Departamento de Fisiologa y Bioqumica Asignatura Bioqumica 2013 Protenas Preparador: Flix Lamas 1. Una muestra del aminocido tirosina es apenas soluble en agua. Un polipptido que contiene slo residuos de Tyr, poli(Tyr), sera ms o menos soluble, suponiendo que el nmero total de grupos de Tyr permanece constante? 2. Dibuje el pptido ATLDAK. A) Calcule su pI aproximado. B) Cul es la carga neta a pH? 3. La protena de insulina est formada por dos polipptidos denominados cadena A y B. Se aisl y se secuenci insulina de diferentes organismos. Las insulinas del hombre y el pato tienen la misma secuencia de aminocidos con la excepcin de seis residuos, como se muestra a continuacin. El pI de la insulina humana es mayor o menor que el de la insulina de pato?
Residuo aminoacdico A8 A9 A10 B1 B2 B27 Humana Thr Ser Ile Phe Val Thr Pato Glu Asp Pro Ala Ala Ser
4. Cul de estos pptidos tiene mayor absorbancia a 280 nm?
A Gln Leu Glu Phe Thr Leu Asp Gly Tyr
B Ser Val Trp Asp Phe Gly Tyr Trp Ala
5. Los residuos hidrfobos generalmente aparecen en la primera y en la cuarta posicin en las repeticiones de siete residuos de los polipptidos que forman espirales enrollados. A) Por qu los residuos cargados o polares comnmente aparecen en las cinco posiciones remanentes? B) Por qu la secuencia Ile-Gln-Glu-Val-Glu-Arg- Asp- es ms probable que la secuencia Trp-Gln-Glu-Tyr-Glu-Arg-Asp para aparecer en una espiral enrollada?
6. Las protenas globulares se construyen a partir de varias capas de estructura secundaria, con un ncleo hidrfobo y una superficie hidrfila Esto es vlido para una protena fibrosa tal como la queratina alfa?
7. Describa la estructura primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria del colgeno
8. Es ms probable que est Trp o Gln en una superficie proteca? B) Es menos probable que est Ser o Val en el interior proteco? C) Es menos probable encontrar a Leu o Ile en el medio de una hlice alfa? D) Es ms probable que est Cys o Ser en una hoja B?
9. Dado tiempo suficiente, Pueden todas las protenas desnaturalizadas renaturalizarse espontneamente?
10. Cul de los siguientes polipptidos es ms probable que forme una hlice alfa? Cul es menos probable que forme una hoja B? A C R A G N R K I V L E T Y
B S E D N F G A P K S I L W
C Q K A S V E M A V R N S G
11. En los seres humanos la urgencia por respirar proviene de la alta concentracin de CO en la sangre; no hay sensores fisiolgicos directos de la pO de la sangre. Los buceadores a menudo hiperventilan (respiran rpdido y profundamente por varios minutos) justo antes de sumergirse creyendo que eso incrementar la concentracin de O en la sangre. A) Se produce eso? B) Aplique sus conocimientos del funcionamiento de la hemoglobina para evaluar si esta prctica es til 12. Los homocigotos de hemoglobina S que son severamente anmicos con frecuencia tienen niveles elevados de BPG en sus eritrocitos. ste es un efecto beneficioso? 13. El cocodrilo, que puede permanecer bajo el agua sin respirar por ms de una hora, sumerge su presa para asfixiarla y luego come tranquilo. Como adaptacin que ayuda al cocodrilo en esto, puede utilizar virtualmente el 100% del O de su sangre mientras que los seres humanos, por ejemplo, podemos extraer slo -65% del O en su sangre. La Hb del cocodrilo no se une al BPG. Sin embargo, la desoxiHb del cocodrilo preferentemente se une a HCO. Cmo ayuda esto al cocodrilo en la obtencin de su comida? 14. Conociendo la estructura secundaria, terciaria y cuaternaria de las protenas se puede predecir la estructura primaria? 15. Cul es el peso molecular aproximado de una protena de 703 residuos aminocidos en una nica cadena polipptidica? 16. Determine la carga neta de la forma predominante de Asp a A) pH 1 B) pH 3, C) pH 6, D) pH 11 17. Calcule el pI de: A) Ala B) His C) Glu 18. Un Pptido tiene la siguiente secuencia:
a.- Cul es la carga neta de la molcula a pH 3, 8 y 11? (utilice los valores de pKa para las cadenas laterales y grupos amino- y carboxilo-terminales dados en la tabla 3-1.) b.- Estime el pI de este pptido 19. Sealar cules de estas protenas sern globulares y cules sern fibrosas, considerando su localizacin o su funcin biolgica (anotadas entre parntesis): 1. Colgeno (tejido conjuntivo) 2. Albmina (reserva) 3. Queratina (pelo) 4. Fibrona (seda) 5. Ribonucleasa (enzima) 6. Inmunoglobulina (defensa) 7. Hemoglobina (transporte de oxgeno) 8. Tropomiosina (fibra muscular) 9. Samatotropina (hormona) 10. Fibringeno (coagulacin sangunea)
20. La ribonucleasa y la lisozima son dos enzimas de secuencia conocida: tienen respectivamente 124 y 129 aminocidos por molcula de protena. Si la masa molecular media de un aminocido libre es de 125 daltons, calcular la masa molecular aproximada de ambos enzimas. 21. La hormona peptdica estimuladora de melanocitos, -melanotropina, tiene la siguiente secuencia:
a) Escribir la secuencia utilizando las abreviaturas de una letra b) Calcular el peso molecular de la -melanotropina utilizando los datos de la tabla 5.1. Por qu este resultado no es exactamente correcto a pH neutro?
Imgenes que deben saberse tanto para mi quiz como para el EPC