DEPARTAMENTO DE CIENCIAS QUÍMICAS Y

DINÁMICAS

BIOQUÍMICA V

ENZIMAS
Q.F. Nelson Hermógenes Urcia Yengle
 ENZIMAS
Prácticamente todas las reacciones químicas que tienen lugar en los
seres vivos( animales, vegetales) están catalizadas por enzimas. Las
enzimas catalizan todas las reacciones biológicamente importantes.

Muchas áreas de la medicina se han visto notablemente beneficiadas

por la aplicación del análisis enzimático, enfermedades como: la
galactosemia, los infartos de miocardio, las enfermedades ósea, el
cáncer de próstata, la enfermedad hepática obstructiva y las distrofias
musculares pueden citarse como ejemplos clínicos comunes.

Etimología: del griego y significa “ en levadura “. Introducida por

Kühne en 1878.
Las enzimas son proteínas que actúan como biocatalizadores
específicos, incrementan la velocidad de las reacciones químicas
llevándolas más rápidamente a su posición de equilibrio,
Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células
no podrían existir.
Las enzimas pueden actuar dentro de la célula , fuera de ésta, y en el
tubo de ensayo.
Las enzimas como catalizadores que son no hacen factibles las
reacciones imposibles, sino que sólo aceleran las que espontáneamente
podrían producirse.
Una enzima puede transformar 1000 moléculas de sustrato/ segundo
Las enzimas hacen posibles la combustión de una grasa a 37°C. La
misma grasa arde en una vela( sin catalizador) a 700°C
Vela(CH₂)n grasa + 3/2 O₂ n CO₂ + nH₂O + energía
( calor)
En la célula hepática:
37ºC
(CH₂)n grasa + 3/2 O₂ Enzimas n CO₂ + nH₂O + energía ( calor)
Por ejemplo: H2O + CO2 H2CO3 H+ + HCO3-
La velocidad de reacción de la descomposición no catalizada del ácido
carbónico en H2O y CO2 es baja, no alcanzándose el equilibrio hasta
transcurridas varias horas. Si se añade anhidrasa carbónica a una
muestra de agua carbonatada, se alcanzará el equilibrio en minutos o
incluso en menos tiempo. Los hematíes son especialmente ricos en
anhidrasa carbónica.
Una enzima no afecta la constante de equilibrio de la reacción que
catalizan, de manera que la reacción tiene lugar más rápidamente
aceleran .

La enzima disminuye la energía de activación

 Sin enzima
Con enzima
• La Energía de activación a de la
hidrólisis de la urea baja de 30 a 11
kcal/mol con la acción de las enzimas,
E+S La temperatura necesario para
producir la reacción no catalizada seria
de 529°C

E+P
Tiempo de la reacción
 Características de las enzimas
Es una proteína
Actúan en baja concentración
No sufren modificaciones durante la reacción
Se recupera intacta
No afecta el equilibrio de la reacción, pero si su velocidad
Son específicas
Cada enzima tiene una forma única con un sitio o centro
activo en el que se une al sustrato
Son catalíticas
Su actividad catalítica está regulada.

Existen TRES características fundamentales en la catálisis general y la

enzimática en particular; que los catalizadores NO tienen :
 Especificidad por el sustrato
 Se inactivan por desnaturación
 Pueden ser reguladas
 Estructura de una enzima:

Además del componente proteico, muchas enzimas requieren

constituyentes no proteicos para su función como catalizadores. Estas
sustancias accesorias reciben diversos nombres, como cofactor, grupo
prostético o coenzima.

Los cofactores,.
Son pequeñas moléculas orgánicas e inorgánicas( átomos, iones o
moléculas) esenciales para la catálisis, sin ser enzima ni substrato. Así
por ejemplo, la actividad de la β- hidroxibutirato deshidrogenasa
requiere fosfolípidos. Estos lípidos son cofactores.

Algunas enzimas requieren cofactores catiónicos( Cu,Mg2+,Zn2+,etc o

aniónicos inorgánicos como ion cloruro( Cl1- etc ) necesario para la α-
amilasa pancreática.
El término coenzima se aplica a la molécula orgánica, derivadas a
menudo de una vitamina y que son esenciales para la actividad
catalítica de una enzima. Generalmente, la coenzima está unida de
forma tan débil que la simple diálisis la separa de la proteína.

El grupo prostético es cualquier porción no aminoacídica de una

proteína que confiere a ésta alguna propiedad especial. Así el hemo,
que confiere una elevada capacidad de fijación del oxígeno, es el
grupo prostético de la hemoglobina.
El grupo prostético se halla unido a la proteína mediante enlaces
covalentes, que para disociarse de la enzima requiere ácidos fuertes.

La apoenzima; es la parte proteica de la enzima y es catalíticamente

inactiva.

Enzima : apoenzima + cofactor 

La anhidrasa carbónica, es una clase de enzima conocida como
metaloenzima, dado que, para poder actuar, tiene unos
requerimientos absolutos de al menos 1 átomo gramo de zinc por mol
de proteína. La separación del zinc produce la completa inactivación
de la anhidrasa carbónica

El hombre necesita ingerir con la dieta muchos metales en cantidades

muy pequeñas, lo cual constituye la expresión directa de las
necesidades de ciertos metales específicos en las estructuras de
diversas enzimas.

El complejo funcional completo de una proteína y todos sus factores

accesorios necesarios reciben el nombre de holoenzima:
 
Holoenzima= apoenzima + coenzima( cofactor)
 Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias a:
• Fijación estereoquímicamente complementaria del substrato
• Transformación catalítica del mismo
En ambas funciones participan:
• Cadenas laterales de los aminoácidos( R )
• Grupos o moléculas no proteicas:
 Grupos prostéticos
 Iones metálicos
 Cofactores
Como cualquier otro material biológico, las enzimas están sujetas a recambio y
sustitución. Por consiguiente, toda dieta debe incluir suficientes aminoácidos
esenciales, metales y vitaminas para la reposición de las enzimas.

La limitada capacidad de almacenamiento de la mayoría de los iones

metálicos esenciales y la labilidad biológica de la mayor parte de las
vitaminas en el ser humano, hacen necesario satisfacer de forma
continua las necesidades nutricionales de todos los componentes
enzimáticos.
Las coenzimas de difusión libre, por lo general, sirven como
acarreadores de reutilización continua de hidrógeno ( FADH2), hidruro
( NADH + H+ y NADPH +H+ ) o de unidades químicas como los grupos
acilo ( Coenzima A ) o los grupos metilo ( folato), para depositarlos
entre los puntos de generación y consumo..
Las enzimas que requieren coenzimas incluyen a las catalizadoras de
las oxidorreducciones, reacciones de transferencias de grupos y de
isomerización, y las reacciones formadoras de enlaces covalentes
( clases: 1,2,5 y 6).
Las reacciones líticas catalizadas por las enzimas
digestivas( hidrolasas), no requieren coenzimas
 Clasificación de las coenzimas

a) Por la transferencia de grupos diferentes del hidrógeno:

.- Fosfato de azúcares
.- CoA-SH
.- Pirofosfato de tiamina
.- Coenzima del folato
.- Biotina
.- Coenzima de la cobalamida ( B12 )
.- Acido lipoico

b) Por la transferencia de hidrógeno:

.- NAD⁺, NADP⁺
.- FMN, FAD
.- Acido lipoico
.- Coenzima Q
Algunos elementos inorgánicos, que son cofactor para enzimas
Vitaminas que no forman parte de cofactores enzimáticos
Liposolubles
Retinoides vit. A
Calciferoles vit. D
Tocoferoles vit. E

Cofactores redox
Operan en procesos de transferencia electrónica, a veces
como aceptores, a veces como donadores.
- Cofactores piridínicos (NAD+, NADP+)
- Cofactores flavínicos
- Cofactores hemínicos
- Ferredoxinas
- Quinonas
- Ác. Ascórbico
- Ác. Lipoico
- Glutatión
 CONH2
NH2
+ N
O O
N N
CH2 O P O P O CH2 O N
OH OH O- O- N
H H
O H H
NAD+
OH OH

Nicotinamida - Ribosa - P - P - Ribosa - Adenina

CONH2
NH2
+ N
O O
N N
CH2 O P O P O CH2 O N
OH OH O- O- N
H H
O H H

NADP+ OH
-
O
O P O
O-
 NAD+, NADP+ NADH, NADPH
(Formas oxidadas) (Formas reducidas)

CONH2 H H
CONH2

N
N

AH2 A + H+

AH2 + NAD(P)+ A + NAD(P)H + H+

 Citocromos

Son proteínas de tamaño pequeño, que operan como transportadores

monoelectrónicos debido a una transición

Fe2+ Fe3+

Se distinguen tres tipos:

1. Citocromos A: Alto potencial redox (transportadores terminales)

2. Citocromos B: Bajo potencial redox
3. Citocromos C: Potencial redox intermedio

(Se distinguen por su espectro característico de absorción)

 SISTEMAS ENZIMÁTICOS:

E + S ES E + P
Sustrato(S): es la molécula sobre la cual actúa la enzima para formar
productos. Como la mayoría de las reacciones enzimáticas son de
tipo reversible, los productos de una reacción en un sentido pueden
transformarse en sustratos de una reacción en sentido inverso.

Complejo enzima sustrato( ES): Es el estado de transición o de

activación, en la cual los enlaces del sustrato están distorsionado e
inestable al máximo( es el alto nivel energético).
El máximo nivel de energía corresponde a la configuración más
inestable del sustrato y el estado en que la cambiante molécula de
sustrato está más fuertemente unida a los grupos funcionales de la
enzima que participan en la reacción.
Un vez que se ha formado el estado de transición, éste puede volver a
sustrato o descomponerse en productos. La enzima no cambia el nivel
energético inicial de los sustrato o el final de los productos.

Donde ES representa un estado de transición en el sitio activo del

complejo enzimático, el acoplamiento del sustrato al sitio activo da
lugar a que el sustrato adopte un estado de transición mediante una
o de los siguientes mecanismos: un sistema de transferencia de
carga, la distorsión conformacional de las moléculas del sustrato u
otros procesos en virtud de las cuales el sustrato del complejo
enzima – sustrato adopta la conformación de transición necesaria
para su conversión en producto.

E + S ES E + P
Producto o Productos: Es la sustancia resultante de la acción de la
enzima sobre su sustrato.

Las abzimas ( anticuerpos catalíticos ) son anticuerpos contra el

complejo del estado de transición. Pueden actuar como enzimas
artificiales. Por ejemplo se han diseñado abzimas contra el complejo
de estado de transición de la cocaína esterasa, la enzima que degrada
en el organismo.

Estas abzimas tienen actividad esterásica, y pueden utilizarse

inyecciones mensuales de abzima contra la droga para destruir
rápidamente la cocaína en la sangre, disminuyendo la dependencia de
los individuos adictos.
 Especificidad de una enzima:

Cada enzima usualmente cataliza una reacción bioquímica específica.

La capacidad de una enzima para seleccionar únicamente un sustrato
y distinguir ese sustrato de un grupo de compuestos muy similares se
denomina especificidad.

La especificidad reside en una región particular de la superficie

enzimática llamada sitio de unión del sustrato, el cual es un
disposición de grupos químicos en la superficie enzimática hecha en
forma específica para unirse a un sustrato determinado. En el sitio de
unión al sustrato puede estar integrado el sitio activo.
Muchas enzimas tienen un solo sustrato biológico, especificidad
absoluta por ejemplo citaremos a la glucosa oxidasa que actúa solo
sobre la glucosa.
mientras que otras tienen especificidad más amplia y utilizan varias
moléculas estructuralmente semejantes, Especificidad relativa ( o de
grupo ), por ejemplo citaremos, la hexoquinasa( hexocinas) que
fosforila a la glucosa, fructosa, manosa y glucosamina.

Los enzimas son estereoespecíficas porque forman varias

interacciones entre aminoácidos del centro activo y los distintos
grupos del sustrato.
 Clasificación de enzimas
La comisión de enzima de la unión Internacional de bioquímicos ha
dividido los tipos de reacción básica y las enzimas que las catalizan, en
seis clases numeradas: oxidorreductasa, 2) transferasa, 3) hidrolasas,
4) liasas, 5) isomerasas y 6) ligasas.

Clase 1: OXIDORREDUCTASAS:

Catalizan reacciones de oxidorreducción, es decir, transferencia de

hidrógeno (H) o electrones (e-) o de oxígeno de un sustrato a otro,
según la reacción general:

Ared + Box Aox + Bred

AH2 + B A + BH2
En las reacciones redox, siempre tienen que estar presentes a la vez
el aceptor y el dador electrónico.
Normalmente una coenzima de transferencia electrónica, tal como el
NAD+/NADH+H+, actúan como donador o aceptor electrónico

Pertenecen a esta clase los siguientes grupos de enzimas:

Deshidrogenasas
Oxidasas
Peroxidasas
Oxigenasas
Hidroxilasas
Reductasas, etc.

Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y

colesterol oxidasa). Deslignificación ó Bioblanqueamiento
Clase 2: TRANSFERASAS :
Catalizan la transferencia de un grupo químico (distinto del
hidrógeno) de un sustrato a otro, según la reacción:
A-X + B A + B-X
Clasificación de subgrupo de las transferasas:
Aciltransferasas
Glicosiltransferasas
Alquil- o Ariltransferasas
Grupos nitrogenados
Grupos fosfato
Grupos sulfato
Grupos selenio

Aplicaciones: Síntesis de oligosacáridos

Si el grupo transferido es un fosfato energético, la enzima es una
quinasa ( kinasa ), si es un glucosilo, la enzima es un
glucosiltransferasa, si se trata de un ácido graso la enzima es una
aciltransferasa.

En las transaminaciones, se dona un grupo amino( - NH2) la enzima se

denomina transaminasa o aminotransferasa. Se necesita la coenzima
Piridoxal fosfato para todas las transaminasas

Cuando el aspecto fisiológico importante de la reacción es el

compuesto que se sintetiza, la transferasa puede denominarse
sintasa. Por ejemplo, la enzima comúnmente llamada glucógeno
sintasa transfiere un residuo glucosídico desde el UDP- glucosa a una
molécula de glucógeno. Su nombre sistemático es la UDP-glucosa-
glucógeno glucosiltransferasa.
 Clase 3: HIDROLASAS:
Catalizan las reacciones de hidrólisis y también su reverso. Son las más
comunes en el dominio de la tecnología enzimática.
Se escinden los enlaces C-O, C-N o C- S mediante la adición de agua
en forma de OH- y H+ a los átomos que forman el enlace( p.e enlace
peptídico )
A – B + H2O A - OH + B - H

No se suelen utilizar nombres sistemáticos en las hidrolasas. Muchas

de ellas conservan el nombre Primitivo. Ejemplo: Quimosina

Clasificación de las hidrolasas:

Esterasas (carboxilesterasas, fosfoesterasas, sulfoesterasas)
Glicosidasas
Éter hidrolasas
Péptido hidrolasas
Acil anhídrido hidrolasas.
Aplicaciones: Lipasas → Síntesis de tensioactivos
Proteasas → Fabrico de quesos
Glicosidasas → Clarificación de jugos; liberación de

aromas en los vinos; aplicaciones textiles

Un ejemplo es la lactasa, que cataliza la reacción:
Lactosa + agua glucosa + galactosa

Caso particular  Péptido hidrolasas: clasificación común (no

sistemática)

I. Según la situación del enlace atacado:

- Exopeptidasas (extremos de la cadena) (Peptidasas)
- Endopeptidasas (interior de la cadena) (Proteinasas)
II. Según el mecanismo catalítico:
- Serin proteinasas
- Tiol proteinasas
- Aspartil proteinasas
- Metaloproteinasas
Clase 4: LIASAS:
Catalizan reacciones de ruptura o soldadura de sustratos, que
escinden enlaces C-C, C-O y C-N de forma diferente a la hidrólisis o la
oxidación: A-B A+B

Algunas enzimas que rompen el enlace C-C se denominan aldolasas,

Descarboxilasas ( cuando se libera CO2 ) y tiolasas ( cuando se utiliza
el nucleófilo que contiene azufre de la cisteína o de la CoASH para
romper el enlace carbono-carbono)

Un ejemplo es la acetocetato descarboxilasa, que cataliza la

reacción: ácido acetacético CO2 + acetona

Esta clase de enzima incluye también deshidratasas, sintasas p.ej.

citrato sintasa.

Aplicaciones: Pectato liasa – Remueve los compuestos indeseables

(ceras, pectinas, proteínas) en fibras en la industria textil
Clase 5: ISOMERASA:
Catalizan reacciones de isomerización moleculares. Muchas
reacciones bioquímicas simplemente reorganizan los átomos
presentes en una molécula, es decir catalizan la interconversión de
isómeros ( crean isómeros de la molécula de partida ):
A B

Son ejemplos la fosfotriosa isomerasa y la fosfoglucosa isomerasa

fosfotriosa isomerasa
gliceraldehído-3-fosfato dihidroxiacetona -fosfato
fosfoglucosa isomerasa
glucosa-6-fosfato fructosa-6-fosfato
Las enzimas que catalizan movimientos de un fosfato de un átomo a
otro átomo dentro de la molécula se llaman mutasas
 Clasificación de las isomerasas:
Racemasas y Epimerasas
cis –Trans - Isomerasas
Oxidoreductasas Intramolecular
Transferasas Intramolecular (mutases)
Liasas Intramoleculares
Clase 6: LIGASAS:
Estas enzimas sintetizan enlaces C-,C-S,C-O y C-N, en reacciones
acopladas a la ruptura de un enlace fosfato del ATP o de otro
nucleótido ( GTP, etc ): A + B + XTP A-B + XDP + Pi

Las carboxilasas, por ejemplo añaden CO₂ a otro compuesto en una

reacción que requiere la hidrólisis del ATP para proporcionar energía.
La mayoría de las carboxilasas necesitan la coenzima biotina.
Por ejemplo en una reacción la piruvato carboxilasa, que cataliza la
reacción: piruvato + CO2 + ATP oxaloacetato + ADP + Pi
Otras ligasas se denominan sintetasas ( p.ej. acil- CoA sintetasa).
Las sintetasas se diferencian de las sintasas , mencionadas como “
liasas “ y “ un grupo de transferasas “, en que aquéllas obtienen
energía para formar el nuevo enlace, de la ruptura de un enlace
fosfato, mientras que las sintasas utilizan otra fuente distinta de
energía

NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS:

Hay varias formas mediante las cuales se asigna un nombre a un

enzima:
nombres particulares
nombre sistemático
código de la comisión enzimática (enzyme comission)

Antiguamente, los enzimas recibían nombres particulares, asignados

por su descubridor. Como por ejemplo, pepsina, ptialina, tripsina,
renina, lisozima, ureasa etc.
Al ir aumentando el número de enzimas conocidos, se denominan
con la terminación “ asa “ tomando como base la identidad de los
sustratos participantes en la reacción, por ejemplo, sacarasa, sucrasa
o invertasa que actúan sobre la sacarosa, sucrosa (sustrato ), lactasa
sobre la lactosa( sustrato, etc.
Al ir aumentando aún más el número de enzimas conocidos, se hizo
necesaria una nomenclatura sistemática: El nombre sistemático de
un enzima consta actualmente de 3 partes: el sustrato preferente
el tipo de reacción realizado terminación "asa“. Que informa sobre la
acción específica de cada enzima y los sustratos participantes sobre
los que actuaba en la reacción. Un ejemplo sería la glucosa fosfato
isomerasa que cataliza la isomerización de la glucosa-6-fosfato en
fructosa-6-fosfato.

Muchos enzimas catalizan reacciones reversibles. No hay una

manera única para fijar cual de los dos sentidos se utiliza para
nombrar al enzima. Así, la glucosa fosfato isomerasa también podría
llamarse fructosa fosfato isomerasa.
Otro, ejemplo, la enzima que cataliza la descarboxilación de la
histidina se llama descarboxilasa de la histidina o también histidina
descarboxilasa.

Otra, que cataliza la eliminación de dos átomos de hidrógeno del

alcohol etílico para formar acetaldehído, se llama deshidrogenasa del
alcohol ó alcohol deshidrogenasa.

Conforme fuero descubriéndose más y más enzimas con funciones

diversas se crearon otros nombres: oxidasas, oxigenasas, cinasas,
tiocinasas, mutasas, transaldolasa, transcetolsa, fosforilasas,
fosfatasas, polimerasas, tropoisomerasas y otras más.

Para remediar esto, la International Unión of Biochemistry ( IUB )

adoptó un sistema complejo, pero inequívoco, de nomenclatura
enzimática basado en el mecanismo de la reacción, las reacciones y
las enzimas constituyen seis clases, cada una de las cuales tienen
subclases.
El nombre de cada enzima puede ser identificado por un código
numérico, encabezado por las letras EC (enzyme commission),
seguidas de cuatro números separados por puntos:
El primer número indica a cuál de las seis clases pertenece el enzima,
El segundo se refiere a distintas subclases dentro de cada grupo,
El tercero se refieren a los grupos químicos específicos que
intervienen en la reacción y
El cuarto corresponde a la enzima específica.

Así, el : E.C. 2.7.1.1, denota la clase 2 ( una transferasa ), la subclase 7

( transferencia de fosfato ), la subsubclase 1 ( un alcohol constituye el
aceptor del fosfato ). El digito 1 denota la hexocinasa, o ATP: D-
hexosa-6-fosfotransferasa, una enzima catalizadora de la transferencia
del fosfato del ATP al grupo hidroxilo sobre el carbono 6 de la glucosa.
En paréntesis puede seguir información adicional, si es que se
requiere para mayor claridad.
Por ejemplo, la enzima catalizadora de:
L-Malato + NAD+ Piruvato + CO2 + NADH + H+
se designa como : E.C. 1,1,1.37 L- malato: NAD+ oxidorreductasa
( descarboxilante )
Otro, ejemplo: ATP: glucosa fosfotransferasa ( glucoquinasa ) se
define como EC 2.7.1.2. El número 2 indica que es una transferasa, el
7 que es una fosfotransferasa, el 1 indica que el aceptor es un grupo
OH, y el último 2 indica que es un OH de la D-glucosa el que acepta el
grupo fosfato
Ejemplo: Glutationa sintasa (EC 6.2.2.3)
Nombre sistémico: G-L- glutamilo - L- cisteina:glicina ligase

Ejemplo: Glucosa isomerasa (EC 5.3.1.5)

ATP: D-Hexosa Fosfotransferasa EC 2.7.1.1

Nombre común: hexokinasa