EJERCICIOS DE SECUENCUACION

1. Se obtuvieron los siguientes datos, acerca de la estructura de una cadena polipeptídica.

La hidrólisis total produjo Gly, Ala,Val2, Leu2, Ile, Cys4, Asp2, Glu4, Ser2, Tyr2. El
tratamiento de la cadena con 2,4-dinitrofluorobenceno, seguido de hidrólisis ácida, rindió
2,4-dinitrofenil-glicina. El análisis del grupo C-terminal dio aspartato. La hidrólisis ácida
parcial proporcionó los siguientes oligopéptidos , entre otros: Cys-Cys-Ala, Glu-Asp-Tyr,
Glu-Glu-Cys, Glu-Leu-Glu, Cys-Asp, Tyr-Cys, Ser-Val-Cys, Glu-Cys-Cys, Ser-Leu-Tyr,
Leu-Tyr-Glu, Gly-Ile-Val-Glu-Glu. La escisión con
pepsina rindió un péptido que por hidrólisis dio Ser-Val-Cys y Ser-Leu. Formúlese una
estructura que esté de acuerdo con los datos anteriores.

2. Un péptido A, de composición Lys, His, Asp, Glu2, Ala, Ile, Val y Tyr, produjo
2,4-dinitrofenilaspartato al efectuar el análisis del resto N-terminal con 2,4-
dinitrofluorobenceno y valina libre como primer producto con la carboxipeptidasa. La
digestión de A con tripsina rindió dos péptidos. Uno de ellos contenia Lys, Asp, Glu, Ala, y
Tyr. El otro (His, Glu, Ile, Val) rindió 2,4-dinitrofenilhistidina al analizar el resto N-
terminal con 2,4-dinitrofluorobenceno. La escisión del último con termolisina rindió entre
otros productos, histidina libre. A partir de A, se formaron también dos péptidos
quimotrípticos. Uno contenía Asp, Ala, y Tyr y el otro contenía Lys, His, Glu 2, Ile yVal.
Dedúzcase una estructura para el péptido A.

3. La hidrólisis ácida de 1 mmol de un pentapéptido hipotético rindió 2mmol de ácido

glutámico, 1mmol de lisina, y no se recuperó cuantitativamente ningún otro
aminoácido. La tripsina escinde el pentapéptido original en dos fragmentos. Por
electroforesis a pH 7.0 uno de los fragmentos trípticos se desplaza hacia el ánodo, y el otro
hacia el cátodo. El tratamiento de uno de los fragmentos trípticos con DNFB, seguido de
hidrólisis ácida, rinde ácido DNF-glutámico. El tratamiento del pentapéptido original con
quimotripsina origina dos dipéptidos y ácido glutámico libre. Propóngase una secuencia
aminoácida para el pentapéptido que esté de acuerdo con los datos precedentes.

4. Un organismo de origen desconocido produce un potente inhibidor de la transmisión

nerviosa y queremos secuenciarlo. El análisis de aminoácidos muestra una composición de
Ala5, Lys1, Phe1, El péptido intacto reacciona con DNFB y tras la hidrólisis ácida del
mismo se obtiene DNF-alanina. La digestión con tripsina produce un tripéptido y un
tetrapéptido de composiciones Ala3. Phe1 y Lys1, Ala2. La reacción del péptido intacto
con quimotripsina da un hexapéptido y alanina libre. ¿Cuál es la secuencia del inhibidor?.

5. Se ha aislado un octapéptido a partir de un hongo raro que previene la calvicie y estamos

interesados en sus posibilidades comerciales. El análisis de aminoácidos da una
composición: Lys2, Asp1, Tyr1, Phe1, Gly1, Ser1, Ala1. El péptido intacto reacciona con
DNFB y tras la hidrólisis ácida del mismo se obtine DNF-alanina. La digestión con tripsina
da péptidos con la composición: Lys1, Ala1, Ser1 y Gly1, Phe1, Lys1, más un dipéptido.
La reacción con quimitripsina libera ácido aspártico, un tetrapéptido de composición: Lys1,
Ser1, Phe1, Ala1 y un tripéptido que libera DNF-glicina tras reaccionar con DNFB seguido
de hidrólisis ácido. ¿Cuál es la secuencia del péptido problema?.
6. Un abejorro sudamericano produce una sustancia que extrae el oro del agua marina, y
deseamos conocer su estructura para llevar a cabo su síntesis a gran escala. El análisis de
aminoácidos da una composición: Lys1, Pro1, Arg1, Phe1, Ala1, Tyr1, Ser1. La reacción
con DNFB no da ningún producto a no ser que el material se haga reaccionar previamente
con quimotripsina, en cuyo caso se obtiene DNF-serina y DNF-lisina a partir de los
péptidos obtenidos, cuya composición es Ala1,Tyr1, Ser1 y Pro1, Phe1, Lys1,Arg1. La
reacción con tripsina también produce dos péptidos de composiciones Arg, Pro y Phe, Tyr,
Lys, Ser, Ala. ¿Cuál es la estructura del péptido y su secuencia?.

7. La composición de aminoácidos de una cadena peptídica era Ala, Asp2, Gln2, Ile,
Lys, Met3, Phe2, Trp. Por digestión del péptido con quimotripsina y realizando la
degradación de Edman sobre los fragmentos resultantes, se obtuvieron los siguientes
péptidos; tratando otra muestra con BrCN, se obtuvieron
Degradación de Edman Muestra tratada con BrCN
Phe Asp
Asp-Met-Gln-Phe Asp-HSL
Lys-Gln-Met-Asp Gln-Phe-Ile-Ala-HSL
Ile-Ala-Met-Trp Trp-Phe-Lys-Gln-HSL
Deducir la secuencia del péptido