Kenya Yamileth Gil Santacruz

BIOQUÍMICA ESTRUCTURAL Y METABÓLICA

EJERCICIOS TEMA VI. Ciclo de Krebs

1). El ciclo del ácido cítrico utiliza ocho reacciones para catabolizar el acetil-CoA:

Oxalacetato + acetilCoA

Citrato

Isocitrato

α- ceto glutarato

Succinil-CoA

Succinato

Fumarato

Malato

Oxalacetato

1. Los cofactores necesarios en la mayoría de las reacciones del ciclo de Krebs son: NAD+,
NADH, FAD+, FADH, GTP, GDP y actilCoA.
2. Los tipos de reacción de nuevo en orden de las reacciones del ciclo son los siguientes:
Deshidratación, Hidratación, Oxidación, Descarboxilación, Descarboxilación oxidativa,
Hidrólisis, Oxidación, Adición, Oxidación, Condensación.
3. Las reacciones que reducen NAD+ son la reacción 2a, 3b y 7. Esto lo sabemos porque son
las reacciones que nos dan como resultado NADH.
4. Las reacciones irreversibles de esta ruta son las reacciones 3a, 3b y 8, esto se puede saber
ya que estas son las reacciones que están reguladas, ya que son las reacciones de
descarboxilación (3ª y 3b) requieren de mucha energía para llevarse a cabo por lo cual no
es favorable llevarlas a cabo en reversa.

2). Los enfermos de beriberi, una enfermedad originada por el déficit de tiamina, tienen niveles
sanguíneos de piruvato y de α-cetoglutarato elevados, en especial después de comidas ricas en
glucosa. ¿Qué relación existe entre estos efectos y el déficit en tiamina?
La tiamina es una vitamina la cual nos ayuda a procesar alimentos consumidos en energía,
sabemos que tanto el piruvato como el α-cetoglutarato son compuestos que nos pueden llevar a
ganancia energética en el cuerpo. Al no tener tiamina en el cuerpo veríamos una acumulación de
estos compuestos en el cuerpo ya que la vitamina no los está ayudando a ser procesados.
3). El oxalacetato mitocondrial es precursor de muchos aminoácidos. ¿Qué pasa con la entrada
del piruvato en el ciclo del ácido cítrico a medida que el oxalacetato es utilizado en la
biosíntesis de aminoácidos? ¿Cómo se repone el oxalacetato en las
células animales?
El piruvato para poder entrar al ciclo del ácido cítrico tiene que pasar por tres reacciones las
cuales nos dejan al final al acetil-CoA y este junto con un oxalacetato empiezan este ciclo. Si se
usara demasiado oxalacetato en otras síntesis o rutas entonces veríamos una deficiencia de este
para ser utilizado en el ciclo de Krebs. El oxalacetato se repone de forma automática en el ciclo
de Krebs. Pero también podemos ver su síntesis a través de la descarboxilación del piruvato.
4). La reacción del ciclo de Krebs catalizada por la succinil-CoA sintetasa produce el
compuesto de alta energía GTP. ¿Cómo se incorpora la energía del GTP a la reserva
de ATP celular?
El GTP es una molécula energética la cual se usa en conjunto con otras moléculas de este tipo asi
como el ATP, CTP, TTP, etc. Estos se guardan hasta que se necesite del aporte energético de
estos en alguna reacción del cuerpo.
5). Relación entre respiración y ciclo del ácido cítrico. A pesar de que el oxígeno no participa
directamente en el ciclo del ácido cítrico, éste opera únicamente en presencia
de O2. ¿Por qué?
El ciclo del ácido cítrico es también conocido como la respiración celular, este proceso se da en
células aerobias, esto quiere decir que necesitan de oxígeno. Por ende el proceso de ciclo de ácido
cítrico necesita del O2 aunque no lo use directamente en sus reacciones ya que sin el O2 no
habría células donde realizar el proceso.
6). Calcular el rendimiento en ATP, en la oxidación de una molécula de glucosa por un
homogenado celular, donde la glucolisis, complejo piruvato deshidrogenasa, ciclo de
Krebs, cadena respiratoria y fosforilación oxidativa son completamente activos.
7). En el siguiente esquema del ciclo del ácido cítrico:

a) Completar las estructuras los nombres de los compuestos o de las enzimas.

Los compuestos que hacen falta son a-cetoglutarato, Succunil-CoA, Fumarato, Malato
b) Si interviene algún compuesto de “alta energía”, señalar cuál es y por qué
Los compuestos que intervienen en esta ruta como productos son el ATP y el GTP, estos
son creados por las fosforilaciones que se llevan a cabo en la reacción.
c) Indicar si alguna reacción es una fosforilación a nivel de sustrato. Justificar.
Una enzima que requiere de FAD es la succinato deshidrogenasa
d) ¿Qué enzimas requieren FAD?
Una enzima que requiere de FAD es la succinato deshidrogenasa
e) ¿Qué reacciones son descarboxilaciones? Nombrar las enzimas que las catalizan.
Las reacciones 3a y 3b son las descarboxilaciones y las enzimas que las catalizan son
isocitrato deshidrogenasa y la a-cetoglutarato deshidrogenasa.
f) ¿Cuáles enzimas son reguladas y por quiénes?
Citrato sintasa, isocitrato deshidrogenasa y α-cetoglutarato deshidrogenasa son reguladas
por el ATP, otras enzimas de la ruta se inhiben o regulan por niveles altos reductivos en la
célula.
g) ¿Qué significa que el ciclo de Krebs es anfibólico?
Esto de referencia a que el ciclo de Krebs cuenta tanto con reacciones anabólicas como
reacciones catabólicas lo cual lo clasifica como un ciclo anfibólico.
h) ¿Qué son las reacciones anapleróticas? Nombrar alguna
Son reacciones que proporcionan intermediarios para los ciclos de ácidos tricarboxílicos o
del ciclo de Krebs. Un ejemplo es el paso de piruvato a oxalacetato.
8). Describa en términos generales cómo afectó la aparición del oxígeno molecular en la
atmósfera de la Tierra, hace alrededor de 3000 millones de años la historia de los seres vivos.
Los seres de la tierra antes de la aparición del oxígeno no tenían un uso para él, eran seres
anaerobios como el caso de las bacterias. Mientras el oxígeno se introdujo a la atmósfera de la
tierra. Esto se dio principalmente con la evolución de usar la bacteria aerobia (mitocondria)
como un orgánulo en las células aerobias para la generación de energía con el uso del O2.

9). Describa los estilos de vías de los organismos siguientes:

a) anaerobios estrictos: Son aquellos organismos que no pueden vivir en presencia del
oxígeno entonces subsisten a través de fermentación y respiración anaerobia, entre estas usan
principalmente la fermentación láctica.
b) anaerobios que toleran el aire: Estos organismos que sí toleran el aire son estrictamente
fermentativos, se especializan en la fermentación, pueden usar tanto respiración aeróbica
como anaeróbica.
c) anaerobios facultativos: Estos organismos usan preferiblemente la respiración aeróbica
pero tienen la habilidad o facultad de también usar la anaerobia.
d) aerobios estrictos: Son organismos los cuales necesitan del oxígeno para subsistir, sin el no
pueden vivir. Un ejemplo muy claro es el ser humano. Aunque tenemos procesos anaerobios
si no tenemos presencia de O2 morimos.

9). Un corredor necesita una cantidad de energía tremenda durante una carrera. ¿Explique
cómo afecta el uso del ATP por los músculos que se contrae el ciclo del ácido cítrico?.
Al necesitar muchísima energía para toda la contracción y esfuerzo muscular que está
haciendo el corredor el cuerpo se verá obligado a impulsar las rutas de creación energética o
también acceder a sus reservas energéticas de lípidos y azúcares en caso de que estos
procesos no sean suficientes para dar el aporte energético necesario.
10). Describa dos funciones importantes del ciclo del ácido cítrico.
Las dos funciones que podríamos ver como principales para el ciclo del ácido cítrico son el
aporte energético al cuerpo y la regeneración del NADH para que otras rutas lo utilicen.
11). La acetil CoA se forma en las mitocondrias y se utiliza en el citoplasma para la síntesis
de ácidos grasos. Sin embargo, la acetil coA no puede atravesar la membrana mitocondrial.
¿Cómo se resuelve este problema?.
Para que el acetil-CoA pase por la membrana mitocondrial primero necesita de un oxalacetato
y una citrato sintasa, para hacer el paso a citrato el cual si puede pasar por la membrana. El
proceso por el cual el citrato pasa por la membrana es llamado Lanzadero de Citrato.
12). ¿Cuáles de las siguientes condiciones indican un estado celular de baja energía?. ¿Qué
reacciones ioquímicas afectan cada condición?
a) un cociente NADH/NAD+ elevado
b) un cociente ATP/ADP elevado
c) una concentración elevada de acetil CoA
d) una concentración baja de citrato
e) una concentración elevada de succinil-CoA

13). ¿Cuál es el significado de las reacciones de fosforilación a nivel de sustrato?. ¿Cuál de

las reacciones del ciclo del ácido cítrico implica una fosforilación a nivel de sustrato?.
Nombre otro ejemplo de ruta bioquímica que le sea familiar.
Una fosforilación a nivel sustrato es básicamente la creación de ATP y GTP, en esta el
sustrato de un grupo fosfato a un ADP o un GDP para la creación de las moléculas
anteriormente mencionadas. Una reacción que es de este tipo en el ciclo de Krebs es la
reacción 4 donde el succinil-CoA pasa a succinato por medio de la succinil-CoA sintetasa.
Otra ruta donde vemos esto es en la glucólisis donde en las reacciones de creación de ATP
vemos fosforilaciones a nivel sustrato.
14). La deficiencia de piruvato carboxilasa es normalmente una enfermedad mortal debido a
la ausencia de la enzima o a una enzima defectuosa que convierte el piruvato en oxalacetato.
Se caracteriza por grados variables de retraso mental y alteraciones de varias rutas
metabólicas, especialmente las que corresponden a los aminoácidos y sus productos de
degradación. Un síntoma destacado de esta enfermedad es la acidemia láctica (ácido láctico
en la orina). Tras revisar la función de la piruvato carboxilasa, explique por qué se produce
este síntoma.
La piruvato carboxilasa se encarga de pasar los piruvatos a oxalacetato, si esta enzima está
fallando entonces no se podrá producir oxalacetato a base del piruvato y el cuerpo para poder
deshacerse de él es probable que lo mande a la fermentación láctica. Por esto vemos el
aumento de ácido láctico en la orina, hay una concentración mayor de este producto.
15). Describa brevemente la justificación biológica de cada uno de los siguientes fenómenos
alostéricos: (a) la activación de la piruvato descarboxilasa por la acetil-coA, (b) la activación
por la piruvato deshidrogenasa quinasa por el NADH, (c) la inhibición de la isocitrato
deshidrogenasa por el NADH, (d) la activación de la isocitrato deshidrogenasa por el ADP,
(e) la inhibición de la a-cetoglutarato deshidrogenasa por la succinil-CoA, y (f) la activación
del complejo piruvato deshidrogenasa por el AMP.

*La piruvato descarboxilasa pasa el piruvato a acetaldehído. Esta se activa con el acetil-CoA
ya que si hay aumentos de acetil-CoA no es necesario que el piruvato pase a acetil-CoA por
medio de la otra ruta.
*La piruvato deshidrogenasa quinasa la cual fosforila a la piruvato deshidrogenasa se activa
por NADH ya que al haber cantidades altas de NADH se puede hacer glucólisis, proceso
regulado por esta misma enzima.
*La enzima isocitrato deshidrogenasa cataliza una descarboxilación oxidativa la cual depende
de NAD + y da como resultado NADH, en caso de tener altos niveles de NADH no es
necesario llevar a cabo esta reacción y por ende se inhibe.
*Como explicado anteriormente el proceso que cataliza la enzima isocitrato deshidrogenasa
es una descarboxilación oxidativa y en el proceso produce ATP, entonces se necesita de ADP
para esta producción y por eso vemos que la presencia de esta molécula activa a la enzima.