45 3.35
Alelo 2 Casos 45 59.78 218.45 3.65
Alelo 1 Controles 40 54.7 216.09 3.95
Alelo 2 Controles 65 50.20 219.04 4.36
ESPERADOS (E); OBSERVADOS (O) 15.32
GWAS DE LA COVID-19
- 1.980 casos hospitalizados por fallo
respiratorio por COVID-19
- 2.381 controles poblacionales: donantes de
sangre, sanos, gastroenterología
- Genotipado: Global Screening Array (GSA)
(Illumina), 712.189 variantes
- Imputación: 8.965.091 SNPs
DIAGRAMA DE MANHATTAN
- En el eje x se representan los cromosomas con
distintos colores para distinguir sus límites
entre uno y otro.
- El eje Y representa el p-valor
- La línea paralela al eje X representa el umbral Diagrama de Manhattan
considerado en el análisis.
HIPÓTESIS:
- El grupo 0 es protector
- El grupo A es de riesgo
RESULTADO:
- El muestreo no ha sido correcto para la región de los grupos sanguíneos
- Los individuos más jóvenes presentan una inserción-deleción G-A en el cromosoma 3, que está relacionado con
la hospitalización y la necesidad de ventilación por la infección del COVID.
5
Comisión 17
18/11/2021
6
Comisión 18
23/11/2021
TIPOS DE MODIFICACIÓN
SUSTITUCIÓN (SNV) Cambio de una base por Transiciones: > frecuentes por mecanismos moleculares (al
otra. SNP afecta a >1% comparar con genoma de referencia)
de la población Pu↔Pu; Pyr↔Pyr
Transversiones: > posibilidades de cambio Pu-Pyr
INSERCIÓN/ Ganancia o pérdida de una o varias bases. Si afecta a múltiplos de 3 nucleótidos, los cambios son
DELECIÓN (INDEL) menos drásticos.
LOCALIZACIÓN (más frecuentes en la población humana y pueden causar enfermedades)
REGIÓN - Codones - Sitios intensificadores (ESE, ISE) o silenciadores (ESS, ISS) de
CODIFICANTE - Sitios de Splicing splicing
- Sitios de poliA - 5’UTR (Corea de Huntington, síndrome del X frágil) y 3‘UTR
REGIONES - Intensificadores y - Promotores
REGULADORAS silenciadores Núcleo → ausencia de ARN; se inhibe trascripción del gen
(reguladores Regulador →modificación de expresión.
distales)
- Aisladores
1
Mutación que ocurre por primera vez en las células del gameto
2
Por el contrario las mutaciones cromosómicas afectarían a regiones más amplias (50pb)
1
2.4 Clasificación de las mutaciones puntuales según la causa
CAUSAS
MODIFICACIÓN CONSECUENCIA
ESPONTÁNEAS
Despurinización: rotura de unión entre purina y Pérdida de 10.000 purinas/(20h y célula).
Modificaciones desoxirribosa.
químicas de las
bases Metilación: adición de un grupo -CH3
Afecta el apareamiento de bases
Desaminación: pérdida de -NH2 de una base
3
Anticipación genética: Aparición de una enfermedad a edades cada vez más tempranas y con síntomas ↑ graves dentro de una misma familia
(mutación dinámica).
2
AGENTES Hidroxilación de Hidroxilamina: hidroxila C,
MODIFICADORES citosina generando tautómero (aparea
con A)
4
En las prácticas se emplea uno perteneciente a la familia del bromuro de Etidio.
3
Comisión 19
25/11/2021
1
Durante la replicación, las polimerasas van a cometer errores/mutaciones que pueden caer en genes esenciales.
1
Comisión 19
25/11/2021
POLIPLOIDÍA
2
Cáncer de pulmón: En ciertas zonas del epitelio pulmonar hay inversiones que coinciden con 2 genes (uno expresándose y otro reprimido). La
inversión provoca que el que se estaba expresando se reprima y viceversa. Es decir, la inversión no provoca un cambio en los genes (ni pérdida ni
ganancia), sino que altera su expresión.
2
Comisión 19
25/11/2021
A. ANEUPLOIDÍAS HUMANAS VIABLE: Suelen ser letales en humanos: 50% de abortos naturales, sólo un
2% sobrevive.
- AUTOSÓMICAS: trisomías que ocurren en cromosomas con bajo número de genes
- SEXUALES: monosomías y trisomías del cromosoma X (mujeres) y cromosoma Y (hombres)
3
Es el más compatible con la vida debido a que contienen menos información genética
4
Aneuploidía de los cromosomas sexuales. Se debe a la compensación de la dosis génica de un cromosoma sexual (generalmente un X). Uno de ellos
es activado mientras los otros se inactivan quedando en forma de heterocromatina (a excepción de un 5 % de los genes).
3
Comisión 19
25/11/2021
4
Comisión 19
25/11/2021
REPRESENTACIÓN
5
Comisión 20
30/11/2021
En este caso:
- Se fusionan los brazos largos en un solo cromosoma
- Los brazos cortos se unen en otro cromosoma
pequeño, que se pierde durante la división celular.
- RESULTADO: dos cromosomas metacéntricos de
diferente tamaño. El cromosoma pequeño se suele
perder, de manera que en la célula tendremos una
dotación cromosómica anómala (se pierde el
pequeño)
RESUMEN
- Una célula portadora entra en meiosis1. - Consecuencia: formación de un cigoto con tres copias del
Como resultado, habrá una copia de un cromooma 14 (dos procedentes del progenitor portador y el otro
cromosoma correcto y otra copia del cr del sano). Esto no es compatible con la vida (aborto)
14 (esto quiere decir que el gameto para - Cuando los gametos se fusionan en circunstancias normales, se
el cromosoma 14 es diploide, mientras restablece el estado diploide.
que para el resto es haploide). - La reordenación cromosómica y la aneuploidía por lo tanto van
relacionadas.
Síndrome de Down
Aprox. un 4% de los pacientes con síndrome de Down presentan 46 cromosomas, uno de los cuales es una translocación
robertsoniana entre el cromosoma 21q y el brazo largo de uno de otros cromosomas acrocéntricos (cr. 14 o 22). A pesar
1
Recordemos que la meiosis consiste en dos divisiones consecutivas cuyo objetivo es la replicación celular y la generación de gametos haploides
1
Comisión 20
30/11/2021
de tener 46 cromosomas, los pacientes con una translocación robertsoniana que afecta al cromosoma 21 son trisómicos
para los genes de todo el brazo 21q. Sin embargo, un portador de una translocación robertsoniana entre los
cromosomas 14 y 21 tiene sólo 45 cromosomas (los cromosomas 14 y 21 se han perdido y han sido sustituidos por el
cromosoma translocado).
A diferencia de lo que ocurre en la trisomía 21 estándar, el síndrome de Down por translocación no muestra relación
con la edad materna y tiene un riesgo de recurrencia relativamente elevado en familias en las que un progenitor es
portador de la translocación, en especial cuando es la madre. Por esta razón, es necesario cariotipar a los progenitores,
y posiblemente a otros familiares, antes de ofrecer un asesoramiento genético preciso.
1. POLIPLOIDÍAS
Poliploide: organismo que presenta un aumento del conjunto de cromosomas al completo.
- Inviables en humanos: causan abortos (sólo un 1-3% de embarazos humanos son triploides)
- Pueden existir organismos triploides (3N) y tetraploides (4N)
Formas de
generar… ENDOMITOSIS: fecundación normal entre dos gametos haploides
TETRAPLOIDÍA pero error en la división posterior a la replicación de ADN
(4N)
PREGUNTA: ¿si se daña el gen que codifica la secuencia de las proteínas encargadas de llevar a cabo los mecanismos de
reparación, que consecuencias tendría? Estos fallos pueden derivar en patologías (pe. cáncer).
2
Comisión 20
30/11/2021
5. Recombinación homóloga (HR) y Reparación de roturas en las dos cadenas del ADN. Doble rotura del ADN por
unión de extremos no homólogos mutaciones exógenas, exposiciones a rayos X. Habrían dos mecanismos
(NHEJ) dependiendo si ocurre antes (HR) o después (NHEJ) de la replicación.
Importante:
● El orden de actuación de los mecanismos de reparación es el establecido en la tabla. Si uno falla actuará el
siguiente y así sucesivamente. P.e.: si la reparación MMR no consigue corregir el error, actuará las proteínas de
reparación por escisión, y después la respuesta SOS.
● El primer mecanismo es el único que no depende de ADN polimerasa. El resto depende de la síntesis de ADN
para su reparación, por lo que requieren esta enzima.
2
Codifican para proteínas con función muy similar
3
Comisión 20
30/11/2021
IMPORTANTE: ¿Cómo distingue la célula qué cadena tiene que Bacterias: MutS (reconoce la señal de
reparar para que no se fije la mutación y se altere la secuencia? La emparejamiento erróneo), MutH y MutL o GATC.
cadena template o molde está metilada (en humanos,
principalmente en citocinas), mientras que las de nueva síntesis Humanos: Homólogos a MutS y MutL (no MutH)
no han tenido tiempo de recuperar estas marcas epigenéticas (en a fragmentos sin unir
bacterias reconocidas por MutH).
4
Comisión 20
30/11/2021
5
Comisión 12
02/12/2021
Este mecanismo depende de que haya dos cromátidas hermanas disponibles para
usarlas como moldes (de que el ADN se haya duplicado previamente).
BRCA1 y BRCA2 codifican proteínas que actúan en este mecanismo. Si estos genes
están mutados y en ese tejido no hay un mecanismo óptimo de reparación por
recombinación homóloga se generan mutaciones en el ADN que puede acabar en
cáncer (se especula que los pacientes con cáncer hereditario tienen estos genes
mutados)
1
Los rayos gamma son mucho más peligrosos, ya que pueden romper ambas cadenas
1
Comisión 12
02/12/2021
CLÍNICA…
Fármacos cuya diana son los mecanismos de reparación en células cancerígenas, que deben ser inhibidos para parar
el crecimiento del tumor y evitar la metástasis (apoptosis inducida). Ejemplo: el gen que codifica para la proteína
P53, cuya actividad es vigilar las variaciones del genoma e inducir la apoptosis, puede presentar un defecto. Como
resultado, la célula se seguirá replicando y dando lugar a más mutaciones que pueden ser malignas (p.e: cáncer).
En terapia oncológica hay que vigilar el tumor muy de cerca. Se puede usar un fármaco que al principio disminuye el
tumor, pero a lo largo del tiempo el tumor puede crecer en vez de disminuir teniendo el mismo régimen farmacéutico.
Esto se debe a que las pocas células cancerígenas que sobreviven al fármaco se han replicado y han transmitido esto a
su descendencia.
2
Comisión 22
09/12/2021
Aplicaciones:
- Las aneuploidías pueden diagnosticarse tanto con el
diseño de cariotipo como con este tipo de sonda (híbrida,
que reconozca un determinado cromosoma).
1
Comisión 22
09/12/2021
Diagnóstico:
- En un cariotipo, comparado con células de referencia se
nos puede escapar dicha inversión.
- Técnica FISH: si diseñamos sondas que hibriden en los
genes ALK y EML4, y otra entre ambos genes (IB: control)
se observan las imágenes B) en células normales y C) en
células tumorales en microscopía de fluorescencia.
1
Gen de fusión EML4 (activo durante toda la vida) -ALK (quinasa que estimula la división celular esencial en estadios embrionarios, silenciado
dentro del pulmón en el adulto) en células de cáncer de pulmón no microcítico (inversión en Chr2). Al unirse estos dos genes el ALK se activa y el
tumor crece y puede ocurrir metástasis.
2
Enlaces covalentes entre ADN y fluoróforos
3
Específicos que flanquean la región donde se va a llevar a cabo la replicación
2
Comisión 22
09/12/2021
Se especula que en 2050 habrá tantas muertes por infecciones bacterianas como por cáncer debido a la resistencia a
los antibióticos. Esta tecnología está permitiendo entender la dinámica de estos patógenos para crear nuevos
medicamentos.
3
Comisión 23
14/12/2021
1
Se crea de manera sintética y contienen ADN monocatenario complementario a la región que queremos analizar
2
Nunca vamos a tener señal en tres cuadrantes, ya que esto supondría genes duplicados.
1
Comisión 23
14/12/2021
h. El cuadrado está dividido en cuatro cuadrantes, cada uno para la variante del SNP (ADN idéntico menos
una posición)
Mecanismo: incubamos ambos nucleótidos y a los dNTP Aclaración (Siempre que estudiemos ADN diploide):
le añadimos un fluoróforo, cada variante de un color. - Homocigoto: 1 color
Como este método hace que cada vez que añades un - Heterocigoto: 2 colores
nucleótido modificado se pare la síntesis de la cadena, al
hacer de forma masiva y con distintos tipos de *Cuidado: No hay que confundirse en los casos en los
nucleótidos será posible secuenciar el ADN ya que que haya ocurrido una delección porque puede pasar que
tendremos copias que han parado en cada uno de las perdamos un fragmento de ADN que justo estemos
bases que componen la secuencia específica. interrogando y pensemos que seamos homocigóticos
cuando realmente solo se está manifestando una copia.
Objetivo: obtener una secuencia de DNA: en una electroforesis (tras la carga de las muestras y aplicación de campo
eléctrico), las de menor tamaño migrarán más rápido, de manera que aparecerán de forma ordenada. El hecho de que
estén marcadas, permite que el detector de señales al final del capilar capte la secuencia.
Diferencia (de arrays y otros métodos): al ser capaz de secuenciar el ADN, puede captar nuevas variaciones.
3
Nucleótidos sintéticos que en el extremo 3’ tienen una H en lugar de OH
2
Comisión 24
15/12/2021
EQUIPO
En la imagen 3 vemos como 10 pb siempre coinciden en los fragmentos, exceptuando a un pb que es un SNP (mutación)
Por ejemplo, si estuviéramos trabajando con una biopsia de aprox. 100 células, puede que en una de ella haya una
mutación que le permita proliferar masivamente (célula tumoral) aunque un fármaco intente impedirlo. Así pues, aunque
esa célula es minoría en la biopsia de hoy, si dejamos pasar el tiempo sin modificar la terapia, la célula va a proliferar y las
demás irán pereciendo.
1
Se fragmenta porque los equipos no leen secuencias de muchos pb.
1
Comisión 24
15/12/2021
Como teniendo pocas lecturas no es eficaz para detectar estos casos, debemos usar un equipo que nos proporcione una
cobertura de, al menos, 100 lecturas de la región o 1000 para detectar estas mutaciones (cobertura de secuenciación).
- Cobertura de secuenciación (depth coverage): nº de veces que un fragmento de DNA es secuenciado. Se
expresa numéricamente como 1X, 2X, 50X, etc. Se usa en oncología para detectar cáncer temprano.
A) FUNCIONAMIENTO EN CONCRETO DE LA COMPAÑÍA ILUMINA
Las librerías se inmovilizan en una superficie sólida y son sometidas a amplificación clonal.
● Secuenciación basada en la síntesis de ADN: requiere un ADN molde, ADN pol y
nucleótidos marcados con fluoróforos (los cuales se añade antes de la
amplificación).
● Ocurre en millones de pocillos de manera simultánea, obteniendo lecturas cortas
(350 pb) y de muy alta calidad (99,9% fiabilidad).
ILUMINA
● Múltiples plataformas y capacidades de lectura ( 15-6.000 Gb/carrera).
● Es la compañía de referencia en el mercado actual.
Video: https://www.youtube.com/watch?v=MvuYATh7Y74
VENTAJAS: Precisa de pocos recursos y es más rápido que, por ejemplo, hacer un cariotipo.
2. DIAGNÓSTICO PRENATAL
Las razones más frecuentes para proponer pruebas de diagnóstico prenatal se basan en:
4
Gen de la Acondroplasia (AD)
3
Comisión 25
16/12/2021
* Hot spots: lugares con mayor probabilidad de mutación (de novo). No todas las regiones del genoma están sujetas a la
misma fuerza de mutación y la frecuencia de mutación no es igual a lo largo del genoma. De los tres más frecuentes, dos
de estos puntos caen en este gen y alteran su secuencia. El otro punto es FGFR2, de manera que todos están relacionados
con factores de crecimiento del fibroblastos.
** ¿Por qué ocurre en la espermatogénesis (75% casos) y no en la ovogénesis? Error de polimerasas, hay mayor
probabilidad de mutaciones porque la división meiótica de espermatozoides es continua a lo largo de toda la vida y es
más numerosa.
***¿Hay test validados para observar las mutaciones de FGFR3?- Si hay test válidos debido a la frecuencia de esta mutación,
pero no hay test válidos para todas las mutaciones del genoma humano.
4. DIAGNÓSTICO PRENATAL BASADO EN TÉCNICAS INVASIVAS3
Con estas técnicas se pretende detectar trastornos cromosómicos o
variantes de enfermedades raras (AR).
Las pruebas prenatales específicas de trastornos cromosómicos y
monogénicos emplean técnicas invasivas para obtener directamente
material de origen fetal. Las 2 aproximaciones más comunes son:
- Amniocentesis (obtención de líquido amniótico): 16-20 SD
- Biopsia de vellosidades coriónicas o BVC (obtención de las
células del corion): 10-13 SD.
Ambos pueden requerir un cultivo celular de 7-10 dd.
- Cordocentesis y fetoscopia: ↓ frecuentes.
El momento en que se realiza la prueba (3MD4) es clave para la interrupción voluntaria del embarazo por parte de
los progenitores (aborto; implicaciones éticas). La propia prueba conlleva riesgos de aborto espontáneo. P.e.
amniocentesis (en su mayoría), 0,5-1%; toma de muestra de vellosidades coriónicas, 1-2%; cordocentesis, 1-2%, y
fetoscopia, 3-5%).
1
Detectar mutaciones específicas en un gen es mucho más complejo que detectar mutaciones cromosómicas (aneuploidías).
2
Recordamos que solo existían individuos con la mutación heterocigóticos, porque la homocigosis no es compatible con la vida
3
Técnica más fiable pero también más arriesgadas (no es posible llevar a cabo un estudio genético con una muestra sanguínea)
4
3er mes de desarrollo/1er trimestre
1
Comisión 25
16/12/2021
5
Enfermedades graves ligadas al X: cuando no es posible el análisis de un solo gen se permite la elección de sexo.
6
Genoma nuclear: progenitora; genoma mitocondrial: donante
2
Comisión 25
16/12/2021
*Elección de sexo:
- Padre afectado en una mutación ligado al X y madre sana: embrión XY (aporta el Y y el hijo estará sano).
- Madre afectada o portadora y varón sano: embrión XX (de estas manera la hija será portadora si es un gen
recesivo u homocigota sana).
**Investigación del profesor ( no examen): está estudiando los genes que predisponen al asma en la población canaria,
pero esto es algo muy complejo ya que tienen que tener en cuenta los factores ambientales. Con esto no quiere decir que
aunque genéticamente un embrión no tenga mutaciones conocidas los factores ambientales puede influir en el desarrollo
y provocar la aparición de enfermedades.
Nota: las enfermedades que están en negritas son las más frecuentes
3
Comisión 26
16/12/2021
1
Comisión 26
16/12/2021
1
ADN libre en sangre de células tumorales
2
No todas las mutaciones están en los exones. Análisis posterior al WES. P.e. Se usa para diagnosticar problemas de ensamblaje y distribución de pps
(en vez de sus aas).
3
Se incluyen diferentes capas ómicas . No solo obtener secuencias de ADN sino incluye diferentes capas como la epigenética, metilación de ADN, etc.
4
Multiplexing: Nº máx de muestras que se pueden combinar para una secuenciación masiva (96 en este caso)
2
Comisión 26
16/12/2021
Nota: Si se sospecha de una enfermedad genética concreta (p.e cáncer de mama), se estudiaría directamente el gen
implicado (BRCA1, BRCA2), no los 50 del panel. Ya si no se encuentra nada en esos dos, se pasan a otros relacionados
con la enfermedad.
13. SECUENCIACIÓN: EXOMAS VS GENOMA Dilema ético: un paciente viene a saber si tiene algún
gen a padecer fibrosis quística y mientras estoy
secuenciando el genoma veo que tiene una
predisposición a padecer cáncer de pulmón ¿se lo
comunicó o no se lo comunicó?
3
Comisión 27
17/12/2021
Gris: farmacodinámica
Verde y azul: farmacocinética
4. MARCADORES FARMACOGENÉTICOS (NIVEL CPIC: A)
Hay 16 genes que caen sobre el nivel A. Las variantes de los genes de
la imagen causan respuestas dañinas en el individuo. Esto nos ayuda
a saber cómo responderá un individuo ante diferentes tratamientos a
partir de la secuenciación de variantes en cada uno de los exones de
dichos genes, facilitando la terapia guiada/individualizada.
1
Comisión 27
17/12/2021
- Hay que tener en cuenta que estas enzimas no solo metaboliza preferentemente por CYP450 específicas
fármacos, ya que esto puede afectar a la dosis proporcionada.
7. GEN CYP2D6
- Primer marcador farmacogenético - Localizado en el cromosoma 22q13.2 (ID: 1565). Presenta dos
clonado y caracterizado (Eichelbaum y transcritos alternativos: 1588 nt (isoforma 1; 497 aa) y 1435 nt
cols., 1987). (isoforma 2, Δexón 3; 446 aa). 2ºvariante presenta un exón más → pp
- La monooxigenasa codificada por dicho de mayor longitud codificada.
gen representa el 2-4% de las CYP450 - Metaboliza hasta un 25% de los fármacos comúnmente recetados:
totales expresadas en hígado (también antidepresivos, antipsicóticos, analgésicos y antitusivos,
se expresa en duodeno e intestino bloqueantes beta adrenérgicos, antiarrítmicos, antieméticos y
delgado), localizándose en el retículo anticancerígenos (más info.)
endoplásmico. - Catálogo de variantes descritas en la base de datos PharmVar
(Pharmacogene Variation Consortium).
3
Comisión 27
17/12/2021
4
Comisión 27
17/12/2021