Unidad III: Genética humana y citogenética.

Proyecto Genoma humano

Proyecto genoma Humano

Genoma Humano: Es el set de la información

genética completa en el humano (Homo sapiens)
 Consorcio Internacional público
Francis Collins/Aris Patrinos
1990: inauguración (NIH-DOE)
2000: 1° borrador
2003: publicación
3.000 millones de dólares
Sector privado: Celera Corporation
Craig Venter
1998: inauguración El Proyecto Genoma Humano (PGH)
2001: 1° borrador
2003: publicación
fue un proyecto de investigación
científica con el objetivo
fundamental de determinar la
secuencia de pares de bases
químicas que componen el ADN e
identificar y cartografiar los
aproximadamente 20.000-25.000
genes del genoma humano desde
un punto de vista físico y
funcional.
Objetivos del proyecto genoma humano

 Identificar todos los genes humanos

 Desarrollar el mapa de ligamiento genético del genoma humano
 Obtener el mapa físico del genoma humano
 Desarrollar la tecnología para el procesamiento de toda la información del
genoma humano
 Conocer las funciones de todos los genes
 Determinar la secuencia de las más de 3 billones de pares de bases que
conforman el genoma completo
 Depositar la información del genoma humano en base de datos públicas
 SECUENCIACION DEL ADN (método de Sanger)

Deoxinucleotidos (dNTPs)

Dideoxinucleotidos (ddNTPs)
Técnicas de secuenciación, automatización y bioinformática: Herramientas claves para los proyectos genómicos.

Deoxinucleotidos (dNTPs) vs
dideoxinucleotidos (ddNTPs)
 Los secuenciadores han evolucionado tecnológicamente.

 Mayor cobertura de secuenciación.

Nº elevado de genomas completos
 Mayor velocidad de secuenciación
de diferentes especies.
 Menores costos
 Organización del genoma Humano

20.000 genes

3.300 Mb

Proteínas
o ARN funcionales

8.475 genes
Para ARNs

1-2 %
del total 20 % del total (50% del total
del genoma del genoma del genoma)

(40% del total del genoma)

UTRs

ADN Satélites, minisatélites, microsatélites LINEs y SINEs

 Curiosidades del proyecto genoma humano:

Variación entre individuos: 1 nucleótido cada 1200-1500 pb (polimorfismos de un solo nucleótido SNPs)
Dicho de otro modo, entre los humanos la similitud es del 99,2- 99,8%
40% de las proteínas deducidas del genoman humano son similares a las encontradas en las moscas y gusano
50 % de los genes hallados en el genoma humano presentan una similitud con los de otros organismos

Los genes no están distribuidos uniformemente en los cromosomas. Todo el genoma comprende los 23
pares de cromosomas autosómicos (22 autosómicos y 1 par sexual)

El cromosoma 1 tiene el mayor número de genes (2706-2968) y el cromosoma Y el menor (104-231)

Los genes pueden hallarse en cualquiera de las 2 cadenas del ADN

Los genes similares pueden estar agrupados en determinadas regiones (loci) mientras que genes totalmente
distintos entre sí suelen estar distribuidos a lo largo del genoma en distintos loci.
 Principales elementos del genoma humano

 ADNr
 pseudogenes
 SNPs
 VNTRs: SSR o STR
 Transposones ADN
 LTRs
Retrotransposones no-LTR)
 LINEs Retrotransposones Retrotransposones LTR
 SINEs
ADN

(VNTRs)
ADNr

43 Kb

13000 pb

Cromosoma 1

REPETICIONES EN TÁNDEM DE 43 Kb
Cromosomas 13, 14, 15, 21 y 22
 Principales elementos del genoma humano

 ADNr
 pseudogenes
 SNPs
 VNTRs: SSR o STR
 Transposones ADN
 LTRs
Retrotransposones no-LTR)
 LINEs Retrotransposones Retrotransposones LTR
 SINEs
ADN

(VNTRs)
Pseudogen: elementos del ADN con características estructurales similares a la de un gen normal pero que en
teoría son NO funcionales, es decir no codifican para productos funcionales (ARNm y proteínas). Está definición
clásica se halla en debate pues se cree que estas características podrían no aplicarse a todos los pseudogenes o
eventualmente algunos de ellos podrían ser funcionales bajo determinadas condiciones específicas.

No procesados (evento accidental)

(duplicaciones
génicas+inactivación).

Procesados
(retrotransposición).

Pseudogen NO procesado
 NO posee
promotor

Pseudogen procesado
(retrogenes)
 Principales elementos del genoma humano

 ADNr
 pseudogenes
 SNPs
 VNTRs: SSR o STR
 Transposones ADN
 LTRs
Retrotransposones no-LTR)
 LINEs Retrotransposones Retrotransposones LTR
 SINEs
ADN

(VNTRs)
 Debe darse en al menos 1% de una población para ser
considerado como tal (lo diferencia de una mutación puntual
inducida o espontánea)
Frecuencia: cada 1200-1500 pb

Puede estar en regiones no codificantes o codificantes

Aporta variabilidad génica entre individuos

Determina la aparición de Alelos en una población

Son heredables y bastantes estables en una población

Estas variaciones en la secuencia del ADN pueden afectar a la

respuesta o predisposición de los individuos a enfermedades,
Polimorfismos de un solo nucleótido bacterias, virus, productos químicos, fármacos.

(SNP: Single Nucleotide Polymorphism)

Estudio de etiología de enfermedades, genes asociados a enfermedades,

Campo Medicina susceptibilidad o predisposición a enfermedades, farmacocinética y
farmacodinamia (medicina personalizada).
Enfermedades genéticas y multifactoriales

Ejemplo: Hipercolesterolemia familiar

 Principales elementos del genoma humano

 ADNr
 pseudogenes
 SNPs
 VNTRs: SSR o STR
 Transposones ADN
 LTRs
Retrotransposones no-LTR)
 LINEs Retrotransposones Retrotransposones LTR
 SINEs
ADN

(VNTRs)
 VNTRs: Variable Number Tandem Repeat (Número variable de repeticiones en tándem) minisatélites
Representan el 5 % del genoma.

Son repeticiones conservadas de secuencias de 2-5 pb (microsatélites) o 9 a 100 pb (minisatélites) sobre

cualquier parte del genoma. El número de repeticiones es variable pero en general es menor a 1000.

SSR o STR: simple sequence repeat y short tandem repeat microsatélites 5-50 repeticiones

Medicina y forense Estudios de enfermedades en familias: heredables

Ejemplo: Enfermedades por extensión de tripletes. Síndrome del X frágil (CGG)- Enfermedad de Huntington (CAG)
 Principales elementos del genoma humano

 ADNr
 pseudogenes
 SNPs
 VNTRs: SSR o STR
 Transposones ADN
 LTRs
Retrotransposones no-LTR)
 LINEs Retrotransposones Retrotransposones LTR
 SINEs
ADN

(VNTRs)
 TRANSPOSONES o elementos transponibles

Son elementos de ADN autónomos que pueden cambiar su posición en el

genoma o auto-amplificarse en el mismo

Son componentes ubicuos en el genoma, es decir están distribuidos al azar en el mismo.

Clase II Clase I

No utiliza intermediarios
Utilizan intermediarios Retrotransposones
Transposones de ADN de ARN
de ARN

3% del genoma
LINES y SINEs LTR

42% del genoma

 TRANSPOSONES DE ADN:

Son elementos de ADN que promueven su propia transposición (“elementos o genes saltarines”).
No usa ARN como intermediario.

Representan hasta un 3% del genoma

Contienen genes que codifican para proteínas denominadas “transposasas”
 8 % del genoma
RETROTRANSPOSONES LTR Long Terminal Repeat
42% del genoma. (repeticiones terminales largas)
Secuencia de nucleótidos característica
que se encuentra en cada extremo de
un elemento retroviral que ha sido
integrado ancestralmente en el genoma
hospedador.

Son secuencias emparentadas a

diferentes elementos retrovirales

34 % del genoma
LINEs y SINEs
LINEs long interspersed elements 21 % del genoma >5000 pb Distintos tipos siendo L1 el más abundante

(Elementos dispersos largos)

Proteínas de unión al ARN Endonucleasa +retrotranscriptasa

SINEs Short interspersed elements 13 % del genoma (< 500 pb) Distintos tipos siendo los elementos del tipo
“Alu” los más abundantes
(Elementos dispersos cortos)
 Consecuencias de las transposiciones o retrotransposiciones
Dependen fundamentalmente de donde se inserten los
elementos transponibles
Principales alteraciones: INSERCIONES O DELECIONES.
Consecuencias de las transposiciones o retrotransposiciones
Funciones de los genes
 Avances médicos vinculados al proyecto genoma humano

 “Con la gran riqueza de datos sobre el ADN humano generados por el Proyecto del
genoma humano y otras investigaciones genómicas, los científicos y profesionales
clínicos cuentan con herramientas más poderosas para estudiar el papel desempeñado
por múltiples factores genéticos entre sí y con el ambiente en enfermedades mucho
más complejas. Estas enfermedades, tales como el cáncer, la diabetes y las
enfermedades cardiovasculares, constituyen la mayoría de los problemas de salud.
Las investigaciones basadas en el genoma ya están haciendo posible que los
investigadores médicos desarrollen estrategias para descubrir nuevas enfermedades
raras de origen genético, mejores pruebas diagnósticas, estrategias de tratamiento
más eficaces, enfoques fundamentados para demostrar la eficacia clínica, y mejores
herramientas para la toma de decisiones tanto para pacientes como para proveedores
de atención de la salud. A la larga, parece inevitable que los tratamientos serán
personalizados según la composición genómica específica de un paciente. Por lo
tanto, el papel de la genética en la atención de la salud está comenzando a cambiar
profundamente, y los primeros ejemplos de la era de la medicina genómica están por
llegar”

Medicina genómica: Aplicación del conocimiento del genoma humano a la práctica médica.
Aplica la genómica para el diagnóstico y tratamiento de patologías genéticas.
Genómica personalizada: tratamiento personalizados de patologías basados en la naturaleza genética
de la patología y las características genéticas del individuo.
Farmacogenética-farmacogenómica.
 Limitaciones del proyecto genoma humano: la era postgenómica

2014: Primer borrador del proyecto proteoma humano.

http://www.humanproteomemap.org/
Proteínas de 17.294 genes (84 % de proteínas anotadas)
http://www.thehpp.org/