Facultad de Ciencias Básicas, Programa de Biología. Taller de Bioqímica. Prof. Jorge A Leyva R. Dr.rer.

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UNIVERSIDADAD DEL ATLÁNTICO

FACULTAD DE CIENCIAS
DEPARTAMENTO DE BIOLOGÍA
TALLER DE BIOQUÍMICA No.2

TEMA: AMINOÁCIDOS, PEPTIDOS Y PROTEINAS

1. Describa como se compone químicamente un amino ácido y por qué puede servir
como regulador ácido-base

2. Cómo se clasifican los amino ácidos y en que se basa su clasificación?

3. Qué es un enlace peptídico y como se lleva a cabo?

4. De acuerdo a la complejidad, cómo se clasifican las proteínas? De ejemplos

5. Qué es el punto isoeléctrico de un amino ácido y de una proteína y cómo se calcula?

6. Escriba las reacciones de disociación de los siguientes aminoácidos partiendo de su

forma más ácida hasta llegar a la forma más básica e identifique las formas catiónica,
aniónica y zwitterion y calcule su punto isoeléctrico.
a. Leucina
b. Lisina
c. Acido aspártico

7. Podrían estar los tres aminoácidos del ejercicio anterior completamente separados
unos de otros por electroforesis en una solución buffer a pH 1, pH 6.0 y pH 13. Explicar
detalladamente.

8. Sí usted está tratando de separar los tres aminoácidos del punto 6 en una columna de
intercambio aniónico, explicar cuál de los siguientes buffer usaría dpH 3, pH 7 o pH 11
u otro.

9. Los aminoácidos pueden ser utilizados como amortiguadores. Un amortiguador es una

solución que resiste cambios de pH cuando se le agrega ácido o base. El intervalo de
pH sobre el cual es efectivo un amortiguador se denomina intervalo amortiguador,
generalmente definido como pKa -1 a pKa +1.
a) Indique el intervalo amortiguador (o intervalos) de Gly, His, Asp y Lys
b) Esperaría que una proteína que contiene 100 aminoácidos pudiera ser tan buen
amortiguador como sus aminoácidos constituyentes libres a concentraciones molares
equivalentes?

10. Investigue la secuencia de residuos de aminoácidos de la angiotensina I y angiotensina

II.
Calcule el punto isoeléctrico de los péptidos anteriores usando un programa de internet
http://web.expasy.org/compute_pi/ o http://web.expasy.org/protparam/

11. Traduzca las siguientes secuencias de ADN en aminoácidos usando el programa

Expasy :http://web.expasy.org/translate/
*Secuencia 1: 5´ TGCTACTTCCAAAACTGCCCACGAGGA 3´
*Secuencia 2: 5´ TGCTACATACAAAACTGCCCAGGT 3´

a. Calcule el punto isoeléctrico de cada péptido y compárelo con el obtenido con el

programa.
b. ¿Las secuencias obtenidas corresponden a los siguientes péptidos?
Cys-Tyr-Phe-Gln-Asn-Cys-Pro-Arg-Gly
Cys-Tyr-Ile-Gln-Asn-Cys-Pro-Leu-Gly
c. ¿Es posible unir las dos proteínas con puentes disulfuro, que aminoácidos son los
 involucrados?

12. De los siguientes pares de proteínas, cuál par se podría separar más fácilmente por
cromatografía de exclusión molecular y por qué?
a. Hemoglobina humana( MW. 64500), albúmina humana (MW.68500)
b. Ribonucleasa (MW.12640), glutamato deshidrogenasa(MW. 1000000).

13. Cuál pH 3, pH 6 o pH 9 escogería para obtener una máxima separación electroforética

de Ureasa (pI 5) y mioglobina (pI 7). Explique.

14. Teniendo en cuenta que el pI para ovoalbúmina 4,6; para -lactoglobulina pI 5,2 y para
quimotripsinógeno pI 9,5. ¿En qué dirección (es decir, hacia el ánodo (A,+), hacia el
cátodo (C,-) o en el origen (O)) emigrarán las siguientes proteínas en un campo
eléctrico al pH indicado?:
a) Ovoalbúmina a pH 5.0.
b) Beta-lactoglobulina a pH 7.0.
c) Quimotripsinógeno a pH 11.

15. De acuerdo con la siguiente tabla, trazar la curva de titulación para la histidina e
identificar los pKa´s, punto isoeléctrico, zonas buffer, regiones donde predomina las
formas catiónicas, aniónicas y el zwitterion de carga cero.

Volumen de
Paso OH- pH paso Volumen de OH- pH
1 0,5 1 13 6,5 7
2 1 1,5 14 6,75 8
3 1,5 1,75 15 7 8,5
4 2 2 16 7,5 8,75
5 2,5 2,5 17 8 9
6 3 3 18 8,5 9,25
7 3,25 4 19 9 9,5
8 3,5 5 20 9,25 10
9 4 5,5 21 9,5 11
10 4,5 5,75 22 9,75 12
11 5 6 23 10 13
12 6 6,5 24 11,25 16

16. ¿Cómo se puede llevar a cabo la extracción de las proteínas de membrana y en que
partes de la célula eucariota se pueden encontrar?

17. ¿Cómo se pueden cuantificar proteínas insolubles?

18. Una de las formas de tratar la cistinuria (es una afección que se transmite de padres a
hijos y en la cual se forman cálculos en los riñones, el uréter y la vejiga, formados por
precipitados de cistina) es consumiendo bicarbonato de sodio. Cuál es el fundamento
del tratamiento.