Unidad

Genética
Molecular
Enlaces en la Red sugeridas:
• BioRom 2007= http://www.biorom.uma.es
• Garrety & Grisham, Biochemistry =
http://www.web.virginia.edu/Heidi/home.htm

Dra. M. Soledad Orellana O.

Organizació
n del
genoma
 ¿Qué es el genoma?
Todos los seres vivos tienen información específica
necesaria para mantenerse y reproducirse.
Esta información es codificada en el DNA.
El DNA está dividido en unidades fundamentales llamadas
genes. (Wilhem Johanson, 1909). Los genes son las
unidades de la herencia, y tienen todas las instrucciones
para hacer un producto funcional (proteína, ARN).

Aparte de los genes, hay un sin número de elementos

genéticos como señales reguladoras, secuencias repetidas
y sitios de recombinación.
Al conjunto de elementos que forman el cromosoma de un
organismo, y a su organización estructural y funcional le
llamamos Genoma.
 Dogma Central
Biología Molecular
MUTACIÓN

genoma
información REPLICACIÓN
autoduplicación DNA

información

TRANSCRIPCIÓN
síntesis RNA
Funciones DNA
como material Núcleo
transcriptoma
genético información
citoplasma

TRADUCCIÓN
proteína síntesis proteínas
ribosoma

proteína
proteoma
 Algunos genomas
secuenciados

ORGANISMO TAMAÑO GENOMA (MB) No DE GENES AÑO

Methanococcus jannaschii 1.66 2,493 1996

Haemophilus influenzae 1.83 1,791 1995
Escherichia coli 4.64 4,397 1996
Mycobacterium tuberculosis 4.41 3,924 1998
Saccharomyces cerevisiae 12 6,548 1997
Caenorhabditis elegans 97 > 20,000 1998
Drosophila melanogaster 170 ~16,000 2000
Arabidopsis thaliana 120 ~20,000 2000
Oryza sativa 415 ~20,000 2002
Homo sapiens sapiens 3,200 ~25,000 2001

Hay un incremento del tamaño mínimo del genoma

necesario para formar organismos de mayor complejidad
El número de genes no permite
explicar la complejidad de los
organismos vivos

No hay una correlación entre el tamaño

del genoma y la complejidad génica.
Proyecto genoma humano: Consorcio Internacional del
Proyecto Genoma Humano (entidad pública internacional)
y Celera Genomics (entidad privada de EEUU)
Año 2000 primer borrador (87 % de la secuencia)
Año 2003 92,3 % del total estimado (3063 Mb)

Mapas físicos, mapas de ligamiento genético y su utilización en el

Proyecto Genoma Humano.
 IHGSC (2001) and Venter et al. (2001).

GENOMA HUMANO

Genoma nuclear Genoma mitocondrial

3.200 megabases (en el genoma haploide) 16,6 Kb
20.000 a 25.000 genes 37 genes

38% 62%
2 genes 22 genes 13 genes
RNAr RNAt proteínas

Genes y DNA
secuencias extragénico
15 % copia única 47 % ADN repetitivo
relacionadas
2% 36% o bajo N° copias

DNA DNA 2% repetidos en 45 % repetidos

Codificante no codificante tándem dispersos
(exones de genes • DNA satélite • LINES
que generan • DNA mini satélite • SINES
proteínas) • DNA microsatélite • Transposones

Genes de pseudogenes intrones secuencias

otros ARN y fragmentos no traducidas
funcionales génicos (5’UTR, 3’UTR, promotores)
GENOMA MITOCONDRIAL
 Doble cadena circular 16.569 pb
Cadena pesada (H)
Cadena liviana (L)
 Presente en miles de copias
 Posee 37 genes
28 Cadena H
9 Cadena L
13 de los genes codifican proteínas de la
respiración celular)
 93% es codificante
 La mayoría de las proteínas de la
mitocondria están codificadas en el
genoma nuclear

 Es heredado de la madre

Los componentes proteínicos
constituyentes de la cadena
oxidativa son 80…pero la
mitocondria codifica sólo 13
La mitocondria depende de
proteínas codificadas por el
genoma nuclear para
garantizar sus funciones

La mitocondria no
exporta sus productos
génicos

El ADNmt tiene mayor susceptibilidad a sufrir mutaciones

-La mitocondria no dispone de sistemas eficientes de reparación.
-El ADNmt no está asociado a proteínas Histonas, por lo que podría estar
menos protegido.
-El ADNmt está en la matriz mitocondrial, donde se produce gran
cantidad de radicales libres como productos secundarios de la
fosforilación oxidativa.

LOS POLIMORFISMOS ACUMULADOS EN EL ADNmt SONN HASTA 17

VECES MAYORES QUE AQUELLOS ENCONTRADOS EN EL ADN NUCLEAR
 GENOMA NUCLEAR

Genoma nuclear
3.200 megabases (en el genoma haploide)
20.000 a 25.000 genes

38% 62%

Genes y DNA
secuencias extragénico
15 % copia única 47 % ADN repetitivo
relacionadas
2% 36% o bajo N° copias

DNA DNA 2% repetidos en 45 % repetidos

Codificante no codificante tándem dispersos
(exones de genes • DNA satélite • LINES
que generan • DNA mini satélite • SINES
proteínas) • DNA microsatélite • Transposones

Genes de pseudogenes intrones secuencias

otros ARN y fragmentos no traducidas
funcionales génicos (5’UTR, 3’UTR, promotores)
Niveles de organización de
la cromatina
 GENOMA NUCLEAR: DNA génico

Genoma nuclear
3.200 megabases (en el genoma haploide)
20.000 a 25.000 genes

38% 62%
Un gen es una secuencia de nucleótidos
que almacena la información para sintetizar
Genes y DNA
un producto génico funcional
secuencias extragénico
relacionadas
2% 36%

DNA DNA
Codificante no codificante
(exones de genes
que generan
proteínas)
Genes de pseudogenes intrones secuencias
otros ARN y fragmentos no traducidas
funcionales génicos (5’UTR, 3’UTR, promotores)
 Secuencias de ADN que
contienen la información
Genes para codificar un
producto génico
funcional

Productos génicos: Proteínas y ARN

estructurales y catalíticos.

En el caso de las proteínas, se requiere Núcleo

de un intermediario, el ARNm y también GEN
ARNt
se requiere del ARNr y del ARNt para su Proteína
ARNm ARNr
procesamiento hasta la formación del
ARNm
producto
 El tamaño promedio de un gen humano es de
Los genes son 20.000 a 30.000pb

discontínuos: El tamaño promedio de un ARNm es 1800 a

2200 pb
Poseen EXONES e pero basados en el código genético (3pb:1aa)
INTRONES son necesario sólo 1.200pb para codificar una
proteína promedio de 400aa.

Glu- Glu- Glu- Glu-Glu- Glu- Secuecia de aa: 6 aa

CAG-CAG-CAG-CAG-CAG-CAG Secuecia de ADN: 6 codones

Esta relación no se cumple

Glu- Glu- Glu- Glu-Glu- Glu- Secuecia de aa: 6 aa

CAG-CAG-CAG-CCC-CCC-CCC-CAG-CAG-CAG Secuencia de ADN: 9

codones
Estructura de un gen eucarionte, que codifica
para una proteína
 GENOMA NUCLEAR: DNA codificante

Genoma nuclear
3.200 megabases (en el genoma haploide)
20.000 a 25.000 genes

38% 62%

Genes y DNA
secuencias extragénico
relacionadas
2%

DNA
Codificante ~ 2% del total del genoma es ADN codificante
(exones de genes
que generan
proteínas)
DNA codificante
Genes y sus funciones

23.2%: Control de la expresión, replicación y mantenimiento del genoma.

21.1%: Transducción de señales.
38.2%: Sistemas de transporte, plegamiento de proteínas, elementos
estructurales.
17.5%: Funciones bioquímicas generales de la célula
Contraste en la densidad de
genes:
(A) región HLA (Human Leukocyte Antigen),
(B) región del gen distrofina.
 GENOMA NUCLEAR: DNA no codificante

Genoma nuclear
3.200 megabases (en el genoma haploide)
20.000 a 25.000 genes

38% 62%

Genes y DNA
secuencias extragénico
relacionadas
36%

DNA
no codificante

Genes de pseudogenes intrones secuencias

otros ARN y fragmentos no traducidas
funcionales génicos (5’UTR, 3’UTR, promotores)
RNAr

RNAt
snRNA Participan en el
procesamiento del snoRNA Participan en el
procesamiento del
ANRm, en el splicing ARNr
Principales clases de ncRNAs (RNA no codificantes) de mamíferos:
ADN Génico NO CODIFICANTE
No expresado

Pseudogenes: Son genes no funcionales. Pueden

considerarse elementos resultantes de la evolución del
genoma (el cual está sufriendo cambios continuamente).
Productos de mutaciones.

Fragmentos de Genes: son aquellos genes que han

perdido parte de sus extremos. Genes truncados.

Intrones: Secuencias intragénicas no transcritas. Se

encuentran entre los exones, los cuales corresponden a
los segmentos del gen que si posee la información que
será traducida a proteína.

Secuencias no traducidas: Secuencias de un gen que se

ubican río arriba del inicio de la transcripción: Región
promotora y dentro de la secuencia transcrita, pero que
no se traduce: 5’UTR y 3’ UTR
 GEN PSEUDOGEN

Intrones Mutaciones puntuales

acumuladas, que lo hacen no
5’ UTR 3’ UTR funcional (codones de
término prematuros)
Intrones y Exones Splicing alternativo
(~60% de los genes humanos)
 GENOMA NUCLEAR: DNA extragénico

Genoma nuclear
3.200 megabases (en el genoma haploide)
20.000 a 25.000 genes

38% 62%

Genes y DNA
secuencias extragénico
15 % copia única 47 % ADN repetitivo
relacionadas
o bajo N° copias

2% repetidos en 45 % repetidos
tándem dispersos
• DNA satélite • LINES
• DNA mini satélite • SINES
• DNA microsatélite • Transposones
GENOMA NUCLEAR:
DNA extragénico, DNA repetitivo
Aproximadamente el 50% del genoma humano está constituido
por DNA repetitivo, antes conocido como DNA basura…

Repeticiones Dispersas:
Una secuencia específica se repite n veces a lo largo del genoma en forma
aparentemente aleatoria. Ejemplo: LINES, SINES y Transposones.

-----CATGATTA------/-----CATGATTA------/-----CATGATTA------/------

Repeticiones en TANDEM o grupos: Secuencias de longitud variable que se

repiten en grupo. Ejemplo: ARNr, Microsatélites, minisatélits, satélites
(estos están altamente repetitivos).
-------CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG---------
GENOMA NUCLEAR:
DNA repetitivo en TANDEM
DNA satélite
SATELITES: DNA centromérico. Secuencias de 5-
220 pb, repetidas hasta un millón de veces. Se
Resto del DNA
separa del resto del ADN por centrifugación (>
proporción de A+T lo hace menos denso)

MINISATELITES: 6 – 25 pb, que forman complejos de hasta 20 kb de extensión

(LTR, Long terminal repeat)
Incluye el ADN de los telómeros y la sec. de ADN hipervariable que está cercana a
los centrómeros. Algunas repeticiones de este tipo son polimórficas, y dan lugar a
los marcadores de tipo VNTR.

MICROSATELITES: 2, 3 o 4 pb repetidas hasta un tamaño total de no más de 150 pb

(STR, Short terminal repeat). Lo más frecuente son repetidos de dinucleótidos con
alrededor de 140.000 copias en todo el genoma, normalmente CA o CAG.
GENOMA NUCLEAR:
DNA altamente repetitivo DISPERSO (45% del genoma nuclear)
 GENOMA NUCLEAR:
DNA altamente repetitivo DISPERSO (45% del genoma nuclear)

• LINES (long interpsersed elements) Elementos dispersos largos

(21% del total del genoma nuclear):
Secuencias de 1 a 5 kb presentes en 20.000 a 850.000 copias por
genoma humano, se localizan predominantemente en las bandas G
de los cromosomas.

Principal es Line-1 o L1, representa un 15% del genoma. Codifica

para una ARN binding protein y otra con actividad endonucleasa y
retrotranscriptasa, son retrotransposones.
• SINES (short interpsersed elements) Elementos dispersos cortos
(13% del total del genoma nuclear): secuencias de 200 a 300 pb
repetidas miles de veces. Elementos Alu en humanos, con
1.500.000 copias por genoma, se localizan predominantemente en
las bandas R de los cromosomas. Actúa como retrotramposón, no
codifica ninguna proteína.
• HERV (retrovirus endógenos humanos), representan copias de los
retrovirus humanos que se han ido integrando en el genoma humano en el
curso de la evolución y con frecuencia son el origen de proto-oncogenes
celulares.

Habitualmente representan copias truncadas del genoma de estos virus, y

constituyen alrededor de un 8% del genoma (hay unas 450.000 copias).
• Transposones: (3% del
genoma)

Son secuencias cortas de ADN (de 1

kb) que pueden moverse en forma
independiente y crear copias
adicionales de si mismos, debido a que
un transposón contiene en gen de una
enzima transposasa.

Estos elementos pueden ser la causa

de enfermedades genéticas por
reordenamientos cromosómicos.
 Resumen de las Características Generales
del Genoma Humano Nuclear
-Sólo un pequeño porcentaje del ADN genómico (1,5%)
corresponde a ADN codificante

-Los genes son de tamaño diverso y son discontinuos, con

presencia de Exones e Intrones.

-Un 50% del genoma está formado por DNA repetitivo, y gran
parte de éste son elementos móviles: LINES, SINES, Transposones.

-Existe una proporción importante del genoma que se encarga del

control de la expresión del ADN codificante. Determinan el tiempo,
espacio y magnitud de la expresión.
 Variabilidad genética humana

Pequeñas variaciones genómicas

fundamentan buena parte de la
variabilidad fenotípica interindividual.

SNPs (Single nucleotide polimorphisms)

¡Bienvenidos a la er
Genómica!